本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2025-10-05 |
Deterministic evolution and stringent selection during preneoplasia
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06102-8
PMID:37258665
|
研究论文 | 通过人类胃类器官模型研究TP53双等位基因失活后的癌前病变演化过程 | 建立了人类胃类器官模型模拟早期肿瘤发生过程,揭示了TP53失活后染色体不稳定的演化规律和克隆选择机制 | 研究基于体外类器官模型,可能与体内真实肿瘤发生环境存在差异 | 探索人类肿瘤发生的最早期事件及其演化规律 | TP53双等位基因失活的人类胃类器官 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞测序, 高通量谱系追踪, 实验演化 | 类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 多个克隆来源的培养物,历时2年的纵向研究 | NA | 单细胞测序, 谱系追踪 | NA | NA |
| 462 | 2025-10-05 |
Hallmarks of transcriptional intratumour heterogeneity across a thousand tumours
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06130-4
PMID:37258682
|
研究论文 | 通过整合77项研究的单细胞RNA测序数据,系统分析了24种肿瘤类型中1,163个肿瘤样本的转录组瘤内异质性模式 | 首次大规模整合跨研究单细胞数据,识别出41个保守元程序并归纳为11个瘤内异质性标志 | 基于已有研究的整合分析,可能受原始数据质量和批次效应影响 | 系统表征肿瘤转录组瘤内异质性模式 | 1,163个肿瘤样本涵盖24种肿瘤类型 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | 整合分析 | 单细胞转录组数据 | 1,163个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 463 | 2025-10-05 |
Treatment of HCC with claudin-1-specific antibodies suppresses carcinogenic signaling and reprograms the tumor microenvironment
2023-02, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.10.011
PMID:36309131
|
研究论文 | 本研究通过靶向非连接性Claudin-1的单克隆抗体治疗肝细胞癌,揭示了其抑制肿瘤生长和重塑肿瘤微环境的作用机制 | 首次探索非连接性Claudin-1作为肝细胞癌治疗靶点的潜力,并开发特异性靶向该蛋白的人源化单克隆抗体 | 目前仍处于临床前研究阶段,尚未进行人体临床试验 | 研究Claudin-1作为肝细胞癌治疗靶点的可行性和作用机制 | 肝细胞癌患者来源的细胞模型和动物模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大量患者来源的细胞系异种移植模型和患者来源的异种移植小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 464 | 2025-10-05 |
Unraveling Vulnerabilities in Endocrine Therapy-Resistant HER2+/ER+ Breast Cancer
2023-11-02, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad159
PMID:37897495
|
研究论文 | 本研究通过建立内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌体外模型,揭示了脂质代谢改变和铁死亡重塑是该类型乳腺癌的治疗脆弱点 | 首次建立了两种不同表型的内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌体外模型,并发现GPX4抑制剂与抗HER2药物联合可显著诱导细胞死亡 | 研究仅基于体外细胞模型,尚未进行体内动物实验验证 | 识别内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌的治疗脆弱点 | BT-474和MDA-MB-361乳腺癌细胞系及其长期雌激素剥夺耐药变体 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | 体外细胞模型 | 基因组数据,转录组数据 | 2种乳腺癌细胞系及其耐药变体 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 465 | 2025-10-05 |
Unraveling Vulnerabilities in Endocrine Therapy-Resistant HER2+/ER+ Breast Cancer
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.554116
PMID:37662291
|
研究论文 | 本研究开发并表征了两种内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌体外模型,以识别潜在的治疗脆弱性 | 建立了两种不同的内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌体外模型,首次发现脂质代谢改变和铁死亡重塑是该类型耐药乳腺癌的脆弱性 | 研究基于体外细胞模型,需要进一步体内实验验证 | 识别内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌的治疗脆弱性 | HER2+/ER+乳腺癌细胞系 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | 体外细胞模型 | 基因组数据,转录组数据 | 两种乳腺癌细胞系(BT-474和MDA-MB-361)及其长期雌激素剥夺衍生株 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 466 | 2025-10-05 |
Cellular Atlas of Senescent Lineages in Radiation- or Immunotherapy-Induced Lung Injury by Single-Cell RNA-Sequencing Analysis
2023-08-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2023.02.005
PMID:36792015
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了放疗或免疫疗法诱导肺损伤中衰老细胞谱系的细胞图谱 | 首次系统识别了肺损伤中30种不同细胞亚群,发现衰老样成纤维细胞是主要的共同病理机制 | 研究基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 阐明免疫疗法和放疗诱导肺损伤的细胞机制 | C57/BL6小鼠肺组织、人类和小鼠细胞系 | 单细胞转录组学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、多重免疫组织化学 | Seurat, Cellchat, Monocol, SCENIC | 单细胞转录组数据、组织染色图像 | 75,396个细胞,多个时间点(7,30,60天) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 467 | 2025-10-05 |
CCL5-producing migratory dendritic cells guide CCR5+ monocytes into the draining lymph nodes
2023-06-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20222129
PMID:36946983
|
研究论文 | 本研究揭示了分泌CCL5的迁移性树突状细胞通过CCR5引导单核细胞进入引流淋巴结的新机制 | 首次发现迁移性cDCs通过分泌CCL5引导表达CCR5的单核细胞进入淋巴结,突破了仅CCR7依赖迁移的传统认知 | 研究主要基于小鼠模型,在人体中的适用性需要进一步验证 | 探究单核细胞在缺乏CCR7表达情况下如何进入引流淋巴结的机制 | 树突状细胞、单核细胞、淋巴结单核吞噬细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用多种基因缺陷小鼠模型(Ccl5、Ccr2、Ccr5、Ccr7、Batf3缺陷型) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 468 | 2025-10-05 |
Hyperactive mTORC1 in lung mesenchyme induces endothelial cell dysfunction and pulmonary vascular remodeling
2023-12-20, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172116
PMID:38127441
|
研究论文 | 本研究探讨了肺间质细胞中过度活跃的mTORC1如何通过旁分泌信号导致内皮细胞功能障碍和肺血管重塑 | 首次揭示了在淋巴管平滑肌瘤病中,间质细胞通过旁分泌信号传导机制与内皮细胞通讯并驱动血管重塑 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本有限且为终末期肺组织 | 阐明LAM疾病中肺间质细胞与内皮细胞之间的通讯机制及其在肺血管重塑中的作用 | 淋巴管平滑肌瘤病(LAM)患者肺组织和Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl基因工程小鼠 | 分子病理学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 组织形态学数据 | 终末期LAM患者肺组织和不同年龄段的基因工程小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 469 | 2025-10-05 |
Retrospective pharmacogenetic study of psoriasis highlights the role of KLK7 in tumour necrosis factor signalling
2023-12-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljad332
PMID:37672660
|
研究论文 | 通过回顾性药物遗传学研究探索银屑病治疗反应的遗传基础,发现KLK7基因在肿瘤坏死因子信号通路中的重要作用 | 首次发现rs1991820和rs62264137两个新标记与银屑病治疗反应相关,并证实KLK7表达与抗TNF治疗反应的关联 | 回顾性研究设计,样本量相对有限(1942例患者),自我评估的治疗反应可能存在偏倚 | 探索银屑病治疗药物反应的遗传通路和生物标志物 | 1942例基因分型的银屑病患者 | 药物遗传学 | 银屑病 | 基因分型、线性回归、表观基因组学、转录组学、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | 线性回归模型 | 基因型数据、表达数据、临床数据 | 1942例银屑病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 470 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2023-12-11, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023113898
PMID:37962490
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析评估了三种不同条件诱导的代谢功能障碍相关脂肪性肝病器官模型 | 首次系统评估MASLD器官模型的转化潜力,并通过单细胞分析揭示不同诱导条件对炎症和纤维化的差异化影响 | 研究仅评估了三种诱导条件,可能未涵盖MASLD所有病理生理机制 | 评估人类肝脏器官模型在代谢功能障碍相关脂肪性肝病研究中的转化潜力 | 人类肝脏器官模型 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序 | 器官模型 | 单细胞转录组数据 | 三种不同诱导条件的器官模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 471 | 2025-10-05 |
GPNMB+ Gal-3+ hepatic parenchymal cells promote immunosuppression and hepatocellular carcinogenesis
2023-12-11, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023114060
PMID:38009297
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示肝细胞癌进展过程中GPNMB+ Gal-3+肝实质细胞的免疫抑制和促癌作用 | 首次在单细胞水平识别了肝细胞癌进展中的三个关键肝实质细胞亚群,并发现GPNMB+ Gal-3+ MT细胞兼具恶性和免疫抑制特性 | 研究主要基于大鼠模型和有限的患者样本,需要更大规模的临床验证 | 探究肝细胞癌发展中特定细胞群体及其在肿瘤微环境形成中的作用 | 毒素诱导的肝肿瘤大鼠模型和肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大鼠模型和HCC患者(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 472 | 2025-10-05 |
Hemorrhage-activated NRF2 in tumor-associated macrophages drives cancer growth, invasion, and immunotherapy resistance
2023-12-07, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174528
PMID:38060331
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤内出血通过激活巨噬细胞中NRF2信号通路促进癌症进展和免疫治疗抵抗的机制 | 首次发现出血激活的NRF2在肿瘤相关巨噬细胞中驱动癌症生长、侵袭和免疫治疗抵抗的新通路 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类临床相关性需要进一步验证 | 探索肿瘤内出血如何影响癌症进展和治疗反应 | 肿瘤相关巨噬细胞和MC38结肠腺癌小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 3D细胞培养球体功能分析 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 473 | 2025-10-05 |
IL-27 produced during acute malaria infection regulates Plasmodium-specific memory CD4+ T cells
2023-12-07, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202317713
PMID:37855243
|
研究论文 | 本研究揭示了IL-27在急性疟疾感染期间通过调控CD4+ T细胞反应影响免疫记忆形成的机制 | 首次发现IL-27在急性疟疾感染期间靶向调控特定CD4+T细胞反应窗口,并鉴定出独特的Th1记忆前体细胞亚群 | 研究主要基于小鼠疟疾模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究IL-27在疟疾感染期间对CD4+ T细胞记忆反应的调控作用 | 疟疾感染小鼠模型中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 疟疾感染小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 474 | 2025-10-05 |
DNA methylation-mediated Rbpjk suppression protects against fracture nonunion caused by systemic inflammation
2023-12-05, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI168558
PMID:38051594
|
研究论文 | 本研究揭示了系统性炎症通过DNA甲基化调控Rbpjk表达导致骨折不愈合的分子机制 | 首次发现NF-κB/Dnmt3b/Rbpjk轴在炎症性骨再生中的作用机制,并证明表观遗传修饰的祖细胞治疗可恢复炎症条件下的骨再生能力 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的可行性和效果需要进一步验证 | 探究系统性炎症导致骨折不愈合的分子机制并开发治疗策略 | 骨折愈合过程中的祖细胞 | 骨骼生物学 | 骨折不愈合 | 单细胞RNA测序,遗传动物模型,表观遗传调控 | 转基因小鼠模型(Ikk2ca,Dnmt3b功能缺失和转基因) | 单细胞转录组数据,遗传表型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 475 | 2025-10-05 |
Modelling the distinct roles of epithelial and stromal androgen receptor in the regulation of prostate epithelial dynamics
2023-11, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.16900
PMID:37424435
|
研究论文 | 本文提出了一个描述前列腺上皮动态的雄激素依赖性调控概念框架,并建立了相应的数学模型 | 区分了上皮和基质雄激素受体的不同功能,提出IGF1作为关键生长因子协调基质-上皮旁分泌通讯,并开发了能够定量拟合实验数据的数学模型 | 模型相对简单,可能需要更全面的建模来完全描述健康和患病前列腺的复杂性 | 阐明雄激素依赖性调控前列腺上皮动态的细胞和分子机制 | 前列腺上皮细胞和基质细胞 | 计算生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,数学建模 | 数学模型 | 基因表达数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 476 | 2025-10-05 |
Myelin dysfunction drives amyloid-β deposition in models of Alzheimer's disease
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06120-6
PMID:37258678
|
研究论文 | 本研究揭示了髓鞘功能障碍通过影响淀粉样前体蛋白加工和分散斑块清除小胶质细胞来驱动阿尔茨海默病模型中β-淀粉样蛋白沉积的机制 | 首次发现髓鞘功能障碍是阿尔茨海默病β-淀粉样蛋白沉积的上游风险因素,并揭示了其通过分散斑块清除小胶质细胞的新型机制 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究年龄相关髓鞘功能障碍在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 阿尔茨海默病小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | 小鼠疾病模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 477 | 2025-10-05 |
Hypoxia activates SREBP2 through Golgi disassembly in bone marrow-derived monocytes for enhanced tumor growth
2023-11-15, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023114032
PMID:37781951
|
研究论文 | 本研究揭示了缺氧通过诱导高尔基体解体和内质网融合激活SREBP2,促进骨髓来源单核细胞胆固醇合成,从而增强肿瘤生长的机制 | 首次发现缺氧通过高尔基体-内质网融合以SCAP非依赖方式激活SREBP2,并在骨髓来源细胞特定谱系中调控胆固醇生物合成 | 研究主要聚焦于骨髓来源单核细胞,其他免疫细胞类型的作用尚未完全阐明 | 探索缺氧环境下骨髓来源细胞中SREBP2激活的分子机制及其在肿瘤进展中的作用 | 骨髓来源细胞(BMDCs)、造血干细胞(HSCs)、单核细胞和巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 478 | 2025-10-05 |
Cephalopod-omics: Emerging Fields and Technologies in Cephalopod Biology
2023-12-29, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icad087
PMID:37370232
|
综述 | 总结了头足类动物生物学中新兴研究领域和技术的现状、挑战与前景 | 整合了头足类分子生物学多个新兴领域的最新进展,包括比较基因组学、基因操纵和单细胞技术等 | NA | 探讨头足类分子生物学和进化研究的关键挑战与未来方向 | 头足类动物 | 比较基因组学,基因编辑,单细胞技术 | NA | 测序技术,成像技术,基因操纵技术,单细胞转录组学,宏基因组学 | NA | 基因组数据,转录组数据,微生物组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,宏基因组学 | NA | NA |
| 479 | 2025-10-05 |
Melatonin modulates the hypothalamic-pituitary neuroendocrine axis to regulate physiological color change in teleost fish
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.81055
PMID:37324950
|
研究论文 | 本研究揭示褪黑素通过激活多种受体调控下丘脑-垂体神经内分泌轴,介导硬骨鱼生理性体色变化的分子机制 | 首次在海洋硬骨鱼中系统解析褪黑素信号系统的多重细胞内信号通路,并发现MT/MCH和MT/(TAC1+CRH)/MSH两条新型调控通路 | 研究仅聚焦于大黄鱼这一特定物种,其发现是否适用于其他硬骨鱼类仍需验证 | 探究褪黑素信号系统在硬骨鱼生理性体色变化中的调控机制 | 大黄鱼(海洋硬骨鱼)及其褪黑素受体信号通路 | 神经内分泌学 | NA | 单细胞RNA测序,药理学实验,配体-受体相互作用分析 | NA | 基因表达数据,空间表达模式数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 480 | 2025-10-05 |
Human Pancreatic α-Cell Heterogeneity and Trajectory Inference Analysis Using Integrated Single Cell- and Single Nucleus-RNA Sequencing Platforms
2023-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.19.567715
PMID:38014078
|
研究论文 | 通过整合单细胞和单核RNA测序技术研究人类胰腺α细胞异质性及其与β细胞的相互转化轨迹 | 首次发现人类胰腺α细胞存在五个不同亚群,并揭示了α-β细胞双向转化的潜在轨迹和特征基因 | 研究主要基于体外胰岛和胰岛移植物,未完全模拟体内自然环境 | 探索人类胰腺α细胞异质性及其在2型糖尿病中与β细胞的相互转化机制 | 人类胰岛细胞(来自非糖尿病供体和2型糖尿病患者)及人类胰岛移植物 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 轨迹推断分析, RNA速率分析 | 轨迹推断模型, PAGA分析 | 单细胞转录组数据, 单核转录组数据 | 人类胰岛样本(来自非糖尿病供体和2型糖尿病患者)及人类胰岛移植物样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |