单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 4701 - 4720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4701 | 2024-08-05 |
Contribution of Retrotransposons to the Pathogenesis of Type 1 Diabetes and Challenges in Analysis Methods
2023-Feb-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24043104
PMID:36834511
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综述 | 本文回顾了反转录转座子在1型糖尿病发病机制中的作用及分析方法的挑战 | 探讨了病毒和反转录转座子在1型糖尿病易感性中的作用，提出了它们可能为遗传易感性与环境因素之间的缺失环节 | 对反转录转座子分析方法的挑战进行了探讨，但未提供具体的解决方案 | 研究反转录转座子与1型糖尿病之间的关系 | 反转录转座子、人内源性逆转录病毒和非长末端重复反转录转座子 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 4702 | 2024-08-08 |
Preparation of a Non-Cardiomyocyte Cell Suspension for Single-Cell RNA Sequencing from a Post-Myocardial Infarction Adult Mouse Heart
2023-02-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/64290
PMID:36805629
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研究论文 | 本文介绍了一种从心肌梗死后成年小鼠心脏中制备非心肌细胞悬液用于单细胞RNA测序的实验方案 | 设计了一种改进的实验方案，通过选择温和的消化酶、控制消化时间和应用荧光激活细胞分选（FACS）来提高细胞活力 | NA | 研究心肌梗死后心脏微环境 | 非心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 心肌梗死后成年小鼠心脏中的非心肌细胞 |
| 4703 | 2024-08-05 |
A combined analysis of bulk and single-cell sequencing data reveals metabolic enzyme, pyruvate dehydrogenase E1 subunit beta (PDHB), as a prediction biomarker for the tumor immune response and immunotherapy
2023-Feb, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e13456
PMID:36816316
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，揭示了代谢酶丙酮酸脱氢酶E1亚基β（PDHB）作为肿瘤免疫反应和免疫疗法的预测生物标志物 | 本文首次系统性地研究了PDHB在多种人类癌症中的表达异常及其与患者预后的相关性 | 研究主要基于已有数据库的生物信息学分析，缺乏临床实验验证 | 探索PDHB在肿瘤免疫反应和预测免疫疗法响应中的潜在作用 | 研究对象包括多种人类癌症以及肾透明细胞癌和肾乳头状细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 生物信息学分析 | NA | 临床数据 | 多个癌症数据集中的患者临床数据，具体样本大小未详细说明 |
| 4704 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome sequencing of macrophages in common cardiovascular diseases
2023-02-01, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiac014
PMID:36822177
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综述 | 本文总结了单细胞转录组测序在常见心血管疾病中研究巨噬细胞变化的应用 | 强调了单细胞RNA测序在发现巨噬细胞异质性方面的优势 | 未涉及具体实验结果，聚焦于已有研究的综述 | 深入了解巨噬细胞在心血管疾病中的功能和特征 | 研究了动脉粥样硬化、心肌梗死和心力衰竭等常见心血管疾病中的巨噬细胞变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | NA | NA |
| 4705 | 2024-08-08 |
"Spatial transcriptomics for respiratory research and medicine." S. Curras-Alonso, J. Soulier, T. Walter, et al. Eur Respir J 2021; 58: 2004314
2023-Feb, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.54314-2020
PMID:36822638
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4706 | 2024-08-08 |
Identifying key multifunctional components shared by critical cancer and normal liver pathways via SparseGMM
2023-01-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2022.100392
PMID:36814838
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SparseGMM的统计方法，用于从多组学数据中发现基因调控网络 | SparseGMM通过结合共表达模式和贝叶斯框架，定量测量调控因子的置信度和目标基因分配的不确定性 | NA | 提高对具有遗传基础的疾病的理解 | 肝癌和正常肝组织 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 高斯混合模型（Gaussian mixtures） | 多组学数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 4707 | 2024-08-08 |
Graph embedding and Gaussian mixture variational autoencoder network for end-to-end analysis of single-cell RNA sequencing data
2023-01-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2022.100382
PMID:36814845
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研究论文 | 本文介绍了一种名为autoCell的深度学习方法，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的丢失填补和特征提取 | autoCell结合了图嵌入和概率深度高斯混合模型，用于推断高维稀疏scRNA-seq数据的分布 | NA | 开发一种端到端的分析工具，用于处理和分析scRNA-seq数据 | scRNA-seq数据，特别是人类胚胎植入前发育轨迹和与疾病相关的星形胶质细胞（DAAs） | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码网络 | 基因表达数据 | 模拟数据集和生物学相关的scRNA-seq数据 |
| 4708 | 2024-08-08 |
scDR: Predicting Drug Response at Single-Cell Resolution
2023-01-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14020268
PMID:36833194
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研究论文 | 本文提出了一种名为scDR的精确单细胞药物反应预测方法，该方法通过整合药物反应基因（DRGs）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的基因表达来计算每个细胞的药物反应分数 | scDR方法在预测药物反应方面具有更高的准确性，并能用于识别内在耐药细胞亚群及探索其潜在机制 | NA | 阐明单细胞分辨率下的药物反应 | 单细胞RNA测序数据中的药物反应基因和基因表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 53,502个细胞来自198个癌细胞系 |
| 4709 | 2024-08-05 |
Identification and validation of neurotrophic factor-related gene signatures in glioblastoma and Parkinson's disease
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1090040
PMID:36825022
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研究论文 | 本文识别并验证了与神经营养因子相关的基因特征在胶质母细胞瘤和帕金森病中的作用 | 本研究通过机器学习技术确定了与帕金森病诊断相关的4个可靠的NFRG，并构建了基于NFRG的风险评分模型来预测胶质母细胞瘤患者的预后 | 本研究可能受到样本大小和外部验证队列有限的影响 | 探讨与神经营养因子相关基因在帕金森病和胶质母细胞瘤中的病理作用和预后意义 | 研究聚焦于2601个神经营养因子相关基因及其在胶质母细胞瘤和帕金森病中的作用 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤, 帕金森病 | LASSO回归, 随机森林算法, Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) | NA | 基因表达数据, 多组学突变分析, 单细胞测序 | 基于TCGA数据库的胶质母细胞瘤队列 |
| 4710 | 2024-08-05 |
Deciphering the sequential changes of monocytes/macrophages in the progression of IDD with longitudinal approach using single-cell transcriptome
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1090637
PMID:36817437
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析阐明了单核细胞/巨噬细胞在间盘退变（IDD）进程中的变化 | 首次采用纵向研究方法系统描述了IDD进展中的免疫反应及单核细胞/巨噬细胞的不同亚群的变化 | 缺乏对其它免疫细胞类型变化的深入分析 | 研究IDD进展过程中单核细胞/巨噬细胞的时序变化及其与氧化应激的关系 | 针对退变的椎间盘组织中的不同细胞群体 | 数字病理学 | 间盘退变 | 单细胞测序，RNA测序，WGCNA，免疫浸润分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 4711 | 2024-08-05 |
Characterization of the microenvironment in different immune-metabolism subtypes of cervical cancer with prognostic significance
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1067666
PMID:36816023
|
研究论文 | 本文探讨了宫颈癌不同免疫代谢亚型的微环境特征及其预后意义 | 识别出具有预后意义的宫颈癌分子亚型，并揭示了一个新的治疗靶点IMPDH1 | 本研究的局限性未详细说明 | 研究宫颈癌中免疫细胞浸润与代谢重编程的相互作用 | 研究对象为宫颈癌的免疫相关基因和代谢相关基因 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 基因组测序，单细胞测序 | 无监督共识聚类 | 基因表达数据 | 使用了癌症基因组图谱（TCGA）和基因表达综合（GEO）数据库中的数据 |
| 4712 | 2024-08-05 |
Development and validation of cuproptosis-related genes in synovitis during osteoarthritis progress
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1090596
PMID:36817415
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研究论文 | 本文分析了在骨关节炎进程中与滑膜炎相关的铜死亡基因 | 首次探讨了铜死亡相关基因与滑膜炎及免疫细胞浸润之间的关系 | 缺乏直接临床验证和长期随访数据 | 研究铜死亡在滑膜炎中的作用及相关基因 | 研究五个铜死亡相关基因及其在滑膜中的表达 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 微阵列数据 | 分析多个公开数据集，具体样本大小未说明 |
| 4713 | 2024-08-05 |
A systematic and comprehensive analysis of T cell exhaustion related to therapy in lung adenocarcinoma tumor microenvironment
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1126916
PMID:36814485
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研究论文 | 该文章对肺腺癌肿瘤微环境中的T细胞耗竭进行了系统和综合的分析 | 构建了一个基于TEX信号通路的风险模型以区分预后良好的患者和预后不良的患者 | 对T细胞耗竭的预后作用在恶性肺腺癌中的复杂性仍未完全理解 | 深入了解T细胞耗竭在肺腺癌免疫逃逸中的作用，以改善癌症免疫治疗 | 参与研究的498名肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林模型 | 基因表达数据 | 498名肺腺癌患者 |
| 4714 | 2024-08-05 |
Moxibustion improves hypothalamus Aqp4 polarization in APP/PS1 mice: Evidence from spatial transcriptomics
2023, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2023.1069155
PMID:36819717
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研究论文 | 本研究探讨了艾灸对APP/PS1小鼠下丘脑AQP4极化的影响 | 该研究首次通过空间转录组学技术揭示了艾灸改善下丘脑AQP4极化的机制 | 研究仅在APP/PS1小鼠模型中进行，缺乏对其他模型的验证 | 探讨艾灸是否能影响血脑屏障周围AQP4的极化 | 野生型小鼠、APP/PS1小鼠及接受艾灸干预的APP/PS1小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | APP/PS1小鼠 | 基因表达数据 | 至少3种小鼠组别的样本 |
| 4715 | 2024-08-08 |
Combined scRNAseq and Bulk RNAseq Analysis to Reveal the Dual Roles of Oxidative Stress-Related Genes in Acute Myeloid Leukemia
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2023/5343746
PMID:36811020
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序（scRNAseq）和批量RNA测序（RNAseq）数据，揭示了氧化应激相关基因在急性髓系白血病（AML）中的双重作用 | 首次区分了具有不同功能的氧化应激相关基因，并构建了预测治疗反应的模型 | NA | 揭示氧化应激相关基因在急性髓系白血病发病和化疗耐药中的不同作用 | 急性髓系白血病细胞和正常细胞中的氧化应激功能 | 数字病理学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNAseq），批量RNA测序（RNAseq） | 机器学习方法 | RNA序列数据 | NA |
| 4716 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the immune microenvironment and signaling networks in cystitis glandularis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1083598
PMID:36814917
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了囊性膀胱炎的免疫微环境和信号网络 | 首次在囊性膀胱炎患者中进行单细胞RNA测序，揭示了新的细胞亚群和免疫细胞的激活差异 | NA | 全面描述囊性膀胱炎中的炎症免疫环境，为临床治疗提供基础 | 囊性膀胱炎患者的炎症组织和周围正常膀胱黏膜组织 | 数字病理学 | 囊性膀胱炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 包括四个炎症组织和三个周围正常膀胱黏膜组织，共分离出18,869个细胞 |
| 4717 | 2024-08-08 |
Targeting macrophagic 17β-HSD7 by fenretinide for the treatment of nonalcoholic fatty liver disease
2023-Jan, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2022.04.003
PMID:36815031
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研究论文 | 研究探讨了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中巨噬细胞极化的分子调控机制，并评估了fenretinide作为17-HSD7抑制剂在NAFLD治疗中的潜在应用 | 首次揭示了17-HSD7在NAFLD中调控巨噬细胞M1极化的作用，并发现fenretinide作为潜在的NAFLD治疗药物 | NA | 研究17-HSD7在NAFLD中的作用及fenretinide的治疗潜力 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的巨噬细胞极化及17-HSD7的作用 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型同窝仔鼠和巨噬细胞-17-HSD7敲除鼠，高脂饮食喂养6周 |
| 4718 | 2024-08-08 |
The Prognostic Model Established by the Differential Expression Genes Based on CD8+ T Cells to Evaluate the Prognosis and the Response to Immunotherapy in Osteosarcoma
2023, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2023/6563609
PMID:36816742
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研究论文 | 本研究通过分析骨肉瘤患者的单细胞RNA测序数据，构建了一个基于CD8+ T细胞差异表达基因的预后模型，用于评估骨肉瘤的预后和免疫治疗反应 | 首次构建了一个基于CD8+ T细胞差异表达基因的预后模型，用于评估骨肉瘤的预后和免疫治疗反应 | NA | 探索一个能够准确评估骨肉瘤对免疫治疗反应的模型 | 骨肉瘤患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个骨肉瘤患者的单细胞RNA测序数据 |
| 4719 | 2024-08-08 |
Single-cell transcription analysis reveals the tumor origin and heterogeneity of human bilateral renal clear cell carcinoma
2023, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2022-0569
PMID:36816799
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研究论文 | 本研究通过分析来自基因表达 omnibus 数据库的单细胞转录组测序数据，揭示了人类双侧肾透明细胞癌的肿瘤起源和异质性 | 首次通过单细胞转录组测序数据分析，揭示了双侧肾透明细胞癌的细胞类型、恶性评分、肿瘤微环境和细胞干性评分等方面的差异 | 研究仅基于单细胞转录组数据，未涉及其他类型的分子数据或临床数据 | 探究双侧肾透明细胞癌的肿瘤起源、微环境、细胞分子特征和肿瘤内异质性 | 双侧肾透明细胞癌的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 共包含来自左侧和右侧透明细胞肾细胞癌的7143个细胞 |
| 4720 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis to identify the influences of SARS-CoV-2 infections to inflammatory bowel disease
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1024041
PMID:36817436
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞分析，探讨了COVID-19与炎症性肠病（IBD）之间的分子和细胞交集，以理解COVID-19对IBD患者的影响 | 本研究首次通过转录组和单细胞RNA测序数据，揭示了COVID-19与IBD之间的共同差异表达基因（DEGs）和免疫细胞类型比例的变化，为理解两者之间的关联提供了新的视角 | 本研究主要基于已有的RNA测序和单细胞RNA测序数据集，可能存在样本选择偏倚和数据集之间的异质性问题 | 探讨COVID-19感染对炎症性肠病（IBD）的影响及其分子机制 | COVID-19与炎症性肠病（IBD）之间的共同差异表达基因和免疫细胞类型 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | 四个RNA测序数据集和两个单细胞RNA测序数据集 |