单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 4561 - 4580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4561 | 2024-08-08 |
Tissue-embedded stretchable nanoelectronics reveal endothelial cell-mediated electrical maturation of human 3D cardiac microtissues
2023-03-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade8513
PMID:36888704
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研究论文 | 研究使用嵌入组织的可拉伸纳米电子器件揭示了人源3D心脏微组织中内皮细胞介导的电成熟过程 | 首次使用组织嵌入的可拉伸纳米电子器件长期稳定地监测人源3D心脏微组织的电活动，并结合机器学习方法分析心肌细胞电信号的发育轨迹 | NA | 探索干细胞疗法在心脏病治疗中的电整合机制 | 人源诱导多能干细胞衍生的心肌细胞（hiPSC-CMs）和内皮细胞（hiPSC-ECs） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 机器学习 | NA | 电信号和RNA序列 | NA |
| 4562 | 2024-08-05 |
MMP14 cleaves PTH1R in the chondrocyte-derived osteoblast lineage, curbing signaling intensity for proper bone anabolism
2023-03-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.82142
PMID:36892459
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研究论文 | 本文研究了膜型金属蛋白酶14（MMP14）在软骨细胞衍生的成骨细胞谱系中如何调节甲状旁腺激素（PTH）信号强度。 | 首次提出了MMP14介导的PTH信号调节的新模式，揭示了其在成骨谱系中的作用。 | 目前研究的范围主要集中在小鼠模型，可能无法完全应用于人类。 | 探讨MMP14在骨生成过程中对PTH信号的调控机制。 | 本研究对象为新生小鼠和成年小鼠的软骨细胞衍生的成骨细胞。 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 新生小鼠和成年小鼠的多个样本，具体数量不详 |
| 4563 | 2024-08-05 |
Roles and mechanisms of tumour-infiltrating B cells in human cancer: a new force in immunotherapy
2023-Mar-09, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-023-00460-1
PMID:36890557
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综述 | 本文总结了肿瘤浸润性B细胞在人类癌症及治疗中的作用和机制 | 探讨B细胞在不同肿瘤中的双重作用，以及其对免疫检查点抑制剂反应的影响 | 研究中B细胞的生物学功能复杂，结果存在争议 | 阐明肿瘤浸润性B细胞在癌症免疫治疗中的作用和机制 | 重点研究肿瘤浸润性B细胞在多种实体瘤中的作用 | 免疫治疗 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 4564 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell landscape following antimony exposure during spermatogenesis in Drosophila testes
2023-Mar-09, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-023-01391-4
PMID:36894529
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了锑暴露对果蝇睾丸中精子发生过程的影响及其转录调控机制 | 本研究首次揭示了锑暴露后果蝇睾丸中细胞组成的改变，并发现了与精子发生相关的多个新基因和代谢途径 | 研究仅限于果蝇模型，可能需要进一步的人体或哺乳动物模型验证 | 探讨锑暴露对果蝇精子发生的影响及其转录调控机制 | 果蝇睾丸中的精子发生过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 暴露于锑的果蝇睾丸样本 |
| 4565 | 2024-08-08 |
Longitudinal single-cell profiling of chemotherapy response in acute myeloid leukemia
2023-03-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36969-0
PMID:36890137
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序结合microRNA-126报告基因的功能验证，前瞻性地识别急性髓系白血病（AML）患者和异种移植模型中的白血病干细胞（LSCs），并评估其对化疗的纵向反应。 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术，结合microRNA-126报告基因的功能验证，前瞻性地识别和评估AML患者和异种移植模型中的LSCs对化疗的反应。 | NA | 研究AML中LSCs对早期治疗抵抗和AML再生的贡献，并评估其对化疗的纵向反应。 | 急性髓系白血病（AML）患者和异种移植模型中的白血病干细胞（LSCs）。 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 大型AML队列 |
| 4566 | 2024-08-05 |
Comparison of the Illumina NextSeq 2000 and GeneMind Genolab M sequencing platforms for spatial transcriptomics
2023-Mar-07, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09192-w
PMID:36882687
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研究论文 | 本文比较了Illumina NextSeq 2000和GeneMind Genolab M两个测序平台在空间转录组学中的应用 | 验证了GeneMind Genolab M在转录组测序中与Illumina NextSeq 2000平台的性能一致性 | 未提及特定的局限性 | 评价两种基因测序平台的性能 | Illumina NextSeq 2000和GeneMind Genolab M测序平台 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 转录组数据 | 使用了相同组织点的样本进行比较 |
| 4567 | 2024-08-08 |
Well-TEMP-seq as a microwell-based strategy for massively parallel profiling of single-cell temporal RNA dynamics
2023-03-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36902-5
PMID:36882403
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research paper | 本文开发了一种名为Well-TEMP-seq的高通量、成本效益高、准确且高效的方法，用于大规模并行分析单细胞基因表达的时间动态 | Well-TEMP-seq结合了代谢RNA标记与单细胞RNA测序方法Well-paired-seq，能够区分每个单细胞中新转录的RNA与预存的RNA | NA | 揭示单细胞基因表达的时间动态 | 单细胞RNA的时间动态 | digital pathology | colorectal cancer | scRNA-seq | NA | RNA | 数千个单细胞 |
| 4568 | 2024-08-08 |
Identification of phenotypically, functionally, and anatomically distinct stromal niche populations in human bone marrow based on single-cell RNA sequencing
2023-03-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81656
PMID:36876630
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序技术，系统地表征了人类骨髓中非造血性基质细胞的组成，并研究了基质细胞调控原则及其与造血细胞的相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出六种转录和功能上不同的基质细胞群体，并利用RNA速度分析和体外增殖能力及分化潜能重现了基质细胞的分化层次 | NA | 深入理解人类骨髓微环境的细胞复杂性和基质-造血相互作用的机制 | 人类骨髓中的基质细胞及其与造血细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个单细胞样本 |
| 4569 | 2024-08-08 |
scEvoNet: a gradient boosting-based method for prediction of cell state evolution
2023-Mar-06, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05213-3
PMID:36879200
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于梯度提升的预测细胞状态演化的方法scEvoNet | scEvoNet是首个用于研究细胞状态演化的scRNA-seq计算工具，能够识别细胞状态间的共享基因，指示进化分歧或共选现象 | NA | 探索细胞在不同生物体中的功能或发育历史，揭示细胞类型的核心分子特征和潜在的进化机制 | 跨物种或与癌症相关的scRNA-seq数据集中的细胞类型演化 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 梯度提升 | scRNA-seq数据 | 涉及癌症和发育数据集 |
| 4570 | 2024-08-08 |
Characterization of bone marrow heterogeneity in NK-AML (M4/M5) based on single-cell RNA sequencing
2023-Mar-06, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-023-00391-5
PMID:36879313
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了6份骨髓抽吸样本中的39,288个细胞，包括5名NK-AML（M4/M5）患者和1名健康供体，以揭示NK-AML（M4/M5）的细胞异质性和基因表达特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术构建了NK-AML（M4/M5）的细胞异质性图谱，并鉴定了可能的生物标志物 | NA | 研究旨在揭示正常核型急性髓系白血病（NK-AML）中的细胞异质性和生物标志物，以推动精准医疗和靶向治疗的发展 | NK-AML（M4/M5）患者的骨髓细胞和健康供体的骨髓细胞 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 39,288个细胞，来自6份骨髓抽吸样本，包括5名NK-AML（M4/M5）患者和1名健康供体 |
| 4571 | 2024-08-05 |
Molecular and spatial profiling of the paraventricular nucleus of the thalamus
2023-03-03, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81818
PMID:36867023
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研究论文 | 这篇文章探讨了丘脑旁室核的分子多样性和空间分布 | 文章首次揭示了小鼠脑中五种分子不同的PVT神经元亚型，并发现了新的分子梯度组织方式 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全代表其他物种的情况 | 本研究旨在阐明丘脑旁室核细胞类型的分子特征和空间分布 | 研究对象为小鼠的丘脑旁室核 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 大约五种分子不同的神经元亚型 |
| 4572 | 2024-08-08 |
Gut microbiome is linked to functions of peripheral immune cells in transition cows during excessive lipolysis
2023-03-03, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-023-01492-3
PMID:36869370
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研究论文 | 研究探讨了过度脂解过程中肠道微生物群与过渡期奶牛外周免疫细胞功能之间的潜在联系 | 首次揭示了过度脂解期间肠道微生物群及其与次级胆酸合成相关的功能如何抑制过渡期奶牛单核细胞功能 | NA | 探究过度脂解期间肠道微生物群与过渡期奶牛免疫抑制之间的关系 | 过渡期奶牛的肠道微生物群和外周免疫细胞功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 16S扩增子测序, 宏基因组学, 靶向代谢组学 | NA | 转录组, 微生物组, 代谢组 | 涉及过度脂解和低/正常脂解的奶牛样本 |
| 4573 | 2024-08-08 |
Tumor microenvironment remodeling after neoadjuvant immunotherapy in non-small cell lung cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2023-03-03, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01164-9
PMID:36869384
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了非小细胞肺癌患者在接受新辅助PD-1阻断联合化疗后肿瘤微环境的转录组变化 | 揭示了与治疗反应相关的特定癌症细胞转录组特征，并发现了预测免疫治疗反应的新生物标志物 | 研究受限于接受联合治疗的患者样本量较小 | 探索非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫治疗后的肿瘤微环境变化及其与治疗反应的关系 | 非小细胞肺癌患者的单细胞转录组 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 92,000个单细胞，来自3名治疗前和12名治疗后的非小细胞肺癌患者 |
| 4574 | 2024-08-08 |
Single-Cell Characterization of the Frizzled 5 (Fz5) Mutant Mouse and Human Persistent Fetal Vasculature (PFV)
2023-03-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.3.8
PMID:36867129
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研究论文 | 本研究通过免疫组织化学和单细胞RNA测序技术，对Fz5突变小鼠和人类持续胎儿血管（PFV）的细胞组成和相关分子特征进行了表征 | 首次详细描述了PFV中的细胞类型及其分子特征，并揭示了Fz5突变小鼠和人类PFV之间的细胞类型和分子特征的相似性 | 研究样本仅包括Fz5突变小鼠和两个人类PFV样本，可能不足以全面代表所有PFV病例 | 旨在表征PFV的细胞组成和相关分子特征，并为深入理解该疾病奠定基础 | Fz5突变小鼠和人类PFV的细胞组成和分子特征 | 数字病理学 | 儿童失明 | 单细胞RNA测序（sc-RNAseq） | NA | 细胞 | Fz5突变小鼠和两个人类PFV样本 |
| 4575 | 2024-08-08 |
Increased retinoic acid signaling decreases lung metastasis in salivary adenoid cystic carcinoma by inhibiting the noncanonical Notch1 pathway
2023-03, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-023-00957-7
PMID:36879115
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和外显子捕获测序，深入研究了唾液腺腺样囊性癌（SACC）肺转移的分子机制，并发现视黄酸信号通路的增强通过抑制非经典Notch1通路减少肺转移。 | 本文首次发现视黄酸（RA）作为内源性拮抗剂，通过纠正细胞分化错误，抑制SACC的肺转移。 | 研究仅基于两名无MYB-NFIB融合和NOTCH1突变的SACC患者样本，可能存在样本量不足的问题。 | 探索唾液腺腺样囊性癌肺转移的分子机制，并评估视黄酸信号通路在其中的作用。 | 唾液腺腺样囊性癌（SACC）患者的原发和转移组织。 | 数字病理学 | 唾液腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），外显子捕获测序 | NA | RNA | 两名SACC患者 |
| 4576 | 2024-08-08 |
Multiomic analyses implicate a neurodevelopmental program in the pathogenesis of cerebral arachnoid cysts
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02238-2
PMID:36879130
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研究论文 | 本研究通过综合分析617个患者-父母（三重）外显子组、152,898个人脑和小鼠脑膜单细胞RNA测序转录组以及患者医疗记录的自然语言处理数据，探讨了脑蛛网膜囊肿（ACs）的发病机制 | 本研究首次揭示了ACs患者中破坏性新生变异（DNVs）的高度富集，并识别了七个基因在ACs中的显著DNV负担，以及AC相关基因在染色质修饰因子和中期妊娠转录网络中的富集 | NA | 阐明脑蛛网膜囊肿的发病机制 | 脑蛛网膜囊肿患者及其基因变异 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 外显子组测序、单细胞RNA测序、自然语言处理 | NA | 基因组数据、转录组数据、文本数据 | 617个患者-父母三重组、152,898个人脑和小鼠脑膜单细胞 |
| 4577 | 2024-08-08 |
Single-cell gene set enrichment analysis and transfer learning for functional annotation of scRNA-seq data
2023-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad024
PMID:36879897
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研究论文 | 本文开发了两种新方法——单细胞基因集富集分析（scGSEA）和单细胞映射器（scMAP），用于自动化单细胞转录组数据的细胞功能注释 | scGSEA结合潜在数据表示和基因集富集分数以单细胞分辨率检测协调的基因活性；scMAP使用迁移学习技术将新细胞重新定位并情境化到参考细胞图谱中 | 大多数现有方法依赖于最初为批量RNA测序开发的技术，或仅利用从细胞聚类中识别的标记基因进行监督注释 | 克服现有细胞功能注释方法的局限性，自动化单细胞转录组数据的注释过程 | 单细胞转录组数据的细胞功能注释 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 迁移学习 | 单细胞转录组数据 | 使用模拟和真实数据集进行验证 |
| 4578 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals dual sensing of HIV-1 in blood Axl+ dendritic cells
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106019
PMID:36866043
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研究论文 | 本研究揭示了HIV-1在血液Axl+树突状细胞中的双重感知机制 | 首次识别了血液AxlDC亚群的特殊能力来识别和复制HIV-1并启动不同的转录程序 | 没有明显的局限性信息 | 研究Axl+树突状细胞对HIV-1的抗病毒响应 | 主要研究人类原代血液树突状细胞的不同亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 主要针对多种血液树突状细胞亚群，具体样本数量未明 |
| 4579 | 2024-08-05 |
resVAE ensemble: Unsupervised identification of gene sets in multi-modal single-cell sequencing data using deep ensembles
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1091047
PMID:36875765
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研究论文 | 提出了一种使用深度集成的无监督基因集识别方法。 | 使用自编码器的集成和随后的排名聚合提取共识特征，从而减少偏倚。 | 缺乏样本量和具体应用案例的实例验证。 | 旨在改进单细胞测序数据分析中的功能标识。 | 不同模态的单细胞测序数据。 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | 集成自编码器 | 测序数据 | 使用了不同模态的数据集，具体样本数量未说明 |
| 4580 | 2024-08-05 |
The intestine: A highly dynamic microenvironment for IgA plasma cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1114348
PMID:36875083
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综述 | 本文章讨论了肠道上皮细胞与IgA浆细胞的空间相互作用及其对IgA浆细胞生成、归巢和寿命的潜在贡献 | 介绍了空间转录组学作为一种新技术，用于解决肠道IgA浆细胞生物学中的未解问题 | NA | 探讨肠道微环境对IgA浆细胞的影响及其生物学特性 | IgA浆细胞和肠道上皮细胞 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA | NA |