单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 4541 - 4560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4541 | 2024-08-08 |
Single cell molecular alterations reveal target cells and pathways of conditioned fear memory
2023-05-15, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2023.148309
PMID:36870465
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了条件性恐惧记忆（CFM）再巩固过程中海马体细胞的转录调控基因变化及其目标细胞 | 首次揭示了CFM再巩固过程中海马体细胞的转录调控基因变化，并发现了与神经退行性疾病相关基因的关联，为CFM在预防阿尔茨海默病中的作用提供了新的转录视角 | 目前的研究仅限于正常C57小鼠，需要进一步在阿尔茨海默病模型小鼠中进行研究以验证初步结论 | 探索条件性恐惧记忆再巩固过程中海马体细胞的转录调控基因变化及其目标细胞 | 海马体细胞及其在条件性恐惧记忆再巩固过程中的转录调控基因变化 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 成年雄性C57小鼠的海马体细胞 |
| 4542 | 2024-08-05 |
SCREENING OF POTENTIAL CORE GENES IN THE PERIPHERAL BLOOD OF ADULT PATIENTS WITH SEPSIS BASED ON IMMUNOREGULATION AND SIGNAL TRANSDUCTION FUNCTIONS
2023-05-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002115
PMID:36880832
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研究论文 | 基于免疫调节和信号转导功能，筛选潜在的核心基因用于脓毒症成人患者的外周血 | 首次通过RNA-seq技术和生物信息学方法综合分析脓毒症患者外周血中的核心基因，识别和验证潜在的研究靶点 | 样本量相对较小，只包含23名脓毒症患者和10名正常志愿者，可能影响结果的泛化能力 | 筛选和验证脓毒症患者外周血中的潜在核心基因，以理解其免疫调节作用 | 脓毒症患者的外周血样本以及正常志愿者的外周血样本 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 总共33个样本（脓毒症患者23个，正常志愿者10个） |
| 4543 | 2024-08-05 |
Insights into the characteristics of primary radioresistant cervical cancer using single-cell transcriptomics
2023-May, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-023-00882-x
PMID:36867313
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学探讨了原发性放射抗性宫颈癌的特征 | 开发了三种放射抗性和两种放射敏感的原发性宫颈癌细胞系，并保持了肿瘤内异质性 | 尚未提及具体的研究局限性 | 研究宫颈癌的放射抗性特征 | 来自患者标本的宫颈癌细胞系 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | CR细胞系 | 细胞系特征数据 | 五种细胞系（包括三种放射抗性和两种放射敏感） |
| 4544 | 2024-08-05 |
High-resolution anatomical and spatial transcriptome analyses reveal two types of meristematic cell pools within the secondary vascular tissue of poplar stem
2023-05-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2023.03.005
PMID:36895162
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研究论文 | 本研究结合高分辨率解剖分析和空间转录组技术，定义了杨树干次生 vascular 组织中 meristematic 细胞的特征 | 研究推断出次生 vascular 组织中存在两种类型的 meristematic 样细胞池，基于高分辨率显微镜和空间转录组结果 | 在技术上对木质树干从初级到次级 vascular 组织的全貌分子特征进行表征存在挑战 | 理解 vascular 植物（如森林树木）的演化、生长和次生径向生长调节机制 | 杨树干中初级和次级 vascular 组织的发展过程中 meristematic 细胞的特征 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 基因表达数据 | 涉及转基因树和单细胞测序样本 |
| 4545 | 2024-08-05 |
Cancer-specific tissue-resident memory T-cells express ZNF683 in colorectal cancer
2023-05, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-023-02202-4
PMID:36869093
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研究论文 | 本研究调查了组织驻留记忆T细胞在结直肠癌中的作用，并表征了癌症特异性Trm细胞 | 首次识别ZNF683作为结直肠癌特异性组织驻留记忆T细胞的候选标记物 | 样本量仅包括结直肠癌相关的免疫细胞，可能限制了研究结果的广泛适用性 | 研究组织驻留记忆T细胞在结直肠癌中的作用及其特征 | 结直肠癌组织中的CD103+/CD8+肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞，RNA | 17,257个结直肠癌浸润免疫细胞 |
| 4546 | 2024-08-05 |
Gene Regulatory Network Inference Using Convolutional Neural Networks from scRNA-seq Data
2023-05, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0355
PMID:36877552
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研究论文 | 本文提出了一种基于卷积神经网络的基因调控网络推断方法 | 创新性地提出了一种监督卷积神经网络（CNNSE），从基因对的2D共表达矩阵中提取基因表达信息 | 没有提及具体的局限性 | 研究和改进基因调控网络的推断准确性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达信息 | 计算机视觉 | NA | RNA-seq | CNN | 图像 | 在模拟数据上进行测试，未提供真实样本数量 |
| 4547 | 2024-08-08 |
Intestinal cell type-specific communication networks underlie homeostasis and response to Western diet
2023-05-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221437
PMID:36880999
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和统计建模研究了肠道细胞的动态特性和潜在的细胞机制，特别是在西方饮食影响下的变化 | 揭示了新的肠道细胞亚群和发育轨迹模型，以及西方饮食对特定免疫细胞群和肠上皮细胞功能的影响 | NA | 探究肠道细胞在免疫和炎症反应中的作用，特别是在高脂高糖饮食下的影响 | 肠道细胞，包括肠上皮内淋巴细胞、固有层淋巴细胞、常规树突状细胞和肠上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 统计建模 | RNA序列数据 | 涉及不同饮食（常规饮食和高脂高糖饮食）的小鼠肠道细胞样本 |
| 4548 | 2024-08-08 |
Construction of endothelial cell-related and autophagy-related prognostic models for hepatocellular carcinoma based on single-cell data
2023-May, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.16172
PMID:36894323
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据构建了与内皮细胞和自噬相关的肝细胞癌预后模型 | 首次使用单细胞RNA测序数据构建了与内皮细胞和自噬相关的肝细胞癌预后模型 | NA | 开发与自噬相关的预后模型，用于肝细胞癌患者的预后预测 | 肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 (ScRNA-Seq) | Cox回归模型 | RNA测序数据 | 涉及多种细胞类型的肝细胞癌患者数据 |
| 4549 | 2024-08-05 |
Improved Bacterial Single-Cell RNA-Seq through Automated MATQ-Seq and Cas9-Based Removal of rRNA Reads
2023-04-25, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03557-22
PMID:36880749
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研究论文 | 该文章改进了细菌单细胞RNA测序协议，通过自动化和rRNA去除技术提高了RNA测序的效率和准确性 | 集成了自动化和更高效的逆转录酶，降低了细胞损失和提高了基因检测灵敏度 | 未提及研究中的限制因素 | 探讨细菌单细胞RNA测序中基因表达的异质性 | 研究对象为不同生长条件下的沙门氏菌单细胞 | 数字病理学 | 细菌感染 | MATQ-Seq | NA | RNA测序数据 | 大量沙门氏菌单细胞样本 |
| 4550 | 2024-08-05 |
Recent advances in deciphering hippocampus complexity using single-cell transcriptomics
2023-04, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2023.106062
PMID:36878328
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综述 | 该文章总结了单细胞转录组学在海马区域的应用 | 创新性地应用scRNA-seq和snRNA-seq技术，深入探讨海马细胞类型和基因表达调控 | 未能完全阐明海马活动背后的所有分子机制 | 旨在加深对海马发育、健康和疾病相关分子机制的理解 | 海马的细胞类型及其基因表达 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和snRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 4551 | 2024-08-05 |
Deep into the niche: Deciphering local endoderm-microenvironment interactions in development, homeostasis, and disease of pancreas and intestine
2023-04, BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology
IF:3.2Q1
DOI:10.1002/bies.202200186
PMID:36871153
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研究论文 | 本文探讨了局部内胚层微环境与胰腺和肠道的相互作用。 | 揭示了特定间充质亚型通过与上皮、神经和微血管的局部相互作用驱动胰腺内分泌细胞和胰岛的形成与成熟。 | 文章没有明确提到具体的实验局限性或模型限制。 | 研究内胚层微环境在胰腺和肠道发育、稳态及疾病中的作用。 | 探索内胚层发育过程中细胞间的功能异质性。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 4552 | 2024-08-08 |
TRIM28 promotes luminal cell plasticity in a mouse model of prostate cancer
2023-04, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02655-0
PMID:36882525
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型探讨TRIM28在前列腺癌进展中的作用 | 首次揭示TRIM28促进前列腺肿瘤细胞中近端腔细胞标志物的表达 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类前列腺癌中验证 | 研究TRIM28在前列腺癌进展中的作用及其对肿瘤细胞可塑性的影响 | TRIM28在前列腺癌中的表达及其对肿瘤细胞的影响 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 基因工程小鼠模型NPp53T |
| 4553 | 2024-08-08 |
Cytotoxic CD161-CD8+ TEMRA cells contribute to the pathogenesis of systemic lupus erythematosus
2023-Apr, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104507
PMID:36893588
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析，揭示了系统性红斑狼疮（SLE）中CD8+ T细胞的异质性，并发现了一种新的高细胞毒性的CD161-CD8+ TEMRA细胞亚群，该亚群在SLE患者中显著增加。 | 本研究首次发现了DTHD1基因突变与CD161-CD8+ TEMRA细胞在SLE中的异常积累之间的关联，并揭示了DTHD1通过抑制MYD88活性来调节CD161-CD8+ TEMRA细胞的增殖和细胞毒性。 | NA | 探讨系统性红斑狼疮（SLE）中CD8+ T细胞的异质性和潜在机制，以及其在SLE发病机制中的作用。 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者和健康对照者的外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、qPCR、全外显子测序（WES） | NA | RNA | 包括3名健康对照和2名SLE患者的家族谱系，以及23名健康对照和33名SLE患者的队列。 |
| 4554 | 2024-08-08 |
Identification of fibrocyte cluster in tumors reveals the role in antitumor immunity by PD-L1 blockade
2023-03-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112162
PMID:36870329
|
研究论文 | 研究探讨了纤维细胞在联合免疫治疗中的作用，特别是抗VEGF抗体和抗PD-L1抗体的联合使用对肿瘤浸润纤维细胞的影响 | 通过单细胞RNA测序识别出肿瘤浸润CD45细胞中的独特“纤维细胞簇”，并发现纤维细胞通过PD-L1阻断增强CD8 T细胞的共刺激活性 | NA | 研究纤维细胞在肿瘤免疫治疗中的作用及其机制 | 纤维细胞及其在肿瘤免疫治疗中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及肺癌患者的肿瘤浸润CD45细胞样本 |
| 4555 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals immunosuppressive myeloid cell diversity during malignant progression in a murine model of glioma
2023-03-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112197
PMID:36871221
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了在小鼠胶质瘤模型中，从低级别胶质瘤（LGG）向高级别胶质瘤（HGG）恶性进展过程中肿瘤微环境（TME）的细胞异质性 | 首次揭示了在LGG向HGG恶性进展过程中，肿瘤微环境中巨噬细胞群从免疫激活表型向免疫抑制状态的转变 | NA | 研究胶质瘤恶性进展过程中肿瘤微环境中髓系细胞的多样性和作用 | 小鼠胶质瘤模型中的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 4556 | 2024-08-08 |
scGAD: a new task and end-to-end framework for generalized cell type annotation and discovery
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad045
PMID:36869836
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研究论文 | 本文提出了一种新的任务和端到端框架scGAD，用于单细胞RNA测序数据的广义细胞类型注释和发现 | scGAD框架通过构建内在对应关系和设计基于软锚的自监督学习模块，能够处理参考数据中缺失的新细胞类型的细粒度语义知识，并有效处理批次效应和细胞类型偏移 | 现有方法很少探索参考数据中缺失的新细胞类型的细粒度语义知识，并且通常容易受到已知细胞类型分类中的批次效应影响 | 提出一种新的任务和算法框架，以改进单细胞RNA测序数据的细胞类型注释和发现 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释和发现 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | scGAD | 单细胞RNA测序数据 | 大量模拟数据集和真实数据集 |
| 4557 | 2024-08-05 |
Targeting the metastatic niche: Single-cell lineage tracing in prime time
2023-Mar-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106174
PMID:36895653
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观点 | 本文探讨了在癌症转移背景下，单细胞谱系追踪与CRISPR-Cas9的结合应用于药物开发的潜力 | 提出结合单细胞转录组学与CRISPR-Cas9的谱系追踪平台，以探索癌症转移中的新机制 | 未详细提供实验数据和具体案例，主要为理论探讨 | 研究单细胞谱系追踪在肿瘤药物开发中的重要性及其潜力 | 探索与癌症转移相关的药物靶点及其抗药机制 | 肿瘤学 | 转移性癌症 | CRISPR-Cas9 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 4558 | 2024-08-08 |
Myeloid TLR4 signaling promotes post-injury withdrawal resolution of murine liver fibrosis
2023-Mar-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106220
PMID:36876136
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研究论文 | 本研究探讨了在肝损伤后撤除治疗的情况下，髓系TLR4信号在肝纤维化消退中的作用 | 首次揭示了髓系TLR4信号在肝损伤撤除后促进肝纤维化消退的作用，并发现微生物群依赖性的消退延迟现象 | NA | 阐明肝纤维化在肝损伤撤除后的消退机制 | 小鼠肝纤维化模型中的髓系TLR4信号 | NA | 肝纤维化 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 两个小鼠模型 |
| 4559 | 2024-08-08 |
Echinacea purpurea-derived homogeneous polysaccharide exerts anti-tumor efficacy via facilitating M1 macrophage polarization
2023-Mar-13, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2023.100391
PMID:36873268
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研究论文 | 本文研究了从紫锥菊中提取的均质多糖EPPA通过促进M1巨噬细胞极化发挥抗肿瘤作用 | 首次从紫锥菊中分离并纯化出一种新型均质多糖EPPA，并揭示了其通过激活炎症小体和重编程转录组及代谢谱来促进M1巨噬细胞极化的机制 | NA | 探讨紫锥菊提取的均质多糖EPPA的抗肿瘤机制 | 紫锥菊提取的均质多糖EPPA及其对肿瘤微环境中免疫细胞的影响 | NA | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 4560 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics uncovers the differentiation of a subset of murine esophageal progenitors into taste buds in vivo
2023-03-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add9135
PMID:36888721
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠食道祖细胞向味蕾的分化过程 | 首次发现食道味蕾的特定细胞组成及其来源于鳞状双能祖细胞 | 主要研究对象为小鼠，结果可能对其他物种不适用 | 探究小鼠食道的祖细胞及其向味蕾分化的机制 | 小鼠食道的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |