单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 4401 - 4420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4401 | 2024-08-08 |
A novel myeloid cell marker genes related signature can indicate immune infiltration and predict prognosis of hepatocellular carcinoma: Integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1118377
PMID:36959981
|
研究论文 | 通过整合分析大量和单细胞RNA测序数据，开发了一种与骨髓细胞标记基因相关的特征，用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫浸润水平 | 首次定义了317个与肝细胞癌相关的骨髓细胞标记基因，并构建了一个八基因特征，用于预测患者的生存风险和免疫浸润水平 | NA | 研究肿瘤相关骨髓细胞相关基因与肝细胞癌的关联 | 肝细胞癌患者的骨髓细胞标记基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | LASSO Cox方法 | RNA数据 | 使用了来自TCGA和ICGC数据集的肝细胞癌样本 |
| 4402 | 2024-08-08 |
The Identification of Immune-Related Biomarkers for Osteoarthritis Immunotherapy Based on Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2023, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2023/5574636
PMID:36960385
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别与骨关节炎免疫治疗相关的生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序分析探索骨关节炎的免疫相关生物标志物，并发现VEGFA可能作为骨关节炎的新生物标志物 | 研究仅基于GEO数据库中的RNA测序数据，样本量和数据来源有限 | 探索骨关节炎的新生物标志物，为骨关节炎的诊断和治疗提供新方向 | 骨关节炎患者的滑膜组织 | 基因组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 4403 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of cell heterogeneity in the sex difference in primary hyperparathyroidism
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1165890
PMID:36960393
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术探讨了原发性甲状旁腺功能亢进症（PHPT）患者性别间甲状旁腺组织细胞的差异 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了PHPT中性别差异与甲状旁腺细胞异质性的关系 | 未提及具体的研究局限性 | 探索男女PHPT患者甲状旁腺组织细胞的差异 | PHPT患者的甲状旁腺组织细胞 | 数字病理学 | 内分泌疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达谱 | 来自男女PHPT患者的甲状旁腺组织样本 |
| 4404 | 2024-08-08 |
Corrigendum: Single-cell transcriptome analysis reveals the metabolic changes and the prognostic value of malignant hepatocyte subpopulations and predict new therapeutic agents for hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1162375
PMID:36969048
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4405 | 2024-08-08 |
Differentiation-related genes in tumor-associated macrophages as potential prognostic biomarkers in non-small cell lung cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1123840
PMID:36969247
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研究论文 | 本研究评估了肿瘤相关巨噬细胞中的分化相关基因（DRGs）在非小细胞肺癌（NSCLC）中的作用 | 首次探讨了肿瘤相关巨噬细胞中分化相关基因作为非小细胞肺癌的潜在预后生物标志物 | NA | 评估分化相关基因在肿瘤相关巨噬细胞中的作用及其作为非小细胞肺癌预后生物标志物的潜力 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤相关巨噬细胞中的分化相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 分析了来自TCGA、UCSC和GEO数据库的数据，涉及1,738个分化相关基因 |
| 4406 | 2024-08-08 |
Integrating RNA-seq and scRNA-seq to explore the mechanism of macrophage ferroptosis associated with COPD
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1139137
PMID:36969832
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研究论文 | 本研究探讨巨噬细胞铁死亡与慢性阻塞性肺疾病（COPD）发病机制的关联 | 首次通过整合RNA测序和单细胞RNA测序数据，识别与COPD相关的巨噬细胞铁死亡相关基因，并筛选出潜在的生物标志物SOCS1和HSPB1 | NA | 揭示巨噬细胞铁死亡在COPD中的重要作用，并探索新的治疗靶点 | 巨噬细胞铁死亡与COPD的关联 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 人工神经网络 | 基因表达数据 | 涉及COPD患者的RNA测序和单细胞RNA测序数据 |
| 4407 | 2024-08-08 |
Histone demethylase KDM4B contributes to advanced clear cell renal carcinoma and association with copy number variations and cell cycle progression
2023-12, Epigenetics
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/15592294.2023.2192319
PMID:36952476
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研究论文 | 本文研究了组蛋白去甲基化酶KDM4B在透明细胞肾细胞癌中的作用及其与拷贝数变异和细胞周期进展的关联 | 首次阐明了KDM4B在透明细胞肾细胞癌中的作用，并探讨了其与拷贝数变异和细胞周期进展的关系 | NA | 探讨KDM4B在透明细胞肾细胞癌中的作用及其与疾病进展和预后的关系 | KDM4B在透明细胞肾细胞癌中的表达及其对细胞增殖、迁移和肿瘤生长与转移的影响 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 免疫组化染色, 细胞计数试剂盒-8 (CCK-8) 测定, Transwell 实验, 异种移植模型, 单细胞RNA测序 | NA | 组织, 病理切片, 细胞系 | 新鲜组织和病理切片样本, 多个细胞系, 异种移植模型 |
| 4408 | 2024-08-05 |
GoM DE: interpreting structure in sequence count data with differential expression analysis allowing for grades of membership
2023-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.03.531029
PMID:36945441
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研究论文 | 本文扩展了差异表达分析方法，以允许细胞部分归属于多个组，称为会员等级差异表达（GoM DE） | 该研究通过GoM DE方法改进了单细胞测序数据集中结构的解释能力，尤其是在处理部分归属的细胞时 | 本文未明确讨论方法在其他类型测序数据集上的适用性 | 研究旨在提高对单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据集中各主题的注释能力 | 主要研究单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据集 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq | NA | 序列计数数据 | NA |
| 4409 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling reveals Müller glia coordinate retinal intercellular communication during light/dark adaptation via thyroid hormone signaling
2023-08-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwad007
PMID:36930538
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠视网膜在光照与黑暗适应过程中的细胞类型特异性转录组变化 | 首次揭示了Müller胶质细胞在光照与黑暗适应过程中通过甲状腺激素信号协调视网膜细胞间通讯的作用 | NA | 探究视网膜细胞在光照与黑暗适应过程中的细胞和分子水平上的相互作用 | 小鼠视网膜细胞在光照与黑暗适应过程中的转录组变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠视网膜细胞 |
| 4410 | 2024-08-05 |
RHAMM marks proliferative subpopulation of human colorectal cancer stem cells
2023-Jul, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15795
PMID:36945114
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研究论文 | 本研究报告了RHAMM在结直肠癌干细胞亚群中的表达 | 发现RHAMM作为结直肠癌干细胞特定标记物，能够识别具有高度增殖特性的细胞亚群 | 未在不同类型的肿瘤中验证RHAMM的作用 | 识别结直肠癌干细胞的特征分子以理解肿瘤异质性 | 探讨人结直肠癌组织中的RHAMM+CD44+细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | 类器官模型 | 细胞 | 人结直肠癌组织中的RHAMM+CD44+细胞 |
| 4411 | 2024-08-08 |
Multiple Fibroblast Subtypes Contribute to Matrix Deposition in Pulmonary Fibrosis
2023-07, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0292OC
PMID:36927333
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了肺纤维化模型中不同成纤维细胞亚型的基因特征，并探讨了它们在肺纤维化中的作用 | 首次确认了多种成纤维细胞亚型在肺纤维化中的作用，并识别了特定细胞表面蛋白，有助于开发针对肺纤维化的治疗策略 | NA | 探讨成纤维细胞亚型在肺纤维化中的作用，并为开发治疗肺纤维化的药物提供新思路 | 肺纤维化模型中的成纤维细胞亚型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠模型和人类肺纤维化疾病样本 |
| 4412 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analyses reveal cellular and molecular patterns of rubber tree response to early powdery mildew infection
2023-07, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.14585
PMID:36929646
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了橡胶树叶片在白粉病早期感染过程中的转录组变化 | 首次构建了橡胶树叶片的单细胞图谱，并揭示了白粉病感染下细胞群的独特基因表达模式 | NA | 探究橡胶树在白粉病早期感染下的细胞和分子响应机制 | 橡胶树叶片在白粉病感染下的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及10种细胞类型 |
| 4413 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling identifies a novel human polyclonal unconventional T cell lineage
2023-06-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20220942
PMID:36939517
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术，鉴定了人类血液中一种新的多克隆非传统T细胞系 | 首次在人类血液中发现并描述了一种新的非传统T细胞系，该细胞系具有独特的转录组特征和多克隆TCR谱 | NA | 鉴定和描述人类血液中的非传统T细胞系 | 非传统T细胞系及其在血液和肠道组织中的分布 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 4414 | 2024-08-08 |
CCL5-producing migratory dendritic cells guide CCR5+ monocytes into the draining lymph nodes
2023-06-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20222129
PMID:36946983
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研究论文 | 研究探讨了树突状细胞（DCs）和单核细胞在淋巴结中的迁移机制，特别是CCL5产生的迁移性树突状细胞如何引导CCR5+单核细胞进入引流淋巴结（LNs）。 | 首次揭示了迁移性树突状细胞通过分泌CCL5引导CCR5+单核细胞进入淋巴结的机制。 | 研究主要集中在稳态和吸入多种病原体相关分子模式（PAMPs）后的情况，未涵盖所有可能的生理和病理条件。 | 阐明树突状细胞和单核细胞在淋巴结中的迁移和功能机制。 | 树突状细胞（DCs）和单核细胞在淋巴结中的迁移和功能。 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及多种基因缺陷小鼠模型 |
| 4415 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Unifies Developmental Programs of Esophageal and Gastric Intestinal Metaplasia
2023-06-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-0824
PMID:36929873
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序构建了整个胃肠道的图谱，包括生理正常和病理状态，以研究食管和胃的肠上皮化生的发展轨迹。 | 本文首次展示了食管和胃的肠上皮化生共享分子特征，并提出了这些病变在分子水平上的相似性，为共同的检测和治疗策略提供了可能。 | NA | 研究食管和胃的肠上皮化生的发展轨迹及其分子相似性。 | 食管和胃的肠上皮化生（BE-IM和GIM）及其相关病理状态。 | 数字病理学 | 胃肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及整个胃肠道的生理正常和病理状态样本 |
| 4416 | 2024-08-05 |
IL-6 in the infarcted heart is preferentially formed by fibroblasts and modulated by purinergic signaling
2023-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI163799
PMID:36943408
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研究论文 | 本文研究了心肌梗死后IL-6的主要来源及其调节机制。 | 发现心脏成纤维细胞是IL-6的主要来源，并揭示了腺苷信号在IL-6产生中的调节作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，缺乏大规模临床数据支持。 | 本研究旨在探讨心肌梗死后IL-6的细胞来源及其调节机制。 | 研究对象为小鼠和人类心肌梗死后的心脏细胞。 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 蛋白质，RNA | 小鼠和人类心脏样本 |
| 4417 | 2024-08-05 |
DNER and GNL2 are differentially m6A methylated in periodontitis in comparison with periodontal health revealed by m6A microarray of human gingival tissue and transcriptomic analysis
2023-Jun, Journal of periodontal research
IF:3.4Q1
DOI:10.1111/jre.13117
PMID:36941720
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研究论文 | 这项研究旨在探讨牙周炎患者与健康对照者之间牙龈组织中N6-甲基腺苷（m6A）甲基化的表观基因组模式差异，并识别潜在生物标志物 | 本研究揭示了独特的m6A表观转录组，识别并验证了两个与牙周炎相关的生物标志物（DNER和GNL2） | 本研究的样本数量有限，仅包括八名参与者，可能影响结果的普遍性 | 研究牙周炎与健康之间牙龈组织中m6A甲基化的差异 | 研究对象为诊断为牙周炎的患者及健康对照者 | 数字病理 | 牙周炎 | m6A微阵列 | NA | 基因表达数据 | 8名参与者（4名牙周炎患者和4名健康对照者） |
| 4418 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing reveals the transcriptional landscape of ND-42 mediated spermatid elongation via mitochondrial derivative maintenance in Drosophila testes
2023-06, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2023.102671
PMID:36933391
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了ND-42通过维持线粒体衍生物在果蝇睾丸中精子细胞伸长的转录景观 | 首次揭示了ND-42在精子细胞伸长过程中对线粒体衍生物维持的新型调控机制 | NA | 探究果蝇精子细胞伸长过程中线粒体的调控机制 | 果蝇睾丸中的精子细胞和线粒体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15个不同的细胞集群 |
| 4419 | 2024-08-08 |
Mural cell composition and functional analysis in the healing process of human gingiva from periodontal intrabony defects
2023-Jun, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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研究论文 | 评估人类牙龈组织中壁细胞群的组成和功能 | 识别并确认了两种壁细胞亚群，RGS5+THY1+和ACTA2+MYH11+，并通过单细胞RNA测序和组织学染色进行了验证 | 研究样本仅限于七名牙周炎（Ⅲ期）患者，可能影响结果的普遍性 | 研究牙龈组织愈合过程中壁细胞的组成和功能 | 人类牙龈组织中的壁细胞 | NA | 牙周病 | 单细胞RNA测序（10X基因组学） | NA | 基因表达数据 | 七名牙周炎（Ⅲ期）患者 |
| 4420 | 2024-08-05 |
A universal framework for single-cell multi-omics data integration with graph convolutional networks
2023-05-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad081
PMID:36929841
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研究论文 | 本研究提出了一种基于图卷积网络的单细胞多组学数据整合的通用框架 | 创新性地提出了GCN-SC框架，利用互近邻算法和图卷积网络有效整合不同的单细胞组学数据 | 未提及特定的局限性 | 旨在解决单细胞多组学数据整合中的挑战 | 涉及六个不同的单细胞数据集 | 数字病理学 | NA | 图卷积网络 | GCN | 单细胞组学数据 | 六个数据集 |