单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 4381 - 4400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4381 | 2024-08-05 |
Gene expression in organoids: an expanding horizon
2023-03-25, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-023-00360-2
PMID:36964575
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综述 | 本文回顾了对类器官进行基因表达研究的最新进展和技术 | 介绍了利用单细胞转录组学和染色质可及性分析等最新多组学技术来研究类器官 | 类器官培养和处理的复杂性和异质性带来了挑战 | 探讨类器官作为发育模型和精准医学平台的研究 | 人体来源的多种组织衍生的类器官 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组学和染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4382 | 2024-08-05 |
Cuproptosis correlates with immunosuppressive tumor microenvironment based on pan-cancer multiomics and single-cell sequencing analysis
2023-03-24, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01752-8
PMID:36959665
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研究论文 | 本研究分析了cuproptosis在全癌症中的表达差异及其与肿瘤微环境的关系 | 首次系统性地揭示了cuproptosis相关基因在不同肿瘤中的表达和突变情况，及其与免疫逃逸的相关性 | 目前的研究还未能全面解析cuproptosis在肿瘤发生和发展的具体机制 | 探讨cuproptosis在肿瘤发生、进展及预后中的作用 | 研究对象为不同类型癌症中的cuproptosis相关基因及其表达情况 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq), 单样本基因集富集分析 (ssGSEA), 免疫组化 (IHC) | NA | 基因组数据 | 涉及多种肿瘤类型，具体样本数量未明确说明 |
| 4383 | 2024-08-08 |
RevGel-seq: instrument-free single-cell RNA sequencing using a reversible hydrogel for cell-specific barcoding
2023-03-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-31915-y
PMID:36964177
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研究论文 | 介绍了一种名为RevGel-seq的新型单细胞RNA测序技术，该技术使用可逆水凝胶进行细胞特异性条形码标记，无需仪器辅助 | RevGel-seq技术通过化学连接剂稳定单细胞与条形码珠的复合体，并在液态水凝胶中分散，无需纳米孔或液滴即可实现细胞的固定和物理分离 | 目前的凝胶设备处理的标准分析范围在10,000个输入细胞，可能限制了大规模研究的应用 | 开发一种无需仪器辅助的单细胞RNA测序技术，以提高实验设计的灵活性和样本处理的时效性 | 新鲜细胞样本，包括外周血单核细胞（PBMC）、胰腺胰岛细胞和心肌细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 分析范围在10,000个输入细胞 |
| 4384 | 2024-08-08 |
MicroRNA-223 Dampens Pulmonary Inflammation during Pneumococcal Pneumonia
2023-03-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12060959
PMID:36980300
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研究论文 | 研究微小RNA-223在肺炎链球菌性肺炎中调节肺部炎症的作用 | 首次探讨了微小RNA-223在肺炎链球菌性肺炎中的作用，并揭示了其在调节中性粒细胞相关炎症反应中的关键角色 | 研究主要基于小鼠模型和肺炎患者的血清样本，可能需要进一步的人体临床试验验证 | 理解微小RNA-223在肺炎链球菌性肺炎中调节肺部炎症的作用 | 肺炎链球菌性肺炎患者和小鼠模型 | NA | 肺部疾病 | 微小RNA测定，单细胞转录组分析 | NA | 血清，肺组织 | 包括肺炎患者和健康个体的血清样本，以及野生型和微小RNA-223敲除小鼠的肺组织 |
| 4385 | 2024-08-05 |
Current Status and Prospects of the Single-Cell Sequencing Technologies for Revealing the Pathogenesis of Pregnancy-Associated Disorders
2023-03-20, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14030756
PMID:36981026
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在分析正常妊娠和妊娠并发症中的应用 | 该文章讨论了单细胞RNA测序在研究妊娠相关疾病发病机制中的应用和潜力 | 文章中提到单细胞技术和数据分析方法的主要原则、优势和局限性 | 研究与妊娠相关疾病的发病机制及其基因表达变化 | 各种细胞类型及其在妊娠和妊娠并发症中的基因表达变化 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4386 | 2024-08-08 |
Integrating Multiple Single-Cell RNA Sequencing Datasets Using Adversarial Autoencoders
2023-Mar-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24065502
PMID:36982574
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研究论文 | 本文提出了一种名为IMAAE的新型深度学习模型，用于整合多个单细胞RNA测序数据集并校正批次效应 | IMAAE模型利用对抗自编码器来更好地利用已知标签，提高了批次校正方法的性能，特别是在多细胞类型的情况下 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据集的整合和批次效应校正 | 单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | RNA测序 | 对抗自编码器 | 基因表达数据 | 多个数据集 |
| 4387 | 2024-08-08 |
Novel Potential Markers of Myofibroblast Differentiation Revealed by Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Mesenchymal Stromal Cells in Profibrotic and Adipogenic Conditions
2023-Mar-10, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11030840
PMID:36979822
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了在促纤维化和脂肪生成条件下间充质基质细胞向肌成纤维细胞分化的潜在标记物 | 首次展示了神经调节蛋白（NTM）在人类脂肪组织间充质基质细胞中的表达，并证明了其在肌成纤维细胞分化刺激下的基因表达增加和膜受体聚集 | 需要进一步验证通过组学方法获得的数据，如发现RDH10的检测结果与转录组分析数据相矛盾 | 测试多能细胞向肌成纤维细胞和脂肪细胞分化过程中基因表达模式的激活假设 | 人类脂肪组织间充质基质细胞在肌成纤维细胞或脂肪生成分化刺激后的单细胞RNA测序转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 4388 | 2024-08-08 |
New Insights into the Role of Synovial Fibroblasts Leading to Joint Destruction in Rheumatoid Arthritis
2023-Mar-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24065173
PMID:36982247
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综述 | 本文综述了类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞在关节破坏中的关键作用及其与免疫细胞的相互作用 | 采用单细胞RNA测序等新技术揭示了滑膜成纤维细胞的异质性及其在类风湿性关节炎中的作用 | NA | 探讨滑膜成纤维细胞在类风湿性关节炎关节破坏中的作用及其与免疫细胞的相互作用 | 滑膜成纤维细胞及其在类风湿性关节炎中的作用 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 4389 | 2024-08-08 |
Parallel Dysregulated Immune Response in Severe Forms of COVID-19 and Bacterial Sepsis via Single-Cell Transcriptome Sequencing
2023-Mar-03, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11030778
PMID:36979757
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，研究了COVID-19和细菌性脓毒症重症患者的免疫反应失调情况 | 发现了COVID-19和细菌性脓毒症重症患者在免疫反应上的相似性，并揭示了轻症和重症之间的基因表达差异 | NA | 旨在理解严重感染性疾病（如重症COVID-19或细菌性脓毒症休克）中的免疫机制，以更好地理解患者的临床轨迹和潜在治疗的成功 | COVID-19和细菌性脓毒症的重症患者 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4390 | 2024-08-05 |
Spatiotemporally deciphering the mysterious mechanism of persistent HPV-induced malignant transition and immune remodelling from HPV-infected normal cervix, precancer to cervical cancer: Integrating single-cell RNA-sequencing and spatial transcriptome
2023-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1219
PMID:36967539
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研究论文 | 本研究首次剖析了人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的宫颈癌变的时空机制 | 首次构建了HPV相关宫颈癌发生过程的时空图谱，并发现了三种独特的HPV相关上皮细胞群体及关键节点基因 | 样本量相对较小，仅包括九个患者样本，可能限制了研究结果的普适性 | 揭示持久HPV感染导致的宫颈癌发生机制及免疫重塑过程 | 来自正常宫颈、前体病变及宫颈癌的HPV感染患者样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组 | NA | 基因表达谱 | 九个患者样本，包括两例HPV阴性正常，两例HPV阳性正常，两例HPV阳性高等级鳞状上皮内病变（HSIL）和三例HPV阳性癌症样本 |
| 4391 | 2024-08-05 |
Cell Type Annotation Model Selection: General-Purpose vs. Pattern-Aware Feature Gene Selection in Single-Cell RNA-Seq Data
2023-02-26, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14030596
PMID:36980868
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研究论文 | 本文比较和评估了两种先进的监督方法在单细胞RNA测序数据中的表现 | 首次展示了XGBoost在细胞类型自动注释中的优势，提供了一种更加简单和可扩展的框架 | 缺乏足够的标注数据可能限制了监督技术的应用范围 | 探讨不同的特征选择方法对细胞类型识别的影响 | 比较XGBoost和支持向量机(SVM)在单细胞RNA-Seq数据上的表现 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | XGBoost, SVM | 数据集 | 三个标准scRNA-seq数据集 |
| 4392 | 2024-08-08 |
Cellular Transcriptomics of Carboplatin Resistance in a Metastatic Canine Osteosarcoma Cell Line
2023-02-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14030558
PMID:36980828
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了犬骨肉瘤细胞系对卡铂化疗耐药性的转录组变化 | 首次揭示了化疗耐药性与上皮-间质转化（EMT）样过程的关联 | NA | 旨在理解基于铂的化疗耐药性的本质 | 犬骨肉瘤细胞系 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三个HMPOS衍生的细胞系，包括两个耐药和一个未处理的细胞系 |
| 4393 | 2024-08-05 |
Tissue specific imprinting on innate lymphoid cells during homeostasis and disease process revealed by integrative inference of single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1127413
PMID:36960063
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研究论文 | 这篇文章揭示了固有淋巴细胞在不同组织中的转录特征和异质性 | 本研究首次系统性地探索了在稳态、炎症和肿瘤过程中固有淋巴细胞的组织特异性标记 | 具体的细胞机制和功能尚未在文章中深入探讨 | 研究固有淋巴细胞在不同组织中的表型和转录特征 | 六种不同组织中的人类固有淋巴细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌, 克罗恩病 | 单细胞基因组学 | NA | 基因组数据 | 从六种不同组织中收集的大量固有淋巴细胞 |
| 4394 | 2024-08-05 |
Porcine anti-human lymphocyte immunoglobulin depletes the lymphocyte population to promote successful kidney transplantation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1124790
PMID:36969156
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研究论文 | 本研究探讨了猪抗人淋巴细胞免疫球蛋白在肾移植中的作用及其对淋巴细胞群体的影响 | 首次详细分析了pALG对外周血单核细胞的结合亲和力及其作用机制 | 样本量较小，仅包括12名肾移植受者 | 评估pALG在肾移植患者中对淋巴细胞群体的影响和免疫特征 | 肾移植受者及其对pALG的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序分析 | NA | 血液样本 | 12名肾移植受者 |
| 4395 | 2024-08-05 |
Expression and prognostic value of PRDX family in colon adenocarcinoma by integrating comprehensive analysis and in vitro and in vivo validation
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1136738
PMID:36969053
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研究论文 | 通过综合分析和体外体内验证，探讨了PRDX家族在结肠腺癌中的表达和预后价值 | 首次提出PRDX4在结肠腺癌预后和分期中的重要性，成为潜在的预后标志物 | 研究聚焦于PRDX4，其他PRDX家族成员的作用尚未深入探讨 | 探讨PRDX家族在结肠腺癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 结肠腺癌患者的PRDX家族表达和相关临床数据 | 数字病理学 | 结肠癌 | 多中心数据库分析，体外细胞实验，体内异种移植实验 | NA | 转录表达数据，临床预后数据 | NA |
| 4396 | 2024-08-05 |
RobustTree: An adaptive, robust PCA algorithm for embedded tree structure recovery from single-cell sequencing data
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1110899
PMID:36968591
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研究论文 | 该文章提出了一种名为RobustTree的算法，用于从单细胞测序数据恢复嵌入树结构 | RobustTree通过扩展鲁棒主成分分析（RPCA）处理树结构优化，并提出了一种自适应参数选择方案来解决树优化问题 | NA | 研究如何从嘈杂和异质的单细胞测序数据中恢复内在的拓扑结构 | 生物过程中的树结构，如细胞发育轨迹和肿瘤进化历史 | 数字病理学 | NA | 鲁棒主成分分析（RPCA） | NA | 高维数据 | 应用于多个合成和真实数据集 |
| 4397 | 2024-08-05 |
TOX regulates T lymphocytes differentiation and its function in tumor
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.990419
PMID:36969216
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研究论文 | 本研究探讨了TOX在肿瘤中调节T淋巴细胞分化及其功能 | 揭示了TOX在不同T淋巴细胞发展阶段的异质性，并探讨了其对T淋巴细胞活化和衰竭的调节作用 | NA | 深入理解T淋巴细胞的发育阶段和功能特征 | T淋巴细胞及其发育阶段的异质性 | 数字病理学 | 肿瘤疾病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 4398 | 2024-08-05 |
Cervical cancer immune infiltration microenvironment identification, construction of immune scores, assisting patient prognosis and immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1135657
PMID:36969161
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研究论文 | 本研究系统评估了 cervical cancer 的免疫微环境，并建立了免疫细胞浸润评分系统和关键基因的识别 | 建立了免疫细胞浸润评分系统，筛选出三个关键基因与 cervical cancer 的免疫微环境相关联 | 研究对 cervical cancer 免疫浸润环境的系统性研究仍有不足 | 评估宫颈癌的肿瘤免疫微环境，并构建免疫细胞浸润评分系统 | 宫颈癌的免疫细胞群体和关键免疫相关基因 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 结合了 TCGA 和 GEO 数据集 |
| 4399 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of nicotinamide metabolism-related signature for predicting prognosis and immunotherapy response in breast cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1145552
PMID:36969219
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研究论文 | 该文章开发了一种与烟酰胺代谢相关的特征以预测乳腺癌患者的预后和免疫治疗响应 | 开发了一种新的6基因烟酰胺代谢相关特征（NMRS），并证明其作为独立指标与乳腺癌预后显著相关 | 在样本外验证和临床应用中的局限性未被详细讨论 | 研究烟酰胺代谢如何影响乳腺癌患者的生存、肿瘤微环境和治疗效果 | 研究对象为乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 基因表达分析 | Cox回归模型 | 转录组数据 | 数据来自TCGA和ICGC等多个数据库，具体样本数量未详述 |
| 4400 | 2024-08-05 |
Bulk and single-cell transcriptome analyses of islet tissue unravel gene signatures associated with pyroptosis and immune infiltration in type 2 diabetes
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1132194
PMID:36967805
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研究论文 | 本文探讨了与2型糖尿病中焦亡和免疫浸润相关的基因特征 | 首次揭示了焦亡相关基因与免疫细胞在2型糖尿病胰岛功能障碍中的作用 | 缺乏对焦亡与免疫细胞在2型糖尿病中作用的更广泛的临床验证 | 探索与2型糖尿病相关的焦亡和免疫浸润的关键基因和通路 | 研究对象为2型糖尿病患者的胰岛组织样本 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 1892个胰岛样本 |