单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5352 篇文献，本页显示第 4381 - 4400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4381 | 2024-08-08 |
Parallel Dysregulated Immune Response in Severe Forms of COVID-19 and Bacterial Sepsis via Single-Cell Transcriptome Sequencing
2023-Mar-03, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11030778
PMID:36979757
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，研究了COVID-19和细菌性脓毒症重症患者的免疫反应失调情况 | 发现了COVID-19和细菌性脓毒症重症患者在免疫反应上的相似性，并揭示了轻症和重症之间的基因表达差异 | NA | 旨在理解严重感染性疾病（如重症COVID-19或细菌性脓毒症休克）中的免疫机制，以更好地理解患者的临床轨迹和潜在治疗的成功 | COVID-19和细菌性脓毒症的重症患者 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4382 | 2024-08-05 |
Spatiotemporally deciphering the mysterious mechanism of persistent HPV-induced malignant transition and immune remodelling from HPV-infected normal cervix, precancer to cervical cancer: Integrating single-cell RNA-sequencing and spatial transcriptome
2023-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1219
PMID:36967539
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研究论文 | 本研究首次剖析了人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的宫颈癌变的时空机制 | 首次构建了HPV相关宫颈癌发生过程的时空图谱，并发现了三种独特的HPV相关上皮细胞群体及关键节点基因 | 样本量相对较小，仅包括九个患者样本，可能限制了研究结果的普适性 | 揭示持久HPV感染导致的宫颈癌发生机制及免疫重塑过程 | 来自正常宫颈、前体病变及宫颈癌的HPV感染患者样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组 | NA | 基因表达谱 | 九个患者样本，包括两例HPV阴性正常，两例HPV阳性正常，两例HPV阳性高等级鳞状上皮内病变（HSIL）和三例HPV阳性癌症样本 |
| 4383 | 2024-08-05 |
Cell Type Annotation Model Selection: General-Purpose vs. Pattern-Aware Feature Gene Selection in Single-Cell RNA-Seq Data
2023-02-26, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14030596
PMID:36980868
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研究论文 | 本文比较和评估了两种先进的监督方法在单细胞RNA测序数据中的表现 | 首次展示了XGBoost在细胞类型自动注释中的优势，提供了一种更加简单和可扩展的框架 | 缺乏足够的标注数据可能限制了监督技术的应用范围 | 探讨不同的特征选择方法对细胞类型识别的影响 | 比较XGBoost和支持向量机(SVM)在单细胞RNA-Seq数据上的表现 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | XGBoost, SVM | 数据集 | 三个标准scRNA-seq数据集 |
| 4384 | 2024-08-08 |
Cellular Transcriptomics of Carboplatin Resistance in a Metastatic Canine Osteosarcoma Cell Line
2023-02-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14030558
PMID:36980828
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了犬骨肉瘤细胞系对卡铂化疗耐药性的转录组变化 | 首次揭示了化疗耐药性与上皮-间质转化（EMT）样过程的关联 | NA | 旨在理解基于铂的化疗耐药性的本质 | 犬骨肉瘤细胞系 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三个HMPOS衍生的细胞系，包括两个耐药和一个未处理的细胞系 |
| 4385 | 2024-08-05 |
Tissue specific imprinting on innate lymphoid cells during homeostasis and disease process revealed by integrative inference of single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1127413
PMID:36960063
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研究论文 | 这篇文章揭示了固有淋巴细胞在不同组织中的转录特征和异质性 | 本研究首次系统性地探索了在稳态、炎症和肿瘤过程中固有淋巴细胞的组织特异性标记 | 具体的细胞机制和功能尚未在文章中深入探讨 | 研究固有淋巴细胞在不同组织中的表型和转录特征 | 六种不同组织中的人类固有淋巴细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌, 克罗恩病 | 单细胞基因组学 | NA | 基因组数据 | 从六种不同组织中收集的大量固有淋巴细胞 |
| 4386 | 2024-08-05 |
Porcine anti-human lymphocyte immunoglobulin depletes the lymphocyte population to promote successful kidney transplantation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1124790
PMID:36969156
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研究论文 | 本研究探讨了猪抗人淋巴细胞免疫球蛋白在肾移植中的作用及其对淋巴细胞群体的影响 | 首次详细分析了pALG对外周血单核细胞的结合亲和力及其作用机制 | 样本量较小，仅包括12名肾移植受者 | 评估pALG在肾移植患者中对淋巴细胞群体的影响和免疫特征 | 肾移植受者及其对pALG的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序分析 | NA | 血液样本 | 12名肾移植受者 |
| 4387 | 2024-08-05 |
Expression and prognostic value of PRDX family in colon adenocarcinoma by integrating comprehensive analysis and in vitro and in vivo validation
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1136738
PMID:36969053
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研究论文 | 通过综合分析和体外体内验证，探讨了PRDX家族在结肠腺癌中的表达和预后价值 | 首次提出PRDX4在结肠腺癌预后和分期中的重要性，成为潜在的预后标志物 | 研究聚焦于PRDX4，其他PRDX家族成员的作用尚未深入探讨 | 探讨PRDX家族在结肠腺癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 结肠腺癌患者的PRDX家族表达和相关临床数据 | 数字病理学 | 结肠癌 | 多中心数据库分析，体外细胞实验，体内异种移植实验 | NA | 转录表达数据，临床预后数据 | NA |
| 4388 | 2024-08-05 |
RobustTree: An adaptive, robust PCA algorithm for embedded tree structure recovery from single-cell sequencing data
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1110899
PMID:36968591
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研究论文 | 该文章提出了一种名为RobustTree的算法，用于从单细胞测序数据恢复嵌入树结构 | RobustTree通过扩展鲁棒主成分分析（RPCA）处理树结构优化，并提出了一种自适应参数选择方案来解决树优化问题 | NA | 研究如何从嘈杂和异质的单细胞测序数据中恢复内在的拓扑结构 | 生物过程中的树结构，如细胞发育轨迹和肿瘤进化历史 | 数字病理学 | NA | 鲁棒主成分分析（RPCA） | NA | 高维数据 | 应用于多个合成和真实数据集 |
| 4389 | 2024-08-05 |
TOX regulates T lymphocytes differentiation and its function in tumor
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.990419
PMID:36969216
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研究论文 | 本研究探讨了TOX在肿瘤中调节T淋巴细胞分化及其功能 | 揭示了TOX在不同T淋巴细胞发展阶段的异质性，并探讨了其对T淋巴细胞活化和衰竭的调节作用 | NA | 深入理解T淋巴细胞的发育阶段和功能特征 | T淋巴细胞及其发育阶段的异质性 | 数字病理学 | 肿瘤疾病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 4390 | 2024-08-05 |
Cervical cancer immune infiltration microenvironment identification, construction of immune scores, assisting patient prognosis and immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1135657
PMID:36969161
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研究论文 | 本研究系统评估了 cervical cancer 的免疫微环境，并建立了免疫细胞浸润评分系统和关键基因的识别 | 建立了免疫细胞浸润评分系统，筛选出三个关键基因与 cervical cancer 的免疫微环境相关联 | 研究对 cervical cancer 免疫浸润环境的系统性研究仍有不足 | 评估宫颈癌的肿瘤免疫微环境，并构建免疫细胞浸润评分系统 | 宫颈癌的免疫细胞群体和关键免疫相关基因 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 结合了 TCGA 和 GEO 数据集 |
| 4391 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of nicotinamide metabolism-related signature for predicting prognosis and immunotherapy response in breast cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1145552
PMID:36969219
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研究论文 | 该文章开发了一种与烟酰胺代谢相关的特征以预测乳腺癌患者的预后和免疫治疗响应 | 开发了一种新的6基因烟酰胺代谢相关特征（NMRS），并证明其作为独立指标与乳腺癌预后显著相关 | 在样本外验证和临床应用中的局限性未被详细讨论 | 研究烟酰胺代谢如何影响乳腺癌患者的生存、肿瘤微环境和治疗效果 | 研究对象为乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 基因表达分析 | Cox回归模型 | 转录组数据 | 数据来自TCGA和ICGC等多个数据库，具体样本数量未详述 |
| 4392 | 2024-08-05 |
Bulk and single-cell transcriptome analyses of islet tissue unravel gene signatures associated with pyroptosis and immune infiltration in type 2 diabetes
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1132194
PMID:36967805
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研究论文 | 本文探讨了与2型糖尿病中焦亡和免疫浸润相关的基因特征 | 首次揭示了焦亡相关基因与免疫细胞在2型糖尿病胰岛功能障碍中的作用 | 缺乏对焦亡与免疫细胞在2型糖尿病中作用的更广泛的临床验证 | 探索与2型糖尿病相关的焦亡和免疫浸润的关键基因和通路 | 研究对象为2型糖尿病患者的胰岛组织样本 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 1892个胰岛样本 |
| 4393 | 2024-08-08 |
A novel myeloid cell marker genes related signature can indicate immune infiltration and predict prognosis of hepatocellular carcinoma: Integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1118377
PMID:36959981
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研究论文 | 通过整合分析大量和单细胞RNA测序数据，开发了一种与骨髓细胞标记基因相关的特征，用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫浸润水平 | 首次定义了317个与肝细胞癌相关的骨髓细胞标记基因，并构建了一个八基因特征，用于预测患者的生存风险和免疫浸润水平 | NA | 研究肿瘤相关骨髓细胞相关基因与肝细胞癌的关联 | 肝细胞癌患者的骨髓细胞标记基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | LASSO Cox方法 | RNA数据 | 使用了来自TCGA和ICGC数据集的肝细胞癌样本 |
| 4394 | 2024-08-08 |
The Identification of Immune-Related Biomarkers for Osteoarthritis Immunotherapy Based on Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2023, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2023/5574636
PMID:36960385
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别与骨关节炎免疫治疗相关的生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序分析探索骨关节炎的免疫相关生物标志物，并发现VEGFA可能作为骨关节炎的新生物标志物 | 研究仅基于GEO数据库中的RNA测序数据，样本量和数据来源有限 | 探索骨关节炎的新生物标志物，为骨关节炎的诊断和治疗提供新方向 | 骨关节炎患者的滑膜组织 | 基因组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 4395 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of cell heterogeneity in the sex difference in primary hyperparathyroidism
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1165890
PMID:36960393
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术探讨了原发性甲状旁腺功能亢进症（PHPT）患者性别间甲状旁腺组织细胞的差异 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了PHPT中性别差异与甲状旁腺细胞异质性的关系 | 未提及具体的研究局限性 | 探索男女PHPT患者甲状旁腺组织细胞的差异 | PHPT患者的甲状旁腺组织细胞 | 数字病理学 | 内分泌疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达谱 | 来自男女PHPT患者的甲状旁腺组织样本 |
| 4396 | 2024-08-08 |
Corrigendum: Single-cell transcriptome analysis reveals the metabolic changes and the prognostic value of malignant hepatocyte subpopulations and predict new therapeutic agents for hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1162375
PMID:36969048
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4397 | 2024-08-08 |
Differentiation-related genes in tumor-associated macrophages as potential prognostic biomarkers in non-small cell lung cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1123840
PMID:36969247
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研究论文 | 本研究评估了肿瘤相关巨噬细胞中的分化相关基因（DRGs）在非小细胞肺癌（NSCLC）中的作用 | 首次探讨了肿瘤相关巨噬细胞中分化相关基因作为非小细胞肺癌的潜在预后生物标志物 | NA | 评估分化相关基因在肿瘤相关巨噬细胞中的作用及其作为非小细胞肺癌预后生物标志物的潜力 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤相关巨噬细胞中的分化相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 分析了来自TCGA、UCSC和GEO数据库的数据，涉及1,738个分化相关基因 |
| 4398 | 2024-08-08 |
Integrating RNA-seq and scRNA-seq to explore the mechanism of macrophage ferroptosis associated with COPD
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1139137
PMID:36969832
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研究论文 | 本研究探讨巨噬细胞铁死亡与慢性阻塞性肺疾病（COPD）发病机制的关联 | 首次通过整合RNA测序和单细胞RNA测序数据，识别与COPD相关的巨噬细胞铁死亡相关基因，并筛选出潜在的生物标志物SOCS1和HSPB1 | NA | 揭示巨噬细胞铁死亡在COPD中的重要作用，并探索新的治疗靶点 | 巨噬细胞铁死亡与COPD的关联 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 人工神经网络 | 基因表达数据 | 涉及COPD患者的RNA测序和单细胞RNA测序数据 |
| 4399 | 2024-08-08 |
Histone demethylase KDM4B contributes to advanced clear cell renal carcinoma and association with copy number variations and cell cycle progression
2023-12, Epigenetics
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/15592294.2023.2192319
PMID:36952476
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研究论文 | 本文研究了组蛋白去甲基化酶KDM4B在透明细胞肾细胞癌中的作用及其与拷贝数变异和细胞周期进展的关联 | 首次阐明了KDM4B在透明细胞肾细胞癌中的作用，并探讨了其与拷贝数变异和细胞周期进展的关系 | NA | 探讨KDM4B在透明细胞肾细胞癌中的作用及其与疾病进展和预后的关系 | KDM4B在透明细胞肾细胞癌中的表达及其对细胞增殖、迁移和肿瘤生长与转移的影响 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 免疫组化染色, 细胞计数试剂盒-8 (CCK-8) 测定, Transwell 实验, 异种移植模型, 单细胞RNA测序 | NA | 组织, 病理切片, 细胞系 | 新鲜组织和病理切片样本, 多个细胞系, 异种移植模型 |
| 4400 | 2024-08-05 |
GoM DE: interpreting structure in sequence count data with differential expression analysis allowing for grades of membership
2023-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.03.531029
PMID:36945441
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研究论文 | 本文扩展了差异表达分析方法，以允许细胞部分归属于多个组，称为会员等级差异表达（GoM DE） | 该研究通过GoM DE方法改进了单细胞测序数据集中结构的解释能力，尤其是在处理部分归属的细胞时 | 本文未明确讨论方法在其他类型测序数据集上的适用性 | 研究旨在提高对单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据集中各主题的注释能力 | 主要研究单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据集 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq | NA | 序列计数数据 | NA |