单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5351 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-12-08 |
Chrna5 and lynx prototoxins identify acetylcholine super-responder subplate neurons
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.105992
PMID:36798433
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研究论文 | 研究通过复杂转基因小鼠模型探索Chrna5+神经元及其对内源性乙酰胆碱的敏感性，发现Chrna5+神经元中存在乙酰胆碱超反应者亚群，并利用单细胞转录组学揭示了其分子标记 | 首次发现Chrna5+神经元中的乙酰胆碱超反应者亚群，并确定了其独特的GPI锚定lynx原毒素基因表达模式 | NA | 探索Chrna5+神经元及其对内源性乙酰胆碱的敏感性，揭示其在注意力障碍中的潜在作用 | Chrna5+神经元及其对乙酰胆碱的反应 | 神经科学 | 注意力障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 复杂转基因小鼠模型 |
| 422 | 2024-12-07 |
Flow-induced reprogramming of endothelial cells in atherosclerosis
2023-11, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-023-00883-1
PMID:37225873
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综述 | 本文讨论了动脉粥样硬化中血流诱导的内皮细胞重编程现象及其潜在的致动脉粥样硬化机制 | 提出了血流诱导的内皮细胞重编程（FIRE）作为潜在的致动脉粥样硬化机制 | NA | 探讨血流诱导的内皮细胞重编程机制及其在动脉粥样硬化中的作用 | 内皮细胞在动脉粥样硬化中的重编程机制 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序和染色质可及性分析 | NA | NA | 使用小鼠模型进行研究 |
| 423 | 2024-12-02 |
Deterministic evolution and stringent selection during preneoplasia
2023-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06102-8
PMID:37258665
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研究论文 | 本文通过双等位基因失活TP53模拟胃癌前病变，研究了早期肿瘤发生过程中的确定性进化和严格选择 | 本文首次在胃器官模型中模拟了TP53失活后的实验进化过程，揭示了早期肿瘤发生中的选择压力和表型收敛现象 | 研究仅限于胃器官模型，可能无法完全代表人体内的复杂情况 | 研究早期肿瘤发生过程中的进化机制和选择压力 | TP53失活的胃器官模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 多个克隆来源的胃器官培养物，历时2年 |
| 424 | 2024-12-01 |
Spatial Transcriptomics Resolve an Emphysema-specific Lymphoid Follicle B Cell Signature in COPD
2023-Dec-08, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0507OC
PMID:38064378
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研究论文 | 研究分析了慢性阻塞性肺疾病（COPD）中与肺气肿相关的淋巴滤泡（LF）的转录组特征 | 揭示了肺气肿患者淋巴滤泡中B细胞活化的独特转录组特征 | 研究样本仅限于40名COPD患者和吸烟者，可能无法代表所有COPD患者的情况 | 探讨COPD患者中肺气肿与淋巴滤泡B细胞免疫成分的关系 | COPD患者和吸烟者的肺组织中的淋巴滤泡 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 40名COPD患者和吸烟者的肺组织样本 |
| 425 | 2024-11-27 |
A spatial human thymus cell atlas mapped to a continuous tissue axis
2023-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.25.562925
PMID:37986877
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研究论文 | 本文通过空间解析分析，建立了一个新的定量形态学框架，用于描述胸腺的皮质-髓质轴，并展示了胸腺细胞和胸腺上皮细胞的高度组织性 | 本文创新性地结合了多模态单细胞、空间转录组学和高分辨率多重成像技术，构建了一个连续组织轴上的空间人类胸腺细胞图谱 | NA | 研究胸腺细胞在出生前和出生后的发育过程及其微解剖学基础 | 胸腺细胞和胸腺上皮细胞的发育轨迹及其组织结构 | NA | NA | 空间转录组学、高分辨率多重成像 | NA | 单细胞数据、空间转录组数据、图像数据 | NA |
| 426 | 2024-11-25 |
Spatial transcriptomics reveals distinct tissue niches linked with steroid responsiveness in acute gastrointestinal GVHD
2023-11-23, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023020644
PMID:37699201
|
研究论文 | 研究利用空间转录组技术揭示了急性胃肠道GVHD中与类固醇反应性相关的不同组织微环境 | 首次利用空间转录组技术分析了急性胃肠道GVHD患者的组织微环境，并发现了与类固醇反应性相关的独特基因表达特征 | 样本量较小，仅包括32名患者，可能影响结果的普适性 | 揭示急性胃肠道GVHD中与类固醇反应性相关的组织微环境，并识别潜在的预后生物标志物 | 急性胃肠道GVHD患者的组织样本 | 数字病理学 | 造血系统疾病 | 空间转录组技术 | NA | 基因表达数据 | 32名急性胃肠道GVHD患者 |
| 427 | 2024-11-25 |
Temporal regulation of neural diversity in Drosophila and vertebrates
2023-06, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2022.05.011
PMID:35623984
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综述 | 本文综述了果蝇和脊椎动物神经多样性的时间调控机制 | 本文通过比较果蝇和脊椎动物的脑发育程序，揭示了神经多样性生成中的时间模式机制的共性 | NA | 探讨果蝇和脊椎动物神经多样性的时间调控机制 | 果蝇和脊椎动物的神经多样性生成 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 大量单细胞样本 |
| 428 | 2024-11-23 |
An Anterior Second Heart Field Enhancer Regulates the Gene Regulatory Network of the Cardiac Outflow Tract
2023-11-21, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 研究通过CRISPR-Cas9基因编辑技术删除心脏增强子，探讨其在心脏流出道基因调控网络中的作用 | 揭示了前第二心场增强子在连接GATA6与NKX2-5依赖的旋转和隔膜基因程序中的关键作用 | NA | 探讨心脏流出道发育异常的基因调控网络 | 心脏流出道、前第二心场增强子、GATA6、NKX2-5 | NA | 心血管疾病 | CRISPR-Cas9基因编辑、RNA测序、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、转座酶可及染色质测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 小鼠模型、人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 |
| 429 | 2024-11-23 |
Single-Cell Integration of BMD GWAS Results Prioritize Candidate Genes Influencing Age-Related Bone Loss
2023-Oct, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jbm4.10795
PMID:37808401
|
研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序数据整合骨密度全基因组关联研究结果，优先筛选影响年龄相关骨丢失的候选基因 | 通过单细胞RNA测序数据，揭示了候选基因在特定细胞类型中的表达特征，为骨密度维持提供了新的治疗靶点 | 主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 研究年龄相关骨丢失的遗传机制，并筛选潜在的治疗靶点 | 骨密度相关基因及其在不同细胞类型中的表达 | 基因组学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年小鼠的骨髓和骨组织样本 |
| 430 | 2024-11-23 |
Mammary duct luminal epithelium controls adipocyte thermogenic programme
2023-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06361-5
PMID:37495690
|
研究论文 | 研究报告了乳腺导管上皮细胞在脂肪微环境中调节冷暴露诱导的小鼠皮下白色脂肪组织中脂肪细胞UCP1表达的作用 | 首次揭示了乳腺导管上皮细胞通过分泌因子'mammokines'调控脂肪细胞UCP1表达，并发现这些因子在性别特异性脂肪生成中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果的普遍性和在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨乳腺导管上皮细胞在脂肪细胞UCP1表达调控中的作用及其在性别特异性脂肪生成中的意义 | 小鼠皮下白色脂肪组织中的乳腺导管上皮细胞和脂肪细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠皮下白色脂肪组织样本 |
| 431 | 2024-11-23 |
SPICEMIX enables integrative single-cell spatial modeling of cell identity
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01256-z
PMID:36624346
|
研究论文 | 介绍了一种名为SPICEMIX的计算方法，用于整合单细胞空间转录组数据，以揭示细胞身份 | SPICEMIX基于概率潜变量建模，能够显著改进细胞类型及其空间模式的推断，优于现有方法 | NA | 开发一种能够利用空间转录组数据独特性质揭示细胞身份的计算方法 | 空间转录组数据中的细胞类型及其空间模式 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 概率潜变量模型 | 基因表达数据 | 人类和小鼠脑区的空间转录组数据，通过seqFISH+、STARmap和Visium技术获取 |
| 432 | 2024-11-22 |
Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2023-Dec-11, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023113898
PMID:37962490
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，评估了三种不同条件下的人类肝脏类器官模型在代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）中的表现 | 首次系统评估了人类肝脏类器官模型在MASLD中的转化潜力，并提供了单细胞参考数据以基准未来的类器官损伤模型 | NA | 评估人类肝脏类器官模型在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的表现，并提供单细胞参考数据 | 人类肝脏类器官模型在不同条件下的MASLD表现 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 三种不同条件下的肝脏类器官模型 |
| 433 | 2024-11-22 |
Single-Cell Analysis Reveals Distinct Immune and Smooth Muscle Cell Populations that Contribute to Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension
2023-05-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202203-0441OC
PMID:36803741
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了慢性血栓栓塞性肺动脉高压中不同的免疫和肌细胞群体及其功能障碍 | 首次通过单细胞RNA测序技术，全面分析了慢性血栓栓塞性肺动脉高压中的多种细胞类型及其功能，并识别出潜在的治疗靶点PAR1 | 研究样本量较小，仅涉及五名患者，可能影响结果的普适性 | 识别构成慢性血栓栓塞性肺动脉高压血栓的多种细胞类型，并研究其功能障碍 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压中的免疫细胞和肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五名患者 |
| 434 | 2024-11-21 |
Dissecting mammalian reproduction with spatial transcriptomics
2023-11-02, Human reproduction update
IF:14.8Q1
DOI:10.1093/humupd/dmad017
PMID:37353907
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在哺乳动物生殖系统研究中的应用，重点介绍了其在配子发生、胚胎发生和生殖病理学方面的生物学新见解 | 空间转录组学技术通过保留细胞在原生组织环境中的空间背景，揭示了细胞状态如何通过与邻近体细胞的相互作用进行调控 | 当前的空间转录组学技术在应用于生殖研究时仍面临实验和计算上的挑战 | 综述空间转录组学技术在哺乳动物生殖系统研究中的最新进展，并讨论其在未来的应用前景 | 哺乳动物生殖系统中的配子发生、胚胎发生和生殖病理学 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 435 | 2024-11-20 |
The testicular microvasculature in Klinefelter syndrome is immature with compromised integrity and characterized by excessive inflammatory cross-talk
2023-12-04, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/dead224
PMID:37910660
|
研究论文 | 研究探讨了Klinefelter综合征（KS）患者的睾丸微血管在单细胞水平上的基因表达模式，揭示了微血管功能障碍的潜在机制 | 首次在单细胞水平上揭示了KS患者睾丸微血管相关细胞的独特基因表达模式，表明内皮细胞过度激活、血管形成紊乱和血管完整性受损 | 研究样本量不平衡，各组样本数量和细胞数量不同，且缺乏临床信息的限制，无法推断基因表达变化可能导致的生物学后果，未包含青春期前年龄组限制了研究结果的普遍性 | 探讨KS是否会导致睾丸中独特的基因表达模式，从而揭示报道的睾丸微血管功能障碍 | Klinefelter综合征（KS）、非阻塞性无精子症（NOA）、隐匿性精子症和对照组的睾丸细胞 | NA | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | KS组6例，NOA组5例，隐匿性精子症3例，对照组15例 |
| 436 | 2024-11-18 |
Technical Advances and Applications of Spatial Transcriptomics
2023-Oct, GEN biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1089/genbio.2023.0032
PMID:39544230
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术的最新进展及其在生物学研究中的应用 | 本文系统地介绍了空间转录组学技术在揭示RNA分子在亚细胞、细胞和组织水平上的位置模式方面的创新应用 | 本文主要讨论了现有空间转录组学技术的局限性，包括方法上的挑战和应用中的限制 | 旨在为研究人员提供关于空间转录组学技术的全面指南 | 空间转录组学技术及其在生物学研究中的应用 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 437 | 2024-11-17 |
Ezh2-dependent methylation in oral epithelia promotes secondary palatogenesis
2023-11-15, Birth defects research
IF:1.6Q4
DOI:10.1002/bdr2.2216
PMID:37435868
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研究论文 | 研究Ezh2依赖的甲基化在口腔上皮中对次级腭发育的影响 | 首次揭示了Ezh2在口腔上皮中的甲基化对次级腭发育的作用 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨Ezh2依赖的甲基化在次级腭发育中的上皮作用 | 小鼠胚胎的口腔上皮 | NA | NA | 单细胞RNA测序、免疫荧光、RT-qPCR | NA | RNA | 小鼠胚胎的口腔上皮样本 |
| 438 | 2024-11-17 |
ScRNAPip: A systematic and dynamic pipeline for single-cell RNA sequencing analysis
2023-Nov, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.132
PMID:38868218
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研究论文 | 本文开发了一个可重复的计算工作流程，用于单细胞RNA测序数据分析 | 提出了一个系统化和动态的单细胞RNA测序分析管道ScRNAPip | NA | 为研究人员提供一个全面的教程，帮助他们构建和优化自己的分析管道 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用公开数据集进行演示 |
| 439 | 2024-11-17 |
Recording morphogen signals reveals origins of gastruloid symmetry breaking
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.02.543474
PMID:37333235
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研究论文 | 研究使用合成基因电路追踪早期细胞内信号如何预测干细胞类胚体中细胞的未来前后位置 | 首次揭示了Wnt信号从均匀状态演变为极化状态的关键6小时时间窗口，并发现早期TGF信号的异质性预测了前后位置并调节Wnt信号 | NA | 探究干细胞类胚体如何打破对称性以可重复地定义单一前后轴 | 干细胞类胚体中的前后轴形成机制 | 发育生物学 | NA | 合成基因电路、单细胞RNA测序、活体成像 | NA | 信号数据、细胞位置数据 | NA |
| 440 | 2024-11-17 |
CIMLA: Interpretable AI for inference of differential causal networks
2023-Apr-25, ArXiv
PMID:37163135
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CIMLA的新工具，用于发现条件依赖的因果关系变化，并展示了其在基因调控网络中的应用 | CIMLA工具在发现条件依赖的因果关系变化方面比现有方法更稳健和准确 | NA | 发现高维数据中的因果关系 | 基因调控网络在不同生物条件下的差异 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 特征归因模型 | 高维数据 | NA |