单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5352 篇文献，本页显示第 4341 - 4360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4341 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis identifies PD-L2 as a tumor promotor in the tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1093716
PMID:37006239
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研究论文 | 本文通过分析PD-L2在肿瘤微环境中的表达及其对肿瘤发展的影响，探讨了PD-L2作为潜在治疗靶点的可能性 | 首次全面分析PD-L2在多种癌症类型中的表达及其对肿瘤微环境的影响，并验证了PD-L2在肿瘤相关巨噬细胞中的表达及其功能 | NA | 探讨PD-L2在肿瘤微环境中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | PD-L2在多种癌症类型中的表达及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | NA | TCGA, ICGC, HPA数据库分析, Kaplan-Meier和Cox回归分析, GSEA, Spearman相关分析, PPI网络, ESTIMATE算法, TIMER 2.0, scRNA-seq, 多重免疫荧光染色, 流式细胞术, 荧光激活细胞分选, qRT-PCR, 跨孔和集落形成实验, TIDE和TISMO分析, GSCA平台 | NA | mRNA, 蛋白质, 免疫细胞, 肿瘤细胞 | 多种人类癌症类型样本, 人结肠癌样本, 免疫活性同基因小鼠 |
| 4342 | 2024-08-08 |
Integrative analysis revealed that distinct cuprotosis patterns reshaped tumor microenvironment and responses to immunotherapy of colorectal cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1165101
PMID:37006250
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研究论文 | 本研究通过综合分析揭示了不同的铜死亡模式如何重塑结直肠癌的肿瘤微环境及对免疫治疗的反应 | 首次探讨了铜死亡在结直肠癌中对肿瘤微环境和免疫调节的作用 | NA | 研究铜死亡模式对结直肠癌肿瘤微环境和免疫治疗反应的影响 | 结直肠癌患者的铜死亡模式及其对肿瘤微环境和免疫治疗的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 共识聚类分析，主成分分析，单细胞转录组数据分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 4343 | 2024-08-08 |
Case report: Long-term voluntary Tyrosine Kinase Inhibitor (TKI) discontinuation in chronic myeloid leukemia (CML): Molecular evidence of an immune surveillance
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1117781
PMID:37007090
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病例报告 | 报道了一例慢性髓性白血病患者在长期自愿中断酪氨酸激酶抑制剂治疗后，通过分子证据显示免疫监视现象的案例 | 通过单细胞转录组RNA-seq分析揭示了与NK-T细胞活化及抑制相关的分子网络，并识别出表达NKG7、granzyme H、cathepsin-W和granulysin的单细胞 | 研究仅基于单个病例，需要进一步研究评估NKG7表达在治疗自由缓解发生中的作用 | 探讨慢性髓性白血病患者在长期中断酪氨酸激酶抑制剂治疗后的分子和免疫学机制 | 慢性髓性白血病患者及其免疫细胞在治疗中断后的分子变化 | NA | 慢性髓性白血病 | 单细胞转录组RNA-seq | NA | 转录组数据 | 单个病例 |
| 4344 | 2024-08-08 |
Cell-type-specific densities in mouse somatosensory cortex derived from scRNA-seq and in situ RNA hybridization
2023, Frontiers in neuroanatomy
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/fnana.2023.1118170
PMID:37007642
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和原位RNA杂交（ISH）图像，研究了小鼠体感皮层中细胞类型的特定密度分布 | 该方法无需选择特定细胞类型的基因子集，也不限于使用样本间变异性低的ISH图像，并补偿了细胞体大小和转录组不完全性的差异 | NA | 研究小鼠体感皮层中细胞类型的分布模式 | 小鼠体感皮层中的细胞类型分布 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），原位RNA杂交（ISH） | NA | 图像，转录组数据 | P56小鼠体感皮层样本 |
| 4345 | 2024-08-08 |
Immune responses of different COVID-19 vaccination strategies by analyzing single-cell RNA sequencing data from multiple tissues using machine learning methods
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1157305
PMID:37007947
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研究论文 | 本研究通过分析来自多个组织的单细胞RNA测序数据，利用机器学习方法探讨不同COVID-19疫苗策略引发的免疫反应差异 | 本研究采用机器学习方法分析单细胞转录组数据，筛选出关键基因，并通过特征增量选择框架构建最优分类器，为疫苗策略提供量化规则 | NA | 揭示不同疫苗策略下SARS-CoV-2感染后仓鼠目标细胞的免疫基因表达水平差异 | 仓鼠的血液、肺和鼻黏膜中的不同细胞类型 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 决策树、随机森林 | RNA测序数据 | 包括未接种组、两剂腺病毒疫苗组、两剂减毒病毒疫苗组、两剂mRNA疫苗组和mRNA/减毒疫苗组共五个组 |
| 4346 | 2024-08-08 |
EMP1 as a Potential Biomarker in Liver Fibrosis: A Bioinformatics Analysis
2023, Gastroenterology research and practice
IF:2.0Q3
DOI:10.1155/2023/2479192
PMID:37008256
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞转录组数据和微阵列数据集，分析了肝纤维化过程中细胞特异性表达的差异基因，特别是EMP1蛋白在不同类型肝纤维化中的表达模式 | 首次揭示EMP1在肝纤维化中的细胞特异性表达，并探讨其在肝损伤后的激活和增殖过程中的潜在作用 | NA | 探索肝纤维化过程中的细胞特异性标记基因 | 肝纤维化中的细胞特异性表达基因EMP1 | 生物信息学 | 肝病 | 单细胞转录组RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括人肝组织和经不同诱导处理的鼠肝组织 |
| 4347 | 2024-08-08 |
Prognostic implication of heterogeneity and trajectory progression induced by enzalutamide in prostate cancer
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1148898
PMID:37008945
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，构建了一个由10个基因组成的预测模型（ENZ-sig），用于预测前列腺癌患者在使用enzalutamide治疗后的无复发生存期 | 首次构建了enzalutamide诱导的基因特征（ENZ-sig），用于预测前列腺癌的进展和无复发生存期 | NA | 研究enzalutamide在前列腺癌中的预后意义及其诱导的异质性和轨迹进展 | 前列腺癌患者在使用enzalutamide治疗后的预后 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 三个enzalutamide刺激模型（0小时、48小时和168小时）以及六个独立数据集 |
| 4348 | 2024-08-08 |
Integrated proteome sequencing, bulk RNA sequencing and single-cell RNA sequencing to identify potential biomarkers in different grades of intervertebral disc degeneration
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1136777
PMID:37009470
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研究论文 | 本研究通过综合分析蛋白质组测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，旨在识别不同等级椎间盘退变中的潜在生物标志物 | 本研究首次综合利用蛋白质组测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序技术，结合机器学习算法筛选关键基因，以识别椎间盘退变的潜在生物标志物 | 研究样本仅包括八个等级的椎间盘退变病例，可能影响结果的普遍性和广泛应用 | 识别不同等级椎间盘退变中的潜在生物标志物 | 椎间盘退变（IDD）的不同等级 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 蛋白质组测序（PRO-seq）、批量RNA测序（bRNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习（ML）算法 | 蛋白质、RNA | 八个等级的椎间盘退变病例 |
| 4349 | 2024-08-08 |
Endothelin-1-Endothelin receptor B complex contributes to oligodendrocyte differentiation and myelin deficits during preterm white matter injury
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1163400
PMID:37009471
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研究论文 | 研究探讨了早产儿脑白质损伤中内皮素-1与内皮素受体B复合体对少突胶质细胞分化及髓鞘缺陷的影响 | 揭示了神经元与少突胶质前体细胞相互作用的新信号模块，为早产儿脑白质损伤的治疗提供了新视角 | NA | 改善移植的少突胶质前体细胞在脑白质损伤中的分化能力，以促进其临床应用 | 早产儿脑白质损伤中的少突胶质前体细胞分化及髓鞘形成 | NA | 早产儿脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 4350 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals enriched memory T-cell subpopulations in hypertension
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1132040
PMID:37009484
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了高血压患者循环记忆T细胞的亚群及其在血压升高中的作用 | 首次在高血压患者中通过单细胞RNA测序技术鉴定出四种记忆T细胞亚群，并发现CD8效应记忆T细胞在血压升高中的重要作用 | 研究仅限于高血压患者的循环记忆T细胞，未涉及其他类型的细胞或组织 | 探讨记忆T细胞在高血压患者中的维持和功能 | 高血压患者的循环记忆T细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 高血压患者的血液样本 |
| 4351 | 2024-08-08 |
Integrative exploration of the mutual gene signatures and immune microenvironment between benign prostate hyperplasia and castration-resistant prostate cancer
2023-Dec, The aging male : the official journal of the International Society for the Study of the Aging Male
DOI:10.1080/13685538.2023.2183947
PMID:36974949
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序、批量RNA测序和微阵列数据，探索了良性前列腺增生和去势抵抗性前列腺癌之间的共同基因特征和免疫微环境。 | 首次揭示了良性前列腺增生和去势抵抗性前列腺癌之间的共同基因特征和免疫微环境，为前列腺癌的免疫治疗提供了潜在的治疗靶点。 | NA | 探索良性前列腺增生和去势抵抗性前列腺癌之间的共同基因特征和免疫微环境。 | 良性前列腺增生和去势抵抗性前列腺癌的共同基因特征和免疫微环境。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、微阵列数据分析 | WGCNA、lasso回归分析 | RNA测序数据 | NA |
| 4352 | 2024-08-08 |
FishSCT: a zebrafish-centric database for exploration and visualization of fish single-cell transcriptome
2023-09, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-022-2293-4
PMID:36971993
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4353 | 2024-08-08 |
Origins of pathological myofibroblasts in lung fibrosis: insights from lineage tracing mouse models in the single-cell RNA sequencing era
2023-06-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00229.2022
PMID:36976924
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综述 | 本文综述了特发性肺纤维化中病理性肌成纤维细胞的起源，基于单细胞RNA测序时代的鼠系追踪模型 | 利用鼠系追踪方法和单细胞RNA测序技术，探讨了肺纤维化中病理性肌成纤维细胞的潜在来源 | 本文为综述性质，未提供具体的实验数据或结果 | 旨在探讨肺纤维化中病理性肌成纤维细胞的起源 | 特发性肺纤维化中的病理性肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 4354 | 2024-08-08 |
Cell Features Reconstruction from Gene Association Network of Single Cell
2023-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00553-3
PMID:36977959
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研究论文 | 本文提出了一种两级方法来重建单细胞特征，通过将原始基因表达特征转换为基因本体特征和基因相互作用特征 | 本文创新性地提出了基于细胞网络特征矩阵的基因引力计算方法和基因引力熵指数，用于量化基因间的相互作用和单细胞分化的水平 | NA | 开发一种新的方法来重建单细胞特征，并量化基因间的相互作用 | 单细胞基因表达特征 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 八个不同的scRNA-seq数据集 |
| 4355 | 2024-08-08 |
Bayesian cluster analysis
2023-May-15, Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences
DOI:10.1098/rsta.2022.0149
PMID:36970819
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研究论文 | 本文概述了贝叶斯聚类分析方法，包括基于模型和基于损失的方法，并讨论了核函数或损失选择以及先验设定的重要性 | 贝叶斯聚类分析不仅提供点估计，还提供聚类结构和每个聚类内模式的不确定性 | 文章讨论了有限混合和无限混合在基于模型方法中的争议以及对模型误设的稳健性，但主要关注的是边际后验的聚类数量 | 研究贝叶斯聚类分析在单细胞RNA测序数据中识别潜在细胞类型以研究胚胎细胞发育的应用 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类和潜在细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯模型 | 数据 | NA |
| 4356 | 2024-08-08 |
Epithelial cells activate fibroblasts to promote esophageal cancer development
2023-05-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.03.001
PMID:36963399
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）发展过程中上皮细胞和成纤维细胞之间的信号交流机制。 | 首次报道了ANXA1在上皮细胞中的表达逐渐减少，并通过FPR2受体影响成纤维细胞的稳态，进而促进ESCC的发展。 | 研究样本仅来自29名患者，可能影响结果的普遍性。 | 探讨食管鳞状细胞癌发展过程中上皮细胞和成纤维细胞之间的信号交流机制。 | 食管鳞状细胞癌的多阶段病变。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 79个多阶段食管病变样本 |
| 4357 | 2024-08-05 |
TAK1 deficiency promotes liver injury and tumorigenesis via ferroptosis and macrophage cGAS-STING signalling
2023-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100695
PMID:36968217
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研究论文 | 这篇文章探讨了肝细胞缺失TAK1如何通过铁死亡和巨噬细胞cGAS-STING信号通路促进肝损伤和肿瘤发生 | 文章首次揭示了肝细胞铁死亡引起的氧化DNA损伤如何促进巨噬细胞STING激活，从而加剧肝损伤和肿瘤生成 | 缺乏对肝细胞铁死亡与巨噬细胞STING激活之间精确机制的深入探讨 | 研究肝细胞铁死亡在自发性肝损伤、纤维化和肿瘤发生中的作用 | TAK1缺失的小鼠模型及体外的主要肝细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA-Seq | NA | 生物样本 | TAK1ΔHEP小鼠 |
| 4358 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of male chicken germ cells reveals changes in signaling pathway-related gene expression profiles during mitotic arrest
2023-05, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13600
PMID:36961279
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了雄性胚胎鸡生殖细胞在有丝分裂停滞期间信号通路相关基因表达谱的变化。 | 首次揭示了雄性胚胎鸡生殖细胞在有丝分裂停滞期间多个信号通路的转录水平变化，包括BMP、Notch、JAK-STAT、MAPK、Hedgehog和甲状腺激素信号通路。 | NA | 理解调控有丝分裂停滞的信号通路，为胚胎生殖细胞发育提供新的见解。 | 雄性胚胎鸡生殖细胞在有丝分裂停滞期间的信号通路动态。 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 4359 | 2024-08-08 |
Temporal multimodal single-cell profiling of native hematopoiesis illuminates altered differentiation trajectories with age
2023-04-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112304
PMID:36961818
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研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组和表位分析与造血干细胞（HSC）特异性谱系追踪的长期功能评估，揭示了年龄对原生造血分化轨迹的影响。 | 研究首次结合单细胞转录组和表位分析，揭示了HSC/前体细胞分化结构的定义，与仅基于单细胞RNA测序的近期研究结果不同。 | 研究主要集中在体外培养和功能评估，对体内动态变化的具体机制仍需进一步探索。 | 探讨年龄对造血功能的影响及其分子机制。 | 造血干细胞（HSC）及其分化轨迹。 | 数字病理学 | 血液细胞疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 4360 | 2024-08-08 |
Stem cell-based modeling and single-cell multiomics reveal gene-regulatory mechanisms underlying human skeletal development
2023-04-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112276
PMID:36965484
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研究论文 | 本文通过结合体外诱导人类多能干细胞形成间质细胞和体内通过植入间质细胞于免疫缺陷小鼠肾囊下形成软骨内骨的方法，研究人类骨骼发育的基因调控机制 | 本文引入了综合方法来模拟人类骨骼发育，并通过单细胞多组学分析揭示了与多个转录因子相关的染色质可及性的动态变化 | NA | 阐明人类骨骼发育的分子机制 | 人类骨骼发育的基因调控网络 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, 单细胞多组学 | NA | 单细胞数据 | 涉及人类多能干细胞和免疫缺陷小鼠 |