单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5352 篇文献，本页显示第 4321 - 4340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4321 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics of adult skin VE-cadherin expressing lineages during hair cycle
2023-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.22.533784
PMID:36993228
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研究论文 | 本研究揭示了在毛发生长周期中成体皮肤内表现VE-钙粘附蛋白的细胞的单细胞转录组学变化 | 该研究首次通过单细胞RNA测序技术深入分析了皮肤内VE-钙粘附蛋白表达细胞在毛发生长周期各阶段的动态 | 研究只涉及了小鼠模型，结果可能在其他物种中不完全适用 | 探讨成体皮肤内血管内皮系细胞在毛发生长周期中的动态变化 | 主要研究表现VE-钙粘附蛋白的内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | FACS分选的VE-钙粘附蛋白表达细胞（确切样本量未提供） |
| 4322 | 2024-08-05 |
Inference of single cell profiles from histology stains with the Single-Cell omics from Histology Analysis Framework (SCHAF)
2023-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.21.533680
PMID:36993643
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研究论文 | 本研究开发了一个名为SCHAF的框架，能够从H&E组织图像生成空间分辨率的单细胞组学数据集 | 该研究利用对抗性机器学习方法，将组织切片的H&E图像与单细胞RNA测序数据有效结合，提供了单细胞的空间信息 | 本文主要集中于肺癌和转移性乳腺癌样本，可能限制了其方法的广泛适用性 | 探讨如何从组织切片获取单细胞的分子信息和空间结构 | 研究对象为来自肺癌和转移性乳腺癌的人类肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌、转移性乳腺癌 | 对抗性机器学习 | NA | 图像 | 两个类型的人类肿瘤样本 |
| 4323 | 2024-08-08 |
An evaluation of statistical differential analysis methods in single-cell RNA-seq data
2023-Mar-23, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2670717/v1
PMID:36993457
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研究论文 | 本文评估了五种开源流行方法在单细胞RNA测序数据中进行基因差异表达分析的性能 | 本文通过模拟研究和真实数据示例，评估了五种方法在不同样本大小、分布假设和数据中零比例下的表现 | NA | 评估单细胞RNA测序数据中基因差异表达分析方法的性能 | 单细胞RNA测序数据中的基因差异表达分析方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同样本大小，包括每组100个样本 |
| 4324 | 2024-08-08 |
HIV-1 Vpr combats the PU.1-driven antiviral response in primary human macrophages
2023-Mar-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.21.533528
PMID:36993393
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研究论文 | 研究探讨了HIV-1辅助蛋白Vpr在人类原代巨噬细胞中对抗PU.1驱动的抗病毒反应的作用 | 发现Vpr通过靶向主转录调节因子PU.1，重编程HIV感染的巨噬细胞基因表达，并揭示了Vpr在非旁观者巨噬细胞中通过PU.1非依赖机制对抗HIV感染的固有免疫反应 | 未观察到PU.1对HIV基因转录的直接影响 | 阐明Vpr在HIV感染原代巨噬细胞中的作用 | HIV-1辅助蛋白Vpr和PU.1在HIV感染中的作用 | NA | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 原代人类巨噬细胞 |
| 4325 | 2024-08-05 |
Cis-regulatory control of transcriptional timing and noise in response to estrogen
2023-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.14.532457
PMID:36993565
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研究论文 | 该文章探讨了顺式调控元件如何影响转录时间和噪声 | 研究揭示了影响转录特点的调控蛋白和表观遗传特征的组合 | 对不同转录特征控制所需的全貌尚未完全理解 | 确定与雌激素处理相关的转录时序和噪声的基因组预测因子 | 涉及雌激素处理条件下的单细胞RNA测序结果 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组表达数据 | 在雌激素处理的时间过程中进行了单细胞分析 |
| 4326 | 2024-08-08 |
CTLA-4 tail fusion enhances CAR-T anti-tumor immunity
2023-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.14.532655
PMID:36993364
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研究论文 | 本文通过利用细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4（CTLA-4）细胞质尾（CT）的内吞特性，重新编程嵌合抗原受体（CAR）功能，显著增强了CAR-T细胞的疗效 | 通过将CTLA-4 CT融合到CAR的C端，实现了CAR-T细胞的渐进性细胞毒性增加，同时减少了激活和促炎细胞因子的产生 | NA | 探索通过合成CTLA-4 CT融合来改进CAR-T细胞功能的新策略 | 嵌合抗原受体T细胞（CAR-T）及其在肿瘤治疗中的应用 | 生物技术 | 白血病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 4327 | 2024-08-05 |
Analysis of RNA processing directly from spatial transcriptomics data reveals previously unknown regulation
2023-Mar-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.13.532412
PMID:36993757
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研究论文 | 本研究直接分析了空间转录组数据中的RNA处理，揭示了之前未知的调节机制 | 首次将ReadZS和SpliZ方法应用于空间转录组数据，以分析RNA处理的空间定位 | 主要集中在小鼠的大脑和肾脏数据，可能无法代表其他组织类型 | 研究空间转录组数据中的RNA处理及其空间调节机制 | 使用小鼠脑和肾脏样本中的RNA数据进行分析 | 数字病理学 | NA | 空间转录组 | NA | RNA数据 | 小鼠脑和肾脏样本 |
| 4328 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling of the vaginal epithelium reveals the heterogeneity of suprabasal cells
2023-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbad006
PMID:37007744
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4329 | 2024-08-08 |
Immune Factors Drive Expression of SARS-CoV-2 Receptor Genes Amid Sexual Disparity
2023-02-28, Viruses
DOI:10.3390/v15030657
PMID:36992366
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研究论文 | 研究探讨了性别差异在SARS-CoV-2感染中的分子机制，并识别了与性别相关的基因特征 | 首次识别了一个6基因特征，该特征在男性和女性中表达差异显著，并显示出区分COVID-19重症监护患者与非重症患者的潜在预后价值 | 研究主要基于小鼠和人类数据集，可能需要更多跨物种验证 | 探索与性别和COVID-19发病机制相关的分子特征，以开发更有效的干预措施 | SARS-CoV-2感染中的性别差异及其分子机制 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠和人类临床数据 |
| 4330 | 2024-08-05 |
Lack of association between leptin concentrations and cystic fibrosis: A meta-analysis and regression
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1126129
PMID:36992806
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meta-analysis | 本综述旨在评估囊性纤维化患者与非囊性纤维化对照组之间的瘦素状态的定量差异 | 研究表明囊性纤维化患者与健康个体在瘦素水平上没有显著差异，揭示了瘦素在囊性纤维化病理生理学中的作用的局限性 | 本研究未能确定瘦素与第一秒用力呼气容量（FEV1）之间的关联，且在不同细胞中肺泡灌洗液中瘦素及瘦素受体的表达水平较低 | 评估囊性纤维化与瘦素浓度之间的关联 | 共纳入919名囊性纤维化患者和397名对照组，以分析瘦素水平 | NA | 囊性纤维化 | 系统评价 | 固定效应或随机效应模型 | NA | 919名囊性纤维化患者和397名对照组 |
| 4331 | 2024-08-05 |
Prognostic signatures of sphingolipids: Understanding the immune landscape and predictive role in immunotherapy response and outcomes of hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1153423
PMID:37006285
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研究论文 | 本研究旨在识别影响肝细胞癌预后的关键鞘脂基因，并建立可靠的预后模型 | 提出了一个六基因特征和一个诺莫图，提供了鞘脂相关基因与免疫微环境之间的联系，揭示了新的免疫治疗策略 | 研究主要依赖于数据集，不同数据源之间的整合可能导致偏差 | 识别肝细胞癌中的关键鞘脂基因并开发预后模型 | 肝细胞癌患者的鞘脂基因及其在肿瘤微环境中的影响 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | LASSO-Cox分析、单细胞测序、机器学习 | 诺莫图 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA、GEO和ICGC的数据集 |
| 4332 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Mononuclear Cell Populations in Skeletal Muscle
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3036-5_26
PMID:36995608
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研究论文 | 本文探讨了骨骼肌中单核细胞群体的转录组分析 | 使用了基于液滴的单细胞RNA测序技术以揭示肌肉内细胞类型的身份 | 没有具体提到研究的局限性 | 研究骨骼肌组织的细胞组成及各细胞群体之间的异质性 | 骨骼肌中的单核细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 4333 | 2024-08-05 |
Integrated analysis to identify the prognostic and immunotherapeutic roles of coagulation-associated gene signature in clear cell renal cell carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1107419
PMID:37006234
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研究论文 | 本研究分析了凝血相关基因在透明细胞肾细胞癌中的作用 | 首次系统分析了凝血相关基因在透明细胞肾细胞癌患者诊断、预后和个性化治疗中的重要性 | 在研究领域缺乏足够的相关研究 | 研究凝血系统异常与透明细胞肾细胞癌进展之间的关系 | 透明细胞肾细胞癌患者的凝血相关基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序 | Cox模型 | 临床样本数据 | 涉及高阶段或等级的透明细胞肾细胞癌患者的临床样本 |
| 4334 | 2024-08-05 |
T-cell exhaustion signatures characterize the immune landscape and predict HCC prognosis via integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1137025
PMID:37006257
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研究论文 | 该研究探讨了T细胞耗竭指纹在肝细胞癌（HCC）免疫环境中的作用，并预测其预后 | 通过整合单细胞RNA测序和高通量RNA测序，开发了一个可靠的T细胞耗竭基础指纹，开辟了HCC患者预后和免疫治疗反应评估的新途径 | 本研究未提到关于实验结果的具体限制 | 研究T细胞耗竭在肝细胞癌中的潜在作用 | 肝细胞癌患者的T细胞耗竭基因及其与预后的关系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序和高通量RNA测序 | LASSO-Cox分析 | RNA测序数据 | 涉及HCC患者的RNA-seq数据和10x单细胞RNA-seq数据，具体样本量未提供 |
| 4335 | 2024-08-05 |
Geographically weighted linear combination test for gene-set analysis of a continuous spatial phenotype as applied to intratumor heterogeneity
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1065586
PMID:36998245
|
研究论文 | 本研究介绍了一种新的计算平台GWLCT，用于基因集分析与空间数据建模的结合 | GWLCT的主要优势在于其分析超越了全局显著性，使基因集与表型之间的关联可以在肿瘤空间中变化 | 文章未提到特定的限制因素 | 研究目的是提供一种新的统计测试，分析基因集与空间表型的局部关联性 | 研究对象为从输入肿瘤样本收集的空间单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间基因表达技术（Visium） | 地理加权线性组合测试（GWLCT） | 空间单细胞RNA-seq数据 | 涉及144种不同的模拟场景和侵袭性乳腺癌组织样本 |
| 4336 | 2024-08-08 |
EasyCellType: marker-based cell-type annotation by automatically querying multiple databases
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad029
PMID:36998720
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研究论文 | 开发了一个名为EasyCellType的计算工具，通过自动查询多个数据库来基于标记进行细胞类型注释 | 提出了一个自动化的方法，结合统计测试来有效利用细胞标记数据库，并提供了一个用户友好的图形界面 | NA | 简化单细胞RNA测序数据中细胞标签注释的过程 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4337 | 2024-08-08 |
Cellular complexity of the peripheral nervous system: Insights from single-cell resolution
2023, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2023.1098612
PMID:36998728
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，深入研究了周围神经系统（PNS）的细胞复杂性，并描述了细胞异质性在发育和再生过程中的变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别了PNS中的多种细胞类型，并进一步识别了神经元和胶质细胞的亚型 | NA | 深入理解周围神经系统的细胞复杂性，并为未来的遗传操作提供细胞基础 | 周围神经系统中的细胞类型及其在不同生理和病理状态下的变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 4338 | 2024-08-08 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing data reveals the relationship between intratumor microbiome signature and host metabolic heterogeneity in breast cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1140995
PMID:36999009
|
研究论文 | 本文通过整合批量和单细胞RNA测序数据，揭示了肿瘤内微生物组特征与宿主代谢异质性在乳腺癌中的关系 | 首次探讨了肿瘤内微生物组与乳腺癌代谢活动之间的关联，并识别了与特定微生物相关的细胞亚群 | 研究依赖于公共数据集，可能存在数据质量和样本选择偏倚的问题 | 探索肿瘤内微生物组与乳腺癌患者代谢状态之间的关系 | 乳腺癌患者的肿瘤内微生物组和宿主代谢状态 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 1085名乳腺癌患者和32个单细胞RNA测序样本 |
| 4339 | 2024-08-08 |
Human umbilical cord mesenchymal stem cell-derived exosomes promote murine skin wound healing by neutrophil and macrophage modulations revealed by single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1142088
PMID:36999022
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研究论文 | 本研究探讨了人脐带间充质干细胞衍生的外泌体（hucMSC-Exosomes）对小鼠皮肤伤口愈合中中性粒细胞和巨噬细胞单细胞转录组的影响 | 本研究首次揭示了hucMSC-Exosomes在皮肤伤口愈合中对中性粒细胞和巨噬细胞的转录组异质性的影响 | NA | 研究hucMSC-Exosomes对皮肤伤口愈合中中性粒细胞和巨噬细胞的单细胞转录组的影响 | 人脐带间充质干细胞衍生的外泌体（hucMSC-Exosomes）对小鼠皮肤伤口愈合中中性粒细胞和巨噬细胞的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 中性粒细胞和巨噬细胞的转录组数据 |
| 4340 | 2024-08-08 |
Corrigendum: Human umbilical cord mesenchymal stem cell-derived exosomes promote murine skin wound healing by neutrophil and macrophage modulations revealed by single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1181215
PMID:37000180
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |