单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 4261 - 4280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4261 | 2024-08-08 |
Schwann Cells Are Key Regulators of Corneal Epithelial Renewal
2023-04-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.4.7
PMID:37036418
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研究论文 | 本研究探讨了施万细胞在维持和再生角膜上皮细胞更新中的关键作用 | 首次明确了角膜轴突包裹的施万细胞在角膜上皮细胞稳态和再生更新中的重要作用 | NA | 研究施万细胞在角膜上皮细胞更新中的作用 | 施万细胞和角膜上皮细胞 | NA | NA | 原位杂交、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了转基因小鼠和去神经化的大鼠角膜样本进行研究 |
| 4262 | 2024-08-08 |
Sox11 is enriched in myogenic progenitors but dispensable for development and regeneration of skeletal muscle
2023-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.30.534956
PMID:37034612
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析，探讨了转录因子Sox11在肌肉干细胞分化和功能中的作用 | 发现Sox11在肌肉干细胞分化过程中表达增加，但在静止和衰老的肌肉干细胞中表达减少 | Sox11在肌肉发生中的具体功能尚未明确 | 研究Sox11在肌肉干细胞分化和肌肉再生中的作用 | 肌肉干细胞（MuSCs）及其在骨骼肌发育和再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 年轻和老年小鼠的肌肉再生样本 |
| 4263 | 2024-08-08 |
Endothelial cells are a key target of IFN-g during response to combined PD-1/CTLA-4 ICB treatment in a mouse model of bladder cancer
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534561
PMID:37034778
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了在小鼠膀胱癌模型中，联合PD-1/CTLA-4免疫检查点阻断治疗对不同细胞类型的响应机制 | 首次揭示了内皮细胞在IFN-γ信号传导中作为ICB治疗响应的关键介质 | NA | 探索联合PD-1/CTLA-4免疫检查点阻断治疗在个体细胞类型中的响应机制 | 小鼠膀胱癌模型中的内皮细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包含三种条件：未治疗的肿瘤、治疗的肿瘤和CD4+ T细胞耗竭后治疗的肿瘤 |
| 4264 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome dataset of human and mouse in vitro adipogenesis models
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534456
PMID:37034809
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研究论文 | 本文介绍了人类和小鼠体外脂肪形成模型的单细胞转录组数据集，通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析了3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化。 | 首次提供了3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成过程中的单细胞转录组数据，有助于理解细胞间基因表达的变异性。 | NA | 研究人类和小鼠体外脂肪形成过程中的分子调控和细胞间基因表达的变异性。 | 3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 混合的3T3-L1和SGBS细胞 |
| 4265 | 2024-08-05 |
exFINDER: identify external communication signals using single-cell transcriptomics data
2023-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.24.533888
PMID:37034624
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研究论文 | 本文介绍了一种名为exFINDER的方法，用于利用单细胞转录组数据识别细胞接收到的外部信号 | exFINDER通过利用信号通路的先验知识，能够发现激活特定目标基因的外部信号，并推断外部信号-靶标信号网络 | NA | 研究旨在开发一种方法识别通过单细胞转录组数据接收到的外部信号 | 使用不同物种的scRNA-seq数据集进行外部信号的识别和分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个不同物种的scRNA-seq数据集 |
| 4266 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing-Based Validation of T Cell-Associated Diagnostic Model Genes and Drug Response in Crohn's Disease
2023-Mar-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24076054
PMID:37047025
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研究论文 | 该研究旨在通过单细胞测序验证与T细胞相关的克罗恩病诊断模型基因及其药物反应 | 首次将单细胞表达谱数据与T细胞标记基因的诊断与药物反应相结合 | 样本数量较少，可能影响研究结果的广泛适用性 | 进一步探索克罗恩病的诊断及T细胞标记基因表达的药物预测 | 22例克罗恩病或正常样本的单细胞表达谱数据 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | TNF中心的5基因诊断模型 | 单细胞表达谱数据 | 22个样本 |
| 4267 | 2024-08-05 |
Single-cell mapping of N6-methyladenosine in esophageal squamous cell carcinoma and exploration of the risk model for immune infiltration
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1155009
PMID:37025404
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研究论文 | 本研究探讨了N6-甲基腺苷（m6A）在食道鳞状细胞癌中的分布及其对免疫浸润的风险模型的构建 | 首次在食道鳞状细胞癌中进行单细胞m6A映射，构建了与免疫浸润相关的风险模型 | 缺乏对m6A具体机制的深入探讨 | 研究m6A在食道癌发展中的作用及其机制 | 174名食道鳞状癌患者的RNA-seq和单细胞测序数据 | 数字病理学 | 食道癌 | RNA-seq | NA | 基因序列数据 | 174个食道鳞状癌患者的样本以及4个单细胞样本 |
| 4268 | 2024-08-05 |
Disease modeling of ADAMTS9-related nephropathy using kidney organoids reveals its roles in tubular cells and podocytes
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1089159
PMID:37035301
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研究论文 | 本研究揭示了ADAMTS9在肾小管细胞和足细胞中的功能角色。 | 识别到新的复合杂合ADAMTS9变异，探讨其在肾脏疾病中的作用。 | 本研究主要集中在ADAMTS9的功能，未探讨其他相关基因的影响。 | 研究ADAMTS9缺失与肾小管病及肾小球病之间的关系。 | 研究两名患有肾小管病的NPHP-RC兄妹的ADAMTS9突变。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 肾脏类器官 | 基因表达 | 2名兄妹 |
| 4269 | 2024-08-05 |
Identification of an immune subtype-related prognostic signature of clear cell renal cell carcinoma based on single-cell sequencing analysis
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1067987
PMID:37035172
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研究论文 | 本研究构建了一个与免疫亚型相关的预后模型，以预测透明细胞肾细胞癌患者的预后 | 首次基于单细胞测序分析定义了ccRCC的免疫亚型相关基因，并构建了一个包含五个基因的预后模型 | 该研究可能缺乏多中心大样本验证以确保模型的普适性 | 旨在预测透明细胞肾细胞癌患者的预后并为治疗策略提供指导 | 聚焦于透明细胞肾细胞癌患者及其免疫亚型特征 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序 | Cox回归和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 包含TCGA和GEO数据库中的ccRCC患者数据 |
| 4270 | 2024-08-05 |
Mitochondria-associated gene expression perturbation predicts clinical outcomes and shows potential for targeted therapy in neuroblastoma
2023, Frontiers in pediatrics
IF:2.1Q2
DOI:10.3389/fped.2023.1094926
PMID:37025299
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研究论文 | 本文探讨了与线粒体相关的基因表达扰动如何预测神经母细胞瘤的临床结果，并展示其作为靶向治疗的潜力 | 提出了线粒体相关蛋白（MAPs）在神经母细胞瘤中的关键作用，并识别出一组独立于MYCN扩增状态的MAP基因标志 | 对线粒体相关蛋白在神经母细胞瘤中作用的全面研究仍然不足，需进一步探索 | 研究线粒体相关基因在神经母细胞瘤中的表达及其与临床结局的关系 | 神经母细胞瘤患者的线粒体相关基因 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | Cox回归分析 | 转录组数据 | 分析了1,712个MAP基因及相关的细胞系和人类初级T细胞 |
| 4271 | 2024-08-05 |
Benchmarking of Nanopore R10.4 and R9.4.1 flow cells in single-cell whole-genome amplification and whole-genome shotgun sequencing
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.03.038
PMID:37025654
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研究论文 | 该文章评估了R10.4流动单元在癌细胞分析中的优势和缺陷。 | 这是首次通过使用ONT R10.4和R9.4.1 MinION流动单元对单细胞全基因组测序进行基准测试。 | 文章未提及具体的样本多样性或其他类型的癌细胞分析局限性。 | 评估新一代测序技术在癌症基因组学和表观基因组学研究中的应用。 | 该研究主要针对人类非小细胞肺癌细胞系HCC78进行分析。 | 基因组学 | 肺癌 | NGS | NA | 基因组数据 | 单细胞样本 |
| 4272 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA analysis to identify five cytokines signaling in immune-related genes for melanoma survival prognosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1148130
PMID:37026000
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析五种细胞因子信号在黑色素瘤生存预后中的作用 | 首次构建并验证了基于单细胞RNA测序数据的机器学习模型，具有成为新治疗靶点和预后生物标志物面板的潜力 | NA | 评估细胞因子信号在与免疫相关基因中的预测价值，以便诊断和治疗黑色素瘤患者 | 黑色素瘤患者及其免疫相关基因的细胞因子信号 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | RNA-seq数据 | NA |
| 4273 | 2024-08-08 |
A novel 7-chemokine-genes predictive signature for prognosis and therapeutic response in renal clear cell carcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1120562
PMID:37021054
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研究论文 | 本研究旨在建立一个针对肾透明细胞癌（ccRCC）的7种趋化因子基因预测签名，以评估患者的预后和治疗反应 | 本研究首次构建了基于7种趋化因子基因的预测签名，并验证了其在ccRCC中的预后价值和治疗反应预测能力 | 需要进一步的临床试验来验证该预测签名在实际治疗中的应用效果 | 建立一个趋化因子基因签名，用于评估肾透明细胞癌的预后和治疗反应 | 肾透明细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO算法 | mRNA测序数据 | 526名肾透明细胞癌患者（263名训练组样本和263名验证组样本） |
| 4274 | 2024-08-08 |
Cellular heterogeneity and stem cells of vascular endothelial cells in blood vessel formation and homeostasis: Insights from single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1146399
PMID:37025170
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研究论文 | 本文总结了单细胞RNA测序技术在血管内皮细胞异质性和内皮干细胞与血管生成及稳态关系研究中的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术发现了新的动脉、静脉和毛细血管内皮细胞的分子特征，以及先前未被识别的特殊内皮细胞亚型 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在血管内皮细胞异质性和内皮干细胞研究中的应用前景 | 血管内皮细胞的异质性和内皮干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多种小鼠组织和人体器官 |
| 4275 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell analysis and machine learning to create glycosylation-based gene signature for prognostic prediction of uveal melanoma
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1163046
PMID:37033251
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析和机器学习技术，创建了基于糖基化的基因特征，用于预测葡萄膜黑色素瘤的预后 | 首次利用糖基化相关基因特征作为独立预测因子，为葡萄膜黑色素瘤的临床诊断和治疗提供了新视角 | NA | 揭示糖基化相关基因在葡萄膜黑色素瘤预后中的影响 | 葡萄膜黑色素瘤患者 | 机器学习 | 葡萄膜黑色素瘤 | RNA-seq | NA | 基因数据 | NA |
| 4276 | 2024-08-08 |
The integrated single-cell analysis developed a lactate metabolism-driven signature to improve outcomes and immunotherapy in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1154410
PMID:37033259
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析，开发了一种基于乳酸代谢驱动的特征，以改善肺腺癌的预后和免疫治疗效果 | 构建了一个基于乳酸代谢相关基因的预测模型，用于预测肺腺癌患者的免疫治疗效果 | NA | 开发新的治疗肺腺癌患者的目标 | 肺腺癌患者的乳酸代谢相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | cox回归和lasso回归 | 基因数据 | 590个调控乳酸代谢的基因 |
| 4277 | 2024-08-08 |
Single-cell protein activity analysis reveals a novel subpopulation of chondrocytes and the corresponding key master regulator proteins associated with anti-senescence and OA progression
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1077003
PMID:37033917
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和metaVIPER算法，揭示了与抗衰老和骨关节炎进展相关的新型软骨细胞亚群及其关键主调控蛋白 | 首次通过单细胞蛋白活性分析，识别出与骨关节炎进展和细胞抗衰老相关的新型软骨细胞亚群及其关键调控蛋白 | 研究依赖于已发表的单细胞RNA测序数据，可能存在基因丢失问题 | 深入了解软骨细胞的分子特征，并为骨关节炎的有效干预策略提供理论基础 | 软骨细胞及其在骨关节炎中的作用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 62,449个来自健康个体和骨关节炎患者的软骨细胞，以及24,675个人类软骨细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 4278 | 2024-08-08 |
Imputation of single-cell transcriptome data enables the reconstruction of networks predictive of breast cancer metastasis
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.03.036
PMID:37035549
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据插补技术，重建了预测乳腺癌转移的细胞类型特异性基因网络 | 首次展示了通过插补单细胞RNA测序数据，有效重建细胞类型特异性基因网络，并识别出乳腺癌转移的关键基因 | NA | 探索单细胞转录组数据在重建细胞类型特异性基因网络中的应用，并识别乳腺癌转移的关键基因 | 七种原发性和九种转移性乳腺癌细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 七种原发性和九种转移性乳腺癌细胞系 |
| 4279 | 2024-08-08 |
Comparison of cell subsets in chronic obstructive pulmonary disease and controls based on single-cell transcriptome sequencing
2023, Technology and health care : official journal of the European Society for Engineering and Medicine
IF:1.4Q3
DOI:10.3233/THC-236002
PMID:37038777
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术比较了慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者与对照组的细胞亚群差异 | 利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）研究COPD患者与对照组的细胞亚群分类，并探讨长链非编码RNA（lncRNA）在单细胞水平的表达 | NA | 旨在进一步理解COPD患者适应性免疫细胞反应的机制 | COPD患者与对照组的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从Gene Expression Omnibus（GEO）数据库下载的COPD患者外周血单个核细胞数据 |
| 4280 | 2024-08-08 |
Age- and Microbiota-Dependent Cell Stemness Plasticity Revealed by Cattle Cell Landscape
2023, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0025
PMID:37040481
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，分析了新生和成年牛的多个器官的细胞图谱，揭示了年龄和微生物群依赖的细胞干细胞可塑性。 | 本文首次揭示了新生反刍动物前胃上皮细胞的转录不一致性和随机性，并发现了一种新生牛特有的新型细胞类型。 | NA | 研究新生和成年反刍动物细胞差异，以改善家养反刍动物的健康和性能。 | 新生和成年牛的多个器官，包括瘤胃、网胃、重瓣胃、皱胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠、结肠、直肠、肝脏、唾液腺和乳腺。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 235,941个高质量单细胞，涵盖78种细胞类型 |