单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 5352 篇文献,本页显示第 4241 - 4260 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
4241 2024-08-08
Single-cell analysis reveals novel clonally expanded monocytes associated with IL1β-IL1R2 pair in acute inflammatory demyelinating polyneuropathy
2023-04-11, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性炎症性脱髓鞘多发性神经病(AIDP)患者的外周血单个核细胞(PBMCs),揭示了一种新的克隆扩增的CD14+ CD163+单核细胞亚型及其与IL1β-IL1R2细胞间通讯的关系。 首次在AIDP患者中发现了一种新的克隆扩增的CD14+ CD163+单核细胞亚型,并观察到IL1β-IL1R2细胞间通讯的增加。 本研究为单中心前瞻性研究,样本量较小,需要进一步的多中心研究来验证结果。 通过分析AIDP患者PBMCs的单细胞图谱,加深对吉兰-巴雷综合征(GBS)患者外周免疫细胞组成的理解,并为未来研究提供理论基础。 急性炎症性脱髓鞘多发性神经病(AIDP)患者和健康对照的外周血单个核细胞(PBMCs)。 数字病理学 神经疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞 5名AIDP患者和3名健康对照
4242 2024-08-05
A single-cell, time-resolved profiling of Xenopus mucociliary epithelium reveals nonhierarchical model of development
2023-04-07, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 这篇文章揭示了蛙类粘液纤毛上皮的发育模式及其细胞类型的形成 揭示了粘液纤毛上皮的非等级性发育模式和多能早期上皮祖细胞的功能 未深入探讨粘液纤毛上皮发育的所有分子机制 研究粘液纤毛上皮的发育过程及其细胞命运获取机制 研究从多能状态到成熟阶段的粘液纤毛上皮细胞 数字病理 慢性呼吸系统疾病 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA成像 多能早期上皮祖细胞到成熟细胞的多阶段样本
4243 2024-08-05
Ancient ubiquitous protein 1 (AUP1) is a prognostic biomarker connected with TP53 mutation and the inflamed microenvironments in glioma
2023-Apr-07, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 这篇文章研究了古老普遍蛋白1 (AUP1) 在胶质瘤中的预后作用及其与TP53突变和炎性微环境的关系 发现AUP1与TP53状态、肿瘤突变负担以及肿瘤增殖相关并首次评估其在胶质瘤中的角色 未能发现AUP1抑制与自噬活性改变之间的直接联系,可能需要进一步研究 探讨AUP1在胶质瘤中的作用及其作为预后生物标记的潜力 主要研究胶质瘤及其相关临床标志物 数字病理学 胶质瘤 mRNA测序、蛋白质组学、全外显子组测序和免疫组化染色 U87MG细胞系 mRNA、蛋白质、临床案例 78个临床案例和多个数据集的单细胞测序数据
4244 2024-08-08
N,N-Dimethyl-3β-hydroxycholenamide attenuates neuronal death and retinal inflammation in retinal ischemia/reperfusion injury by inhibiting Ninjurin 1
2023-Apr-07, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 研究N,N-二甲基-3β-羟基胆甾胺(DMHCA)通过抑制Ninjurin 1减轻视网膜缺血/再灌注损伤中的神经元死亡和视网膜炎症 首次揭示了DMHCA通过抑制Ninjurin 1在视网膜缺血/再灌注损伤中的神经保护作用,并提供了单细胞RNA测序的新见解 文章未提及具体的局限性 探讨DMHCA在视网膜缺血/再灌注损伤中的效果及其分子机制 DMHCA处理的小鼠视网膜缺血/再灌注损伤及DMHCA处理后的微胶质细胞 NA 视网膜疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 未具体说明样本数量
4245 2024-08-08
Comprehensive analysis of cuproptosis-related immune biomarker signature to enhance prognostic accuracy in gastric cancer
2023-04-07, Aging
研究论文 本研究探讨了铜依赖性程序性细胞死亡机制——铜死亡相关免疫基因(CRIGs)在胃癌(GC)中的潜在功能及其作为生物标志物的价值 首次揭示了CRIGs在胃癌中的功能,并建立了一个有效的铜死亡相关免疫生物标志物签名,用于准确预测胃癌患者的长期生存 NA 挖掘铜死亡相关免疫基因在胃癌中的潜在功能及其作为生物标志物的价值 胃癌及其免疫微环境 数字病理学 胃癌 scRNA-seq, 免疫组织化学 Cox和LASSO分析 转录组数据, 临床信息 数据来自TCGA, GTEx, 和GEO数据库
4246 2024-08-05
Identification of cell barcodes from long-read single-cell RNA-seq with BLAZE
2023-04-06, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 文章介绍了BLAZE,这是一种用于仅依赖纳米孔长读长单细胞RNA测序数据识别细胞条形码的方法 BLAZE准确高效地识别10x细胞条形码,而不依赖于匹配的短读数据 NA 旨在简化长读单细胞RNA测序并提高结果质量 长读单细胞RNA测序数据中的细胞条形码 数字病理学 NA RNA测序 NA 长读RNA测序数据 NA
4247 2024-08-05
Prognostic values of tissue-resident CD8+T cells in human hepatocellular carcinoma and intrahepatic cholangiocarcinoma
2023-Apr-06, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1
研究论文 该研究分析了组织驻留CD8+T细胞在肝细胞癌和肝内胆管癌中的预后价值 首次系统描述了肝细胞癌和肝内胆管癌中CD8+T细胞的表达及其预后相关性 本研究的样本量和单细胞RNA测序分析可能存在选择偏倚 探讨组织驻留CD8+T细胞在肝细胞癌和肝内胆管癌中的预后价值 人类肝细胞癌和肝内胆管癌中的组织驻留CD8+T细胞 数字病理学 肝细胞癌 多重免疫组化(mIHC)和成像分析 NA 组织样本 使用了肝细胞癌和肝内胆管癌的组织微阵列
4248 2024-08-05
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Microevolution of the Stickleback Immune System
2023-04-06, Genome biology and evolution IF:3.2Q2
研究论文 本研究揭示了三刺鱼免疫系统微进化的特征 首次创建了三刺鱼的综合免疫细胞图谱,并展示了免疫细胞类型之间显著的变异 研究的样本量相对较小,仅包含来自三个种群的九条鱼 探讨三刺鱼种群间免疫系统的微进化 三刺鱼(Gasterosteus aculeatus)和寄生虫感染相关免疫细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 九条鱼,来自三个不同的种群
4249 2024-08-05
Cynomolgus monkey embryo model captures gastrulation and early pregnancy
2023-04-06, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 构建了与人类胚胎形态和转录组相似的猕猴胚胎模型,观察其发育潜力 首次展示了猕猴胚胎在体外发生胃肠形成与体内早期妊娠的能力 未对比不同胚胎发展阶段的各种模型 探讨猕猴胚胎的发育潜力并在伦理上对人类胚胎研究进行替代 猕猴胚胎模型 数字病理学 NA 单细胞转录组学 NA 细胞、胚胎组织 使用猕猴胚胎模型进行的多次实验,具体样本量未说明
4250 2024-08-08
FIPRESCI: droplet microfluidics based combinatorial indexing for massive-scale 5'-end single-cell RNA sequencing
2023-04-06, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文介绍了一种基于液滴微流控技术的组合索引方法FIPRESCI,用于大规模5'端单细胞RNA测序 FIPRESCI方法通过大规模样本复用,将液滴微流控系统的通量提高了十倍以上 NA 开发一种超高通量的5'端单细胞RNA测序方法 小鼠胚胎和12名癌症患者的外周血T细胞 数字病理学 癌症 RNA测序 NA RNA 约100,000个单细胞转录组
4251 2024-08-08
Matters arising: Insufficient evidence that pancreatic β cells are derived from adult ductal Neurog3-expressing progenitors
2023-04-06, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本文对Gribben等人关于成年胰腺导管细胞作为内分泌前体的结论提出质疑,并通过实验数据支持成年胰腺β细胞并非源自导管细胞的观点 提出对现有胰腺β细胞起源理论的重新解释,挑战了传统的观点 依赖于特定的Cre线标记方法,可能存在标记错误和分类错误的问题 探讨胰腺β细胞的起源,对糖尿病再生疗法具有重要意义 胰腺β细胞及其可能的前体细胞 NA 糖尿病 单细胞RNA测序 NA RNA序列 未具体说明样本数量
4252 2024-08-05
Localized nuclear reaction breaks boron drug capsules loaded with immune adjuvants for cancer immunotherapy
2023-04-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文研究了一种通过局部核反应激活的硼胶囊与免疫佐剂联用的癌症免疫疗法 本研究工程化了一种中子激活的硼胶囊,能够增强BNCT和免疫佐剂的协同效果,以引发强效的抗肿瘤免疫反应 目前缺乏对其抗肿瘤效果的进一步临床研究 探讨硼中子捕获疗法的抗肿瘤免疫响应 采用女性小鼠肿瘤模型进行研究 数字病理学 癌症 BNCT NA NA 使用女性小鼠肿瘤模型进行观察
4253 2024-08-05
clusterMaker2: a major update to clusterMaker, a multi-algorithm clustering app for Cytoscape
2023-Apr-05, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 clusterMaker2是clusterMaker的重大更新,提供多种算法用于生物数据集的聚类分析 引入了新的算法类别,如节点排名和降维,增强了与Cytoscape的集成 NA 旨在提供易于使用的工具以分析和可视化现代生物数据集 对酵母热休克表达实验数据集进行重新分析 数字病理学 NA NA NA 数据集 NA
4254 2024-08-08
Schwann Cells Are Key Regulators of Corneal Epithelial Renewal
2023-04-03, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究探讨了施万细胞在维持和再生角膜上皮细胞更新中的关键作用 首次明确了角膜轴突包裹的施万细胞在角膜上皮细胞稳态和再生更新中的重要作用 NA 研究施万细胞在角膜上皮细胞更新中的作用 施万细胞和角膜上皮细胞 NA NA 原位杂交、免疫组织化学、单细胞RNA测序 NA 细胞 使用了转基因小鼠和去神经化的大鼠角膜样本进行研究
4255 2024-08-08
Sox11 is enriched in myogenic progenitors but dispensable for development and regeneration of skeletal muscle
2023-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过单细胞RNA测序数据分析,探讨了转录因子Sox11在肌肉干细胞分化和功能中的作用 发现Sox11在肌肉干细胞分化过程中表达增加,但在静止和衰老的肌肉干细胞中表达减少 Sox11在肌肉发生中的具体功能尚未明确 研究Sox11在肌肉干细胞分化和肌肉再生中的作用 肌肉干细胞(MuSCs)及其在骨骼肌发育和再生中的作用 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 年轻和老年小鼠的肌肉再生样本
4256 2024-08-08
Endothelial cells are a key target of IFN-g during response to combined PD-1/CTLA-4 ICB treatment in a mouse model of bladder cancer
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序探索了在小鼠膀胱癌模型中,联合PD-1/CTLA-4免疫检查点阻断治疗对不同细胞类型的响应机制 首次揭示了内皮细胞在IFN-γ信号传导中作为ICB治疗响应的关键介质 NA 探索联合PD-1/CTLA-4免疫检查点阻断治疗在个体细胞类型中的响应机制 小鼠膀胱癌模型中的内皮细胞 数字病理学 膀胱癌 scRNA-seq NA 单细胞RNA测序数据 包含三种条件:未治疗的肿瘤、治疗的肿瘤和CD4+ T细胞耗竭后治疗的肿瘤
4257 2024-08-08
Single-cell transcriptome dataset of human and mouse in vitro adipogenesis models
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了人类和小鼠体外脂肪形成模型的单细胞转录组数据集,通过单细胞RNA测序(scRNA-Seq)分析了3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化。 首次提供了3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成过程中的单细胞转录组数据,有助于理解细胞间基因表达的变异性。 NA 研究人类和小鼠体外脂肪形成过程中的分子调控和细胞间基因表达的变异性。 3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 转录组数据 混合的3T3-L1和SGBS细胞
4258 2024-08-05
exFINDER: identify external communication signals using single-cell transcriptomics data
2023-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为exFINDER的方法,用于利用单细胞转录组数据识别细胞接收到的外部信号 exFINDER通过利用信号通路的先验知识,能够发现激活特定目标基因的外部信号,并推断外部信号-靶标信号网络 NA 研究旨在开发一种方法识别通过单细胞转录组数据接收到的外部信号 使用不同物种的scRNA-seq数据集进行外部信号的识别和分析 数字病理学 NA 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 多个不同物种的scRNA-seq数据集
4259 2024-08-05
Single-Cell Sequencing-Based Validation of T Cell-Associated Diagnostic Model Genes and Drug Response in Crohn's Disease
2023-Mar-23, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 该研究旨在通过单细胞测序验证与T细胞相关的克罗恩病诊断模型基因及其药物反应 首次将单细胞表达谱数据与T细胞标记基因的诊断与药物反应相结合 样本数量较少,可能影响研究结果的广泛适用性 进一步探索克罗恩病的诊断及T细胞标记基因表达的药物预测 22例克罗恩病或正常样本的单细胞表达谱数据 数字病理学 克罗恩病 单细胞测序 TNF中心的5基因诊断模型 单细胞表达谱数据 22个样本
4260 2024-08-05
Single-cell mapping of N6-methyladenosine in esophageal squamous cell carcinoma and exploration of the risk model for immune infiltration
2023, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究探讨了N6-甲基腺苷(m6A)在食道鳞状细胞癌中的分布及其对免疫浸润的风险模型的构建 首次在食道鳞状细胞癌中进行单细胞m6A映射,构建了与免疫浸润相关的风险模型 缺乏对m6A具体机制的深入探讨 研究m6A在食道癌发展中的作用及其机制 174名食道鳞状癌患者的RNA-seq和单细胞测序数据 数字病理学 食道癌 RNA-seq NA 基因序列数据 174个食道鳞状癌患者的样本以及4个单细胞样本
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