单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 4181 - 4200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4181 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptome atlas of the maturing zebrafish telencephalon
2023-04, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277278.122
PMID:37072188
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研究论文 | 本文通过综合分析约64,000个单细胞转录组数据，描绘了斑马鱼端脑从幼体到成体的九种主要神经细胞类型及其标记基因 | 发现了斑马鱼与小鼠神经细胞类型的保守性和缺失性，以及在成年前脑中显著扩张的几种细胞类型 | NA | 揭示斑马鱼端脑神经细胞类型的转录特征及其发育时间线 | 斑马鱼端脑的神经细胞类型及其发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 约64,000个细胞，来自6天、15天和成体的端脑 |
| 4182 | 2024-08-08 |
Intratumoral tertiary lymphoid structure (TLS) maturation is influenced by draining lymph nodes of lung cancer
2023-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005539
PMID:37072348
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研究论文 | 研究探讨了肺肿瘤引流淋巴结（TDLN）对非小细胞肺癌（NSCLC）内肿瘤内三级淋巴结构（TLS）成熟的影响 | 首次研究了肿瘤引流淋巴结与肿瘤内三级淋巴结构成熟之间的关系 | 研究样本仅限于接受手术的616名患者，可能无法代表所有NSCLC患者的情况 | 探讨肿瘤引流淋巴结对肿瘤内三级淋巴结构成熟的影响及其机制 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织和淋巴结 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫组织化学，多重免疫荧光和流式细胞术 | Cox比例风险回归模型，逻辑回归模型 | 组织切片 | 616名接受手术的非小细胞肺癌患者 |
| 4183 | 2024-08-08 |
Identification of distinct tumor cell patterns with single-cell RNA sequencing integrating primary lung adenocarcinoma and brain metastasis tumor
2023-Mar-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-23-107
PMID:37057123
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，整合原发性肺腺癌和脑转移瘤的数据，分析肿瘤细胞的异质性并识别潜在的治疗靶点 | 本研究首次整合了原发性肺腺癌和脑转移瘤的单细胞RNA测序数据，揭示了脑转移瘤细胞的高度异质性及其潜在的恶性细胞来源 | 研究样本量较小，仅包括8名未经治疗的肺腺癌脑转移患者，可能影响结果的普遍性 | 旨在解析肿瘤细胞的异质性并识别潜在的治疗靶点 | 肺腺癌及其脑转移瘤的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 8名未经治疗的肺腺癌脑转移患者及10个原发性肺腺癌样本及其匹配的正常组织 |
| 4184 | 2024-08-05 |
Single-Cell Isolation Microfluidic Chip Based on Thermal Bubble Micropump Technology
2023-Mar-30, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s23073623
PMID:37050683
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于热气泡微泵技术的微流体芯片，用于单细胞的分离。 | 该方法通过匹配流道的流阻实现单细胞分离，无需注射泵和蠕动泵，大大简化了操作流程。 | 目前单细胞的捕获率约为75%，尚未实现100%的捕获率。 | 研究旨在开发一种高通量的单细胞分离技术。 | 研究对象为单细胞，包括细胞悬浮液和聚苯乙烯微珠。 | 数字病理学 | NA | 热气泡微泵技术 | 微流体芯片 | 细胞悬液、微珠 | 多个单细胞和聚苯乙烯微珠样本 |
| 4185 | 2024-08-05 |
Data-driven microscopy allows for automated context-specific acquisition of high-fidelity image data
2023-03-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100419
PMID:37056378
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研究论文 | 本文介绍了一种数据驱动显微镜技术，可以自动获取背景特定的高保真图像数据。 | 提出了一种数据驱动显微镜(DDM)框架，结合实时的人群特征化，能够根据人群背景进行高保真成像。 | 尚未明确提及限制 | 研究目标是提高显微成像的质量和可重复性，特别是在样本人群背景下。 | 研究对象为细胞迁移和感染过程中感兴趣的事件。 | 数字病理学 | NA | 显微镜成像 | NA | 图像 | NA |
| 4186 | 2024-08-08 |
A robust and efficient microvascular isolation method for multimodal characterization of the mouse brain vasculature
2023-03-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100431
PMID:37056377
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research paper | 本文开发了一种快速简单的脑血管片段分离方法，无需转基因报告基因，适用于多种实验模式 | 该方法能够快速简单地分离脑血管片段，适用于单细胞分析、蛋白质印迹和原代细胞培养等多种实验模式 | NA | 研究与疾病相关的脑血管变化 | 小鼠脑血管 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 22,515个细胞 |
| 4187 | 2024-08-05 |
Epi-Impute: Single-Cell RNA-seq Imputation via Integration with Single-Cell ATAC-seq
2023-Mar-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24076229
PMID:37047200
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Epi-Impute的计算方法，用于通过整合表达和编程组学数据来解决单细胞RNA-seq数据中的丢失现象 | Epi-Impute利用单细胞ATAC-seq数据作为额外的信息来源，以减少丢失现象的数量，特别适用于稀疏的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 提出一种新的方法来改进单细胞RNA-seq数据的缺失值填补 | 单细胞RNA-seq数据和单细胞ATAC-seq数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 4188 | 2024-08-08 |
ERS International Congress 2022: highlights from the Basic and Translational Science Assembly
2023-Mar, ERJ open research
IF:4.3Q1
DOI:10.1183/23120541.00561-2022
PMID:37077558
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综述 | 本文综述了2022年欧洲呼吸学会国际大会中基础与转化科学会议的亮点内容 | 提出了人类肺细胞图谱(HLCA)作为健康人类肺部的新参考点，并结合单细胞RNA测序和空间数据，发现了新的细胞类型/状态和生态位 | NA | 探讨呼吸事件从出生到老年对气候变化相关空气质量变化的影响，以及转化研究中确定的哮喘新治疗靶点和免疫调节机制 | 呼吸事件、气候变化、空气质量、肺部疾病、哮喘治疗 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 空间数据 | NA |
| 4189 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of platelets from patients with periodontitis and diabetes
2023-Feb, Research and practice in thrombosis and haemostasis
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.rpth.2023.100099
PMID:37063767
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研究论文 | 本研究分析了牙周炎患者和同时患有牙周炎与2型糖尿病患者的血小板表达谱，以探讨牙周炎诱导的血小板转录组特征及糖尿病的修饰效应 | 本研究首次使用单细胞RNA测序技术分析了牙周炎及牙周炎合并2型糖尿病患者的血小板转录组，揭示了血小板在疾病状态下的分子变化 | 研究样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨牙周炎及牙周炎合并2型糖尿病对血小板转录组的影响 | 牙周炎患者、牙周炎合并2型糖尿病患者的血小板 | NA | 牙周炎, 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11名健康供体，10名牙周炎患者，6名牙周炎合并2型糖尿病患者 |
| 4190 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling of GP2-enriched pancreatic progenitors to simultaneously create acinar, ductal, and endocrine organoids
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.78323
PMID:37064874
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研究论文 | 本文对富含GP2的胰腺祖细胞进行单细胞分析，以同时创建腺泡、导管和内分泌类器官 | 引入了一种新型的胰腺祖细胞分化平台，采用综合化合物筛选和先进的计算工具，提高了多能性祖细胞的产生效率 | 没有明确提到实验的限制 | 研究人类多能干细胞向多能胰腺祖细胞的转化，探讨胰腺不同谱系的生成 | GP2富集的胰腺祖细胞，研究其多谱系潜力和细胞间通讯信号 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种PP亚群体的细胞，具体样本数量未提及 |
| 4191 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Single-cell RNA-seq analysis reveals cellular functional heterogeneity in dermis between fibrotic and regenerative wound healing fates
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1175360
PMID:37063891
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更正 | 该文章更正了之前关于单细胞RNA测序分析的内容 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4192 | 2024-08-05 |
TNFα aggravates detrimental effects of SARS-CoV-2 infection in the liver
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1151937
PMID:37063909
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研究论文 | 本文分析了TNFα在SARS-CoV-2感染中对肝脏的有害影响 | 研究发现肝脏中TNFα的表达增加与病人死亡率升高相关 | 当前尚不清楚这些免疫介质在SARS-CoV-2感染过程中对患者生存的具体影响 | 探讨在SARS-CoV-2感染过程中肝脏中TNFα信号的作用及其对患者生存的影响 | 对45名因SARS-CoV-2感染去世患者进行尸检分析 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 患者生物样本数据 | 45名因SARS-CoV-2感染去世的患者 |
| 4193 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing depicts metabolic changes in children with aplastic anemia
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1075408
PMID:37064094
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了儿童再生障碍性贫血的代谢变化 | 该研究首次揭示再生障碍性贫血患者T淋巴细胞和自然杀伤细胞的代谢异常路径 | 研究中没有提及样本的具体数量和来源的详细信息 | 探讨再生障碍性贫血中免疫细胞的代谢异常及其可能的治疗策略 | 儿童再生障碍性贫血患者及健康供体 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 4194 | 2024-08-05 |
Three-dimensional and single-cell sequencing of liver cancer reveals comprehensive host-virus interactions in HBV infection
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1161522
PMID:37063858
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研究论文 | 本研究揭示了HBV感染下肝癌的主机-病毒相互作用 | 首次应用三维基因组组织分析揭示HBV如何影响肝细胞的染色质相互作用 | 尚未探讨HBV感染的所有机制 | 研究HBV感染对肝疾病机制及主机-病毒相互作用的影响 | 针对HBV阴性及阳性肝细胞系的基因组和转录组分析 | 数字病理学 | 肝癌 | HiC测序 | NA | 单细胞RNA-seq、RNA-seq数据及ChIP-seq数据 | 使用了HepG2及HepG2-2.2.15细胞系，具体样本数量NA |
| 4195 | 2024-08-05 |
Recent advances in understanding neuronal diversity and neural circuit complexity across different brain regions using single-cell sequencing
2023, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2023.1007755
PMID:37063385
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研究论文 | 本文探讨了采用单细胞测序技术对不同脑区神经元多样性和神经电路复杂性的理解进展 | 文章创新性地总结了区域特异性发现，并强调单细胞测序在理解神经电路中的应用 | 文章未详细阐述实验方法和样本数量的具体限制 | 研究脑区特异性神经元多样性和神经电路复杂性的最新进展 | 研究对象为不同脑区的神经元及其电路 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 4196 | 2024-08-05 |
GRACE: Graph autoencoder based single-cell clustering through ensemble similarity learning
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0284527
PMID:37058497
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研究论文 | 本文介绍了一种新型的单细胞聚类算法GRACE | 提出了一种基于图自编码器的单细胞聚类算法，具有高度一致的细胞分组 | NA | 旨在提高单细胞聚类的准确性 | 单细胞基因表达数据 | 数字病理学 | 复杂疾病 | 单细胞测序 | 图自编码器 | 基因表达数据 | 真实世界单细胞测序数据集 |
| 4197 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals in vivo osteoimmunology interactions between the immune and skeletal systems
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1107511
PMID:37051201
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探索了免疫细胞与成骨细胞系细胞在体内的骨免疫相互作用 | 首次在单细胞分辨率下鉴定了多种可能介导免疫细胞与成骨细胞系细胞之间信号传递的配体-受体对 | NA | 揭示免疫系统与骨骼系统在体内的骨免疫相互作用 | 免疫细胞与成骨细胞系细胞的相互作用 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类股骨头和外周血单核细胞的数据集 |
| 4198 | 2024-08-08 |
Analysis of necroptosis-related prognostic genes and immune infiltration in idiopathic pulmonary fibrosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1119139
PMID:37051233
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研究论文 | 本研究探讨了特发性肺纤维化（IPF）中与坏死性凋亡相关的预后基因及其与免疫浸润的关系，构建了基于坏死性凋亡相关基因的IPF预后预测模型。 | 首次深入研究了IPF中的坏死性凋亡现象及其与免疫浸润的关联，并构建了预后预测模型。 | 研究主要基于公共数据库数据，需要在更多临床样本中验证模型的准确性和适用性。 | 探究IPF中的坏死性凋亡现象及其与免疫浸润的关系，构建预后预测模型。 | 特发性肺纤维化（IPF）中的坏死性凋亡相关基因及其与免疫浸润的关系。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | RT-qPCR, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据 | 使用了多个GEO数据库中的数据集，包括GSE110147, GSE70866, GSE122960, GSE213001, GSE93606，具体样本数量未详细说明。 |
| 4199 | 2024-08-08 |
Combined analysis of bulk and single-cell RNA sequencing reveals novel natural killer cell-related prognostic biomarkers for predicting immunotherapeutic response in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1142126
PMID:37056756
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研究论文 | 本研究通过结合批量和单细胞RNA测序数据，识别出与自然杀伤细胞相关的预后生物标志物，用于预测肝细胞癌的免疫治疗反应 | 首次结合批量和单细胞RNA测序数据，创建了一个基于自然杀伤细胞标记基因的独特预后特征，用于预测肝细胞癌患者的免疫治疗效果 | NA | 研究目的是识别和验证与自然杀伤细胞相关的预后生物标志物，以预测肝细胞癌患者的免疫治疗反应 | 研究对象为肝细胞癌患者的自然杀伤细胞及其相关预后生物标志物 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 共选择了1,196个样本进行分析 |
| 4200 | 2024-08-08 |
CD226 identifies functional CD8+T cells in the tumor microenvironment and predicts a better outcome for human gastric cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1150803
PMID:37056782
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研究论文 | 本文研究了CD226在人胃癌肿瘤微环境中对CD8+T细胞的调节作用及其对患者预后的影响 | 首次揭示了CD226在胃癌肿瘤微环境中对CD8+T细胞的调节作用，并证明了CD226CD8T细胞在胃癌患者中的预后价值 | NA | 探讨CD226在胃癌肿瘤微环境中对CD8+T细胞的调节作用及其对患者预后的影响 | 人胃癌肿瘤微环境中的CD8+T细胞和CD226表达 | 数字病理学 | 胃癌 | 转座酶可及染色质测序（ATAC-seq），多色免疫组织化学染色（mIHC），单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 胃癌患者的癌症组织样本 |