单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-09-23 |
Does Chronic Obstructive Pulmonary Disease Originate from Different Cell Types?
2023-11, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0175PS
PMID:37584669
|
研究论文 | 本文探讨了慢性阻塞性肺病（COPD）是否由不同细胞类型引起，并讨论了当前研究中的知识空白和技术应用 | 本文提出了通过新技术如单细胞转录组学和蛋白质组学来研究COPD的潜在机制 | 本文主要讨论了当前研究的局限性和知识空白，未提供具体实验数据 | 探讨COPD是否由不同细胞类型引起，并研究这些细胞在疾病发展中的作用 | COPD的病理机制和不同细胞类型在疾病发展中的作用 | NA | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-09-23 |
Loss of ANT1 Increases Fibrosis and Epithelial Cell Senescence in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2023-11, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0315OC
PMID:37487137
|
研究论文 | 研究探讨了ANT1在特发性肺纤维化中的作用及其对细胞衰老和纤维化的影响 | 首次揭示了ANT1缺失通过线粒体功能障碍、增加细胞衰老和减少AT2细胞再生能力，促进特发性肺纤维化的机制 | NA | 探究ANT1在特发性肺纤维化中的作用及其对细胞衰老和纤维化的影响 | 特发性肺纤维化患者肺组织中的ANT1和ANT2表达 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序和组织染色 | NA | RNA | 特发性肺纤维化患者肺组织样本 |
| 403 | 2024-09-23 |
A new Bayesian factor analysis method improves detection of genes and biological processes affected by perturbations in single-cell CRISPR screening
2023-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02017-4
PMID:37770710
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研究论文 | 本文介绍了一种新的贝叶斯因子分析方法，用于改进单细胞CRISPR筛选中受扰动影响的基因和生物过程的检测 | 开发了一种名为引导稀疏因子分析（GSFA）的新统计方法，通过推断潜在因子来检测基因扰动效应，显著提高了检测能力 | NA | 改进单细胞CRISPR筛选数据的分析方法，提高基因扰动效应的检测能力 | 单细胞CRISPR筛选数据，特别是受扰动影响的基因和生物过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR筛选 | 贝叶斯因子分析 | 基因表达数据 | 人类CD8 T细胞和神经前体细胞的单细胞CRISPR数据 |
| 404 | 2024-09-23 |
Camel nanobody-based B7-H3 CAR-T cells show high efficacy against large solid tumours
2023-09-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41631-w
PMID:37739951
|
研究论文 | 研究基于骆驼纳米抗体的B7-H3 CAR-T细胞对大型实体瘤的高效性 | 开发了基于骆驼纳米抗体识别B7-H3 IgC域的CAR-T细胞，显示出对大型肿瘤的强大抗肿瘤活性 | 研究仅在雌性小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 优化基于CAR-T细胞的免疫疗法，特别是针对实体瘤 | B7-H3蛋白及其在实体瘤中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组RNA测序，功能性T细胞蛋白质组学分析 | NA | RNA测序数据，蛋白质组学数据 | 雌性小鼠 |
| 405 | 2024-09-23 |
Genetic activation of glycolysis in osteoblasts preserves bone mass in type I diabetes
2023-09-21, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2023.07.003
PMID:37562406
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研究论文 | 研究探讨了I型糖尿病中骨形成受损的机制，并发现通过激活成骨细胞中的糖酵解可以维持骨量 | 首次揭示了I型糖尿病中成骨细胞糖代谢缺陷是骨质疏松的致病机制，并提出增强成骨细胞糖酵解可能是一种潜在的骨形成疗法 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探讨I型糖尿病中骨形成受损的机制，并寻找潜在的治疗策略 | I型糖尿病小鼠的成骨细胞和骨组织 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、稳定同位素示踪 | NA | RNA序列数据 | 小鼠模型 |
| 406 | 2024-09-23 |
Bulk brain tissue cell-type deconvolution with bias correction for single-nuclei RNA sequencing data using DeTREM
2023-Sep-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05476-w
PMID:37726653
|
研究论文 | 本文提出了一种名为DeTREM的改进方法，用于校正单核RNA测序数据与批量RNA测序数据之间的偏差，以提高脑组织细胞类型反卷积的准确性 | DeTREM方法通过补偿单核RNA测序与批量RNA测序数据之间的差异，提高了细胞类型反卷积的准确性，并优于其他反卷积方法 | NA | 提高脑组织细胞类型反卷积的准确性 | 人脑组织的细胞类型反卷积 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 (snRNA-seq) | MuSiC | RNA测序数据 | NA |
| 407 | 2024-09-23 |
SiGra: single-cell spatial elucidation through an image-augmented graph transformer
2023-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41437-w
PMID:37699885
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SiGra的方法，通过图像增强的图变换器来揭示单细胞空间域并增强稀疏和噪声的转录组数据 | SiGra方法结合了多通道免疫组化图像信息，通过混合图变换器在单细胞空间图上进行处理，显著提高了模型性能 | NA | 开发一种方法来利用图像信息揭示空间域并增强转录组数据 | 单细胞和斑点级别的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 免疫组化 | 图变换器 | 图像 | 复杂组织中的单细胞和斑点级别的空间转录组数据 |
| 408 | 2024-09-23 |
Alk1 acts in non-endothelial VE-cadherin+ perineurial cells to maintain nerve branching during hair homeostasis
2023-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40761-5
PMID:37699906
|
研究论文 | 研究了VE-cadherin和Alk1在非内皮细胞中的作用，特别是在神经分支维持中的作用 | 发现VE-cadherin和Alk1不仅在内皮细胞中起作用，还在非内皮细胞中维持神经分支 | NA | 探讨VE-cadherin和Alk1在皮肤血管重塑和神经分支维持中的作用 | VE-cadherin阳性细胞和Alk1在皮肤中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠 |
| 409 | 2024-09-23 |
Notch and retinoic acid signals regulate macrophage formation from endocardium downstream of Nkx2-5
2023-09-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41039-6
PMID:37669937
|
研究论文 | 研究揭示了Nkx2-5下游的Notch和视黄酸信号在心肌内膜向巨噬细胞分化的调控网络 | 首次揭示了Nkx2-5/Notch/RA信号通路在心肌内膜向巨噬细胞分化中的关键作用 | NA | 探讨心肌内膜向巨噬细胞分化的分子机制 | 心肌内膜、巨噬细胞、Nkx2-5、Notch信号、视黄酸信号 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 410 | 2024-09-23 |
NF-κB subunits direct kinetically distinct transcriptional cascades in antigen receptor-activated B cells
2023-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01561-7
PMID:37524800
|
研究论文 | 研究了NF-κB家族中的Rel和RelA在B细胞受体激活后的基因表达调控中的不同功能 | 揭示了Rel和RelA在B细胞激活后基因表达调控中的不同动力学特征和功能对抗性 | NA | 探讨NF-κB家族成员在B细胞激活后的基因表达调控中的特异性功能 | Rel和RelA在B细胞中的基因表达调控功能 | NA | NA | 多组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 411 | 2024-09-23 |
Projecting RNA measurements onto single cell atlases to extract cell type-specific expression profiles using scProjection
2023-08-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40744-6
PMID:37626024
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scProjection的方法，用于将多模态RNA测量映射到深度测序的scRNA-seq图谱上，以提取细胞类型特异性的单细胞基因表达谱 | scProjection方法结合了多模态和scRNA-seq测量的优势，能够精确地进行单细胞的多模态测量 | NA | 开发一种方法，将多模态RNA测量映射到深度测序的scRNA-seq图谱上，以提取细胞类型特异性的单细胞基因表达谱 | 多模态RNA测量和scRNA-seq图谱 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | NA | RNA | NA |
| 412 | 2024-09-23 |
Ret deficiency decreases neural crest progenitor proliferation and restricts fate potential during enteric nervous system development
2023-08-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2211986120
PMID:37585461
|
研究论文 | 研究了RET受体酪氨酸激酶在肠神经系统发育中对神经嵴来源细胞命运的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了RET缺失对肠神经系统发育中细胞类型和状态特异性效应的影响 | 仅限于小鼠模型，未涉及人类数据 | 探讨RET在肠神经系统发育中的作用及其缺失对细胞命运和增殖的影响 | 肠神经系统中的神经嵴来源细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从胚胎第12.5天和第14.5天的RET缺失杂合和纯合小鼠的发育中肠道中提取的神经嵴来源细胞 |
| 413 | 2024-09-23 |
Alignment of spatial transcriptomics data using diffeomorphic metric mapping
2023-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.11.534630
PMID:37090640
|
研究论文 | 本文开发了一种名为STalign的方法，用于通过微分同胚度量映射对空间转录组学数据进行对齐 | STalign方法能够处理部分匹配的组织切片和其他局部非线性畸变，显著提高了基因表达和细胞类型在匹配空间位置上的对应性 | NA | 解决空间转录组学数据在不同切片、样本和技术之间的比较难题 | 空间转录组学数据的对齐 | 生物信息学 | NA | 微分同胚度量映射 | NA | 空间转录组学数据 | NA |
| 414 | 2024-09-23 |
Spatial organization of the mouse retina at single cell resolution by MERFISH
2023-08-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40674-3
PMID:37582959
|
研究论文 | 本文使用MERFISH技术生成了小鼠视网膜的单细胞空间图谱 | 首次揭示了小鼠视网膜中8种先前未知的移位无长突细胞亚型，并建立了细胞亚型的分子分类与其空间排列之间的联系 | NA | 研究小鼠视网膜中神经元亚型的空间组织 | 小鼠视网膜中的神经元亚型及其空间组织 | 数字病理学 | NA | 多重错误纠正荧光原位杂交（MERFISH） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过390,000个细胞 |
| 415 | 2024-09-23 |
Characterizing cancer metabolism from bulk and single-cell RNA-seq data using METAFlux
2023-08-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40457-w
PMID:37573313
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为METAFlux的计算框架，用于从批量和单细胞RNA-seq数据中推断代谢通量，以表征癌症代谢 | 提出了METAFlux框架，能够从批量和单细胞RNA-seq数据中推断代谢通量，并验证了其在不同癌症和免疫治疗背景下的能力 | 尚未明确当前方法在肿瘤微环境表征中的可靠性 | 研究癌症研究中肿瘤微环境中的代谢重编程 | 癌症代谢的表征 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 涉及多种癌症和免疫治疗背景下的细胞系、TCGA数据和单细胞RNA-seq数据 |
| 416 | 2024-09-23 |
spinDrop: a droplet microfluidic platform to maximise single-cell sequencing information content
2023-08-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40322-w
PMID:37553326
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为spinDrop的液滴微流控平台，通过荧光激活液滴分选和皮克注射技术，提高了单细胞测序的信息含量和质量 | 本文创新性地使用荧光激活液滴分选和皮克注射技术，实现了对高质量材料和特定细胞类型的富集，并进行了多步酶促反应，显著提高了基因检测率和降低了背景噪音 | NA | 提高单细胞测序的信息含量和质量 | 单细胞测序中的液滴微流控技术 | 生物技术 | NA | 荧光激活液滴分选，皮克注射 | NA | RNA | 小鼠脑发育和器官发生过程中的RNA |
| 417 | 2024-09-23 |
Cas9-mediated knockout of Ndrg2 enhances the regenerative potential of dendritic cells for wound healing
2023-08-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40519-z
PMID:37550295
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研究论文 | 研究使用CRISPR/Cas9技术敲除Ndrg2基因，增强树突状细胞的再生潜力，以促进伤口愈合 | 首次使用CRISPR/Cas9技术精确编辑树突状细胞，增强其治疗慢性伤口的潜力 | 研究仅在非糖尿病和糖尿病小鼠模型中进行，尚未进行临床试验 | 开发一种新的细胞疗法，通过基因编辑增强树突状细胞的再生能力，以治疗慢性伤口 | 树突状细胞和慢性伤口 | 细胞疗法 | 慢性伤口 | CRISPR/Cas9 | NA | RNA序列 | 非糖尿病和糖尿病小鼠模型 |
| 418 | 2024-09-23 |
SpaRx: Elucidate single-cell spatial heterogeneity of drug responses for personalized treatment
2023-Aug-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.03.551911
PMID:37577665
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图的领域自适应模型SpaRx，用于揭示药物反应的空间细胞异质性，并优化个体化治疗 | SpaRx通过混合学习与动态对抗适应，将药物基因组学知识转移到单细胞空间转录组数据中，揭示了肿瘤细胞在肿瘤病变不同位置对药物的异质性敏感性或抗性 | NA | 揭示药物反应的空间细胞异质性，优化个体化治疗 | 肿瘤细胞对药物的反应及其空间异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞空间转录组学 | 图模型 | 转录组数据 | NA |
| 419 | 2024-09-23 |
Distinct pulmonary and systemic effects of dexamethasone in severe COVID-19
2023-Aug-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3168149/v1
PMID:37577607
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研究论文 | 研究地塞米松在严重COVID-19患者中的肺部和全身效应 | 通过批量和单细胞RNA测序以及血浆细胞因子分析，揭示了地塞米松在严重COVID-19患者中的免疫细胞效应，并识别了不同部位和细胞类型的特定差异 | 研究仅限于严重COVID-19患者，且依赖于公开数据集 | 探讨地塞米松在严重COVID-19患者中的免疫调节机制 | 严重COVID-19患者的肺部和全身免疫细胞 | NA | COVID-19 | RNA测序，细胞因子分析 | NA | RNA数据，细胞因子数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 420 | 2024-09-23 |
Integrative analysis of transcriptome dynamics during human craniofacial development identifies candidate disease genes
2023-08-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40363-1
PMID:37532691
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研究论文 | 本文通过整合分析转录组动态变化，识别出与人类颅面发育相关的候选疾病基因 | 本文首次结合bulk和单细胞RNA测序技术，分析了人类颅面组织在4-8周胚胎期的基因表达模式，并识别出539个可能与颅面畸形相关的基因 | 本文主要基于转录组和表观基因组数据进行分析，未涉及功能验证实验 | 研究人类颅面发育过程中的基因表达模式，识别与颅面畸形相关的候选基因 | 人类颅面组织在4-8周胚胎期的基因表达 | 基因组学 | 颅面畸形 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 4-8周胚胎期的人类颅面组织样本 |