单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5352 篇文献，本页显示第 4141 - 4160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4141 | 2024-08-08 |
Single-cell immune profiling reveals immune responses in oral lichen planus
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1182732
PMID:37090715
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和免疫组库测序技术，揭示了口腔扁平苔藓（OLP）黏膜免疫微环境的特征 | 首次通过单细胞免疫图谱分析，揭示了OLP中组织驻留记忆CD8+ T细胞的活化状态及其他免疫细胞的克隆扩增和基因配对偏好 | NA | 探究口腔扁平苔藓（OLP）的免疫反应机制 | 口腔扁平苔藓（OLP）的黏膜免疫微环境 | 数字病理学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组库测序 | NA | 转录组 | 四个OLP活检样本及其配对的外周血单个核细胞（PBMCs），两个健康组织和三个健康PBMCs样本 |
| 4142 | 2024-08-08 |
ProgClust: A progressive clustering method to identify cell populations
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1183099
PMID:37091787
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研究论文 | 提出了一种名为ProgClust的方法，用于分解细胞群并检测稀有细胞，通过聚类树表示单细胞数据，并设计了一种渐进搜索方法来选择细胞群特异性基因和聚类细胞 | ProgClust能够自动确定聚类数量，并有效地识别常见和稀有细胞，同时在真实未标记数据中揭示潜在的细胞亚群 | NA | 开发一种新的方法来识别单细胞RNA测序数据中的不同细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群和稀有细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类树 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 4143 | 2024-08-08 |
Molecular characterization of colorectal mucinous adenocarcinoma and adenocarcinoma, not otherwise specified, identified by multiomic data analysis
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1150362
PMID:37091868
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研究论文 | 本文利用多组学数据分析了结直肠黏液腺癌和非特定类型腺癌的分子特征 | 发现了非特定类型腺癌具有免疫活跃但暴露于缺氧微环境，而黏液腺癌细胞能保护DNA免受损伤，微环境不利于白细胞穿透内皮迁移 | NA | 探究非特定类型腺癌和黏液腺癌的分子特征及其在肿瘤微环境中的差异 | 结直肠黏液腺癌、非特定类型腺癌及正常结肠组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多组学数据分析 | NA | 蛋白质组学、转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学数据 | NA |
| 4144 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals new subtypes of lens superficial tissue in humans
2023-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13477
PMID:37057399
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了人眼透镜表层组织的新亚型 | 识别了特定表达C8orf4和ADAMTSL4的透镜上皮细胞亚型，以及与上皮细胞邻近的新类型纤维细胞 | 未明确人透镜干/祖细胞在上皮细胞中的分类及其分子特征 | 探讨人眼透镜上皮细胞的亚型及其分化的分子特征 | 人眼透镜表层组织中18,596个细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 18,596个细胞 |
| 4145 | 2024-08-05 |
VT3D: a visualization toolbox for 3D transcriptomic data
2023-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2023.04.001
PMID:37054878
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研究论文 | 本文介绍了VT3D，一个用于3D转录组数据可视化的工具箱 | VT3D允许用户探索3D转录组数据，并支持基因表达映射到任意感兴趣的2D平面 | 目前缺乏广泛可用的数据可视化工具，限制了该技术的潜在影响和应用 | 研究目的是开发一个可视化工具，以促进3D转录组数据的探索和理解 | 研究对象包括多种基于测序和成像的技术生成的数据集 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | NA | 3D转录组数据 | 多个数据集，包括Stereo-seq, 空间转录组学和Slide-seq等技术生成的数据 |
| 4146 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies a highly replicating Cd168+ skeletal stem/progenitor cell population in mouse long bones
2023-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2023.04.004
PMID:37075860
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了小鼠长骨中的骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs）的异质性，并发现了一种具有高度复制能力的Cd168+ SSPC群体 | 本研究首次鉴定出一种新的Cd168 SSPC群体，具有高度复制能力和成骨软骨生成潜力，并能在骨折愈合过程中贡献于新形成的骨骼组织 | NA | 阐明小鼠长骨中SSPC群体的异质性及其各自的再生能力 | 小鼠长骨中的骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠后肢芽、新生长骨和骨折长骨的单细胞RNA测序数据 |
| 4147 | 2024-08-08 |
Immunosuppressive tumor microenvironment contributes to tumor progression in diffuse large B-cell lymphoma upon anti-CD19 chimeric antigen receptor T therapy
2023-Aug, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-022-0972-8
PMID:37060525
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研究论文 | 研究抗CD19嵌合抗原受体T细胞疗法在复发或难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者中的效果及肿瘤微环境的影响 | 首次揭示了M2亚型巨噬细胞在CAR-T细胞疗法失败和疾病进展中的作用，并提出了针对肿瘤微环境和免疫细胞代谢重编程的治疗策略 | 研究样本量较小，需要进一步的大规模临床试验验证 | 探讨CAR-T细胞疗法失败的原因及肿瘤微环境的影响 | 复发或难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | CAR-T细胞 | RNA | 22名可评估的弥漫大B细胞淋巴瘤患者 |
| 4148 | 2024-08-05 |
TMEM59 ablation leads to loss of olfactory sensory neurons and impairs olfactory functions via interaction with inflammation
2023-07, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.04.005
PMID:37061103
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研究论文 | 本研究识别了TMEM59作为维持和再生嗅觉上皮的关键调节因子 | TMEM59缺失导致嗅觉功能受损和嗅觉神经元的丧失，揭示其与炎症的相互作用 | 本研究可能未探讨TMEM59与其他因素的相互作用 | 研究TMEM59在嗅觉上皮维持与再生中的作用 | TMEM59及其在嗅觉上皮中的功能与机制 | 数字病理学 | 嗅觉障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | TMEM59-KO动物和正常对照 |
| 4149 | 2024-08-08 |
Understanding and targeting erythroid progenitor cells for effective cancer therapy
2023-07-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000762
PMID:37052294
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综述 | 本文综述了红细胞祖细胞（EPCs）在癌症中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 近年来研究发现EPCs在癌症中具有促进肿瘤生长的作用，并能转化为免疫抑制性髓系细胞，限制T细胞功能和免疫治疗 | NA | 总结EPCs的生物学特性，探讨其促进肿瘤活动的机制，并展望未来针对这些细胞的治疗策略 | 红细胞祖细胞（EPCs）及其在癌症治疗中的应用 | NA | 癌症 | 单细胞转录组和谱系追踪分析 | NA | 转录组 | NA |
| 4150 | 2024-08-05 |
Anaplastic transformation in thyroid cancer revealed by single-cell transcriptomics
2023-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169653
PMID:37053016
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研究论文 | 本文研究了由单细胞转录组学揭示的甲状腺癌中去分化转化的过程 | 通过单细胞转录组学揭示了去分化甲状腺癌细胞的不同亚型和转化模型，识别出重要的转化关键阶段 | 目前对肿瘤内部复杂的转化过程仍缺乏全面理解 | 阐明甲状腺癌中去分化转化的细胞谱系和命运转变 | 不同亚型甲状腺癌患者的单细胞转录组和基因变化数据 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 不同亚型甲状腺癌患者的细胞数据 |
| 4151 | 2024-08-05 |
Fibroblast and Immune Cell Cross-Talk in Cardiac Fibrosis
2023-06, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-023-01877-8
PMID:37074566
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综述 | 本文全面概述了在心脏疾病中免疫细胞与成纤维细胞之间的相互作用 | 识别了在心肌梗死中可能的促炎成纤维细胞，并探讨了成纤维细胞如何影响炎症细胞行为 | 没有提到具体的实验数据支持或临床试验结果 | 探究心脏损伤背景下炎症与修复反应之间复杂的相互作用 | 关注心脏疾病中的成纤维细胞和炎症细胞 | 心血管疾病 | 心脏纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 4152 | 2024-08-05 |
Unraveling the heterogeneity of cholangiocarcinoma and identifying biomarkers and therapeutic strategies with single-cell sequencing technology
2023-Jun, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.114697
PMID:37060660
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综述 | 本文旨在利用单细胞测序技术评估胆管癌的异质性，以识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 通过单细胞测序技术深入分析胆管癌的肿瘤细胞基因组和表观基因组，提供了癌症进展机制的新见解 | 目前尚未解决的准确诊断方法限制了研究的广泛应用 | 寻找胆管癌的早期诊断生物标志物和改进治疗策略 | 胆管癌细胞及其异质性 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤组织 | NA |
| 4153 | 2024-08-08 |
Wnt3a-Loaded Extracellular Vesicles Promote Alveolar Epithelial Regeneration after Lung Injury
2023-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202206606
PMID:37072558
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研究论文 | 本研究开发了一种通过将Wnt3a固定在细胞外囊泡(EVs)表面来远程传递Wnt3a的策略，以促进肺损伤后的肺泡上皮再生 | 本研究创新性地利用细胞外囊泡作为载体，有效解决了Wnt蛋白亲水性差的问题，并成功验证了其在肺泡上皮细胞再生中的生物活性 | NA | 探索慢性阻塞性肺疾病(COPD)治疗的新方法 | Wnt3a细胞外囊泡在肺损伤后肺泡上皮再生中的作用 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 4154 | 2024-08-08 |
Clustering ensemble in scRNA-seq data analysis: Methods, applications and challenges
2023-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106939
PMID:37075602
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据分析中聚类集成方法的应用、挑战及未来方向 | 聚类集成方法能提高单细胞转录组数据分析的准确性和可靠性 | 不同聚类方法产生的结果存在差异，不稳定的分区会影响分析的准确性 | 总结聚类集成方法在单细胞转录组数据分析中的应用和挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类集成 | 转录组数据 | NA |
| 4155 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals XBP1-SLC38A2 axis as a metabolic regulator in cytotoxic T lymphocytes in multiple myeloma
2023-05-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216171
PMID:37054944
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，比较了多发性骨髓瘤患者与健康捐赠者骨髓和外周血中T细胞的基因表达谱，揭示了XBP1-SLC38A2轴在细胞毒性T淋巴细胞中的代谢调控作用。 | 首次揭示了XBP1通过直接结合SLC38A2的启动子来抑制其表达，从而影响T细胞的谷氨酰胺摄取和免疫功能。 | 研究样本仅包括10名新诊断的多发性骨髓瘤患者和3名健康捐赠者，样本量较小。 | 阐明多发性骨髓瘤中T淋巴细胞功能障碍和代谢重编程的机制。 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓和外周血中的T细胞。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10名多发性骨髓瘤患者和3名健康捐赠者 |
| 4156 | 2024-08-05 |
Single-Cell Spatial Analysis Identifies Regulators of Brain Tumor-Initiating Cells
2023-05-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3004
PMID:37067922
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析揭示了调节脑肿瘤发起细胞的机制 | 首次揭示了脑肿瘤微环境中不同解剖区域对肿瘤异质性调控的影响 | 研究主要基于小鼠模型，应用于人类具体情况需要进一步验证 | 探索脑肿瘤微环境如何影响脑胶质母细胞瘤的异质性 | 小鼠和人类的脑胶质母细胞瘤微环境 | 数字病理学 | 脑癌 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | 无 | 转录组数据 | 在小鼠模型中使用了特定的脑胶质母细胞瘤细胞系 |
| 4157 | 2024-08-08 |
Mesenchymal loss of p53 alters stem cell capacity and models human soft tissue sarcoma traits
2023-05-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.03.009
PMID:37059101
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研究论文 | 本研究探讨了p53在间充质干细胞中缺失对成人未分化软组织肉瘤（USTS）的影响 | 发现p53缺失导致间充质干细胞的干细胞特性改变，并模拟了人类软组织肉瘤的特征 | NA | 理解间充质干细胞介导的肿瘤发生，并为肉瘤研究提供有效的鼠模型 | 间充质干细胞中的p53缺失及其对软组织肉瘤的影响 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 4158 | 2024-08-08 |
Identifying a dynamic transcriptomic landscape of the cynomolgus macaque placenta during pregnancy at single-cell resolution
2023-05-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.03.012
PMID:37054708
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法，全面分析了食蟹猴胎盘在妊娠期间的动态转录组景观 | 首次展示了食蟹猴胎盘在整个妊娠期间的单细胞转录组全景，揭示了胎盘细胞在不同妊娠阶段的特异性差异及其分子机制 | NA | 深入理解灵长类胎盘在妊娠期间的细胞层次结构和分子机制，为支持健康妊娠结果提供基础 | 食蟹猴胎盘在妊娠期间的细胞和分子机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 4159 | 2024-08-08 |
Characterization of T-cell receptors and immunoglobulin heavy chains loci and identification of T/B cell clusters in teleost
2023-May, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2023.108746
PMID:37054766
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研究论文 | 本研究通过Iso-seq技术测序了大量完整的T细胞受体（TCR）和免疫球蛋白重链（IgH）转录本，并利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了血液白细胞中的T/B细胞簇，揭示了鲆鱼中TCR和IgH基因座的组织结构和表达模式 | 首次全面描述了鲆鱼中T细胞受体和免疫球蛋白重链基因座的基因组织结构，并通过单细胞RNA测序技术验证了这些基因在T/B细胞簇中的高表达 | NA | 旨在深入理解鲆鱼中T细胞受体和免疫球蛋白重链基因座的结构和功能，以及它们在T和B淋巴细胞进化和功能中的作用 | 鲆鱼中的T细胞受体（TCR）和免疫球蛋白重链（IgH）基因座及其在T/B细胞簇中的表达 | 数字病理学 | NA | Iso-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录本, 基因表达 | 大量完整的TCR和IgH转录本, 血液白细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 4160 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis revealed the immune profile of PD-1 blockade in gallbladder carcinoma liver metastasis
2023-05-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000131
PMID:37058121
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了PD-1阻断剂在胆囊癌肝转移中的免疫特征 | 发现PD-1治疗后CD8+T细胞的细胞毒性活性提高和骨髓细胞的促炎表型增强，以及SPP1+TAMs与不良预后相关 | NA | 探讨PD-1阻断剂在胆囊癌肝转移治疗中的免疫机制 | 胆囊癌肝转移患者的免疫细胞动态 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 19,648个高质量单细胞转录组数据 |