单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 4121 - 4140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4121 | 2024-08-08 |
Cortical glia in SOD1(G93A) mice are subtly affected by ALS-like pathology
2023-04-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-33608-y
PMID:37085528
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研究论文 | 本研究探讨了SOD1(G93A)小鼠模型皮质中胶质细胞在肌萎缩侧索硬化症（ALS）样病理中的变化 | 首次全面研究了SOD1(G93A)小鼠皮质中胶质细胞在疾病不同阶段的变化，并考虑了性别因素 | 研究结果表明SOD1(G93A)小鼠皮质未能完全再现人类ALS病理，建议使用其他模型进行进一步研究 | 研究胶质细胞在ALS样病理中的作用，特别是在大脑皮质中的变化 | SOD1(G93A)小鼠皮质中的星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞 | NA | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和免疫组织化学 | NA | 细胞 | 涉及四个疾病阶段的SOD1(G93A)小鼠皮质中的胶质细胞 |
| 4122 | 2024-08-08 |
Effect of distance measures on confidences of t-SNE embeddings and its implications on clustering for scRNA-seq data
2023-04-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-32966-x
PMID:37085593
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研究论文 | 本文研究了距离度量对t-SNE嵌入置信度的影响及其对scRNA-seq数据聚类的意义。 | 提出了一种使用随机森林回归算法和多种距离度量来预测t-SNE嵌入的样本基置信分数的方法，并利用这些置信分数改进聚类算法。 | NA | 旨在找到预测t-SNE嵌入置信分数的最佳方法，并利用这些置信分数提高聚类算法的性能。 | t-SNE嵌入的置信分数及其对scRNA-seq数据聚类的影响。 | 机器学习 | NA | t-分布随机邻域嵌入(t-SNE) | 随机森林回归(RF) | 单细胞RNA测序数据(scRNA-seq) | 未具体说明 |
| 4123 | 2024-08-08 |
A gene regulatory network inference model based on pseudo-siamese network
2023-Apr-21, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05253-9
PMID:37085776
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研究论文 | 本研究提出了一种基于伪孪生网络的基因调控网络（GRN）推断模型，称为伪孪生GRN（PSGRN），用于从时间序列表达数据集中推断大规模GRN | 本研究创新性地应用伪孪生网络和门控循环单元来捕捉转录因子（TF）及其目标矩阵的时间和空间特征，并通过sigmoid函数评估交互作用 | NA | 揭示生物系统中基因交互的潜在机制，并促进基因表达模式与表型特征之间关系的研究 | 基因调控网络（GRN）及其在生物生长发育中的作用 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 伪孪生网络 | 时间序列表达数据 | 包括基因表达水平和GRN的两个玉米子数据集 |
| 4124 | 2024-08-08 |
Publisher Correction: FIPRESCI: droplet microfluidics based combinatorial indexing for massive-scale 5'-end single-cell RNA sequencing
2023-Apr-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-02944-7
PMID:37085832
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4125 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic atlas of lung microvascular regeneration after targeted endothelial cell ablation
2023-04-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80900
PMID:37078698
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了在小鼠模型中选择性肺内皮细胞消融后肺微血管再生的机制 | 首次揭示了肺微血管再生过程中新出现的表达apelin的gCap内皮干细胞样细胞及其在肺微血管再生中的关键作用 | NA | 探究肺微血管再生在严重急性肺损伤模型中的机制 | 肺微血管再生及内皮细胞的再生过程 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用表达人白喉毒素受体的转基因小鼠进行实验，涉及多个时间点的细胞样本 |
| 4126 | 2024-08-08 |
Anti-PD-1 therapy achieves favorable outcomes in HBV-positive non-liver cancer
2023-Apr-20, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-023-00468-0
PMID:37080999
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研究论文 | 本研究评估了抗PD-1疗法在HBV阳性非肝癌患者中的疗效 | 发现抗PD-1疗法在HBV阳性非肝癌患者中取得了比HBV阴性患者更好的治疗效果，并识别出与更好临床结果相关的CX3CR1 T细胞亚群 | NA | 分析抗PD-1疗法在HBV阳性癌症患者中的疗效 | HBV阳性非肝癌患者 | NA | 非肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 外周血单个核细胞（PBMCs）来自食管鳞状细胞癌（ESCC）患者 |
| 4127 | 2024-08-08 |
Autophagy-prominent cell clusters among human lens epithelial cells: integrated single-cell RNA-sequencing analysis
2023-Apr-20, BMC ophthalmology
IF:1.7Q3
DOI:10.1186/s12886-023-02910-8
PMID:37081480
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探索了人晶状体上皮细胞中自噬显著的细胞簇的存在及其位置。 | 首次鉴定了人晶状体上皮细胞中自噬显著的细胞簇，并揭示了其在晶状体囊中央区的定位。 | NA | 探索人晶状体上皮细胞中自噬显著的细胞簇的存在。 | 人晶状体上皮细胞中的自噬显著细胞簇。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 18,120个细胞 |
| 4128 | 2024-08-08 |
Human pluripotent stem cells-derived inner ear organoids recapitulate otic development in vitro
2023-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.11.536448
PMID:37090562
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研究论文 | 本文通过比较人胚胎期的耳泡和由人诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的内耳类器官（IEOs），利用多重免疫染色和单细胞RNA测序技术，详细描述了IEOs在三个关键发育阶段的特征 | 首次直接比较了人胚胎期的耳泡和人iPSC衍生的IEOs，提供了独特的耳前区、上皮、神经母细胞和感觉上皮的特征 | NA | 旨在通过iPSC衍生的IEOs来补充和细化我们对人耳分化及发育缺陷的理解 | 人胚胎期的耳泡和人iPSC衍生的内耳类器官（IEOs） | 干细胞研究 | NA | 多重免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多个发育阶段的IEOs和人类胚胎样本 |
| 4129 | 2024-08-08 |
SigPrimedNet: A Signaling-Informed Neural Network for scRNA-seq Annotation of Known and Unknown Cell Types
2023-Apr-10, Biology
DOI:10.3390/biology12040579
PMID:37106779
|
研究论文 | 介绍了一种名为SigPrimedNet的神经网络方法，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型注释，特别是对已知和未知细胞类型的识别 | SigPrimedNet通过引入稀疏诱导的信号传导电路信息层进行高效训练，并通过监督学习进行特征表示学习，以及通过异常检测方法识别未知细胞类型 | NA | 开发一种能够有效注释已知细胞类型并识别未知细胞类型的新方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 多个公开可用的数据集 |
| 4130 | 2024-08-05 |
Integrating single-cell RNA sequencing with spatial transcriptomics reveals an immune landscape of human myometrium during labour
2023-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1234
PMID:37095651
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研究论文 | 该文章揭示了人类子宫肌层在分娩期间的免疫景观，并分析了炎症的特定细胞机制 | 综合了单细胞RNA测序与空间转录组学，首次全面描述了分娩期间子宫肌层中的免疫细胞及其转录特征 | 目前对人类分娩期间子宫肌层炎症的具体细胞机制尚不完全了解 | 研究人类分娩期间子宫肌层的免疫细胞变化及其与炎症的关系 | 分析分娩时和未分娩时的人类子宫肌层中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，时空转录组学 | NA | 转录组数据，细胞信号 | 人类分娩期间和非分娩期的子宫肌层样本 |
| 4131 | 2024-08-08 |
Tumor and immune remodeling following radiotherapy in human renal cell carcinoma
2023-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-006392
PMID:37080610
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研究论文 | 本研究探讨了放射治疗后人类肾细胞癌（RCC）肿瘤中免疫细胞的变化及其与癌细胞的相互作用 | 首次详细描述了放射治疗后RCC肿瘤中免疫细胞的蛋白质表达和转录变化，以及这些变化如何影响免疫细胞与癌细胞的相互作用 | 研究仅限于RCC患者，且样本量相对较小，可能限制了结果的普遍性 | 研究放射治疗如何重塑肾细胞癌患者的免疫细胞组成及其与癌细胞的相互作用 | 肾细胞癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq），光谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 34,626个细胞 |
| 4132 | 2024-08-05 |
Identification and Characterisation of Infiltrating Immune Cells in Malignant Pleural Mesothelioma Using Spatial Transcriptomics
2023-Mar-28, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps6020035
PMID:37104017
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研究论文 | 本文描述了一种使用空间转录组学技术映射和表征恶性胸膜间皮瘤中肿瘤浸润免疫细胞的方法 | 提出了基于Visium技术的空间转录组学协议，增强了肿瘤特异性免疫细胞基因特征的识别和空间分辨率 | 关于肿瘤微环境中免疫组成的了解仍然有限 | 探讨肿瘤微环境中的免疫细胞特征，以提高免疫检查点抑制剂的疗效与安全性 | 恶性胸膜间皮瘤中的浸润免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4133 | 2024-08-05 |
Recent revelations and future directions using single-cell technologies in chronic lymphocytic leukemia
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1143811
PMID:37091144
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综述 | 本文讨论了单细胞技术在慢性淋巴细胞白血病（CLL）研究中的应用及未来方向 | 提出了多种单细胞测序技术并探讨其在CLL发病和进展研究中的应用 | 文章中提到不同单细胞技术在样本准备和数据解读方面的局限性 | 研究单细胞技术如何改善我们对慢性淋巴细胞白血病的理解 | 慢性淋巴细胞白血病的肿瘤微环境中的白血病和非恶性细胞 | 数字病理学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序等 | NA | 基因组数据 | NA |
| 4134 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell RNA-seq analysis reveals the vital cell types and dynamic development signature of atherosclerosis
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1118239
PMID:37089432
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研究论文 | 这项研究深入分析了健康和动脉粥样硬化动脉中的单细胞RNA-seq数据 | 本研究揭示了成纤维细胞在动脉粥样硬化中调节疾病过程的新机制 | 尚未提及具体的样本来源和其他细胞类型的作用 | 探讨动脉粥样硬化中的细胞类型及其动态发展特征 | 18个健康和动脉粥样硬化动脉样本 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 18个样本 |
| 4135 | 2024-08-05 |
A senescence-based prognostic gene signature for colorectal cancer and identification of the role of SPP1-positive macrophages in tumor senescence
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1175490
PMID:37090726
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研究论文 | 本研究构建了一种与衰老相关的结直肠癌预后模型，并探讨了SPP1阳性巨噬细胞在肿瘤衰老中的作用 | 提出了一种基于衰老相关基因的新模型，可以识别预后较差的结直肠癌患者及具有免疫抑制性肿瘤微环境 | 顺势而为的临床数据和样本的多样性可能限制了结果的推广性 | 旨在构建一个与衰老相关的结直肠癌预后模型并研究肿瘤微环境中的衰老影响 | 结直肠癌患者的转录组和临床数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组测序 | LASSO模型 | 转录组数据、临床数据 | NA |
| 4136 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis for cancer and biology of the pancreas: A review on recent progress
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1029758
PMID:37091793
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综述 | 本文回顾了单细胞转录组分析在胰腺生物学和癌症研究中的最新进展 | 文章探讨了单细胞RNA测序技术在胰腺生理和病理中的最新发现，揭示了细胞异质性和癌症组织中的新免疫靶点及分子机制 | 未提及具体的限制 | 旨在阐明单细胞分析如何推动胰腺生物学的未来研究 | 研究对象包括胰腺的健康细胞类型及癌组织 | 数字病理 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 4137 | 2024-08-05 |
An integrated bioinformatic analysis of bulk and single-cell sequencing clarifies immune microenvironment and metabolic profiles of lung adenocarcinoma to predict immunotherapy efficacy
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1163314
PMID:37091977
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和大样本测序分析肺腺癌的免疫微环境和代谢特征，以预测免疫疗法的疗效 | 提出了一种新的方法，通过单细胞与大样本测序结合，揭示了肺腺癌的免疫微环境和代谢特征 | 研究只集中在单一类型的肺腺癌，可能无法推广到其他癌症类型 | 探索免疫微环境如何影响肺腺癌免疫疗法的疗效 | 以肺腺癌的单细胞数据和TCGA大样本数据为研究对象 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序和大样本测序 | NA | 基因组数据 | 使用TCGA大样本数据和GSE131907单细胞数据 |
| 4138 | 2024-08-05 |
RNA-seq and Single-Cell Transcriptome Analyses of TRAIL Receptors Gene Expression in Human Osteosarcoma Cells and Tissues
2023, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351231161478
PMID:37101729
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研究论文 | 本研究探讨了人类骨肉瘤细胞中TRAIL受体基因表达的特征. | 本研究提供了TRAIL受体在骨肉瘤中的表达谱，为治疗新策略提供了新视角. | 研究仍未明确TRAIL受体的具体作用机制. | 研究骨肉瘤中TRAIL受体的表达以探索新的治疗靶点. | 主要研究人类骨肉瘤细胞和组织中的TRAIL受体. | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq和单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了人类骨肉瘤细胞和组织的样本 |
| 4139 | 2024-08-05 |
MulCNN: An efficient and accurate deep learning method based on gene embedding for cell type identification in single-cell RNA-seq data
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1179859
PMID:37082202
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研究论文 | 本研究提出了一种新型的多级卷积神经网络MulCNN，旨在通过基因嵌入方法在单细胞RNA测序数据中识别细胞类型 | MulCNN利用细胞类型特异的基因表达特征提取方法，并通过多尺度卷积来提取关键特征，过滤噪声 | NA | 研究单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别问题 | 使用各种物种的数据集进行细胞类型识别 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | 多级卷积神经网络 (MulCNN) | 单细胞RNA数据 | 多物种的数据集 |
| 4140 | 2024-08-05 |
Post-ischemic inflammatory response in the brain: Targeting immune cell in ischemic stroke therapy
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1076016
PMID:37078089
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研究论文 | 这篇文章探讨了缺血性中风后大脑的炎症反应和免疫细胞的作用 | 文章创新性地运用了单细胞测序技术来探讨缺血性中风中的细胞异质性和基因表达差异 | 该研究的局限性在于未提供具体的实验数据和样本规模 | 研究缺血性中风中大脑细胞的变化及其炎症反应 | 研究对象包括神经元、免疫细胞、胶质细胞和内皮细胞等 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | NA |