单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5352 篇文献，本页显示第 4101 - 4120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4101 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of the aged ovarian immune system reveals a shift towards adaptive immunity and attenuated cell function
2023-04-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.74915
PMID:37096871
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和流式细胞术，全面描述了小鼠卵巢免疫系统，并揭示了随着年龄增长，免疫细胞组成向适应性免疫转变的现象 | 首次全面描述了小鼠卵巢免疫系统，并揭示了女性衰老过程中卵巢免疫系统的变化 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探究女性衰老对卵巢免疫系统的影响 | 小鼠卵巢免疫系统 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 4102 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of NEUROG3+ cells during pancreatic endocrine differentiation with small molecules
2023-04-25, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03338-z
PMID:37098639
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了使用小分子化合物促进人胚胎干细胞向NEUROG3+胰腺内分泌细胞分化的方法 | 本研究采用DAPT联合四种因子（4FS）的方法，显著提高了NEUROG3的表达，并促进了胰腺内分泌细胞和肠嗜铬样细胞的分化 | NA | 提高人胚胎干细胞向胰腺内分泌细胞分化的效率，为糖尿病的干细胞治疗提供新策略 | 人胚胎干细胞及其向胰腺内分泌细胞的分化过程 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 4103 | 2024-08-05 |
ALS is imprinted in the chromatin accessibility of blood cells
2023-Apr-24, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04769-w
PMID:37095391
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研究论文 | 本研究识别了与肌萎缩侧索硬化症（ALS）相关的表观遗传特征，通过分析ALS患者血细胞的染色质可及性来进行。 | 本研究首次通过染色质可及性分析识别出一种与ALS相关的表观遗传特征，显示出表观遗传调控与疾病发病机制之间的关系。 | 研究主要集中在血细胞中，未探讨其他受影响组织中的表观遗传特征，可能会限制对疾病的全面理解。 | 旨在揭示和识别与肌萎缩侧索硬化症相关的表观遗传特征。 | 对肌萎缩侧索硬化症患者的血细胞进行研究。 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | ATAC-seq 和 RNA-seq 的结合与单细胞测序 | NA | 细胞样本数据 | 来自ALS患者的外周血单核细胞（PBMCs）和运动皮层的样本 |
| 4104 | 2024-08-08 |
Classification of triple-negative breast cancer based on pathway enrichment levels
2023-Apr-24, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-023-02021-w
PMID:37093316
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研究论文 | 本文基于免疫、间质、致癌和代谢途径的富集水平，对三阴性乳腺癌（TNBC）进行了分类 | 首次通过无监督聚类方法，根据14条相关途径的富集水平对TNBC进行分类，并识别出四种亚型 | NA | 对三阴性乳腺癌进行分类，以深入理解肿瘤生物学和临床意义 | 三阴性乳腺癌（TNBC）及其亚型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 无监督聚类 | 转录组数据 | 三个批量肿瘤转录组数据集和一个单细胞RNA测序数据集 |
| 4105 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis profiles the expression features of TMEM173 in BM cells of high-risk B-cell acute lymphoblastic leukemia
2023-Apr-24, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-10830-5
PMID:37095455
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了高风险B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）患者骨髓（BM）细胞中TMEM173的表达特征 | 首次详细描述了TMEM173在高风险B-ALL患者骨髓细胞中的转录组特征，并探讨了其在不同细胞类型中的表达模式 | NA | 探究TMEM173在B细胞急性淋巴细胞白血病中的转录组特征，为癌症免疫治疗提供新策略 | TMEM173在B-ALL患者骨髓细胞中的表达特征 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及2名B-ALL患者的骨髓细胞 |
| 4106 | 2024-08-08 |
An integrative analysis of the single-cell transcriptome identifies DUSP4 as an exhaustion-associated gene in tumor-infiltrating CD8+ T cells
2023-04-22, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01056-6
PMID:37086337
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4107 | 2024-08-08 |
Novel insight into the underlying dysregulation mechanisms of immune cell-to-cell communication by analyzing multitissue single-cell atlas of two COVID-19 patients
2023-04-22, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05814-z
PMID:37087411
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研究论文 | 本研究通过分析两名COVID-19患者的肺、血液和骨髓的单细胞转录组图谱，探讨了SARS-CoV-2感染引起的细胞间通信失调机制 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染导致肺部微环境紊乱和炎症风暴的细胞通信失调机制 | 研究样本仅为两名死亡的COVID-19患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨SARS-CoV-2感染如何引起肺部微环境紊乱和炎症风暴的机制 | COVID-19患者的肺、血液和骨髓中的单细胞转录组 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 两名COVID-19患者 |
| 4108 | 2024-08-05 |
Size matters: the impact of nucleus size on results from spatial transcriptomics
2023-04-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04129-z
PMID:37081484
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研究论文 | 该文章探讨了细胞核大小对空间转录组学实验结果的影响 | 文章提出了连续切片数据整合（CSDI）方法，提升了空间转录组学的准确性 | 该研究可能对特定类型的组织切片有局限性，未探讨不同组织的广泛适用性 | 研究空间转录组学中细胞核尺寸对结果影响的机制 | 人类死后脑组织的连续切片 | 数字病理学 | NA | 空间基因表达（ST） | NA | RNA-seq数据 | 人类死后大脑连续切片 |
| 4109 | 2024-08-05 |
Consequences and opportunities arising due to sparser single-cell RNA-seq datasets
2023-04-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-02933-w
PMID:37085823
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研究论文 | 本文探讨了稀疏单细胞RNA测序数据集的后续分析结果 | 提出了二进制基因表达分析与计数分析得到类似的结果，并能够处理更多细胞 | 未提及具体的局限性 | 研究稀疏单细胞RNA测序数据集在下游分析中的应用 | 单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 最多可分析约50倍更多细胞 |
| 4110 | 2024-08-05 |
Contribution of LRP1 in Human Congenital Heart Disease Correlates with Its Roles in the Outflow Tract and Atrioventricular Cushion Development
2023-04-21, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14040947
PMID:37107705
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研究论文 | 文章探讨了LRP1在先天性心脏病中的作用，及其与心脏发育的关系 | 通过整合人类和小鼠心脏的单细胞RNA测序和空间转录组数据，揭示了LRP1在心脏发育中的主要表达区域 | 研究主要基于过往的数据分析，对实验验证的依赖性不明确 | 更好地理解先天性心脏病的原因以及LRP1基因的影响 | 1922例先天性心脏病患者与2602个对照的基因组数据 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 全外显子组测序 | NA | 基因组数据 | 1922例先天性心脏病患者与2602个对照 |
| 4111 | 2024-08-08 |
Immune cell dynamics deconvoluted by single-cell RNA sequencing in normothermic machine perfusion of the liver
2023-04-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37674-8
PMID:37085477
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了肝脏在常温机械灌注过程中的免疫细胞动态变化 | 首次全面描述了肝脏常温机械灌注过程中免疫细胞亚群、细胞迁移和细胞因子释放的特征 | NA | 旨在全面表征肝脏常温机械灌注过程中免疫细胞（亚）群、细胞迁移和细胞因子释放 | 人供体肝脏在常温机械灌注前、中、后的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 多个供体肝脏样本 |
| 4112 | 2024-08-08 |
Cortical glia in SOD1(G93A) mice are subtly affected by ALS-like pathology
2023-04-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-33608-y
PMID:37085528
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研究论文 | 本研究探讨了SOD1(G93A)小鼠模型皮质中胶质细胞在肌萎缩侧索硬化症（ALS）样病理中的变化 | 首次全面研究了SOD1(G93A)小鼠皮质中胶质细胞在疾病不同阶段的变化，并考虑了性别因素 | 研究结果表明SOD1(G93A)小鼠皮质未能完全再现人类ALS病理，建议使用其他模型进行进一步研究 | 研究胶质细胞在ALS样病理中的作用，特别是在大脑皮质中的变化 | SOD1(G93A)小鼠皮质中的星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞 | NA | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和免疫组织化学 | NA | 细胞 | 涉及四个疾病阶段的SOD1(G93A)小鼠皮质中的胶质细胞 |
| 4113 | 2024-08-08 |
Effect of distance measures on confidences of t-SNE embeddings and its implications on clustering for scRNA-seq data
2023-04-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-32966-x
PMID:37085593
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研究论文 | 本文研究了距离度量对t-SNE嵌入置信度的影响及其对scRNA-seq数据聚类的意义。 | 提出了一种使用随机森林回归算法和多种距离度量来预测t-SNE嵌入的样本基置信分数的方法，并利用这些置信分数改进聚类算法。 | NA | 旨在找到预测t-SNE嵌入置信分数的最佳方法，并利用这些置信分数提高聚类算法的性能。 | t-SNE嵌入的置信分数及其对scRNA-seq数据聚类的影响。 | 机器学习 | NA | t-分布随机邻域嵌入(t-SNE) | 随机森林回归(RF) | 单细胞RNA测序数据(scRNA-seq) | 未具体说明 |
| 4114 | 2024-08-08 |
A gene regulatory network inference model based on pseudo-siamese network
2023-Apr-21, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05253-9
PMID:37085776
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研究论文 | 本研究提出了一种基于伪孪生网络的基因调控网络（GRN）推断模型，称为伪孪生GRN（PSGRN），用于从时间序列表达数据集中推断大规模GRN | 本研究创新性地应用伪孪生网络和门控循环单元来捕捉转录因子（TF）及其目标矩阵的时间和空间特征，并通过sigmoid函数评估交互作用 | NA | 揭示生物系统中基因交互的潜在机制，并促进基因表达模式与表型特征之间关系的研究 | 基因调控网络（GRN）及其在生物生长发育中的作用 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 伪孪生网络 | 时间序列表达数据 | 包括基因表达水平和GRN的两个玉米子数据集 |
| 4115 | 2024-08-08 |
Publisher Correction: FIPRESCI: droplet microfluidics based combinatorial indexing for massive-scale 5'-end single-cell RNA sequencing
2023-Apr-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-02944-7
PMID:37085832
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4116 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic atlas of lung microvascular regeneration after targeted endothelial cell ablation
2023-04-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80900
PMID:37078698
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了在小鼠模型中选择性肺内皮细胞消融后肺微血管再生的机制 | 首次揭示了肺微血管再生过程中新出现的表达apelin的gCap内皮干细胞样细胞及其在肺微血管再生中的关键作用 | NA | 探究肺微血管再生在严重急性肺损伤模型中的机制 | 肺微血管再生及内皮细胞的再生过程 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用表达人白喉毒素受体的转基因小鼠进行实验，涉及多个时间点的细胞样本 |
| 4117 | 2024-08-08 |
Anti-PD-1 therapy achieves favorable outcomes in HBV-positive non-liver cancer
2023-Apr-20, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-023-00468-0
PMID:37080999
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研究论文 | 本研究评估了抗PD-1疗法在HBV阳性非肝癌患者中的疗效 | 发现抗PD-1疗法在HBV阳性非肝癌患者中取得了比HBV阴性患者更好的治疗效果，并识别出与更好临床结果相关的CX3CR1 T细胞亚群 | NA | 分析抗PD-1疗法在HBV阳性癌症患者中的疗效 | HBV阳性非肝癌患者 | NA | 非肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 外周血单个核细胞（PBMCs）来自食管鳞状细胞癌（ESCC）患者 |
| 4118 | 2024-08-08 |
Autophagy-prominent cell clusters among human lens epithelial cells: integrated single-cell RNA-sequencing analysis
2023-Apr-20, BMC ophthalmology
IF:1.7Q3
DOI:10.1186/s12886-023-02910-8
PMID:37081480
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探索了人晶状体上皮细胞中自噬显著的细胞簇的存在及其位置。 | 首次鉴定了人晶状体上皮细胞中自噬显著的细胞簇，并揭示了其在晶状体囊中央区的定位。 | NA | 探索人晶状体上皮细胞中自噬显著的细胞簇的存在。 | 人晶状体上皮细胞中的自噬显著细胞簇。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 18,120个细胞 |
| 4119 | 2024-08-08 |
Human pluripotent stem cells-derived inner ear organoids recapitulate otic development in vitro
2023-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.11.536448
PMID:37090562
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研究论文 | 本文通过比较人胚胎期的耳泡和由人诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的内耳类器官（IEOs），利用多重免疫染色和单细胞RNA测序技术，详细描述了IEOs在三个关键发育阶段的特征 | 首次直接比较了人胚胎期的耳泡和人iPSC衍生的IEOs，提供了独特的耳前区、上皮、神经母细胞和感觉上皮的特征 | NA | 旨在通过iPSC衍生的IEOs来补充和细化我们对人耳分化及发育缺陷的理解 | 人胚胎期的耳泡和人iPSC衍生的内耳类器官（IEOs） | 干细胞研究 | NA | 多重免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多个发育阶段的IEOs和人类胚胎样本 |
| 4120 | 2024-08-08 |
SigPrimedNet: A Signaling-Informed Neural Network for scRNA-seq Annotation of Known and Unknown Cell Types
2023-Apr-10, Biology
DOI:10.3390/biology12040579
PMID:37106779
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研究论文 | 介绍了一种名为SigPrimedNet的神经网络方法，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型注释，特别是对已知和未知细胞类型的识别 | SigPrimedNet通过引入稀疏诱导的信号传导电路信息层进行高效训练，并通过监督学习进行特征表示学习，以及通过异常检测方法识别未知细胞类型 | NA | 开发一种能够有效注释已知细胞类型并识别未知细胞类型的新方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 多个公开可用的数据集 |