单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 4081 - 4100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4081 | 2024-08-08 |
Single cell landscape of parietal epithelial cells in healthy and diseased states
2023-07, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.03.036
PMID:37100348
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了壁上皮细胞在健康和疾病状态下的分子特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了壁上皮细胞的亚群及其在新月体形成中的作用 | NA | 探讨壁上皮细胞的生物学多样性及其在足细胞再生和新月体形成中的作用 | 壁上皮细胞及其亚群 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 4082 | 2024-08-05 |
Deficiency in the omega-3 lysolipid transporter Mfsd2a leads to aberrant oligodendrocyte lineage development and hypomyelination
2023-06-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI164118
PMID:37104036
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研究论文 | 该文章探讨了Mfsd2a在少突胶质细胞发育和髓鞘形成中的重要性 | 首次证明Mfsd2a在少突胶质细胞前体细胞的特异性表达及其在髓鞘形成中的关键作用 | 研究未发现Mfsd2a缺失与小头畸形直接相关 | 研究Mfsd2a对少突胶质细胞发育及髓鞘形成的作用 | 使用Mfsd2a-KO小鼠模型和单细胞测序技术研究少突胶质细胞谱系 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq，脂质组学分析 | NA | NA | 使用2aOKO小鼠模型进行实验 |
| 4083 | 2024-08-05 |
IRF7 and UNC93B1 variants in an infant with recurrent herpes simplex virus infection
2023-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI154016
PMID:37097753
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研究论文 | 这篇文章描述了一名婴儿反复感染单纯疱疹病毒（HSV）的病例及其相关基因变异。 | 本文首次揭示了IRF7和UNC93B1基因变异与新生儿单纯疱疹病毒感染的关系 | 本研究集中于单个病例，样本量较小，限制了结果的普遍性 | 研究新生儿对于单纯疱疹病毒感染的遗传易感性 | 一名新生儿，呈现反复单纯疱疹病毒感染的症状 | 数字病理学 | 单纯疱疹病毒感染 | 外显子组测序 | NA | RNA-Seq | 1名婴儿 |
| 4084 | 2024-08-05 |
The journey from melanocytes to melanoma
2023-06, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-023-00565-7
PMID:37095242
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研究论文 | 本文讨论了黑素细胞从神经嵴到完全成熟的色素黑素细胞的转变过程。 | 提出了黑素细胞生物学的新理解，以及不同黑素细胞亚群和微环境对黑素瘤发生和进展的独特见解。 | 尽管进展显著，但黑素瘤的起源细胞依然存在激烈争论。 | 探索和理解黑素细胞的发育及其在黑素瘤形成中的作用。 | 研究黑素细胞的异质性和转录弹性，以及它们的不同亚群和微环境。 | 数字病理学 | 黑素瘤 | 高通量单细胞测序 | 动物模型 | NA | NA |
| 4085 | 2024-08-05 |
The MIR34B/C genomic region contains multiple potential regulators of multiciliogenesis
2023-06, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.14630
PMID:37102425
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研究论文 | 本研究探讨了MIR34B/C基因组区域中多个潜在的多纤毛生成调控因子。 | 首次揭示了MIR34B/C基因组区域中BTG4、LAYN和HOATZ与多纤毛生成的关系。 | 研究可能仅限于特定的生物模型，如人类、小鼠和猪，未涵盖其他物种。 | 研究MIR34B/C区域中的调节因子对多纤毛生成的影响。 | 研究涉及的对象包括BTG4、LAYN和HOATZ等基因及其蛋白质表达情况。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和超分辨率显微镜 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4086 | 2024-08-05 |
Identification of a single cell-based signature for predicting prognosis risk and immunotherapy response in patients with glioblastoma
2023-06, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109345
PMID:37100336
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研究论文 | 本研究构建了一种基于单细胞和散装测序样本的新基因对特征，以预测胶质母细胞瘤患者的预后风险和免疫疗效 | 提出了一种新的基因对特征，能够有效区分不同的恶性生物学特征并预测预后 | 研究样本主要来自单一医院，可能影响结果的广泛性 | 研究旨在构建有效的基因对特征以预测胶质母细胞瘤的预后和免疫治疗反应 | 研究对象为来自湘雅医院的胶质瘤样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序和散装测序 | 算法模型 | 基因表达数据 | 来自湘雅医院的胶质瘤样本 |
| 4087 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptional profiles of monocytes in HBV-infected pregnant women during mid-pregnancy
2023-06, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17746
PMID:37078407
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了HBV感染的孕妇中期妊娠期间单核细胞的转录组特征 | 首次系统地阐明了HBV感染孕妇中单核细胞的固有免疫特征，并识别了单核细胞亚群中的分子驱动因子 | 研究样本量较小，仅包括三名健康孕妇和三名HBV感染孕妇 | 探讨HBV感染孕妇中期妊娠期间单核细胞的免疫反应特征 | HBV感染孕妇和健康孕妇的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三名健康孕妇和三名HBV感染孕妇 |
| 4088 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the developmental program underlying proximal-distal patterning of the human lung at the embryonic stage
2023-06, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-023-00802-6
PMID:37085732
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了人类胚胎期肺部近端-远端模式化的发育程序 | 发现了新的转录调控因子（如THRB、EGR3、ETV1和SOX6）以及早期胚胎的BDNF群体，这些发现加深了对人类肺发育中上皮近端-远端模式化的理解 | NA | 探索人类胚胎期肺部发育的近端-远端模式化的调控机制 | 人类胚胎期肺部的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 169,686个细胞 |
| 4089 | 2024-08-08 |
Identification of an EMT-related gene-based prognostic signature in osteosarcoma
2023-06, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.5942
PMID:37102261
|
研究论文 | 本研究构建了一个与上皮-间质转化（EMT）相关的基因签名，用于预测骨肉瘤（OS）的预后 | 提出了一个新的EMT相关基因签名，包括CDK3、MYC、UHRF2、STC2、COL5A2、MMD和EHMT2，用于骨肉瘤的预后预测 | NA | 构建一个与EMT相关的基因签名，用于骨肉瘤的预后预测 | 骨肉瘤患者 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单变量Cox回归分析、LASSO回归分析、逐步多元Cox回归分析、Kaplan-Meier分析、时间依赖性接收器操作特征（ROC）分析、GSVA、ssGSEA、ESTIMATE算法、scRNA-seq | NA | 转录组数据、生存数据 | 来自Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Treatments（TARGET）和Gene Expression Omnibus（GEO）的骨肉瘤患者数据 |
| 4090 | 2024-08-08 |
Associations between brain gene expression perturbations implicated by COVID-19 and psychiatric disorders
2023-06, Journal of psychiatric research
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.jpsychires.2023.03.033
PMID:37105022
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研究论文 | 本研究通过整合COVID-19脑组织单细胞RNA测序数据和精神疾病的全基因组关联研究总结统计数据，进行元分析，探讨COVID-19引起的脑部变化与精神疾病遗传易感性之间的关联 | 首次揭示了COVID-19引起的脑部基因表达扰动与精神分裂症之间的显著关联 | NA | 探讨COVID-19引起的脑部变化与精神疾病遗传易感性之间的关联 | COVID-19脑组织和精神疾病 | 神经科学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4091 | 2024-08-08 |
MLSpatial: A machine-learning method to reconstruct the spatial distribution of cells from scRNA-seq by extracting spatial features
2023-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106873
PMID:37105115
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MLSpatial的新型计算方法，该方法通过学习基因表达模式与细胞空间位置之间的关系，基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据预测细胞间距离分布，从而重建细胞的空间分布。 | MLSpatial方法创新地利用scRNA-seq数据重建细胞的空间分布，这在癌症免疫治疗等需要细胞空间信息的场景中尤为重要。 | MLSpatial的性能依赖于细胞类型，且需要scRNA-seq数据与FISH数据具有相似的背景条件。 | 开发一种能够从scRNA-seq数据中重建细胞空间分布的计算方法。 | 研究对象包括果蝇胚胎和骨肉瘤细胞的scRNA-seq数据。 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 果蝇胚胎数据包含3039个细胞的FISH数据和1297个高质量细胞的scRNA-seq数据；骨肉瘤数据包含645个细胞的MERFISH数据。 |
| 4092 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the transcriptomic landscape of kidneys in patients with ischemic acute kidney injury
2023-May-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002679
PMID:37083129
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了缺血性急性肾损伤患者的肾脏转录组图谱 | 发现了在缺血性急性肾损伤中上调的新型促凋亡基因，并揭示了细胞特异性的转录组图谱和改变的信号通路 | NA | 通过单细胞RNA测序技术定义缺血性急性肾损伤患者的转录组图谱 | 缺血性急性肾损伤患者的肾脏 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个缺血性急性肾损伤患者的肾脏样本及三个公共单细胞RNA测序数据集作为对照 |
| 4093 | 2024-08-05 |
Graph deep learning enabled spatial domains identification for spatial transcriptomics
2023-05-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad146
PMID:37080761
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研究论文 | 本文构建了一种基于图深度学习的空间聚类方法，以进行空间转录组学的空间域识别 | 提出了一种新的基于图深度学习的空间聚类方法，利用残差门控图卷积神经网络和贝叶斯高斯混合模型 | NA | 旨在提高空间转录组学中空间域的识别精度 | 关注于基因表达谱和空间位置的数据 | 数字病理学 | NA | 图深度学习 | 残差门控图卷积神经网络 | 基因表达数据 | 多个空间转录组学数据集 |
| 4094 | 2024-08-05 |
Dimensionality reduction and visualization of single-cell RNA-seq data with an improved deep variational autoencoder
2023-05-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad152
PMID:37088976
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研究论文 | 本研究提出了一种改进的变分自编码器模型DREAM，用于单细胞RNA测序数据的降维和可视化分析 | DREAM模型结合了变分自编码器和高斯混合模型，并通过引入零膨胀层显式解决'缺失'事件 | 研究主要集中在模型的降维与可视化，未深入探讨其他潜在应用 | 研究旨在提高单细胞RNA测序数据的降维与可视化能力 | 主要研究对象为单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 变分自编码器 | 数据集 | 九个单细胞RNA测序数据集 |
| 4095 | 2024-08-08 |
Benchmarking of analytical combinations for COVID-19 outcome prediction using single-cell RNA sequencing data
2023-05-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad159
PMID:37096588
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研究论文 | 本研究评估了分析选择对使用五个scRNA-seq COVID-19数据集进行患者预后预测模型质量的影响 | 研究强调了集成学习的优势，不同学习方法之间的一致性以及在使用多个数据集作为模型输入时对数据集标准化的稳健性 | NA | 评估分析选择对患者预后预测模型质量的影响 | 使用单细胞RNA测序数据的COVID-19患者预后预测模型 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 集成学习方法，经典机器学习到现代深度学习方法 | 单细胞RNA测序数据 | 五个scRNA-seq COVID-19数据集 |
| 4096 | 2024-08-05 |
Organoids from mouse molar and incisor as new tools to study tooth-specific biology and development
2023-05-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.03.011
PMID:37084723
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研究论文 | 本研究建立了来源于小鼠磨牙和切牙的牙齿类器官模型，用于研究牙齿特异性生物学和发育 | 首次从小鼠牙齿中开发牙齿类器官，展示了其长期扩展能力和特异性表型特征 | 研究中未提及大样本或多样本间的比较，更广泛的种类和临床相关性尚未探讨 | 研究小鼠牙齿特异性生物学和发育的新工具 | 小鼠早期后出生的磨牙和切牙 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞模型及其衍生的转录组数据 | NA |
| 4097 | 2024-08-08 |
[Single-cell transcriptome analysis reveals development atlas of mouse molar pulp cells]
2023-May-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序技术分析小鼠磨牙发育过程中的牙髓细胞，构建时空发育图谱，揭示牙齿发育的过程和调控机制 | 利用单细胞RNA测序技术全面发现转录组水平的细胞间异质性，为研究器官发育过程和调控机制提供了有力工具 | NA | 构建小鼠磨牙牙髓细胞的时空发育图谱，揭示牙齿发育的发育过程和调控机制 | 小鼠磨牙的牙髓细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从C57BL/6小鼠的出生后第0天和第3天的下颌第一磨牙中分别获取了10个样本 |
| 4098 | 2024-08-08 |
AAV-mediated gene augmentation therapy of CRB1 patient-derived retinal organoids restores the histological and transcriptional retinal phenotype
2023-05-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.03.014
PMID:37084726
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研究论文 | 本研究通过AAV介导的基因增强疗法，对来自CRB1患者的视网膜类器官进行治疗，恢复了其组织学和转录组学上的视网膜表型 | 首次展示了AAV.hCRB1或AAV.hCRB2治疗改善CRB1患者来源视网膜类器官表型的概念验证 | NA | 探索CRB1基因突变导致的遗传性视网膜病变的治疗方法 | CRB1患者来源的视网膜类器官 | NA | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织学和转录组学数据 | CRB1患者来源的视网膜类器官与同源对照 |
| 4099 | 2024-08-05 |
[Tumor cell-based glycolytic metabolism and single-cell sequencing of urinary exfoliated cells for the diagnosis and molecular profiling of urothelial carcinoma]
2023-May-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
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研究论文 | 探讨HK2测试和单细胞测序在尿路上皮癌（UC）诊断中的价值 | 提供了一种新的可靠方法，结合HK2测试和细胞学来提高UC早期诊断的敏感性 | 样本量较小，仅限于265名怀疑UC患者或术后患者 | 研究HK2测试和单细胞测序在尿路上皮癌的诊断价值 | 265名来自中国医学科学院肿瘤医院的怀疑UC患者或术后患者的尿液标本 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 单细胞测序，HK2检测 | NA | 尿液样本 | 265名疑似尿路上皮癌患者的尿液样本 |
| 4100 | 2024-08-05 |
Clonally resolved single-cell multi-omics identifies routes of cellular differentiation in acute myeloid leukemia
2023-05-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.04.001
PMID:37098346
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研究论文 | 本文介绍了一种新方法CloneTracer，能够为急性髓系白血病（AML）中的单细胞RNA测序数据增加克隆分辨率 | CloneTracer提供了对AML患者样本的克隆解析，揭示了白血病细胞分化的路径，并识别出了特异性调节的表面标记 | 虽然研究揭示了LSC的活跃程度和特征，但仍存在健康和前白血病细胞在休眠干细胞部分占主导地位的限制 | 揭示急性髓系白血病（AML）中细胞分化的路线 | 19名AML患者的样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 19个AML患者的样本 |