单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5352 篇文献，本页显示第 4061 - 4080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4061 | 2024-08-08 |
Histone acetylation gene-based biomarkers as novel markers of the immune microenvironment in glioblastoma
2023-10, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3511
PMID:37097165
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研究论文 | 本文研究了组蛋白乙酰化基因作为胶质母细胞瘤免疫微环境新标记物的潜力 | 首次系统研究了组蛋白乙酰化在胶质母细胞瘤中的作用，并构建了基于组蛋白乙酰化的预后模型 | NA | 探讨组蛋白乙酰化基因在胶质母细胞瘤免疫微环境中的作用及其作为预后标记物的潜力 | 胶质母细胞瘤患者的全转录组测序数据和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | LASSO分析 | 基因表达数据 | 多个胶质母细胞瘤患者的样本 |
| 4062 | 2024-08-08 |
Exploring the Nonlymphocytic Cutaneous Microenvironment in Advanced Cutaneous T-Cell Lymphomas using Single-Cell RNA Sequencing
2023-10, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.07.037
PMID:37100194
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4063 | 2024-08-08 |
Transcriptome and single-cell sequencing analysis in tumor microenvironment
2023-10, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3520
PMID:37102577
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4064 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing Informs That Mesenchymal Stem Cell Alleviates Renal Injury Through Regulating Kidney Regional Immunity in Lupus Nephritis
2023-08, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2023.0047
PMID:37082951
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序系统地调查了间充质干细胞在系统性红斑狼疮性肾炎中的作用 | 首次系统性研究了间充质干细胞对肾脏区域免疫细胞的影响 | 过滤的细胞类型和机制仍需进一步探索 | 探讨间充质干细胞在狼疮性肾炎中的作用机制 | 狼疮性肾炎中的免疫细胞 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 4065 | 2024-08-05 |
Single-cell multi-omics sequencing and its application in tumor heterogeneity
2023-07-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad009
PMID:37078714
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review | 本文综述了单细胞多组学测序的最新进展及其在肿瘤异质性分析中的应用 | 文章的创新点在于总结了单细胞多组学测序中的代表性技术及其在复杂疾病鉴定中的应用 | 文章未详细描述单细胞多组学测序在不同类型肿瘤中的具体应用限制 | 调研单细胞多组学测序在精准医疗中的潜力和进展 | 肿瘤及其他复杂疾病 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序技术 | NA | 基因组学、转录组学、表观基因组学和蛋白组学数据 | NA |
| 4066 | 2024-08-05 |
Allogeneic chimeric antigen receptor-T cells with CRISPR-disrupted programmed death-1 checkpoint exhibit enhanced functional fitness
2023-07, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2023.03.011
PMID:37086241
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研究论文 | 该研究探讨了通过CRISPR技术破坏PD-1检查点的异体CAR-T细胞的功能增强 | 研究展示了通过基因组编辑技术增强CAR-T细胞的功能适应性，首次将PD-1敲除与CAR-T细胞治疗结合 | 研究未涉及长期疗效及人类临床试验的数据 | 探讨基因组PD-1检查点破坏对异体CAR-T细胞治疗B淋巴瘤的影响 | 研究对象为通过CRISPR基因编辑技术改造的异体人类T细胞 | 数字病理学 | B细胞恶性肿瘤 | CRISPR技术 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 |
| 4067 | 2024-08-08 |
Quantifying Cell-Type-Specific Differences of Single-Cell Datasets Using Uniform Manifold Approximation and Projection for Dimension Reduction and Shapley Additive exPlanations
2023-07, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0366
PMID:37093052
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研究论文 | 本研究提出了一种计算流程，用于量化单细胞数据集中特定细胞类型的差异，并识别导致这些差异的基因 | 使用低维均匀流形近似和投影进行维度降低空间作为高维空间差异的代理，并利用SHapley加性解释量化驱动差异的基因 | NA | 量化不同条件下单细胞数据集之间特定细胞类型的响应差异 | 单细胞数据集中的特定细胞类型差异 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | 均匀流形近似和投影, SHapley加性解释 | 单细胞数据集 | Iris花数据集, 单细胞RNA测序数据集, 质谱流式细胞术数据集 |
| 4068 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA transcriptomic and plasma Lipidomic reveal the potential mechanisms of a Methotrexate-based therapy against Rheumatoid Arthritis
2023-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2023.154816
PMID:37094424
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和血浆脂质组学分析，探讨基于甲氨蝶呤的治疗方案在类风湿关节炎中的潜在机制 | 采用单细胞RNA测序和脂质组学分析技术，揭示甲氨蝶呤治疗类风湿关节炎的潜在机制 | 需要更严格的研究设计来证实治疗效果与脂质代谢的相关性 | 评估基于甲氨蝶呤的治疗方案是否能带来更多的临床益处 | 类风湿关节炎患者 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，脂质组学分析 | NA | RNA，脂质 | 46名患者接受治疗，42名完成随访 |
| 4069 | 2024-08-08 |
Single cell landscape of parietal epithelial cells in healthy and diseased states
2023-07, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.03.036
PMID:37100348
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了壁上皮细胞在健康和疾病状态下的分子特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了壁上皮细胞的亚群及其在新月体形成中的作用 | NA | 探讨壁上皮细胞的生物学多样性及其在足细胞再生和新月体形成中的作用 | 壁上皮细胞及其亚群 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 4070 | 2024-08-05 |
Deficiency in the omega-3 lysolipid transporter Mfsd2a leads to aberrant oligodendrocyte lineage development and hypomyelination
2023-06-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI164118
PMID:37104036
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研究论文 | 该文章探讨了Mfsd2a在少突胶质细胞发育和髓鞘形成中的重要性 | 首次证明Mfsd2a在少突胶质细胞前体细胞的特异性表达及其在髓鞘形成中的关键作用 | 研究未发现Mfsd2a缺失与小头畸形直接相关 | 研究Mfsd2a对少突胶质细胞发育及髓鞘形成的作用 | 使用Mfsd2a-KO小鼠模型和单细胞测序技术研究少突胶质细胞谱系 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq，脂质组学分析 | NA | NA | 使用2aOKO小鼠模型进行实验 |
| 4071 | 2024-08-05 |
IRF7 and UNC93B1 variants in an infant with recurrent herpes simplex virus infection
2023-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI154016
PMID:37097753
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研究论文 | 这篇文章描述了一名婴儿反复感染单纯疱疹病毒（HSV）的病例及其相关基因变异。 | 本文首次揭示了IRF7和UNC93B1基因变异与新生儿单纯疱疹病毒感染的关系 | 本研究集中于单个病例，样本量较小，限制了结果的普遍性 | 研究新生儿对于单纯疱疹病毒感染的遗传易感性 | 一名新生儿，呈现反复单纯疱疹病毒感染的症状 | 数字病理学 | 单纯疱疹病毒感染 | 外显子组测序 | NA | RNA-Seq | 1名婴儿 |
| 4072 | 2024-08-05 |
The journey from melanocytes to melanoma
2023-06, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-023-00565-7
PMID:37095242
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研究论文 | 本文讨论了黑素细胞从神经嵴到完全成熟的色素黑素细胞的转变过程。 | 提出了黑素细胞生物学的新理解，以及不同黑素细胞亚群和微环境对黑素瘤发生和进展的独特见解。 | 尽管进展显著，但黑素瘤的起源细胞依然存在激烈争论。 | 探索和理解黑素细胞的发育及其在黑素瘤形成中的作用。 | 研究黑素细胞的异质性和转录弹性，以及它们的不同亚群和微环境。 | 数字病理学 | 黑素瘤 | 高通量单细胞测序 | 动物模型 | NA | NA |
| 4073 | 2024-08-05 |
The MIR34B/C genomic region contains multiple potential regulators of multiciliogenesis
2023-06, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.14630
PMID:37102425
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研究论文 | 本研究探讨了MIR34B/C基因组区域中多个潜在的多纤毛生成调控因子。 | 首次揭示了MIR34B/C基因组区域中BTG4、LAYN和HOATZ与多纤毛生成的关系。 | 研究可能仅限于特定的生物模型，如人类、小鼠和猪，未涵盖其他物种。 | 研究MIR34B/C区域中的调节因子对多纤毛生成的影响。 | 研究涉及的对象包括BTG4、LAYN和HOATZ等基因及其蛋白质表达情况。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和超分辨率显微镜 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4074 | 2024-08-05 |
Identification of a single cell-based signature for predicting prognosis risk and immunotherapy response in patients with glioblastoma
2023-06, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109345
PMID:37100336
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研究论文 | 本研究构建了一种基于单细胞和散装测序样本的新基因对特征，以预测胶质母细胞瘤患者的预后风险和免疫疗效 | 提出了一种新的基因对特征，能够有效区分不同的恶性生物学特征并预测预后 | 研究样本主要来自单一医院，可能影响结果的广泛性 | 研究旨在构建有效的基因对特征以预测胶质母细胞瘤的预后和免疫治疗反应 | 研究对象为来自湘雅医院的胶质瘤样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序和散装测序 | 算法模型 | 基因表达数据 | 来自湘雅医院的胶质瘤样本 |
| 4075 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptional profiles of monocytes in HBV-infected pregnant women during mid-pregnancy
2023-06, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17746
PMID:37078407
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了HBV感染的孕妇中期妊娠期间单核细胞的转录组特征 | 首次系统地阐明了HBV感染孕妇中单核细胞的固有免疫特征，并识别了单核细胞亚群中的分子驱动因子 | 研究样本量较小，仅包括三名健康孕妇和三名HBV感染孕妇 | 探讨HBV感染孕妇中期妊娠期间单核细胞的免疫反应特征 | HBV感染孕妇和健康孕妇的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三名健康孕妇和三名HBV感染孕妇 |
| 4076 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome reveals cell division-regulated hub genes in the unicellular eukaryote Paramecium
2023-Jun, European journal of protistology
IF:1.9Q4
DOI:10.1016/j.ejop.2023.125978
PMID:37080141
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了单细胞真核生物草履虫在细胞分裂过程中上调的关键基因 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了草履虫细胞分裂过程中的关键基因，并通过加权基因共表达网络分析识别了可能在此过程中起关键作用的枢纽基因 | NA | 探究草履虫细胞分裂过程中的分子机制 | 草履虫的单细胞转录组 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 草履虫cf. multimicronucleatum细胞 |
| 4077 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the developmental program underlying proximal-distal patterning of the human lung at the embryonic stage
2023-06, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-023-00802-6
PMID:37085732
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了人类胚胎期肺部近端-远端模式化的发育程序 | 发现了新的转录调控因子（如THRB、EGR3、ETV1和SOX6）以及早期胚胎的BDNF群体，这些发现加深了对人类肺发育中上皮近端-远端模式化的理解 | NA | 探索人类胚胎期肺部发育的近端-远端模式化的调控机制 | 人类胚胎期肺部的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 169,686个细胞 |
| 4078 | 2024-08-08 |
Identification of an EMT-related gene-based prognostic signature in osteosarcoma
2023-06, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.5942
PMID:37102261
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研究论文 | 本研究构建了一个与上皮-间质转化（EMT）相关的基因签名，用于预测骨肉瘤（OS）的预后 | 提出了一个新的EMT相关基因签名，包括CDK3、MYC、UHRF2、STC2、COL5A2、MMD和EHMT2，用于骨肉瘤的预后预测 | NA | 构建一个与EMT相关的基因签名，用于骨肉瘤的预后预测 | 骨肉瘤患者 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单变量Cox回归分析、LASSO回归分析、逐步多元Cox回归分析、Kaplan-Meier分析、时间依赖性接收器操作特征（ROC）分析、GSVA、ssGSEA、ESTIMATE算法、scRNA-seq | NA | 转录组数据、生存数据 | 来自Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Treatments（TARGET）和Gene Expression Omnibus（GEO）的骨肉瘤患者数据 |
| 4079 | 2024-08-08 |
Associations between brain gene expression perturbations implicated by COVID-19 and psychiatric disorders
2023-06, Journal of psychiatric research
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.jpsychires.2023.03.033
PMID:37105022
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研究论文 | 本研究通过整合COVID-19脑组织单细胞RNA测序数据和精神疾病的全基因组关联研究总结统计数据，进行元分析，探讨COVID-19引起的脑部变化与精神疾病遗传易感性之间的关联 | 首次揭示了COVID-19引起的脑部基因表达扰动与精神分裂症之间的显著关联 | NA | 探讨COVID-19引起的脑部变化与精神疾病遗传易感性之间的关联 | COVID-19脑组织和精神疾病 | 神经科学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4080 | 2024-08-08 |
MLSpatial: A machine-learning method to reconstruct the spatial distribution of cells from scRNA-seq by extracting spatial features
2023-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106873
PMID:37105115
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MLSpatial的新型计算方法，该方法通过学习基因表达模式与细胞空间位置之间的关系，基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据预测细胞间距离分布，从而重建细胞的空间分布。 | MLSpatial方法创新地利用scRNA-seq数据重建细胞的空间分布，这在癌症免疫治疗等需要细胞空间信息的场景中尤为重要。 | MLSpatial的性能依赖于细胞类型，且需要scRNA-seq数据与FISH数据具有相似的背景条件。 | 开发一种能够从scRNA-seq数据中重建细胞空间分布的计算方法。 | 研究对象包括果蝇胚胎和骨肉瘤细胞的scRNA-seq数据。 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 果蝇胚胎数据包含3039个细胞的FISH数据和1297个高质量细胞的scRNA-seq数据；骨肉瘤数据包含645个细胞的MERFISH数据。 |