单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5352 篇文献，本页显示第 4001 - 4020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4001 | 2024-08-08 |
Receptor-ligand pair typing and prognostic risk model of response or resistance to immune checkpoint inhibitors in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1170942
PMID:37152010
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研究论文 | 研究探讨了肺腺癌（LUAD）中免疫检查点抑制剂反应或抵抗的受体-配体对类型及预测模型 | 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，揭示了免疫疗法反应或抵抗的转录特征，并基于LASSO Cox回归分析确定了新的预测性生物标志物 | NA | 探索免疫疗法机制并识别肺腺癌中的新治疗机会 | 肺腺癌患者对PD-1靶向治疗的反应 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO Cox回归分析 | RNA | 涉及对PD-1治疗有反应和无反应的患者的样本 |
| 4002 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of peripheral blood and muscle cells reveals inflammatory features of juvenile dermatomyositis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1166017
PMID:37152289
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合生物信息学分析，探讨了幼年皮肌炎患者外周血和肌肉组织中细胞类型、细胞组成和转录组动态变化 | 首次详细分析了幼年皮肌炎相关免疫细胞的动态变化，并识别了与炎症相关的特定细胞亚型 | NA | 旨在研究幼年皮肌炎中外周血和肌肉组织的细胞类型、细胞组成和转录组动态变化，以阐明免疫细胞在发病机制中的作用 | 幼年皮肌炎患者的外周血和肌肉组织 | 数字病理学 | 幼年皮肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 45,859个细胞 |
| 4003 | 2024-08-08 |
Identification of cuproptosis-related biomarkers in dilated cardiomyopathy and potential therapeutic prediction of herbal medicines
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1154920
PMID:37168258
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研究论文 | 本研究探讨了扩张型心肌病（DCM）中铜死亡相关生物标志物的识别及其对中草药潜在治疗效果的预测 | 本研究首次系统地阐明了铜死亡与DCM病理特征之间的复杂关系，并识别了两个关键基因（FDX1和SLC31A1）及两种天然化合物（Rutin和Polydatin） | NA | 旨在理解DCM中铜死亡的生物学机制，并为药物开发提供依据 | DCM患者的心脏组织及中草药的治疗潜力 | 数字病理学 | 心血管疾病 | LASSO, RF, SVM-RFE, XGBoost, WGCNA, AUCell, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习模型 | 基因表达数据, scRNA-seq数据 | DCM数据集来自Gene Expression Omnibus，具体样本数量未详细说明 |
| 4004 | 2024-08-08 |
Identification of Cuproptosis-Related Subtypes, Establishment of a Prognostic Signature and Characterization of the Tumor Microenvironment in Gastric Cancer
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S404847
PMID:37168531
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研究论文 | 本研究利用生物信息学方法，探讨了铜死亡与胃癌的相关性，并建立了铜死亡相关基因集风险评分签名，以评估胃癌患者的预后和肿瘤微环境特征。 | 首次全面讨论了铜死亡与胃癌的相关性，并建立了铜死亡相关基因集风险评分签名，用于预测胃癌患者的预后和个性化治疗。 | NA | 探讨铜死亡与胃癌的相关性，并建立预后预测模型。 | 胃癌患者及其肿瘤微环境。 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序, 实时定量聚合酶链反应 (RT-qPCR) | 风险评分模型 | RNA测序数据 | 大量胃癌患者队列 |
| 4005 | 2024-08-05 |
AAFL: automatic association feature learning for gene signature identification of cancer subtypes in single-cell RNA-seq data
2023-11-10, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac047
PMID:37122141
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研究论文 | 本研究提出了一种新的基因选择方法，自动关联特征学习（AAFL），用于单细胞RNA测序数据中癌症亚型的基因特征识别 | AAFL方法能够同时为不同的细胞亚群识别不同的基因特征，克服了以往只选择相同基因的问题 | 本研究未讨论AAFL方法在其他类型癌症或其他数据集上的适用性 | 探讨如何通过基因特征识别改善癌症亚型的精确分类 | 单细胞RNA测序数据中的癌细胞亚群和基因特征 | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA-seq | 残差网络与低秩网络相结合的模型 | 基因表达数据 | 涉及真实的黑色素瘤癌症的单细胞RNA测序数据集 |
| 4006 | 2024-08-08 |
A pathogenic variant in the uncharacterized RNF212B gene results in severe aneuploidy male infertility and repeated IVF failure
2023-07-13, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2023.100189
PMID:37124137
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研究论文 | 本文通过外显子测序分析了两个近亲家族成员的基因组，发现了一个未知的RNF212B基因中的罕见同源无义突变，该突变导致严重的非整倍体男性不育和反复的体外受精（IVF）失败 | 首次在RNF212B基因中发现与严重男性不育和IVF失败相关的致病变异，并通过scRNA-seq和FISH分析验证了其在减数分裂和基因组稳定性中的关键作用 | 研究样本量较小，仅基于两个近亲家族成员和一个无关的不育患者，可能影响结果的普遍性 | 识别导致严重男性不育和反复IVF失败的致病变异 | 患有严重男性不育和反复IVF失败的患者的基因组 | 遗传学 | 男性不育 | 外显子测序, scRNA-seq, FISH | NA | 基因组数据 | 两个近亲家族成员和一个无关的不育患者 |
| 4007 | 2024-08-08 |
A Rare Subset of Primary Tumor Cells with Concomitant Hyperactivation of Extracellular Matrix Remodeling and dsRNA-IFN1 Signaling Metastasizes in Breast Cancer
2023-07-05, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2717
PMID:37133448
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研究论文 | 本研究利用慢病毒条形码结合单细胞RNA测序技术，追踪乳腺癌转移过程中的克隆和转录组进化，揭示了乳腺癌转移的分子机制 | 首次发现并证明了乳腺癌转移源自于在原发肿瘤中数量较少但具有高转移潜能的克隆，这些克隆同时高度激活了细胞外基质重塑和dsRNA-IFN信号通路 | NA | 深入理解乳腺癌转移的分子决定因素，以促进预防和治疗策略的开发 | 乳腺癌转移的分子机制 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 4008 | 2024-08-05 |
Identification and Characterization of the Wilms Tumor Cancer Stem Cell
2023-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202206787
PMID:37114795
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研究论文 | 本研究识别和表征了具有癌症干细胞特征的肾源性前体细胞，驱动威尔姆斯肿瘤的发生 | 本文通过空间转录组学和单细胞RNA测序等技术，首次定义了威尔姆斯肿瘤中的SIX2+CITED1+细胞为肾源样癌症干细胞，并揭示了其在自我更新和分化中的调节机制 | 研究可能局限于少量样本，未能覆盖所有可能的威尔姆斯肿瘤变异 | 研究威尔姆斯肿瘤中的癌症干细胞特征及其发育机制 | 威尔姆斯肿瘤样本中的肾源性前体细胞对照发育中的人类肾脏细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 4009 | 2024-08-08 |
Inferring cell diversity in single cell data using consortium-scale epigenetic data as a biological anchor for cell identity
2023-06-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad307
PMID:37125641
|
研究论文 | 本文介绍了TRIAGE-Cluster和TRIAGE-ParseR方法，利用全基因组表观遗传数据识别单细胞RNA测序数据中的细胞多样性 | 提出了基于全基因组表观遗传数据和加权密度估计的细胞类型聚类方法，以及评估基因表达排名列表的机器学习方法 | NA | 开发新的方法来解析单细胞RNA测序数据中的细胞多样性和基因调控 | 单细胞RNA测序数据中的细胞多样性和基因调控 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 多种生物样本 |
| 4010 | 2024-08-08 |
Single-cell landscape analysis unravels molecular programming of the human B cell compartment in chronic GVHD
2023-06-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169732
PMID:37129971
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了在慢性移植物抗宿主病（cGVHD）中人类B细胞分区的分子编程 | 发现了在cGVHD患者中与健康或感染个体相比，记忆B细胞分区的显著转录差异，包括潜在致病性的非典型B细胞（ABCs）的扩展 | NA | 理解在异基因造血干细胞移植（allo-HCT）中B细胞的分子编程 | 从患者中纯化的B细胞 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 大量纯化的B细胞 |
| 4011 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq with spatial transcriptomics to create an atlas of human diabetic kidney disease
2023-06, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202202013RR
PMID:37130011
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和空间转录组分析探索糖尿病肾病的细胞群体和相互作用 | 首次将单细胞RNA-seq与空间转录组学结合，以创建人类糖尿病肾病的细胞图谱 | 样本量和数据范围可能限制了研究结果的广泛适用性 | 研究糖尿病肾病中细胞群体及其相互作用 | 来自糖尿病患者的肾脏标本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组分析 | NA | 组织标本 | 糖尿病患者的肾脏标本（具体样本数量未提供） |
| 4012 | 2024-08-05 |
Perivascular localized cells commit erythropoiesis in PDGF-B-expressing solid tumors
2023-06, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12423
PMID:37120719
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研究论文 | 该研究探讨了肿瘤微环境中血管周围局部细胞如何影响红细胞生成 | 揭示了肿瘤组织中血管周围局部细胞参与红细胞生成的新机制 | 缺乏对人类肿瘤的直接临床验证 | 了解肿瘤组织中血管周围细胞对红细胞生成的影响 | 小鼠衍生的血管周围局部细胞和肿瘤微环境中的血液生成过程 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序、qPCR、ELISA | NA | 细胞、基因表达数据 | 小鼠模型的特定细胞样本 |
| 4013 | 2024-08-05 |
Time-resolved single-cell transcriptomics reveals the landscape and dynamics of hepatic cells in sepsis-induced acute liver dysfunction
2023-Jun, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100718
PMID:37122356
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研究论文 | 该论文揭示了脓毒症诱导的急性肝功能障碍中肝细胞的细胞异质性和动态调节 | 首次在单细胞分辨率下展示了主要非肝实质细胞在脓毒症进展中的动态转录组景观和相互作用 | 当前研究仍未完全阐明脓毒症诱导的急性肝功能障碍的所有发病机制 | 探讨脓毒症诱导的急性肝功能障碍中主要非肝实质细胞的动态及其相互作用 | 脓毒症小鼠模型中的主要非肝实质细胞亚群 | 数字病理学 | 脓毒症诱导的急性肝功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 控制组和脓毒症小鼠的主要肝非实质细胞的转录组分析 |
| 4014 | 2024-08-08 |
Applications of single-cell RNA sequencing in drug discovery and development
2023-06, Nature reviews. Drug discovery
DOI:10.1038/s41573-023-00688-4
PMID:37117846
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在药物发现和开发中的应用 | scRNA-seq技术通过细胞亚型分类提高了对疾病的理解，促进了目标识别和功能基因组学筛选，增强了目标认证和优先级排序 | 讨论了scRNA-seq技术在制药行业实施中的持续挑战 | 展示scRNA-seq方法在药物发现和开发关键步骤中的应用 | scRNA-seq技术在药物发现和开发中的应用 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA |
| 4015 | 2024-08-08 |
Triple immune modulator therapy for aberrant hyperinflammatory responses in severe COVID-19
2023-06, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109628
PMID:37119951
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研究论文 | 评估双重（糖皮质激素和托珠单抗）和三重（加上巴瑞替尼）免疫调节疗法对严重COVID-19的临床有效性 | 首次探讨三重免疫调节疗法（糖皮质激素、托珠单抗和巴瑞替尼）对严重COVID-19患者30天恢复的影响，并通过单细胞RNA测序分析其对异常免疫反应的调节作用 | 回顾性队列研究，可能存在选择偏倚和信息偏倚 | 评估双重和三重免疫调节疗法对严重COVID-19的临床效果 | 严重COVID-19患者及其免疫反应 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 4016 | 2024-08-08 |
Identifying Aging and Alzheimer Disease-Associated Somatic Variations in Excitatory Neurons From the Human Frontal Cortex
2023-Jun, Neurology. Genetics
DOI:10.1212/NXG.0000000000200066
PMID:37123987
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研究论文 | 本文通过对比全基因组测序（WGS）数据和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，设计了一个体细胞突变检测流程，并应用于76名参与者的数据集，以识别与年龄和阿尔茨海默病（AD）相关的体细胞变异。 | 本文首次结合scRNA-seq和WGS数据，成功检测出与AD和年龄相关的体细胞突变，并提供了新的见解。 | NA | 研究阿尔茨海默病（AD）与体细胞突变积累之间的关系，以理解AD的病因。 | 主要关注人类前额叶皮层中的兴奋性神经元。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组测序（WGS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，转录组数据 | 76名参与者 |
| 4017 | 2024-08-08 |
DNMT3AR882H accelerates angioimmunoblastic T-cell lymphoma in mice
2023-06, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02699-2
PMID:37127775
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研究论文 | 本文研究了DNMT3A突变在血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤（AITL）中的作用，特别是在小鼠模型中的影响 | 首次报道了DNMT3A突变在AITL中的功能作用，并通过单细胞转录组分析揭示了其分子机制 | NA | 探讨DNMT3A突变在AITL中的功能作用及其分子机制 | DNMT3A突变对AITL的影响，以及其对Tfh细胞和B细胞分化的影响 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠淋巴结样本 |
| 4018 | 2024-08-05 |
SSNMDI: a novel joint learning model of semi-supervised non-negative matrix factorization and data imputation for clustering of single-cell RNA-seq data
2023-05-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad149
PMID:37122068
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研究论文 | 本文提出了一种新颖的联合学习模型SSNMDI，用于对单细胞RNA测序数据进行数据填充和聚类 | 在单细胞RNA测序领域首次结合数据填充、部分标签信息、维度降低和聚类 | NA | 旨在改善单细胞RNA测序数据的聚类性能 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 非负矩阵分解 (NMF) | NA | 数据集 | 14个数据集 |
| 4019 | 2024-08-08 |
Expansion of macrophage and liver sinusoidal endothelial cell subpopulations during non-alcoholic steatohepatitis progression
2023-May-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106572
PMID:37124414
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了非酒精性脂肪性肝炎（NASH）进展过程中肝脏非实质细胞（NPCs）的异质性，并识别了与NASH进展相关的特定亚群。 | 发现了一种具有潜在调节巨噬细胞积累和促进NASH发展功能的Itgad/Fcrl5巨噬细胞亚群，以及可能参与病理性血管生成和炎症调节的Egr1和Ly6a肝窦内皮细胞（LSECs）亚群。 | NA | 探索非酒精性脂肪性肝炎（NASH）进展中肝脏非实质细胞的异质性并识别特定亚群。 | 肝脏非实质细胞（NPCs）及其在NASH进展中的作用。 | NA | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 4020 | 2024-08-08 |
Direct neuronal reprogramming by temporal identity factors
2023-05-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2122168120
PMID:37126716
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研究论文 | 研究通过条件基因表达系统，探索时间身份转录因子在终末分化细胞中的神经重编程能力 | 首次发现早期时间身份转录因子Ikzf1和Ikzf4能够直接将Müller胶质细胞转化为iONL细胞，并能在体外将胚胎成纤维细胞重编程为诱导神经元 | NA | 探究时间身份因子是否能重编程终末分化细胞的身份 | 小鼠视网膜胶质细胞和胚胎成纤维细胞 | 神经科学 | NA | 条件基因表达系统，遗传谱系追踪，免疫组织化学，单细胞转录组和多组学分析 | NA | 细胞 | 小鼠视网膜胶质细胞和胚胎成纤维细胞 |