单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 4001 - 4020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4001 | 2024-08-08 |
Role of MicroRNAs and their Downstream Target Transcription Factors in Zebrafish Thrombopoiesis
2023-Apr-24, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2807790/v1
PMID:37162944
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研究论文 | 本研究利用斑马鱼血栓细胞模型，通过单细胞RNA测序和基因敲降技术，探讨了微小RNA及其下游转录因子在血栓生成中的作用 | 首次系统研究了斑马鱼血栓细胞中的微小RNA及其下游转录因子，揭示了它们在血栓生成中的调控网络 | 研究主要集中在斑马鱼模型，尚未在人类中验证这些发现 | 探讨微小RNA及其下游转录因子在斑马鱼血栓生成中的作用 | 斑马鱼血栓细胞中的微小RNA及其下游转录因子 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15种微小RNA在斑马鱼血栓细胞中被鉴定 |
| 4002 | 2024-08-05 |
Immune Cell Profiling of Atopic Dermatitis Patients Before and After Treatment with Halometasone Cream Wet-Wrap Therapy by Single-Cell Sequencing
2023 Jan-Feb, Indian journal of dermatology
IF:1.0Q4
DOI:10.4103/ijd.ijd_801_22
PMID:37151231
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术对特应性皮炎患者在治疗前后的外围血免疫细胞进行了分析 | 首次报道了特应性皮炎患者在使用氟氯噻吨乳膏湿包疗法前后的免疫细胞特征 | 样本数量仅限于两名患者，结果的普遍性需要更多研究来验证 | 研究特应性皮炎患者在治疗前后的免疫细胞特征变化 | 特应性皮炎患者 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2名患者 |
| 4003 | 2024-08-05 |
Case report: Immune modulation after PD-1 inhibitor therapy in a patient with extranodal NK/T-cell lymphoma secondary to chronic active Epstein-Barr virus disease unveiled by single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1172307
PMID:37138889
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病例报告 | 该文章描述了一个患有CAEBV的ENKTL患者在接受PD-1抑制剂治疗后免疫调节的案例 | 首次使用单细胞转录组学揭示了PD-1抑制剂治疗后患者淋巴细胞的显著增加，特别是自然杀伤细胞的活性 | 只报告了一个病例，无法广泛推广结果 | 探讨PD-1抑制剂治疗在EBV相关疾病中的疗效和安全性 | 一位因CAEBV并发的ENKTL患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 1个病例 |
| 4004 | 2024-08-05 |
Prognostic value of SLC4A4 and its correlation with the microsatellite instability in colorectal cancer
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1179120
PMID:37152025
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研究论文 | 本研究探讨了与微卫星不稳定性相关的新生物标志物，以更好地预测结直肠癌的预后和指导药物治疗 | 确认了SLC4A4作为肿瘤抑制基因，其表达显著降低并与微卫星不稳定性呈正相关，可以在结直肠癌治疗中联合应用 | 本研究的样本量和具体分析方法可能限制了结论的普遍适用性 | 旨在探索新的生物标志物以改善结直肠癌的预后预测 | 研究对象为结直肠癌患者和相关细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | PCR检测、单细胞测序、免疫组化 | Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 844个不同表达基因，涉及多个结直肠癌细胞系 |
| 4005 | 2024-08-05 |
The effects of mechanical force on fibroblast behavior in cutaneous injury
2023, Frontiers in surgery
IF:1.6Q2
DOI:10.3389/fsurg.2023.1167067
PMID:37143767
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研究论文 | 本文章回顾了机械力对皮肤损伤中成纤维细胞行为的影响。 | 揭示了涉及机械感知的蛋白质及其下游通路如何影响伤口愈合和疤痕形成。 | 研究中动物模型的结果可能不完全适用于人类情况。 | 探讨机械信号在病理性疤痕形成中的作用及其潜在的临床治疗策略。 | 聚焦于皮肤伤口愈合过程中的成纤维细胞及其转变为肌成纤维细胞的行为。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 4006 | 2024-08-05 |
Dissecting order amidst chaos of programmed cell deaths: construction of a diagnostic model for KIRC using transcriptomic information in blood-derived exosomes and single-cell multi-omics data in tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1130513
PMID:37153569
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研究论文 | 本文章构建了一个基于转录组信息的肾脏肿瘤（KIRC）诊断模型 | 首次结合了编程性细胞死亡相关基因与单细胞多组学数据构建KIRC的诊断模型 | 未明确指出具体限制 | 探讨KIRC的发病机制和改进其诊断方法 | 使用KIRC患者的血液来源外泌体的转录组信息进行研究 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序（RNA-seq） | NA | 基因组数据 | 使用了1428个样本和216155个单细胞 |
| 4007 | 2024-08-08 |
The regeneration-responsive element careg monitors activation of Müller glia after MNU-induced damage of photoreceptors in the zebrafish retina
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1160707
PMID:37138703
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研究论文 | 本文研究了斑马鱼视网膜中光感受器受损后Müller胶质细胞的再生响应元素careg的激活情况。 | 首次发现转录报告因子careg参与斑马鱼视网膜的修复过程，并揭示了Müller胶质细胞在再生过程中的分子特征和异质性响应。 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，其结果在哺乳动物中的适用性需要进一步验证。 | 探讨斑马鱼视网膜光感受器受损后Müller胶质细胞的再生机制。 | 斑马鱼视网膜中的Müller胶质细胞和光感受器。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼视网膜中的多个细胞类型 |
| 4008 | 2024-08-08 |
Transcriptional networks of transient cell states during human prefrontal cortex development
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1126438
PMID:37138706
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序数据，探讨了人类前额叶皮层发育过程中的不同短暂细胞状态及其基因调控网络 | 本研究首次揭示了前额叶皮层发育中的独特中间状态和特定的基因相互作用网络，并验证了在少突胶质细胞前体细胞谱系指定中的关键基因调控成分 | NA | 阐明人类前额叶皮层发育过程中的细胞异质性及其分子调控机制 | 人类前额叶皮层的发育过程及其细胞状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 胎儿阶段的人类前额叶皮层样本 |
| 4009 | 2024-08-08 |
Synergistic effect of CD47 blockade in combination with cordycepin treatment against cancer
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1144330
PMID:37138855
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研究论文 | 本研究探讨了冬虫夏草素与CD47阻断剂联合治疗对肿瘤微环境的影响 | 首次展示了冬虫夏草素与抗CD47抗体联合治疗能够显著增强肿瘤抑制效果，并调节肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤浸润淋巴细胞的比例 | NA | 研究冬虫夏草素与CD47阻断剂联合治疗对肿瘤微环境的影响 | 肿瘤微环境中的巨噬细胞和T细胞 | 数字病理学 | 消化道恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 4010 | 2024-08-08 |
Macrophage-derived exosome promotes regulatory T cell differentiation in malignant pleural effusion
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1161375
PMID:37143656
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研究论文 | 本文研究了肿瘤相关巨噬细胞衍生的外泌体在恶性胸腔积液中促进调节性T细胞分化的作用 | 首次明确了巨噬细胞及其分泌的外泌体在恶性胸腔积液中的免疫调节活性和功能 | NA | 探讨巨噬细胞衍生的外泌体在恶性胸腔积液中的免疫调节作用 | 巨噬细胞、外泌体、T细胞及恶性胸腔积液 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、miRNA微阵列 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 4011 | 2024-08-08 |
Identification and Validation of NK Marker Genes in Ovarian Cancer by scRNA-seq Combined with WGCNA Algorithm
2023, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2023/6845701
PMID:37144238
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合WGCNA算法，鉴定和验证了卵巢癌中的NK细胞标记基因，并构建了预测患者临床结局和治疗策略的新特征 | 首次利用单细胞RNA测序和WGCNA算法筛选NK细胞标记基因，并构建了基于这些基因的预测模型，用于预测患者的临床结局和治疗策略 | NA | 鉴定和验证卵巢癌中的NK细胞标记基因，并开发预测患者临床结局和治疗策略的新特征 | 卵巢癌样本中的NK细胞标记基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | WGCNA | RNA | 总共包括1793个样本 |
| 4012 | 2024-08-08 |
Bulk and single-cell transcriptome profiling reveal extracellular matrix mechanical regulation of lipid metabolism reprograming through YAP/TEAD4/ACADL axis in hepatocellular carcinoma
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.82177
PMID:37151879
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析，揭示了细胞外基质机械调控通过YAP/TEAD4/ACADL轴影响肝细胞癌中脂质代谢重编程的机制 | 发现ACADL作为机械反应酶，通过细胞外基质硬度的增加激活YAP/TEAD4转录复合体，从而在转录水平上抑制ACADL，影响肝细胞癌中的脂质代谢 | NA | 研究细胞外基质硬度对肝细胞癌代谢失调的影响及其分子机制 | 肝细胞癌样本及其代谢途径 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | TCGA-LIHC数据库（n=374）和GEO数据集（GSE14520） |
| 4013 | 2024-08-08 |
Receptor-ligand pair typing and prognostic risk model of response or resistance to immune checkpoint inhibitors in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1170942
PMID:37152010
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研究论文 | 研究探讨了肺腺癌（LUAD）中免疫检查点抑制剂反应或抵抗的受体-配体对类型及预测模型 | 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，揭示了免疫疗法反应或抵抗的转录特征，并基于LASSO Cox回归分析确定了新的预测性生物标志物 | NA | 探索免疫疗法机制并识别肺腺癌中的新治疗机会 | 肺腺癌患者对PD-1靶向治疗的反应 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO Cox回归分析 | RNA | 涉及对PD-1治疗有反应和无反应的患者的样本 |
| 4014 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of peripheral blood and muscle cells reveals inflammatory features of juvenile dermatomyositis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1166017
PMID:37152289
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合生物信息学分析，探讨了幼年皮肌炎患者外周血和肌肉组织中细胞类型、细胞组成和转录组动态变化 | 首次详细分析了幼年皮肌炎相关免疫细胞的动态变化，并识别了与炎症相关的特定细胞亚型 | NA | 旨在研究幼年皮肌炎中外周血和肌肉组织的细胞类型、细胞组成和转录组动态变化，以阐明免疫细胞在发病机制中的作用 | 幼年皮肌炎患者的外周血和肌肉组织 | 数字病理学 | 幼年皮肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 45,859个细胞 |
| 4015 | 2024-08-08 |
Identification of cuproptosis-related biomarkers in dilated cardiomyopathy and potential therapeutic prediction of herbal medicines
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1154920
PMID:37168258
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研究论文 | 本研究探讨了扩张型心肌病（DCM）中铜死亡相关生物标志物的识别及其对中草药潜在治疗效果的预测 | 本研究首次系统地阐明了铜死亡与DCM病理特征之间的复杂关系，并识别了两个关键基因（FDX1和SLC31A1）及两种天然化合物（Rutin和Polydatin） | NA | 旨在理解DCM中铜死亡的生物学机制，并为药物开发提供依据 | DCM患者的心脏组织及中草药的治疗潜力 | 数字病理学 | 心血管疾病 | LASSO, RF, SVM-RFE, XGBoost, WGCNA, AUCell, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习模型 | 基因表达数据, scRNA-seq数据 | DCM数据集来自Gene Expression Omnibus，具体样本数量未详细说明 |
| 4016 | 2024-08-08 |
Identification of Cuproptosis-Related Subtypes, Establishment of a Prognostic Signature and Characterization of the Tumor Microenvironment in Gastric Cancer
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S404847
PMID:37168531
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研究论文 | 本研究利用生物信息学方法，探讨了铜死亡与胃癌的相关性，并建立了铜死亡相关基因集风险评分签名，以评估胃癌患者的预后和肿瘤微环境特征。 | 首次全面讨论了铜死亡与胃癌的相关性，并建立了铜死亡相关基因集风险评分签名，用于预测胃癌患者的预后和个性化治疗。 | NA | 探讨铜死亡与胃癌的相关性，并建立预后预测模型。 | 胃癌患者及其肿瘤微环境。 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序, 实时定量聚合酶链反应 (RT-qPCR) | 风险评分模型 | RNA测序数据 | 大量胃癌患者队列 |
| 4017 | 2024-08-05 |
AAFL: automatic association feature learning for gene signature identification of cancer subtypes in single-cell RNA-seq data
2023-11-10, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac047
PMID:37122141
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研究论文 | 本研究提出了一种新的基因选择方法，自动关联特征学习（AAFL），用于单细胞RNA测序数据中癌症亚型的基因特征识别 | AAFL方法能够同时为不同的细胞亚群识别不同的基因特征，克服了以往只选择相同基因的问题 | 本研究未讨论AAFL方法在其他类型癌症或其他数据集上的适用性 | 探讨如何通过基因特征识别改善癌症亚型的精确分类 | 单细胞RNA测序数据中的癌细胞亚群和基因特征 | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA-seq | 残差网络与低秩网络相结合的模型 | 基因表达数据 | 涉及真实的黑色素瘤癌症的单细胞RNA测序数据集 |
| 4018 | 2024-08-08 |
A pathogenic variant in the uncharacterized RNF212B gene results in severe aneuploidy male infertility and repeated IVF failure
2023-07-13, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2023.100189
PMID:37124137
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研究论文 | 本文通过外显子测序分析了两个近亲家族成员的基因组，发现了一个未知的RNF212B基因中的罕见同源无义突变，该突变导致严重的非整倍体男性不育和反复的体外受精（IVF）失败 | 首次在RNF212B基因中发现与严重男性不育和IVF失败相关的致病变异，并通过scRNA-seq和FISH分析验证了其在减数分裂和基因组稳定性中的关键作用 | 研究样本量较小，仅基于两个近亲家族成员和一个无关的不育患者，可能影响结果的普遍性 | 识别导致严重男性不育和反复IVF失败的致病变异 | 患有严重男性不育和反复IVF失败的患者的基因组 | 遗传学 | 男性不育 | 外显子测序, scRNA-seq, FISH | NA | 基因组数据 | 两个近亲家族成员和一个无关的不育患者 |
| 4019 | 2024-08-08 |
A Rare Subset of Primary Tumor Cells with Concomitant Hyperactivation of Extracellular Matrix Remodeling and dsRNA-IFN1 Signaling Metastasizes in Breast Cancer
2023-07-05, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2717
PMID:37133448
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研究论文 | 本研究利用慢病毒条形码结合单细胞RNA测序技术，追踪乳腺癌转移过程中的克隆和转录组进化，揭示了乳腺癌转移的分子机制 | 首次发现并证明了乳腺癌转移源自于在原发肿瘤中数量较少但具有高转移潜能的克隆，这些克隆同时高度激活了细胞外基质重塑和dsRNA-IFN信号通路 | NA | 深入理解乳腺癌转移的分子决定因素，以促进预防和治疗策略的开发 | 乳腺癌转移的分子机制 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 4020 | 2024-08-05 |
Identification and Characterization of the Wilms Tumor Cancer Stem Cell
2023-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202206787
PMID:37114795
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研究论文 | 本研究识别和表征了具有癌症干细胞特征的肾源性前体细胞，驱动威尔姆斯肿瘤的发生 | 本文通过空间转录组学和单细胞RNA测序等技术，首次定义了威尔姆斯肿瘤中的SIX2+CITED1+细胞为肾源样癌症干细胞，并揭示了其在自我更新和分化中的调节机制 | 研究可能局限于少量样本，未能覆盖所有可能的威尔姆斯肿瘤变异 | 研究威尔姆斯肿瘤中的癌症干细胞特征及其发育机制 | 威尔姆斯肿瘤样本中的肾源性前体细胞对照发育中的人类肾脏细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |