单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5352 篇文献，本页显示第 3981 - 4000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3981 | 2024-08-05 |
Change in cytokine profiles released by mast cells mediated by lung cancer-derived exosome activation may contribute to cancer-associated coagulation disorders
2023-05-04, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-023-01110-7
PMID:37143160
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研究论文 | 本研究探讨了肺癌来源的外泌体激活的肥大细胞释放的细胞因子谱变化可能导致与癌症相关的凝血障碍。 | 首次揭示了肺癌细胞来源的外泌体如何激活肥大细胞并促进其释放促凝血介质，与肺癌患者的凝血异常密切相关。 | 研究可能局限于体外实验，尚需在临床环境中验证结果。 | 探讨肥大细胞在肺癌相关凝血障碍中的具体作用。 | 肺癌患者的肥大细胞以及从肺腺癌细胞系A549提取的外泌体。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序，生物信息学分析，荧光显微镜 | NA | NA | 肺癌患者的肥大细胞和肺腺癌细胞系A549的外泌体 |
| 3982 | 2024-08-05 |
Reversible transitions between noradrenergic and mesenchymal tumor identities define cell plasticity in neuroblastoma
2023-05-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38239-5
PMID:37142597
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研究论文 | 本研究探讨了神经母细胞瘤中去甲肾上腺素能和间充质细胞身份之间的可逆转变及其细胞可塑性。 | 揭示了神经母细胞瘤细胞的内在可塑性特性依赖于环境的外部影响，从而推动细胞身份的改变 | 患者肿瘤中这些身份的相对贡献仍然不清晰 | 研究神经母细胞瘤中去甲肾上腺素能与间充质细胞身份的关系 | 神经母细胞瘤细胞系及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 肿瘤生物组织样本 | 18个肿瘤活检和15个PDX模型 |
| 3983 | 2024-08-08 |
BACE1 regulates expression of Clusterin in astrocytes for enhancing clearance of β-amyloid peptides
2023-05-04, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-023-00611-w
PMID:37143090
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研究论文 | 本文研究了BACE1在星形胶质细胞中的作用，特别是其对Clusterin和Cxcl14表达的调控，以及这种调控如何影响β-淀粉样蛋白的清除。 | 首次揭示了BACE1在星形胶质细胞中通过调控胰岛素受体途径影响Clusterin和Cxcl14的表达，从而增强β-淀粉样蛋白的清除。 | NA | 探讨BACE1在星形胶质细胞中的功能及其对阿尔茨海默病中β-淀粉样蛋白清除的影响。 | 星形胶质细胞中的BACE1及其调控的基因表达。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Bace1 KO小鼠和野生型对照小鼠的纯化星形胶质细胞进行实验。 |
| 3984 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing uncovers heterogeneous transcriptional signatures in tumor-infiltrated dendritic cells in prostate cancer
2023-May, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e15694
PMID:37144199
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了前列腺癌肿瘤微环境中树突状细胞的异质性转录特征 | 本研究通过构建基因共表达网络，提出了新的治疗靶点 | NA | 探究前列腺癌肿瘤微环境中树突状细胞的分子功能和通讯 | 前列腺癌肿瘤微环境中的树突状细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3985 | 2024-08-08 |
Transcriptomic analysis of B cells suggests that CD70 and LY9 may be novel features in patients with systemic lupus erythematosus
2023-May, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e15684
PMID:37144201
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组数据分析，探讨了系统性红斑狼疮患者B细胞亚群的特征及其在疾病中的作用 | 首次发现CD70和LY9在系统性红斑狼疮患者B细胞中的过表达，这可能是该疾病的一个新特征 | 研究仅限于分析B细胞亚群的转录组数据，未涉及这些分子在疾病中的具体功能和机制 | 探究系统性红斑狼疮患者B细胞亚群的特征及其在疾病中的作用 | 系统性红斑狼疮患者的B细胞亚群及其相关基因表达 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血单个核细胞及分离的B细胞亚群 |
| 3986 | 2024-08-08 |
Matrix prior for data transfer between single cell data types in latent Dirichlet allocation
2023-05, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011049
PMID:37146053
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研究论文 | 本文探讨了利用潜在狄利克雷分配（LDA）模型中的非均匀矩阵先验，从大规模单细胞ATAC-seq或scRNA-seq数据中提取信息，以改善新scATAC-seq数据集的细胞类型检测 | 提出了一种使用非对称矩阵先验的LDA方法，以提高小规模scATAC-seq数据集中细胞类型信息的捕获能力 | NA | 开发一种方法，利用先前生成的大规模scATAC-seq或scRNA-seq数据来指导新scATAC-seq数据集的分析 | 单细胞ATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | 潜在狄利克雷分配（LDA） | LDA | 单细胞数据 | C. elegans线虫和鼠皮肤细胞的SHARE-seq数据 |
| 3987 | 2024-08-08 |
Dozer: Debiased personalized gene co-expression networks for population-scale scRNA-seq data
2023-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.25.538290
PMID:37163070
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Dozer的方法，用于校正单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的基因-基因相关性估计，以准确量化个体间的网络水平变异 | Dozer在通用泊松测量模型中校正相关性估计，并提供了一种量化高噪声测量基因的指标 | NA | 旨在改进从scRNA-seq数据中估计个性化共表达网络的方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达网络 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及多个分化的人诱导多能干细胞（iPSC）线和阿尔茨海默病及对照组的后遗症人组织中的少突胶质细胞的群体规模scRNA-seq数据 |
| 3988 | 2024-08-08 |
A mannitol-based buffer improves single-cell RNA sequencing of high-salt marine cells
2023-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.26.538465
PMID:37163054
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research paper | 本文研究了一种基于甘露醇的低盐磷酸盐缓冲液（PBS-M）对高盐海洋细胞单细胞RNA测序（scRNA-seq）质量的改善效果 | 提出了一种新的缓冲液配方，通过添加D-甘露醇，使得高盐海洋细胞的scRNA-seq质量得到提升 | NA | 探索和优化适用于高盐海洋生物的单细胞RNA测序方法 | 海洋生物中的血细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 3989 | 2024-08-08 |
Role of MicroRNAs and their Downstream Target Transcription Factors in Zebrafish Thrombopoiesis
2023-Apr-24, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2807790/v1
PMID:37162944
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研究论文 | 本研究利用斑马鱼血栓细胞模型，通过单细胞RNA测序和基因敲降技术，探讨了微小RNA及其下游转录因子在血栓生成中的作用 | 首次系统研究了斑马鱼血栓细胞中的微小RNA及其下游转录因子，揭示了它们在血栓生成中的调控网络 | 研究主要集中在斑马鱼模型，尚未在人类中验证这些发现 | 探讨微小RNA及其下游转录因子在斑马鱼血栓生成中的作用 | 斑马鱼血栓细胞中的微小RNA及其下游转录因子 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15种微小RNA在斑马鱼血栓细胞中被鉴定 |
| 3990 | 2024-08-05 |
Immune Cell Profiling of Atopic Dermatitis Patients Before and After Treatment with Halometasone Cream Wet-Wrap Therapy by Single-Cell Sequencing
2023 Jan-Feb, Indian journal of dermatology
IF:1.0Q4
DOI:10.4103/ijd.ijd_801_22
PMID:37151231
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术对特应性皮炎患者在治疗前后的外围血免疫细胞进行了分析 | 首次报道了特应性皮炎患者在使用氟氯噻吨乳膏湿包疗法前后的免疫细胞特征 | 样本数量仅限于两名患者，结果的普遍性需要更多研究来验证 | 研究特应性皮炎患者在治疗前后的免疫细胞特征变化 | 特应性皮炎患者 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2名患者 |
| 3991 | 2024-08-05 |
Case report: Immune modulation after PD-1 inhibitor therapy in a patient with extranodal NK/T-cell lymphoma secondary to chronic active Epstein-Barr virus disease unveiled by single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1172307
PMID:37138889
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病例报告 | 该文章描述了一个患有CAEBV的ENKTL患者在接受PD-1抑制剂治疗后免疫调节的案例 | 首次使用单细胞转录组学揭示了PD-1抑制剂治疗后患者淋巴细胞的显著增加，特别是自然杀伤细胞的活性 | 只报告了一个病例，无法广泛推广结果 | 探讨PD-1抑制剂治疗在EBV相关疾病中的疗效和安全性 | 一位因CAEBV并发的ENKTL患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 1个病例 |
| 3992 | 2024-08-05 |
Prognostic value of SLC4A4 and its correlation with the microsatellite instability in colorectal cancer
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1179120
PMID:37152025
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研究论文 | 本研究探讨了与微卫星不稳定性相关的新生物标志物，以更好地预测结直肠癌的预后和指导药物治疗 | 确认了SLC4A4作为肿瘤抑制基因，其表达显著降低并与微卫星不稳定性呈正相关，可以在结直肠癌治疗中联合应用 | 本研究的样本量和具体分析方法可能限制了结论的普遍适用性 | 旨在探索新的生物标志物以改善结直肠癌的预后预测 | 研究对象为结直肠癌患者和相关细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | PCR检测、单细胞测序、免疫组化 | Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 844个不同表达基因，涉及多个结直肠癌细胞系 |
| 3993 | 2024-08-05 |
The effects of mechanical force on fibroblast behavior in cutaneous injury
2023, Frontiers in surgery
IF:1.6Q2
DOI:10.3389/fsurg.2023.1167067
PMID:37143767
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研究论文 | 本文章回顾了机械力对皮肤损伤中成纤维细胞行为的影响。 | 揭示了涉及机械感知的蛋白质及其下游通路如何影响伤口愈合和疤痕形成。 | 研究中动物模型的结果可能不完全适用于人类情况。 | 探讨机械信号在病理性疤痕形成中的作用及其潜在的临床治疗策略。 | 聚焦于皮肤伤口愈合过程中的成纤维细胞及其转变为肌成纤维细胞的行为。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 3994 | 2024-08-05 |
Dissecting order amidst chaos of programmed cell deaths: construction of a diagnostic model for KIRC using transcriptomic information in blood-derived exosomes and single-cell multi-omics data in tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1130513
PMID:37153569
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研究论文 | 本文章构建了一个基于转录组信息的肾脏肿瘤（KIRC）诊断模型 | 首次结合了编程性细胞死亡相关基因与单细胞多组学数据构建KIRC的诊断模型 | 未明确指出具体限制 | 探讨KIRC的发病机制和改进其诊断方法 | 使用KIRC患者的血液来源外泌体的转录组信息进行研究 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序（RNA-seq） | NA | 基因组数据 | 使用了1428个样本和216155个单细胞 |
| 3995 | 2024-08-08 |
The regeneration-responsive element careg monitors activation of Müller glia after MNU-induced damage of photoreceptors in the zebrafish retina
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1160707
PMID:37138703
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研究论文 | 本文研究了斑马鱼视网膜中光感受器受损后Müller胶质细胞的再生响应元素careg的激活情况。 | 首次发现转录报告因子careg参与斑马鱼视网膜的修复过程，并揭示了Müller胶质细胞在再生过程中的分子特征和异质性响应。 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，其结果在哺乳动物中的适用性需要进一步验证。 | 探讨斑马鱼视网膜光感受器受损后Müller胶质细胞的再生机制。 | 斑马鱼视网膜中的Müller胶质细胞和光感受器。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼视网膜中的多个细胞类型 |
| 3996 | 2024-08-08 |
Transcriptional networks of transient cell states during human prefrontal cortex development
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1126438
PMID:37138706
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序数据，探讨了人类前额叶皮层发育过程中的不同短暂细胞状态及其基因调控网络 | 本研究首次揭示了前额叶皮层发育中的独特中间状态和特定的基因相互作用网络，并验证了在少突胶质细胞前体细胞谱系指定中的关键基因调控成分 | NA | 阐明人类前额叶皮层发育过程中的细胞异质性及其分子调控机制 | 人类前额叶皮层的发育过程及其细胞状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 胎儿阶段的人类前额叶皮层样本 |
| 3997 | 2024-08-08 |
Synergistic effect of CD47 blockade in combination with cordycepin treatment against cancer
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1144330
PMID:37138855
|
研究论文 | 本研究探讨了冬虫夏草素与CD47阻断剂联合治疗对肿瘤微环境的影响 | 首次展示了冬虫夏草素与抗CD47抗体联合治疗能够显著增强肿瘤抑制效果，并调节肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤浸润淋巴细胞的比例 | NA | 研究冬虫夏草素与CD47阻断剂联合治疗对肿瘤微环境的影响 | 肿瘤微环境中的巨噬细胞和T细胞 | 数字病理学 | 消化道恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 3998 | 2024-08-08 |
Macrophage-derived exosome promotes regulatory T cell differentiation in malignant pleural effusion
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1161375
PMID:37143656
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研究论文 | 本文研究了肿瘤相关巨噬细胞衍生的外泌体在恶性胸腔积液中促进调节性T细胞分化的作用 | 首次明确了巨噬细胞及其分泌的外泌体在恶性胸腔积液中的免疫调节活性和功能 | NA | 探讨巨噬细胞衍生的外泌体在恶性胸腔积液中的免疫调节作用 | 巨噬细胞、外泌体、T细胞及恶性胸腔积液 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、miRNA微阵列 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 3999 | 2024-08-08 |
Identification and Validation of NK Marker Genes in Ovarian Cancer by scRNA-seq Combined with WGCNA Algorithm
2023, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2023/6845701
PMID:37144238
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合WGCNA算法，鉴定和验证了卵巢癌中的NK细胞标记基因，并构建了预测患者临床结局和治疗策略的新特征 | 首次利用单细胞RNA测序和WGCNA算法筛选NK细胞标记基因，并构建了基于这些基因的预测模型，用于预测患者的临床结局和治疗策略 | NA | 鉴定和验证卵巢癌中的NK细胞标记基因，并开发预测患者临床结局和治疗策略的新特征 | 卵巢癌样本中的NK细胞标记基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | WGCNA | RNA | 总共包括1793个样本 |
| 4000 | 2024-08-08 |
Bulk and single-cell transcriptome profiling reveal extracellular matrix mechanical regulation of lipid metabolism reprograming through YAP/TEAD4/ACADL axis in hepatocellular carcinoma
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.82177
PMID:37151879
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析，揭示了细胞外基质机械调控通过YAP/TEAD4/ACADL轴影响肝细胞癌中脂质代谢重编程的机制 | 发现ACADL作为机械反应酶，通过细胞外基质硬度的增加激活YAP/TEAD4转录复合体，从而在转录水平上抑制ACADL，影响肝细胞癌中的脂质代谢 | NA | 研究细胞外基质硬度对肝细胞癌代谢失调的影响及其分子机制 | 肝细胞癌样本及其代谢途径 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | TCGA-LIHC数据库（n=374）和GEO数据集（GSE14520） |