单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-09-25 |
Challenges of clinical translation from single-cell sequencing to measures in clinical biochemistry of haematology: Definition of immune cell identities
2023-09, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1401
PMID:37700496
|
研究论文 | 本文探讨了从单细胞测序到临床血液学生化检测的临床转化挑战，特别是免疫细胞身份的定义 | 提出了细胞身份标记基因面板（ciMGPs）的概念，并探讨了其在疾病系统性反应、疾病特异性生物标志物识别和细胞异质性定义中的潜力 | 定义细胞亚群和状态的精确身份存在困难，且临床意义的精确解释和影响评估具有挑战性 | 促进单细胞RNA测序（scRNA-seq）在临床血液学生化检测中的应用 | 外周免疫细胞及其在系统性和微环境止血中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 大规模人群，包括不同年龄、疾病和治疗方案的个体 |
| 382 | 2024-09-25 |
Activin A-Mediated Polarization of Cancer-Associated Fibroblasts and Macrophages Confers Resistance to Checkpoint Immunotherapy in Skin Cancer
2023-09-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-0219
PMID:37327314
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研究论文 | 研究探讨了皮肤癌中免疫检查点抑制剂治疗抵抗的细胞和分子机制 | 首次揭示了Activin A介导的癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞的极化在皮肤癌免疫治疗抵抗中的关键作用 | 研究仅限于基底细胞癌，未涵盖其他类型的皮肤癌 | 探究基底细胞癌对免疫检查点抑制剂治疗抵抗的细胞和分子机制 | 基底细胞癌中的癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞 | NA | 皮肤癌 | 空间转录组学和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括对免疫治疗敏感和抵抗的基底细胞癌患者 |
| 383 | 2024-09-25 |
Inferring and perturbing cell fate regulomes in human brain organoids
2023-Sep, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05279-8
PMID:36198796
|
研究论文 | 研究利用人类脑类器官和单细胞基因组技术，推断和扰动细胞命运调控网络 | 开发了Pando框架，整合多组学数据和转录因子结合位点预测，推断出描述类器官发育的全局基因调控网络 | NA | 研究人类脑发育中的基因调控网络，并评估转录因子对细胞命运和状态调控的影响 | 人类脑类器官中的单细胞转录组和可及染色质数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因组数据 | 覆盖神经上皮形成、模式化、脑区域化和神经发生的密集时间序列数据 |
| 384 | 2024-09-25 |
Single-cell sequencing of individual retinal organoids reveals determinants of cell-fate heterogeneity
2023-08-28, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100548
PMID:37671011
|
研究论文 | 本文应用sci-Plex单细胞组合索引RNA测序方法分析视网膜类器官的细胞命运异质性 | 开发了一种测量类器官异质性的方法，并发现早期激活Wnt信号通路可增加视网膜细胞类型 | 当前技术在处理条件上的限制限制了其在筛选或类器官异质性研究中的应用 | 探索视网膜类器官的细胞命运异质性及其调控机制 | 视网膜类器官及其细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 410个视网膜类器官 |
| 385 | 2024-09-25 |
Unraveling Vulnerabilities in Endocrine Therapy-Resistant HER2+/ER+ Breast Cancer
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.554116
PMID:37662291
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研究论文 | 本研究开发并表征了两种不同的内分泌治疗耐药（ETR）HER2+/ER+乳腺癌体外模型，以识别可能的治疗脆弱性 | 本研究首次开发了两种内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌体外模型，并识别了脂质代谢和铁死亡重塑作为此类ETR乳腺癌的脆弱性 | 本研究仅限于体外模型，尚未在临床环境中验证其发现 | 研究内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌的潜在治疗脆弱性 | 内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 全基因组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 两种长期雌激素剥夺（LTED）细胞系：BT-474（BT474）和MDA-MB-361（MM361） |
| 386 | 2024-09-25 |
An overview of human single-cell RNA sequencing studies in neurobiological disease
2023-08, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2023.106201
PMID:37321420
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在神经生物学疾病研究中的应用 | 揭示了神经生物学疾病中的新型细胞类型或亚型，提出了新的病理生理机制，发现了新的药物靶点和潜在的生物标志物 | 主要集中在皮质脑区和少数疾病类型，未来研究应扩展到非皮质脑区和更多疾病类型 | 综述单细胞RNA测序在神经生物学疾病研究中的应用，探讨其对疾病理解和治疗的影响 | 神经生物学疾病患者的脑组织和由外周细胞衍生的类器官 | 数字病理学 | 神经生物学疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 387 | 2024-09-25 |
The central role of neutrophil extracellular traps (NETs) and by-products in COVID-19 related pulmonary thrombosis
2023-08, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.949
PMID:37647446
|
研究论文 | 探讨中性粒细胞外陷阱（NETs）及其副产物在COVID-19相关肺血栓形成中的中心作用 | 揭示了SARS-CoV-2如何促进NETs形成，并探讨了NETs在肺血栓形成中的作用机制 | 尚未完全阐明SARS-CoV-2促进NETs的具体机制 | 研究NETs在COVID-19相关肺血栓形成中的作用及其机制，并探讨针对NETs的治疗潜力 | 中性粒细胞外陷阱（NETs）及其在COVID-19肺血栓形成中的作用 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 388 | 2024-09-25 |
High-Dimensional Single-Cell Multimodal Landscape of Human Carotid Atherosclerosis
2023-Jul-16, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.07.13.23292633
PMID:37502836
|
研究论文 | 本文通过结合CITE-seq和scRNA-seq技术，详细描述了人类颈动脉粥样硬化的单细胞多模态景观 | 首次全面揭示了颈动脉粥样硬化病变中细胞的转录组和表型景观，并开发了首个用于分离病变中SMC衍生细胞的流式细胞术面板 | NA | 深入了解颈动脉粥样硬化病变中细胞的全面转录组和表型景观 | 颈动脉粥样硬化病变中的细胞类型及其与临床病理生理学的关联 | 数字病理学 | 心血管疾病 | CITE-seq, scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 21个病变样本，其中13个为有症状的 |
| 389 | 2024-09-25 |
Spatially resolved multiomics of human cardiac niches
2023-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06311-1
PMID:37438528
|
研究论文 | 本文结合单细胞和空间转录组学数据，研究了人类心脏八个区域的细胞微环境 | 本文揭示了心脏传导系统细胞的独特离子通道、G蛋白偶联受体和调控网络，并引入了药物靶点预测工具drug2cell | NA | 研究人类心脏细胞微环境的特征及其在心脏传导系统和免疫反应中的作用 | 人类心脏的八个区域及其细胞微环境 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类心脏的八个区域 |
| 390 | 2024-09-25 |
Heterogeneity of Islet-Infiltrating IL-21+ CD4 T Cells in a Mouse Model of Type 1 Diabetes
2023-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200712
PMID:36762954
|
研究论文 | 研究了在小鼠1型糖尿病模型中胰岛内IL-21+ CD4 T细胞的异质性 | 生成了一个新的IL-21报告NOD小鼠品系，以进一步表征IL-21+ CD4 T细胞在1型糖尿病中的作用 | NA | 探讨胰岛内IL-21+ CD4 T细胞的表型和分化状态 | 胰岛内IL-21+ CD4 T细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 391 | 2024-09-25 |
Glioblastoma induces the recruitment and differentiation of hybrid neutrophils from skull bone marrow
2023-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.24.534105
PMID:36993266
|
研究论文 | 研究揭示了胶质母细胞瘤诱导颅骨骨髓中的混合中性粒细胞招募和分化的机制 | 首次发现胶质母细胞瘤能够诱导颅骨骨髓中的混合中性粒细胞分化，并抑制肿瘤生长 | 研究主要基于患者和鼠类的胶质母细胞瘤样本，需要进一步验证在其他肿瘤类型中的适用性 | 探讨肿瘤相关中性粒细胞在胶质母细胞瘤生物学中的作用 | 胶质母细胞瘤、肿瘤相关中性粒细胞、颅骨骨髓 | NA | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者和鼠类的胶质母细胞瘤样本 |
| 392 | 2024-09-25 |
Myocardial Milieu Favors Local Differentiation of Regulatory T Cells
2023-03-03, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.122.322183
PMID:36744467
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研究论文 | 研究心肌微环境如何影响局部调节性T细胞的分化 | 首次揭示了心肌微环境通过促进抗原特异性Treg细胞的分化来塑造局部免疫反应 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证 | 探讨心肌微环境对T辅助细胞分化的影响 | 心肌微环境中的抗原特异性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠心肌梗死模型 |
| 393 | 2024-09-25 |
Pairing of single-cell RNA analysis and T cell antigen receptor profiling indicates breakdown of T cell tolerance checkpoints in atherosclerosis
2023-Mar, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-023-00218-w
PMID:37621765
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序与T细胞抗原受体测序相结合的方法，研究了动脉粥样硬化斑块、动脉三级淋巴器官和淋巴结中的T细胞耐受检查点 | 首次揭示了动脉粥样硬化斑块中T细胞耐受检查点的破坏模式，并发现人类冠状动脉和颈动脉斑块中存在类似的CD8 T细胞耐受功能障碍 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，可能无法完全代表人类动脉粥样硬化的复杂性 | 探讨动脉粥样硬化中T细胞耐受检查点的功能障碍 | 动脉粥样硬化斑块、动脉三级淋巴器官、淋巴结和血液中的T细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、T细胞抗原受体测序 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 |
| 394 | 2024-09-25 |
Radiation-induced circulating myeloid-derived suppressor cells induce systemic lymphopenia after chemoradiotherapy in patients with glioblastoma
2023-01-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abn6758
PMID:36696484
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研究论文 | 研究了胶质母细胞瘤患者在接受放化疗后出现的淋巴细胞减少症的生物学机制，并探讨了药物抑制MDSC对缓解这一现象的潜力 | 首次揭示了放疗诱导的循环髓源抑制细胞（MDSC）与系统性淋巴细胞减少之间的因果关系，并验证了药物抑制MDSC在临床前模型中的有效性 | 研究仅限于临床前模型和少量患者样本，需要进一步的临床试验验证 | 探讨胶质母细胞瘤患者在接受放化疗后淋巴细胞减少的生物学机制，并寻找潜在的治疗方法 | 胶质母细胞瘤患者的外周血样本和临床前小鼠模型 | 免疫学 | 脑癌 | RNA测序、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、免疫监测数据 | 20名胶质母细胞瘤患者的外周血样本和临床前小鼠模型 |
| 395 | 2024-09-25 |
Multi-omics analysis identifies IgG2b class-switching with ALCAM-CD6 co-stimulation in joint-draining lymph nodes during advanced inflammatory-erosive arthritis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1237498
PMID:37691918
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研究论文 | 本文利用多组学空间和单细胞转录组学技术，研究了在严重类风湿性关节炎（RA）患者中，关节引流淋巴结中淋巴引流功能障碍的分子机制 | 首次整合单细胞和空间转录组学数据，揭示了ALCAM-CD6共刺激在促进IgG2b类别转换中的作用 | 需要进一步研究免疫球蛋白克隆性和潜在的自身免疫后果，以及抗CD6疗法的有效性 | 探讨严重类风湿性关节炎中淋巴引流功能障碍的分子机制 | 关节引流淋巴结中的淋巴内皮细胞、巨噬细胞、B细胞和T细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 野生型小鼠10只，TNF-Tg小鼠18只（早期6只，晚期12只） |
| 396 | 2024-09-25 |
scDemultiplex: An iterative beta-binomial model-based method for accurate demultiplexing with hashtag oligos
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.08.013
PMID:37664174
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研究论文 | 提出了一种基于beta-二项分布模型的迭代方法scDemultiplex，用于准确的多重样本解复用 | scDemultiplex采用beta-二项分布模型和迭代策略，相比现有七种方法在高质量和低质量数据中均表现出色，并能与其他方法结合以提升性能 | 未提及 | 开发一种准确的多重样本解复用方法，以提高单细胞测序数据的分析质量 | 单细胞测序中的多重样本解复用问题 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | beta-二项分布模型 | 单细胞测序数据 | 未提及 |
| 397 | 2024-09-25 |
The Comparative Pathology Workbench: Interactive visual analytics for biomedical data
2023, Journal of pathology informatics
DOI:10.1016/j.jpi.2023.100328
PMID:37693862
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研究论文 | 设计了一个名为比较病理工作台（CPW）的交互式系统，用于生物医学数据的视觉分析 | 开发了一个基于网络浏览器的视觉分析平台，提供共享访问和交互式图像数据展示，支持多用户协作和讨论 | NA | 开发一个支持病理学家比较不同样本、病例和物种间正常和病变组织图像的交互式系统 | 病理图像和相关分析数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 图像 | NA |
| 398 | 2024-09-23 |
Blockade of IL-6R prevents preterm birth and adverse neonatal outcomes
2023-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104865
PMID:37944273
|
研究论文 | 研究探讨了IL-6R阻断剂在预防早产和不良新生儿结局中的作用 | 首次证明了IL-6R阻断剂可以有效预防由无菌性羊膜内炎症引起的早产和不良新生儿结局 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类临床试验中验证 | 探讨IL-6R阻断剂在预防早产和不良新生儿结局中的潜在治疗作用 | IL-6和IL-1α在无菌性羊膜内炎症中的作用，以及IL-6R阻断剂的治疗效果 | NA | 早产 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序、QUEST-MRI、宏基因组测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、MRI图像、宏基因组数据 | C57BL/6小鼠模型，具体样本数量未明确提及 |
| 399 | 2024-09-23 |
Single-cell profiling and zebrafish avatars reveal LGALS1 as immunomodulating target in glioblastoma
2023-11-08, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202318144
PMID:37791581
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序和斑马鱼模型揭示了胶质母细胞瘤中LGALS1作为免疫调节靶点的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序和斑马鱼模型研究了胶质母细胞瘤相关巨噬细胞与肿瘤细胞的动态相互作用，并识别出LGALS1作为主要的免疫抑制调节因子 | NA | 揭示胶质母细胞瘤中肿瘤异质性和免疫抑制微环境的关键因素，并寻找新的免疫调节靶点 | 胶质母细胞瘤相关巨噬细胞与肿瘤细胞的相互作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个胶质母细胞瘤患者样本 |
| 400 | 2024-09-23 |
Microfluidics-free single-cell genomics with templated emulsification
2023-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01685-z
PMID:36879006
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研究论文 | 本文介绍了一种无需微流控设备的新型单细胞基因组学方法，基于粒子模板乳化技术 | 开发了一种无需微流控设备和专业硬件的单细胞RNA测序方法，通过粒子模板乳化技术实现单细胞封装和cDNA条码化 | NA | 开发一种简便、灵活且可扩展的单细胞测序工作流程 | 单细胞RNA测序和多组学测量 | 基因组学 | 急性白血病 | RNA测序 | NA | 转录组 | 数千个样本或数百万个细胞 |