单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
21 2024-12-12
Tick innate immune responses to hematophagy and Ehrlichia infection at single-cell resolution
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了孤星蜱在未进食、部分进食和感染埃立克体时的血细胞反应 首次在单细胞分辨率下揭示了蜱对埃立克体感染和吸血的先天免疫反应 NA 深入了解血细胞在蜱与蜱传微生物相互作用中的作用,揭示其在媒介传播能力中的功能 孤星蜱的血细胞及其在不同状态下的基因表达 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未进食、部分进食和感染埃立克体的孤星蜱血细胞样本
22 2024-12-11
CD8+ lymphocytes are critical for early control of tuberculosis in macaques
2023-12-04, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 研究探讨了CD8+淋巴细胞在结核病早期控制中的关键作用 首次通过实验证明CD8+淋巴细胞在结核病早期控制中的重要性,并揭示了其在肺部和淋巴结中的作用机制 实验仅在猕猴模型中进行,结果的普适性有待进一步验证 探讨CD8+淋巴细胞在结核病早期控制中的功能 猕猴体内的CD8+淋巴细胞及其在结核病早期控制中的作用 免疫学 结核病 流式细胞术、单细胞RNA测序、配体-受体分析 NA 细胞、基因表达数据 猕猴样本
23 2024-12-11
Increased spatial coupling of integrin and collagen IV in the immunoresistant clear cell renal cell carcinoma tumor microenvironment
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究探讨了免疫治疗抵抗的透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中整合素和IV型胶原蛋白的空间耦合增加 首次使用细胞分辨率的空间转录组学技术,结合空间基因集富集分析和自相关分析,揭示了免疫治疗暴露的肿瘤微环境中整合素和IV型胶原蛋白的高表达耦合 研究样本量较小,仅包括21个患者样本,可能影响结果的普适性 探讨免疫治疗抵抗的透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中分子机制 透明细胞肾细胞癌肿瘤及其微环境中的整合素和IV型胶原蛋白 数字病理学 肾癌 空间转录组学、空间分子成像、多重免疫荧光 NA 转录组数据、蛋白质组数据 21个患者样本
24 2024-12-11
Post-ischemic inactivation of HIF prolyl hydroxylases in endothelium promotes maladaptive kidney repair by inducing glycolysis
2023-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文研究了缺血性急性肾损伤(AKI)后内皮细胞中缺氧诱导因子脯氨酰羟化酶(PHD)的失活如何通过诱导糖酵解促进不良肾脏修复 首次揭示了内皮细胞中PHD1、PHD2和PHD3的联合失活通过诱导糖酵解促进不良肾脏修复的机制,并提出了通过靶向内皮细胞缺氧驱动的糖酵解/MCT4轴来阻止AKI向慢性肾病(CKD)转化的潜在途径 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 探讨缺血性急性肾损伤后内皮细胞功能障碍的机制及其对肾脏修复的影响 内皮细胞中的PHD1、PHD2和PHD3酶及其在缺血性急性肾损伤后的作用 NA 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠和人类肾脏样本
25 2024-12-11
Single-cell analysis of human nasal mucosal IgE antibody secreting cells reveals a newly minted phenotype
2023-06, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析了过敏性真菌性鼻窦炎患者鼻息肉中的IgE抗体分泌细胞,揭示了一种新的表型 本文首次通过单细胞RNA测序揭示了鼻黏膜IgE抗体分泌细胞的新表型,并发现其与IgD和记忆B细胞的发育关系 研究样本量较小,仅包括3名患者,可能影响结果的普遍性 研究过敏性真菌性鼻窦炎患者鼻黏膜中IgE抗体分泌细胞的表型和功能 过敏性真菌性鼻窦炎患者鼻息肉中的IgE抗体分泌细胞 免疫学 过敏性疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 3名过敏性真菌性鼻窦炎患者的鼻息肉样本
26 2024-12-11
Pharmacologic targeting of Nedd8-activating enzyme reinvigorates T-cell responses in lymphoid neoplasia
2023-06, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本文研究了Nedd8激活酶(NAE)抑制剂pevonedistat在淋巴瘤中的治疗作用,特别是其对CD8 T细胞反应的重新激活 首次展示了NAE抑制剂pevonedistat能够直接作用于CD8 T细胞,增强其细胞毒性和细胞因子表达,并在淋巴瘤模型中延缓肿瘤进展 研究主要集中在体外实验和小鼠模型,尚未在临床试验中验证其效果 探讨NAE抑制剂在淋巴瘤治疗中的潜在作用及其对T细胞反应的影响 CD8 T细胞、淋巴瘤模型、淋巴瘤患者 NA 淋巴瘤 NA NA 单细胞RNA测序数据 NA
27 2024-12-11
Targeting lymphoid-derived IL-17 signaling to delay skin aging
2023-Jun, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本文研究了皮肤老化过程中IL-17信号通路的作用,并探讨了通过靶向IL-17信号来延缓皮肤老化的可能性 首次通过单细胞RNA测序揭示了老年皮肤中T辅助细胞、γδ T细胞和先天淋巴细胞向IL-17表达表型的偏移,并证明了IL-17信号通路的阻断可以减少皮肤炎症并延缓老化特征的出现 研究仅在老鼠模型上进行,尚未在人类中验证其效果 探讨皮肤老化过程中炎症信号的作用,并寻找延缓皮肤老化的方法 皮肤老化过程中的IL-17信号通路及其对皮肤炎症和功能的影响 NA 皮肤老化 单细胞RNA测序 NA RNA 老鼠皮肤样本
28 2024-12-10
Cytotoxic CD4+ tissue-resident memory T cells are associated with asthma severity
2023-Dec-08, Med (New York, N.Y.)
研究论文 研究探讨了细胞毒性CD4+组织驻留记忆T细胞与哮喘严重程度之间的关系 发现了在严重哮喘患者中,CD4+组织驻留记忆T细胞(TRM)显著增加,并且这些细胞表达与细胞毒性和炎症相关的基因 研究样本仅包括30名患者,可能不足以代表所有哮喘患者的情况 探讨不同CD4+ T细胞亚群在哮喘发病机制中的作用 从30名轻度和重度哮喘患者中提取的50,000多个气道CD4+ T细胞 NA 哮喘 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 30名轻度和重度哮喘患者
29 2024-12-09
Identification of human exTreg cells as CD16+CD56+ cytotoxic CD4+ T cells
2023-Oct, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本文通过RNA测序和单细胞RNA测序技术,鉴定了人类exTreg细胞为CD16+CD56+细胞毒性CD4+T细胞 首次鉴定了人类exTreg细胞为CD16+CD56+细胞毒性CD4+T细胞,并验证了其细胞毒性功能 研究主要基于小鼠模型和人类样本,可能存在种属差异 鉴定人类exTreg细胞的表型和功能 人类和小鼠的T细胞和exT细胞 免疫学 动脉粥样硬化 RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术 NA RNA 小鼠和人类样本
30 2024-12-09
T cell-Mediated Development of Stromal Fibroblasts with an Immune-Enhancing Chemokine Profile
2023-Jun-07, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 研究探讨了癌症相关成纤维细胞(CAF)在不同免疫微环境中的适应性变化及其对T细胞浸润的影响 首次揭示了CAF在T细胞介导下可以转变为促进免疫的表型,通过调节CXCL12和CXCL9的表达来影响T细胞的浸润 研究主要在体外和小鼠模型中进行,需要进一步的临床验证 探讨CAF在不同免疫微环境中的适应性及其对免疫反应的影响 癌症相关成纤维细胞(CAF)和T细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠胰腺腺癌中的CAF样本
31 2024-12-08
Single-cell RNA-Seq reveals intracellular microbial diversity within immune cells during SARS-CoV-2 infection and recovery
2023-Nov-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 研究利用单细胞RNA测序技术揭示了SARS-CoV-2感染和恢复期间免疫细胞内的微生物多样性 首次利用单细胞RNA测序技术探索了免疫细胞内微生物的分布及其对宿主细胞的影响 需要进一步研究以理解这些微生物在不同生理状态下的细胞特异性丰度的功能意义 揭示SARS-CoV-2感染和恢复期间免疫细胞内的微生物多样性及其对宿主细胞的影响 健康个体、SARS-CoV-2阳性患者和康复者的外周血单核细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 涉及健康个体、SARS-CoV-2阳性患者和康复者的外周血单核细胞样本
32 2024-12-08
Comprehensive single cell aging atlas of mammary tissues reveals shared epigenomic and transcriptomic signatures of aging and cancer
2023-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究了衰老如何重塑小鼠乳腺组织的转录组和表观基因组程序,揭示了衰老和癌症之间的共同表观遗传和转录特征 首次在单细胞分辨率下全面分析了小鼠乳腺组织的衰老和癌症相关特征,并发现了衰老细胞在代谢、炎症和癌症相关基因中的表观遗传和转录变化 研究主要集中在小鼠模型上,尚未完全验证这些发现是否适用于人类 探讨衰老相关的细胞和分子事件如何影响癌症的发生 小鼠乳腺组织的单细胞转录组和表观基因组 数字病理学 乳腺癌 单细胞测序 NA 转录组数据 小鼠乳腺组织样本
33 2024-12-08
Epididymal segment-specific miRNA and mRNA regulatory network at the single cell level
2023-10, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
研究论文 研究比较了不同附睾段特异性样本之间的miRNA和mRNA表达,并构建了单细胞水平的miRNA和mRNA调控网络 首次在单细胞水平上揭示了人类附睾段特异性的miRNA-mRNA调控网络及其上游转录因子和下游通路 研究仅基于小鼠样本,且样本量有限 揭示人类附睾段特异性的miRNA-mRNA调控网络及其功能 附睾不同段的miRNA和mRNA表达及其调控网络 基因表达调控 NA RNA测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、定量实时PCR(qRT-PCR) NA 基因表达数据 6只小鼠的附睾组织
34 2024-12-08
Nanoparticle stereochemistry-dependent endocytic processing improves in vivo mRNA delivery
2023-04, Nature chemistry IF:19.2Q1
研究论文 研究报告了纳米颗粒立体化学依赖的内吞处理如何提高体内mRNA递送效率 首次揭示了纳米颗粒中单一化合物的立体化学对多组分胶体(如脂质纳米颗粒LNP)在体内活性的影响 研究仅限于肝脏细胞,未探讨其他细胞类型或组织中的效果 探讨纳米颗粒立体化学对体内mRNA递送效率的影响 脂质纳米颗粒(LNP)及其所含的20α-羟基胆固醇和20β-羟基胆固醇 NA NA 单细胞RNA测序和成像技术 NA RNA序列和图像数据 涉及肝脏细胞的体内实验
35 2024-12-08
Chrna5 and lynx prototoxins identify acetylcholine super-responder subplate neurons
2023-Feb-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 研究通过复杂转基因小鼠模型探索Chrna5+神经元及其对内源性乙酰胆碱的敏感性,发现Chrna5+神经元中存在乙酰胆碱超反应者亚群,并利用单细胞转录组学揭示了其分子标记 首次发现Chrna5+神经元中的乙酰胆碱超反应者亚群,并确定了其独特的GPI锚定lynx原毒素基因表达模式 NA 探索Chrna5+神经元及其对内源性乙酰胆碱的敏感性,揭示其在注意力障碍中的潜在作用 Chrna5+神经元及其对乙酰胆碱的反应 神经科学 注意力障碍 单细胞转录组学 NA 转录组数据 复杂转基因小鼠模型
36 2024-12-07
Flow-induced reprogramming of endothelial cells in atherosclerosis
2023-11, Nature reviews. Cardiology
综述 本文讨论了动脉粥样硬化中血流诱导的内皮细胞重编程现象及其潜在的致动脉粥样硬化机制 提出了血流诱导的内皮细胞重编程(FIRE)作为潜在的致动脉粥样硬化机制 NA 探讨血流诱导的内皮细胞重编程机制及其在动脉粥样硬化中的作用 内皮细胞在动脉粥样硬化中的重编程机制 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序和染色质可及性分析 NA NA 使用小鼠模型进行研究
37 2024-12-06
Heterogeneous murine peribiliary glands orchestrate compartmentalized epithelial renewal
2023-Dec-04, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 研究了小鼠胆管外分支中的异质性腺体如何调控分隔化的上皮更新 首次揭示了胆管外分支上皮更新的细胞层次结构,并展示了不同位置的胆管细胞在维持腺体和表面上皮中的不同作用 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 探究胆管外分支上皮更新的细胞机制 小鼠胆管外分支的腺体和上皮细胞 NA NA 单细胞测序 NA 基因表达数据 小鼠模型
38 2024-12-06
Optimized single-cell RNA sequencing protocol to study early genome activation in mammalian preimplantation development
2023-Sep-15, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文介绍了一种改进的单细胞RNA测序协议,用于研究哺乳动物植入前发育中的早期基因组激活 提出了针对单细胞或有限RNA输入的基因表达研究的改进方法,包括不同的逆转录酶和cDNA扩增酶、改良的裂解缓冲液以及cDNA扩增前的额外清洁步骤 NA 研究哺乳动物植入前发育中的基因表达 单细胞RNA 基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 单个细胞或数十到数百个细胞
39 2024-12-06
CD4-/CD8- double-negative tumor-infiltrating lymphocytes expanded from solid tumor tissue suppress the proliferation of tumor cells in an MHC-independent way
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 研究从实体肿瘤组织中扩增的CD4-/CD8-双阴性肿瘤浸润淋巴细胞(DN-TILs)对肿瘤细胞增殖的抑制作用 首次详细研究了从胃癌组织中扩增的CD4-/CD8-双阴性肿瘤浸润淋巴细胞(DN-TILs)的特性和功能,发现其具有广泛的抗癌细胞毒性,且这种毒性是MHC非依赖性的 研究主要集中在体外和异种移植模型中,尚未进行临床试验 探讨从实体肿瘤中提取的CD4-/CD8-双阴性肿瘤浸润淋巴细胞(DN-TILs)的特性和功能 从胃癌组织中提取的CD4-/CD8-双阴性肿瘤浸润淋巴细胞(DN-TILs) 肿瘤学 胃癌 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 细胞 从胃癌组织中提取的DN-TILs,以及多种癌细胞系(如Panc-1、HGC-27、SKOV-3、A375)
40 2024-12-06
The HDAC inhibitor domatinostat induces type I interferon α in Merkel cell carcinoma by HES1 repression
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 研究HDAC抑制剂domatinostat通过抑制HES1表达诱导默克尔细胞癌中的I型干扰素α 首次揭示了HDAC抑制剂domatinostat通过抑制HES1表达诱导I型干扰素α,从而在默克尔细胞癌中发挥抗肿瘤作用 研究仅限于特定的默克尔细胞癌细胞系和初级成纤维细胞,可能无法完全代表所有默克尔细胞癌的情况 探讨HDAC抑制剂domatinostat在默克尔细胞癌中的抗肿瘤机制 默克尔细胞癌细胞系和初级成纤维细胞 数字病理学 皮肤癌 RT-qPCR NA RNA 包括WaGa、MKL-1和UM-MCC 34细胞系以及初级成纤维细胞
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