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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-06-07
Transcriptomic landscape reveals germline potential of porcine skin-derived multipotent dermal fibroblast progenitors
2023-Jul-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示猪皮肤来源的多能真皮成纤维细胞祖细胞具有向原始生殖细胞样细胞分化的潜能,并探讨其转录调控机制 首次通过单细胞转录组分析确认猪皮肤干细胞主要来源于多能真皮成纤维祖细胞,并揭示其在体外分化成原始生殖细胞样细胞过程中受组蛋白修饰和MAPK信号通路调控,且与人类原始生殖细胞谱系具有保守性 研究主要基于体外实验,体内分化效果和临床转化潜力尚未验证;样本为猪模型,与人类直接相关性仍需进一步确认 阐明皮肤来源干细胞分化为原始生殖细胞样细胞的细胞起源及其转录组动态变化,为不孕症治疗提供新思路 猪皮肤来源的多能真皮成纤维祖细胞及其分化的原始生殖细胞样细胞 数字病理学 不孕症 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 猪皮肤细胞样本,具体数量未在标题和摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
22 2026-06-02
Two distinct molecular faces of preeclampsia revealed by single-cell transcriptomics
2023-10-13, Med (New York, N.Y.)
研究论文 通过单细胞转录组学揭示先兆子痫的两种不同分子面孔 首次通过单细胞和单核转录组学分析,系统揭示了早发型和晚发型先兆子痫在胎盘各细胞类型中的分子差异,发现早发型先兆子痫存在广泛的基因表达失调,而晚发型则影响极小;并鉴定了胎儿来源的Hofbauer细胞和母体来源的TREM2巨噬细胞作为炎症的关键角色 未明确说明,但研究主要基于胎盘样本,可能未涵盖全身其他组织的分子变化 解析早发型和晚发型先兆子痫中胎盘不同细胞类型的功能变化,提供两种疾病的分子证据 早发型和晚发型先兆子痫患者与孕周匹配对照组的胎盘样本 数字病理学 先兆子痫 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA 转录组数据 早发型和晚发型先兆子痫及对照组的胎盘单细胞和单核样本,具体数量未明确 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3' 和单核测序,Illumina NovaSeq测序平台
23 2026-06-02
Single-cell RNA sequencing identifies response of renal lymphatic endothelial cells to acute kidney injury
2023-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞RNA测序鉴定肾脏淋巴管内皮细胞对急性肾损伤的反应 首次通过单细胞RNA测序表征小鼠肾脏淋巴管内皮细胞亚群及其在顺铂急性肾损伤中的变化,并发现以往研究未描述的肾淋巴管内皮细胞及其淋巴管血管作用 未明确说明局限性 探索肾脏淋巴管内皮细胞对急性肾损伤的反应及其在肾脏疾病进展中的潜在作用 小鼠肾脏淋巴管内皮细胞 单细胞转录组学 急性肾损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠肾脏细胞样本(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
24 2026-06-01
Plasma cells in human pancreatic ductal adenocarcinoma secrete antibodies against self-antigens
2023-11-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和免疫球蛋白测序,研究了人类胰腺导管腺癌中浆细胞分泌的自身抗体及其靶向抗原 首次鉴定了胰腺导管腺癌中浆细胞分泌的抗体靶向的三种细胞内自身抗原(F-肌动蛋白、RUVBL2和HSPD1),并发现这些自身抗体在患者血浆中显著升高 样本量较小(仅7个原发性胰腺导管腺癌样本),且自身抗体在胰腺导管腺癌发生发展中的具体作用机制尚不明确 探究胰腺导管腺癌中驱动B细胞反应的抗原,并研究浆细胞分泌的抗体反应性 人类胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞,特别是浆细胞和B细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序, 免疫球蛋白测序 NA 基因表达数据, 免疫球蛋白序列数据 7个原发性胰腺导管腺癌样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
25 2026-06-01
Spatial transcriptomics stratifies psoriatic disease severity by emergent cellular ecosystems
2023-06-08, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 利用空间转录组学分析银屑病(PsO)皮肤活检样本,揭示健康与发炎皮肤之间免疫微环境的显著差异,以及疾病严重程度分层的组织生态系统特征 首次通过空间转录组学对银屑病的组织生态系统进行系统性分类,发现轻度和重度银屑病具有不同的分子特征,且重度银屑病可能从分子水平改变远端未受累皮肤区域 样本量较小(25例活检样本),且未提及空间转录组学的分辨率限制或潜在批次效应;单细胞数据的整合可能受公共数据异质性影响 探究银屑病(一种炎症性皮肤病)的组织空间特征及其与疾病严重程度和系统性表现的关系 银屑病患者和健康对照者的皮肤活检样本(包括活动性皮损、临床未受累皮肤和健康皮肤) 空间转录组学 银屑病 空间转录组学(ST)、单细胞转录组学整合分析 NA 空间转录组数据、单细胞转录组数据 25例皮肤活检样本(包括健康、活动性皮损和临床未受累皮肤) NA 空间转录组学 NA NA
26 2026-05-31
Single-Nucleus Transcriptome Profiling of Dorsolateral Prefrontal Cortex: Mechanistic Roles for Neuronal Gene Expression, Including the 17q21.31 Locus, in PTSD Stress Response
2023-10-01, The American journal of psychiatry
研究论文 通过单核RNA测序解析创伤后应激障碍和重性抑郁障碍中背外侧前额叶皮层的细胞类型特异性转录组机制 首次在创伤后应激障碍中开展死后脑组织的单核RNA测序研究,以细胞类型分辨率揭示疾病转录组病理,并发现17q21.31位点基因在应激反应中的新作用 研究样本量相对有限(32个样本用于发现,15个用于复制),可能影响统计效力;此外,死后脑组织研究无法直接观察活体动态过程 阐明创伤后应激障碍和重性抑郁障碍背外侧前前额叶皮层的细胞类型特异性转录组病理及其在应激反应中的作用机制 背外侧前额叶皮层样本,包括创伤后应激障碍患者、重性抑郁障碍患者和对照个体 自然语言处理 创伤后应激障碍, 重性抑郁障碍 单核RNA测序 NA 基因表达数据 发现阶段:32个样本(约415K细胞核,每样本>13K细胞);复制阶段:15个样本(约160K细胞核,每样本>11K细胞) NA 单细胞RNA-seq NA NA
27 2026-05-30
Deciphering tumor ecosystems at super resolution from spatial transcriptomics with TESLA
2023-05-17, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 提出一种名为TESLA的机器学习框架,通过整合组织学信息和基因表达,在空间转录组数据中实现像素级分辨率的组织注释,揭示肿瘤微环境的超分辨率结构 首次利用机器学习方法整合组织学图像与基因表达数据,实现空间转录组像素级分辨率组织注释,能够检测三级淋巴结构等独特肿瘤微环境特征 主要验证在癌症领域的应用,虽声称可推广至其他疾病但未充分验证;依赖Visium等低分辨率平台数据的空间覆盖问题 开发高分辨率空间转录组数据分析工具,解析肿瘤微环境的细胞组成、空间分布及精细组织结构 肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞,包括其丰度、组成和空间定位 机器学习, 数字病理学 肿瘤疾病 空间转录组学 机器学习框架 图像, 基因表达数据 未说明具体样本数量 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium低分辨率空间转录组平台
28 2026-05-30
JAK-STAT activation contributes to cytotoxic T cell-mediated basal cell death in human chronic lung allograft dysfunction
2023-03-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示JAK-STAT信号激活导致细胞毒性T细胞介导的基底细胞死亡,进而参与人类慢性肺同种异体移植物功能障碍的发生机制 首次阐明JAK-STAT信号在气道上皮细胞中激活导致MHC-I上调,从而引起基底细胞被细胞毒性T细胞杀伤的细胞间相互作用机制,为CLAD治疗提供新靶点 研究基于离体组织样本,尚需在体模型验证;未明确JAK-STAT信号抑制剂的具体疗效 探究慢性肺同种异体移植物功能障碍(CLAD)中气道特异性同种免疫损伤的细胞分子机制 人类肺移植受者中CLAD患者的移植肺组织 数字病理学 慢性肺同种异体移植物功能障碍 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据 来自人类肺移植受者(具体样本量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 可能使用10x Chromium Single Cell 3'和10x Visium空间转录组试剂盒
29 2026-05-30
Human ureteric bud organoids recapitulate branching morphogenesis and differentiate into functional collecting duct cell types
2023-02, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本文描述了从人类多能干细胞高效、无血清分化成输尿管芽类器官和功能性集合管细胞的过程 首次实现从人类多能干细胞高效分化出输尿管芽类器官,展示分支形态发生并分化为功能性集合管细胞类型,通过单细胞RNA测序验证细胞纯度超过95% NA 肾脏再生医学中功能性输尿管和集合管上皮的定向分化 人类多能干细胞衍生的输尿管芽类器官和集合管细胞 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
30 2026-05-29
Targeting hnRNPC suppresses thyroid follicular epithelial cell apoptosis and necroptosis through m6A-modified ATF4 in autoimmune thyroid disease
2023-10, Pharmacological research IF:9.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组、全转录组、全长转录组和代谢组测序,揭示了hnRNPC通过m6A修饰的ATF4调控甲状腺滤泡上皮细胞凋亡和坏死性凋亡在自身免疫性甲状腺疾病中的作用 首次揭示了hnRNPC通过m6A修饰调控ATF4表达,从而影响甲状腺滤泡上皮细胞凋亡和坏死性凋亡的机制,并确定了新的治疗靶点 样本量较小(仅2名HT患者、2名GD患者和1名对照),且未对更大样本进行验证 探讨自身免疫性甲状腺疾病中甲状腺滤泡上皮细胞死亡的分子机制,寻找新的治疗靶点 甲状腺滤泡上皮细胞(ThyFoEp细胞) 数字病理学 自身免疫性甲状腺疾病(格雷夫斯病和桥本甲状腺炎) 单细胞转录组测序、全转录组测序、Oxford Nanopore全基因组测序、代谢组测序 NA 序列数据、代谢物数据 2名桥本甲状腺炎患者、2名格雷夫斯病患者和1名健康对照的甲状腺组织样本 Oxford Nanopore Technologies 单细胞RNA测序、全长转录组测序、代谢组学 Oxford Nanopore测序平台 Oxford Nanopore全长转录组测序
31 2026-05-29
Deciphering the heterogeneity and immunosuppressive function of regulatory T cells in osteosarcoma using single-cell RNA transcriptome
2023-10, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 利用单细胞RNA转录组解析骨肉瘤中调节性T细胞的异质性和免疫抑制功能 首次在单细胞水平揭示骨肉瘤微环境中调节性T细胞的异质性及其通过CXCL信号与成骨细胞、内皮细胞和髓系细胞的相互作用,并构建基于Treg特异性基因的预后模型 未提及具体局限性 探究骨肉瘤微环境中调节性T细胞的异质性和免疫抑制功能,并构建预后模型 骨肉瘤组织与癌旁组织的调节性T细胞 生物信息学 骨肉瘤 单细胞RNA测序, 基因集变异分析, 细胞通讯分析 LASSO回归, 多变量分析 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 未提供具体样本量 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
32 2026-05-29
Netrin-1 blockade inhibits tumour growth and EMT features in endometrial cancer
2023-08, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究揭示了Netrin-1在子宫内膜癌中上调,使用抗Netrin-1抗体NP137可抑制肿瘤进展和上皮间质转化,并在临床试验中展示初步疗效 首次在临床试验中验证Netrin-1单克隆抗体NP137作为单一药物治疗晚期子宫内膜癌的效果,并揭示其通过抑制上皮间质转化发挥抗肿瘤作用的新机制 临床试验样本量较小(14例),仅体现初步疗效,且未报告长期生存获益和不良反应详细信息 评估Netrin-1阻断剂NP137在子宫内膜癌中的抗肿瘤效果及其作用机制 子宫内膜癌患者和小鼠模型 机器学习 子宫内膜癌 RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、转录组数据 14例晚期子宫内膜癌患者,以及小鼠模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 10x Chromium 用于单细胞RNA测序、空间转录组学以及批量RNA测序的10x Chromium平台
33 2026-05-29
Accelerated cerebromicrovascular senescence contributes to cognitive decline in a mouse model of paclitaxel (Taxol)-induced chemobrain
2023-07, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 紫杉醇诱导的脑微血管衰老加速小鼠认知衰退,并表明通过药物消除衰老细胞可改善认知功能 首次证明紫杉醇诱导的内皮细胞衰老是化疗脑功能损伤的关键机制,并通过遗传和药物方法消除衰老细胞,验证了其因果关系 研究局限于小鼠模型,临床上对人类化疗脑的转化效果仍需进一步验证 探索紫杉醇(PTX)诱导的认知功能障碍的机制,特别是内皮细胞衰老的作用 p16-3MR转基因小鼠脑微血管内皮细胞 机器学习 心血管疾病 单细胞转录组学 NA 文本 紫杉醇治疗组与对照组各含多个小鼠,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
34 2026-05-29
scDisInFact: disentangled learning for integration and prediction of multi-batch multi-condition single-cell RNA-sequencing data
2023-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出scDisInFact,一种解耦学习方法,用于多批次多条件单细胞RNA测序数据的整合与预测 首次同时建模批次效应和条件效应,实现批次效应去除、条件相关关键基因检测和扰动预测三项任务的联合执行 仅在模拟和真实数据集上验证,未提及对复杂临床场景的泛化能力或计算资源需求 开发能够解耦批次效应和条件效应的深度学习框架,以提升多批次多条件scRNA-seq数据的整合与预测准确性 多批次多条件单细胞RNA测序数据,包括模拟数据和真实数据集 机器学习 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 深度学习 (解耦学习框架) 基因表达数据 (单细胞转录组) 模拟数据集和真实数据集(具体规模未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA NA
35 2026-05-28
Engrailed transcription factors direct excitatory cerebellar neuron diversity and survival
2023-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和空间表达分析,揭示了EN1/2转录因子在兴奋性小脑神经元多样性和存活中的保守作用 首次定义胚胎期小脑核内侧兴奋性神经元的分子亚域,并揭示EN1/2在三种小脑兴奋性神经元类型中调控TBR2表达、神经元分化和存活的保守功能 NA 阐明EN1/2转录因子在小脑兴奋性神经元多样性和存活中的功能机制 小鼠胚胎期小脑核兴奋性神经元 分子神经生物学 NA 单细胞RNA测序, 空间表达分析 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
36 2026-05-28
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2023-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 结合全基因组比对、生物信息学和计算结构建模,系统性研究了果蝇属新基因的起源、演化及蛋白质结构特征 首次系统揭示果蝇谱系特异性新基因的蛋白质结构起源与演化规律,发现大多数潜在折叠良好的蛋白质在诞生时即已折叠,并观察到少数无序蛋白在短时间内转变为有序结构 基于计算预测的蛋白质结构缺乏实验验证,且研究局限于果蝇属,结论的普适性有待验证 解析新基因在果蝇属中的起源机制、演化过程及蛋白质结构变化规律 果蝇属(Drosophila)中555个谱系特异性新基因候选者 机器学习和生物信息学交叉 NA 全基因组比对、生物信息学分析、Alphafold2、ESMFold、分子动力学模拟、祖先序列重构、单细胞RNA-seq Alphafold2, ESMFold 基因组序列、蛋白质结构预测数据、单细胞转录组数据 果蝇属555个新基因候选者,以及睾丸单细胞RNA-seq数据 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 用于果蝇睾丸组织的单细胞RNA-seq分析
37 2026-05-28
RNA polymerase II pausing is essential during spermatogenesis for appropriate gene expression and completion of meiosis
2023-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用稳态、新生和单细胞RNA测序策略全面分析雄性生殖细胞群体的基因表达,揭示RNA聚合酶II暂停在精子发生过程中对基因表达调控和减数分裂完成的关键作用 首次发现RNA聚合酶II暂停在精子分化的早期阶段对建立基因活性图谱至关重要,并揭示了Pol II暂停在减数分裂过程中对SPO11介导的双链断裂形成的新调控作用 未在摘要中明确说明研究局限性 阐明RNA聚合酶II暂停在雄性生殖细胞分化和减数分裂中的调控机制 雄性生殖细胞(包括未成熟和成熟精子细胞) 机器学习 不育症 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 新生RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
38 2026-05-28
Astroglial toxicity promotes synaptic degeneration in the thalamocortical circuit in frontotemporal dementia with GRN mutations
2023-03-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 通过比较单细胞转录组学揭示星形胶质细胞毒性在GRN突变导致的额颞叶痴呆丘脑皮质回路突触变性中的关键作用 首次发现并验证GRN突变引起的星形胶质细胞病理特征(GJA1、AQP4、APOE上调及SLC1A2下调)是跨物种突触变性的保守机制 未明确星形胶质细胞毒性与TDP-43蛋白病之间的上下游因果关系 阐明GRN突变导致额颞叶痴呆的丘脑皮质回路神经退行性机制 Grn-/-小鼠及FTLD-GRN患者的丘脑和额叶皮层 数字病理学 额颞叶痴呆 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 Grn-/-小鼠及FTLD-GRN患者样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
39 2026-05-27
First-in-human clinical trial of personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma
2023-Sep-21, Research square
研究论文 首次人体临床试验评估个性化新抗原疫苗作为无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者的早期干预措施 首次在无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者中进行DNA个体型新抗原疫苗的人体临床试验,通过单细胞转录组分析揭示疫苗诱导肿瘤免疫微环境的双相抗肿瘤反应,发现B细胞与浆细胞亚群的不同响应机制 样本量较小(仅9例患者),主要观察到疾病稳定而非显著缓解,且肿瘤浆细胞亚群对疫苗存在内在及获得性耐药,未来需联合靶向浆细胞亚群或阻断IGF-1信号及髓系检查点的策略 评估个性化新抗原疫苗治疗无症状淋巴浆细胞淋巴瘤的安全性和有效性,并探索其免疫机制 9例无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者 数字病理学 淋巴浆细胞淋巴瘤 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 9例患者的骨髓样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒(用于单细胞转录组分析)
40 2026-05-27
Single-cell transcriptome profiles of Drosophila fruitless-expressing neurons from both sexes
2023-02-01, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术,对果蝇中表达fruitless基因的神经元进行了转录组图谱分析,揭示了性别间的差异和共性 首次构建了果蝇雄性化和雌性化fruitless表达神经元的单细胞转录组图谱,并鉴定出113个细胞簇,发现性别差异在神经元数量和基因表达中普遍存在 未明确说明局限性,可能包括样本数量和实验条件下的潜在偏差 研究果蝇fruitless表达神经元的单细胞转录组特征,探索性别差异的分子基础 果蝇的fruitless表达神经元 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
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