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当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-12-04 |
Population-level integration of single-cell datasets enables multi-scale analysis across samples
2023-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02035-2
PMID:37813989
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研究论文 | 本文介绍了scPoli，一种用于整合单细胞数据集以支持跨样本多尺度分析的开源学习方法 | 提出了一种开放世界学习框架，能够整合异构队列数据，学习样本和细胞的表示，适用于数据整合、标签转移和参考映射 | 未明确说明方法在处理极大规模数据集时的计算效率或特定技术限制 | 开发一种工具以整合人群水平的单细胞图谱数据，实现样本与细胞数据的关联分析 | 肺和外周血单核细胞的单细胞图谱数据，包括约780万个细胞和2375个样本 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 生成模型 | 单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据 | 约780万个细胞，来自2375个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-12-04 |
Spatial transcriptomics reveals the distinct organization of mouse prefrontal cortex and neuronal subtypes regulating chronic pain
2023-11, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01455-9
PMID:37845544
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了小鼠前额叶皮层在细胞类型组成和基因表达模式上的独特性，并识别了调节慢性疼痛的特定神经元亚型和环路 | 首次通过空间分辨单细胞转录组分析，系统描绘了成年小鼠前额叶皮层的细胞与环路组织，并发现了其与邻近皮层区域的差异，以及神经元亚型在慢性疼痛中的特异性作用 | 研究仅基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；空间转录组学技术可能受分辨率限制，影响细胞亚型精细识别 | 解码前额叶皮层在认知、情感、执行功能和疼痛处理等多样功能中的细胞与环路组织机制 | 成年小鼠的前额叶皮层组织 | 空间转录组学 | 慢性疼痛 | 空间分辨单细胞转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | 未明确指定样本数量，基于成年小鼠前额叶皮层组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 23 | 2025-12-04 |
DNA-binding protein PfAP2-P regulates parasite pathogenesis during malaria parasite blood stages
2023-11, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01497-6
PMID:37884813
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了恶性疟原虫中一个关键的AP2转录因子PfAP2-P，揭示了其在疟原虫血液阶段发育、致病性和有性阶段转换中的调控作用 | 首次系统性地揭示了PfAP2-P作为上游转录调控因子，在疟原虫血液阶段发育周期中两个不同时间点的表达高峰及其对多种致病相关基因的调控机制 | 研究主要基于体外实验和测序数据，体内功能验证和具体调控通路的分子机制仍需进一步探索 | 探究疟原虫血液阶段发育中转录因子对致病性的调控机制 | 恶性疟原虫（Plasmodium falciparum）及其AP2转录因子PfAP2-P | 分子生物学与寄生虫学 | 疟疾 | 染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、荧光激活细胞分选（FACS） | NA | 基因组测序数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-12-04 |
A new Bayesian factor analysis method improves detection of genes and biological processes affected by perturbations in single-cell CRISPR screening
2023-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02017-4
PMID:37770710
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研究论文 | 本文提出了一种名为引导稀疏因子分析（GSFA）的新统计方法，用于分析单细胞CRISPR筛选数据，以提高检测受遗传扰动影响的基因和生物过程的效率 | GSFA通过推断代表共调控基因或基因模块的潜在因子，并借用这些因子的信息来推断遗传扰动对单个基因的影响，从而在检测扰动效应方面比现有方法具有更高的统计功效 | NA | 开发一种统计方法以更有效地分析单细胞CRISPR筛选数据，检测受遗传扰动影响的基因和生物过程 | 单细胞CRISPR筛选数据，具体来自人类CD8 T细胞和神经祖细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR筛选 | 贝叶斯因子分析，引导稀疏因子分析（GSFA） | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-12-04 |
The cellular states and fates of shed intestinal cells
2023-11, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-023-00905-9
PMID:37857731
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研究论文 | 本研究通过批量及单细胞RNA测序分析雄性小鼠肠道粪便洗涤物，揭示了脱落肠上皮细胞在肠道腔内的存活状态及功能 | 首次证明脱落肠上皮细胞在肠道腔内保持活性，并上调独特的抗菌程序，同时识别了免疫细胞的脱落现象及其在结肠炎中的增加 | 技术限制先前阻碍了对脱落肠细胞状态和命运的研究，本研究可能受限于小鼠模型和粪便样本的复杂性 | 探究脱落肠细胞的细胞状态、命运及其在肠道腔内的潜在功能 | 雄性小鼠的肠道粪便洗涤物中的脱落肠上皮细胞和免疫细胞 | 单细胞组学 | 结肠炎 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 雄性小鼠肠道粪便洗涤物样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-12-04 |
Learning single-cell perturbation responses using neural optimal transport
2023-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01969-x
PMID:37770709
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研究论文 | 本文提出CellOT框架，利用最优传输理论和输入凸神经网络架构，从非配对分布中学习单个细胞对扰动的响应 | 结合最优传输理论与输入凸神经网络，首次实现从非配对单细胞数据中学习异质性扰动响应 | 方法依赖于单细胞测量需破坏细胞的限制，仅能处理非配对分布数据 | 预测单细胞在化学、遗传或机械扰动下的分子响应 | 单个细胞 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, 多重蛋白质成像技术 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质成像数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2025-12-04 |
Single-cell dissection of cellular and molecular features underlying mesenchymal stem cell therapy in ischemic acute kidney injury
2023-10-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2023.07.024
PMID:37533253
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了间充质干细胞在缺血性急性肾损伤治疗中的细胞和分子机制 | 首次使用无偏单细胞RNA测序解析MSC治疗AKI的详细修复机制，并发现MSC来源的miR-26a-5p通过抑制Zeb2表达来抑制促纤维化TECs和免疫细胞招募 | 研究基于IRI模型，可能无法完全反映所有类型AKI的机制；单细胞测序数据为观察性，需进一步功能验证 | 探究间充质干细胞治疗缺血性急性肾损伤的细胞和分子机制 | 缺血再灌注损伤（IRI）模型小鼠的肾脏组织细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | IRI模型小鼠（有/无MSC治疗）的肾脏单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-12-04 |
A subpopulation of lipogenic brown adipocytes drives thermogenic memory
2023-10, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-023-00893-w
PMID:37783943
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研究论文 | 本文探讨了短暂冷暴露如何通过脂源性棕色脂肪细胞亚群驱动“产热记忆”，从而改善二次冷暴露的产热反应 | 揭示了脂源性棕色脂肪细胞亚群在产热记忆中的关键作用，并发现酰基肉碱的补充足以模拟改善的二次冷反应 | 未明确说明研究的局限性，如样本量或实验模型的潜在限制 | 研究短暂环境刺激下棕色脂肪组织的长期适应机制，以探索对抗肥胖的潜在治疗策略 | 棕色脂肪组织及其脂源性亚群 | 单细胞组学 | 肥胖 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 29 | 2025-12-04 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Difference of Aortic Atherosclerosis Response to Phytosterols and Oxidation Products of Sterols
2023-06, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.202200811
PMID:36877953
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了植物甾醇及其氧化产物对主动脉粥样硬化细胞异质性的不同影响 | 首次在单细胞水平上比较了植物甾醇、胆固醇氧化产物和植物甾醇氧化产物对主动脉细胞组成的差异影响，并鉴定了四个功能不同的成纤维细胞亚群 | 研究基于ApoE-/-小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；样本量未明确说明 | 探究饮食中植物甾醇及其氧化产物在动脉粥样硬化发展中对主动脉细胞的影响机制 | ApoE-/-小鼠的主动脉细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-12-04 |
PfAP2-MRP DNA-binding protein is a master regulator of parasite pathogenesis during malaria parasite blood stages
2023-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.23.541898
PMID:37293082
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研究论文 | 本文鉴定并表征了疟原虫血液阶段的关键转录因子PfAP2-MRP，揭示了其在调控寄生虫生长、抗原变异和染色质结构中的核心作用 | 首次将PfAP2-MRP鉴定为疟原虫致病性的主调控因子，并阐明其在两个不同发育阶段（滋养体和裂殖体）的转录调控机制，包括通过ChIP-seq、单细胞RNA-seq和Hi-C技术揭示其对基因表达和染色质构象的多层次控制 | 研究主要基于体外实验和特定时间点的分析，可能未完全反映体内复杂环境下的调控网络；基因敲除模型的长期效应和临床相关性有待进一步验证 | 探究疟原虫在红细胞内发育周期中致病性的分子调控机制，特别是转录因子在寄生虫生长、宿主细胞重塑和免疫逃避中的作用 | 恶性疟原虫（Plasmodium falciparum）的血液阶段寄生虫，重点关注其转录因子PfAP2-MRP及相关基因家族 | 分子生物学与寄生虫学 | 疟疾 | ChIP-seq、单细胞RNA-seq、荧光激活细胞分选、染色体构象捕获（Hi-C）、诱导性基因敲除 | NA | 基因组DNA、RNA、染色质互作数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学（未明确指定平台） | NA | NA |
| 31 | 2025-12-03 |
Global and cell type-specific immunological hallmarks of severe dengue progression identified via a systems immunology approach
2023-12, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01654-3
PMID:37872316
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和靶向蛋白质组学技术，揭示了严重登革热进展的全球和细胞类型特异性免疫学特征 | 首次在自然感染中证明B细胞携带复制性登革病毒，并系统性地识别了严重登革热进展中的免疫细胞迁移、炎症反应及抗原呈递细胞功能受损等关键特征 | 研究主要聚焦于儿童血液样本，可能无法完全代表成人或其他组织中的登革热病理机制 | 定义登革病毒靶细胞并识别严重登革热进展的免疫学标志 | 儿童血液中的免疫细胞和登革病毒 | 系统免疫学 | 登革热 | 病毒包容性单细胞RNA测序（viscRNA-Seq 2）、靶向蛋白质组学、分泌组分析、功能实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质组学数据、分泌组数据 | 儿童血液样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-12-02 |
A discrete 'early-responder' stromal-cell subtype orchestrates immunocyte recruitment to injured tissue
2023-12, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01669-w
PMID:37932455
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研究论文 | 本研究通过时间分辨单细胞RNA测序，鉴定出一种在急性损伤后早期响应的间充质基质细胞亚型，该亚型通过表达免疫调节因子（如Cxcl5）协调免疫细胞（如中性粒细胞和巨噬细胞）的招募，从而影响组织再生和炎症进程 | 首次在肌肉间充质基质细胞中识别出一种“早期响应者”亚型，该亚型在损伤后第一天迅速激活，表达独特的免疫调节转录本，并证明其通过Cxcl5等因子在协调免疫细胞招募和组织再生中发挥关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证有限；且未详细探讨该亚型在其他疾病或组织中的具体功能机制 | 探究急性损伤后间充质基质细胞亚型在免疫细胞招募和组织再生中的作用机制 | 小鼠肌肉间充质基质细胞（MmSCs）及其在急性损伤和肌肉萎缩模型中的响应 | 单细胞组学 | 肌肉损伤和肌肉萎缩 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2025-12-02 |
Identification of human exTreg cells as CD16+CD56+ cytotoxic CD4+ T cells
2023-10, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01589-9
PMID:37563308
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研究论文 | 本文通过小鼠模型和人类单细胞RNA测序数据，识别并验证了人类exTreg细胞为CD16+CD56+细胞毒性CD4+ T细胞 | 首次将人类exTreg细胞定义为CD16+CD56+细胞毒性CD4+ T细胞，并利用跨物种转录组分析和功能实验验证其细胞毒性 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本的验证可能有限，且疾病背景聚焦于动脉粥样硬化 | 识别和表征在动脉粥样硬化中从调节性T细胞转化而来的exTreg细胞的分子特征和功能 | 小鼠和人类的T细胞、exTreg细胞，以及自然杀伤细胞 | 免疫学 | 动脉粥样硬化 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, CITE-seq, 流式细胞术, T细胞受体测序, 细胞杀伤和CD107a脱颗粒实验 | NA | RNA测序数据, 流式细胞数据, 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-12-02 |
Multimodal single-cell datasets characterize antigen-specific CD8+ T cells across SARS-CoV-2 vaccination and infection
2023-10, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01608-9
PMID:37735591
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研究论文 | 本文使用多模态单细胞测序技术，对SARS-CoV-2疫苗接种和感染后的抗原特异性CD8+ T细胞进行了纵向分析 | 首次结合转录组、可及染色质景观和免疫表型，定义了疫苗诱导的CD8 T细胞亚群，并发现其与COVID-19患者临床结局相关 | 研究主要基于mRNA疫苗BNT162b2，可能不适用于其他疫苗类型；样本量有限，需进一步扩大验证 | 改善对T细胞反应的表征和量化，以补充基于抗体滴度的群体监测 | 人类循环白细胞，特别是CD8+ T细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 多模态测序技术，包括scRNA-seq | NA | 单细胞多模态数据（转录组、染色质可及性、免疫表型） | 纵向收集的疫苗接种前后人类白细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析 | NA | NA |
| 35 | 2025-12-02 |
Antigen-driven colonic inflammation is associated with development of dysplasia in primary sclerosing cholangitis
2023-06, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02372-x
PMID:37322120
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研究论文 | 本研究通过分析原发性硬化性胆管炎（PSC）患者的结肠组织，发现了一种独特的适应性炎症转录特征，该特征与PSC患者发生异型增生的更高风险和更短时间相关 | 首次结合流式细胞术、批量与单细胞转录组学以及T和B细胞受体库分析，识别出PSC中与异型增生风险相关的特异性抗原驱动的炎症特征，揭示了PSC与IBD在异型增生机制上的差异 | 样本量相对有限（共221名参与者），且研究主要关注右结肠组织，可能未全面反映整个结肠的炎症状态 | 探究PSC患者结肠炎症与异型增生发展的关联机制，以指导结直肠癌预防 | 65名PSC患者、108名IBD患者和48名健康个体的右结肠组织 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 流式细胞术、批量转录组学、单细胞转录组学、T和B细胞受体库分析 | NA | 转录组数据、细胞表型数据 | 221名参与者（65名PSC患者、108名IBD患者、48名健康个体） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-12-02 |
The tumor immune microenvironment of nasopharyngeal carcinoma after gemcitabine plus cisplatin treatment
2023-06, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02369-6
PMID:37280275
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，揭示了吉西他滨联合顺铂（GP）化疗后鼻咽癌肿瘤免疫微环境的变化，并发现了一种以先天样B细胞（ILB）为中心的抗肿瘤免疫反应机制 | 首次在单细胞分辨率下描绘了GP化疗后鼻咽癌的免疫微环境图谱，并发现了化疗诱导的DNA片段通过STING通路和TLR9信号激活先天样B细胞（ILB）的新型抗肿瘤免疫机制 | 样本量相对有限（15对匹配样本），且为观察性研究，需要进一步的功能性实验验证机制 | 阐明GP化疗在鼻咽癌中发挥临床活性的免疫学机制 | 鼻咽癌患者 | 单细胞组学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序，T细胞和B细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据，免疫受体序列数据 | 15对匹配的初治与GP化疗后鼻咽癌样本（单细胞测序），一项III期试验中的139名患者（生存分析），以及380名接受GP联合免疫治疗的患者（验证队列） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2025-12-02 |
Multimodal characterization of antigen-specific CD8 + T cells across SARS-CoV-2 vaccination and infection
2023-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.24.525203
PMID:36747786
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研究论文 | 本文利用多模态测序技术对BNT162b2疫苗接种前后的循环白细胞进行纵向分析，揭示了抗原特异性CD8+ T细胞的亚群特征及其与临床预后的关联 | 首次结合转录组、染色质可及性、免疫表型和T细胞受体测序等多模态数据，系统表征了疫苗诱导的SARS-CoV-2抗原特异性CD8+ T细胞，并发现其频率可预测COVID-19临床结局 | 研究主要基于疫苗接种后的时间点分析，对感染后长期动态的覆盖有限；样本量相对较小，且未涵盖不同人群的异质性 | 深入表征SARS-CoV-2感染或疫苗接种后T细胞免疫应答，特别是抗原特异性CD8+ T细胞的特征 | 人类循环白细胞，特别是CD8+ T细胞亚群 | 免疫学 | COVID-19 | 多模态测序技术，包括scRNA-seq、ATAC-seq、T细胞受体测序和DNA寡核苷酸标记的肽-MHC多聚体技术 | NA | 单细胞多组学数据 | 疫苗接种前后采集的纵向人类白细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 38 | 2025-11-29 |
Combinatorial Immunotherapy with Agonistic CD40 Activates Dendritic Cells to Express IL12 and Overcomes PD-1 Resistance
2023-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0699
PMID:37478171
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研究论文 | 本研究通过组合免疫疗法激活CD40使树突状细胞表达IL12，从而克服PD-1耐药性 | 发现CCL22+CCL5+ IL12分泌型树突状细胞亚群是三联疗法的关键早期效应因子，并证明新型IL12 mRNA疗法单独使用即可克服PD-1耐药 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者数据仅限于系统性细胞因子谱比较 | 探索克服抗PD-1耐药性的免疫治疗策略 | 小鼠黑色素瘤模型和人类患者样本 | 免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，单细胞细胞因子分泌分析，微孔检测 | 小鼠黑色素瘤模型 | 单细胞RNA测序数据，细胞因子分泌数据 | 多数小鼠显示完全肿瘤消退 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞细胞因子分泌分析 | NA | 新型微孔检测法 |
| 39 | 2025-11-29 |
Low TCR Binding Strength Results in Increased Progenitor-like CD8+ Tumor-Infiltrating Lymphocytes
2023-05-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0761
PMID:36787375
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研究论文 | 本研究探讨TCR结合强度对肿瘤微环境中CD8+肿瘤浸润淋巴细胞功能分化的影响 | 首次在內源性多克隆T细胞反应中揭示TCR结合强度与祖细胞样表型分化的关联 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证尚不充分 | 阐明TCR结合强度如何影响T细胞在肿瘤微环境中的功能分化 | 肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）和TCR转基因小鼠模型 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，MHC四聚体标记 | NA | 转录组数据，蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-11-27 |
Genetic and immune determinants of E. coli liver abscess formation
2023-Dec-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2310053120
PMID:38096412
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了E. coli肝脓肿形成的宿主遗传和免疫决定因素 | 首次发现肝脓肿易感性是多基因性状并以性别依赖方式遗传，且与早期炎症反应强度相关 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需验证 | 探究E. coli肝脓肿形成的宿主遗传和免疫机制 | 小鼠肝脏组织和免疫细胞 | 空间生物学 | 肝脓肿 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠品系（包括C57BL/6N等） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |