单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 3961 - 3980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3961 | 2024-08-05 |
Predicting cellular responses to complex perturbations in high-throughput screens
2023-06-12, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202211517
PMID:37154091
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研究论文 | 本文提出了一种新的计算方法，名为成分扰动自编码器（CPA），用于预测细胞对复杂扰动的反应 | CPA结合了线性模型的可解释性和深度学习方法的灵活性，能够高效预测未见剂量、细胞类型、时间点和物种的转录扰动反应 | 本研究依赖于未见药物的预测，可能对某些药物组合的通用性不足 | 研究旨在开发计算方法以预测和解释细胞对药物和遗传扰动的反应 | 研究对象为单细胞的转录扰动反应 | 计算机视觉 | NA | 高通量筛选 | 自编码器 | 单细胞转录组数据 | 生成了新单细胞药物组合数据，补全了5,329个缺失组合 |
| 3962 | 2024-08-08 |
Microglia modulate general anesthesia through P2Y12 receptor
2023-06-05, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2023.04.047
PMID:37167975
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研究论文 | 本文揭示了小胶质细胞通过P2Y12受体调节全身麻醉的机制 | 首次证明了小胶质细胞通过P2YR介导的信号传导积极参与全身麻醉的多个过程，扩展了小胶质细胞在脑中的非免疫角色 | NA | 探讨小胶质细胞在全身麻醉中的作用及其机制 | 小胶质细胞及其在全身麻醉中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 |
| 3963 | 2024-08-05 |
Cuproptosis-related gene CDKN2A as a molecular target for IPF diagnosis and therapeutics
2023-Jun, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-023-01739-7
PMID:37166466
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研究论文 | 本研究探讨了CDKN2A作为特发性肺纤维化（IPF）诊断和治疗的分子靶点 | 首次提出CDKN2A基因在IPF发展中的重要作用，并揭示其与M2巨噬细胞和cuproptosis的关系 | 研究的样本量及范围尚未明确，可能影响结果的普遍性 | 探讨cuproptosis相关基因在IPF中的预后和治疗潜力 | 特发性肺纤维化患者的肺组织样本及相关细胞模型 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA序列分析 | NA | 基因表达数据 | IPF患者肺组织样本及小鼠实验样本 |
| 3964 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics in human skin research
2023-06, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14827
PMID:37150587
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评论 | 本研究总结了空间转录组学在皮肤研究中的应用和方法 | 介绍了空间转录组学技术在皮肤组织中的创新应用 | 缺乏对不同皮肤疾病的具体实验数据支持 | 旨在促进对皮肤功能和病理的理解 | 不同皮肤疾病的基因表达和细胞定位 | 数字病理学 | 皮肤病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达 | NA |
| 3965 | 2024-08-05 |
Matrix metalloproteinases in arthritis: towards precision medicine
2023-06, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-023-00966-w
PMID:37161083
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研究论文 | 本文探讨了基质金属蛋白酶在关节炎中的作用，旨在推动精准医学的发展 | 该研究突出强调了MMP在关节修整中的双重作用，及其在自身免疫过程中产生持久表位的机制 | 未提及具体的样本数据和临床试验结果 | 研究MMP在关节退化和自身免疫过程中在不同疾病阶段的作用与调节 | 关节相关疾病患者的ECM降解和MMP的作用 | 数字病理学 | 关节炎 | 蛋白质组学和单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 3966 | 2024-08-08 |
A comprehensive analysis of single-cell RNA transcriptome reveals unique SPP1+ chondrocytes in human osteoarthritis
2023-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106926
PMID:37141654
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人骨关节炎中的SPP1+软骨细胞，揭示了其在骨关节炎中的独特作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了包含正常和骨关节炎软骨的大量细胞，发现了高表达SPP1的独特软骨细胞群 | 研究主要集中在骨关节炎软骨细胞的发生和发展，缺乏对正常软骨细胞发育的分析 | 旨在更好地理解骨关节炎的机制，特别是SPP1在骨关节炎中的作用 | 人骨关节炎中的软骨细胞和SPP1表达 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 包含正常和骨关节炎软骨的大量细胞 |
| 3967 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of mouse lower respiratory tract epithelial cells: A meta-analysis
2023-06, Cells & development
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.cdev.2023.203847
PMID:37146757
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研究论文 | 本文通过元分析七项不同的研究，建立了小鼠下呼吸道上皮细胞的单细胞转录组图谱 | 本文首次系统地注释了小鼠肺部所有上皮细胞类型，并提供了每种上皮细胞类型的最佳标记物 | NA | 深入理解呼吸系统中不同部位的细胞组成和功能，以及其在各种疾病中的病理过程 | 小鼠下呼吸道上皮细胞 | 数字病理学 | 慢性呼吸疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 七项不同研究中的小鼠肺和气管样本 |
| 3968 | 2024-08-08 |
ScRNA-Seq Reveals a Distinct Osteogenic Progenitor of Alveolar Bone
2023-06, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231159821
PMID:37148259
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了小鼠牙槽骨细胞的单细胞图谱，揭示了牙槽骨中一种新的骨生成前体细胞群体Fat4细胞 | 发现了牙槽骨中一种新的细胞群体Fat4细胞，并证明了其在牙槽骨骨生成分化轨迹中的独特作用 | NA | 揭示牙槽骨中骨髓间充质干细胞的异质性及其骨生成分化轨迹 | 小鼠牙槽骨细胞及其骨生成前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠牙槽骨细胞 |
| 3969 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas reveals a distinct immune profile fostered by T cell-B cell crosstalk in triple negative breast cancer
2023-06, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12429
PMID:37158690
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了三阴性乳腺癌中由T细胞-B细胞相互作用促进的独特免疫特征 | 本研究首次揭示了三阴性乳腺癌中T细胞-B细胞相互作用对免疫微环境的独特影响，并建立了一个预测三阴性乳腺癌患者预后的标志物 | NA | 描绘和比较三阴性乳腺癌、HER2阳性乳腺癌和腔内乳腺癌的免疫景观 | 三阴性乳腺癌、HER2阳性乳腺癌和腔内乳腺癌的免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 117,958个免疫细胞 |
| 3970 | 2024-08-08 |
Tenofovir alters the immune microenvironment of pregnant women with hepatitis B virus infection: Evidence from single-cell RNA sequencing
2023-Jun, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110245
PMID:37163920
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了替诺福韦治疗对妊娠期乙型肝炎病毒感染妇女免疫微环境的影响 | 首次揭示了替诺福韦治疗后妊娠期乙型肝炎病毒感染妇女外周血单个核细胞的细胞亚型和分子特征的变化 | 研究样本量较小，仅包括三名妊娠期乙型肝炎病毒感染妇女 | 探讨替诺福韦治疗对妊娠期乙型肝炎病毒感染妇女免疫功能的影响 | 妊娠期乙型肝炎病毒感染妇女的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | t-分布随机邻域嵌入 | 细胞 | 6个样本，共68,200个外周血单个核细胞 |
| 3971 | 2024-08-08 |
EGFR marks a subpopulation of dermal mesenchymal cells highly expressing IGF1 which enhances hair follicle regeneration
2023-06, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17766
PMID:37165726
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研究论文 | 本研究旨在识别通过旁分泌机制增强毛囊再生的新型真皮间充质细胞亚群 | 发现表皮生长因子受体（EGFR）标记的真皮间充质细胞亚群，这些细胞高表达胰岛素样生长因子1（IGF1），有助于毛囊新生 | NA | 识别新型真皮间充质细胞亚群，探讨其在毛囊再生中的作用 | 真皮间充质细胞及其在毛囊再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光染色、流式细胞术（FACS） | NA | RNA | 新生和成年小鼠的真皮细胞 |
| 3972 | 2024-08-05 |
Competition between skin antimicrobial peptides and commensal bacteria in type 2 inflammation enables survival of S. aureus
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112494
PMID:37167061
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研究论文 | 该文章探讨了在类型2炎症下皮肤抗菌肽与共生细菌之间的竞争，如何影响金黄色葡萄球菌的生存。 | 揭示了IL-4Rα激活导致抗菌肽生成减少，从而选择性抑制抗生素生产的共生细菌株生存的机制。 | 没有提供不同类型的炎症对抗菌肽和细菌相互作用行为的全面比较。 | 研究皮肤抗菌肽和共生细菌在类型2炎症条件下与金黄色葡萄球菌生存之间的相互作用。 | 主要对象为Il4ra小鼠及其皮肤微生物组。 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞测序 | NA | 微生物组数据 | Il4ra小鼠的单细胞样本及相关微生物组分析 |
| 3973 | 2024-08-08 |
Glial progenitor heterogeneity and key regulators revealed by single-cell RNA sequencing provide insight to regeneration in spinal cord injury
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112486
PMID:37149868
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了脊髓损伤后星形胶质细胞系的异质性及其在再生中的作用 | 首次揭示了脊髓损伤后成年脊髓中星形胶质细胞系细胞的多样性及其调控机制 | NA | 探究脊髓损伤后星形胶质细胞系细胞的异质性及其对再生的贡献 | 脊髓损伤后的星形胶质细胞系细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成年脊髓损伤模型中的GFAP表达细胞 |
| 3974 | 2024-08-08 |
A single-cell view on host immune transcriptional response to in vivo BCG-induced trained immunity
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112487
PMID:37155329
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了BCG疫苗诱导的训练免疫（TI）在人体内的免疫转录反应异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了BCG诱导的训练免疫中巨噬细胞和CD8 T细胞的异源转录反应，并发现了STAT1作为关键转录因子在所有巨噬细胞亚群中的作用 | NA | 研究BCG疫苗诱导的训练免疫在人体内的免疫转录反应异质性 | 巨噬细胞和CD8 T细胞的转录反应 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 156个样本 |
| 3975 | 2024-08-08 |
Dynamic cellular changes in acute kidney injury caused by different ischemia time
2023-May-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106646
PMID:37168554
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了不同缺血时间下急性肾损伤的动态细胞变化过程 | 发现了Slc5a2近端小管细胞对急性肾损伤的敏感性，并揭示了中性氨基酸转运蛋白基因表达随时间的变化，以及血浆异亮氨酸水平在急性肾损伤中的下降 | NA | 解析缺血再灌注损伤导致的急性肾损伤的动态过程 | 急性肾损伤的细胞变化及代谢物变化 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 临床相关的缺血再灌注损伤小鼠模型 |
| 3976 | 2024-08-05 |
Digital microfluidics-based digital counting of single-cell copy number variation (dd-scCNV Seq)
2023-05-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221934120
PMID:37155890
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研究论文 | 本研究报告了一种基于数字微流控技术的单细胞拷贝数变异数字计数的新方法。 | 提出的dd-scCNV Seq方法通过直接切割单细胞DNA并利用这些片段进行扩增，解决了现有单细胞全基因组扩增方法的偏差问题，提升了拷贝数变异计数的准确性。 | 研究中未对dd-scCNV Seq的广泛适用性和长期保存性进行评估。 | 旨在开发一种准确的单细胞拷贝数变异分析技术，以推动生物发现。 | 主要研究对象为单细胞DNA的拷贝数变异。 | 数字病理学 | NA | 数字微流控 | NA | DNA片段 | NA |
| 3977 | 2024-08-05 |
The combination therapy of isomucronulatol 7-O-beta-glucoside (IMG) and CEP-9722 targeting ferroptosis-related biomarkers in non-small cell lung cancer (NSCLC)
2023-May-11, BMC pulmonary medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1186/s12890-023-02445-0
PMID:37165402
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研究论文 | 本文研究了非小细胞肺癌(NSCLC)中与铁死亡相关的生物标志物的组合治疗 | 建立了一个以铁死亡为基础的预后模型，并通过单细胞测序揭示了基因表达与肿瘤的关系 | 研究的样本和数据主要来源于公共数据库，可能存在数据偏差 | 旨在为NSCLC患者建立潜在的预测模型并提供可用的靶向药物 | 非小细胞肺癌患者的基因表达档案及其细胞群体和状态 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 涉及GSE31210训练集和TCGA测试集的多名患者 |
| 3978 | 2024-08-05 |
Protocol for using single-cell sequencing to study the heterogeneity of NF1 nerve sheath tumors from clinical biospecimens
2023-May-10, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102297
PMID:37167059
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研究论文 | 本文介绍了一种使用单细胞测序技术研究神经纤维瘤1型相关神经鞘瘤异质性的协议 | 提供了一种针对临床生物样本获取单细胞悬浮液并进行转录组分析的新方法 | 该协议主要针对NF1神经鞘瘤，适用性可能有限 | 研究NF1神经鞘瘤的异质性 | 来自神经纤维瘤1型的神经鞘瘤临床样本 | 数字病理学 | 神经纤维瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 临床生物样本 |
| 3979 | 2024-08-05 |
Spatially resolved multi-omics highlights cell-specific metabolic remodeling and interactions in gastric cancer
2023-05-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38360-5
PMID:37164975
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研究论文 | 本文通过整合多种组学手段，揭示了胃癌中细胞特异性的代谢重塑及其相互作用 | 创新性地结合了质谱成像技术和空间转录组学，提供了肿瘤微环境中代谢异质性的分层可视化 | NA | 旨在改善对肿瘤生物学的理解，为高级治疗策略的设计提供基础 | 研究宫癌样本中的肿瘤及非肿瘤细胞的代谢重塑和相互作用 | 数字病理学 | 胃癌 | 质谱成像、空间代谢组学和空间转录组学 | NA | 代谢物、脂质、基因表达数据 | 同一胃癌样本中的多个细胞类型 |
| 3980 | 2024-08-08 |
scRAA: the development of a robust and automatic annotation procedure for single-cell RNA sequencing data
2023-May-10, Journal of biopharmaceutical statistics
IF:1.2Q2
DOI:10.1080/10543406.2023.2208671
PMID:37162278
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研究论文 | 本文提出了一种名为scRAA的鲁棒自动注释程序，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型识别 | 引入了一种鲁棒的集成方法进行细胞分类，并采用了批次校正方法来处理参考数据和查询数据之间的批次效应 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型预测的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成方法 | 基因表达数据 | 涉及肺和胰腺数据 |