单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5352 篇文献，本页显示第 3921 - 3940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3921 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Revealed Heterogeneity and Identified Novel Therapeutic Targets for Breast Cancer Subtypes
2023-04-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12081182
PMID:37190091
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研究论文 | 本研究利用计算算法分析了来自26名乳腺癌患者的49,899个单细胞转录组数据，揭示了乳腺癌亚型的细胞组成，并识别了新的治疗靶点 | 首次揭示了各乳腺癌分子亚型的独特基因特征，并识别了新的依赖性和治疗脆弱性 | NA | 识别乳腺癌亚型的新治疗靶点，为开发更有效的靶向疗法奠定基础 | 乳腺癌的四种亚型：雌激素受体阳性（ER）、HER2、ERHER2和三阴性乳腺癌（TNBC） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 49,899个单细胞，来自26名乳腺癌患者 |
| 3922 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Gene Regulatory Network Changes in the Development of Lung Adenocarcinoma
2023-04-12, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13040671
PMID:37189418
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞转录组数据，绘制了从发病到进展的肺腺癌细胞图谱，并提供了不同疾病阶段的细胞间通信视图 | 构建了一个筛选细胞间基因调控网络的过程，减少了单细胞通信分析产生的误差，并增加了所选细胞通信信号的可信度 | NA | 探索肺腺癌中癌细胞与其肿瘤微环境的调控关系，以及肿瘤微环境在肺腺癌发生发展中的作用 | 肺腺癌中的细胞间通信及其在疾病发展中的作用 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了远端正常肺组织（nLung）、早期肺腺癌（tLung）和晚期肺腺癌（tL/B）的单细胞转录组数据 |
| 3923 | 2024-08-05 |
scTransSort: Transformers for Intelligent Annotation of Cell Types by Gene Embeddings
2023-03-28, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13040611
PMID:37189359
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研究论文 | 本研究提出了一种基于基因嵌入的智能细胞类型标注方法scTransSort | 创新点在于采用transformer的思想进行单细胞转录组数据的细胞类型分类，自动提取有效特征而无需手动标记 | 缺乏对大规模样本的广泛验证，尚需在更多类型的细胞上进行验证 | 研究单细胞RNA测序技术中的细胞类型识别 | 对来自35个人类和26只小鼠组织的细胞进行分类和标注 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | transformer | 基因表达数据 | 来自35个人类和26只小鼠组织的细胞 |
| 3924 | 2024-08-05 |
Global Single-Cell Sequencing Landscape of Adipose Tissue of Different Anatomical Site Origin in Humans
2023, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2023/8282961
PMID:37197688
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研究论文 | 本研究结合了不同解剖部位来源的人类脂肪组织的单细胞RNA测序，探讨其细胞水平的差异 | 本研究首次揭示了不同解剖部位来源的脂肪组织中的细胞类型差异及其生物信号通路的变化 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在数据来源的偏差 | 研究不同解剖部位来源的脂肪组织在慢性难愈合创伤治疗中的作用 | 本研究对象为人类腿部和腹部的皮下脂肪组织样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 包括腿部和腹部皮下脂肪组织样本及公共数据库中的内脏脂肪组织样本 |
| 3925 | 2024-08-05 |
Ribosomal proteins are blood biomarkers and associated with CD4+ T cell activation in Alzheimer's disease: a study based on machine learning strategies and scRNA-Seq data validation
2023, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:37193138
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研究论文 | 本文揭示了核糖体蛋白作为阿尔茨海默病的血液生物标志物，并与CD4+ T细胞激活相关 | 提出了核糖体蛋白作为新的生物标志物，并通过机器学习方法建立了诊断模型 | 研究可能受限于样本的公共数据库以及可能的外部验证不足 | 旨在识别与阿尔茨海默病相关的血液标志物并评估其诊断能力 | 阿尔茨海默病相关的外周血样本及其核糖体蛋白 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | RNA测序（scRNA-Seq） | lightGBM | 血液样本 | 来自公共数据库的四个大样本和单细胞RNA测序外周血样本 |
| 3926 | 2024-08-05 |
Identification of the metabolic state of surviving cardiomyocytes in the human infarcted heart by spatial single-cell transcriptomics
2023 Jan-Mar, Cardiology plus
DOI:10.1097/CP9.0000000000000038
PMID:37187809
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研究论文 | 本研究使用空间单细胞RNA测序评估心肌梗死后幸存心肌细胞的代谢状态 | 首次采用空间单细胞RNA测序分析人类心肌梗死心脏中幸存心肌细胞的代谢状态 | 没有提到研究的样本规模和患者的具体特征 | 研究幸存心肌细胞在心肌梗死后的人类心脏中的代谢状态 | 幸存的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 3927 | 2024-08-05 |
High-Plex Spatial Profiling of RNA and Protein Using Digital Spatial Profiler
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3163-8_6
PMID:37191791
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研究论文 | 本文分享了使用数字空间分析仪(DSP)进行RNA和蛋白质的高通量空间分析的详细操作协议和要点 | 提出了优化数字空间分析仪(DSP)的工作程序的实用经验和操作规范 | 未提及具体的实验数据或样本分析 | 旨在为生物医学研究社区提供使用DSP的高效操作指南 | 数字空间分析技术在空间转录组学和蛋白质组学中的应用 | 数字病理学 | NA | 数字空间分析仪(DSP) | NA | RNA和蛋白质数据 | NA |
| 3928 | 2024-08-08 |
Analysis of candidate genes for cleft lip ± cleft palate using murine single-cell expression data
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1091666
PMID:37169019
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研究论文 | 本研究利用小鼠单细胞表达数据分析唇裂±腭裂候选基因的表达模式 | 引入单细胞RNA测序技术，提供高分辨率的胚胎小鼠面部数据资源，并展示其在研究唇裂±腭裂候选基因表达模式中的价值 | NA | 旨在聚合现有的胚胎小鼠单细胞RNA测序数据，并为颅面研究社区提供这一资源，同时展示这些数据在研究唇裂±腭裂候选基因表达模式中的价值 | 唇裂±腭裂候选基因的表达模式 | 数字病理学 | 唇裂±腭裂 | 单细胞RNA测序 | NA | 表达数据 | 两个已发表的胚胎小鼠单细胞RNA测序数据集 |
| 3929 | 2024-08-08 |
Single-Cell Profiling Uncovers the Roles of Endometrial Fibrosis and Microenvironmental Changes in Adenomyosis
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S402734
PMID:37179754
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨腺肌症中子宫内膜纤维化和微环境变化的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了腺肌症中不同细胞类型的基因表达差异，并发现了与纤维化相关的异常基因表达 | 研究样本仅来自一位腺肌症患者，可能影响结果的普遍性 | 探究腺肌症的病理生理变化和分子机制 | 腺肌症患者的异位子宫内膜和正常子宫内膜 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 一位腺肌症患者及三位患者的样本用于验证 |
| 3930 | 2024-08-08 |
Construction of a hypoxia-immune-related prognostic panel based on integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses in gastric cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1140328
PMID:37180146
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据，构建了一个与胃癌中低氧和免疫相关的预后标志物面板 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据，构建了胃癌中低氧相关的预后标志物面板，并评估了其对免疫浸润和免疫治疗预测的影响 | NA | 探索低氧在胃癌中的影响并建立一个低氧相关的预后标志物面板 | 胃癌中的低氧相关基因表达和免疫浸润 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qPCR, 免疫组化 | LASSO-COX回归分析 | RNA序列数据 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的胃癌单细胞和批量RNA测序数据 |
| 3931 | 2024-08-08 |
Immune heterogeneity in cardiovascular diseases from a single-cell perspective
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1057870
PMID:37180791
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review | 本文综述了从单细胞角度观察心血管疾病中免疫异质性的现象及其在三种心血管疾病中的表现 | 利用单细胞RNA测序等技术，系统性地探究免疫细胞亚群，提供了对免疫群体整合行为的深入理解 | 由于技术限制，动态免疫网络对心血管疾病的影响及其分子机制尚未完全揭示 | 增强对免疫异质性如何推动心血管疾病进展的理解，阐明免疫细胞亚群在疾病中的调控作用，指导新免疫疗法的开发 | 心血管疾病中的免疫细胞亚群及其在疾病进展中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 3932 | 2024-08-08 |
Barcode demultiplexing of nanopore sequencing raw signals by unsupervised machine learning
2023, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2023.1067113
PMID:37181486
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研究论文 | 本文介绍了一种名为UNPLEX的新框架，用于通过直接操作记录的信号来解决纳米孔测序原始信号的条形码解复用问题 | UNPLEX结合了两种无监督机器学习方法：自动编码器和自组织映射（SOM），以提取记录信号的紧凑、潜在表示并进行聚类 | NA | 解决纳米孔测序中条形码解复用的问题 | 纳米孔测序的原始信号 | 机器学习 | NA | 纳米孔测序（ONT） | 自动编码器和自组织映射（SOM） | 信号 | 两个数据集，包含生成的类似ONT的信号 |
| 3933 | 2024-08-08 |
Promising immunotherapeutic targets in lung cancer based on single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1148061
PMID:37187731
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综述 | 本文综述了基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在肺癌免疫治疗中的最新进展，特别是关注基质细胞，并提出了基于scRNA-seq识别的细胞标志物的肺癌免疫治疗预测性生物标志物和新靶点 | 利用scRNA-seq技术识别肿瘤微环境（TME）中的细胞标志物，为肺癌免疫治疗提供了新的靶点和策略 | NA | 提高肺癌患者对免疫治疗的反应 | 肺癌中的免疫治疗靶点 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 3934 | 2024-08-08 |
Identification of TREM2-positive tumor-associated macrophages in esophageal squamous cell carcinoma: implication for poor prognosis and immunotherapy modulation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1162032
PMID:37187751
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在食管鳞状细胞癌中鉴定出一种新的TREM2阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群，并探讨其对患者预后和免疫治疗的影响 | 首次在食管鳞状细胞癌中发现TREM2阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群，并揭示其与不良预后和免疫治疗反应的关系 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和少量临床样本，需要更多临床数据验证 | 探讨食管鳞状细胞癌中TREM2阳性肿瘤相关巨噬细胞亚群对患者预后和免疫治疗的影响 | 食管鳞状细胞癌中的肿瘤相关巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括48名黑色素瘤患者和80名食管鳞状细胞癌患者的样本 |
| 3935 | 2024-08-08 |
Multicellular network analysis of melanoma heterogeneity by scRNA-seq
2023, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:37193189
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研究论文 | 本研究通过分析已发表的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，绘制了人类黑色素瘤的细胞景观图 | 本研究首次通过构建细胞特异性网络（CSN）对每个细胞群体进行聚类和伪轨迹分析，提供了黑色素瘤免疫微环境的详细图谱 | NA | 揭示黑色素瘤的细胞类型组成和肿瘤免疫微环境 | 分析4645个细胞的转录组数据，来自19个黑色素瘤组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 4645个细胞，来自19个黑色素瘤组织 |
| 3936 | 2024-08-08 |
Engineering and Modeling the Lung Mesenchyme
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-26625-6_8
PMID:37195530
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研究论文 | 本文探讨了肺间质细胞的结构及其在肺部功能中的作用，并介绍了使用单细胞RNA测序和生物工程方法研究肺间质细胞功能的新方法 | 利用单细胞RNA测序和遗传小鼠模型揭示了肺间质细胞的转录和功能异质性，并采用生物工程方法模拟组织结构以阐明间质细胞类型的功能和调控 | NA | 研究肺间质细胞的生物学特性和功能 | 肺间质细胞及其在肺部结构和功能中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及遗传小鼠模型 |
| 3937 | 2024-08-05 |
An interferon gamma response signature links myocardial aging and immunosenescence
2023-11-15, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad068
PMID:37141306
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研究论文 | 本研究探讨了衰老的T细胞与老年小鼠心肌细胞生物学变化之间的关系 | 揭示了衰老与心肌IFN-γ信号增强之间的关系，以及这对心力衰竭中的炎症和代谢变化的影响 | 研究主要在小鼠模型中进行，可能限制了结果向人类的翻译相关性 | 研究衰老如何影响心脏的免疫及代谢环境 | 聚焦于不同年龄段C57BL/6J小鼠心脏内的T细胞及心肌细胞 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞RNA/T细胞受体测序 | NA | 单细胞基因组数据 | 使用2、6、12和18个月龄的C57BL/6J小鼠 |
| 3938 | 2024-08-08 |
Monocyte heterogeneity in cardiovascular disease
2023-09-05, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad069
PMID:37161473
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研究论文 | 本文综述了单核细胞在心血管疾病中的异质性及其在稳态和疾病中的功能差异 | 提出了超越当前三分法子集划分的单核细胞异质性新范式，并主张更新命名法和功能研究以证实基于标记的子集划分 | 缺乏明确的因果关系证据以及对心血管疾病的预测价值 | 探讨单核细胞异质性在心血管疾病中的作用及其潜在的子集特异性影响 | 单核细胞及其在心血管疾病中的异质性和功能 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 3939 | 2024-08-05 |
M2 macrophage marker CHI3L2 could serve as a potential prognostic and immunological biomarker in glioma by integrated single-cell and bulk RNA-Seq analysis
2023-09, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3523
PMID:37147894
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研究论文 | CHI3L2在胶质瘤中具有预后和免疫标志物的潜在价值 | 综合了散装RNA测序、蛋白组学和单细胞RNA测序以确定CHI3L2在胶质瘤中的作用 | 该研究主要依赖于在线数据库的分析，可能存在数据库数据的局限性 | 探讨CHI3L2在胶质瘤中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 研究对象为胶质瘤患者的CHI3L2表达 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, IHC | Cox回归模型 | 基因数据 | 涉及多组胶质瘤的样本数据来自多个数据库 |
| 3940 | 2024-08-08 |
Microbiota-mediated shaping of mouse spleen structure and immune function characterized by scRNA-seq and Stereo-seq
2023-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2023.04.012
PMID:37156441
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研究论文 | 本文通过scRNA-seq和Stereo-seq技术研究了无菌（GF）小鼠中微生物群对脾脏结构和免疫功能的影响 | 首次揭示了微生物群缺失对脾脏红髓区域红细胞生成和白髓区域先天免疫缺陷的影响，并展示了脾脏免疫细胞的空间分布层次 | NA | 探索微生物群在调节和塑造脾脏结构和免疫功能中的作用 | 小鼠脾脏的结构、细胞类型、功能和空间分子特征 | 免疫学 | NA | scRNA-seq, Stereo-seq | NA | 细胞和分子数据 | 无菌小鼠 |