单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 3921 - 3940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3921 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis in Immuno-Oncology
2023-May-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24098422
PMID:37176128
|
综述 | 本文综述了单细胞组学技术在免疫肿瘤学中的应用，特别是多组学分析如何通过单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、T细胞受体测序等技术，以及相关的生物信息学工具，来高吞吐量地评估大量分析物在单细胞分辨率下的情况。 | 本文介绍了单细胞组学技术在解析肿瘤微环境中免疫和非免疫成分的多样性方面的创新应用，以及这些技术如何帮助理解适应性免疫反应的抗原特异性和动态变化，并为潜在的治疗靶点提供建议。 | NA | 探讨单细胞组学技术在免疫肿瘤学中的应用，以及如何通过这些技术来优化患者的治疗方案。 | 肿瘤微环境中的免疫和非免疫细胞，以及它们在不同患者中的分布和响应模式。 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq）、T细胞受体测序（scTCR-seq） | NA | 单细胞数据 | NA |
| 3922 | 2024-08-05 |
Single-nucleus and Spatially Resolved Intratumor Subtype Heterogeneity in Bladder Cancer
2023-May, European urology open science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.euros.2023.03.006
PMID:37187723
|
研究论文 | 本研究探讨了膀胱癌中肿瘤内部亚型异质性的程度及其潜在的临床影响 | 提出了通过单核RNA测序和批量RNA测序评估膀胱癌内部亚型异质性的新方法，并展示了其与临床结果的相关性 | 使用DroNc-seq测序协议生成的数据稀疏性是一个限制因素 | 研究膀胱癌肿瘤内部亚型异质性及其对临床结果的影响 | 48个膀胱肿瘤进行单核RNA测序和空间转录组学分析 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 48个膀胱肿瘤 |
| 3923 | 2024-08-05 |
The peripheral nervous system
2023-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201164
PMID:37170957
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综述 | 本文讨论了外周神经系统在身体中的多样角色及其不同领域的起源和异质性 | 提出了最新的发现和概念，并改进了以前的细胞类型分类 | 未提及具体的实验数据或实例来支持某些观点 | 探讨外周神经系统的多样性以及对未来研究的展望 | 外周神经系统的各种神经元亚型及其功能 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 3924 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics herald a new era of transcriptome research
2023-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1264
PMID:37190941
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3925 | 2024-08-05 |
Construction of a prognostic model for lung adenocarcinoma based on membrane-tension-related genes
2023-Apr-28, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-23-396
PMID:37197492
|
研究论文 | 本研究构建了一个与膜张力相关基因的肺腺癌预后模型 | 首次关注膜张力在肺腺癌中的作用，并构建了基于膜张力相关基因的预后模型 | 样本可能存在选择偏差，模型在不同人群中的验证需要进一步研究 | 旨在识别影响肺腺癌预后的关键生物标志物 | 关注于肺腺癌患者的膜张力相关基因及其预后价值 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | COX回归模型和LASSO回归模型 | 基因组数据 | 从TCGA数据库中获取了肺腺癌样本的RNA测序数据 |
| 3926 | 2024-08-05 |
IRF7 and IFIT2 in mediating different hemorrhage outcomes for non-small cell lung cancer after bevacizumab treatment
2023-Apr-28, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-23-389
PMID:37197507
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研究论文 | 本文研究了IRF7和IFIT2在非小细胞肺癌患者接受贝伐单抗治疗后不同出血结果中的作用 | 揭示了IRF7和IFIT2可能影响非小细胞肺癌患者贝伐单抗治疗后的出血结果的新机制 | 在贝伐单抗治疗对不同类型肺癌出血结果的影响机制方面仍需进一步研究 | 探讨贝伐单抗治疗后非小细胞肺癌不同病理类型患者出血结果的潜在机制 | 非小细胞肺癌患者中的腺癌和鳞癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序，实时聚合酶链反应，免疫荧光分析等 | NA | 肿瘤组织样本 | LUAD和LUSC患者的肿瘤组织样本 |
| 3927 | 2024-08-05 |
Immune characteristics and genetic markers of esophageal cancer by single-cell analysis: implications for immunotherapy
2023-Apr-28, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-23-317
PMID:37197539
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析探讨了食管癌的肿瘤环境特征和潜在遗传标记. | 应用单细胞分析技术识别了食管癌中的特定细胞亚群，并发现了CXCL8蛋白作为潜在的预后标志物. | 本研究主要基于公共基因组数据，可能缺乏临床样本的多样性与个体差异考量. | 研究食管癌患者的肿瘤微环境特征，为个性化治疗提供基础. | 研究对象为食管癌样本及其旁癌样本中的免疫细胞亚群. | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 从TCGA数据库下载的食管癌样本数据 |
| 3928 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Atlas of Yak Testis Cells
2023-Apr-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24097982
PMID:37175687
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了牦牛睾丸细胞的图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面且无偏地研究了性成熟4岁牦牛的精子发生过程，并鉴定了多种细胞类型及其标记基因 | NA | 探索牦牛精子发生过程中的细胞异质性 | 牦牛的睾丸细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 性成熟4岁牦牛的睾丸细胞 |
| 3929 | 2024-08-05 |
UVRAG Promotes Tumor Progression through Regulating SP1 in Colorectal Cancer
2023-Apr-27, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15092502
PMID:37173968
|
研究论文 | 本研究探讨了UVRAG在结直肠癌中的作用及其对预后的影响 | 揭示了UVRAG通过上调SP1表达增强肿瘤迁移和药物耐受性，提供了结直肠癌潜在机制的见解 | 本研究的具体限制未提及 | 旨在分析UVRAG在结直肠癌中的表达及其对患者预后的影响 | 研究对象为结直肠癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 高UVRAG表达组和低UVRAG表达组的样本 |
| 3930 | 2024-08-08 |
Single-Cell Next-Generation Sequencing to Monitor Hematopoietic Stem-Cell Transplantation: Current Applications and Future Perspectives
2023-Apr-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15092477
PMID:37173944
|
综述 | 本文综述了单细胞下一代测序技术在急性髓系白血病（AML）和骨髓增生异常综合征（MDS）患者造血干细胞移植（HSCT）后微小残留病（MRD）评估中的应用及未来展望 | 介绍了单细胞DNA基因组学在MRD评估中的应用，并探讨了单细胞RNA测序和可及染色质分析的潜在优势 | NGS技术的一个主要缺点是无法区分非白血病克隆性造血，且HSCT后的风险评估和预后因基因型漂移而变得更加复杂 | 探讨单细胞下一代测序技术在预测HSCT后患者预后中的应用 | 急性髓系白血病（AML）和骨髓增生异常综合征（MDS）患者 | 数字病理学 | 白血病 | 下一代测序（NGS） | NA | 基因组数据 | NA |
| 3931 | 2024-08-08 |
Characterizing Intraindividual Podocyte Morphology In Vitro with Different Innovative Microscopic and Spectroscopic Techniques
2023-04-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12091245
PMID:37174644
|
研究论文 | 本文开发了一种新的连续相关方法，通过结合多种显微和光谱技术在同一细胞中进行分析，以更好地理解足细胞的形态学特征 | 本文采用了一系列创新的显微和光谱技术，如光学显微镜、拉曼光谱、扫描电子显微镜和原子力显微镜，以及扫描离子电导显微镜，这些技术通常需要不同的处理和固定方法，但本文成功地开发了一种兼容的协议，允许在同一细胞上使用多种技术进行分析 | NA | 旨在通过多种显微和光谱技术深入理解足细胞的形态学特征 | 足细胞的形态学特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、光学显微镜（LM）、拉曼光谱、扫描电子显微镜（SEM）、原子力显微镜（AFM）、扫描离子电导显微镜（SICM） | NA | 细胞图像 | 未明确提及具体样本数量 |
| 3932 | 2024-08-08 |
The Functions and Phenotypes of Microglia in Alzheimer's Disease
2023-04-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12081207
PMID:37190116
|
综述 | 本文综述了阿尔茨海默病中微胶质细胞的功能和表型，以及它们在疾病发展中的作用 | 利用单细胞RNA测序等新技术揭示了阿尔茨海默病中微胶质细胞的异质性状态 | NA | 总结微胶质细胞对阿尔茨海默病病理的反应，并探讨其在疾病中的保护作用和炎症关系 | 微胶质细胞在阿尔茨海默病中的功能和表型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3933 | 2024-08-05 |
Large-Scale Integration of Single-Cell RNA-Seq Data Reveals Astrocyte Diversity and Transcriptomic Modules across Six Central Nervous System Disorders
2023-04-19, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13040692
PMID:37189441
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研究论文 | 本文展示了如何通过大规模整合多组学数据揭示在六种中枢神经系统疾病中星形胶质细胞的多样性和转录组模块 | 通过整合302个公开单细胞RNA测序数据集，揭示了未识别的星形胶质细胞亚群，构建了涉及疾病发展的七个转录组模块 | 人类大脑样本的稀少性限制了星形胶质细胞的单细胞转录组分析 | 研究星形胶质细胞在多种神经系统疾病中的功能和转录组特征 | 分析302个单细胞RNA测序数据集中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病, 帕金森病, 亨廷顿病, 多发性硬化, 癫痫, 慢性创伤性脑病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 近一百万个细胞 |
| 3934 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Revealed Heterogeneity and Identified Novel Therapeutic Targets for Breast Cancer Subtypes
2023-04-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12081182
PMID:37190091
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研究论文 | 本研究利用计算算法分析了来自26名乳腺癌患者的49,899个单细胞转录组数据，揭示了乳腺癌亚型的细胞组成，并识别了新的治疗靶点 | 首次揭示了各乳腺癌分子亚型的独特基因特征，并识别了新的依赖性和治疗脆弱性 | NA | 识别乳腺癌亚型的新治疗靶点，为开发更有效的靶向疗法奠定基础 | 乳腺癌的四种亚型：雌激素受体阳性（ER）、HER2、ERHER2和三阴性乳腺癌（TNBC） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 49,899个单细胞，来自26名乳腺癌患者 |
| 3935 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Gene Regulatory Network Changes in the Development of Lung Adenocarcinoma
2023-04-12, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13040671
PMID:37189418
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞转录组数据，绘制了从发病到进展的肺腺癌细胞图谱，并提供了不同疾病阶段的细胞间通信视图 | 构建了一个筛选细胞间基因调控网络的过程，减少了单细胞通信分析产生的误差，并增加了所选细胞通信信号的可信度 | NA | 探索肺腺癌中癌细胞与其肿瘤微环境的调控关系，以及肿瘤微环境在肺腺癌发生发展中的作用 | 肺腺癌中的细胞间通信及其在疾病发展中的作用 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了远端正常肺组织（nLung）、早期肺腺癌（tLung）和晚期肺腺癌（tL/B）的单细胞转录组数据 |
| 3936 | 2024-08-05 |
scTransSort: Transformers for Intelligent Annotation of Cell Types by Gene Embeddings
2023-03-28, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13040611
PMID:37189359
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研究论文 | 本研究提出了一种基于基因嵌入的智能细胞类型标注方法scTransSort | 创新点在于采用transformer的思想进行单细胞转录组数据的细胞类型分类，自动提取有效特征而无需手动标记 | 缺乏对大规模样本的广泛验证，尚需在更多类型的细胞上进行验证 | 研究单细胞RNA测序技术中的细胞类型识别 | 对来自35个人类和26只小鼠组织的细胞进行分类和标注 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | transformer | 基因表达数据 | 来自35个人类和26只小鼠组织的细胞 |
| 3937 | 2024-08-05 |
Global Single-Cell Sequencing Landscape of Adipose Tissue of Different Anatomical Site Origin in Humans
2023, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2023/8282961
PMID:37197688
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研究论文 | 本研究结合了不同解剖部位来源的人类脂肪组织的单细胞RNA测序，探讨其细胞水平的差异 | 本研究首次揭示了不同解剖部位来源的脂肪组织中的细胞类型差异及其生物信号通路的变化 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在数据来源的偏差 | 研究不同解剖部位来源的脂肪组织在慢性难愈合创伤治疗中的作用 | 本研究对象为人类腿部和腹部的皮下脂肪组织样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 包括腿部和腹部皮下脂肪组织样本及公共数据库中的内脏脂肪组织样本 |
| 3938 | 2024-08-05 |
Ribosomal proteins are blood biomarkers and associated with CD4+ T cell activation in Alzheimer's disease: a study based on machine learning strategies and scRNA-Seq data validation
2023, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:37193138
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研究论文 | 本文揭示了核糖体蛋白作为阿尔茨海默病的血液生物标志物，并与CD4+ T细胞激活相关 | 提出了核糖体蛋白作为新的生物标志物，并通过机器学习方法建立了诊断模型 | 研究可能受限于样本的公共数据库以及可能的外部验证不足 | 旨在识别与阿尔茨海默病相关的血液标志物并评估其诊断能力 | 阿尔茨海默病相关的外周血样本及其核糖体蛋白 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | RNA测序（scRNA-Seq） | lightGBM | 血液样本 | 来自公共数据库的四个大样本和单细胞RNA测序外周血样本 |
| 3939 | 2024-08-05 |
Identification of the metabolic state of surviving cardiomyocytes in the human infarcted heart by spatial single-cell transcriptomics
2023 Jan-Mar, Cardiology plus
DOI:10.1097/CP9.0000000000000038
PMID:37187809
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研究论文 | 本研究使用空间单细胞RNA测序评估心肌梗死后幸存心肌细胞的代谢状态 | 首次采用空间单细胞RNA测序分析人类心肌梗死心脏中幸存心肌细胞的代谢状态 | 没有提到研究的样本规模和患者的具体特征 | 研究幸存心肌细胞在心肌梗死后的人类心脏中的代谢状态 | 幸存的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 3940 | 2024-08-05 |
High-Plex Spatial Profiling of RNA and Protein Using Digital Spatial Profiler
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3163-8_6
PMID:37191791
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研究论文 | 本文分享了使用数字空间分析仪(DSP)进行RNA和蛋白质的高通量空间分析的详细操作协议和要点 | 提出了优化数字空间分析仪(DSP)的工作程序的实用经验和操作规范 | 未提及具体的实验数据或样本分析 | 旨在为生物医学研究社区提供使用DSP的高效操作指南 | 数字空间分析技术在空间转录组学和蛋白质组学中的应用 | 数字病理学 | NA | 数字空间分析仪(DSP) | NA | RNA和蛋白质数据 | NA |