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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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3901 | 2024-08-08 |
Novel CH25H+ and OASL+ microglia subclusters play distinct roles in cerebral ischemic stroke
2023-May-15, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02799-6
PMID:37183260
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了脑缺血性卒中后微胶质细胞的转录变化及其在卒中治疗中的潜在作用 | 首次鉴定出CH25H+和OASL+微胶质细胞亚群,并揭示了它们在脑缺血性卒中中的不同作用 | NA | 探讨脑缺血性卒中后微胶质细胞的转录变化及其在卒中治疗中的潜在作用 | 微胶质细胞亚群在脑缺血性卒中的作用 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用脑缺血组织和假手术小鼠的脑组织进行单细胞RNA测序,以及Ch25h-/-小鼠进行功能研究 |
3902 | 2024-08-08 |
Author Correction: Identification of a differentiation-related prognostic nomogram based on single-cell RNA sequencing in clear cell renal cell carcinoma
2023-May-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-34897-z
PMID:37188750
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
3903 | 2024-08-08 |
An exploratory study for tuft cells in the breast and their relevance in triple-negative breast cancer: the possible relationship of SOX9
2023-May-13, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-10949-5
PMID:37179317
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研究论文 | 本研究探讨了乳腺中的簇状细胞及其在三阴性乳腺癌中的相关性,特别是SOX9的可能关系 | 首次发现簇状细胞样表达特征在三阴性乳腺癌中的存在,并通过免疫组化证实了簇状细胞在正常人乳腺中的存在 | 研究样本量有限,需要进一步的大规模研究来验证结果 | 探索簇状细胞在乳腺中的存在及其在三阴性乳腺癌中的作用 | 簇状细胞、三阴性乳腺癌、SOX9 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 免疫组化(IHC)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 组织样本 | 4例先前报道的POU2F3阳性浸润性乳腺癌、1853例新的浸润性乳腺癌、15例非肿瘤性乳腺组织 |
3904 | 2024-08-08 |
High-throughput single nucleus total RNA sequencing of formalin-fixed paraffin-embedded tissues by snRandom-seq
2023-05-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38409-5
PMID:37173341
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research paper | 本文开发了一种基于液滴的snRNA测序技术(snRandom-seq),用于固定石蜡包埋(FFPE)组织中的单核RNA测序 | snRandom-seq技术具有较低的双重率(0.3%),更高的RNA覆盖率,并能检测更多的非编码RNA和新生RNA | NA | 开发一种适用于FFPE组织的高通量单核RNA测序技术 | FFPE组织中的单核RNA | digital pathology | liver cancer | snRNA-seq | NA | RNA | 一个临床FFPE人肝癌样本 |
3905 | 2024-08-08 |
Publisher Correction: Modeling group heteroscedasticity in single-cell RNA-seq pseudo-bulk data
2023-May-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-02965-2
PMID:37173797
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
3906 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals homogeneity and heterogeneity of the cytopathological mechanisms in different etiology-induced AKI
2023-05-11, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05830-z
PMID:37169762
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了不同病因诱导的急性肾损伤(AKI)中细胞病理机制的均一性和异质性 | 本研究构建了一个包含20种细胞类型的多模型AKI单细胞测序图谱,并发现了新型AKI内皮损伤生物标志物S100a6 | 研究主要在小鼠模型上进行,可能存在物种间差异 | 探讨不同病因诱导的急性肾损伤的细胞病理机制 | 小鼠模型,包含五种常见的AKI病因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 包含80,689个高质量细胞 |
3907 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the local cell landscape in mouse epididymal initial segment during aging
2023-May-11, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-023-00345-9
PMID:37170325
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年小鼠附睾头段(IS)的细胞景观,揭示了与年龄相关的细胞和分子变化 | 首次揭示了小鼠附睾头段在衰老过程中存在炎症老化状态,这与男性近端生殖道的普遍低免疫反应模式相反 | NA | 探究衰老过程中小鼠附睾头段的局部细胞和分子变化 | 年轻和老年小鼠的附睾头段组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 共获取了来自年轻和老年小鼠附睾头段组织的10,027个细胞 |
3908 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis in Immuno-Oncology
2023-May-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24098422
PMID:37176128
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术在免疫肿瘤学中的应用,特别是多组学分析如何通过单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、T细胞受体测序等技术,以及相关的生物信息学工具,来高吞吐量地评估大量分析物在单细胞分辨率下的情况。 | 本文介绍了单细胞组学技术在解析肿瘤微环境中免疫和非免疫成分的多样性方面的创新应用,以及这些技术如何帮助理解适应性免疫反应的抗原特异性和动态变化,并为潜在的治疗靶点提供建议。 | NA | 探讨单细胞组学技术在免疫肿瘤学中的应用,以及如何通过这些技术来优化患者的治疗方案。 | 肿瘤微环境中的免疫和非免疫细胞,以及它们在不同患者中的分布和响应模式。 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、T细胞受体测序(scTCR-seq) | NA | 单细胞数据 | NA |
3909 | 2024-08-05 |
Single-nucleus and Spatially Resolved Intratumor Subtype Heterogeneity in Bladder Cancer
2023-May, European urology open science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.euros.2023.03.006
PMID:37187723
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研究论文 | 本研究探讨了膀胱癌中肿瘤内部亚型异质性的程度及其潜在的临床影响 | 提出了通过单核RNA测序和批量RNA测序评估膀胱癌内部亚型异质性的新方法,并展示了其与临床结果的相关性 | 使用DroNc-seq测序协议生成的数据稀疏性是一个限制因素 | 研究膀胱癌肿瘤内部亚型异质性及其对临床结果的影响 | 48个膀胱肿瘤进行单核RNA测序和空间转录组学分析 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 48个膀胱肿瘤 |
3910 | 2024-08-05 |
The peripheral nervous system
2023-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201164
PMID:37170957
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综述 | 本文讨论了外周神经系统在身体中的多样角色及其不同领域的起源和异质性 | 提出了最新的发现和概念,并改进了以前的细胞类型分类 | 未提及具体的实验数据或实例来支持某些观点 | 探讨外周神经系统的多样性以及对未来研究的展望 | 外周神经系统的各种神经元亚型及其功能 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
3911 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics herald a new era of transcriptome research
2023-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1264
PMID:37190941
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
3912 | 2024-08-05 |
Construction of a prognostic model for lung adenocarcinoma based on membrane-tension-related genes
2023-Apr-28, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-23-396
PMID:37197492
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研究论文 | 本研究构建了一个与膜张力相关基因的肺腺癌预后模型 | 首次关注膜张力在肺腺癌中的作用,并构建了基于膜张力相关基因的预后模型 | 样本可能存在选择偏差,模型在不同人群中的验证需要进一步研究 | 旨在识别影响肺腺癌预后的关键生物标志物 | 关注于肺腺癌患者的膜张力相关基因及其预后价值 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | COX回归模型和LASSO回归模型 | 基因组数据 | 从TCGA数据库中获取了肺腺癌样本的RNA测序数据 |
3913 | 2024-08-05 |
IRF7 and IFIT2 in mediating different hemorrhage outcomes for non-small cell lung cancer after bevacizumab treatment
2023-Apr-28, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-23-389
PMID:37197507
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研究论文 | 本文研究了IRF7和IFIT2在非小细胞肺癌患者接受贝伐单抗治疗后不同出血结果中的作用 | 揭示了IRF7和IFIT2可能影响非小细胞肺癌患者贝伐单抗治疗后的出血结果的新机制 | 在贝伐单抗治疗对不同类型肺癌出血结果的影响机制方面仍需进一步研究 | 探讨贝伐单抗治疗后非小细胞肺癌不同病理类型患者出血结果的潜在机制 | 非小细胞肺癌患者中的腺癌和鳞癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序,实时聚合酶链反应,免疫荧光分析等 | NA | 肿瘤组织样本 | LUAD和LUSC患者的肿瘤组织样本 |
3914 | 2024-08-05 |
Immune characteristics and genetic markers of esophageal cancer by single-cell analysis: implications for immunotherapy
2023-Apr-28, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-23-317
PMID:37197539
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析探讨了食管癌的肿瘤环境特征和潜在遗传标记. | 应用单细胞分析技术识别了食管癌中的特定细胞亚群,并发现了CXCL8蛋白作为潜在的预后标志物. | 本研究主要基于公共基因组数据,可能缺乏临床样本的多样性与个体差异考量. | 研究食管癌患者的肿瘤微环境特征,为个性化治疗提供基础. | 研究对象为食管癌样本及其旁癌样本中的免疫细胞亚群. | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 从TCGA数据库下载的食管癌样本数据 |
3915 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Atlas of Yak Testis Cells
2023-Apr-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24097982
PMID:37175687
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了牦牛睾丸细胞的图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面且无偏地研究了性成熟4岁牦牛的精子发生过程,并鉴定了多种细胞类型及其标记基因 | NA | 探索牦牛精子发生过程中的细胞异质性 | 牦牛的睾丸细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 性成熟4岁牦牛的睾丸细胞 |
3916 | 2024-08-05 |
UVRAG Promotes Tumor Progression through Regulating SP1 in Colorectal Cancer
2023-Apr-27, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15092502
PMID:37173968
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研究论文 | 本研究探讨了UVRAG在结直肠癌中的作用及其对预后的影响 | 揭示了UVRAG通过上调SP1表达增强肿瘤迁移和药物耐受性,提供了结直肠癌潜在机制的见解 | 本研究的具体限制未提及 | 旨在分析UVRAG在结直肠癌中的表达及其对患者预后的影响 | 研究对象为结直肠癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 高UVRAG表达组和低UVRAG表达组的样本 |
3917 | 2024-08-08 |
Single-Cell Next-Generation Sequencing to Monitor Hematopoietic Stem-Cell Transplantation: Current Applications and Future Perspectives
2023-Apr-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15092477
PMID:37173944
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综述 | 本文综述了单细胞下一代测序技术在急性髓系白血病(AML)和骨髓增生异常综合征(MDS)患者造血干细胞移植(HSCT)后微小残留病(MRD)评估中的应用及未来展望 | 介绍了单细胞DNA基因组学在MRD评估中的应用,并探讨了单细胞RNA测序和可及染色质分析的潜在优势 | NGS技术的一个主要缺点是无法区分非白血病克隆性造血,且HSCT后的风险评估和预后因基因型漂移而变得更加复杂 | 探讨单细胞下一代测序技术在预测HSCT后患者预后中的应用 | 急性髓系白血病(AML)和骨髓增生异常综合征(MDS)患者 | 数字病理学 | 白血病 | 下一代测序(NGS) | NA | 基因组数据 | NA |
3918 | 2024-08-08 |
Characterizing Intraindividual Podocyte Morphology In Vitro with Different Innovative Microscopic and Spectroscopic Techniques
2023-04-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12091245
PMID:37174644
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研究论文 | 本文开发了一种新的连续相关方法,通过结合多种显微和光谱技术在同一细胞中进行分析,以更好地理解足细胞的形态学特征 | 本文采用了一系列创新的显微和光谱技术,如光学显微镜、拉曼光谱、扫描电子显微镜和原子力显微镜,以及扫描离子电导显微镜,这些技术通常需要不同的处理和固定方法,但本文成功地开发了一种兼容的协议,允许在同一细胞上使用多种技术进行分析 | NA | 旨在通过多种显微和光谱技术深入理解足细胞的形态学特征 | 足细胞的形态学特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq)、光学显微镜(LM)、拉曼光谱、扫描电子显微镜(SEM)、原子力显微镜(AFM)、扫描离子电导显微镜(SICM) | NA | 细胞图像 | 未明确提及具体样本数量 |
3919 | 2024-08-08 |
The Functions and Phenotypes of Microglia in Alzheimer's Disease
2023-04-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12081207
PMID:37190116
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病中微胶质细胞的功能和表型,以及它们在疾病发展中的作用 | 利用单细胞RNA测序等新技术揭示了阿尔茨海默病中微胶质细胞的异质性状态 | NA | 总结微胶质细胞对阿尔茨海默病病理的反应,并探讨其在疾病中的保护作用和炎症关系 | 微胶质细胞在阿尔茨海默病中的功能和表型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
3920 | 2024-08-05 |
Large-Scale Integration of Single-Cell RNA-Seq Data Reveals Astrocyte Diversity and Transcriptomic Modules across Six Central Nervous System Disorders
2023-04-19, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13040692
PMID:37189441
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研究论文 | 本文展示了如何通过大规模整合多组学数据揭示在六种中枢神经系统疾病中星形胶质细胞的多样性和转录组模块 | 通过整合302个公开单细胞RNA测序数据集,揭示了未识别的星形胶质细胞亚群,构建了涉及疾病发展的七个转录组模块 | 人类大脑样本的稀少性限制了星形胶质细胞的单细胞转录组分析 | 研究星形胶质细胞在多种神经系统疾病中的功能和转录组特征 | 分析302个单细胞RNA测序数据集中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病, 帕金森病, 亨廷顿病, 多发性硬化, 癫痫, 慢性创伤性脑病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 近一百万个细胞 |