单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 3881 - 3900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3881 | 2024-08-05 |
Apposition of Fibroblasts With Metaplastic Gastric Cells Promotes Dysplastic Transition
2023-08, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.04.038
PMID:37196797
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研究论文 | 这篇文章研究了成纤维细胞与变性胃细胞的关系如何促进胃癌前病变的进展。 | 文章创新性地识别了四种不同亚群的成纤维细胞，并探讨了它们在变性转化中的作用。 | 研究主要基于患者样本，可能无法完全代表所有情况。 | 探讨成纤维细胞在胃癌前病变进展中的重要性和作用机制。 | 研究对象为来自胃癌患者的黏膜细胞和成纤维细胞。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组学 | NA | 组织切片，细胞培养 | 来源于胃癌患者的组织和细胞样本 |
| 3882 | 2024-08-05 |
A novel T-cell proliferation-associated gene predicts prognosis and reveals immune infiltration in patients with oral squamous cell carcinoma
2023-Aug, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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研究论文 | 这篇文章建立了一种新的T细胞增殖调节因子的标志物，以预测口腔鳞状细胞癌(OSCC)的预后。 | 创新点在于识别了T细胞增殖调节因子在OSCC中的预后价值，并通过生物标志物分类患者风险。 | 研究限制在于依赖于TCGA数据库的单一数据集，可能影响结果的广泛适用性。 | 该研究旨在探讨OSCC的T细胞增殖调节因子与患者预后的关系。 | 研究对象是口腔鳞状细胞癌患者及其肿瘤微环境。 | 数字病理学 | 口腔癌 | mRNA表达谱分析 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA队列中涉及的OSCC患者数量不明确 |
| 3883 | 2024-08-08 |
Analysis of meristems and plant regeneration at single-cell resolution
2023-08, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2023.102378
PMID:37172363
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析植物分生组织和再生过程中的细胞异质性方面的应用 | scRNA-seq技术使得研究人员能够以前所未有的分辨率区分不同的植物细胞群体，描绘细胞周期连续体，并推断多样细胞类型在不同分生组织中的连续分化轨迹 | NA | 探讨scRNA-seq技术在揭示植物细胞类型、细胞状态及发育轨迹中的应用 | 植物分生组织和再生过程中的细胞类型和状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | NA |
| 3884 | 2024-08-08 |
DLP printed hDPSC-loaded GelMA microsphere regenerates dental pulp and repairs spinal cord
2023-08, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分析，提供了非培养和单层培养的牙髓细胞图谱，并使用数字光处理（DLP）打印机制备了载有人牙髓干细胞（hDPSC）的微球，这些微球能够促进牙髓再生和脊髓修复。 | 本研究首次使用DLP打印技术制备载有hDPSC的微球，这些微球具有增强的干细胞特性和多向分化潜能，能够促进血管、神经和牙本质组织的形成。 | NA | 探索牙髓再生和脊髓修复的新疗法 | 牙髓细胞和脊髓损伤模型 | 生物医学工程 | 口腔疾病 | 数字光处理（DLP）打印技术 | NA | 细胞 | 涉及大鼠和裸鼠的脊髓损伤模型以及迷你猪的牙髓再生实验 |
| 3885 | 2024-08-08 |
Integrative Single-Cell and Bulk Transcriptomes Analyses Identify Intrinsic HNSCC Subtypes with Distinct Prognoses and Therapeutic Vulnerabilities
2023-Aug-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-3563
PMID:37192003
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，确定了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）的内在上皮亚型，并评估了它们的分子特征和临床意义 | 提出了三种内在共识分子亚型（iCMS1-3），并开发了用于患者预后和治疗反应预测的新型机器学习特征 | NA | 定义HNSCC的内在上皮亚型，并评估其分子特征和临床意义 | HNSCC的恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | RNA测序数据 | 1,325名患者 |
| 3886 | 2024-08-08 |
Tr1 cell-mediated protection against autoimmune disease by intranasal administration of a fusion protein targeting cDC1 cells
2023-08, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2023.05.006
PMID:37192682
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研究论文 | 本文开发了一种针对自身免疫疾病的治疗性疫苗新策略，通过鼻内给药融合蛋白tolerogen，诱导Tr1细胞产生IL-10，抑制效应CD4 T细胞反应，从而减轻多发性硬化症模型的临床症状 | 首次报道了通过鼻内给药融合蛋白tolerogen，诱导Tr1细胞产生IL-10，抑制效应CD4 T细胞反应，有效减轻多发性硬化症模型的临床症状 | 治疗效果依赖于IL-27信号传导，且在缺乏IL-27Ra的骨髓嵌合体中无效 | 开发针对自身免疫疾病的治疗性疫苗新策略 | 多发性硬化症模型及其他自身免疫疾病 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 融合蛋白技术 | NA | RNA测序数据 | 单细胞RNA测序分析了引流淋巴结中的树突状细胞 |
| 3887 | 2024-08-08 |
Metformin Reprograms Tryptophan Metabolism to Stimulate CD8+ T-cell Function in Colorectal Cancer
2023-07-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3042
PMID:37195082
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了二甲双胍如何通过重编程色氨酸代谢来刺激结直肠癌中的CD8+ T细胞功能 | 首次展示了二甲双胍通过调节色氨酸代谢，增强CD8+ T细胞的抗癌免疫功能 | NA | 探讨二甲双胍在结直肠癌中通过重编程色氨酸代谢来刺激CD8+ T细胞功能的机制 | 结直肠癌中的免疫细胞和色氨酸代谢 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单细胞分辨率的结直肠癌肿瘤微环境中的细胞 |
| 3888 | 2024-08-08 |
Monocytes differentiate along two alternative pathways during sterile inflammation
2023-Jul-05, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256308
PMID:37191947
|
研究论文 | 本研究使用时间单细胞RNA测序技术，在体外模型中同时分化人类单核细胞为巨噬细胞和树突状细胞，探讨这两种细胞是否源自不同的分化途径 | 首次揭示单核细胞在炎症过程中沿两条不同路径分化，并确定了影响这些分化的关键转录因子 | NA | 探讨单核细胞在炎症中的分化路径及其调控机制 | 单核细胞、巨噬细胞和树突状细胞的分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和鼠类的单核细胞样本 |
| 3889 | 2024-08-05 |
Seven-colour multiplex immunochemistry/immunofluorescence and whole slide imaging of frozen sections
2023-07, Journal of immunological methods
IF:1.6Q4
DOI:10.1016/j.jim.2023.113490
PMID:37172777
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研究论文 | 本研究提出了一种新的七色多重免疫化学/免疫荧光成像工作流程，以在冷冻组织切片中同时检测七个生物标志物 | 该方法允许在冷冻切片中同时标记和检测多个标志物，克服了传统荧光显微镜所面临的处理限制 | 该方法的适用性可能受到样本类型和组织切片质量的限制 | 研究旨在开发一种新的影像工作流程，以便在肿瘤免疫微环境研究中实现多标志物的同时检测 | 研究对象为转移性黑色素瘤中的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 肿瘤 | 多重免疫化学/免疫荧光 (mIHC/IF) | NA | 图像 | NA |
| 3890 | 2024-08-05 |
Receptor for hyaluronan-mediated motility (RHAMM) defines an invasive niche associated with tumor progression and predicts poor outcomes in breast cancer patients
2023-07, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6082
PMID:37186300
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研究论文 | 本研究探讨了RHAMM在乳腺癌进展中的作用，并提出了新的预后标志。 | 开发了27基因RHAMM相关标志（RRS），并证明其在乳腺癌患者中的预后价值。 | 尚未完全建立RHAMM表达与肿瘤进展之间的因果关系。 | 研究RHAMM如何影响乳腺癌的侵袭性及其与预后之间的关系。 | 研究乳腺癌患者中RHAMM的表达及其与肿瘤微环境的相互作用。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | CRISPR/Cas9 | 细胞转化模型 | 基因表达数据 | 内部乳腺癌患者队列以及独立队列 |
| 3891 | 2024-08-05 |
Target enrichment of uncultured human oral bacteria with phage-derived molecules found by single-cell genomics
2023-Jul, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2023.04.005
PMID:37188549
|
研究论文 | 该研究探讨了利用噬菌体衍生分子检测和分离未培养的人类口腔细菌。 | 创新点在于使用多重单细胞测序获取大量未培养的口腔细菌基因组，并基于未培养细菌的SAG设计了能选择性捕捉特定细菌的分子。 | 该研究未能全面了解这些未培养细菌的功能和存在模式。 | 研究的目的是探索噬菌体衍生分子在检测和分离未培养细菌中的应用。 | 研究对象为人类口腔中的未培养细菌。 | 微生物组学 | NA | 单细胞基因组学 | NA | 基因组数据 | 450个单放大基因组(SAGs) |
| 3892 | 2024-08-08 |
Navigating the immunometabolic heterogeneity of B cells in murine hepatocellular carcinoma at single cell resolution
2023-Jul, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110257
PMID:37182447
|
研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠肝细胞癌模型中B细胞的组成、分布、表型、功能和代谢特征 | 首次详细描述了肝细胞癌微环境中B细胞的代谢异质性及其对功能的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 深入理解肝细胞癌中B细胞的免疫学特性，为免疫治疗提供新靶点 | 肝细胞癌中的B细胞及其代谢状态 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自同种异体肝细胞癌小鼠模型的肝细胞癌和邻近肝组织 |
| 3893 | 2024-08-08 |
Cystathionine-γ-lyase attenuates inflammatory response and pain of osteoarthritis
2023-Jul, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110289
PMID:37182456
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研究论文 | 研究探讨了胱硫醚-γ-裂解酶（CSE）在减轻骨关节炎（OA）炎症反应和疼痛中的作用 | 首次发现CSE通过抑制NF-κB信号通路减轻OA中的炎症和退行性变化 | NA | 探索CSE作为治疗骨关节炎潜在疗法的效果 | 骨关节炎患者的炎症反应和疼痛 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和免疫组织化学 | NA | RNA | 涉及人类软骨和前交叉韧带切断（ACLT）大鼠模型 |
| 3894 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Atlas of Newcastle Disease Virus in Chickens Both In Vitro and In Vivo
2023-06-15, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.05121-22
PMID:37191506
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了新城疫病毒（NDV）感染鸡肺组织细胞和鸡胚成纤维细胞系DF-1的异质性反应 | 首次在单细胞转录组水平上描述了NDV在鸡肺中的目标细胞类型，并区分了病毒感染和未感染细胞，揭示了病毒感染后的主要信号通路和细胞间通讯 | NA | 研究新城疫病毒（NDV）在鸡体内的细胞内复制及其在不同细胞类型中宿主反应的异质性 | 鸡肺组织细胞和鸡胚成纤维细胞系DF-1 | 数字病理学 | 家禽疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及鸡肺组织细胞和鸡胚成纤维细胞系DF-1的多个细胞样本 |
| 3895 | 2024-08-08 |
Remodeling of the immune and stromal cell compartment by PD-1 blockade in mismatch repair-deficient colorectal cancer
2023-06-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.04.011
PMID:37172580
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了错配修复缺陷和微卫星不稳定性高（d-MMR/MSI-H）结直肠癌患者在接受新辅助PD-1阻断治疗后，免疫和基质细胞的动态变化。 | 研究发现，在病理完全反应（pCR）的肿瘤中，治疗后CD8 Trm-mitotic、CD4 Tregs、促炎性IL1B Mono和CCL2 Fibroblast的数量减少，而CD8 Tem、CD4 Th、CD20 B和HLA-DRA Endothelial细胞的比例增加。 | NA | 揭示免疫检查点抑制剂治疗成功机制，并寻找提高治疗效果的潜在靶点。 | 错配修复缺陷和微卫星不稳定性高的结直肠癌患者。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 19名患者 |
| 3896 | 2024-08-05 |
Mathematics of neural stem cells: Linking data and processes
2023-06, Cells & development
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.cdev.2023.203849
PMID:37179018
|
综述 | 本文解释了数学建模如何改善对成人大脑中干细胞动态的机制理解 | 结合单细胞测序技术和数学建模，为干细胞生物学领域的一些重要问题提供了独特的机会 | NA | 探讨成人干细胞动态的数学建模及单细胞测序的影响 | 成人干细胞及其分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 数学模型 | 细胞数据 | NA |
| 3897 | 2024-08-05 |
Early alterations in the MCH system link aberrant neuronal activity and sleep disturbances in a mouse model of Alzheimer's disease
2023-06, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01325-4
PMID:37188873
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研究论文 | 本研究表明MCH系统在早期阿尔茨海默病中的变化与异常神经活动和睡眠障碍相关 | 发现MCH系统在早期阿尔茨海默病中脆弱，且其功能受损与异常兴奋性驱动和睡眠缺陷相关 | 未提及特定的样本限制或实验条件的局限性 | 研究MCH系统在早期阿尔茨海默病中的作用及其对神经活动和睡眠质量的影响 | 使用阿尔茨海默病小鼠模型作为研究对象 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组分析 | NA | 细胞和神经元活动数据 | App小鼠和阿尔茨海默病患者的样本 |
| 3898 | 2024-08-05 |
Hes1 marks peri-condensation mesenchymal cells that generate both chondrocytes and perichondrial cells in early bone development
2023-06, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.104805
PMID:37172728
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研究论文 | 本研究展示了围绕凝聚体的间充质细胞对软骨和膜软骨的贡献 | 首次明确了Hes1标记的间充质细胞在早期骨发育中的重要性 | 未探讨Hes1在不同发育阶段的功能变化 | 探究早期骨发育中间充质细胞的角色 | 位于骨骼发育中的间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | Prrx1-cre标记的肢芽间充质细胞 |
| 3899 | 2024-08-08 |
An empirical Bayes method for differential expression analysis of single cells with deep generative models
2023-05-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2209124120
PMID:37192164
|
研究论文 | 本文提出了一种基于深度生成模型的单细胞差异表达分析的贝叶斯方法lvm-DE | lvm-DE方法利用深度生成模型的不确定性进行差异表达分析，并能控制假发现率(FDR) | NA | 开发一种新的方法来进行单细胞RNA测序数据的差异表达分析 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 深度生成模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 3900 | 2024-08-05 |
A scalable unsupervised learning of scRNAseq data detects rare cells through integration of structure-preserving embedding, clustering and outlier detection
2023-05-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad125
PMID:37185897
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研究论文 | 本文提出了一种新的框架用于聚类大规模单细胞数据并识别稀有细胞亚群体 | 创新点在于结合了保持结构的嵌入、聚类和异常检测的方法，特别是使用了PaCMAP和高斯混合模型来处理稀疏的高维单细胞RNA-seq数据 | 对高维数据的准确聚类方法仍然存在挑战，尽管本研究提供了一种新的方法，但在某些情况下可能仍不够准确 | 旨在通过单细胞RNA-seq分析，开发更有效的聚类和稀有细胞识别方法 | 研究对象为单细胞RNA-seq数据中的稀有细胞亚群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 高斯混合模型，孤立森林，单类支持向量机 | 单细胞RNA-seq数据 | 使用多种公开数据集进行验证，涉及不同的细胞类型和稀有细胞亚群体 |