单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
3861 2024-08-05
Analysis of immunogenic cell death in ascending thoracic aortic aneurysms based on single-cell sequencing data
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文研究了免疫原性细胞死亡在升主动脉瘤中的作用 首次探讨了免疫原性细胞死亡在心血管疾病,特别是在升主动脉瘤中的角色 未进行临床试验和小规模的样本验证,需进一步研究结合临床数据 研究免疫原性细胞死亡在升主动脉瘤中的作用及机制 升主动脉瘤中的单细胞RNA测序数据及其相关细胞类型 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 从RNA测序数据中识别出10种细胞类型
3862 2024-08-05
Single-cell landscape dissecting the transcription and heterogeneity of innate lymphoid cells in ischemic heart
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文揭示了缺血性心脏病中天然淋巴细胞(ILCs)的转录异质性及其亚群的角色 首次在心脏中识别出新ILC亚群,并利用单细胞测序技术分析ILC的多样性 未详细阐述ILC在缺血性心脏病中具体的细胞和分子机制 研究ILC在心肌缺血性疾病中的作用及其相关机制 8周龄男性C57BL/6J小鼠,分为心肌梗死、缺血再灌注损伤和对照组 数字病理学 心血管疾病 单细胞测序 NA 细胞 共有三组小鼠样本,包括心肌梗死、缺血再灌注损伤和对照组
3863 2024-08-07
Different iPSC-derived neural stem cells shows various spectrums of spontaneous differentiation during long term cultivation
2023, Frontiers in molecular neuroscience IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了不同来源的iPSC衍生的神经干细胞在长期培养过程中自发分化的谱系变化 首次详细分析了不同iPSC衍生神经干细胞在长期培养中的自发分化谱系变化 研究仅限于体外培养条件,未涉及体内环境的影响 旨在优化神经干细胞的生产和长期培养协议 不同来源的iPSC衍生的神经干细胞 干细胞研究 神经退行性疾病 免疫细胞化学、qPCR、bulk转录组和单细胞RNA测序 NA 细胞 四条不同的iPSC细胞系
3864 2024-08-07
Classification of tuberculosis-related programmed cell death-related patient subgroups and associated immune cell profiling
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过分析结核病(TB)相关数据集中的免疫细胞谱,识别并验证了与程序性细胞死亡(PCD)相关的基因表达模式,以此来分层TB患者并探讨其与免疫细胞丰度的关系 首次通过机器学习方法筛选出与PCD相关的关键基因,并利用这些基因对TB患者进行分层,进一步验证了这些分层在独立数据集中的有效性 研究主要基于公共数据库的数据,未来需要更多的临床样本验证这些发现 旨在通过PCD相关基因的表达模式来分层TB患者,并探讨其与免疫细胞丰度的关系,为TB的诊断和治疗提供新的策略 结核病患者及其PCD相关基因表达模式 数字病理学 结核病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 机器学习 基因表达数据 TB患者样本
3865 2024-08-07
Bayesian Data Selection
2023, Journal of machine learning research : JMLR IF:4.3Q2
PMID:37206375
研究论文 本文介绍了“数据选择”问题,并提出了一种新的评分方法——Stein体积准则(SVC),用于在高维数据中发现与给定参数模型匹配的低维统计量 提出了Stein体积准则(SVC),这是一种不需拟合非参数模型的新型数据选择评分方法 NA 旨在解决高维数据中数据选择的问题,并提出一种新的评分方法以提高效率和统计性能 高维数据和单细胞RNA测序数据集 机器学习 NA 单细胞RNA测序 概率主成分分析和自旋玻璃模型 高维数据 NA
3866 2024-08-07
TYROBP-positive endothelial cell-derived TWEAK as a promoter of osteosarcoma progression: insights from single-cell omics
2023, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了TYROBP阳性内皮细胞在骨肉瘤进展中的作用,特别是通过分泌TWEAK介导的与恶性细胞的相互作用 首次揭示了TYROBP阳性内皮细胞作为骨肉瘤进展的启动细胞,并通过TWEAK介导与恶性细胞的强相互作用 研究主要基于体外实验和单细胞转录组数据,需要进一步的体内实验验证 探索骨肉瘤中内皮细胞的启动细胞及其与恶性细胞的潜在相互作用 骨肉瘤中的内皮细胞及其与恶性细胞的相互作用 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 6名骨肉瘤患者
3867 2024-08-07
Identification and validation of a novel signature based on cell-cell communication in head and neck squamous cell carcinoma by integrated analysis of single-cell transcriptome and bulk RNA-sequencing
2023, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组和批量RNA测序数据,识别并验证了基于细胞间通讯的头颈鳞状细胞癌(HNSCC)新型标志物。 开发了一种基于细胞间通讯相关基因的新型标志物,具有强大的预测HNSCC患者预后和免疫治疗反应的能力。 NA 研究HNSCC肿瘤免疫微环境中复杂的通讯网络,阐明免疫细胞与肿瘤之间的相互作用,并建立预后风险模型。 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的细胞间通讯网络及其对患者临床结果的影响。 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序 NA 转录组数据 20个HNSCC样本
3868 2024-08-07
Metabolic profiling reveals altered tryptophan metabolism in patients with kawasaki disease
2023, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 研究探讨了川崎病患者的代谢变化,特别是色氨酸代谢,以确定新的诊断和预后生物标志物 发现了川崎病患者中色氨酸代谢途径的显著改变,并提出代谢指标可能作为新的诊断和治疗生物标志物 NA 研究川崎病患者的代谢变化,寻找新的诊断和预后生物标志物 川崎病患者和健康对照组的色氨酸代谢 代谢组学 川崎病 代谢组学 NA 代谢物数据 包括川崎病患者和健康对照组,以及川崎病冠状动脉炎小鼠模型
3869 2024-08-07
Assessing the effects of aging on the renal endothelial cell landscape using single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了衰老对小鼠肾脏内皮细胞转录组的影响 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了衰老过程中肾脏内皮细胞的转录组变化,并确认了免疫调节信号的变化 NA 探究衰老对肾脏内皮细胞的影响及其机制 小鼠肾脏内皮细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组 NA
3870 2024-08-07
Heme oxygenase-1 determines the cell fate of ferroptotic death of alveolar macrophages in COPD
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了慢性阻塞性肺疾病(COPD)中肺泡巨噬细胞的铁死亡命运及其与疾病发展的关系 首次揭示了M2型肺泡巨噬细胞通过调节脂质和铁稳态影响铁死亡敏感性,而M1型肺泡巨噬细胞则表现出对铁死亡的抵抗性 研究主要基于动物模型和体外实验,需要进一步的人体临床试验验证 探讨COPD中肺泡巨噬细胞的铁死亡机制及其对疾病发展的影响 COPD患者的肺组织和肺泡巨噬细胞 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 基因表达数据 包括25名额外受试者和RAW 264.7巨噬细胞,以及实验性香烟烟雾诱导的COPD小鼠模型
3871 2024-08-07
Comprehensive Analyses Reveal Effects on Tumor Immune Infiltration and Immunotherapy Response of APOBEC Mutagenesis and Its Molecular Mechanisms in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2023, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本文通过收集169名食管鳞状细胞癌(ESCC)患者的匹配多组学数据,利用多种生物信息学方法评估APOBEC突变对肿瘤免疫浸润和免疫治疗反应的影响及其分子机制 首次发现AOBEC3A活性主要由FOSL1转激活,并通过上调加剧细胞质双链DNA积累,从而刺激cGAS-STING途径 NA 探讨APOBEC突变在食管鳞状细胞癌中的功能角色及其对免疫治疗的影响 食管鳞状细胞癌患者的免疫浸润和免疫治疗反应 数字病理学 食管鳞状细胞癌 RNA测序(scRNA-seq) NA 多组学数据 169名食管鳞状细胞癌患者
3872 2024-08-07
C-C motif chemokine receptor 2 inhibition reduces liver fibrosis by restoring the immune cell landscape
2023, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了C-C基序趋化因子受体2(CCR2)抑制通过恢复免疫细胞景观减轻肝纤维化的机制 本研究揭示了CVC通过恢复免疫细胞景观减轻肝纤维化的新机制,并抑制了CCR2-STAT1/NFκB/ERK信号通路中的促纤维化基因转录 NA 探讨CCR2抑制减轻肝纤维化的机制 肝纤维化及其相关机制 NA 肝病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 野生型小鼠和敲除小鼠
3873 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood reveals immune cell dysfunction in premature ovarian insufficiency
2023, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了早发性卵巢功能不全(POI)患者外周血单个核细胞(PBMC)的特征,探讨了免疫反应在POI中的潜在作用 首次通过单细胞RNA测序揭示了POI患者PBMC中免疫细胞的功能障碍,并识别了相关的差异表达基因和细胞间通讯变化 研究样本量较小,仅包括三名正常受试者和三名POI患者 分析POI患者外周血单个核细胞的特征,探索免疫系统在POI中的作用 早发性卵巢功能不全(POI)患者的外周血单个核细胞(PBMC) 数字病理学 妇科疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 三名正常受试者和三名POI患者
3874 2024-08-08
Machine learning-based glycolysis-associated molecular classification reveals differences in prognosis, TME, and immunotherapy for colorectal cancer patients
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过结合转录组和单细胞分析,利用机器学习方法基于糖酵解相关基因在结直肠癌中识别新的分子亚型,为结直肠癌患者提供治疗方向 首次探讨了糖酵解相关基因在结直肠癌中的整体意义及其对免疫微环境的影响,并开发了基于单细胞和糖酵解相关簇的预测模型 NA 研究糖酵解相关基因在结直肠癌中的作用及其对免疫微环境的影响 结直肠癌患者的糖酵解相关基因表达模式及其与免疫微环境的关系 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序分析 机器学习方法 转录组数据 NA
3875 2024-08-08
Fibroblast growth factor receptor 1 as a potential marker of terminal effector peripheral T helper cells in rheumatoid arthritis patients
2023-11-02, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 本研究旨在探讨纤维母细胞生长因子受体1(FGFR1)在类风湿性关节炎(RA)患者CD4+ T细胞中的表达及其在疾病发病机制中的作用 首次揭示了FGFR1在RA患者外周血和滑膜中CD4+ T细胞的表达情况,并发现FGFR1阳性Tph细胞具有终末效应细胞表型 NA 研究FGFR1在RA患者CD4+ T细胞中的表达及其在疾病发病机制中的作用 RA患者的CD4+ T细胞 免疫学 类风湿性关节炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞 RA患者和健康对照组的外周血和滑膜CD4+ T细胞
3876 2024-08-08
scRNA-seq and proteomics reveal the distinction of M2-like macrophages between primary and recurrent malignant glioma and its critical role in the recurrence
2023-11, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,揭示了原发性和复发性恶性胶质瘤中M2样肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的差异及其在复发中的关键作用 本研究首次详细描述了原发性和复发性恶性胶质瘤中M2样TAMs的差异,并揭示了其在肿瘤复发中的动态基因表达变化和细胞间相互作用机制 研究样本仅来自6名患者,可能限制了结果的普遍性和广泛适用性 探讨原发性和复发性恶性胶质瘤中M2样TAMs的差异及其在复发中的作用 原发性和复发性恶性胶质瘤中的M2样肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 23,010个单细胞来自6名患者
3877 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing reveals the cellular and molecular characteristics of high-grade and metastatic bladder cancer
2023-Oct, Cellular oncology (Dordrecht)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了高级别和转移性膀胱癌的细胞和分子特征 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了膀胱癌的细胞类型比例和基因表达谱,揭示了肿瘤微环境中细胞间的通信机制 NA 探究高级别和转移性膀胱癌的细胞和分子特征,为未来的治疗提供潜在的治疗靶点 膀胱癌的邻近正常组织、原发肿瘤和淋巴结转移样本 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 共50,158个细胞
3878 2024-08-08
Clearance of Stress-Induced Premature Senescent Cells Alleviates the Formation of Abdominal Aortic Aneurysms
2023-Oct-01, Aging and disease IF:7.0Q1
研究论文 本文研究了压力诱导的过早衰老(SIPS)细胞在腹主动脉瘤(AAA)形成中的作用,并探讨了使用senolytic药物ABT263抑制SIPS作为治疗AAA的潜在策略。 首次揭示了SIPS通过激活FGF9/PDGFRβ/ERK1/2信号通路促进血管平滑肌细胞(VSMCs)表型转换,从而促进AAA的发展和进展。 NA 探讨SIPS在腹主动脉瘤形成中的作用及使用senolytic药物ABT263抑制SIPS的治疗潜力。 腹主动脉瘤患者和年轻小鼠的SIPS细胞,以及血管平滑肌细胞(VSMCs)的表型转换。 NA 心血管疾病 RNA测序和单细胞RNA测序 NA RNA 腹主动脉瘤患者和小鼠样本
3879 2024-08-05
Role of Gltp in Maturation of Oligodendrocytes Under the Regulation of Nkx2.2
2023-Sep, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了GLTP在髓鞘形成的成熟寡突胶质细胞中的作用 识别了Gltp作为髓鞘形成寡突胶质细胞中的关键脂质代谢基因并揭示了其在分化过程中的重要性 尚未明确GLTP在髓鞘发育和维持中的具体机制 研究Gltp在寡突胶质细胞分化和成熟中的功能 寡突胶质细胞及其相关基因表达 数字病理学 NA 综合组学分析,转录组分析,单细胞测序 NA 基因表达数据 独立的转录组和单细胞测序研究
3880 2024-08-08
Angiopoietin-like 4 Is a Critical Regulator of Fibroblasts during Pulmonary Fibrosis Development
2023-Sep, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 研究探讨了Angiopoietin-like 4(ANGPTL4)在特发性肺纤维化(IPF)发展中对成纤维细胞的关键调控作用 首次发现ANGPTL4在肺纤维化区域的成纤维细胞中高度表达,并且能够调控纤维化相关基因表达、细胞迁移和增殖 研究主要基于小鼠模型和IPF患者的肺成纤维细胞,可能需要更多临床数据支持 揭示ANGPTL4在肺纤维化发展中的作用机制,探索其作为IPF早期诊断标志物和治疗靶点的可能性 特发性肺纤维化患者的肺成纤维细胞和小鼠肺纤维化模型 数字病理学 肺纤维化 DNA微阵列分析 NA 基因表达数据 包括来自IPF患者肺纤维化和非纤维化区域的成纤维细胞,以及接受bleomycin处理的小鼠模型
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