单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 3841 - 3860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3841 | 2024-08-08 |
Gut AstA mediates sleep deprivation-induced energy wasting in Drosophila
2023-May-23, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00541-3
PMID:37221172
|
研究论文 | 研究使用果蝇模型探讨肠道分泌的激素Allatostatin A (AstA)在严重睡眠剥夺(SD)导致的能量消耗中的作用 | 首次揭示了肠道AstA通过促进脂肪动员激素(Akh)的释放，在睡眠剥夺导致的能量消耗中的分子机制 | NA | 探讨肠道分泌激素在睡眠剥夺导致的能量消耗中的作用及机制 | 果蝇和老鼠 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成年果蝇和睡眠剥夺小鼠 |
| 3842 | 2024-08-05 |
Differentiation and single-cell RNA-seq analyses of human pluripotent-stem-cell-derived renal organoids
2023-May-22, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102314
PMID:37220001
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研究论文 | 本文提出了一种将人类多能干细胞分化为肾类器官的协议 | 提供了一种快速且可重复的人肾发育和肾病建模模型 | NA | 研究人类多能干细胞向肾类器官分化的过程 | 人类多能干细胞及其衍生的肾类器官 | 数字病理学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 单细胞RNA-seq | NA |
| 3843 | 2024-08-07 |
Application of single-cell RNA sequencing analysis of novel breast cancer phenotypes based on the activation of ferroptosis-related genes
2023-May-22, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01086-0
PMID:37212877
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研究论文 | 本研究基于铁死亡相关基因的表达差异，利用单细胞RNA测序分析了乳腺癌的新表型，并通过机器学习建立了预测模型，验证了其在乳腺癌患者中的预后能力 | 首次利用单细胞RNA测序数据系统揭示了高和低铁死亡激活组间的微环境差异，包括转录因子激活状态、细胞伪时特征、细胞通讯、免疫浸润、化疗效率和潜在药物抵抗 | NA | 旨在建立一个基于铁死亡激活相关基因差异表达的模型，并验证其在乳腺癌中的应用 | 乳腺癌患者的铁死亡激活水平及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 使用了TCGA-BRCA数据集和GEO数据集 |
| 3844 | 2024-08-07 |
A scalable sparse neural network framework for rare cell type annotation of single-cell transcriptome data
2023-05-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04928-6
PMID:37210444
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研究论文 | 介绍了一种名为scBalance的集成稀疏神经网络框架，用于单细胞转录组数据的自动细胞类型注释 | scBalance框架结合了自适应权重采样和dropout技术，能够有效处理单细胞RNA测序数据集的不平衡问题，并提高对稀有细胞类型的识别能力 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和效率 | 单细胞转录组数据中的细胞类型注释 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 稀疏神经网络 | 转录组数据 | 20个不同规模和平衡程度的单细胞RNA测序数据集 |
| 3845 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity and intercellular crosstalk in human intervertebral disc degeneration
2023-May-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106692
PMID:37216089
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研究论文 | 这篇文章揭示了人类椎间盘退化的异质性和细胞间相互作用 | 首次通过单细胞转录组学揭示了人类椎间盘退化的微环境及其机制 | 该研究主要集中于椎间盘的转录组特征，未探讨其他生物标志物 | 探究人类椎间盘退化的微环境及其机制 | 人类椎间盘中的细胞群体及其在退化不同阶段的特征 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 3846 | 2024-08-05 |
PCNT is a prognostic biomarker correlated with tumor immune microenvironment in hepatocellular carcinoma and promotes tumor progression by inhibiting cell cycle arrest
2023-05-19, Aging
DOI:10.18632/aging.204711
PMID:37211383
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研究论文 | PCNT在肝细胞癌中作为预后生物标志物，与肿瘤免疫微环境相关，并通过抑制细胞周期停滞促进肿瘤进展 | 发现PCNT在肝细胞癌中表达升高，与不良的临床病理特征和预后相关，且抑制PCNT能降低肝细胞癌细胞的生存能力、迁移和侵袭能力 | 未详细讨论PCNT在其他癌症中的作用，实验仅限于174名患者的队列和公共数据库 | 研究PCNT在肝细胞癌中的作用及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 174名肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达和蛋白表达数据 | 174名肝细胞癌患者 |
| 3847 | 2024-08-07 |
RANK+TLR2+ myeloid subpopulation converts autoimmune to joint destruction in rheumatoid arthritis
2023-05-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85553
PMID:37204303
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研究论文 | 本文报道了在类风湿性关节炎（RA）的小鼠模型中，RANK髓系单核细胞中TLR2表达及其α(2,3)唾液酸化的上调介导了从自身免疫到破骨细胞融合和骨吸收的转变，导致关节破坏 | 发现了一种新的RANKTLR2亚群，该亚群负向调节破骨细胞融合，并提供了TRAP单核细胞在骨中的成骨活性的潜在解释 | NA | 探究类风湿性关节炎中从自身免疫到关节破坏的机制 | RANK髓系单核细胞中的TLR2表达及其α(2,3)唾液酸化 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 来自RA小鼠的单细胞RNA测序库 |
| 3848 | 2024-08-05 |
Advances in spatial transcriptomics and related data analysis strategies
2023-05-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04150-2
PMID:37202762
|
review | 本文总结了空间转录组学技术及其数据分析策略 | 论述了空间转录组学的应用及未来潜力，突出其在生物医学研究中的重大突破 | 未提到具体的技术局限，可能导致对某些应用场景的理解不足 | 探讨空间转录组学的技术及其在生物医学研究中的应用 | 空间转录组技术及其在组织结构和细胞微环境相互作用中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学技术 | NA | RNA数据 | NA |
| 3849 | 2024-08-07 |
Identification of RAC1 in promoting brain metastasis of lung adenocarcinoma using single-cell transcriptome sequencing
2023-05-18, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05823-y
PMID:37202394
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，识别了RAC1在肺腺癌脑转移中的作用及其相关生物标志物和治疗潜力 | 首次通过单细胞转录组测序技术详细分析了RAC1在肺腺癌脑转移中的作用，并验证了其在转移过程中的关键角色 | 研究样本量较小，仅基于有限的患者数据进行分析，可能影响结果的普遍性 | 探索肺腺癌脑转移中的生物标志物、相关通路及潜在治疗策略 | 肺腺癌患者的循环肿瘤细胞、原发肿瘤组织和转移肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 8名肺腺癌患者 |
| 3850 | 2024-08-07 |
The cellular and immunological dynamics of early and transitional human milk
2023-05-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04910-2
PMID:37202439
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研究论文 | 本研究利用系统方法分析了产后两周内36位母亲的人乳中的62种可溶性成分和细胞成分，并通过单细胞转录组分析识别了24种不同的上皮细胞和免疫细胞群体 | 首次详细描述了人乳中可溶性免疫和生长因子的时间动态变化，并识别了24种不同的细胞群体 | NA | 深入了解人乳中的可溶性和细胞成分，为未来人乳研究提供重要资源 | 人乳中的可溶性成分和细胞成分 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 128,016个人乳细胞 |
| 3851 | 2024-08-08 |
Interplay of spermatogonial subpopulations during initial stages of spermatogenesis in adult primates
2023-05-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201430
PMID:37222410
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研究论文 | 研究分析了成年猕猴精原细胞在精原细胞生成初期的表达谱，并与人类数据进行比较 | 发现了新的早期分化精原细胞亚群，并揭示了这些细胞在精原细胞生成过程中的作用 | NA | 探讨精原细胞亚群在成年灵长类动物精原细胞生成初期的相互作用 | 成年猕猴的精原细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 成年猕猴 |
| 3852 | 2024-08-05 |
Mild/Asymptomatic Maternal SARS-CoV-2 Infection Leads to Immune Paralysis in Fetal Circulation and Immune Dysregulation in Fetal-Placental Tissues
2023-May-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.10.540233
PMID:37214938
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研究论文 | 本研究分析了母体轻微/无症状SARS-CoV-2感染对新生儿免疫系统的影响 | 揭示了母体轻微SARS-CoV-2感染对胎儿循环中的免疫功能障碍和胎盘组织中的免疫失调的影响 | 缺乏纵向传播的证据，且研究样本涉及的母体疫苗接种情况有限 | 研究母体轻微SARS-CoV-2感染对新生儿免疫反应的影响 | 分析了来自未接种疫苗母亲的新生儿脐带血和胎盘绒毛组织 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术、单细胞转录组学、功能检测 | NA | 生物样本 | 来自无症状SARS-CoV-2感染母亲的新生儿脐带血和胎盘绒毛 |
| 3853 | 2024-08-07 |
Host genetic background regulates the capacity for anti-tumor antibody-dependent phagocytosis
2023-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.09.540046
PMID:37214876
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研究论文 | 本文研究了宿主遗传背景对肿瘤抗体依赖性吞噬作用的影响 | 首次揭示了宿主遗传因素在靶向免疫治疗中的关键调节作用，并鉴定了可能调控巨噬细胞功能的因果基因 | 研究主要基于小鼠模型，未来需在人类中验证相关发现 | 探讨宿主遗传背景如何影响抗肿瘤抗体治疗的疗效 | 遗传多样性的小鼠和BALB/c小鼠的F1杂交后代 | 免疫学 | 肿瘤 | 遗传连锁分析、定量性状位点分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、免疫细胞数据 | 使用了多种遗传背景的小鼠模型，包括DOCF1和CCxCF1模型 |
| 3854 | 2024-08-07 |
Single-cell Mayo Map ( scMayoMap ): an easy-to-use tool for cell type annotation in single-cell RNA-sequencing data analysis
2023-May-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.03.538463
PMID:37205463
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scMayoMap的单细胞RNA测序数据分析工具，用于细胞类型注释 | scMayoMap是一个用户友好的工具，无需标记的训练/参考数据集或预定义的细胞子集标记，提供了快速准确的细胞类型注释 | NA | 开发一种用户友好且精确的单细胞RNA测序数据分析工具，用于细胞类型注释 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在48个独立的单细胞RNA测序数据集中进行了验证 |
| 3855 | 2024-08-08 |
CAR T-cell detection scoping review: an essential biomarker in critical need of standardization
2023-05, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-006596
PMID:37217245
|
综述 | 本文通过范围综述评估了CAR T细胞扩增和持久性数据的异质性，强调了建立CAR T细胞检测报告标准的迫切需求。 | 提出了建立CAR T细胞检测和报告的统一标准，以改善患者接受CAR T细胞疗法的疗效。 | 目前CAR T细胞检测方法、检测频率和间隔以及定量数据报告存在显著变异性，限制了试验间和构建体间的比较。 | 评估CAR T细胞扩增和持久性数据的异质性，并强调建立统一报告标准的重要性。 | CAR T细胞的扩增和持久性数据，以及检测和报告方法的变异性。 | NA | NA | 流式细胞术和定量PCR | NA | 定量数据 | 分析了21个临床试验中的60篇论文 |
| 3856 | 2024-08-08 |
Identification of Hif1α as a Potential Participant in Autoimmune Uveitis Pathogenesis Using Single-Cell Transcriptome Analysis
2023-05-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.5.24
PMID:37227746
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了自身免疫性葡萄膜炎（AU）发病机制中的转录变化，并识别了潜在的治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了Hif1α在自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的作用 | 研究主要基于实验模型和部分人类样本，需要进一步的人体临床试验验证 | 揭示自身免疫性葡萄膜炎的转录变化并识别潜在的治疗靶点 | 自身免疫性葡萄膜炎的发病机制及治疗靶点 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）模型鼠、EAU对照组鼠及正常鼠的颈部引流淋巴结细胞 |
| 3857 | 2024-08-07 |
Endometrial Receptivity During the Preimplantation Period: A Narrative Review
2023-Apr, Cureus
DOI:10.7759/cureus.37753
PMID:37214054
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综述 | 本文综述了影响子宫内膜容受性的多种因素，包括激素调节和分子机制，以及评估子宫内膜容受性的潜在生物标志物 | 近期转录组学和蛋白质组学技术的进步已识别出几个可能增强预测子宫内膜容受性能力的候选生物标志物 | 尽管缺乏可靠的生物标志物，但已提出多种治疗策略以改善子宫内膜容受性 | 旨在阐明影响子宫内膜容受性的各种因素 | 子宫内膜容受性的激素调节、分子机制及潜在生物标志物 | NA | NA | 单细胞RNA测序和基于质谱的蛋白质组学 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | NA |
| 3858 | 2024-08-05 |
Integrating Bulk-seq and Single-cell-seq Reveals Estrogen and MAPK Pathways Associating with Neuroblastoma Outcome
2023 Jan-Dec, Cancer control : journal of the Moffitt Cancer Center
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10732748231178177
PMID:37219000
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研究论文 | 本研究揭示了雌激素和MAPK通路与神经母细胞瘤结局相关的发现。 | 整合了Bulk-seq和单细胞测序，并提出了三基因预后签名，具有优秀的预测性能。 | 研究中的样本量和外部验证的数量可能限制结果的普适性。 | 探讨神经母细胞瘤中的信号通路活动与治疗前景的关系。 | 以神经母细胞瘤患者为研究对象，分析信号通路活动。 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | Bulk-seq和单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因组数据 | 涉及的样本数量未明确说明 |
| 3859 | 2024-08-05 |
Integrated multi-omics analysis reveals insights into Chinese forest musk deer (Moschus berezovskii) genome evolution and musk synthesis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1156138
PMID:37228656
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研究论文 | 本文探讨了中国林麝基因组演化和麝香合成的见解。 | 通过对中国林麝组织的基因组重注释，识别了三个扩展的基因家族，并揭示了麝香腺的细胞组成和转录特征。 | 研究仅基于有限数量的样本，且仍需进一步探讨麝香腺的功能特征。 | 探讨麝香腺形成的基因基础和麝香合成过程。 | 中国林麝的麝香腺组织，包括两只幼年和三只成年麝鹿。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据, mRNA表达数据 | 5个样本（2只幼年和3只成年中国林麝） |
| 3860 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals a unique pericyte type associated with capillary dysfunction
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.83532
PMID:37215579
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了一种与毛细血管功能障碍相关的独特周细胞类型 | 首次描绘了来自小鼠视网膜的超过76,000个单细胞转录组，并识别了与视网膜毛细血管功能障碍相关的周细胞亚群 | 主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类疾病的复杂性 | 探索毛细血管功能障碍中周细胞的异质性及其分子特征 | 小鼠视网膜中的周细胞及其在毛细血管功能障碍中的作用 | 数字病理学 | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 来自4只小鼠视网膜的76,000个单细胞转录组 |