单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 3781 - 3800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3781 | 2024-08-05 |
Single-nucleus ribonucleic acid-sequencing and spatial transcriptomics reveal the cardioprotection of Shexiang Baoxin Pill (SBP) in mice with myocardial ischemia-reperfusion injury
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1173649
PMID:37229263
|
研究论文 | 本研究探讨了雪香百补丸（SBP）在小鼠心肌缺血再灌注损伤中的心脏保护机制 | 该研究通过单细胞核RNA测序和空间转录组学首次揭示了SBP对心肌缺血再灌注损伤的保护作用及其相关的细胞机制 | 研究主要是在小鼠模型中进行的，尚需在人类或其他动物模型中验证结果 | 探讨雪香百补丸在心肌缺血再灌注损伤中的潜在机制 | C57BL/6小鼠样本，使用心肌缺血再灌注模型进行研究 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞核RNA测序，空间转录组学 | NA | 细胞数据 | 9个样本来自9个个体，获得了75,546个细胞 |
| 3782 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Reactive astrogliosis in the era of single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1212975
PMID:37256151
|
更正 | 本文为先前发表文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3783 | 2024-08-05 |
Comprehensive transcriptomic analysis and meta-analysis identify therapeutic effects of N-acetylcysteine in nonalcoholic fatty liver disease
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1186582
PMID:37256235
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meta-analysis | 本研究通过转录组学分析和元分析探讨了N-乙酰半胱氨酸在非酒精性脂肪肝病中的治疗作用 | 本研究首次系统评估了N-乙酰半胱氨酸在非酒精性脂肪肝病中的疗效，并提供了转录组学数据支持 | 本研究仅基于13项临床前研究，可能不足以得出全面的结论 | 调查N-乙酰半胱氨酸在非酒精性脂肪肝病中的疗效 | 临床前研究中的多项关于N-乙酰半胱氨酸的研究 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 13项研究 |
| 3784 | 2024-08-05 |
Bulk and Single-Cell RNA-Seq Analyses for Studies of Spermatogonia
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3139-3_4
PMID:37249866
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研究论文 | 本文介绍了用于研究哺乳动物睾丸转录组的批量和单细胞RNA测序分析方法 | 提出了针对大量和单个细胞的RNA测序的生物信息学工作流程的稳健选项 | 未提及具体的限制 | 研究睾丸转录组的转录物丰度 | 涉及数百到数百万个细胞的样本以及单个细胞 | 数字病理学 | NA | 下一代测序（NGS） | NA | mRNA | 数百到数百万个细胞的样本 |
| 3785 | 2024-08-07 |
Cellular dynamics of distinct skeletal cells and the development of osteosarcoma
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1181204
PMID:37229448
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综述 | 本文综述了不同骨骼细胞的动态变化及其在骨肉瘤发展中的作用 | 利用单细胞RNA测序分析和小鼠谱系追踪方法揭示了骨骼干细胞及其谱系细胞的多样性 | 骨肉瘤的起源尚未完全阐明，对整个骨骼细胞多样性和动态的了解不足 | 探讨多种骨骼细胞类型的多样性和动态，以及骨肉瘤在原生环境中的起源 | 骨骼干细胞、前体细胞、成骨细胞、软骨细胞、骨髓基质细胞和脂肪细胞等骨骼细胞类型 | 数字病理学 | 骨癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 |
| 3786 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing and traditional RNA sequencing reveals the role of cancer-associated fibroblasts in oral squamous cell carcinoma cohort
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1195520
PMID:37234985
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和传统RNA测序，探讨了口腔鳞状细胞癌（OSCC）与牙周病之间的潜在关联，并构建了基于癌症相关成纤维细胞（CAFs）的风险模型。 | 本研究首次构建了基于CAFs的牙周病相关风险模型，并通过单细胞RNA测序获得了CAFs的生物标志物。 | NA | 探索口腔鳞状细胞癌与牙周病之间的潜在关联，并构建相关的风险模型。 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）患者及癌症相关成纤维细胞（CAFs）。 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归分析，COX回归分析 | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3787 | 2024-08-07 |
Single-Molecule Fluorescence In Situ Hybridization for Spatial Detection of mRNAs in Sections of Mammalian Testes
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3139-3_3
PMID:37249865
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研究论文 | 本文介绍了一种结合单分子荧光原位杂交（smFISH）和间接免疫荧光（IIF）的方法，用于在小鼠睾丸切片中同时可视化mRNA和蛋白质 | 本文采用RNAscope方法进行多重smFISH，并与IIF结合，提高了检测的特异性和与单细胞RNA测序（scRNA-seq）的一致性 | NA | 验证并空间重映射在分离细胞中描述的mRNA表达模式到其原始组织 | 小鼠睾丸组织中的mRNA和蛋白质 | 数字病理学 | NA | 单分子荧光原位杂交（smFISH） | NA | 图像 | 涉及小鼠睾丸的冷冻切片 |
| 3788 | 2024-08-07 |
Combined analysis of single-cell and bulk RNA sequencing reveals the expression patterns of circadian rhythm disruption in the immune microenvironment of Alzheimer's disease
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1182307
PMID:37251379
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研究论文 | 本研究结合单细胞和批量RNA测序技术，揭示了阿尔茨海默病免疫微环境中昼夜节律紊乱的表达模式 | 首次在单细胞水平上揭示了阿尔茨海默病微环境中基于昼夜节律紊乱的细胞亚型，并提出了一个强有力的昼夜节律紊乱特征签名用于阿尔茨海默病的诊断 | NA | 探索昼夜节律紊乱在阿尔茨海默病免疫微环境中的功能及其对疾病发展的影响 | 阿尔茨海默病患者的免疫微环境和昼夜节律相关基因的表达 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序，RT-PCR | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 涉及阿尔茨海默病患者的单细胞RNA测序数据和批量转录组数据 |
| 3789 | 2024-08-07 |
CD16+ monocytes are involved in the hyper-inflammatory state of Prader-Willi Syndrome by single-cell transcriptomic analysis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1153730
PMID:37251380
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了CD16+单核细胞在Prader-Willi综合征（PWS）患者中过度炎症状态的作用 | 首次在单细胞水平上扩展了我们对PWS外周免疫细胞的了解 | NA | 探讨PWS患者中CD16+单核细胞在过度炎症状态中的作用 | PWS患者的外周免疫细胞 | NA | Prader-Willi综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和高维流式细胞术（CyTOF） | NA | 细胞 | 健康对照组13人，PWS患者10人，scRNA-seq和CyTOF分析中PWS患者6人，健康对照组12人 |
| 3790 | 2024-08-07 |
Identification of the shared gene signatures and molecular mechanisms between multiple sclerosis and non-small cell lung cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1180449
PMID:37251402
|
研究论文 | 本研究旨在识别多发性硬化症（MS）和非小细胞肺癌（NSCLC）之间的共享基因特征和分子机制 | 本研究首次识别了MS和NSCLC之间最显著的共享基因PDE4A，并探讨了其在NSCLC患者中的表达及其对患者预后的影响和分子机制 | 本研究的局限性在于对MS和NSCLC之间分子机制的研究尚不完全 | 识别MS和NSCLC之间的共享基因特征、共享局部免疫微环境和分子机制 | 多发性硬化症（MS）和非小细胞肺癌（NSCLC） | NA | 多发性硬化症，非小细胞肺癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个GEO数据集，包括GSE19188，GSE214334，GSE199460，和GSE148071 |
| 3791 | 2024-08-07 |
Identification of a chemoresistance-related prognostic gene signature by comprehensive analysis and experimental validation in pancreatic cancer
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1132424
PMID:37251940
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研究论文 | 本研究通过综合分析和实验验证，在胰腺癌中识别出与化疗耐药相关的预后基因特征 | 开发了一个与化疗耐药相关的五基因特征，并构建了一个预测诺模图，该特征不仅是一个独立的预后因子，还是一个预测化疗耐药、肿瘤突变负荷和免疫细胞的生物标志物 | NA | 旨在识别调控化疗耐药的关键基因，并开发一个与化疗耐药相关的基因特征用于预后预测 | 胰腺癌细胞系和基因表达数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RT-qPCR, Western blot, CCK-8 | LASSO Cox风险模型 | 基因表达数据 | 30个胰腺癌细胞系，四个GEO数据集（GSE28735, GSE62452, GSE85916, GSE102238） |
| 3792 | 2024-08-07 |
Chondrocyte-like cells in nucleus pulposus and articular chondrocytes have similar transcriptomic profiles and are paracrine-regulated by hedgehog from notochordal cells and subchondral bone
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1151947
PMID:37255604
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学分析，探讨了椎间盘核（NP）中的软骨细胞样细胞（CLCs）与关节软骨细胞之间的转录组相似性及其调控机制 | 首次揭示了CLCs和部分关节软骨细胞具有相似的基因表达谱，并受来自脊索细胞和软骨下骨的旁分泌刺猬蛋白调控 | 研究样本仅限于三岁猕猴，且未包括软骨下骨样本进行单细胞RNA测序 | 阐明NP和软骨细胞中的细胞调控机制 | 椎间盘核中的软骨细胞样细胞和关节软骨细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 三岁猕猴的关节软骨和椎间盘核样本 |
| 3793 | 2024-08-07 |
Gene representation in scRNA-seq is correlated with common motifs at the 3' end of transcripts
2023, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2023.1120290
PMID:37255988
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研究论文 | 研究探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）中基因表达的稀疏性及其与转录本3'端常见motif的关系 | 发现了一组在scRNA-seq中经常被低估的基因，并观察到这些基因的3'端富集了poly(T) motif，这可能是导致它们在scRNA-seq中被低估的机制 | 研究依赖于公共数据源，可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 探究scRNA-seq中是否存在更容易被低估的基因以及这些基因的共同特征 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达及其与转录本3'端motif的关系 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 53个人类样本 |
| 3794 | 2024-08-07 |
Mast cell marker gene signature: prognosis and immunotherapy response prediction in lung adenocarcinoma through integrated scRNA-seq and bulk RNA-seq
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1189520
PMID:37256127
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序数据，开发了一种与肥大细胞相关的基因（MRGs）签名，用于预测肺腺癌（LUAD）患者的预后和免疫治疗反应 | 首次通过scRNA-seq技术确定肥大细胞特异性标记基因，并开发了一种新的MRGs签名，用于区分LUAD患者的高风险和低风险群体 | 研究主要基于数据分析，需要进一步的临床试验验证其临床应用效果 | 研究肥大细胞在肺腺癌预后和免疫治疗反应中的作用 | 肺腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及多个训练和验证队列，具体样本数量未详细说明 |
| 3795 | 2024-08-05 |
TGF-β-p-STAT1-LAIR2 axis has a "self-rescue" role for exhausted CD8+ T cells in hepatocellular carcinoma
2023-Dec, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-023-00830-9
PMID:37223874
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研究论文 | 本研究探讨了TGF-β在肝细胞癌中对CD8+ T细胞功能的影响 | 发现TGF-β-p-STAT1-LAIR2轴具有CD8+ T细胞的“自我拯救”机制 | 该“自我拯救”机制在TGF-β刺激下存在时间和剂量限制，容易被更强的抑制信号掩盖 | 研究TGF-β对肝细胞癌中CD8+ T细胞的调控效应及分子机制 | 主要研究肝细胞癌中浸润的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 流式细胞术, 质量细胞术, 免疫组化, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 高通量测序的可转置酶可接近染色质检测, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告基因测定 | NA | NA | NA |
| 3796 | 2024-08-05 |
Differential Effects of Ontamalimab Versus Vedolizumab on Immune Cell Trafficking in Intestinal Inflammation and Inflammatory Bowel Disease
2023-Nov-24, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjad088
PMID:37208197
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研究论文 | 本研究探讨了Ontamalimab与Vedolizumab在肠道炎症和炎症性肠病中的免疫细胞迁移的不同影响 | Ontamalimab展现出独特且更广泛的作用机制，超出Vedolizumab的机制 | 研究的结果基于小鼠实验模型，可能无法完全预测临床应用中的效果 | 探索Ontamalimab的作用机制并与Vedolizumab进行比较 | 研究对象包括活跃的炎症性肠病患者中的MAdCAM-1表达及其在小鼠模型中的作用 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | RNA测序, 免疫组化, 荧光显微镜 | NA | 单细胞RNA测序 | 使用了小鼠模型进行实验，具体样本数量未明确说明 |
| 3797 | 2024-08-07 |
Engineered human Diamond-Blackfan anemia disease model confirms therapeutic effects of clinically applicable lentiviral vector at single-cell resolution
2023-11-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2022.282068
PMID:37199130
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研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9和同源定向修复技术生成可追踪的RPS19缺陷细胞模型，以单细胞分辨率研究临床适用慢病毒载体的治疗效果 | 开发了一种温和的纳米吸管递送平台，用于编辑人类脐带血来源的CD34+造血干细胞和祖细胞中的RPS19基因，并首次通过单细胞RNA测序分析鉴定了特定的红系祖细胞及其异常细胞周期状态 | NA | 验证临床适用慢病毒载体在单细胞分辨率下的治疗效果 | RPS19缺陷细胞模型及人类脐带血来源的CD34+造血干细胞和祖细胞 | 基因编辑 | 骨髓衰竭症 | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类脐带血来源的CD34+造血干细胞和祖细胞 |
| 3798 | 2024-08-07 |
CellEnBoost: A Boosting-Based Ligand-Receptor Interaction Identification Model for Cell-to-Cell Communication Inference
2023-10, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2023.3278685
PMID:37216267
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研究论文 | 本文开发了一种基于Boosting的配体-受体相互作用识别模型CellEnBoost，用于细胞间通信的推断 | CellEnBoost模型结合了Light梯度提升机和AdaBoost以及卷积神经网络，用于预测和过滤配体-受体相互作用，并通过结合细胞间通信强度测量和单细胞RNA测序数据进行验证 | NA | 旨在识别肿瘤微环境中癌细胞自身及癌细胞与正常细胞间的通信，以帮助理解癌症的发生、发展和转移 | 细胞间通信及配体-受体相互作用 | 机器学习 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | CNN | 数据集 | 收集了四个配体-受体相互作用数据集 |
| 3799 | 2024-08-08 |
A Carboxy-terminal Smarcb1 Point Mutation Induces Hydrocephalus Formation and Affects AP-1 and Neuronal Signalling Pathways in Mice
2023-Oct, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-023-01361-5
PMID:37219662
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研究论文 | 本文通过建立一个新的携带羧基端Smarcb1 c.1148del点突变的小鼠模型，研究了该突变对小鼠大脑发育的影响。 | 首次探讨了特定非截断型Smarcb1突变的影响，并通过磁共振成像、组织学和单细胞RNA测序技术进行了深入分析。 | 仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现。 | 研究SMARCB1突变对神经发育的影响及其相关表型。 | 携带羧基端Smarcb1 c.1148del点突变的小鼠。 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 磁共振成像、组织学、单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 图像、组织切片、RNA序列 | 新生突变小鼠的脑组织 |
| 3800 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic data reveal the increase in extracellular matrix organization and antigen presentation abilities of fibroblasts and smooth muscle cells in patients with pelvic organ prolapse
2023-Oct, International urogynecology journal
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00192-023-05539-9
PMID:37222740
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序分析了盆腔器官脱垂患者阴道壁中成纤维细胞和平滑肌细胞的细胞特性变化 | 首次揭示了盆腔器官脱垂患者中成纤维细胞和平滑肌细胞的细胞外基质组织和抗原呈递能力增强的现象 | 研究样本量较小，仅包括5例盆腔器官脱垂患者和5例对照组 | 探索盆腔器官脱垂中成纤维细胞和平滑肌细胞的细胞特性，以增进对盆腔器官脱垂分子机制的理解 | 盆腔器官脱垂患者的成纤维细胞和平滑肌细胞 | 数字病理学 | 盆腔器官脱垂 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 5例盆腔器官脱垂患者和5例对照组 |