单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-10-06 |
Signature morphoelectric properties of diverse GABAergic interneurons in the human neocortex
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf6484
PMID:37824669
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研究论文 | 本研究通过病毒遗传标记和Patch-seq技术系统表征了人类新皮质中多种GABA能中间神经元的形态电生理特性 | 揭示了PVALB和SST亚类之间的过渡特征，发现了丰富转录组类型中的形态异质性，识别了灵长类特化的双束细胞多个空间独特类型 | 研究基于脑切片样本，可能无法完全反映在体状态下的神经元特性 | 完善新兴的转录组细胞类型分类并理解人类脑细胞类型的保守和特化特性 | 人类新皮质中的GABA能中间神经元 | 神经科学 | NA | 病毒遗传标记，Patch-seq（膜片钳电生理学加单细胞RNA测序） | NA | 电生理数据，单细胞转录组数据，形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 362 | 2025-10-06 |
Neuronal identity defines α-synuclein and tau toxicity
2023-05-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.02.033
PMID:36948206
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研究论文 | 本研究通过分析人脑数据集和果蝇模型，探索神经元身份对α-突触核蛋白和tau蛋白毒性的影响 | 发现神经元易损性与α-突触核蛋白或tau蛋白表达水平无关，揭示了突触和钙稳态相关基因作为tau毒性调节因子 | 研究主要基于果蝇模型，需要在哺乳动物系统中进一步验证 | 确定对α-突触核蛋白或tau蛋白毒性反应最敏感的细胞环境 | 人脑神经元和果蝇活神经元类型 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，深度表型分析 | 果蝇模型 | 基因表达数据，转录组数据 | 超过200种活神经元类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 363 | 2025-10-06 |
Epithelial Endoplasmic Reticulum Stress Enhances the Risk of Muc5b-associated Lung Fibrosis
2023-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0252OC
PMID:36108173
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研究论文 | 本研究探讨了MUC5B过表达如何通过内质网应激途径加剧肺纤维化，并发现ISRIB药物可逆转这一过程 | 首次揭示MUC5B通过内质网应激途径促进肺纤维化的分子机制，并证明ISRIB可逆转该过程 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究MUC5B相关肺纤维化的分子机制及潜在治疗策略 | 小鼠模型和人类IPF患者组织样本 | 分子病理学 | 肺纤维化 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 364 | 2025-10-06 |
Quantification of spatial pharmacogene expression heterogeneity in breast tumors
2023-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1686
PMID:35906899
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组技术分析乳腺癌组织中286个药物基因的空间表达异质性 | 首次在乳腺癌组织中系统量化药物基因的空间表达异质性，并识别出与活性氧处理和解毒机制相关的关键异质性基因 | 样本量较小（仅6个乳腺癌样本），且主要基于观察性数据 | 确定药物基因在肿瘤组织中是否存在空间表达异质性，并识别最具异质性的药物基因 | 乳腺癌组织样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组测序 | NA | 空间基因表达数据 | 6个乳腺癌样本（4个来自生物样本库，2个来自10x Genomics数据集） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组平台，55微米直径条形码区域 |
| 365 | 2025-10-06 |
Single cell spatial transcriptomic profiling of childhood-onset lupus nephritis reveals complex interactions between kidney stroma and infiltrating immune cells
2023-Nov-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.09.566503
PMID:38014158
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研究论文 | 通过单细胞空间转录组技术分析儿童发病狼疮性肾炎肾脏组织，揭示基质细胞与浸润免疫细胞间的复杂相互作用 | 首次在单细胞分辨率下构建儿童狼疮性肾炎的空间转录组图谱，揭示免疫细胞定位与组织位置相关的基因表达变化 | 组织学疾病活动评分与肾小球细胞转录特征相关性较弱，样本量有限（8例患者+2例对照） | 解析儿童狼疮性肾炎的免疫发病机制和分子异质性 | 儿童狼疮性肾炎患者和对照者的肾脏组织 | 空间转录组学 | 狼疮性肾炎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 8例儿童狼疮性肾炎患者和2例对照，超过400,000个细胞 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 366 | 2025-10-06 |
Development of a cell-free strategy to recover aged skeletal muscle after disuse
2023-11, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP282867
PMID:35318675
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研究论文 | 开发了一种基于过氧化氢预处理周细胞来源的小细胞外囊泡的无细胞策略，用于恢复老年小鼠废用性骨骼肌萎缩 | 首次发现周细胞在废用和恢复期间丧失抗氧化能力，并利用健康供体周细胞经H2O2刺激产生具有修复功能的小细胞外囊泡 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证；sEVs中具体起作用的蛋白质机制需进一步确认 | 开发针对老年废用性骨骼肌萎缩的新型治疗策略 | 小鼠骨骼肌周细胞和骨骼肌纤维 | 肌肉生物学 | 肌肉萎缩 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学分析，功能实验 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据 | 年轻成年和老年小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 367 | 2025-10-06 |
MitoTracer facilitates the identification of informative mitochondrial mutations for precise lineage reconstruction
2023-Nov-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.22.568285
PMID:38045409
|
研究论文 | 开发了一种名为MitoTracer的开源计算算法，用于从单细胞测序数据中准确识别信息性线粒体突变并进行谱系重建 | 首次提供自动识别信息性线粒体突变的计算工具，在灵敏度和特异性方面优于现有方法 | NA | 开发用于单细胞谱系重建的计算工具 | 线粒体突变、单细胞RNA测序数据、单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 计算算法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 368 | 2025-10-06 |
Single-Nucleus Transcriptome Profiling of Dorsolateral Prefrontal Cortex: Mechanistic Roles for Neuronal Gene Expression, Including the 17q21.31 Locus, in PTSD Stress Response
2023-10-01, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.20220478
PMID:37491937
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研究论文 | 首次使用单核RNA测序技术研究创伤后应激障碍和重度抑郁症患者背外侧前额叶皮层的细胞类型特异性转录组机制 | 首次在PTSD中进行死后脑组织的单核RNA测序研究，揭示了细胞类型特异性机制，特别是在兴奋性和抑制性神经元中发现的17q21.31基因座相关差异表达基因 | 样本量相对有限（11例PTSD，10例MDD，11例对照），且为死后脑组织研究 | 阐明PTSD和MDD在背外侧前额叶皮层的细胞类型特异性转录组病理机制 | 人类死后背外侧前额叶皮层样本，包括PTSD患者、MDD患者和对照受试者 | 单细胞转录组学 | 创伤后应激障碍,重度抑郁症 | 单核RNA测序,诱导多能干细胞分化 | 差异基因表达分析 | 单核RNA测序数据 | 32个DLPFC样本（约415K细胞核），复制样本15个DLPFC样本（约160K细胞核） | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 369 | 2025-10-06 |
Development of a Nanoparticle-Based Tendon-Targeting Drug Delivery System to Pharmacologically Modulate Tendon Healing
2023-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.29.569204
PMID:38076889
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研究论文 | 开发了一种基于纳米颗粒的肌腱靶向药物递送系统，用于药理调节肌腱愈合 | 利用空间转录组学数据发现愈合肌腱中TRAP高表达区域，并首次将TRAP结合肽功能化纳米颗粒应用于肌腱靶向药物递送 | 研究仅针对急性肌腱损伤模型，未验证在慢性肌腱病变或其他类型软组织损伤中的效果 | 开发靶向肌腱的药物递送系统以改善肌腱愈合过程 | 肌腱愈合过程、TRAP表达、纳米颗粒药物递送系统 | 组织工程与再生医学 | 肌腱损伤 | 空间转录组学、纳米颗粒药物递送、功能评估 | NA | 基因表达数据、功能评估数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 370 | 2025-10-06 |
Solute carrier (SLC) expression reveals skeletogenic cell diversity
2023-11, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.08.004
PMID:37611888
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析海胆胚胎发育中转运蛋白表达模式，揭示细胞功能多样性 | 采用基于转运蛋白表达的细胞聚类策略，发现传统基因调控状态分类中被忽略的细胞功能亚群 | 研究仅针对紫球海胆特定发育阶段，结论在其他物种或发育阶段的普适性需进一步验证 | 探究胚胎发育过程中不同细胞类型转运蛋白表达模式的多样性 | 紫球海胆晚期原肠胚阶段的各类细胞，特别是中胚层细胞（色素细胞、胚腔细胞和骨骼形成细胞） | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞基因表达数据 | 紫球海胆晚期原肠胚阶段单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 371 | 2025-10-06 |
Discoveries in Retina Physiology and Disease Biology Using Single-Cell RNA Sequencing
2023-10-19, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2810247
PMID:37919055
|
综述 | 本文系统回顾单细胞RNA测序技术在视网膜生理和疾病生物学研究中的应用进展 | 系统梳理scRNA-seq技术在视网膜细胞亚型鉴定和疾病机制研究中的独特价值，提供对视网膜发育和疾病分子基础的新见解 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在视网膜生理功能和疾病生物学研究中的应用 | 视网膜神经元细胞和胶质细胞 | 数字病理 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 372 | 2025-10-06 |
Deep learning applications in single-cell genomics and transcriptomics data analysis
2023-Sep, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.115077
PMID:37393865
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综述 | 本文系统回顾了深度学习在单细胞基因组学和转录组学数据分析中的应用 | 系统评估深度学习在单细胞多组学整合和空间转录组学等新兴领域的应用潜力 | 深度学习尚未彻底解决单细胞组学领域最紧迫的挑战，发展进程相对渐进 | 评估深度学习在单细胞组学研究中的优势与挑战 | 单细胞基因组学、转录组学、空间转录组学和多组学整合数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学整合 | 深度学习 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 373 | 2025-10-06 |
Harmonized cross-species cell atlases of trigeminal and dorsal root ganglia
2023-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.04.547740
PMID:37461736
|
研究论文 | 构建了跨物种协调的背根神经节和三叉神经节细胞图谱，描述了6个物种18种神经元和11种非神经元细胞类型 | 创建了首个跨物种协调的背根神经节和三叉神经节细胞图谱，解决了不同研究和物种间细胞类型比较的难题 | 研究主要基于转录组数据，可能无法完全反映细胞功能的多样性 | 比较不同物种背根神经节和三叉神经节细胞类型的转录组特征 | 背根神经节和三叉神经节的神经元和非神经元细胞 | 单细胞转录组学 | 疼痛相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个物种、19项研究的细胞数据，包括新分析的人类和蝾螈背根神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 374 | 2025-10-06 |
Endoplasmic reticulum in oocytes: spatiotemporal distribution and function
2023-Jun, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-023-02782-3
PMID:37171741
|
综述 | 本文系统综述了内质网在哺乳动物卵母细胞中的功能、结构、时空分布及其与其他细胞器的相互作用 | 结合单细胞RNA测序技术解析内质网机制，并将内质网功能与体外成熟临床问题相联系 | NA | 总结内质网在哺乳动物卵母细胞中的功能和作用机制，为辅助生殖技术研究提供参考 | 哺乳动物卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 375 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Exploration of the Transcriptomic Landscape in Multiple Sclerosis: A Systematic Review
2023-Jan-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24021448
PMID:36674968
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综述 | 本文通过系统综述探讨多发性硬化症中的转录组学特征及其相关生物学过程 | 整合了近年来RNA测序技术在多发性硬化症研究中的应用，揭示了疾病不同阶段的特异性分子特征和非编码RNA的关键作用 | 作为综述文章，未进行原始数据分析，依赖于已有研究结果的整合 | 探索转录组学在多发性硬化症中的作用机制 | 多发性硬化症相关的转录组学研究 | 生物信息学 | 多发性硬化症 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 376 | 2025-10-06 |
Single-cell landscape analysis unravels molecular programming of the human B cell compartment in chronic GVHD
2023-06-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169732
PMID:37129971
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示人类B细胞在慢性移植物抗宿主病中的分子编程机制 | 首次在人类异基因造血干细胞移植背景下对B细胞进行大规模单细胞转录组分析，发现慢性GVHD中记忆B细胞区室的显著转录差异和潜在致病性非典型B细胞的扩增 | 样本来源仅限于异基因造血干细胞移植患者，未涉及其他自身免疫疾病模型 | 理解异基因造血干细胞移植背景下B细胞的分子编程机制及其在慢性移植物抗宿主病发病中的作用 | 异基因造血干细胞移植患者的纯化B细胞 | 单细胞生物学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 来自患者的大量纯化B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 377 | 2025-10-06 |
Imputation for Single-cell RNA-seq Data with Non-negative Matrix Factorization and Transfer Learning
2023-12, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S0219720023500294
PMID:38248911
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研究论文 | 提出一种结合非负矩阵分解和迁移学习的方法来填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 首次将迁移学习与非负矩阵分解相结合用于scRNA-seq数据填补，通过引入图正则化项和迁移项来保持数据固有几何结构并提高表达值估计精度 | NA | 开发更准确的单细胞RNA测序数据填补方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解, 迁移学习 | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 378 | 2025-10-06 |
Enhanced microglial dynamics and paucity of tau seeding in the amyloid plaque microenvironment contributes to cognitive resilience in Alzheimer's disease
2023-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.27.550884
PMID:37546928
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研究论文 | 研究无症状阿尔茨海默病患者大脑中淀粉样斑块微环境的特征及其与认知弹性的关系 | 首次发现无症状AD患者斑块微环境中小胶质细胞具有高效肌动蛋白运动机制和tau蛋白播种活性降低的特征 | 基于尸检样本的回顾性研究，无法确定因果关系 | 探究阿尔茨海默病认知弹性的潜在机制 | 无症状阿尔茨海默病患者的尸检脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本，转录组数据 | 无症状AD患者尸检脑组织队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 379 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics defines injury-specific microenvironments in the adult mouse kidney and novel cellular interactions in regeneration and disease
2023-Nov-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.22.568217
PMID:38045285
|
研究论文 | 本研究应用单细胞空间转录组学技术分析小鼠肾脏缺血再灌注损伤，揭示损伤特异性微环境和细胞间相互作用 | 首次使用空间转录组学技术揭示肾脏损伤中空间依赖的基因表达模式和持续损伤的近端小管细胞与成纤维细胞间的分子相互作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探索肾脏损伤和修复过程中的分子通路和细胞相互作用 | 成年小鼠肾脏组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 380 | 2025-10-06 |
BOTH THE INFECTION STATUS AND INFLAMMATORY MICROENVIRONMENT INDUCE TRANSCRIPTIONAL REMODELING IN MACROPHAGES IN MURINE LEISHMANIAL LESIONS
2023-05-01, The Journal of parasitology
IF:1.0Q4
DOI:10.1645/22-94
PMID:37270767
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析皮肤利什曼病病灶中感染与未感染巨噬细胞的转录组差异 | 首次在体内模型中同时比较感染与非感染巨噬细胞的转录组特征，揭示寄生虫和炎症微环境对核糖体机制的独立影响 | 研究仅针对利什曼原虫感染模型，未验证其他病原体感染情况 | 探究寄生虫感染和炎症微环境对巨噬细胞转录重编程的独立贡献 | 利什曼原虫感染小鼠皮肤病灶中的巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 皮肤利什曼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠皮肤病灶巨噬细胞（含感染组与未感染组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |