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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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3761 | 2024-08-07 |
Pluripotent stem cell-derived committed cardiac progenitors remuscularize damaged ischemic hearts and improve their function in pigs
2023-May-26, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-023-00302-6
PMID:37236990
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研究论文 | 本文报道了人多能胚胎干细胞衍生的心脏前体细胞(CCPs)在猪心肌梗死模型中的移植效果,显示其在改善心脏功能和心肌再生方面的潜力 | 首次在猪模型中展示了多能干细胞衍生的心脏前体细胞在心肌梗死治疗中的应用,并观察到显著的心功能改善和心肌再生 | 研究中观察到部分猪出现室性心动过速,尽管所有猪均存活且未形成肿瘤 | 探索多能干细胞衍生的心脏前体细胞在心肌梗死治疗中的应用及其对心脏功能的影响 | 人多能胚胎干细胞衍生的心脏前体细胞及其在猪心肌梗死模型中的移植效果 | 再生医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10头猪 |
3762 | 2024-08-05 |
scMEB: a fast and clustering-independent method for detecting differentially expressed genes in single-cell RNA-seq data
2023-May-25, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09374-6
PMID:37231345
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研究论文 | 本文提出了一种新的快速方法scMEB,用于在单细胞RNA-seq数据中检测差异表达基因。 | scMEB方法不依赖于先前的细胞聚类结果,利用已知的稳定表达基因来构建最小包围球,并基于映射基因到超球中心的距离来定义差异表达基因。 | 未提及具体的局限性 | 开发一种准确且快速的方法用于单细胞RNA-seq数据中的差异表达基因检测。 | 使用11个真实数据集评估新提出的方法scMEB的表现。 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 11个真实数据集 |
3763 | 2024-08-05 |
A T-cell-related signature for prognostic stratification and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma based on transcriptomics and single-cell sequencing
2023-May-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05344-7
PMID:37231356
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研究论文 | 该研究提出了一种用于肝细胞癌的T细胞相关预后标志。 | 这项研究开发了一种基于T细胞相关基因的预后签名(TRPS),并且在多个队列中验证了其有效性。 | 该研究可能受到样本选择和外部验证数据集的限制。 | 研究旨在通过转录组学和单细胞测序评估T细胞标志在肝细胞癌中的作用。 | 研究对象为肝细胞癌患者及其T细胞相关标志。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO算法 | 基因组数据 | 181个T细胞标志 |
3764 | 2024-08-07 |
PD-1 blockade potentiates neoadjuvant chemotherapy in NSCLC via increasing CD127+ and KLRG1+ CD8 T cells
2023-May-25, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00384-x
PMID:37231145
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研究论文 | 本文研究了PD-1阻断剂与新辅助化疗联合治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的机制,通过单细胞RNA测序和多重荧光免疫组化分析,揭示了PD-1阻断剂增强化疗效果的免疫细胞机制。 | 首次详细阐述了PD-1阻断剂通过增加CD127+和KLRG1+ CD8 T细胞来增强新辅助化疗效果的机制,并通过空间分布分析和GEO数据集验证了其有效性。 | 研究样本量相对较小,且仅限于手术切除的新鲜肿瘤样本,可能限制了结果的普遍性。 | 探讨PD-1阻断剂与新辅助化疗联合治疗NSCLC的免疫机制,以提高治疗效果。 | 非小细胞肺癌患者及其免疫细胞在PD-1阻断剂与新辅助化疗联合治疗下的反应。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,多重荧光免疫组化 | NA | 免疫细胞数据 | 7名接受新辅助化疗或新辅助化疗联合PD-1阻断剂的NSCLC患者,以及65名接受新辅助化疗或新辅助化疗联合PD-1阻断剂的NSCLC患者的FFPE组织样本。 |
3765 | 2024-08-07 |
Rapid TCR:Epitope Ranker (RAPTER): a primary human T cell reactivity screening assay pairing epitope and TCR at single cell resolution
2023-05-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-35710-7
PMID:37231180
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Rapid TCR:Epitope Ranker (RAPTER)的单细胞RNA测序方法,用于评估功能性T细胞反应性 | RAPTER方法能够以单细胞分辨率定义配对的表位特异性和TCR序列,并包含RNA和蛋白质水平的T细胞表型信息 | NA | 旨在识别T细胞响应的表位,以理解T细胞介导的免疫反应 | 主要使用人源T细胞和抗原呈递细胞(APCs)进行功能性T细胞反应性评估 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-SEQ) | NA | RNA | 涉及低血液体积的主要细胞样本 |
3766 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Ferroptosis in the Tumor Microenvironment of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2023-May-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24109092
PMID:37240436
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研究论文 | 本研究调查了清细胞肾细胞癌(TME)肿瘤微环境中的铁死亡作用 | 首次识别与清细胞肾细胞癌预后相关的免疫介导的铁死亡基因 | 样本量相对较小,仅包括七个ccRCC病例 | 探讨铁死亡在清细胞肾细胞癌肿瘤微环境中的作用 | 七个清细胞肾细胞癌病例的单细胞数据 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 7个清细胞肾细胞癌病例 |
3767 | 2024-08-05 |
The Effect of Lung Resection for NSCLC on Circulating Immune Cells: A Pilot Study
2023-05-17, Current oncology (Toronto, Ont.)
DOI:10.3390/curroncol30050387
PMID:37232845
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研究论文 | 本研究评估了非小细胞肺癌肺切除术前后循环免疫细胞,特别是调节性T细胞亚群的水平。 | 首次系统地分析了肺切除术对循环免疫细胞,特别是Treg亚群的影响 | 样本量较小,仅包括25名患者且部分数据因技术问题被排除 | 评估非小细胞肺癌肺切除术对循环免疫细胞的影响 | 参与研究的患者是接受非小细胞肺癌肺切除术的患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 血液样本 | 共25名患者,最终19名患者参与循环免疫细胞分析 |
3768 | 2024-08-05 |
Progress and Challenges of Immunotherapy Predictive Biomarkers for Triple Negative Breast Cancer in the Era of Single-Cell Multi-Omics
2023-May-16, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life13051189
PMID:37240834
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综述 | 本文讨论了三阴性乳腺癌免疫治疗预测生物标志物的进展与挑战 | 本文提出使用单细胞多组学分析来识别新的有效生物标志物,突破了传统生物标志物的局限性 | 本文为综述,未提供原始实验数据或直接研究结果 | 探讨并总结如何通过单细胞多组学分析提升三阴性乳腺癌的生物标志物识别 | 三阴性乳腺癌及其相关的免疫治疗特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
3769 | 2024-08-07 |
Macrophage-Related Testicular Inflammation in Individuals with Idiopathic Non-Obstructive Azoospermia: A Single-Cell Analysis
2023-May-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24108819
PMID:37240164
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析技术探讨特发性非阻塞性无精子症(iNOA)的潜在机制及其在睾丸环境中的细胞和分子变化 | 采用单细胞RNA测序和微阵列数据进行生物信息学分析,揭示了iNOA与正常组在生精微环境中的显著差异,并发现了与巨噬细胞相关的睾丸炎症以及潜在的生物标志物 | NA | 旨在理解特发性非阻塞性无精子症(iNOA)的根本原因 | iNOA患者的睾丸组织 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
3770 | 2024-08-05 |
Cellular and Genetic Background of Osteosarcoma
2023-May-15, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb45050276
PMID:37232745
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综述 | 本文总结了骨肉瘤的细胞和遗传背景及其最新进展 | 探讨了新技术如下一代测序和单细胞测序在骨肉瘤研究中的应用 | 针对肿瘤高异质性和不同突变的靶向治疗方法受限 | 研究骨肉瘤的细胞特征及其分子发病机制 | 骨肉瘤及其干细胞的特性和存在 | 数字病理学 | NA | 下一代测序, 单细胞测序 | NA | NA | NA |
3771 | 2024-08-05 |
Neuromorphological Atlas of Human Prenatal Brain Development: White Paper
2023-May-13, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life13051182
PMID:37240827
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research paper | 该论文提供了关于人类胎儿大脑发育的新在线人类胎儿大脑发育图谱的初始信息 | 介绍了基于不同胎龄的人类胎儿大脑系列切片的前脑注释半球图,并展示了区域特定免疫表型的时空变化 | 没有提到具体的样本大小和实验方法的局限性 | 建立一个人类胎儿大脑发育数据的参考数据库,为神经学研究提供支持 | 人类胎儿大脑的发育过程和相关的免疫表型资料 | 神经学 | 神经退行性疾病和癌症 | 神经超声、X射线计算机断层扫描(CT)和磁共振成像(MRI) | NA | 虚拟切片图像 | NA |
3772 | 2024-08-05 |
Nuclei Isolation from Mouse Cardiac Progenitor Cells for Epigenome and Gene Expression Profiling at Single-Cell Resolution
2023-05-12, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65328
PMID:37246858
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研究论文 | 本文提出了一种快速隔离小鼠心脏前体细胞核的新方法 | 首次实现了从冷冻样本中快速隔离细胞核以进行单核双组学分析 | 缺乏对更广泛实验条件的分析 | 开发一种灵活的细胞核隔离方法以支持单细胞基因组和表观基因组分析 | 小鼠心脏前体细胞 | 数字疾病病理学 | 心脏病 | 单细胞RNA测序(snRNA-seq)和单细胞可接近染色质转座酶测定(snATAC-seq) | NA | 细胞核 | 冷冻心脏前体细胞样本 |
3773 | 2024-08-05 |
Comparative Genomic and Transcriptomic Profiling Revealed the Molecular Basis of Starch Promoting the Growth and Proliferation of Balantioides coli
2023-May-11, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani13101608
PMID:37238038
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研究论文 | 该研究揭示了淀粉促进Balantioides coli生长和增殖的分子机制 | 研究首次阐明了淀粉通过激活cAMP/PKA信号通路和抑制PI3K/AKT/mTOR通路影响Balantioides coli生长的机制 | NA | 探讨淀粉对Balantioides coli生长和复制的机制 | Balantioides coli及其相关的基因组和转录组特征 | NA | NA | SMART-seq2单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据和转录组数据 | 单个滋养体 |
3774 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Evidence of Endothelial Dysfunction in the Brains of COVID-19 Patients with Implications for Glioblastoma Progression
2023-May-05, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci13050762
PMID:37239234
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研究论文 | 本研究探讨了COVID-19患者大脑中内皮功能障碍的单细胞转录组特征及其对胶质母细胞瘤发展的影响 | 研究揭示了COVID-19与胶质母细胞瘤之间在内皮功能障碍方面的显著重叠 | 研究限制在于仅使用了两个数据集,可能影响结果的普适性 | 研究COVID-19导致的大脑内皮功能障碍及其与胶质母细胞瘤进展的关联 | COVID-19患者的大脑内皮细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多个COVID-19患者的单细胞转录组数据集(GSE131928和GSE159812) |
3775 | 2024-08-05 |
[Latest Findings on the Pathogenic Mechanisms of Thoracic Aortic Dissection]
2023-May, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20230260101
PMID:37248608
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综述 | 本文总结了功能失调的血管平滑肌细胞在胸主动脉夹层的发病机制和发展中的关键作用 | 探讨了血管平滑肌细胞功能失调的分子机制及其在胸主动脉夹层发病中的特殊角色 | 尚未提供有效的药物治疗方案,且目前的研究仍处于初步阶段 | 探讨胸主动脉夹层的发病机制,以推动有效药物靶点的发现 | 胸主动脉夹层中的功能失调的血管平滑肌细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
3776 | 2024-08-07 |
Highly efficient cell-microbead encapsulation using dielectrophoresis-assisted dual-nanowell array
2023-May, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgad155
PMID:37252002
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研究论文 | 本文介绍了一种基于介电电泳辅助的双纳米孔阵列(ddNA)设备,用于高效地将细胞与微珠封装 | 该设备通过创新的微结构设计和操作流程,解耦了珠和细胞的加载过程,提高了单细胞捕获和配对率 | NA | 开发一种便携式微流控设备,用于高吞吐量的单细胞分析 | 人类胚胎肾细胞 | 微纳制造技术 | NA | 介电电泳(DEP) | NA | 微流控设备 | 数千个亚纳升微孔对 |
3777 | 2024-08-05 |
The Genomic Landscape of Melanoma and Its Therapeutic Implications
2023-04-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14051021
PMID:37239381
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综述 | 本文提供了涵盖黑色素瘤基因组及其治疗影响的全面回顾 | 探讨了最新技术如何增进对黑色素瘤及其微环境基因组格局的理解 | 未提及具体的实验数据或临床试验结果 | 研究黑色素瘤的遗传构成及其对治疗的影响 | 黑色素瘤的肿瘤发生、转移和预后相关的遗传因素 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 下一代测序(NGS)和单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
3778 | 2024-08-05 |
[Evaluation of peripheral blood T-lymphocyte subpopulations features in patients with hepatitis B virus-related acute-on-chronic liver failure based on single-cell sequencing technology]
2023-Apr-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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研究论文 | 该研究探讨了HBV相关急性慢性肝衰竭患者外周血T淋巴细胞亚群特征 | 通过单细胞RNA测序技术识别了八种不同的T淋巴细胞亚群及其特征,揭示了T细胞在HBV-ACLF发病机制中的异质性 | 样本仅限于六例HBV-ACLF患者与三例健康对照,样本量较小 | 研究HBV相关急性慢性肝衰竭患者T淋巴细胞的免疫耗竭特征 | 含有HBV-ACLF患者及健康对照的外周血T淋巴细胞 | 数字病理 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 六例HBV-ACLF患者和三例健康对照 |
3779 | 2024-08-05 |
Identification of the candidate genes of diagnosing rheumatoid arthritis using the single-cell sequencing technology and T cell subclusters analysis of patients with rheumatoid arthritis
2023-Mar, Archives of rheumatology
IF:1.1Q4
DOI:10.46497/ArchRheumatol.2022.9573
PMID:37235118
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析类风湿关节炎患者外周血单核细胞中的细胞异质性并鉴定关键基因 | 首次通过单细胞测序分析确定九个与RA发生密切相关的候选基因 | 研究的样本量和数据来源可能影响结果的普遍性 | 分析类风湿关节炎患者外周血单核细胞中细胞类型的异质性 | 类风湿关节炎患者的外周血单核细胞及其T细胞亚群 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 10,483个细胞 |
3780 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing technology in colorectal cancer: a new technology to disclose the tumor heterogeneity and target precise treatment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1175343
PMID:37256123
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综述 | 本文探讨了单细胞测序技术在结直肠癌中应用的潜力 | 介绍了单细胞测序如何揭示肿瘤的异质性并指导精准治疗 | 未提及具体实验数据或样本分析 | 旨在更好地理解结直肠癌的发展和转移机制 | 分析结直肠癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组序列信息 | NA |