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当前共找到 5351 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-10-06 |
Feasibility of Inferring Spatial Transcriptomics from Single-Cell Histological Patterns for Studying Colon Cancer Tumor Heterogeneity
2023-Oct-09, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.10.09.23296701
PMID:37873186
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研究论文 | 本研究开发了一种通过单细胞组织学模式推断空间转录组学的方法，用于研究结肠癌肿瘤异质性 | 开发了细胞图神经网络算法，通过最优传输方法将组织学信息与单细胞RNA模式对齐，实现从组织学单独推断空间mRNA表达模式 | 需要与病理学家合作进行精确的空间细胞类型识别，并需使用更先进的检测方法进行严格验证 | 探索整合单细胞组织学和转录组数据来推断空间mRNA表达模式 | pT3期结直肠癌患者的全切片图像 | 数字病理学 | 结肠癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 细胞图神经网络 | 图像，基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 10x Visium | Visium空间基因表达解决方案 |
| 342 | 2025-10-06 |
Leveraging spatial transcriptomics data to recover cell locations in single-cell RNA-seq with CeLEry
2023-07-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39895-3
PMID:37422469
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研究论文 | 提出CeLEry算法，利用空间转录组学数据恢复单细胞RNA测序中细胞的空间位置信息 | 开发了基于监督深度学习的算法，通过数据增强程序提高鲁棒性，能够从scRNA-seq数据中恢复细胞的多层次空间信息 | NA | 解决单细胞RNA测序中细胞空间位置信息缺失的问题 | 大脑和癌组织中的细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 监督深度学习, 变分自编码器 | 基因表达数据, 空间位置数据 | 多个数据集 | 10x Genomics, Vizgen, NanoString | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | Visium, MERSCOPE, MERFISH, Xenium | 10x Visium空间转录组平台, Vizgen MERSCOPE平台, NanoString GeoMx DSP平台 |
| 343 | 2025-10-06 |
Mapping disease regulatory circuits at cell-type resolution from single-cell multiomics data
2023-Jul, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00476-5
PMID:37974651
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研究论文 | 提出一种名为MAGICAL的层次贝叶斯方法，通过单细胞多组学数据解析疾病相关的调控回路 | 开发了能够同时建模跨细胞和条件的多组学信号变化的创新算法，实现了高精度的调控回路推断 | 仅应用于脓毒症研究，需要验证在其他疾病中的适用性 | 解析染色质重塑相关的基因表达变化，理解疾病状态 | 脓毒症患者和未感染对照者的外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 单细胞转座酶可及染色质测序 | 层次贝叶斯模型 | 单细胞多组学数据 | 脓毒症患者和未感染对照者的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 344 | 2025-10-06 |
A human liver organoid screening platform for DILI risk prediction
2023-05, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.01.019
PMID:36738840
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研究论文 | 本研究开发了基于人肝类器官的高通量和器官芯片平台用于药物性肝损伤风险预测 | 首次将人肝类器官同时应用于高通量筛选和器官芯片系统进行DILI风险评估，并展示了其在预测协同肝毒性和机制研究方面的能力 | 仅使用了三个iPSC细胞系，样本规模有限；需要进一步验证在更广泛药物和患者群体中的适用性 | 评估人肝类器官在药物性肝损伤风险预测中的应用价值 | 人肝类器官、肝毒性化合物 | 器官芯片技术 | 药物性肝损伤 | 单细胞转录组学、生化检测、形态学分析 | 器官芯片、类器官模型 | 转录组数据、图像数据、生化指标数据 | 三个独立的iPSC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 345 | 2025-10-06 |
SpaDecon: cell-type deconvolution in spatial transcriptomics with semi-supervised learning
2023-04-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04761-x
PMID:37029267
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研究论文 | 开发了一种名为SpaDecon的半监督学习方法，用于空间转录组数据中的细胞类型反卷积 | 首次结合基因表达、空间位置和组织学信息进行细胞类型反卷积的半监督学习方法 | 仅使用四个真实SRT数据集和四个伪SRT数据集进行评估 | 解决空间条形码SRT技术缺乏单细胞分辨率的问题，推断细胞类型的空间分布 | 空间转录组数据中的细胞类型分布 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 半监督学习 | 基因表达数据、空间位置数据、组织学图像 | 四个真实SRT数据集和四个伪SRT数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 346 | 2025-10-06 |
Characterization of Intestinal Mesenchymal Stromal Cells From Patients With Inflammatory Bowel Disease for Autologous Cell Therapy
2023-03-03, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad003
PMID:36869704
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研究论文 | 本研究评估了炎症性肠病患者自体肠道间充质基质细胞用于细胞治疗的适用性和功能性 | 首次系统性评估自体肠道MSCs作为细胞治疗平台的潜力，并发现IFN-γ预处理可消除基线转录差异 | 样本量相对较小（克罗恩病11例，溃疡性结肠炎12例，对照14例），需要更大规模研究验证 | 评估自体肠道MSCs作为炎症性肠病细胞治疗平台的可行性 | 炎症性肠病（克罗恩病和溃疡性结肠炎）患者和对照组的肠道黏膜活检来源的间充质基质细胞 | 细胞治疗 | 炎症性肠病 | 显微镜检查，流式细胞术，bulk RNA测序，单细胞RNA测序，Luminex多重检测 | NA | 图像，流式细胞数据，基因表达数据，蛋白质分泌数据 | 克罗恩病11例，溃疡性结肠炎12例，对照组14例 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | 30-plex Luminex panel |
| 347 | 2025-10-06 |
Deriving early single-rosette brain organoids from human pluripotent stem cells
2023-12-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.10.020
PMID:37995702
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研究论文 | 开发了一种从人多能干细胞生成早期单玫瑰花结脑类器官的新方法 | 通过从二维单层细胞而非三维拟胚体起始，实现了具有可重复大小和结构的单玫瑰花结皮质类器官的生成 | NA | 开发改进的脑类器官生成方法用于研究人脑发育和疾病建模 | 人多能干细胞生成的脑类器官 | 发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序,免疫细胞化学 | NA | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 348 | 2025-10-06 |
Integrative lactylation and tumor microenvironment signature as prognostic and therapeutic biomarkers in skin cutaneous melanoma
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05483-7
PMID:37955686
|
研究论文 | 本研究通过整合乳酸化修饰和肿瘤微环境特征，构建了皮肤黑色素瘤的预后预测模型和治疗生物标志物 | 首次将乳酸化修饰与肿瘤微环境特征相结合构建预后模型，并发现CLPB基因在黑色素瘤中的关键功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证和临床样本确认 | 开发皮肤黑色素瘤的预后预测方法和治疗指导策略 | 皮肤黑色素瘤患者和细胞系 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序，LASSO回归，Cox回归，CIBERSORT算法 | LAC-TME分类器，预后模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | TCGA和GTEx数据库中的皮肤黑色素瘤样本 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 349 | 2025-10-06 |
Combined signature of G protein-coupled receptors and tumor microenvironment provides a prognostic and therapeutic biomarker for skin cutaneous melanoma
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05486-4
PMID:38006451
|
研究论文 | 本研究通过分析G蛋白偶联受体相关基因和肿瘤微环境构建了皮肤黑色素瘤的预后模型 | 首次结合GPCRs相关基因和肿瘤微环境构建预后分类器，并鉴定出GPR19作为新的生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证和临床样本确认 | 构建皮肤黑色素瘤的预后模型以指导临床治疗策略 | 皮肤黑色素瘤患者和黑色素瘤细胞系(A375, A2058) | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 差异表达分析, LASSO算法, Cox回归分析, 单细胞RNA测序, 细胞实验 | 预后模型, GPR-TME分类器 | 基因表达数据, 临床信息, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的皮肤黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 350 | 2025-10-06 |
Machine learning- and WGCNA-mediated double analysis based on genes associated with disulfidptosis, cuproptosis and ferroptosis for the construction and validation of the prognostic model for breast cancer
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05378-7
PMID:37712959
|
研究论文 | 基于双硫死亡、铜死亡和铁死亡相关基因构建乳腺癌预后模型 | 首次整合双硫死亡相关基因(DRGs)、铜死亡相关基因(CRGs)和铁死亡相关基因(FRGs)构建乳腺癌预后特征 | NA | 构建和验证乳腺癌预后预测模型 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,Cox回归分析 | 无监督聚类分析,Lasso-Cox分析,WGCNA | 基因表达数据 | TCGA-BRCA数据库训练集和验证集,GSE20685和GSE42568外部验证集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 351 | 2025-10-06 |
Anti-PD-1 immunotherapy with androgen deprivation therapy induces robust immune infiltration in metastatic castration-sensitive prostate cancer
2023-11-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.10.006
PMID:37922910
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析转移性去势敏感性前列腺癌患者在接受抗PD-1免疫治疗联合雄激素剥夺治疗后的肿瘤微环境免疫浸润变化 | 首次在转移性去势敏感性前列腺癌中开展纵向单细胞RNA测序分析，揭示跨多个转移部位保守的免疫亚群及其与治疗反应和临床结局的关联 | 样本来源于单一二期临床试验，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探究转移性去势敏感性前列腺癌肿瘤微环境的免疫特征及治疗反应机制 | 转移性去势敏感性前列腺癌患者的转移部位组织样本 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 二期临床试验(NCT03951831)参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 352 | 2025-10-06 |
Transcriptomes and metabolism define mouse and human MAIT cell populations
2023-11-10, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abn8531
PMID:37948512
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和代谢分析定义了小鼠和人类MAIT细胞在不同器官中的群体特征及发育途径 | 首次系统比较了小鼠和人类MAIT细胞的转录组和代谢特征，揭示了物种间MAIT细胞功能的差异及环境对MAIT细胞的影响 | 研究主要关注MAIT17和MAIT1亚群，可能未完全覆盖所有MAIT细胞亚型；人类样本仅限于肺和血液 | 阐明小鼠和人类MAIT细胞在不同组织中的转录组和代谢特征差异 | 小鼠和人类黏膜相关恒定T细胞(MAIT细胞) | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 表型分析, 代谢分析 | NA | 转录组数据, 代谢数据 | 多器官组织样本（包括胸腺、肺、血液） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 353 | 2025-10-06 |
IFNɣ but not IFNα increases recognition of insulin defective ribosomal product-derived antigen to amplify islet autoimmunity
2023-11, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05991-8
PMID:37581620
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研究论文 | 本研究探讨了干扰素γ通过诱导免疫蛋白酶体亚基表达增强胰岛素缺陷核糖体产物衍生抗原呈递的机制 | 首次揭示IFNγ通过诱导PSMB10表达增强胰岛素DRiP衍生抗原呈递，并发现该基因在1型糖尿病患者胰岛β细胞中特异性上调 | 研究主要使用人β细胞系EndoC-βH1，未在原发性人胰岛中完全验证 | 研究早期先天细胞因子和晚期免疫适应性事件在胰岛素DRiP衍生肽呈递中的作用 | 人胰岛β细胞、EndoC-βH1细胞系、糖尿病源性CD8+ T细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞转录组测序、siRNA干扰、抗原肽呈递检测 | NA | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 354 | 2025-10-06 |
Spatial enrichment of the type 1 interferon signature in the brain of a neuropsychiatric lupus murine model
2023-11, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.06.021
PMID:37369340
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研究论文 | 本研究通过验证神经精神性狼疮小鼠模型，揭示大脑中1型干扰素信号的空间富集特征及其对细胞通讯通路的抑制作用 | 首次发现1型干扰素特征在大脑实质中形成空间分区的斑块状富集，并通过单核测序揭示其对神经元发育通路的普遍抑制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探究1型干扰素在中枢神经系统中介导神经精神性狼疮症状的机制 | 神经精神性狼疮小鼠模型的大脑组织 | 空间转录组学 | 神经精神性狼疮 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 355 | 2025-10-06 |
Machine learning and single-cell sequencing reveal the potential regulatory factors of mitochondrial autophagy in the progression of gastric cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05287-9
PMID:37648811
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研究论文 | 通过机器学习和单细胞测序技术分析线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的潜在调控因子 | 结合机器学习算法与单细胞RNA测序技术系统分析胃癌中线粒体自噬的调控网络 | 研究样本量有限（13个GC样本），需要进一步实验验证 | 全面分析线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用 | 胃癌细胞和组织 | 机器学习 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 支持向量机, 随机森林 | 基因表达数据 | 13个GC样本中的28,836个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 356 | 2025-10-06 |
A novel coiled-coil domain containing-related gene signature for predicting prognosis and treatment effect of breast cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05222-y
PMID:37558766
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研究论文 | 开发了一个基于卷曲螺旋结构域相关基因的预后特征模型，用于预测乳腺癌患者的预后和治疗效果 | 首次系统研究CCDC蛋白家族在乳腺癌中的预后价值，并构建了包含5个基因的风险预测模型 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床研究进一步验证 | 建立乳腺癌预后预测模型并评估其治疗指导价值 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞测序，基因表达分析，药物敏感性分析 | Cox回归，LASSO回归，风险评分模型 | 基因表达数据，临床数据 | 来自TCGA、METABRIC和GEO数据库的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 357 | 2025-10-06 |
The role of KPNA2 as a monotonically changing differentially expressed gene in the diagnosis, risk stratification, and chemotherapy sensitivity of chronic hepatitis B-liver cirrhosis-hepatocellular carcinoma
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05213-z
PMID:37526663
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研究论文 | 本研究探讨KPNA2基因在慢性乙型肝炎-肝硬化-肝细胞癌演变过程中的诊断、风险分层和化疗敏感性价值 | 首次发现KPNA2作为单调变化差异表达基因在CLH演变过程中的动态表达规律，并构建了预测HCC发生风险的列线图模型 | 研究样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证KPNA2的临床应用价值 | 探索KPNA2在慢性乙型肝炎-肝硬化-肝细胞癌演变过程中的诊断和预后价值 | 慢性乙型肝炎患者、肝硬化患者和肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | ELISA, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | 列线图模型, Cox回归模型 | 基因表达数据, 临床病理数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 358 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis of expression profile and prognostic values of connexin family in LUAD
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05075-5
PMID:37458803
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了连接蛋白家族在肺腺癌中的表达谱和预后价值 | 首次在泛癌和肺腺癌中系统分析连接蛋白家族的表达差异和预后意义，并构建了结合风险评分和临床特征的预后模型 | NA | 全面分析连接蛋白基因家族在肺腺癌中的表达谱、预后意义、遗传改变、潜在生物学功能和药物敏感性 | 连接蛋白基因家族，特别是GJB2-5基因 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞测序，多组学分析 | 预后风险模型，列线图 | 基因表达数据，临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 359 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell and bulk sequencing analyses with experimental validation identify the prognostic and immunological implications of CD226 in pan-cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05268-y
PMID:37580402
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量测序分析结合实验验证，研究CD226在泛癌中的预后和免疫学意义 | 首次在泛癌水平系统研究CD226的表达特征、预后价值和免疫调控功能，并验证其作为免疫治疗生物标志物的潜力 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于小鼠黑色素瘤模型，需要更多临床样本验证 | 探究CD226在泛癌中的生物学功能、肿瘤免疫作用及其预测预后和免疫治疗反应的潜力 | 多种癌症类型、肿瘤浸润免疫细胞（CD8+T细胞、NK细胞） | 生物信息学 | 泛癌 | 单细胞测序, 批量测序, 基因集富集分析, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床预后数据 | 多种癌症类型的批量测序数据和单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 360 | 2025-10-06 |
Selenium metabolism heterogeneity in pan-cancer: insights from bulk and single-cell RNA sequencing
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05333-6
PMID:37648807
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研究论文 | 通过批量和单细胞RNA测序分析泛癌中硒代谢异质性及其与免疫反应和癌症生物学的关联 | 首次在泛癌水平系统描绘硒代谢景观，结合单细胞分辨率揭示细胞间通讯机制 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证硒代谢的具体分子机制 | 探究硒代谢在癌症发生发展和免疫调节中的作用 | 多种癌症类型和细胞类型（包括上皮细胞、成纤维细胞和巨噬细胞） | 生物信息学 | 泛癌 | RNA测序, 基因集富集分析(GSEA), 机器学习, 细胞间通讯分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | TCGA、GTEx、CCLE和单细胞数据集整合分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |