单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-10-30 |
Unraveling Vulnerabilities in Endocrine Therapy-Resistant HER2+/ER+ Breast Cancer
2023-Nov-02, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad159
PMID:37897495
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研究论文 | 本研究开发并表征了两种内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌体外模型，以识别可能的治疗脆弱性 | 本研究首次开发了两种长期雌激素剥夺的细胞系，并结合全基因组测序和单细胞RNA测序，揭示了HER2+/ER+乳腺癌内分泌治疗耐药的分子机制和代谢重塑 | 本研究仅限于体外模型，尚未在临床环境中验证其发现 | 识别HER2+/ER+乳腺癌内分泌治疗耐药的潜在治疗靶点 | HER2+/ER+乳腺癌细胞系及其内分泌治疗耐药变异体 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 全基因组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 两种HER2+/ER+乳腺癌细胞系及其长期雌激素剥夺变异体 |
| 342 | 2024-10-30 |
A hybrid machine learning and regression method for cell type deconvolution of spatial barcoding-based transcriptomic data
2023-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.24.554722
PMID:37662370
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研究论文 | 本文介绍了一种混合机器学习和回归方法SDePER，用于空间条形码转录组数据的细胞类型反卷积 | SDePER方法通过机器学习去除ST和scRNA-seq数据之间的系统差异（平台效应），并考虑了细胞类型的稀疏性和空间相关性 | NA | 开发一种新的方法来提高空间条形码转录组数据的细胞类型反卷积的准确性和鲁棒性 | 空间条形码转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合机器学习和回归模型 | 转录组数据 | 四个真实数据集和模拟数据 |
| 343 | 2024-10-30 |
Systems biological assessment of the temporal dynamics of immunity to a viral infection in the first weeks and months of life
2023-Jan-31, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.01.28.23285133
PMID:36778389
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研究论文 | 本文通过多组学方法，对婴儿和幼儿在生命早期几周和几个月内对SARS-CoV-2感染的免疫动态进行了纵向分析 | 首次提供了生命早期几周和几个月内对病毒感染的免疫动态的快照 | NA | 研究婴儿和幼儿在生命早期对SARS-CoV-2感染的免疫动态 | 婴儿和幼儿对SARS-CoV-2感染的先天性和适应性免疫反应 | NA | NA | 多组学分析 | NA | 血液样本 | 感染前、感染期间和感染后收集的血液样本 |
| 344 | 2024-10-30 |
Targeting Immune-Fibroblast Crosstalk in Myocardial Infarction and Cardiac Fibrosis
2023-Jan-26, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2402606/v1
PMID:36747878
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研究论文 | 研究心肌梗死和心脏纤维化中免疫细胞与成纤维细胞之间的相互作用 | 首次揭示了人类心脏疾病中免疫细胞与成纤维细胞之间的分子机制，并展示了通过靶向炎症治疗组织纤维化的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和人类心脏样本，可能存在种属差异 | 探讨心肌梗死和心脏纤维化中免疫细胞与成纤维细胞的相互作用机制 | 心肌梗死和心脏纤维化中的免疫细胞与成纤维细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞基因表达分析、表位映射、染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据 | 38名急性心肌梗死和慢性心力衰竭患者的心脏样本 |
| 345 | 2024-10-28 |
Unified Mouse and Human Kidney Single-Cell Expression Atlas Reveal Commonalities and Differences in Disease States
2023-11-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000217
PMID:37639336
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，比较了18种小鼠肾脏疾病模型与人类糖尿病肾病患者的基因表达差异，揭示了疾病状态下基因表达的共性和差异 | 首次系统性地分析和比较了多种小鼠肾脏疾病模型的单细胞基因表达数据，并将其与人类糖尿病肾病患者的单细胞数据进行对比 | 小鼠模型与人类患者之间的单细胞基因表达变化重叠较少，表明动物模型与人类疾病之间存在差异 | 研究小鼠肾脏疾病模型与人类疾病状态下基因表达的共性和差异 | 18种小鼠肾脏疾病模型和人类糖尿病肾病患者 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 36个单细胞RNA测序样本和42个批量基因表达数据样本 |
| 346 | 2024-10-28 |
Liquid-biopsy proteomics combined with AI identifies cellular drivers of eye aging and disease in vivo
2023-10-26, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.09.012
PMID:37863056
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研究论文 | 本文通过结合液体活检蛋白质组学和单细胞转录组学，追踪了5953种蛋白质在房水中的细胞来源，并开发了人工智能模型评估个体细胞的衰老情况 | 本文首次将液体活检蛋白质组学与单细胞转录组学结合，用于追踪非再生器官如眼睛和大脑的疾病机制，并揭示了帕金森病中的视网膜退化现象 | 本文的研究主要集中在眼睛，尚未扩展到其他器官系统 | 研究眼睛衰老和疾病的细胞驱动因素，并开发新的分子诊断和预后方法 | 眼睛中的5953种蛋白质及其细胞来源，以及个体细胞的衰老情况 | 生物信息学 | 眼科疾病 | 液体活检蛋白质组学，单细胞转录组学 | 人工智能模型 | 蛋白质组学数据，转录组学数据 | 5953种蛋白质 |
| 347 | 2024-10-27 |
Neural stem cell metabolism revisited: a critical role for mitochondria
2023-08, Trends in endocrinology and metabolism: TEM
DOI:10.1016/j.tem.2023.05.008
PMID:37380501
|
综述 | 本文综述了线粒体代谢在鼠和人类神经干细胞（NSCs）胚胎和成年大脑中的作用 | 本文重新审视了线粒体在神经干细胞代谢中的关键作用，并探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据在成年NSCs代谢特征中的应用 | NA | 探讨线粒体代谢在神经干细胞维持和命运决定中的作用 | 鼠和人类神经干细胞（NSCs） | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 348 | 2024-10-27 |
Cloning a profibrotic stem cell variant in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-04-26, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abp9528
PMID:37099633
|
研究论文 | 研究通过单细胞克隆技术在特发性肺纤维化患者中鉴定出一种促纤维化干细胞变异体 | 首次通过单细胞克隆技术鉴定出特发性肺纤维化中的一种主要干细胞变异体，并发现其在体外能将正常肺成纤维细胞转化为病理性肌成纤维细胞，在体内能激活和招募肌成纤维细胞 | 研究样本量较小，且仅限于特发性肺纤维化患者和对照组，未涵盖其他肺部疾病 | 探讨特发性肺纤维化中干细胞变异体的特征及其在疾病发展中的作用 | 特发性肺纤维化患者的远端肺部基底干细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 16名特发性肺纤维化患者和10名对照组 |
| 349 | 2024-10-26 |
Microfluidic single-cell migration chip reveals insights into the impact of extracellular matrices on cell movement
2023-10-24, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc00651d
PMID:37750357
|
研究论文 | 开发了一种高通量微流控细胞迁移芯片，结合机器人液体处理和计算机视觉技术，监测3200个单细胞的运动，研究细胞外基质对细胞迁移的影响 | 开发了高通量微流控细胞迁移芯片，提供前所未有的单细胞分辨率，研究不同细胞外基质对三阴性乳腺癌细胞迁移的影响 | 研究主要集中在三阴性乳腺癌细胞，未涵盖所有类型的细胞和疾病 | 研究细胞外基质对细胞迁移的影响，为开发治疗与细胞迁移相关疾病的新策略提供见解 | 三阴性乳腺癌细胞在不同细胞外基质中的迁移行为 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微流控技术 | NA | 图像 | 3200个单细胞 |
| 350 | 2024-10-26 |
A subpopulation of lipogenic brown adipocytes drives thermogenic memory
2023-Oct, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-023-00893-w
PMID:37783943
|
研究论文 | 本文研究了短暂寒冷暴露后棕色脂肪组织的长期转录和代谢适应机制 | 发现了一种脂质生成棕色脂肪细胞亚群，该亚群在短暂寒冷暴露后驱动热生成记忆，并能改善二次寒冷暴露时的热生成反应 | NA | 探讨短暂环境刺激后长期适应的机制 | 棕色脂肪组织及其在寒冷暴露后的转录和代谢适应 | NA | 肥胖 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 351 | 2024-10-25 |
The C-type lectin COLEC10 is predominantly produced by hepatic stellate cells and involved in the pathogenesis of liver fibrosis
2023-11-30, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06324-8
PMID:38036508
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研究论文 | 研究了C型凝集素COLEC10在肝星状细胞中的表达及其在肝纤维化发病机制中的作用 | 首次发现COLEC10主要由肝星状细胞产生，并在肝纤维化过程中表达下调，揭示了其在肝纤维化发病机制中的新作用 | 研究主要基于小鼠和人类肝脏样本，缺乏更广泛的物种验证；体外实验结果需要体内实验进一步验证 | 探讨COLEC10在肝纤维化发病机制中的作用 | 肝星状细胞、肝纤维化患者和健康捐赠者的血清 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | RNA | 小鼠肝脏样本、人类肝脏样本、慢性肝病患者和健康捐赠者的血清 |
| 352 | 2024-10-25 |
Identification of PHACTR4 as A New Biomarker for Diabetic Nephropathy and Its Correlation with Glomerular Endothelial Dysfunction and Immune Infiltration
2023-Nov, Iranian journal of kidney diseases
IF:0.8Q4
PMID:38043109
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研究论文 | 本研究通过结合微阵列和单细胞测序数据分析，识别出PHACTR4作为糖尿病肾病的新生物标志物，并探讨其与肾小球内皮细胞功能障碍和免疫浸润的相关性 | 本研究首次将PHACTR4识别为糖尿病肾病的关键生物标志物，并揭示了其与肾小球内皮细胞功能障碍和免疫浸润的关联 | 本研究主要依赖于微阵列和单细胞测序数据，未进行大规模临床验证 | 识别与糖尿病肾病相关的生物标志物，并探讨其与肾小球内皮细胞功能障碍和免疫浸润的关系 | 糖尿病肾病患者的肾小球内皮细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 微阵列分析、单细胞测序、RT-PCR | NA | 基因表达数据 | 微阵列数据集GSE30528和单细胞测序数据集GSE131882 |
| 353 | 2024-10-21 |
CellBiAge: Improved single-cell age classification using data binarization
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113500
PMID:38032797
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研究论文 | 本文开发了一种名为CellBiAge的机器学习管道，用于通过单细胞转录组学对小鼠脑细胞的年龄进行分类 | 通过基因表达值的二值化显著提高了不同模型、技术和脑区的测试性能，并识别了潜在的与年龄相关的基因 | NA | 开发一种准确的方法来预测特定细胞类型的年龄，以理解衰老的异质性和评估 rejuvenation 策略 | 小鼠脑细胞的年龄分类 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA |
| 354 | 2024-10-21 |
INVADEseq to identify cell-adherent or invasive bacteria and the associated host transcriptome at single-cell-level resolution
2023-Nov, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-023-00888-7
PMID:37789194
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为INVADEseq的新方法，用于在单细胞水平分辨率下识别细胞粘附或侵袭性细菌及其相关宿主转录组 | INVADEseq方法通过引入针对细菌16S rRNA基因的引物，克服了传统scRNAseq技术无法捕获细菌RNA的局限性 | NA | 开发一种能够在单细胞水平上同时分析宿主和细菌转录组的新技术 | 人类肿瘤细胞系和患者肿瘤样本中的细菌及其相关宿主转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 人类肿瘤细胞系和患者肿瘤样本 |
| 355 | 2024-10-21 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify a macrophage population associated with skeletal muscle fibrosis
2023-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.18.537253
PMID:37131694
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组学和空间转录组学技术，识别与骨骼肌纤维化相关的巨噬细胞群体 | 发现了六个新的巨噬细胞集群，这些集群与传统的M1或M2巨噬细胞激活定义不符，并揭示了spp1在肌营养不良中调节基质祖细胞和巨噬细胞相互作用的关键作用 | 研究主要集中在小鼠模型和人类肌肉活检样本上，可能无法完全代表所有肌肉退行性疾病的情况 | 探讨巨噬细胞在肌肉退行性疾病中的作用，特别是其在肌肉纤维化中的作用 | 骨骼肌中的巨噬细胞及其在肌肉退行性疾病中的分子特征 | 数字病理学 | 肌肉退行性疾病 | 单细胞转录组学和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和人类肌肉活检样本 |
| 356 | 2024-10-21 |
Virus infection pattern imprinted and diversified the differentiation of T-cell memory in transcription and function
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1334597
PMID:38264657
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研究论文 | 研究比较了由不同病毒（CMV、EBV和SARS-CoV-2）诱导的记忆T细胞的转录组和功能差异 | 发现CD28和CTLA4可作为评估T细胞抗病毒能力的连续指标，并提出REL是CMV特异性T细胞产生细胞因子的主要调控因子 | NA | 理解不同病毒特异性记忆T细胞的差异，为开发新的抗病毒治疗策略提供基础 | 由CMV、EBV和SARS-CoV-2诱导的记忆T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 由CMV、EBV和SARS-CoV-2诱导的记忆T细胞样本 |
| 357 | 2024-10-21 |
ATF5 promotes malignant T cell survival through the PI3K/AKT/mTOR pathway in cutaneous T cell lymphoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1282996
PMID:38223508
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研究论文 | 研究探讨了转录因子ATF5在皮肤T细胞淋巴瘤中的作用及其通过PI3K/AKT/mTOR通路促进恶性T细胞生存的机制 | 首次揭示了ATF5在皮肤T细胞淋巴瘤中的肿瘤特异性高表达及其促进肿瘤生存的机制 | 研究仅限于两个CTCL细胞系，可能需要进一步的临床验证 | 识别皮肤T细胞淋巴瘤中肿瘤特异性的转录因子 | 皮肤T细胞淋巴瘤中的恶性T细胞 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 两个CTCL细胞系Myla和H9 |
| 358 | 2024-10-21 |
Comprehensive analysis of senescence-associated genes in sepsis based on bulk and single-cell sequencing data
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1322221
PMID:38259686
|
研究论文 | 本文通过批量和单细胞测序数据分析了与脓毒症相关的衰老相关基因，并开发了一种基于关键基因的脓毒症诊断模型 | 本文首次通过综合分析批量和单细胞测序数据，揭示了衰老相关基因与脓毒症之间的关联，并开发了一种高可靠性的诊断模型 | 本文仅使用了两个RNA表达数据集，样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探讨衰老相关基因与脓毒症之间的关系，并开发一种新的脓毒症诊断模型 | 衰老相关基因、脓毒症患者、健康对照组 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序 | 无监督聚类分析、加权基因共表达网络分析 | RNA表达数据、单细胞RNA测序数据 | 两个RNA表达数据集（GSE28750和GSE57065），具体样本量未详细说明 |
| 359 | 2024-10-21 |
Single-cell sequencing reveals an important role of SPP1 and microglial activation in age-related macular degeneration
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1322451
PMID:38259505
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研究论文 | 研究衰老相关细胞因子在年龄相关性黄斑变性中的作用 | 揭示了SPP1和微胶质细胞激活在年龄相关性黄斑变性中的重要作用，并提出SPP1可能成为潜在的治疗靶点 | 需要更多的体外和体内研究来验证结果和治疗效果 | 探讨衰老相关细胞因子在年龄相关性黄斑变性病理生理中的作用 | 人类视网膜神经节细胞和年龄相关性黄斑变性患者 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 118例人类黄斑神经视网膜样本 |
| 360 | 2024-10-21 |
Application progress of single-cell sequencing technology in mesenchymal stem cells research
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1336482
PMID:38264356
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在间充质干细胞研究中的应用进展 | 单细胞测序技术揭示了间充质干细胞在基因表达异质性、分化过程中的动态转录变化以及调控因子在关键过程中的作用 | NA | 探讨单细胞测序技术在间充质干细胞研究中的应用 | 间充质干细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |