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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-10-06 |
Immunosuppressive role of SPP1-CD44 in the tumor microenvironment of intrahepatic cholangiocarcinoma assessed by single-cell RNA sequencing
2023-Aug, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04498-w
PMID:36469154
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序评估SPP1-CD44在肝内胆管癌肿瘤微环境中的免疫抑制作用 | 首次在单细胞水平揭示SPP1-CD44相互作用通过抑制T细胞增殖在肝内胆管癌中发挥免疫抑制功能 | 样本量较小(仅9例患者),缺乏功能实验验证 | 探究SPP1在肝内胆管癌中的生物学功能及其免疫抑制作用 | 肝内胆管癌患者的肿瘤组织和癌旁组织细胞 | 单细胞转录组学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | 差异基因表达分析、生存分析、相关性分析、CellChat、CytoSig | 单细胞转录组数据 | 9例患者的62,770个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 342 | 2025-10-06 |
Heterogeneity and Functional Analysis of Cardiac Fibroblasts in Heart Development
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551164
PMID:37577541
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研究论文 | 本研究通过单细胞mRNA测序和功能分析揭示了心脏成纤维细胞在胚胎和新生阶段的异质性及其在心脏发育中的关键作用 | 首次系统比较了不同来源心脏成纤维细胞的转录谱,通过条件性消融技术揭示了成纤维细胞在心脏发育不同阶段的功能差异 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究心脏成纤维细胞的异质性及其在心脏发育过程中的功能 | 小鼠心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞mRNA测序, 生物信息学分析, 单分子原位杂交, 白喉毒素片段A消融系统 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 两个小鼠品系在18个发育阶段的成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 343 | 2025-10-06 |
Loss of metabolic fitness drives tumor resistance after CAR-NK cell therapy and can be overcome by cytokine engineering
2023-07-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add6997
PMID:37494448
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式分析,揭示了CAR-NK细胞在输注后的异质性演变及其代谢适应性丧失导致肿瘤耐药的机制 | 首次在临床前模型和患者样本中系统追踪CAR-NK细胞从肿瘤控制到复发阶段的体内演变过程,发现代谢适应性丧失是耐药关键机制,并提出IL-15细胞因子工程可部分克服此问题 | 研究样本量有限,仅包含一个应答者和一个无应答者患者样本,需要在更大队列中验证发现 | 探究CAR-NK细胞输注后的转录特征和影响肿瘤控制的因素 | CAR-NK细胞和淋巴瘤模型 | 细胞治疗 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 质谱流式 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 临床前淋巴瘤模型及2例患者样本(1例应答者,1例无应答者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 344 | 2025-10-06 |
p38MAPKα Stromal Reprogramming Sensitizes Metastatic Breast Cancer to Immunotherapy
2023-06-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-0907
PMID:36883955
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研究论文 | 本研究揭示p38MAPKα抑制剂通过重编程转移性肿瘤微环境增强乳腺癌对免疫疗法的敏感性 | 发现p38MAPKα抑制与OX40激动剂联合使用的协同抗转移效应,并建立p38i转移基质特征与患者预后的关联 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 开发针对转移性乳腺癌的有效免疫治疗策略 | 转移性乳腺癌肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,基质标记方法 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 345 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis of xenotransplanted human retinal organoids defines two migratory cell populations of nonretinal origin
2023-05-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.04.004
PMID:37163980
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了人视网膜类器官移植后产生的两种非视网膜来源的迁移细胞群 | 首次发现移植后出现非视网膜来源的星形胶质细胞和脑/脊髓样神经前体细胞,这些细胞在体外培养的类器官中罕见或缺失 | 研究仅在光感受器缺陷小鼠模型中进行,未验证其他视网膜疾病模型 | 探索受体视网膜环境对移植类器官细胞存活、成熟和增殖的调控机制 | 人视网膜类器官来源细胞和光感受器缺陷小鼠 | 单细胞转录组学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序,组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织学图像 | 移植人视网膜类器官细胞至光感受器缺陷小鼠,并与时间匹配的体外培养类器官对比 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 346 | 2025-10-06 |
Integrated transcriptomics contrasts fatty acid metabolism with hypoxia response in β-cell subpopulations associated with glycemic control
2023-Mar-28, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09232-5
PMID:36978008
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,探索肥胖小鼠中β细胞异质性及其与血糖控制相关的亚群 | 整合单细胞和批量转录组数据识别β细胞新亚群,并发现脂肪酸代谢与缺氧反应在不同血糖表型肥胖中的关联 | 研究仅限于SM/J肥胖小鼠模型,未在其他物种或模型中验证 | 探索β细胞异质性对糖尿病发病机制的影响 | 肥胖SM/J小鼠的胰腺胰岛β细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 347 | 2025-10-06 |
Extracellular vesicle distribution and localization in skeletal muscle at rest and following disuse atrophy
2023-03-10, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-023-00315-1
PMID:36895061
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研究论文 | 本研究探讨了细胞外囊泡在骨骼肌中的分布定位及其在废用性萎缩中的变化 | 首次系统揭示了骨骼肌中细胞外囊泡生物发生因子的细胞类型表达谱和空间定位特征,并比较了不同物种在废用性萎缩模型中细胞外囊泡浓度的差异 | 样本量有限,仅使用了啮齿动物和人类模型,且未深入探讨细胞外囊泡功能机制 | 研究骨骼肌中细胞外囊泡的生物发生、标记物表达和细胞定位,及其在废用性萎缩中的变化 | 大鼠骨骼肌和血清样本,以及人类卧床休息模型的血清样本 | 细胞生物学 | 肌肉萎缩疾病 | 密度梯度超速离心,荧光相关光谱,qPCR,单细胞RNA测序,免疫组织化学,纳米颗粒跟踪分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质定位数据,纳米颗粒浓度数据 | 大鼠和人类废用性萎缩模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 348 | 2025-10-06 |
A cellular taxonomy of the adult human spinal cord
2023-02-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.01.007
PMID:36731429
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学技术构建了成人人类脊髓的细胞分类系统 | 首次系统性地建立了成人人类脊髓的细胞分类图谱,揭示了运动神经元的特异性分子特征 | 研究主要基于单核RNA测序数据,可能无法完全反映细胞在生理状态下的完整功能特性 | 构建人类脊髓细胞分类系统并探索其在人类疾病中的意义 | 成人人类脊髓组织 | 单细胞生物学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 抗体验证 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 349 | 2025-10-06 |
Enteroendocrine Cells Protect the Stem Cell Niche by Regulating Crypt Metabolism in Response to Nutrients
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.12.016
PMID:36608902
|
研究论文 | 本研究揭示了肠内分泌细胞通过调节隐窝代谢向干细胞巢传递营养信息的重要机制 | 首次证明肠内分泌细胞作为营养传感器,通过调节隐窝代谢向肠道干细胞巢传递营养状态信息 | 研究主要基于小鼠模型和人类肠道类器官,需要进一步验证在完整生理系统中的功能 | 探究肠内分泌细胞在调节肠道干细胞巢代谢和功能中的作用 | 小鼠肠道上皮细胞、人类肠道类器官、肠道干细胞 | 细胞生物学 | 代谢性疾病 | 间接热量测定、1H-NMR代谢组学、线粒体活体成像、单细胞测序 | NA | 代谢数据、成像数据、基因表达数据 | 转基因小鼠模型和人类多能干细胞来源的肠道类器官 | 10x Genomics, Agilent Technologies | 单细胞RNA测序, 代谢分析 | 10x Chromium, Seahorse生物分析仪 | 10x Genomics单细胞测序平台,Agilent Seahorse XF分析仪 |
| 350 | 2025-10-06 |
A novel cuproptosis-related gene signature of prognosis and immune microenvironment in head and neck squamous cell carcinoma cancer
2023-Jan, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04471-7
PMID:36376617
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研究论文 | 本研究构建了一个铜死亡相关基因特征模型,用于预测头颈鳞状细胞癌患者的预后和免疫微环境 | 首次系统评估头颈鳞状细胞癌中铜死亡相关基因的差异表达和遗传改变,并构建了基于10个CRG的风险预测模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 评估铜死亡相关基因在头颈鳞状细胞癌中的预后价值和免疫微环境关联 | 头颈鳞状细胞癌患者组织和细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序,基因表达分析,拷贝数变异分析 | Cox回归分析,lasso回归 | 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据 | 来自公共数据库的头颈鳞状细胞癌和正常组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 351 | 2025-10-06 |
CD73-generated extracellular adenosine promotes resolution of neutrophil-mediated tissue injury and restrains metaplasia in pancreatitis
2023-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201537R
PMID:36468677
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研究论文 | 本研究探讨CD73通过产生细胞外腺苷在胰腺炎中促进中性粒细胞介导的组织损伤修复和抑制化生的作用机制 | 首次揭示CD73缺失导致胰腺炎中持续化生和炎症的机制,并证明中性粒细胞清除可显著减少化生 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 阐明CD73在胰腺炎炎症消退和组织修复中的作用机制 | CD73基因敲除小鼠和野生型C57BL/6小鼠 | 分子病理学 | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | CD73敲除和野生型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 352 | 2025-10-06 |
The Simple prEservatioN of Single cElls method for cryopreservation enables the generation of single-cell immune profiles from whole blood
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1271800
PMID:38090590
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研究论文 | 开发了一种名为SENSE的单步冷冻保存全血方法,用于生成高质量单细胞免疫图谱 | 开发了单步冷冻保存全血的新方法,在单细胞检测过程中同时进行粒细胞去除,简化了传统多步骤流程 | 样本量较小(n=6),在髓系细胞中存在批次效应 | 开发简化的全血单细胞冷冻保存方法,促进单细胞RNA测序在临床中的应用 | 人类全血样本 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 6个全血样本,获得22,353个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 353 | 2025-10-06 |
EasyCellType: marker-based cell-type annotation by automatically querying multiple databases
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad029
PMID:36998720
|
研究论文 | 开发了一个名为EasyCellType的用户友好计算工具,用于基于标记基因自动注释单细胞RNA测序数据的细胞类型 | 通过自动查询多个数据库并提供图形化注释建议,解决了手动检查细胞标记列表的困难 | NA | 促进单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的自动化过程 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因集富集分析,改进的Fisher精确检验 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 354 | 2025-10-06 |
Idiopathic subglottic stenosis arises at the epithelial interface of host and pathogen
2023-May-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2945067/v1
PMID:37292825
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究特发性声门下狭窄的发病机制,揭示上皮细胞异常与微生物群位移在纤维化过程中的作用 | 首次利用国际患者队列和单细胞RNA测序无偏倚地表征声门下狭窄的细胞亚群,发现上皮祖细胞耗竭和微生物群位移至固有层的新机制 | 疾病罕见性和患者地理分布广泛可能限制样本代表性,动物模型与人类疾病的完全一致性尚需验证 | 探究特发性声门下狭窄的发病机制和病理过程 | 特发性声门下狭窄患者的病变黏膜组织和动物模型 | 单细胞基因组学 | 特发性声门下狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、微生物组数据 | 国际iSGS患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 355 | 2025-10-06 |
PGF2α signaling drives fibrotic remodeling and fibroblast population dynamics in mice
2023-12-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172977
PMID:37934604
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示PGF2α信号通路在特发性肺纤维化中的作用机制 | 首次发现PGF2α/FPr信号轴是TGF-β1非依赖性的IPF信号枢纽,并识别出易感的成纤维细胞亚群 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究PGF2α信号在肺纤维化重塑和成纤维细胞群体动态中的作用 | 表达Sftpc基因突变的小鼠模型和Ptgfr基因敲除小鼠 | 病理生物学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序,伪时序分析,体外实验 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据,组织病理数据 | 多组基因型小鼠队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 356 | 2025-10-06 |
Variant STAT4 and Response to Ruxolitinib in an Autoinflammatory Syndrome
2023-06-15, The New England journal of medicine
DOI:10.1056/NEJMoa2202318
PMID:37256972
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研究论文 | 本研究通过基因测序发现STAT4基因功能获得性变异导致致残性全硬化性硬斑病,并证实JAK抑制剂鲁索替尼可改善该疾病的炎症表型 | 首次发现STAT4基因功能获得性变异与致残性全硬化性硬斑病的因果关系,并证明JAK抑制剂对该疾病的治疗潜力 | 研究样本量较小(仅4名患者),需要更大规模研究验证 | 探究致残性全硬化性硬斑病的遗传病因和潜在治疗方法 | 来自3个无亲缘关系家庭的4名致残性全硬化性硬斑病患者 | 医学遗传学 | 自身炎症性疾病 | 基因组测序, 单细胞RNA测序, 体外细胞功能实验 | NA | 基因组数据, 基因表达数据, 临床数据 | 4名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 357 | 2025-10-06 |
Thyroid hormone receptor α1: a novel regulator of thyroid cancer cell differentiation
2023-10, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02815-2
PMID:37634007
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研究论文 | 本研究揭示甲状腺激素受体α1通过调控PAX8基因表达促进未分化甲状腺癌细胞向分化状态转变 | 首次发现TRα1作为甲状腺分化新调控因子,通过单细胞转录组分析揭示其通过多信号通路抑制肿瘤生长的分子机制 | 研究仅基于两种ATC细胞系,缺乏体内实验验证 | 探索TRα1在未分化甲状腺癌进展中的功能作用 | 人未分化甲状腺癌细胞系THJ-11T和THJ-16T | 癌症生物学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,分子分析 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 两种人ATC细胞系及其TRα1稳定表达株系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 358 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals a cancer-associated fibroblast marker gene signature in hepatocellular carcinoma that predicts prognosis
2023-Mar, ILIVER..
DOI:10.1016/j.iliver.2022.12.002
PMID:40636406
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析构建了肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞的标志基因特征,用于预测患者预后 | 首次构建了基于单细胞RNA测序数据的CAF标志基因特征模型(CAFMGS),为肝细胞癌预后预测提供了新的生物标志物 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 研究癌症相关成纤维细胞在肝细胞癌中的预后价值和治疗靶点潜力 | 肝细胞癌患者和癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 基因表达数据 | TCGA训练队列和ICGC验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 359 | 2025-10-06 |
Inference after latent variable estimation for single-cell RNA sequencing data
2023-12-15, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxac047
PMID:36511385
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研究论文 | 提出了一种称为计数分割的灵活框架,用于在单细胞RNA测序数据分析中进行有效的统计推断 | 开发了计数分割方法,能够在潜在变量估计后实现有效的统计推断,解决了标准方法无法控制I型错误的问题 | 方法基于泊松假设,可能不适用于不符合此假设的数据类型 | 解决单细胞RNA测序数据分析中潜在变量估计后的统计推断问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计推断框架 | 基因表达数据 | 多能干细胞向心肌细胞分化的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 360 | 2025-10-06 |
T cell-Mediated Development of Stromal Fibroblasts with an Immune-Enhancing Chemokine Profile
2023-08-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0593
PMID:37216570
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过T细胞介导的细胞因子信号从免疫抑制表型向免疫激活表型转化的分子机制 | 首次发现CAFs具有表型可塑性,能够通过T细胞来源的IFNγ和TNFα协调调控趋化因子表达,实现从CXCL12+/CXCL9-免疫抑制表型向CXCL12-/CXCL9+免疫激活表型的转化 | 研究主要基于小鼠胰腺腺癌模型,在人类肿瘤中的适用性需要进一步验证 | 探究癌症相关成纤维细胞是否能够适应不同免疫微环境并形成免疫促进性趋化因子谱 | 小鼠胰腺腺癌中的癌症相关成纤维细胞和CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |