单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 3561 - 3580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3561 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics of Epstein-Barr Virus and Human Herpesvirus 6 Coinfection
2023-Jul-18, Microbiology resource announcements
IF:0.7Q4
DOI:10.1128/mra.00342-23
PMID:37338391
|
研究论文 | 本文描述了同时感染埃博病毒和人类疱疹病毒6型的单细胞转录组学研究 | 首次在单细胞水平上探讨EBV和HHV-6的共感染及其相互作用 | 未涉及感染过程中其他细胞类型的作用 | 研究EBV和HHV-6共感染在单细胞层面的转录组特征 | 两种携带EBV和HHV-6的淋巴母细胞系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 两个淋巴母细胞系 |
| 3562 | 2024-08-07 |
Spatial Reconstruction of Oligo and Single Cells by De Novo Coalescent Embedding of Transcriptomic Networks
2023-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202206307
PMID:37323105
|
研究论文 | 本文提出了一种新的算法D-CE，用于从头合并非单细胞转录组网络，以重建单细胞的三维空间组织 | D-CE算法通过保留中尺度网络组织，能够捕捉空间域，识别空间表达基因，并重建细胞样本的三维空间分布 | NA | 解决从头重建单细胞三维空间组织的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | D-CE算法 | 转录组数据 | 14个数据集和497个重建 |
| 3563 | 2024-08-07 |
Lactation-associated macrophages exist in murine mammary tissue and human milk
2023-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01530-0
PMID:37337103
|
研究论文 | 本文描述了在小鼠乳腺组织和人乳中存在的哺乳期相关巨噬细胞 | 首次鉴定出哺乳期诱导的CD11cCX3CR1Dectin-1巨噬细胞群体（liMac），并发现其在哺乳期通过增殖在原地扩张，且部分依赖于微生物群 | NA | 研究哺乳期乳腺腺体巨噬细胞的动态变化 | 小鼠乳腺组织和人乳中的巨噬细胞 | NA | NA | 多参数流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 3564 | 2024-08-07 |
Progenitor hierarchy among parietal epithelial cells depicted at the single-cell level
2023-07, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.04.019
PMID:37349059
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术进一步描述了壁上皮细胞（PECs）在肾脏功能和疾病中的作用，并确认了其在小鼠肾脏生物学中的关键病理生理作用。 | 利用单细胞RNA测序技术详细描绘了壁上皮细胞的祖细胞层次结构。 | NA | 探讨壁上皮细胞在肾脏功能和疾病中的作用。 | 壁上皮细胞（PECs）及其在肾脏中的祖细胞类型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 3565 | 2024-08-07 |
Modelling viral encephalitis caused by herpes simplex virus 1 infection in cerebral organoids
2023-07, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01405-y
PMID:37349587
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序、电生理学和免疫染色技术，研究了人脑类器官中由单纯疱疹病毒1型（HSV-1）引起的病毒性脑炎 | 本文首次在人脑类器官中模拟了HSV-1感染，并探讨了抗炎药物与抗病毒治疗结合的可能性 | NA | 研究HSV-1感染对脑类器官的影响及潜在的治疗策略 | 人脑类器官中的HSV-1感染 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 3566 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals maturation of transplanted stem cell-derived retinal pigment epithelial cells toward native state
2023-06-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2214842120
PMID:37339216
|
研究论文 | 该研究揭示了移植的干细胞来源的视网膜色素上皮细胞向原生状态的成熟过程 | 研究首次使用单细胞RNA测序分析了移植的视网膜色素上皮细胞的转录特征，并发现了其向成人原生视网膜色素上皮状态的单向成熟过程 | 对移植RPE细胞如何与宿主视网膜相互作用的理解仍然有限 | 探索干细胞来源的视网膜色素上皮细胞在受体视网膜中的生存和成熟机制 | 免疫功能正常的兔子中的干细胞来源的视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 在免疫功能正常的兔子中移植了干细胞来源的视网膜色素上皮细胞，具体样本数量未提供 |
| 3567 | 2024-08-05 |
Unique evolution of foraminiferal calcification to survive global changes
2023-06-23, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add3584
PMID:37343099
|
研究论文 | 本研究揭示了有孔虫的钙化机制及其对海洋酸化的反应 | 识别了独特的α-碳酸酐酶基因，揭示了应对海洋酸化的钙化控制机制 | 未广泛测量其他有孔虫物种的钙化机制，可能限制了普适性 | 探索有孔虫的钙化机制以理解其对全球变化的适应 | 主要研究有孔虫及其钙化相关基因 | 生物地球化学 | NA | 单细胞转录组学和荧光显微镜 | NA | 基因数据 | 个别有孔虫样本 |
| 3568 | 2024-08-05 |
CCL24 regulates biliary inflammation and fibrosis in primary sclerosing cholangitis
2023-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.162270
PMID:37345655
|
研究论文 | 本研究探讨了CCL24在原发性硬化性胆管炎中的作用及其潜在的治疗效果 | 首次验证了CCL24在原发性硬化性胆管炎中的关键作用，并评估了其作为治疗靶点的潜力 | 实验主要基于小鼠模型，临床适用性需进一步研究验证 | 评估CCL24在原发性硬化性胆管炎中的作用及其抑制对疾病的影响 | 原发性硬化性胆管炎及相关的肝脏炎症和纤维化 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 针对CCL24的单克隆抗体CM-101以及空间转录组学 | Mdr2-/-小鼠模型 | 组织样本和血清样本 | 使用了Mdr2-/-小鼠模型并分析了PSC患者的肝活检和血清样本 |
| 3569 | 2024-08-07 |
Nanoparticle-enhanced proton beam immunoradiotherapy drives immune activation and durable tumor rejection
2023-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167749
PMID:37345658
|
研究论文 | 本文研究了纳米颗粒增强的质子束免疫放疗在驱动免疫激活和持久肿瘤排斥中的作用 | 首次研究了质子束疗法作为组合免疫放疗策略的效果，并展示了纳米颗粒NBTXR3在增强免疫反应中的显著作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索质子束疗法与免疫疗法结合在肿瘤治疗中的效果 | 小鼠的肺癌模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 质子束疗法（PBT） | NA | RNA测序数据 | 使用双肿瘤肺癌模型的小鼠 |
| 3570 | 2024-08-05 |
Interactions between MFAP5 + fibroblasts and tumor-infiltrating myeloid cells shape the malignant microenvironment of colorectal cancer
2023-06-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04281-6
PMID:37344903
|
研究论文 | 本研究探讨了MFAP5 + 成纤维细胞与肿瘤浸润性髓系细胞之间的相互作用如何影响结直肠癌的恶性微环境 | 本研究揭示了肿瘤特异性MFAP5 + 成纤维细胞与髓系细胞之间的动态相互作用，并识别出多个肿瘤促进信号通路 | 未提供研究的具体局限性 | 探索结直肠癌中MFAP5 + 成纤维细胞与肿瘤浸润性髓系细胞之间的相互作用及其对肿瘤微环境的影响 | 主要研究MFAP5 + 成纤维细胞及其与肿瘤浸润性髓系细胞的相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 27,414个细胞，来自肿瘤及相邻组织 |
| 3571 | 2024-08-05 |
HOPX is a tumor-suppressive biomarker that corresponds to T cell infiltration in skin cutaneous melanoma
2023-Jun-21, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-023-02962-2
PMID:37344870
|
研究论文 | HOPX作为一个肿瘤抑制生物标志物，与皮肤黑色素瘤中的T细胞浸润相关 | HOPX被确认为在SKCM进展中的抑制因子，并可能成为新的免疫治疗靶点 | HOPX在SKCM中的具体功能尚不明确，需要进一步研究 | 探讨HOPX在皮肤黑色素瘤患者中的诊断和预后价值 | 皮肤黑色素瘤患者，特别是HOPX表达的影响 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序，转录组测序 | A375细胞系 | 生物数据 | 使用TCGA和GEO数据库的多种样本，具体样本数量未提供 |
| 3572 | 2024-08-05 |
Joint inference of exclusivity patterns and recurrent trajectories from tumor mutation trees
2023-06-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39400-w
PMID:37344522
|
研究论文 | 本文提出了一种新的概率框架TreeMHN，用于从肿瘤进化树共同推断排斥模式和重复轨迹 | 创新点在于TreeMHN能同时处理肿瘤的排斥模式和进化轨迹的推断 | 未提及现有方法在多个方面的不足 | 旨在通过肿瘤变异树推断肿瘤的进化过程和突变模式 | 分析血液、肺部和乳腺癌的数据集 | 数字病理学 | 肺癌 | 多区域和单细胞测序 | TreeMHN | 数据集 | NA |
| 3573 | 2024-08-07 |
Selective oxidative protection leads to tissue topological changes orchestrated by macrophage during ulcerative colitis
2023-06-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39173-2
PMID:37344477
|
研究论文 | 本研究利用成像质谱流式细胞技术和单细胞RNA测序技术，描绘了人类结肠生态系统的单细胞景观，并探讨了溃疡性结肠炎中组织拓扑结构的变化及其机制。 | 本研究首次揭示了溃疡性结肠炎区域中组织驻留巨噬细胞的消失反应，并提出了炎症巨噬细胞替代驻留巨噬细胞的机制。 | NA | 理解溃疡性结肠炎生态系统的组成和空间变化 | 人类结肠生态系统的单细胞景观 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 成像质谱流式细胞技术，单细胞RNA测序 | NA | 图像，基因表达数据 | NA |
| 3574 | 2024-08-07 |
Integrative scATAC-seq and scRNA-seq analyses map thymic iNKT cell development and identify Cbfβ for its commitment
2023-Jun-20, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00547-x
PMID:37336875
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）技术，分析了超过17,000个iNKT细胞的转录组和超过39,000个iNKT细胞的染色质可及性状态，以描绘胸腺中iNKT细胞的发育轨迹并识别关键的转录因子Cbfβ。 | 本研究首次揭示了iNKT细胞在胸腺中的发育程序及其细胞异质性，并发现了一个新的转录因子Cbfβ，该因子在iNKT细胞早期承诺阶段起关键作用。 | NA | 揭示胸腺中iNKT细胞的发育程序及其细胞异质性，并识别关键的转录因子。 | iNKT细胞的发育过程及其分子机制。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 超过17,000个iNKT细胞的转录组和超过39,000个iNKT细胞的染色质可及性状态 |
| 3575 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling of sepsis identifies HLA-DRlowS100Ahigh monocytes with immunosuppressive function
2023-06-19, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-023-00462-y
PMID:37337301
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了与免疫抑制状态相关的HLA-DRlowS100Ahigh单核细胞的特征 | 本研究首次识别出HLA-DRlowS100Ahigh单核细胞，这些细胞在脓毒症患者中显著富集并可能具有免疫抑制功能 | 本研究主要依赖于已有的数据集，可能存在样本选择偏差 | 探讨脓毒症患者中免疫抑制的免疫细胞特征及其潜在治疗靶点 | 脓毒症患者的单核细胞亚群体 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自脓毒症患者和小鼠模型的两个已发表的数据集 |
| 3576 | 2024-08-05 |
Analysis of Notch1 signaling in mammalian sperm development
2023-Jun-19, BMC research notes
IF:1.6Q2
DOI:10.1186/s13104-023-06378-z
PMID:37337280
|
研究论文 | 本文分析了Notch1信号在哺乳动物精子发育中的作用 | 利用转基因小鼠系统研究Notch1信号在精子发育中的表达情况，发现其在正常精子发育中的作用或许被低估 | 在转基因小鼠模型中未观察到Notch1信号的活跃表达，可能影响结果的普适性 | 验证Notch1在精子发育过程中的实际作用 | 小鼠和人类睾丸中的精子细胞谱系 | 数字病理 | NA | RNA-seq | NA | 单细胞数据 | 四个单细胞RNA-seq数据集 |
| 3577 | 2024-08-05 |
Significance of liquid-liquid phase separation (LLPS)-related genes in breast cancer: a multi-omics analysis
2023-06-19, Aging
DOI:10.18632/aging.204812
PMID:37338518
|
研究论文 | 本研究探索了与液-液相分离（LLPS）相关的基因在乳腺癌中的重要性 | 建立了一个由九个基因组成的LLPS相关预后模型，特别是发现PGAM1作为新标记 | 研究模型的应用和验证主要集中在特定数据集和基因上，可能不适用于所有乳腺癌患者 | 探讨液-液相分离在乳腺癌中的作用和相关基因的重要性 | 乳腺癌细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序，转录组测序， COX回归，Lasso回归 | 加权共表达网络分析（WGCNA） | 基因表达数据 | 使用了GSE188600和GSE198745的单细胞测序数据集及转录组测序数据，具体样本数量未提及 |
| 3578 | 2024-08-05 |
Prioritization and functional validation of target genes from single-cell transcriptomics studies
2023-06-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05006-7
PMID:37330599
|
研究论文 | 该文章探讨了如何从单细胞转录组学研究中优先选择并功能验证靶基因 | 文章创新性地通过针对未报告的高排名尖端内皮细胞标记基因进行优先选择和功能验证 | 并非所有高排名的scRNA-seq标记都表现出预测功能，这可能限制了目标的实际应用 | 目标是选择和验证与血管生成相关的尖端内皮细胞靶基因 | 研究对象为尖端内皮细胞的标记基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因 | 六个候选基因 |
| 3579 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic profiling of microvascular endothelial cell heterogeneity in congenital diaphragmatic hernia
2023-06-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-37050-y
PMID:37330615
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，探讨了先天性膈疝（CDH）中微血管内皮细胞的异质性及其与肺发育不良和重塑的关系 | 首次揭示了CDH肺中微血管内皮细胞的三个不同集群，并发现CDH微血管内皮细胞集群具有独特的炎症转录组特征 | 研究仅使用了硝苯酚诱导的CDH模型，可能限制了结果的普遍性 | 探究先天性膈疝肺中微血管内皮细胞的异质性及其与肺发育不良和重塑的关系 | 先天性膈疝（CDH）肺中的微血管内皮细胞 | 数字病理学 | 先天性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了E21.5的硝苯酚模型中的大鼠胎儿，包括健康对照组（2HC）、硝苯酚暴露对照组（NC）和硝苯酚暴露的CDH组 |
| 3580 | 2024-08-05 |
Heterogeneity of tumor immune microenvironment in malignant and metastatic change in LUAD is revealed by single-cell RNA sequencing
2023-06-16, Aging
DOI:10.18632/aging.204752
PMID:37335089
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了肺腺癌（LUAD）肿瘤免疫微环境的异质性。 | 通过单细胞测序技术，分析了LUAD中不同细胞类型的转录组特征，并识别了709个在LUAD微环境中发挥重要作用的基因。 | 本文没有详细说明样本的多样性及其对结果的影响。 | 研究肺腺癌的肿瘤微环境及其在恶性和转移变化中的异质性。 | 主要研究对象是肺腺癌（LUAD）中的免疫细胞和其相关的转录组特征。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |