单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 3461 - 3480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3461 | 2024-08-05 |
Combined near infrared photoacoustic imaging and ultrasound detects vulnerable atherosclerotic plaque
2023-Jun-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.06.11.23291099
PMID:37398016
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研究论文 | 本文展示了近红外光声成像与超声结合用于检测易损斑块 | 文章创新性地将近红外光声成像与超声成像结合，以区分稳定与易损斑块 | 目前的研究仅限于25名患者的切除斑块 | 研究目的在于有效识别和表征动脉粥样硬化斑块的形态和脆弱性 | 研究对象为25名患者的动脉粥样硬化斑块样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 近红外光声成像 | NA | 斑块样本 | 25个切除的斑块样本 |
| 3462 | 2024-08-05 |
Spatially resolved expression landscape and gene-regulatory network of human gastric corpus epithelium
2023-06-07, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwac059
PMID:37402315
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研究论文 | 文章揭示了人类胃体上皮的空间表达景观和基因调控网络 | 首次系统性地分析了人类胃体上皮的细胞多样性和稳态 | 研究可能缺乏对胃体其他区域的广泛性分析 | 揭示人类胃体上皮的分子特征和基因调控机制 | 研究了人类胃体上皮细胞及其干/前体细胞群体 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、单细胞可接触染色质测序(scATAC-seq) | NA | NA | NA |
| 3463 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of individual retinal organoids reveals determinants of cell fate heterogeneity
2023-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.31.543087
PMID:37398481
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研究论文 | 本文探讨了利用单细胞测序分析视网膜类器官中细胞命运异质性的决定因素 | 创新地应用了sci-Plex方法来扩展对视网膜类器官细胞组成的分析 | 当前技术对处理条件的限制阻碍了类器官异质性的研究 | 研究类器官的异质性及其对人类发展和疾病模型的贡献 | 视网膜类器官及其细胞类别的组成 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 细胞组成数据 | 410个类器官 |
| 3464 | 2024-08-07 |
Single-cell lineage tracing reveals hierarchy and mechanism of adipocyte precursor maturation
2023-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.01.543318
PMID:37398135
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术揭示了皮肤中脂肪细胞前体细胞的特征及其成熟机制 | 发现了新的未成熟前脂肪细胞群体，揭示了前体细胞的分化潜能偏向性，并首次识别出Sox9作为驱动前体细胞向脂肪细胞分化的关键因子 | NA | 探究脂肪细胞前体细胞的成熟过程及其分子机制 | 皮肤中的脂肪细胞前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 3465 | 2024-08-07 |
Boosting Single-Cell RNA Sequencing Analysis with Simple Neural Attention
2023-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.29.542760
PMID:37398136
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scANNA的新型可解释深度学习模型，用于单细胞RNA测序研究，利用神经注意力学习基因关联 | scANNA模型通过神经注意力机制提高了单细胞RNA测序分析的可解释性，并能在不重新训练的情况下进行下游分析 | 当前深度学习方法在单细胞RNA测序分析中缺乏可解释性，且现有流程是为特定任务设计的，不适用于分析的不同阶段 | 开发一种可解释的深度学习模型，以提高单细胞RNA测序分析的效率和可解释性 | 单细胞RNA测序数据分析 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经注意力模型 | 基因表达数据 | NA |
| 3466 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals microenvironment context-specific routes for epithelial-mesenchymal transition in pancreas cancer cells
2023-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.30.542969
PMID:37398348
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨胰腺癌细胞在缺氧或生长因子诱导下上皮-间质转化（EMT）的转录基础 | 发现FAT1蛋白在上皮细胞中富集并抑制EMT，以及AXL受体酪氨酸激酶在缺氧条件下与YAP核定位相关，这些发现为胰腺癌治疗提供了新的潜在药物靶点 | 研究主要集中在单细胞RNA测序数据分析，未涉及临床试验验证 | 揭示胰腺癌细胞在不同微环境条件下EMT的特定信号通路 | 胰腺癌细胞在缺氧或生长因子诱导下的上皮-间质转化 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3467 | 2024-08-05 |
Transcriptome sequencing and single-cell sequencing analysis identify GARS1 as a potential prognostic and immunotherapeutic biomarker for multiple cancers, including bladder cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1169588
PMID:37404826
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研究论文 | 本研究识别GARS1作为多种癌症（包括膀胱癌）的潜在预后和免疫治疗生物标志物 | GARS1在多种癌症中表现出预后价值，并与免疫调节通路紧密相关，未被广泛探索 | GARS1的角色在肿瘤免疫学中的影响仍然未完全理解 | 研究GARS1在多种癌症中的表达及其预后和免疫学影响 | 人类癌症中的GARS1表达及其在膀胱癌细胞中的生物学功能 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 转录组测序和单细胞测序 | NA | mRNA和蛋白表达数据，单细胞数据 | NA |
| 3468 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing reveals tumor heterogeneity and a signature based on NK cell marker genes for predicting prognosis in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1200114
PMID:37397471
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研究论文 | 本文构建了一个基于NK细胞相关基因的肝细胞 carcinoma (HCC) 患者预后预测模型 | 使用NK细胞标记基因作为创新生物标志物进行HCC的预后评估 | NA | 研究旨在评估NK细胞相关基因预测HCC患者预后的可行性 | 以肝细胞癌患者为研究对象 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | Cox回归和lasso回归 | 基因表达数据 | 从TCGA数据集中获得数据，涉及161个HCC相关的NK细胞标记基因 |
| 3469 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics and data analyses for prokaryotes-Past, present and future concepts
2023, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2023.04.002
PMID:37400172
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研究论文 | 这篇文章探讨了原核生物的单细胞转录组学及其数据分析的过去、现在和未来概念 | 提出了针对细菌的单细胞RNA测序新方法，并讨论了实验与数据分析中面临的挑战 | 在实验工作流程和数据处理分析中仍然存在难题，例如放大过程中引入的偏差 | 研究原核生物单细胞转录组学的应用以及如何优化实验和数据分析 | 主要针对原核生物，尤其是细菌的单细胞mRNA测序 | 数字病理学 | NA | mRNA测序 | NA | NA | NA |
| 3470 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA sequencing of leaf sheath cells reveals the mechanism of rice resistance to brown planthopper (Nilaparvata lugens)
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1200014
PMID:37404541
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了水稻对褐飞虱的抗性机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了不同水稻细胞类型在抵抗褐飞虱中的作用 | 研究的细胞类型尚不全面，可能遗漏其他相关细胞的作用 | 探讨水稻对褐飞虱的抗性分子机制 | 比较易感和抗性水稻品种的叶鞘细胞反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了30,000个细胞来自两个水稻品种 |
| 3471 | 2024-08-05 |
Deciphering the contributions of cuproptosis in the development of hypertrophic scar using single-cell analysis and machine learning techniques
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1207522
PMID:37409114
|
研究论文 | 本研究探讨了铜诱导细胞死亡在肥厚性瘢痕形成中的作用。 | 通过单细胞分析和机器学习算法，鉴定出新的治疗靶标基因（如ATP7A、ULK1和MTF1）并提出治疗新思路。 | 未提及样本量和具体实验设置的详细信息，可能影响结果的普适性。 | 研究铜诱导细胞死亡在肥厚性瘢痕形成中的潜在作用。 | 主要关注肥厚性瘢痕及相关细胞（如成纤维细胞）。 | 数字病理学 | 肥厚性瘢痕 | 单细胞测序，转录组数据分析，qRT-PCR | 随机森林，支持向量机 | 基因表达数据 | 未提供具体的样本量 |
| 3472 | 2024-08-05 |
Integration analysis of single-cell and spatial transcriptomics reveal the cellular heterogeneity landscape in glioblastoma and establish a polygenic risk model
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1109037
PMID:37397378
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组测序分析了胶质母细胞瘤的细胞异质性，建立了一个多基因风险模型 | 该研究提出了一种基于恶性细胞转变的TPRGRS，通过整合分析bulkRNA-seq和scRNA-seq数据，为胶质母细胞瘤患者提供个性化药物方案的可能性 | 未提及研究的具体局限性 | 探究胶质母细胞瘤中的细胞异质性及其对肿瘤进展的影响 | 胶质母细胞瘤中的恶性细胞亚群体 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 空间转录组测序 (stRNA-seq), bulk RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 涉及三个数据集的患者样本 |
| 3473 | 2024-08-05 |
A tricarboxylic acid cycle-based machine learning model to select effective drug targets for the treatment of esophageal squamous cell carcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1195195
PMID:37383713
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研究论文 | 本文基于TCA循环相关基因构建了一种预测食管鳞状细胞癌的风险评分模型 | 创新性地将TCA循环基因与食管鳞状细胞癌相关联，并建立预测模型 | 未全面探讨TCA循环在食管鳞状细胞癌中的所有潜在作用 | 研究TCA循环基因在食管鳞状细胞癌中的角色，并预测患者预后 | 食管鳞状细胞癌样本及相关TCA循环基因 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞测序 | Cox回归和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 38类8种细胞类型的单细胞序列数据 |
| 3474 | 2024-08-05 |
Deciphering the role of NETosis-related signatures in the prognosis and immunotherapy of soft-tissue sarcoma using machine learning
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1217488
PMID:37408763
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研究论文 | 该论文探讨了NETosis相关基因在软组织肉瘤预后和免疫治疗中的作用 | 研究提供了NETosis评分系统以预测免疫治疗反应，展现了个性化治疗的潜力 | 关于NETosis在软组织肉瘤中的作用的研究仍然有限 | 研究NETosis相关基因在软组织肉瘤中的作用及其预后价值 | 使用TCGA和GEO数据库中的大规模队列研究NETosis相关基因 | 机器学习 | 软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归和支持向量机递归特征消除（SVM-RFE） | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的大规模样本 |
| 3475 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing highlights the role of PVR/PVRL2 in the immunosuppressive tumour microenvironment in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1164448
PMID:37383234
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了肝细胞癌（HCC）肿瘤微环境中的免疫抑制作用，特别是PVR/PVRL2轴的作用 | 首次揭示了VCAN+肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）可能经历M2样极化，并发现TIGIT-PVR/PVRL2轴在免疫抑制微环境中的重要作用 | 研究仅限于体外实验，尚未进行临床试验验证 | 深入理解肝细胞癌中肿瘤微环境的异质性和细胞间通讯网络 | 肝细胞癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 35786个未选择的单细胞来自3个肝细胞癌肿瘤和3个匹配的邻近样本 |
| 3476 | 2024-08-07 |
The Regulation Network of Glycerolipid Metabolism as Coregulators of Immunotherapy-Related Myocarditis
2023, Cardiovascular therapeutics
IF:3.4Q2
DOI:10.1155/2023/8774971
PMID:37388276
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和代谢组学分析，研究了免疫疗法相关心肌炎中甘油酯代谢的调控网络 | 首次揭示了线粒体调控的甘油酯代谢在免疫疗法相关心肌炎中的关键作用，特别是DGKZ蛋白的作用 | NA | 探究免疫疗法相关心肌炎中代谢重编程的机制 | 免疫细胞在免疫疗法相关心肌炎中的异质性和代谢网络差异 | NA | 心肌炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS） | NA | RNA序列，代谢组学数据 | Pdcd1-/-Ctla4+/-和野生型小鼠心脏的CD45+单细胞 |
| 3477 | 2024-08-07 |
Impact of Cuproptosis-related markers on clinical status, tumor immune microenvironment and immunotherapy in colorectal cancer: A multi-omic analysis
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.06.011
PMID:37389187
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了铜死亡相关标记物在结直肠癌中的临床状态、肿瘤免疫微环境和免疫治疗中的作用 | 构建了一种基于铜死亡相关标记物的新型评分系统（CuproScore），用于预测结直肠癌患者的预后、肿瘤微环境及免疫治疗反应 | NA | 探讨铜死亡及其相关生物标志物在结直肠癌中的功能和临床价值 | 结直肠癌中的铜死亡相关标记物及其对临床状态、分子功能和肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多组学分析（转录组学、基因组学和单细胞转录组） | NA | 转录组数据 | 15对结直肠癌组织样本，以及4种结直肠癌细胞系的体外实验 |
| 3478 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of neural stem cells derived from human trisomic iPSCs reveals the abnormalities during neural differentiation of Down syndrome
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1137123
PMID:37396785
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了从唐氏综合征患者和正常对照患者的诱导多能干细胞（iPSCs）分化而来的神经干细胞（NSCs），揭示了唐氏综合征神经分化过程中的异常情况。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了唐氏综合征神经分化过程中的分子机制异常，特别是发现了一组未能分化为神经干细胞的唐氏综合征iPSCs（DS-iPSCs-ND），并分析了其异常表达模式。 | 研究仅限于细胞水平，未涉及临床患者，且未探讨这些发现如何转化为临床治疗策略。 | 探究唐氏综合征神经分化过程中的分子机制异常。 | 唐氏综合征患者的诱导多能干细胞（iPSCs）及其分化后的神经干细胞（NSCs）。 | 数字病理学 | 唐氏综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从唐氏综合征和正常对照的iPSC样本中分别获得了8,500和10,922个细胞，从NSC样本中分别获得了7,182和9,324个细胞。 |
| 3479 | 2024-08-07 |
Single cell transcriptome profiling reveals cutaneous immune microenvironment remodeling by photodynamic therapy in photoaged skin
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1183709
PMID:37404811
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，探讨了5-氨基酮戊酸光动力疗法（ALA-PDT）对光老化皮肤中免疫微环境的改造作用 | 首次详细揭示了ALA-PDT如何通过改变免疫细胞的功能和相互作用，逆转光老化皮肤的免疫衰老状态 | 研究仅限于人类前臂的伸侧皮肤样本，且结果需要进一步在更广泛的样本和人群中验证 | 探讨ALA-PDT对光老化皮肤免疫微环境的影响及其潜在机制 | 光老化皮肤中的免疫细胞及其功能变化 | 数字病理学 | 皮肤老化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 光老化皮肤样本在ALA-PDT治疗前后的对比 |
| 3480 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic profiling of dorsal root ganglion: an overview
2023, Frontiers in neuroanatomy
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/fnana.2023.1162049
PMID:37405309
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在背根神经节（DRG）中的应用，以增进对人类和啮齿动物DRG神经元分子转录组、细胞类型和功能注释的全面理解 | 利用单细胞（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）技术，提供了对DRG神经元组成和功能异质性的单细胞分辨率理解 | NA | 总结当前关于DRG单细胞转录组测序的文献，以全面理解DRG神经元的分子转录组、细胞类型和功能注释 | 背根神经节（DRG）中的感觉神经元 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |