单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 3421 - 3440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3421 | 2024-08-05 |
Cancer-associated fibroblast expression of glutamine fructose-6-phosphate aminotransferase 2 (GFPT2) is a prognostic marker in gastric cancer
2023-09, The journal of pathology. Clinical research
DOI:10.1002/cjp2.333
PMID:37395335
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研究论文 | 研究表明，GFPT2在胃癌中的表达与预后相关 | 首次确认GFPT2在胃癌相关成纤维细胞中的重要功能，并提出其作为预后标志物的潜力 | 研究中未详细探讨GFPT2的具体作用机制 | 探讨GFPT2在胃癌中的生物学功能及临床意义 | 胃癌患者的转录组数据及相关细胞系和组织样本 | 数字病理 | 胃癌 | 转录组测序 | NA | 文本数据 | 分析了来自Harbin Medical University和The Cancer Genome Atlas的多个样本 |
| 3422 | 2024-08-07 |
Clonal architecture and single-cell transcriptome landscape in Richter's syndrome
2023-09, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.18952
PMID:37401149
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3423 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a pro-metastatic subpopulation and the driver transcription factor NFE2L1 in ovarian cancer cells
2023-09, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01418-1
PMID:37405595
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了卵巢癌细胞中的促转移亚群及驱动转录因子NFE2L1 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了卵巢癌细胞中的促转移亚群，并确定了NFE2L1作为关键的转录因子 | NA | 阐明基因表达改变在获得转移潜能过程中的机制，并鉴定卵巢癌细胞中的转移亚群 | 卵巢癌细胞及其转移亚群 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两个卵巢癌细胞系：SKOV-3和SKOV-3-13 |
| 3424 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cellular heterogeneity and highlights Fstl1-regulated alveolar myofibroblasts in mouse lung at birth
2023-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110677
PMID:37406975
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了野生型和Fstl1基因敲除小鼠肺部的细胞异质性，并揭示了Fstl1调控的肺泡肌成纤维细胞的作用 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了Fstl1调控的肺泡肌成纤维细胞在肺发育中的作用，并阐明了其分子机制 | NA | 探究Fstl1在肺发育中的作用及其分子机制 | 野生型和Fstl1基因敲除小鼠的肺部细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 22,774个单细胞样本 |
| 3425 | 2024-08-07 |
Classification and characterisation of extracellular vesicles-related tuberculosis subgroups and immune cell profiles
2023-09, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17836
PMID:37409682
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研究论文 | 本文通过分析外泌体相关基因表达谱，探索了结核病（TB）的分子机制和潜在诊断标记物，并利用机器学习技术建立了TB风险模型。 | 本文首次通过外泌体相关基因表达谱分析，结合单细胞RNA测序技术，识别出九个与TB相关的重要基因，并建立了TB风险模型，为TB的诊断和治疗提供了新的生物标志物。 | NA | 探索结核病的分子机制，寻找有效的诊断标记物和治疗靶点。 | 结核病及其相关的外泌体和免疫细胞。 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 20个外泌体相关差异表达基因，其中17个上调，3个下调 |
| 3426 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq Revealed that Altered Tumor Infiltrating Lymphocytes in Cirrhotic Liver Indicate Development of Hepatocellular Carcinoma
2023-Aug-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2022.00062
PMID:37408821
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研究论文 | 本研究探讨了健康、肝硬化和肝细胞癌（HCC）肿瘤组织中的免疫微环境特征 | 发现肝硬化患者中减少的天真T细胞浸润和增加的中性粒细胞浸润可能是HCC发展的指征，并且这些免疫细胞亚群的动态变化可能作为新的生物标志物 | 本研究可能对肝硬化和HCC的生物标志物识别存在局限性，需进一步验证 | 旨在识别肝硬化向HCC过渡的免疫生物标志物 | 研究对象包括健康肝、肝硬化肝和HCC肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本表达矩阵 | NA |
| 3427 | 2024-08-05 |
Probabilistic tensor decomposition extracts better latent embeddings from single-cell multiomic data
2023-08-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad570
PMID:37403780
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研究论文 | 该文章提出了一种概率张量分解框架，SCOIT，用于从单细胞多组学数据中提取嵌入。 | SCOIT结合了多种分布来处理稀疏、嘈杂和异质的单细胞数据，提升了嵌入的提取质量。 | NA | 研究单细胞多组学数据的嵌入提取和分析方法。 | 八个来自不同测序协议的单细胞多组学数据集。 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 多组学数据 | 八个单细胞多组学数据集 |
| 3428 | 2024-08-07 |
DOT1L activity affects neural stem cell division mode and reduces differentiation and ASNS expression
2023-08-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256233
PMID:37382163
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研究论文 | 本文研究了组蛋白甲基转移酶DOT1L的酶活性对神经干细胞分裂模式的影响，并探讨了其对神经元分化和ASNS表达的调控作用 | 首次揭示了DOT1L通过调控神经干细胞的分裂模式和代谢基因的转录，影响神经元分化和ASNS表达 | NA | 探讨DOT1L在皮质神经发生中的作用及其分子机制 | 神经干细胞的分裂模式和神经元分化 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 3429 | 2024-08-05 |
Developmental emergence of cortical neurogliaform cell diversity
2023-08-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201830
PMID:37401408
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研究论文 | 研究聚焦于皮层神经胶质细胞的多样性及其发育过程 | 揭示了皮层神经胶质细胞的分子亚型及其发育中的标志性转录因子Tox2的重要性 | 本研究主要集中于小鼠大脑皮层，可能不适用于其他物种的神经胶质细胞研究 | 探讨皮层神经胶质细胞的发育过程及其多样性 | 小鼠的皮层神经胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学, CRISPR-Cas9 | NA | NA | 使用小鼠模型的不同发育阶段的神经胶质细胞 |
| 3430 | 2024-08-05 |
Integrated analysis identifies RAC3 as an immune-related prognostic biomarker associated with chemotherapy sensitivity in endometrial cancer
2023-08, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17824
PMID:37386813
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研究论文 | 本研究揭示了RAC3在子宫内膜癌中的作用及其作为免疫相关预后生物标志物的潜力 | 本研究首次指出RAC3在子宫内膜癌中的高表达与化疗敏感性之间的关系，并提出了其作为新型诊断生物标志物的可能性 | 本研究未提供RAC3在不同癌症类型中的比较数据，局限于子宫内膜癌的特定分析 | 探讨RAC3在子宫内膜癌中的作用及其作为化疗敏感性的生物标志物的潜力 | 本研究主要分析了子宫内膜癌组织中的RAC3的表达及其相关性 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床样本 | 基于TCGA，单细胞RNA测序，以及临床样本的分析 |
| 3431 | 2024-08-07 |
PRRX1+MSCs Enhance Mandibular Regeneration during Distraction Osteogenesis
2023-08, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231176522
PMID:37387366
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研究论文 | 本研究通过建立犬下颌骨牵张成骨和骨缺损模型，探讨了牵张成骨过程中PRRX1+MSCs对下颌骨再生的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析了下颌骨牵张成骨和骨缺损中的细胞差异，并验证了PRRX1+MSCs在牵张成骨中的重要作用 | 研究主要在犬模型中进行，未来需在人类中进一步验证 | 探讨牵张成骨过程中PRRX1+MSCs对下颌骨再生的作用及其机制 | 犬下颌骨牵张成骨和骨缺损模型中的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9 | NA | 细胞 | 26个细胞集群，代表6种主要细胞群体 |
| 3432 | 2024-08-07 |
Updated skin transcriptomic atlas depicted by reciprocal contribution of single-nucleus RNA sequencing and single-cell RNA sequencing
2023-Aug, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.06.005
PMID:37407342
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研究论文 | 本文通过单核RNA测序（snRNA-seq）与单细胞RNA测序（scRNA-seq）相结合的方法，更新了皮肤转录组图谱 | snRNA-seq能够使用冷冻、难以分离的材料，避免了scRNA-seq的局限性，并能更有效地检测转录因子 | NA | 通过snRNA-seq与scRNA-seq并行分析，绘制皮肤细胞图谱 | 皮肤细胞的转录组 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 一个皮肤样本 |
| 3433 | 2024-08-05 |
Dissecting the spermatogonial stem cell niche using spatial transcriptomics
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112737
PMID:37393620
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研究论文 | 本文通过空间转录组学系统分析了精原干细胞庇护所的分子和细胞成分 | 结合空间转录组学和计算分析，首次系统地揭示了精原干细胞和其庇护所之间的相互作用 | 对精原干细胞及其庇护所的理解仍然不完全，尤其是在不同的生理状态下 | 研究精原干细胞与其微环境庇护所之间的分子和细胞相互作用 | 小鼠和人类的精原干细胞庇护所 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类的样本 |
| 3434 | 2024-08-05 |
Epigenetically regulated RNA-binding proteins signify malaria hypnozoite dormancy
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112727
PMID:37392389
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研究论文 | 本研究探讨了调控假疟疾休眠状态的RNA结合蛋白。 | 首次揭示了调控假疟疾休眠的RNA结合蛋白及其基因沉默机制。 | 本研究主要集中在特定基因和模型的分析，可能未涵盖所有相关因子。 | 探索假疟疾休眠的基因调控机制。 | 假疟疾寄生虫，包括Plasmodium vivax和cynomolgi。 | 数字病理学 | 无效疟疾 | 单细胞转录组学，染色质可及性分析，荧光原位RNA杂交 | NA | 基因组数据 | NA |
| 3435 | 2024-08-05 |
Glutamine supplementation reverses manganese neurotoxicity by eliciting the mitochondrial unfolded protein response
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107136
PMID:37408687
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研究论文 | 这篇文章研究了谷氨酰胺补充如何通过激发线粒体未折叠蛋白反应来逆转锰神经毒性 | 该研究揭示了谷氨酰胺通过增加谷胱甘肽浓度来触发线粒体未折叠蛋白反应，从而减轻锰引起的神经毒性 | 研究主要集中于斑马鱼和人类神经母细胞瘤细胞，结果可能不完全适用于其他神经组织或动物模型 | 探索改善神经线粒体代谢以治疗锰引起的神经毒性的潜在机制 | 研究对象包括斑马鱼多巴胺能神经元和人类神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序和代谢组学分析 | NA | 细胞数据 | 斑马鱼和人类神经母细胞瘤细胞 |
| 3436 | 2024-08-07 |
Identification of BST2 as a conjunctival epithelial stem/progenitor cell marker
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107016
PMID:37389178
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，从人诱导多能干细胞（hiPSCs）衍生的结膜上皮细胞群体中鉴定出结膜上皮干细胞/祖细胞的特异性标记物BST2 | 首次鉴定出BST2作为结膜上皮干细胞/祖细胞的特异性标记物，并验证了其在分离和扩增这些细胞中的应用 | NA | 鉴定结膜上皮干细胞/祖细胞的特异性标记物 | 结膜上皮干细胞/祖细胞及其标记物 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从人诱导多能干细胞（hiPSCs）衍生的结膜上皮细胞群体 |
| 3437 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of human fetal epicardium reveals its cellular composition and identifies CRIP1 as a modulator of EMT
2023-07-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.06.002
PMID:37390825
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人类胎儿心外膜的细胞组成，并鉴定了CRIP1作为上皮-间质转化（EMT）的调节因子 | 本研究首次鉴定了CRIP1作为心外膜上皮-间质转化的未知调节因子，并提供了人类胎儿心外膜细胞的高质量数据集 | 研究中观察到的特定亚群较少，可能限制了对心外膜异质性的全面理解 | 旨在定义人类胎儿心外膜的细胞组成，并识别发育过程中的调节因子 | 人类胎儿心外膜细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3438 | 2024-08-07 |
The tumor suppressor CREBBP and the oncogene MYCN cooperate to induce malignant brain tumors in mice
2023-Jul-05, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-023-00481-3
PMID:37407554
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研究论文 | 研究CREBBP肿瘤抑制基因和MYCN癌基因在诱导小鼠恶性脑肿瘤中的协同作用 | 首次通过hGFAP-cre::Crebbp::lsl-MYCN小鼠模型，结合CREBBP缺失和MYCN在神经干细胞中的过表达，研究了这两种基因在脑肿瘤形成中的协同作用 | NA | 探究CREBBP和MYCN基因在脑肿瘤形成中的协同作用及其机制 | CREBBP和MYCN基因在神经干细胞中的功能及其在脑肿瘤形成中的作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | hGFAP-cre::Crebbp::lsl-MYCN小鼠模型中的神经干细胞 |
| 3439 | 2024-08-07 |
Premature aging of skeletal stem/progenitor cells rather than osteoblasts causes bone loss with decreased mechanosensation
2023-Jul-05, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-023-00269-6
PMID:37407584
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠中的Zmpste24（Z24）建立了早衰模型，发现Prx1依赖的Z24缺失导致显著的骨丢失，而Acan相关的Z24缺失仅导致小梁骨丢失。单细胞RNA测序揭示了两群骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs）在早衰中的减少，这些细胞表现出凋亡信号通路的激活和机械感受的减少。 | 本研究首次确定了两种早衰相关骨丢失的SSPCs群体，并揭示了Z24缺陷SSPCs中机械感受受损的新机制，为通过体育锻炼预防骨老化提供了新见解。 | NA | 研究早衰相关的骨丢失机制及其与机械感受的关系。 | 骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs）及其在早衰中的变化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 3440 | 2024-08-05 |
Robustness of single-cell RNA-seq for identifying differentially expressed genes
2023-Jul-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09487-y
PMID:37394518
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在识别差异表达基因（DEGs）方面的稳健性。 | 本研究首次量化了识别DEGs所需的细胞数量，为研究设计提供了参考。 | 研究仅限于人类诱导多能干细胞衍生的细胞，可能不适用于其他类型的细胞。 | 旨在评估在不同细胞数量下识别DEGs的有效性。 | 研究对象为人类诱导多能干细胞衍生的血管内皮细胞和平滑肌细胞。 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和聚腺苷酸依赖的RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 实验涉及的细胞数量范围从50到2000个 |