单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 3281 - 3300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3281 | 2024-08-07 |
PreCanCell: An ensemble learning algorithm for predicting cancer and non-cancer cells from single-cell transcriptomes
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.07.009
PMID:37501705
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研究论文 | 本文提出了一种名为PreCanCell的新算法，用于从单细胞转录组数据中预测恶性与非恶性细胞 | PreCanCell通过识别五种常见癌症类型中恶性与非恶性细胞的差异表达基因，并使用多数投票机制进行分类，显示出比其他七种算法更高的准确性和更简单的实现 | NA | 开发一种新的算法来预测单细胞转录组数据中的癌症与非癌症细胞 | 五种常见癌症类型的单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | NA | 集成学习算法 | 转录组数据 | 19个单细胞数据集 |
| 3282 | 2024-08-07 |
The interaction of macrophages and CD8 T cells in bronchoalveolar lavage fluid is associated with latent tuberculosis infection
2023-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2023.2239940
PMID:37470432
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞群体，特别是巨噬细胞和CD8 T细胞在潜伏性结核感染中的相互作用 | 发现巨噬细胞MM-CCL23在潜伏性结核感染中的保护性免疫作用，及其通过CCL20/CCR6招募CD8-CCR6 T细胞的机制 | 对从潜伏性结核感染进展到活动性结核的免疫机制仍定义不明确 | 探究潜伏性结核感染进展到活动性结核的免疫机制 | 支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞群体，特别是巨噬细胞和CD8 T细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自潜伏性结核感染或活动性结核患者的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 3283 | 2024-08-05 |
Construction of a hepatocytes-related and protein kinase-related gene signature in HCC based on ScRNA-Seq analysis and machine learning algorithm
2023-Nov, Journal of physiology and biochemistry
IF:3.7Q1
DOI:10.1007/s13105-023-00973-1
PMID:37458958
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序和机器学习算法构建了一个与肝细胞相关的蛋白激酶相关基因特征 | 该研究通过机器学习算法建立了PKRG预测模型，并识别出潜在的HCC治疗靶点 | 该研究没有提及样本的多样性和外部验证的结果 | 分析HCC的单细胞数据并构建预测模型，以促进个性化医学 | 肝细胞癌患者的单细胞数据，重点研究蛋白激酶相关基因 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自多个数据集（如TCGA、ICGC和GEO）的大量HCC患者样本 |
| 3284 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis of expression profile and prognostic values of connexin family in LUAD
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05075-5
PMID:37458803
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研究论文 | 本研究首次探讨了连接蛋白家族在肺腺癌（LUAD）中的表达差异和预后意义 | 开发了一个综合预后模型，揭示了GJB2-5在LUAD患者预后中的关键作用 | NA | 全面分析连接蛋白基因家族在LUAD中的表达谱和预后意义 | 连接蛋白基因家族及其在LUAD中的表达和功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | 风险模型 | NA | NA |
| 3285 | 2024-08-05 |
Targeting histone deacetylase suppresses tumor growth through eliciting METTL14-modified m6 A RNA methylation in ocular melanoma
2023-11, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12471
PMID:37466203
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶抑制剂如何通过调控METTL14修饰的m6 A RNA甲基化抑制眼黑色素瘤的肿瘤生长 | 揭示了HDAC/METTL14/FAT4表观遗传级联中的组蛋白和RNA之间的相互作用 | 研究主要集中在眼黑色素瘤细胞，对其他癌症类型的适用性尚待验证 | 探讨组蛋白乙酰化和m6 A修饰在眼黑色素瘤肿瘤发生调控中的作用 | 眼黑色素瘤细胞及其相关的分子机制 | 数字病理学 | 眼黑色素瘤 | RNA测序, 免疫沉淀-qPCR, 单细胞测序等 | 细胞模型和正位异种移植模型 | RNA数据 | NA |
| 3286 | 2024-08-07 |
Establishment of a prognostic model based on m6A regulatory factors and stemness of hepatocellular carcinoma using RNA-seq data and scRNA-seq data
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05045-x
PMID:37466793
|
研究论文 | 本研究基于m6A调控因子和肝细胞癌的干细胞特性，利用RNA-seq和scRNA-seq数据建立了一个预测肝细胞癌预后的模型 | 研究首次综合分析了m6A调控因子与肝细胞癌干细胞之间的关系，并建立了一个临床工具来预测肝细胞癌的预后 | NA | 旨在建立一个预测肝细胞癌预后的临床工具 | 肝细胞癌的m6A调控因子和干细胞特性 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了ICGC和TCGA数据集 |
| 3287 | 2024-08-07 |
Corrigendum to "A single-cell RNA-seq analysis of early larval cell-types of the starfish, Patiria pectinifera: Insights into evolution of the chordate body plan" [Dev. Biol. 496 (2023) 52-62]
2023-Oct, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.06.014
PMID:37454579
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3288 | 2024-08-07 |
Cross-species analysis and comparison of the inner ear between chickens and mice
2023-10, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25524
PMID:37462291
|
研究论文 | 本研究通过比较鸡和鼠的内耳结构，利用RNA测序技术分析了同源基因的表达，并探讨了内耳结构形成的基因表达模式 | 首次进行了鸡和鼠内耳结构的跨物种比较分析，并利用单细胞RNA测序和批量RNA-Seq技术揭示了内耳结构形成的基因表达模式 | NA | 探讨不同物种内耳结构的细胞和分子基础 | 鸡和鼠的内耳结构 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 鸡和鼠的内耳组织 |
| 3289 | 2024-08-05 |
Spatial-MGCN: a novel multi-view graph convolutional network for identifying spatial domains with attention mechanism
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad262
PMID:37466210
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研究论文 | 本文提出了一种名为Spatial-MGCN的新型深度学习方法，用于识别空间域 | 该方法结合了注意力机制的多视角图卷积网络，能够自适应学习基因表达与空间信息之间的复杂关系 | 本文未提及具体的限制条件 | 研究旨在通过有效整合基因表达谱与空间信息来准确识别空间域 | 研究对象为基因表达谱和空间信息 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | 多视角图卷积网络 | 基因表达数据 | NA |
| 3290 | 2024-08-07 |
Integrated analysis reveals Atf3 promotes neuropathic pain via orchestrating JunB mediated release of inflammatory cytokines in DRG macrophage
2023-Sep-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.121939
PMID:37451398
|
研究论文 | 本研究通过综合分析揭示了Atf3通过调控JunB介导的炎症细胞因子释放促进背根神经节（DRG）巨噬细胞中的神经病理性疼痛（NP） | 首次揭示了Atf3通过JunB介导的炎症细胞因子释放机制在DRG巨噬细胞中促进神经病理性疼痛的作用 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，需要进一步的人体实验验证 | 探讨背根神经节在神经病理性疼痛中的调控机制 | 背根神经节（DRG）中的免疫相关基因（IRGs）和巨噬细胞 | 神经科学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了来自神经损伤（SNI）模型小鼠的DRG样本 |
| 3291 | 2024-08-05 |
Siglec-9 acts as an immune-checkpoint molecule on macrophages in glioblastoma, restricting T-cell priming and immunotherapy response
2023-09, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00598-9
PMID:37460871
|
研究论文 | 这篇文章研究了Siglec-9作为胶质母细胞瘤中巨噬细胞的免疫检查点分子。 | 本研究首次揭示了Siglec-9在胶质母细胞瘤中作为免疫检查点分子的作用，并探讨了其对T细胞活化和免疫治疗反应的限制。 | 研究局限于小鼠模型，可能无法完全反映人类患者的反应。 | 本研究旨在探索胶质母细胞瘤中的免疫调节机制并提高免疫治疗效果。 | 研究对象为接受过新辅助抗PD-1治疗的胶质母细胞瘤患者及相应的小鼠模型。 | 数字病理学 | 胶质癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 研究涉及的样本数量及类型不详 |
| 3292 | 2024-08-05 |
Transmorph: a unifying computational framework for modular single-cell RNA-seq data integration
2023-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad069
PMID:37448589
|
研究论文 | 提出了一个用于整合单细胞RNA测序数据的统一计算框架 | 提供一个灵活的软件生态系统，以便用户针对特定场景构建强大的数据集成管道 | 针对多种特定场景时的灵活性不足仍可能存在问题 | 解决单细胞RNA测序数据整合中的多种实际挑战 | 单细胞RNA测序数据集的整合 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据集 | NA |
| 3293 | 2024-08-05 |
CD4 Phenotypes Are Associated with Reduced Expansion of Tumor-Infiltrating Lymphocytes in Melanoma Patients Treated with Adoptive Cell Therapy
2023-09-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300250
PMID:37466381
|
研究论文 | 本研究探讨了CD4表型与黑色素瘤患者肿瘤浸润淋巴细胞扩展的关系 | 发现CD4+细胞频率与TIL扩展呈负相关，为肿瘤浸润淋巴细胞的疗效提供了新见解 | 研究可能受到患者样本量和特定基因表达变化的局限 | 评估影响肿瘤浸润淋巴细胞扩展的相关因素 | 黑色素瘤患者的肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 通过中位数分组的黑色素瘤患者数据，包括'TIL高'和'TIL低'患者 |
| 3294 | 2024-08-07 |
Oxidised IL-33 drives COPD epithelial pathogenesis via ST2-independent RAGE/EGFR signalling complex
2023-09, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02210-2022
PMID:37442582
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研究论文 | 研究氧化型IL-33在慢性阻塞性肺病（COPD）上皮病理过程中的作用及其通过非ST2依赖的RAGE/EGFR信号复合体的影响 | 首次揭示IL-33、RAGE和EGFR在气道上皮中通过非ST2依赖途径共同作用，影响COPD中的异常上皮重塑和黏液阻塞特征 | NA | 探究氧化型IL-33在气道上皮中的功能活性是否独立于ST2 | 健康和COPD上皮细胞的三维气液界面（ALI）细胞培养模型 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | RNA测序 | NA | 细胞 | 来自严重COPD患者的气道上皮细胞 |
| 3295 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analysis of CX3CR1+ Cells Reveals a Pathogenic Role for BIRC5+ Myeloid Proliferating Cells Driven by Staphylococcus aureus Leukotoxins
2023-09-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300166
PMID:37466391
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和遗传命运图谱技术，分析了CX3CR1+细胞在感染过程中的作用，特别是BIRC5+髓系细胞在金黄色葡萄球菌感染中的致病角色 | 首次揭示了BIRC5+髓系细胞在金黄色葡萄球菌感染中的致病作用，并发现这些细胞的扩增依赖于毒素 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨人类中的相关性 | 探究CX3CR1+细胞在感染中的作用及BIRC5+髓系细胞的致病机制 | CX3CR1+细胞和BIRC5+髓系细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的CX3CR1+细胞 |
| 3296 | 2024-08-07 |
Systemic host inflammation induces stage-specific transcriptomic modification and slower maturation in malaria parasites
2023-08-31, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01129-23
PMID:37449844
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研究论文 | 本文研究了系统性宿主炎症对疟原虫在红细胞内成熟速度的影响 | 发现宿主炎症反应可以减缓疟原虫的成熟过程，并识别出可能抑制疟原虫成熟的候选代谢物 | NA | 探讨宿主炎症反应对疟原虫成熟的影响 | 疟原虫在红细胞内的成熟过程 | NA | 疟疾 | scRNA-seq | NA | 代谢物 | 小鼠模型 |
| 3297 | 2024-08-07 |
Identifying a Lung Stem Cell Subpopulation by Combining Single-Cell Morphometrics, Organoid Culture, and Transcriptomics
2023-08-16, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad044
PMID:37468433
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研究论文 | 本文通过结合单细胞形态学、类器官培养和转录组学，建立了一种新的单细胞分析方法scMORN，用于揭示肺组织干细胞的亚群 | 开发了一种名为scMORN的新方法，整合了单细胞形态学、类器官形成实验和RNA测序，以揭示组织干细胞的亚群及其分化潜能 | NA | 探索肺上皮干细胞，并揭示其亚群及其分化潜能 | 肺组织干细胞及其亚群 | 数字病理学 | 肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及多种肺干细胞，包括基底细胞、杯状细胞和肺泡类型2细胞 |
| 3298 | 2024-08-05 |
Integrating spatial and single-nucleus transcriptomic data elucidates microglial-specific responses in female cynomolgus macaques with depressive-like behaviors
2023-08, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01379-4
PMID:37443281
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学，对患有社交压力相关抑郁症状的雌性猕猴的背外侧前额叶皮层进行了分析 | 首次揭示了与抑郁样行为相关的微胶质细胞特异性基因表达变化 | 研究主要集中于特定物种的特定行为，可能无法完全推广至其他物种或抑郁症的所有方面 | 探讨与抑郁样行为相关的细胞和分子机制 | 雌性猕猴，这些猕猴表现出社会压力相关的抑郁样行为 | 数字病理学 | 抑郁症 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 通过分析雌性猕猴的背外侧前额叶皮层得到的数据，样本数量未具体列出 |
| 3299 | 2024-08-07 |
Integrated multiomic analysis and high-throughput screening reveal potential gene targets and synergetic drug combinations for osteosarcoma therapy
2023-Aug, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.317
PMID:37457661
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析和高通量筛选，揭示了骨肉瘤治疗中潜在的基因靶点和协同药物组合 | 首次通过长读RNA测序和基于串联质谱标签（TMT）的定量蛋白质组学，结合下一代测序（NGS）和高通量药物组合筛选，全面分析了骨肉瘤的分子特征和治疗靶点 | NA | 旨在发现骨肉瘤治疗的新基因靶点和协同药物组合 | 骨肉瘤及其邻近正常组织，骨肉瘤细胞系 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 长读RNA测序，串联质谱标签（TMT）定量蛋白质组学，下一代测序（NGS） | NA | RNA序列，蛋白质组数据 | 骨肉瘤和邻近正常组织样本，骨肉瘤细胞系 |
| 3300 | 2024-08-07 |
FDG uptake reflects an immune-enriched subtype of thyroid cancer: Clinical implications of imaging-based molecular characterization
2023-08, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.6350
PMID:37466323
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研究论文 | 本文通过转录组分析研究了甲状腺癌中葡萄糖代谢与肿瘤微环境（TME）之间的关系，并探讨了FDG摄取在甲状腺癌中的临床意义。 | 本文首次探讨了甲状腺癌中FDG摄取与免疫细胞富集的TME之间的关联，并提出了FDG摄取作为免疫富集型甲状腺癌的标志。 | NA | 研究甲状腺癌中葡萄糖代谢与肿瘤微环境的关系，并探讨FDG摄取的临床意义。 | 甲状腺癌及其肿瘤微环境中的葡萄糖代谢和免疫细胞。 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | F-18 FDG PET、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA序列 | NA |