单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 3221 - 3240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3221 | 2024-08-07 |
Identifying Network Biomarkers for Alzheimer's Disease Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31978-5_19
PMID:37525046
|
研究论文 | 本文提出了一种R工作流程，用于从通路网络中提取疾病扰动的子通路，并结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）表达谱构建基因-基因相互作用网络，以识别阿尔茨海默病（AD）的网络生物标志物。 | 本文采用了单细胞RNA测序技术，并结合系统层面的网络方法，提取疾病扰动的子通路，为复杂疾病如阿尔茨海默病的研究提供了新的网络生物标志物。 | NA | 开发一种新的方法来识别阿尔茨海默病的网络生物标志物。 | 阿尔茨海默病（AD）的网络生物标志物。 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3222 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of anoikis-related genes in prognosis and immune infiltration of gastric cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05157-4
PMID:37474682
|
研究论文 | 本研究基于批量和单细胞RNA测序数据，全面分析了与胃癌预后和免疫浸润相关的凋亡相关基因 | 建立了基于七个凋亡相关基因的预后风险模型，该模型在多个数据集中表现良好，并能指导药物治疗 | NA | 探索凋亡抵抗在胃癌细胞转移中的关键作用，并开发新的胃癌治疗方法 | 胃癌患者的预后和免疫细胞浸润情况 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | Cox回归模型 | RNA测序数据 | 涉及多个数据集的胃癌样本 |
| 3223 | 2024-08-07 |
Invariant natural killer T cells drive hepatic homeostasis in nonalcoholic fatty liver disease via sustained IL-10 expression in CD170+ Kupffer cells
2023-11, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350474
PMID:37489253
|
研究论文 | 通过高维单细胞RNA测序技术，研究了胚胎来源的枯否细胞（KCs）在非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的作用，并揭示了不变自然杀伤T细胞（iNKT）通过维持CD170+枯否细胞中的IL-10表达来驱动肝脏稳态的机制 | 首次鉴定了两种具有不同基因表达谱的枯否细胞亚群（KC-1和KC-2），并揭示了iNKT细胞与KC-1细胞之间的CD206介导的交叉对话对IL-10表达的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 探讨枯否细胞亚群在非酒精性脂肪肝病中的作用及其与iNKT细胞的相互作用 | 枯否细胞亚群、iNKT细胞、IL-10表达 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 高维单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎来源的枯否细胞 |
| 3224 | 2024-08-07 |
MTHFD2 ablation in T cells protects against heart transplant rejection by perturbing IRF4/PD-1 pathway through the metabolic-epigenetic nexus
2023-Nov, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2023.07.009
PMID:37495036
|
研究论文 | 本研究探讨了一碳代谢酶MTHFD2在T细胞中的缺失如何通过代谢-表观遗传机制影响IRF4/PD-1通路，从而保护心脏移植免受排斥反应。 | 首次揭示了一碳代谢酶MTHFD2在心脏移植排斥反应中的作用，并阐明了其通过代谢-表观遗传机制影响IRF4/PD-1通路的机制。 | NA | 研究一碳代谢酶MTHFD2在心脏移植排斥反应中的作用及其机制。 | 心脏移植排斥反应中的T细胞和一碳代谢酶MTHFD2。 | NA | 心血管疾病 | 转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、酶联免疫吸附试验、Cleavage Under Targets and Tagmentation assay | NA | 转录组数据、代谢数据、单细胞RNA数据 | 人类和小鼠心脏移植受者的组织样本 |
| 3225 | 2024-08-05 |
SCM is potential resource for non-invasive preimplantation genetic testing based on human embryos single-cell sequencing
2023-Oct-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.147647
PMID:37473972
|
研究论文 | 本研究探讨了使用胎胚单细胞测序的非侵入性植入前基因检测的潜力 | 本文章创新点在于提出了使用花球液（SCM）作为更有效的胚胎DNA来源进行植入前基因检测 | 目前非侵入性植入前基因检测的临床应用受到灵敏度和特异性不足的限制 | 本研究旨在提高非侵入性植入前基因检测的有效性 | 本研究的对象为218个人胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞全基因组扩增（WGA） | NA | 基因组数据 | 218个人胚胎 |
| 3226 | 2024-08-05 |
T-cell subsets in allergy and tolerance induction
2023-10, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202249983
PMID:37489248
|
研究论文 | 讨论抗原特异性T淋巴细胞在过敏和耐受诱导中的作用 | 介绍了通过多参数流式细胞术和单细胞测序直接表征过敏原特异性T细胞的新技术 | 目前对过敏免疫治疗（AIT）机制的理解仍不完全 | 研究T细胞亚群在健康状态、过敏敏感化过程和AIT中的作用 | 抗原特异性T细胞的不同表型和功能特征 | 数字病理学 | 过敏 | 单细胞测序、多参数流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 3227 | 2024-08-05 |
m6A regulator-mediated RNA methylation modification remodels immune microenvironment in dilated cardiomyopathy
2023-Oct, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31085
PMID:37475583
|
研究论文 | 本研究探讨了m6A调节因子介导的RNA甲基化对扩张型心肌病中的免疫微环境的重塑作用 | 本研究首次验证了IGFBP2在扩张型心肌病中的关键作用及其在免疫微环境中的重塑机制 | 此研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的病理情况 | 探讨m6A RNA甲基化如何影响扩张型心肌病患者的免疫微环境 | 扩张型心肌病小鼠模型及相关免疫细胞的研究 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA、蛋白质 | N/A |
| 3228 | 2024-08-05 |
High expression of centromere protein A and its molecular mechanism and clinical significance in prostate cancer: A study based on data mining and immunohistochemistry
2023-10, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12073
PMID:37488766
|
研究论文 | 这项研究揭示了中心体蛋白A在前列腺癌中的重要作用及其分子机制和临床意义 | 本研究首次将中心体蛋白A的表达与前列腺癌和转移性前列腺癌的临床病理特征关联起来 | 本研究的局限性在于需要进一步实验验证CENPA在前列腺癌中的具体作用 | 阐明中心体蛋白A在前列腺癌中的重要作用及其临床意义 | 本研究的对象为前列腺癌及转移性前列腺癌患者的数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序和免疫组化 | NA | RNA数据 | 使用了大量的RNA测序数据及内部免疫组化数据 |
| 3229 | 2024-08-05 |
Transcriptomic evidence for Brachyury expression in the caudal tip region of adult Ptychodera flava (Hemichordata)
2023-Oct, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.12882
PMID:37483093
|
研究论文 | 本文展示了在成年Ptychodera flava的尾端区域中Brachyury基因的表达情况 | 首次在成年阶段发现Brachyury基因的表达，扩展了对这一基因在发育过程中作用的理解 | 需要进一步研究Brachyury在成年个体中的具体功能 | 探讨Brachyury基因在成年Ptychodera flava中的表达模式及其潜在功能 | 成人Ptychodera flava的尾端区域细胞 | NA | NA | Iso-Seq, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 使用了成年Ptychodera flava的样本 |
| 3230 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular and molecular alterations in submandibular gland and blood in IgG4-related disease
2023-10, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224363
PMID:37474274
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了IgG4相关疾病中颌下腺和外周血单个核细胞的细胞和分子改变 | 发现了IgG4相关疾病中颌下腺内三种新的组织驻留免疫细胞亚群，并揭示了免疫细胞与非免疫细胞间的通信模式变化 | NA | 旨在通过单细胞水平分析IgG4相关疾病受累组织和外周血单个核细胞的转录组图谱，以识别细胞群体及其间的相互作用，从而理解IgG4相关疾病的病因 | IgG4相关疾病患者的颌下腺和外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | IgG4相关疾病患者和匹配对照组的颌下腺和外周血单个核细胞样本 |
| 3231 | 2024-08-07 |
Dual-GCN-based deep clustering with triplet contrast for ScRNA-seq data analysis
2023-Oct, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于双图卷积网络（Dual-GCN）和三元组对比的深度聚类方法（scDGDC），用于单细胞RNA测序（ScRNA-seq）数据分析中的降维和聚类 | 引入了双图卷积网络编码器以捕获更全面的拓扑信息，并使用三元组对比来减少图卷积网络的过度平滑问题 | 现有的基于图的深度聚类算法在构建细胞图时忽略了节点的分布信息，导致嵌入表示中的信息不完整 | 优化单细胞RNA测序数据分析中的聚类和降维任务 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | 图卷积网络（GCN） | 基因表达数据 | 八个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 3232 | 2024-08-07 |
Glyoxal as an alternative fixative for single-cell RNA sequencing
2023-09-30, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkad160
PMID:37494060
|
研究论文 | 本文开发并测试了使用甘油醛作为固定剂进行单细胞RNA测序的协议 | 提出甘油醛作为单细胞RNA测序的新型固定剂，有效保留了细胞转录组状态 | NA | 探索甘油醛作为单细胞RNA测序固定剂的效果 | 果蝇和人类细胞的转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 果蝇和人类细胞 |
| 3233 | 2024-08-07 |
AtacAnnoR: a reference-based annotation tool for single cell ATAC-seq data
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad268
PMID:37497729
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于参考的单细胞ATAC-seq数据注释工具AtacAnnoR | AtacAnnoR采用两轮注释方法，使用高质量注释的scRNA-seq数据作为参考，并实现了'Combine and Discard'策略以提高多参考注释的准确性 | NA | 开发和评估一种新的单细胞ATAC-seq数据注释方法 | 单细胞ATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | 11个基准数据集 |
| 3234 | 2024-08-07 |
Combining single-cell RNA sequencing with spatial transcriptome analysis reveals dynamic molecular maps of cambium differentiation in the primary and secondary growth of trees
2023-09-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100665
PMID:37491818
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组测序技术，揭示了树木初生和次生生长过程中形成层分化的转录组图谱 | 研究首次详细比较了初生和次生生长组织的细胞图谱和分化轨迹，揭示了不同的调控网络 | NA | 深入理解树木初生和次生生长过程中的细胞身份和分化过程 | 树木初生和次生生长组织中的形成层分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及杨树茎部的初生和次生生长组织 |
| 3235 | 2024-08-05 |
Voltage-Seq: all-optical postsynaptic connectome-guided single-cell transcriptomics
2023-09, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01965-1
PMID:37474808
|
研究论文 | 本研究介绍了一种新方法Voltage-Seq，通过全光学技术对神经元连接进行功能特征化，为单细胞转录组学提供指导 | 创新点在于结合全光学电压成像和单细胞RNA测序，能够基于特定的突触后反应类型精准选取神经元 | 本研究的局限性可能在于仅使用小鼠模型，不能代表其他物种或更广泛的生理条件 | 本研究的目的是开发一种新方法，以改进神经元的信息路由分析 | 研究对象为小鼠的周脑导水管灰质中的8347个神经元 | 数字病理学 | NA | 全光学电压成像，单细胞RNA测序 | NA | 神经元电活动数据 | 8347个神经元 |
| 3236 | 2024-08-05 |
FTO-mediated m6A modification alleviates autoimmune uveitis by regulating microglia phenotypes via the GPC4/TLR4/NF-κB signaling axis
2023-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2022.09.008
PMID:37492748
|
研究论文 | 本研究探讨了FTO介导的m6A修饰如何通过GPC4/TLR4/NF-κB信号轴调控小胶质细胞表型，从而缓解自身免疫性葡萄膜炎 | 揭示了FTO在小胶质细胞中的作用及其通过GPC4/TLR4/NF-κB通路调节炎症的机制 | 尚未在临床样本中进行全面验证，且对FTO的治疗潜力需要进一步研究 | 研究FTO在自身免疫性葡萄膜炎中的作用及其机制 | 研究对象为小胶质细胞及其在自身免疫性葡萄膜炎中的表现 | 数字病理学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞测序(scRNA-seq)和RNA测序(RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 以小鼠模型和人小胶质细胞克隆3(HMC3)细胞为样本进行验证 |
| 3237 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome, phagocytic activity and immunohistochemical analysis of crucian carp (Carassius auratus) in response to Rahnella aquatilis infection
2023-Sep, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2023.108970
PMID:37488042
|
研究论文 | 研究报道了感染拉恩氏菌的鲫鱼后肾的单细胞转录组景观、免疫组织化学和吞噬特性 | 首次详细描述了鲫鱼免疫细胞和宿主-拉恩氏菌相互作用，有助于理解鲤科鱼类肾脏免疫细胞的生物学特性和潜在标记 | NA | 阐明鲫鱼在拉恩氏菌感染下的免疫细胞和细胞标记 | 鲫鱼的后肾免疫细胞及其在拉恩氏菌感染下的反应 | NA | NA | 单细胞转录组测序、免疫组织化学、TUNEL检测 | NA | 单细胞转录组数据 | 18种主要的免疫细胞群，包括单核细胞/巨噬细胞、树突状细胞、B细胞、T细胞、粒细胞和造血祖细胞 |
| 3238 | 2024-08-05 |
A combined microscopy and single-cell sequencing approach reveals the ecology, morphology, and phylogeny of uncultured lineages of zoosporic fungi
2023-08-31, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01313-23
PMID:37486265
|
研究论文 | 该研究结合显微镜和单细胞测序方法，揭示了未经培养的水生真菌谱系的生态、形态和系统发育。 | 本研究为未描述的水生早期分支真菌线系提供了新的单细胞DNA序列，显示出其潜在的丰富多样性。 | 由于样本主要来自水生环境，研究结果未必适用于其他生态环境的真菌。 | 旨在通过单细胞测序深入了解未描述的水生真菌的生态功能和形态。 | 研究对象为127个主机关联真菌的单细胞样本。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA序列 | 127个真菌细胞样本 |
| 3239 | 2024-08-07 |
Sox10 escalates vascular inflammation by mediating vascular smooth muscle cell transdifferentiation and pyroptosis in neointimal hyperplasia
2023-08-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112869
PMID:37481722
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，发现Sox10在血管平滑肌细胞向巨噬细胞样细胞转化及焦亡过程中的作用，揭示了其在血管炎症和新生内膜增生中的调控机制 | 首次揭示Sox10通过PI3K/AKT信号通路诱导血管平滑肌细胞转化和焦亡，从而加剧血管炎症 | NA | 探讨Sox10在血管炎症和新生内膜增生中的作用及机制 | 血管平滑肌细胞、巨噬细胞样细胞、Sox10、新生内膜增生 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 |
| 3240 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic characterization of sheep conceptus elongation and implantation
2023-Aug-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112860
PMID:37494181
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了绵羊胚胎在植入前和植入期的转录组动态变化 | 首次详细描述了绵羊胚胎在植入前和植入期的细胞类型分化和基因表达特征，揭示了胚胎与子宫内膜之间的分子对话机制 | NA | 探究绵羊胚胎在植入前和植入期的转录组动态变化及其与子宫内膜的相互作用 | 绵羊胚胎和子宫内膜在植入前和植入期的细胞类型和基因表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个绵羊胚胎和子宫内膜样本 |