单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 3201 - 3220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3201 | 2024-08-07 |
Single-Cell Atlas Reveals the Hemocyte Subpopulations and Stress Responses in Asian Giant Softshell Turtle during Hibernation
2023-Jul-12, Biology
DOI:10.3390/biology12070994
PMID:37508424
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，比较了亚洲巨型软壳龟在活跃状态和冬眠期间血细胞的分子特征，揭示了血细胞亚群及其在冬眠期间的应激反应 | 发现了六种细胞类型及每个细胞亚群的新标记基因，并确定了冬眠期间上调的热休克基因和免疫相关基因 | NA | 探究龟类冬眠期间的季节性适应机制 | 亚洲巨型软壳龟的血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3202 | 2024-08-07 |
Derivation of Human Extraembryonic Mesoderm-like Cells from Primitive Endoderm
2023-Jul-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241411366
PMID:37511125
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研究论文 | 本研究开发了一种从原始内胚层样细胞（nEnd）生成人类胚外中胚层样细胞（ExM-like）的协议 | 首次证实了人类胚外中胚层可以从原始内胚层衍生，并建立了一个细胞培养系统来研究人类胚外中胚层在胚胎发育早期的作用 | NA | 探讨人类胚外中胚层的起源及其在胚胎发育中的作用 | 人类胚外中胚层样细胞及其在胚胎发育中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 细胞 | NA |
| 3203 | 2024-08-07 |
Molecular Subtypes and Tumor Microenvironment Characteristics of Small-Cell Lung Cancer Associated with Platinum-Resistance
2023-Jul-11, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15143568
PMID:37509231
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研究论文 | 本文旨在通过基因表达分类细化小细胞肺癌（SCLC）的分子亚型，并探索与铂类耐药相关的肿瘤微环境（TME）特征 | 首次揭示了SCLC的四种分子亚型及其与铂类耐药的关系，特别是EndMT在SCLC-I亚型中的不良预后作用，并提出了BET抑制剂作为克服铂类耐药的新候选药物 | NA | 细化小细胞肺癌的分子亚型并揭示与铂类耐药相关的肿瘤微环境特征 | 小细胞肺癌的分子亚型及其与铂类耐药的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 81个基因表达样本和87个验证样本 |
| 3204 | 2024-08-05 |
Disease-Associated Oligodendrocyte: New Player in Alzheimer's Disease and CNS Pathologies
2023-Jul-07, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/j.jin2204090
PMID:37519162
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评论 | 本文章探讨了与阿尔茨海默病相关的少突胶质细胞的作用 | 强调了少突胶质细胞在阿尔茨海默病及中枢神经系统病理中的潜在新角色 | 研究主要为综述，缺乏实证研究支持 | 探讨少突胶质细胞在认知下降中的角色及其分子特征 | 与阿尔茨海默病相关的少突胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 3205 | 2024-08-05 |
Spatial Omics Sequencing Based on Microfluidic Array Chips
2023-Jul-06, Biosensors
DOI:10.3390/bios13070712
PMID:37504111
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综述 | 这篇文章介绍了基于微流体阵列芯片的空间组学测序技术的发展 | 文章创新点在于展示了不同微流体设计中条形码策略的简便性和高效性 | 文章未具体指出实验数据和案例研究 | 研究空间组学测序技术及其在微流体芯片上的应用 | 基于微流体阵列芯片的空间组学测序技术 | 数字病理学 | NA | 微流体阵列芯片 | NA | NA | NA |
| 3206 | 2024-08-07 |
Relationship between Macrophages and Tissue Microenvironments in Diabetic Kidneys
2023-Jul-03, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11071889
PMID:37509528
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研究论文 | 本文探讨了巨噬细胞与糖尿病肾脏组织微环境之间的关系及其在糖尿病肾病发展中的作用 | 利用单细胞RNA测序技术确认了糖尿病肾病中巨噬细胞的异质性和可塑性 | NA | 研究巨噬细胞在糖尿病肾病中的作用及其与组织微环境的关系 | 巨噬细胞及其在糖尿病肾病中的功能和与组织微环境的相互作用 | NA | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 3207 | 2024-08-07 |
Identification of Gene Markers Associated with COVID-19 Severity and Recovery in Different Immune Cell Subtypes
2023-Jul-02, Biology
DOI:10.3390/biology12070947
PMID:37508378
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研究论文 | 本研究旨在揭示COVID-19不同阶段不同免疫细胞亚群的分子特征，通过机器学习工作流程分析scRNA-seq数据，识别与COVID-19严重程度和恢复相关的基因标记 | 采用机器学习方法分析scRNA-seq数据，结合多种特征选择算法和分类算法，提取关键基因特征并构建高性能分类器 | NA | 揭示COVID-19不同阶段不同免疫细胞亚群的分子特征 | COVID-19患者的免疫细胞亚群及其分子水平变化 | 机器学习 | COVID-19 | scRNA-seq | 机器学习模型（决策树、k-最近邻、随机森林） | scRNA-seq数据 | 403,700个B细胞样本，634,595个T细胞样本，346,547个髓系细胞样本 |
| 3208 | 2024-08-07 |
Profiling A-to-I RNA editing during mouse somatic reprogramming at the single-cell level
2023-Jul, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e18133
PMID:37519753
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了小鼠体细胞重编程过程中A-to-I RNA编辑位点的变化 | 首次在单细胞水平上分析了A-to-I RNA编辑频率的广泛变化及其与ADAR1表达的相关性 | NA | 研究小鼠体细胞重编程过程中A-to-I RNA编辑的动态变化及其生物学意义 | 小鼠体细胞重编程过程中的A-to-I RNA编辑 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 3209 | 2024-08-07 |
Quantitative Spatial Analysis of Neuroligin-3 mRNA Expression in the Enteric Nervous System Reveals a Potential Role in Neuronal-Glial Synapses and Reduced Expression in Nlgn3R451C Mice
2023-06-30, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13071063
PMID:37509099
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研究论文 | 本文通过结合RNAScope原位杂交和免疫荧光技术，量化分析了Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的空间表达，并探讨了其在神经-胶质突触中的潜在作用及在Nlgn3R451C小鼠中的表达减少情况。 | 首次详细描述了Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的细胞特异性表达模式，并验证了其在神经-胶质相互作用中的作用。 | 研究仅限于小鼠模型，且依赖于特定的基因突变，可能限制了结果的普遍性。 | 探讨Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的表达及其在自闭症谱系障碍和胃肠功能障碍中的潜在作用。 | Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的表达，特别是在Nlgn3R451C突变小鼠中的表达。 | NA | 自闭症谱系障碍 | RNAScope原位杂交, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 野生型和Nlgn3R451C突变小鼠 |
| 3210 | 2024-08-05 |
Effective Preprocessing of Single-Cell RNA-Seq for Unravelling Alzheimer's Disease Signatures
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31978-5_25
PMID:37525052
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞RNA测序数据的预处理方法，以揭示阿尔茨海默病的特征 | 开发了一个探索性数据分析方法论，结合多种工具有效处理单细胞RNA测序数据 | 数据复杂性可能导致分析挑战，需要谨慎处理 | 研究单细胞RNA测序在阿尔茨海默病诊断中的应用 | 阿尔茨海默病的数据集 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 3211 | 2024-08-05 |
Cuproptosis/ferroptosis-related gene signature is correlated with immune infiltration and predict the prognosis for patients with breast cancer
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1192434
PMID:37521466
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研究论文 | 本研究开发了一个与铜致死/铁死亡相关的基因预测模型，以预测乳腺癌患者的生存情况 | 提出了一种新的生存预测模型，该模型基于铜致死和铁死亡相关基因，能够有效评估乳腺癌患者的预后 | 该研究的样本来源主要依赖于TCGA和GEO数据库，可能存在样本选择偏倚 | 研究的目的是构建一个用于预测乳腺癌患者生存的预后模型 | 研究对象为乳腺浸润性癌（BRCA）患者的转录组和临床数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 基因组数据分析 | 比例风险回归模型 | 转录组数据 | 共涉及验证集和训练集的乳腺癌样本，具体数量未说明 |
| 3212 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of multi-omics data for discovery of ferroptosis-related gene signature predicting immune activity in neuroblastoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1162563
PMID:37521469
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研究论文 | 本研究构建了一种与铁死亡相关的基因签名，以预测神经母细胞瘤的免疫活性 | 提出了一种新的FRG签名，可用于评估神经母细胞瘤免疫治疗效果，并整合多组学数据进行预测 | 尚需更多临床验证以确保在不同患者群体中的普遍适用性 | 探索神经母细胞瘤的免疫治疗结果的评估签名 | 神经母细胞瘤患者及其相关基因 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | RNA测序和蛋白质组学 | Cox回归模型 | 基因数据 | 训练队列(GSE62564)及外部验证队列(TCGA)中的患者数据 |
| 3213 | 2024-08-05 |
Spatial metabolomics in head and neck tumors: a review
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1213273
PMID:37519782
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综述 | 该文章全面回顾了空间代谢组学在头颈肿瘤研究中的应用进展 | 文章创新性地对传统代谢组学和空间代谢组学进行了比较，并讨论了空间代谢组学结合多组学在肿瘤代谢重编程研究中的应用挑战 | 对头颈肿瘤代谢机制的研究仍然处于未充分开发的阶段 | 探讨头颈肿瘤的代谢机制及其发生、发展和预后的研究进展 | 头颈肿瘤的代谢机制 | 数字病理学 | NA | 空间代谢组学 | NA | NA | NA |
| 3214 | 2024-08-05 |
A Consensus Gene Regulatory Network for Neurodegenerative Diseases Using Single-Cell RNA-Seq Data
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31978-5_20
PMID:37525047
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研究论文 | 该文章提出了一种基于单细胞RNA测序数据的神经退行性疾病共识基因调控网络 | 创新点在于开发了一种集成方法，通过整合不同的基因调控网络算法来提升生物学见解 | 尽管采用了集成方法，但每个基因调控网络算法仍然基于其自身的假设，可能会限制预测的生物学意义 | 本研究旨在构建一个共识基因调控网络，以更好地理解神经退行性疾病的基因调控机制 | 研究对象为来自CK-p25小鼠模型的单细胞RNA测序数据集 | 系统生物学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 集成基因调控网络算法 | 基因表达数据 | NA |
| 3215 | 2024-08-05 |
High throughput isolation of RNA from single-cells within an intact tissue for spatial and temporal sequencing a reality
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0289279
PMID:37527243
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研究论文 | 本研究开发了一种自动化的纳米吸管技术，以高通量从完整组织中分离单细胞RNA | 创新点在于结合了全自动纳米吸管技术与磁性纳米粒子，消除了手动操作的需求 | 研究未针对不同类型组织的适用性进行深入探讨 | 研究旨在提高从组织样本中获取高质量单细胞测序数据的效率 | 研究对象为来自乳腺癌组织切片的单个细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 22个乳腺癌组织切片中的细胞 |
| 3216 | 2024-08-07 |
Autoimmune thyroid disease disrupts immune homeostasis in the endometrium of unexplained infertility women-a single-cell RNA transcriptome study during the implantation window
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1185147
PMID:37501789
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了自身免疫性甲状腺疾病（AITD）患者在着床窗口期子宫内膜的免疫微环境 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了AITD患者子宫内膜中免疫细胞亚型的组成和基因表达模式的差异 | 样本量较小，仅包括3名AITD患者和3名对照组 | 探讨AITD如何影响不明原因不孕女性子宫内膜的免疫稳态及其对着床的影响 | 不明原因不孕女性中AITD患者的子宫内膜免疫细胞 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 3名AITD患者和3名对照组 |
| 3217 | 2024-08-07 |
Integrating scRNA and bulk-RNA sequencing develops a cell senescence signature for analyzing tumor heterogeneity in clear cell renal cell carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1199002
PMID:37503331
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（Bulk RNA-seq），开发了一种细胞衰老标志物，用于分析透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤异质性 | 本研究创新性地结合了scRNA-seq和Bulk RNA-seq技术，以识别ccRCC中恶性与非恶性表型在三个衰老相关通路中的差异，并构建了一个新的风险模型 | NA | 分析细胞衰老在透明细胞肾细胞癌中的生化特性 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的细胞衰老 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（Bulk RNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 3218 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor immune microenvironment in human hypopharygeal squamous cell carcinoma and lymphatic metastasis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1168191
PMID:37503341
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人喉下鳞状细胞癌及其淋巴转移的肿瘤免疫微环境 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了喉下鳞状细胞癌及其淋巴转移中的肿瘤免疫微环境，并识别了特定的细胞群和标记基因 | 研究样本仅来自五名患者，可能影响结果的普遍性 | 研究喉下鳞状细胞癌的肿瘤免疫微环境，以提供新的治疗靶点和策略 | 喉下鳞状细胞癌、癌旁组织及淋巴组织 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 132,869个单细胞样本，来自五名喉下鳞状细胞癌患者 |
| 3219 | 2024-08-07 |
A chemotherapy response prediction model derived from tumor-promoting B and Tregs and proinflammatory macrophages in HGSOC
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1171582
PMID:37519793
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研究论文 | 本研究开发了一种基于肿瘤促进B细胞、Tregs和促炎性巨噬细胞的高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）化疗反应预测模型 | 该模型包含43个特征基因，AUC值达到0.97，显著优于现有预测模型 | NA | 开发新的预测标志物，以准确预测高级别浆液性卵巢癌患者的化疗反应 | 高级别浆液性卵巢癌患者的化疗反应 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | RNA-seq数据 | 88个样本 |
| 3220 | 2024-08-07 |
Aerosolized miR-138-5p and miR-200c targets PD-L1 for lung cancer prevention
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1166951
PMID:37520581
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研究论文 | 本研究探讨了通过吸入方式递送miR-138-5p和miR-200c模拟物在肺癌预防中的联合效果 | 采用吸入方式递送微小RNA（miRNA）作为肺癌预防的新方法 | NA | 研究通过吸入方式递送miR-138-5p和miR-200c在肺癌预防中的效果 | miR-138-5p和miR-200c在肺癌预防中的作用 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和成像质谱流式细胞术（IMC） | NA | NA | 小鼠 |