单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 3141 - 3160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3141 | 2024-08-05 |
Aggrephagy-related patterns in tumor microenvironment, prognosis, and immunotherapy for acute myeloid leukemia: a comprehensive single-cell RNA sequencing analysis
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1195392
PMID:37534253
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析急性髓性白血病（AML）中与聚集自噬相关的细胞簇 | 首次在急性髓性白血病的肿瘤微环境中系统性地识别与聚集自噬相关的细胞簇 | 该研究可能未考虑到所有可能的细胞类型和致癌机制 | 探索急性髓性白血病中聚集自噬相关细胞簇的作用及其预后意义 | 急性髓性白血病患者的细胞群体 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 针对11种特定细胞类型进行的分析 |
| 3142 | 2024-08-07 |
Mapping the tumor microenvironment in clear cell renal carcinoma by single-cell transcriptome analysis
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1207233
PMID:37533434
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，深入探讨了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）肿瘤微环境（TME）的异质性 | 首次详细描述了ccRCC TME中免疫细胞的功能多样性，并揭示了肿瘤细胞与正常细胞在拷贝数变异（CNV）频率上的差异 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据，可能无法全面反映所有细胞类型的功能和相互作用 | 旨在阐明ccRCC肿瘤微环境中的肿瘤内异质性，并寻找潜在的治疗靶点 | ccRCC肿瘤及其周围组织的单细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 51,780个单细胞，来自7个ccRCC肿瘤和5个周围组织样本 |
| 3143 | 2024-08-07 |
The role of cellular crosstalk in the progression of diabetic nephropathy
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1173933
PMID:37538798
|
综述 | 本文综述了糖尿病肾病（DN）发展过程中肾脏细胞间相互作用的特征及相关机制 | 利用单细胞转录组测序和单细胞蛋白质组学等医学实验技术，关注肾脏细胞相互作用引起的病理改变 | NA | 探讨糖尿病肾病进展中肾脏细胞间相互作用的特点及其潜在治疗效果 | 肾脏细胞如足细胞、内皮细胞、系膜细胞、周细胞和免疫细胞 | NA | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组测序、单细胞蛋白质组学 | NA | NA | NA |
| 3144 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of plasma proteome and cortex single-cell transcriptome reveals the novel biomarkers during cortical aging
2023, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2023.1063861
PMID:37539343
|
研究论文 | 本文通过整合血浆蛋白质组和皮质单细胞转录组数据，揭示了皮质老化过程中的新型生物标志物。 | 本文创新性地采用多组学分析方法来描绘脑老化的血浆标志物。 | NA | 寻找大脑皮质老化过程中血浆中的特定老化标志物。 | 血浆中的差异基因/蛋白质与大脑皮质老化的关系。 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单核转录组测序（snRNA-seq），血浆蛋白质组测序 | NA | 转录组数据，蛋白质组数据 | 65,064个核来自14个不同年龄阶段的受试者，2,925个血浆蛋白质来自4,263名18至95岁的个体 |
| 3145 | 2024-08-07 |
Plant Nuclei Isolation for Single-Nucleus RNA Sequencing
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3299-4_15
PMID:37540366
|
研究论文 | 本文描述了一种从植物组织中准备用于后续文库构建和高通量测序的核的详细通用协议 | 引入了单核RNA测序（snRNA-seq）技术应用于植物研究，相比单细胞RNA测序（scRNA-seq），可以应用于更广泛的组织类型和植物种类 | 与scRNA-seq相比，从每个核中获得的转录本数量较少 | 解决植物单细胞RNA测序中依赖原生质体分离的问题，并扩展其应用范围 | 植物组织的单核RNA测序 | NA | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 3146 | 2024-08-07 |
A Hands-On Guide to Generate Spatial Gene Expression Profiles by Integrating scRNA-seq and 3D-Reconstructed Microscope-Based Plant Structures
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3299-4_27
PMID:37540378
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研究论文 | 本文提供了一个实用指南，介绍如何通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据和基于显微镜的三维重建表达谱来预测植物结构中的基因表达模式 | 本文提出了一种新的计算方法，通过整合少数标记基因的空间表达谱和scRNA-seq技术，解决植物领域中空间基因表达记录的局限性 | 目前的方法在植物领域的应用有限 | 研究植物细胞中基因表达变化的空间背景，并将其与潜在的形态变化联系起来 | 植物细胞的转录组和基因表达模式 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小部分参考基因 |
| 3147 | 2024-08-07 |
[Identification of transcriptional features and surface markers of plasma cell clones in POEMS syndrome by single-cell RNA sequencing]
2023, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.64.581
PMID:37544716
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别和发现了POEMS综合征中克隆浆细胞的转录特征和表面标记 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了POEMS综合征克隆浆细胞的独特转录特征和表面标记 | 研究样本仅来自10名患者，可能影响结果的普遍性 | 识别POEMS综合征中克隆浆细胞的转录特征和表面标记 | POEMS综合征患者的骨髓浆细胞 | 数字病理学 | 浆细胞疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名患者 |
| 3148 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis and immune landscape of chemokines- and chemokine receptors-based signature in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1164669
PMID:37545521
|
研究论文 | 本研究旨在建立基于趋化因子和趋化因子受体的肝细胞癌（HCC）预后标志物，并探讨其与肿瘤免疫微环境的关系 | 成功建立了一个包含两个趋化因子（CCL14, CCL20）和一个趋化因子受体（CCR3）的预后标志物，并验证了其在HCC患者中的独立风险因素作用 | NA | 开发和验证一种新的预后生物标志物，深入探讨预后模型与肿瘤免疫微环境的关系 | 肝细胞癌（HCC）患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），实时定量PCR（RT-qPCR） | Cox比例风险回归分析 | 基因表达数据 | 342名HCC患者 |
| 3149 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing and Transcriptome Analysis Revealed the Immune Microenvironment and Gene Markers of Acute Respiratory Distress Syndrome
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S419576
PMID:37547124
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的免疫微环境和基因标志物 | 首次使用单细胞RNA测序技术比较了脓毒症诱导的ARDS（SEP-ARDS）和肺炎性ARDS（PNE-ARDS）患者的外周血单核细胞，并识别了ARDS中的分子失调机制 | NA | 探索ARDS患者的免疫微环境和基因标志物 | 急性呼吸窘迫综合征（ARDS）患者的免疫细胞和基因表达 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了GSE152978和GSE152979数据集，涉及ARDS患者和对照组的1939个差异表达基因 |
| 3150 | 2024-08-07 |
Immune landscape in rejection of renal transplantation revealed by high-throughput single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1208566
PMID:37547477
|
研究论文 | 本研究利用高吞吐量的单细胞RNA测序技术揭示了肾移植排斥反应中的免疫景观 | 首次在单细胞水平上分析了肾移植排斥反应中的细胞类型和分子机制，并识别了与排斥反应相关的特定细胞亚群和信号通路 | 研究样本仅包括三名抗体介导排斥反应患者和两名非排斥原因的急性肾损伤患者，样本量较小 | 探讨肾移植排斥反应中细胞层面的作用机制 | 肾移植组织活检样本中的单细胞 | 数字病理学 | 肾移植排斥反应 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从三名抗体介导排斥反应患者和两名急性肾损伤患者的肾移植组织活检中获得了81,139个单细胞 |
| 3151 | 2024-08-07 |
BCR-ABL1-driven exosome-miR130b-3p-mediated gap-junction Cx43 MSC intercellular communications imply therapies of leukemic subclonal evolution
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.83178
PMID:37554265
|
研究论文 | 本文研究了BCR-ABL1驱动的exosome-miR130b-3p介导的间隙连接Cx43 MSC细胞间通讯在白血病亚克隆进化中的作用及其治疗意义。 | 首次揭示了BCR-ABL1通过上调转录因子C/EBPβ诱导miR130a/b-3p表达，进而通过exosome介导的间隙连接Cx43 MSC细胞间通讯影响白血病微环境中的亚克隆进化。 | 研究主要集中在细胞和分子层面，临床应用的具体效果和安全性需要进一步验证。 | 探究BCR-ABL1驱动的exosome-miR130b-3p介导的间隙连接Cx43 MSC细胞间通讯在白血病亚克隆进化中的分子机制及其治疗潜力。 | 骨髓微环境中的间充质干细胞（MSCs）和白血病细胞。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 临床样本和细胞共培养实验 |
| 3152 | 2024-08-07 |
Transcriptome sequencing reveals novel molecular features of SLE severity
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1121359
PMID:37554401
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研究论文 | 本研究利用RNA测序和单细胞RNA测序技术，结合临床参数，分析了45名系统性红斑狼疮（SLE）患者的转录组特征，以识别与SLE严重程度相关的分子特征和信号通路 | 本研究首次识别了12个在严重SLE中差异表达的基因，并发现Treg细胞数量与AMPH表达呈负相关 | NA | 旨在识别与系统性红斑狼疮严重程度相关的分子特征和信号通路 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者的转录组特征 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 45名SLE患者 |
| 3153 | 2024-08-07 |
Construction of molecular typing in LIHC microenvironment based on lipid metabolism-related genes
2023, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:37559997
|
研究论文 | 本研究基于脂质代谢相关基因构建并验证了肝细胞癌（LIHC）中的两种细胞亚型C1和C2，以深入反映肝癌特征并补充临床分期系统的不足。 | 首次基于脂质代谢相关基因构建肝细胞癌的分子分型，并通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据进行验证。 | 研究样本量较小，且依赖于现有数据库中的数据，可能影响结果的普遍性。 | 旨在通过分子分型提高肝细胞癌的诊断和治疗效果。 | 肝细胞癌（LIHC）及其分子分型。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 11个LIHC组织样本 |
| 3154 | 2024-08-07 |
A novel classifier combining G protein-coupled receptors and the tumor microenvironment is associated with survival status in glioblastoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1093263
PMID:37560473
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量测序的综合数据，探讨了G蛋白偶联受体（GPCRs）在胶质母细胞瘤（GBM）中的表达模式及其与肿瘤微环境（TME）的关系 | 首次详细研究了GPCRs在GBM中的表达及其与TME的关联，并发现GPCRs与TME的分类是GBM的独立风险因素 | NA | 探索GPCRs在GBM中的作用及其与TME的关系，评估其作为GBM预后标志物的潜力 | GPCRs在GBM中的表达及其与TME的相互作用 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自脑膜瘤和GBM患者的手术样本 |
| 3155 | 2024-08-07 |
Guided Differentiation of Pluripotent Stem Cells for Cardiac Cell Diversity
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.21.550072
PMID:37502898
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研究论文 | 本文开发了一种引导多能干细胞向心脏细胞多样性分化的协议 | 提出了一个快速生成多种心脏相关细胞类型的引导iPSC分化协议 | NA | 研究调控数量性状位点（QTLs）及其在个体间表型变异中的作用 | 多能干细胞分化为心脏细胞的多样性 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型 | 在8-10天内生成多种心脏相关细胞类型 |
| 3156 | 2024-08-05 |
The role of KPNA2 as a monotonically changing differentially expressed gene in the diagnosis, risk stratification, and chemotherapy sensitivity of chronic hepatitis B-liver cirrhosis-hepatocellular carcinoma
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05213-z
PMID:37526663
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研究论文 | 这篇文章探讨了KPNA2在慢性乙型肝炎-肝硬化-肝细胞癌的诊断和风险分层中的作用 | 发现KPNA2作为一种新的血清生物标志物，可用于监测慢性乙型肝炎到肝细胞癌的动态演变 | 研究限于中国的特定人群，结果可能对其他地区的适用性有限 | 旨在识别CLH阶段中KPNA2的作用及其在HCC早期诊断中的潜力 | 关注慢性乙型肝炎患者、肝硬化患者和肝细胞癌患者的KPNA2表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | ELISA，单细胞RNA-seq，和常规RNA-seq | Cox回归模型 | 血清样本 | 研究样本涉及慢性乙型肝炎、肝硬化及肝细胞癌患者 |
| 3157 | 2024-08-07 |
Tumor-infiltrating gamma delta T-cells reveal exhausted subsets with remarkable heterogeneity in colorectal cancer
2023-11-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34669
PMID:37531161
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研究论文 | 研究肿瘤浸润性γδT细胞在结直肠癌微环境中的耗竭表型和功能状态 | 揭示了结直肠癌微环境中肿瘤浸润性γδT细胞的耗竭表型，并发现其比肿瘤浸润性CD8 T细胞或NK细胞表现出更严重的功能耗竭 | NA | 探究肿瘤浸润性γδT细胞在结直肠癌微环境中的抑制受体表达模式和功能状态 | 肿瘤浸润性γδT细胞在结直肠癌微环境中的耗竭特征 | 免疫学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | NA |
| 3158 | 2024-08-07 |
Targeting the Immunoglobulin IGSF9 Enhances Antitumor T-cell Activity and Sensitivity to Anti-PD-1 Immunotherapy
2023-Oct-13, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3115
PMID:37506192
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研究论文 | 本文研究了免疫球蛋白超家族成员9（IGSF9）在肿瘤细胞和肿瘤浸润免疫细胞中的表达，并探讨了其作为免疫检查点在肿瘤免疫逃逸中的作用 | 发现IGSF9通过抑制T细胞增殖和激活促进肿瘤免疫逃逸，为免疫治疗提供了新的靶点 | 研究主要集中在体外和小鼠模型中，需要进一步的人体临床试验验证 | 探索新的免疫检查点以改善癌症患者的免疫治疗反应 | 免疫球蛋白超家族成员9（IGSF9）在肿瘤免疫逃逸中的作用 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多种癌症类型的肿瘤细胞和肿瘤浸润免疫细胞 |
| 3159 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling of muscle-infiltrating T cells in idiopathic inflammatory myopathies
2023-10-11, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202217240
PMID:37522383
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研究论文 | 本研究深入分析了特发性炎症性肌病患者中浸润肌肉的T细胞 | 揭示了特发性炎症性肌病患者肌肉组织中存在的记忆T细胞特征，并提供了识别新的治疗靶点的转录组图谱 | 样本量较小，仅涉及六名患者，可能限制结果的普遍性 | 探讨特发性炎症性肌病患者浸润肌肉的T细胞特征 | 六名最近被诊断为特发性炎症性肌病的患者 | 数字病理学 | 特发性炎症性肌病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 六名患者的肌肉和外周血记忆T细胞 |
| 3160 | 2024-08-05 |
Emerging Concepts in Precision Medicine in Axial Spondyloarthritis
2023-10, Current rheumatology reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1007/s11926-023-01113-w
PMID:37505349
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研究论文 | 本文回顾了轴性脊柱关节炎中精准医学的新兴概念和最近发展 | 探讨了多基因风险评分、孟德尔随机化、药物基因组学、单细胞测序和空间转录组学等新思想 | 在临床应用之前，需要大量研究和实施策略 | 探索精准医学在轴性脊柱关节炎患者中的应用 | 关注于轴性脊柱关节炎患者的遗传风险因素和免疫反应 | 数字病理学 | NA | 多基因风险评分、孟德尔随机化、药物基因组学、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |