单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 3101 - 3120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3101 | 2024-08-05 |
Cross-species transcriptomics reveals bifurcation point during the arterial-to-hemogenic transition
2023-08-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05190-6
PMID:37558796
|
研究论文 | 本文介绍了一种跨物种的方法HomologySeeker，以研究人类的内皮到造血转变现象 | 提出了HomologySeeker方法，利用小鼠信息研究人类EHT的变化，并发现物种间的平行发育关系 | 对人类内皮到造血转变的现象的具体机制尚不清楚，且可能缺乏临床验证 | 探讨人类内皮到造血转变的过程及其物种间的保守性 | 专注于动脉内皮细胞及其向造血内皮细胞转变的阶段 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用小鼠和人类细胞的单细胞转录组数据进行比较 |
| 3102 | 2024-08-05 |
Disease-associated astrocytes and microglia markers are upregulated in mice fed high fat diet
2023-08-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-39890-0
PMID:37558676
|
研究论文 | 这篇文章探讨了高脂饮食如何影响与阿尔茨海默病相关的星形胶质细胞和小胶质细胞的标志物 | 文章提出C4b作为肥胖或糖尿病人群中阿尔茨海默病的潜在早期标志物，揭示了肥胖、糖尿病与阿尔茨海默病发病机制之间的新联系 | 研究主要基于小鼠实验和人类数据，尚未在临床上验证所发现的标志物 | 研究与阿尔茨海默病及2型糖尿病风险相关的基因表达变化 | 研究对象为在高脂饮食下的小鼠及患有阿尔茨海默病的人类 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类的脑组织样本 |
| 3103 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis reveals region-heterogeneous responses in rhesus monkey spinal cord with complete injury
2023-08-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40513-5
PMID:37558705
|
研究论文 | 该研究揭示了完全脊髓损伤猴子脊髓中区域异质性的细胞动态响应 | 使用单细胞转录组学研究不同脊髓区域的细胞响应，发现远端腰椎组织受到严重影响，并提出了基于支架的治疗方法 | 研究样本仅限于雌性猕猴，可能影响结果的广泛性 | 探讨脊髓损伤后不同区域的细胞反应及其异质性 | 雌性猕猴脊髓损伤的细胞动态反应 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组学 | NA | 组织样本 | 雌性猕猴脊髓损伤样本 |
| 3104 | 2024-08-07 |
TPL2 kinase activity regulates microglial inflammatory responses and promotes neurodegeneration in tauopathy mice
2023-08-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.83451
PMID:37555828
|
研究论文 | 本文研究了TPL2激酶活性在微胶质细胞炎症反应中的作用及其在tauopathy小鼠模型中促进神经退行性变的影响 | 发现TPL2激酶活性调节微胶质细胞的细胞因子释放，并在tauopathy模型中减少神经炎症和恢复神经功能 | NA | 探讨TPL2激酶活性在神经退行性疾病中的作用及潜在治疗策略 | TPL2激酶活性、微胶质细胞、神经退行性疾病 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | tauopathy小鼠模型 |
| 3105 | 2024-08-07 |
LAST-seq: single-cell RNA sequencing by direct amplification of single-stranded RNA without prior reverse transcription and second-strand synthesis
2023-08-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03025-5
PMID:37559123
|
研究论文 | 本文开发了一种新的单细胞RNA测序方法LAST-seq，该方法直接扩增原始的单链RNA分子，无需先前的逆转录和第二链合成 | LAST-seq方法直接扩增单链RNA，提高了单分子捕获效率并降低了技术噪声 | NA | 开发新的单细胞RNA测序技术并研究人类细胞中的转录爆发动力学 | 单细胞RNA测序技术和人类细胞的转录调控 | 基因组学 | NA | LAST-seq | NA | RNA | 单细胞 |
| 3106 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics analysis of esophageal squamous precancerous lesions and their progression to esophageal cancer
2023-08-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40343-5
PMID:37553345
|
研究论文 | 本研究分析了食管鳞状上皮癌前病变及其向食管癌的进展情况 | 该研究利用空间全转录组图谱分析，识别出TAGLN2和CRNN作为食管癌前病变阶段预测食管癌风险的候选指标 | NA | 本研究旨在寻找能够预测食管鳞状细胞癌风险的生物标志物 | 研究对象为食管鳞状上皮癌前病变及其进展到食管鳞状细胞癌的过程 | 数字病理学 | 食管癌 | 空间全转录组分析 | NA | 组织样本 | 配对样本数量未提供 |
| 3107 | 2024-08-05 |
Phylogenetic inference from single-cell RNA-seq data
2023-08-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-39995-6
PMID:37553438
|
研究论文 | 该文章提出了一种从单细胞RNA测序数据重建肿瘤细胞的系统发育关系的方法PhylinSic | PhylinSic方法能够结合基因表达谱重建个体癌细胞的进化关系，解决了传统方法难以达成的挑战 | NA | 探讨肿瘤细胞在演化过程中的恶性特性获取及其对治疗的影响 | 单细胞RNA测序数据中的癌细胞及其遗传谱系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-Seq | 贝叶斯建模算法 | 基因表达数据 | NA |
| 3108 | 2024-08-07 |
Transgene-free direct conversion of murine fibroblasts into functional muscle stem cells
2023-Aug-08, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-023-00317-z
PMID:37553383
|
研究论文 | 本研究报道了一种高效的无转基因方法，通过过表达合成MyoD-mRNA与增强的小分子混合物，直接将小鼠成纤维细胞转化为诱导的肌源性前体细胞（iMPCs） | 本研究开发了一种无转基因的方法，避免了病毒载体带来的不利基因组整合和潜在的分子后果 | NA | 探索一种更安全的方法，用于再生医学中将成纤维细胞转化为肌源性干细胞 | 小鼠成纤维细胞转化为肌源性干细胞 | 再生医学 | 杜氏肌营养不良 | 过表达合成MyoD-mRNA，小分子混合物 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3109 | 2024-08-07 |
Restoring gluconeogenesis by TEF inhibited proliferation and promoted apoptosis and immune surveillance in kidney renal clear cell carcinoma
2023-Aug-08, Cancer & metabolism
IF:6.0Q1
DOI:10.1186/s40170-023-00312-4
PMID:37553601
|
研究论文 | 本研究探讨了肾透明细胞癌（KIRC）中糖异生作用的恢复对肿瘤细胞增殖和凋亡的影响 | 通过过表达PCK1或TEF并抑制miR-4477b，成功恢复了KIRC中的糖异生作用，显著抑制了肿瘤细胞的增殖和集落形成，并诱导了细胞凋亡 | NA | 研究糖异生作用在肾透明细胞癌中的作用及其对治疗结果的潜在影响 | 肾透明细胞癌（KIRC）及其糖异生相关基因和miRNAs | 数字病理学 | 肾癌 | QPCR, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及KIRC肿瘤和邻近组织样本，以及临床肿瘤患者 |
| 3110 | 2024-08-07 |
Mesenchymal stem cells shift the pro-inflammatory phenotype of neutrophils to ameliorate acute lung injury
2023-08-08, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03438-w
PMID:37553691
|
研究论文 | 研究探讨了间充质干细胞（MSC）在急性肺损伤（ALI）中对中性粒细胞表型的影响 | 首次揭示了MSC通过上调CD24表达，将激活的中性粒细胞表型转变为衰老型，从而抑制炎症反应 | NA | 研究MSC在ALI中对中性粒细胞的免疫抑制作用 | ALI小鼠肺组织中的中性粒细胞 | NA | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | ALI小鼠肺组织中的中性粒细胞 |
| 3111 | 2024-08-05 |
The single-cell transcriptome and chromatin accessibility datasets of peripheral blood mononuclear cells in Chinese holstein cattle
2023-08-07, BMC genomic data
IF:1.9Q3
DOI:10.1186/s12863-023-01139-0
PMID:37550629
|
研究论文 | 本研究分析了中国荷斯坦奶牛外周血单核细胞的单细胞转录组和染色质可及性数据集 | 提供了关于LPS刺激下外周血单核细胞的单细胞层面的新见解 | 对于LPS如何在单细胞水平上刺激PBMCs仍然了解不多 | 通过分析PBMCs的单细胞转录组和染色质可及性，促进对免疫应答的理解 | 中国荷斯坦奶牛的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及性染色质测序（scATAC-seq） | NA | 基因组数据 | 共计30,756个估计单细胞，经过质量控制后映射到26,141个单细胞 |
| 3112 | 2024-08-05 |
SONAR enables cell type deconvolution with spatially weighted Poisson-Gamma model for spatial transcriptomics
2023-08-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40458-9
PMID:37550279
|
研究论文 | 提出SONAR模型以利用空间转录组数据进行细胞类型解卷积 | SONAR模型结合空间加权回归框架和弹性加权步骤，提升了细胞类型成分的局部估计 | 由于空间分辨率限制，测量的表达往往混合自多种细胞 | 开发一种能够更准确解卷积空间转录组数据中细胞类型的模型 | 空间转录组数据中的细胞类型 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组 | 回归模型 | 空间转录组数据 | 包括小鼠大脑、人类心脏和人类胰腺导管腺癌的样本 |
| 3113 | 2024-08-07 |
Specific subsets of urothelial bladder carcinoma infiltrating T cells associated with poor prognosis
2023-08-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-39208-0
PMID:37550396
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了来自两名膀胱尿路上皮癌患者的30,905个T细胞，识别出18种不同的T细胞亚群，并发现某些特定亚群与不良预后相关 | 首次详细描述了膀胱尿路上皮癌中浸润性T细胞的组成，并揭示了与不良预后相关的特定T细胞亚群 | 研究样本仅来自两名患者，可能影响结果的普遍性 | 探索膀胱尿路上皮癌中肿瘤浸润淋巴细胞的组成，为开发有效的肿瘤免疫疗法提供理论基础 | 膀胱尿路上皮癌中的T细胞亚群及其与患者预后的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 30,905个T细胞 |
| 3114 | 2024-08-07 |
The expression and prognostic value of disulfidptosis progress in lung adenocarcinoma
2023-08-07, Aging
DOI:10.18632/aging.204938
PMID:37552140
|
研究论文 | 本研究探讨了二硫化物死亡相关基因（DRGs）在肺腺癌（LUAD）中的表达及其预后价值 | 构建了一个包含五个DRGs的模型，用于评估LUAD的预后，该模型的预测准确性显著高于基于临床参数的模型 | NA | 研究二硫化物死亡相关基因在肺腺癌中的表达及其预后价值 | 二硫化物死亡相关基因在肺腺癌中的表达及预后价值 | 数字病理学 | 肺腺癌 | scRNA-seq | LASSO分析和多元Cox回归分析 | 表达谱和单细胞RNA测序数据 | 从TCGA和GEO数据库收集的表达谱和scRNA-seq数据，涉及22个DRGs在正常和肿瘤组织中的差异表达 |
| 3115 | 2024-08-07 |
A novel metabolic subtype with S100A7 high expression represents poor prognosis and immuno-suppressive tumor microenvironment in bladder cancer
2023-Aug-05, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11182-w
PMID:37543645
|
研究论文 | 本研究通过共识聚类将膀胱癌患者分为两种代谢亚型，并探讨了代谢亚型与免疫微环境及预后的关系 | 首次系统全面地阐述了膀胱癌的代谢异质性，并发现了S100A7高表达的代谢亚型与免疫抑制性肿瘤微环境和良好免疫治疗反应相关 | NA | 探讨膀胱癌的代谢异质性及其与免疫微环境和预后的关系 | 膀胱癌患者及其代谢亚型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 共识聚类 | NA | 基因表达数据 | 1640个代谢相关基因，63例膀胱癌样本和16例癌旁样本 |
| 3116 | 2024-08-07 |
A single-cell transcriptional landscape of immune cells shows disease-specific changes of T cell and macrophage populations in human achalasia
2023-08-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39750-5
PMID:37542039
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了人体贲门失弛缓症患者与对照组的下食管括约肌组织和血液样本的免疫细胞转录组特征 | 首次揭示了贲门失弛缓症中C1QC巨噬细胞和组织驻留记忆T细胞的显著扩张及其与疾病进展的关系 | NA | 探讨贲门失弛缓症中免疫细胞的转录组特征及其与疾病进展的关系 | 贲门失弛缓症患者的下食管括约肌组织和血液样本 | 数字病理学 | 贲门失弛缓症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 贲门失弛缓症患者与对照组的下食管括约肌组织和血液样本 |
| 3117 | 2024-08-05 |
Decoding the prognostic significance of integrator complex subunit 9 (INTS9) in glioma: links to TP53 mutations, E2F signaling, and inflammatory microenvironments
2023-Aug-03, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-023-03006-5
PMID:37537630
|
研究论文 | 本研究探讨了INTS9在胶质瘤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 本文首次将INTS9与TP53突变、E2F信号通路和炎症微环境联系起来 | 缺乏临床试验验证结果，尚需进一步研究以确认发现 | 旨在明确INTS9在胶质瘤治疗中的潜在角色 | 研究对象包括胶质瘤的基因组、蛋白质组数据及细胞系 | 数字病理学 | NA | 全外显子测序、免疫组化 | NA | 基因组数据、蛋白组数据 | 从TCGA和CGGA收集多个肿瘤样本进行分析 |
| 3118 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics of human cholesteatoma identifies an activin A-producing osteoclastogenic fibroblast subset inducing bone destruction
2023-08-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40094-3
PMID:37537159
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析发现在人类胆脂瘤中存在一种产激活素A的成骨破坏性成纤维细胞亚群，导致骨破坏 | 本研究首次确定了胆脂瘤中特有的产激活素A的成纤维细胞亚群，并揭示了其在骨破坏中的作用 | 本研究的限制在于使用的是小鼠模型，可能与人类病理机制存在差异 | 研究胆脂瘤中骨破坏的病理生理机制 | 人类胆脂瘤样本中的单细胞 | 数字病理学 | 耳科疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA序列数据 | 人类胆脂瘤样本NA |
| 3119 | 2024-08-05 |
Integration of single-cell sequencing and bulk expression data reveals chemokine signaling pathway in proliferating cells is associated with the survival outcome of osteosarcoma
2023-08-03, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01617-5
PMID:37537613
|
研究论文 | 该文章研究了化学因子信号通路与骨肉瘤患者生存结果的关系 | 整合单细胞RNA测序和大规模转录组数据，识别与生存相关的细胞亚群体 | 未充分验证所发现的生物标志物在临床应用中的有效性 | 探讨骨肉瘤中与生存结果相关的生物标志物 | 骨肉瘤患者的细胞亚群体 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序和大规模转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3120 | 2024-08-07 |
Extracellular matrix remodelling in dental pulp tissue of carious human teeth through the prism of single-cell RNA sequencing
2023-08-02, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-023-00238-z
PMID:37532703
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析结合免疫染色技术，生成了一份全面的龋齿人牙髓单细胞图谱，揭示了龋齿牙髓组织中细胞群的分子和细胞学变化。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了龋齿牙髓组织的分子和细胞学景观，展示了细胞群的显著变化，如免疫细胞、间充质干细胞和成纤维细胞的改变。 | 研究仅限于龋齿牙髓组织，未涉及其他类型的牙髓疾病或病变。 | 旨在揭示龋齿牙髓组织中的分子和细胞学变化，并为未来牙科病理学研究和疾病器官的比较分析提供基础。 | 研究对象为龋齿人牙髓组织。 | 数字病理学 | 牙科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 研究涉及龋齿人牙髓组织的多个细胞群 |