单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 3041 - 3060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3041 | 2024-08-07 |
New discoveries in the field of metabolism by applying single-cell and spatial omics
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.06.002
PMID:37577385
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综述 | 本文综述了单细胞多组学（SCM-Omics）和空间多组学（SM-Omics）技术在代谢疾病研究中的应用进展 | 结合SCM-Omics和SM-Omics技术，探索细胞的分子和空间分析，为揭示代谢过程的异质性提供了有前景的工具 | NA | 探讨SCM-Omics和SM-Omics技术在代谢相关疾病中的应用，揭示代谢疾病的分子机制 | 代谢相关疾病，包括肥胖、糖尿病、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）和心血管疾病（CVD） | 代谢学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间多组学（SM-Omics） | NA | 细胞 | NA |
| 3042 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of cellular heterogeneity and interactions in the ischemia-reperfusion injured mouse intestine
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.02.002
PMID:37577387
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析了小鼠肠道缺血再灌注损伤中的细胞异质性和细胞间相互作用 | 发现了新的细胞亚群，如EC1、EC3和EC8，并揭示了它们在消化吸收和细胞连接中的作用 | NA | 研究小鼠肠道缺血再灌注损伤中的细胞异质性和细胞间相互作用 | 小鼠肠道中的九种主要细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 46,716个细胞 |
| 3043 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing and subcellular spatial transcriptomics facilitate the translation of liver microphysiological systems for regulatory application
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.06.013
PMID:37577388
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3044 | 2024-08-07 |
Cux1+ proliferative basal cells promote epidermal hyperplasia in chronic dry skin disease identified by single-cell RNA transcriptomics
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.04.004
PMID:37577389
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和原位杂交技术，在慢性干燥皮肤疾病模型中识别出一种新型增殖性基底细胞（PBC），该细胞特异性表达转录因子Cux1，并探讨了其在皮肤表皮增生中的作用。 | 首次在干燥皮肤疾病模型中通过单细胞RNA测序技术识别出表达Cux1的增殖性基底细胞，并揭示了Cux1在角质形成细胞增殖中的关键作用。 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床应用的直接证据尚需进一步验证。 | 探讨慢性干燥皮肤疾病中表皮增生的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点。 | 慢性干燥皮肤疾病模型中的增殖性基底细胞及其在表皮增生中的作用。 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型及部分皮肤病患者样本 |
| 3045 | 2024-08-05 |
Therapeutic implications for localized prostate cancer by multiomics analyses of the ageing microenvironment landscape
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.85209
PMID:37564213
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研究论文 | 本文探讨了衰老微环境在前列腺癌中的作用及其治疗意义 | 首次全面阐明了前列腺癌中衰老微环境的复杂特征，并建立了衰老微环境指数(AMI) | 缺乏大规模临床数据以进一步验证AMI的临床相关性 | 研究衰老微环境如何影响前列腺癌的进展及个性化治疗 | 813例前列腺癌患者及其衰老微环境特征 | 数字病理学 | 前列腺癌 | NMF算法、空间转录组学、GDSC、CMap和CellMiner数据库 | NA | 基因组数据、细胞实验数据 | 813例前列腺癌患者 |
| 3046 | 2024-08-05 |
Machine learning-based integration develops a neutrophil-derived signature for improving outcomes in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1216585
PMID:37575244
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研究论文 | 本研究开发了一个基于中性粒细胞特征的风险模型，以改善肝细胞癌患者的预后 | 首次将中性粒细胞异质性用于肝细胞癌患者分层，并建立了新的风险模型 | 未详细讨论不同中性粒细胞特征对个体治疗决策的影响 | 探讨中性粒细胞在肝细胞癌免疫微环境中的作用，并开发相关的风险模型 | 肝细胞癌患者的中性粒细胞特征及其与预后的关系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 肿瘤组织大规模测序、单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 涉及了两组肝细胞癌患者 |
| 3047 | 2024-08-05 |
Study on the cytokines related to SARS-Cov-2 in testicular cells and the interaction network between cells based on scRNA-seq data
2023, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2022-0661
PMID:37589002
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研究论文 | 本研究探讨了与SARS-Cov-2相关的细胞因子在睾丸细胞中的表达及其细胞间相互作用网络。 | 研究整合了单细胞测序数据，分析了睾丸细胞中的细胞因子表达和细胞间的通信机制。 | 关于睾丸细胞细胞因子表达的研究相对较少，尚需进一步探索其在其他生理和病理状态下的作用。 | 本研究旨在分析COVID-19中细胞因子风暴对男性生育的潜在影响。 | 研究对象为睾丸细胞及其间的细胞相互作用。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | NA | 20个细胞簇 |
| 3048 | 2024-08-05 |
Integrative multi-omics analyses unravel the immunological implication and prognostic significance of CXCL12 in breast cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1188351
PMID:37564657
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研究论文 | 本研究综合分析CXCL12在乳腺癌中的免疫学意义和预后价值 | 通过整合多组学分析，识别出CXCL12相关的生物标志物并构建强有力的乳腺癌预后模型 | 尚未说明样本来源和选择标准的具体细节 | 探究CXCL12在乳腺癌中的作用及其相关生物标志物 | 乳腺癌患者的CXCL12表达水平及其与预后的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 免疫组织化学分析、单细胞RNA测序、批量RNA测序、WGCNA分析 | Cox回归模型、LASSO回归 | RNA测序数据、基因表达数据 | 总共分析了402个基因，并包括了不同风险组的验前结果 |
| 3049 | 2024-08-05 |
NR2F6, a new immune checkpoint that acts as a potential biomarker of immunosuppression and contributes to poor clinical outcome in human glioma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1139268
PMID:37575237
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研究论文 | 该研究系统地探索了NR2F6在胶质瘤中的临床特征和生物功能 | 首次调查了NR2F6在胶质瘤中的作用，并提出其可能作为免疫抑制的生物标志物 | 本研究的样本主要来自公共数据库，可能存在样本选择偏倚 | 研究NR2F6在胶质瘤中的作用及其作为免疫检查点的潜力 | NR2F6在663个胶质瘤样本中的表达及其相关临床特征 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 663个胶质瘤样本用于训练，325个样本用于验证，60个样本用于确认 |
| 3050 | 2024-08-05 |
Molecular mechanisms regulating natural menopause in the female ovary: a study based on transcriptomic data
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1004245
PMID:37564980
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研究论文 | 本研究探讨了女性卵巢在自然绝经前后的分子和细胞变化 | 揭示了卵巢颗粒细胞的分化轨迹和调控其状态的基因，为理解绝经过程中的分子机制提供了新视角 | 研究中可能存在样本量不足，且仅基于特定人群的转录组数据 | 探究女性卵巢在自然绝经期间的分子机制和细胞变化 | 研究对象包括不同年龄段女性的卵巢组织与单细胞测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、转录组测序 | NA | 转录组数据 | 总共112个个体，分为30-39岁(14个)，40-49岁(37个)和50-59岁(61个) |
| 3051 | 2024-08-07 |
Prognostic and immunomodulatory roles of schizophrenia-associated genes HTR2A, COMT, and PRODH in pan-cancer analysis and glioma survival prediction model
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1201252
PMID:37564635
|
研究论文 | 本研究探讨了与精神分裂症相关的基因HTR2A、COMT和PRODH在泛癌分析中的表达及其在胶质瘤生存预测模型中的作用 | 本研究首次在泛癌分析中探讨了精神分裂症相关基因HTR2A、COMT和PRODH的表达，并构建了一个胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤的生存预测模型 | 研究主要集中在基因表达和免疫细胞浸润分析，未涉及其他可能影响癌症发展的因素 | 探讨精神分裂症相关基因在癌症中的表达及其对生存的影响，并构建胶质瘤生存预测模型 | 精神分裂症相关基因HTR2A、COMT和PRODH在多种癌症中的表达及其对胶质瘤生存的影响 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | COX回归分析 | 基因表达数据 | 多个癌症类型的数据 |
| 3052 | 2024-08-07 |
Unveiling efferocytosis-related signatures through the integration of single-cell analysis and machine learning: a predictive framework for prognosis and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1237350
PMID:37575252
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析和机器学习技术，揭示了与肝细胞癌（HCC）预后和免疫治疗反应相关的吞噬作用相关基因（EFRGs）特征 | 首次系统地探讨了吞噬作用相关基因在肝细胞癌中的作用，并构建了一个预测模型，用于评估患者的预后和免疫治疗反应 | NA | 发现新的早期生物标志物，以改善肝细胞癌相关的死亡率 | 肝细胞癌患者及其吞噬作用相关基因 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA测序数据, 临床特征数据 | 来自TCGA数据库的肝细胞癌患者数据 |
| 3053 | 2024-08-07 |
Crosstalk between Placental Trophoblast and Decidual Immune Cells in Recurrent Miscarriage
2023, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.86533
PMID:37575278
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research paper | 本研究旨在识别复发性流产中滋养层细胞与蜕膜免疫细胞之间的功能障碍相互作用 | 通过单细胞RNA测序技术，揭示了复发性流产中母胎界面细胞组织的改变、细胞类型特异性转录组及免疫与非免疫细胞间的通讯 | NA | 识别复发性流产中滋养层细胞与蜕膜免疫细胞之间的功能障碍相互作用 | 滋养层细胞与蜕膜免疫细胞 | digital pathology | recurrent miscarriage | scRNA-seq | NA | single-cell RNA sequencing data | 22976个细胞，包括11种细胞类型 |
| 3054 | 2024-08-07 |
Heterogeneity in quiescent Müller glia in the uninjured zebrafish retina drive differential responses following photoreceptor ablation
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1087136
PMID:37575968
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）探讨了斑马鱼视网膜中静息状态的Müller胶质细胞在光感受器选择性消融后的基因表达异质性及其对再生反应的影响 | 首次揭示了斑马鱼视网膜中静息状态的Müller胶质细胞在不同区域的基因表达异质性，并展示了这些细胞在神经消融后的独特激活和再生特征 | 尚未完全阐明Müller胶质细胞激活及视网膜再生的分子机制 | 探究斑马鱼视网膜中Müller胶质细胞在神经消融后的激活及再生特征 | 斑马鱼视网膜中的Müller胶质细胞及光感受器 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及斑马鱼视网膜中不同区域的Müller胶质细胞样本 |
| 3055 | 2024-08-07 |
Integrative single-cell analysis of cardiac and pulmonary sarcoidosis using publicly available cardiac and bronchoalveolar lavage fluid sequencing datasets
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1227818
PMID:37576111
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研究论文 | 本研究利用公开的心脏和支气管肺泡灌洗液单细胞RNA测序数据集，对心脏和肺部结节病进行了综合单细胞分析 | 首次综合分析了心脏和肺部结节病的单细胞转录组数据，揭示了两种结节病之间的共享转录趋势 | 研究依赖于公开数据集，可能无法涵盖所有相关细胞类型和病理情况 | 探讨心脏和肺部结节病的病理机制及其在转录水平上的差异和共性 | 心脏结节病（CS）和肺部结节病（PS）的细胞类型及其转录特征 | 数字病理学 | 结节病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了两个公开的支气管肺泡灌洗单细胞RNA测序数据集和两个公开的心脏单核RNA测序数据集 |
| 3056 | 2024-08-07 |
A Novel Prognostic Signature of comprising Nine NK Cell signatures Based on Both Bulk RNA Sequencing and Single-Cell RNA Sequencing for Hepatocellular Carcinoma
2023, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.85873
PMID:37576389
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，开发了一种基于九个NK细胞标志物的肝细胞癌预后模型 | 首次基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，开发了一种新的肝细胞癌预后标志物模型 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序识别NK细胞标记基因，并开发肝细胞癌的预后标志物 | 肝细胞癌的NK细胞标记基因及预后标志物 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO-COX算法 | RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据来自10名患者，批量RNA测序数据来自786名患者 |
| 3057 | 2024-08-07 |
Nicotinamide N-Methyl Transferase as a Predictive Marker of Tubular Fibrosis in CKD
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S420706
PMID:37576910
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研究论文 | 本研究旨在验证尼克酰胺N-甲基转移酶（NNMT）作为慢性肾脏病（CKD）进展的预测标志物 | 首次验证NNMT作为CKD进展的预测标志物，并探讨其在肾小管间质纤维化中的作用 | 研究样本量较小，需要进一步的大规模研究验证 | 验证NNMT作为CKD进展的预测标志物 | NNMT表达与CKD相关结果变量的关系 | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 37名CKD患者 |
| 3058 | 2024-08-07 |
Identification of novel gene signature for lung adenocarcinoma by machine learning to predict immunotherapy and prognosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1177847
PMID:37583701
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别出与肺腺癌（LUAD）免疫治疗和预后相关的新基因标志物，并构建了一个风险模型以指导LUAD患者的个性化治疗 | 本研究首次通过机器学习方法识别出27个与预后相关的免疫细胞标志基因，并构建了一个七基因风险模型，用于指导LUAD患者的免疫治疗和预后评估 | NA | 构建一个风险模型以有效指导肺腺癌（LUAD）患者的免疫治疗 | 肺腺癌（LUAD）患者的免疫治疗和预后 | 机器学习 | 肺腺癌 | RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、微阵列数据分析 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据、微阵列数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的LUAD Bulk RNA-seq数据、scRNA-seq数据（GSE203360）和微阵列数据（GSE31210） |
| 3059 | 2024-08-07 |
Hepatocellular carcinoma cell differentiation trajectory predicts immunotherapy, potential therapeutic drugs, and prognosis of patients
2023, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2022-0656
PMID:37589009
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研究论文 | 本研究旨在探索肝细胞癌（HCC）细胞的新分类及其临床意义，通过分析综合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，将HCC细胞分为三个不同的分化状态子群，并基于HCC分化相关基因（HDRGs）识别出三种分子类别，揭示了免疫检查点基因表达和HCC患者的总体生存率 | 本研究通过细胞轨迹分析将HCC细胞分为三个不同的分化状态子群，并基于HDRGs识别出三种分子类别，进一步筛选出潜在的治疗药物，为HCC的个性化治疗提供了方向 | NA | 探索肝细胞癌细胞的新分类及其临床意义 | 肝细胞癌（HCC）细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | HCC样本 |
| 3060 | 2024-08-05 |
Analysis of single-cell sequencing results of an elderly patient with myeloid leukemia reveals high expression of multiple oncogenes in monocytes and hematopoietic stem cells
2023-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2023.2240129
PMID:37535066
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研究论文 | 本研究分析了一名老年急性髓性白血病患者的单细胞基因组测序结果 | 该研究发现单核细胞和造血干细胞中多种癌基因的高表达，对急性髓性白血病的进展和治疗提供新见解 | 研究只针对一例老年急性髓性白血病患者，样本量较小，结果可能不具普遍性 | 分析老年急性髓性白血病患者的基因序列以提供新的治疗思路 | 一名64岁的急性髓性白血病患者的外周血和骨髓细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 1名患者的外周血和骨髓细胞 |