单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 2981 - 3000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2981 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq and bulk-seq identify RAB17 as a potential regulator of angiogenesis by human dermal microvascular endothelial cells in diabetic foot ulcers
2023, Burns & trauma
IF:6.3Q1
DOI:10.1093/burnst/tkad020
PMID:37605780
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研究论文 | 本研究分析了糖尿病足溃疡患者和健康对照的皮肤微血管内皮细胞HDMECs，并识别了RAB17作为潜在的血管生成调节因子 | 首次明确了RAB17在糖尿病足溃疡中作为血管生成的潜在调节因子，并揭示了其表达下调与血管生成能力受损的关系 | 仅通过磁性细胞分选技术获取细胞样本，可能存在选择偏差，且部分结果需进一步通过临床实验验证 | 全面分析糖尿病足溃疡患者的HDMECs，以确认潜在的血管生成调节因子 | 糖尿病足溃疡患者和健康对照的皮肤微血管内皮细胞HDMECs | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序和传统RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从糖尿病足溃疡患者和健康对照中获取的皮肤样本 |
| 2982 | 2024-08-05 |
Identification of cuproptosis and immune-related gene prognostic signature in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1179742
PMID:37622116
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研究论文 | 本研究旨在基于cuproptosis和免疫相关基因创建肺腺癌患者的生存预测模型 | 首次结合cuproptosis和免疫相关基因进行肺腺癌预后模型的建立 | 未提及具体的临床验证和临床应用效果 | 用于提高肺腺癌患者的个性化治疗效果 | 肺腺癌患者的RNA序列数据和相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | 比例风险回归模型 | RNA数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个肺腺癌患者的数据 |
| 2983 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the transcriptomic characteristics of peripheral blood mononuclear cells in hepatitis B vaccine non-responders
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1091237
PMID:37593735
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了乙型肝炎疫苗无应答者外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次揭示了乙型肝炎疫苗无应答者中抗原呈递细胞的活性、MAPK通路活性及效应T细胞活性显著降低，以及NKT细胞的细胞毒性显著增加 | 样本量较小，仅包括三名高应答者和三名无应答者 | 探究乙型肝炎疫苗无应答者的分子机制 | 外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6名志愿者（3名高应答者和3名无应答者） |
| 2984 | 2024-08-07 |
Integrating Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Reveals Heterogeneity, Tumor Microenvironment, and Immunotherapeutic Efficacy Based on Sialylation-Related Genes in Bladder Cancer
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S418433
PMID:37600224
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据，揭示了膀胱癌中与唾液酸化相关基因的异质性、肿瘤微环境及免疫治疗效果 | 建立了基于唾液酸化相关基因的膀胱癌风险分层，并展示了其在预测患者预后、临床病理特征、免疫微环境和免疫治疗效果方面的良好准确性 | NA | 旨在基于唾液酸化相关基因建立膀胱癌风险分层，并阐明其在膀胱癌预后、肿瘤微环境和免疫治疗中的作用 | 膀胱癌样本及其唾液酸化相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 批量RNA测序样本分为3种肿瘤亚型，基于19个与预后相关的唾液酸化基因；单细胞RNA测序数据中识别出5种核心细胞类型 |
| 2985 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies a novel proliferation cell type affecting clinical outcome of pancreatic ductal adenocarcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1236435
PMID:37601684
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，识别出一种新的增殖细胞类型Prol，该细胞类型在胰腺导管腺癌中富集，并与患者的生存率降低相关 | 首次发现并描述了一种新的增殖细胞类型Prol，并证实其在胰腺导管腺癌中的作用及其与免疫抑制微环境的关联 | NA | 旨在识别影响胰腺导管腺癌患者临床结果的细胞类型 | 胰腺导管腺癌中的细胞类型及其对患者生存率的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST） | 机器学习集成算法 | RNA测序数据 | 使用了来自癌症基因组图谱（TCGA）队列的批量RNA测序数据 |
| 2986 | 2024-08-07 |
GADD45B regulates the carcinogenesis process of chronic atrophic gastritis and the metabolic pathways of gastric cancer
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1224832
PMID:37608794
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研究论文 | 本研究探讨了GADD45B在慢性萎缩性胃炎（CAG）致癌过程中的作用及其在胃癌代谢途径中的影响。 | 首次揭示了GADD45B在CAG致癌过程中的关键作用，并探讨了其在胃癌发展和代谢途径中的影响。 | 研究主要基于转录组数据分析，未来研究可结合更多实验验证。 | 探究GADD45B在慢性萎缩性胃炎致癌过程中的作用及其在胃癌代谢途径中的影响。 | 慢性萎缩性胃炎和胃癌的致癌机制及代谢途径。 | 数字病理学 | 胃癌 | hdWGCNA, LASSO, SVM-RFE, RF | NA | 转录组数据 | 涉及CAG、非萎缩性胃炎（NAG）和胃癌的组织样本 |
| 2987 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals key differences between early-stage and late-stage systemic sclerosis skin across autoantibody subgroups
2023-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224184
PMID:37580109
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了弥漫性皮肤系统性硬化症（dcSSc）患者与健康对照组之间的细胞差异 | 发现了dcSSc患者中抗RNA聚合酶III（ARA）和抗拓扑异构酶抗体（ATA）亚组在疾病早期和晚期皮肤细胞表达谱和细胞间相互作用的差异 | NA | 探究dcSSc患者皮肤在不同疾病阶段和抗体亚组间的细胞差异 | 弥漫性皮肤系统性硬化症患者和健康对照组 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 皮肤活检样本 | 15个前臂皮肤活检样本，包括12名dcSSc患者和3名健康对照组 |
| 2988 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of spinal cord injury reveals functional heterogeneity of oligodendrocyte lineage cells
2023-Nov-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.147713
PMID:37579960
|
研究论文 | 本研究揭示了脊髓损伤后少突胶质细胞谱系细胞的功能异质性 | 首次揭示了Junb在成熟少突胶质细胞中的独特作用，并预测了可能的转录因子 | 尚缺乏对脊髓损伤后少突胶质细胞状态和细胞间相互作用的深入研究 | 探讨脊髓损伤后少突胶质细胞谱系细胞的功能变化和相互作用 | 脊髓损伤后的少突胶质细胞谱系细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞转录组数据 | NA |
| 2989 | 2024-08-07 |
Integrating single-cell imaging and RNA sequencing datasets links differentiation and morphogenetic dynamics of human pancreatic endocrine progenitors
2023-11-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.07.019
PMID:37591246
|
research paper | 本文通过监测NEUROG3基因表达和蛋白质在单细胞水平上的动态变化，结合单细胞转录组数据，研究了人类胰腺内分泌前体细胞的分化和形态发生动力学 | 提出了将单细胞转录组数据与活细胞动态行为统计整合的数据映射方法，并发现了KLK12在NEUROG3表达初期对细胞迁移的作用 | NA | 研究人类胰腺内分泌前体细胞的分化和形态发生动力学 | NEUROG3基因在人类胰腺内分泌前体细胞中的表达和功能 | digital pathology | NA | RNA sequencing | NA | image | 单细胞水平的数据 |
| 2990 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk sequencing analyses with experimental validation identify the prognostic and immunological implications of CD226 in pan-cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05268-y
PMID:37580402
|
研究论文 | 本研究探讨了CD226在泛癌中的生物功能、肿瘤免疫作用及其作为预后和免疫治疗反应预测因子的潜力 | CD226被提出作为一种创新生物标志物，能预测患者预后和免疫治疗反应 | CD226在多种癌症类型中的具体机制仍需进一步深入研究 | 研究CD226在肿瘤免疫中的作用及其预后预测潜力 | CD226在肿瘤浸润的CD8+和NK细胞中的表达及其功能 | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞和整体测序分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2991 | 2024-08-07 |
Aging impairs the ability of vascular endothelial stem cells to generate endothelial cells in mice
2023-11, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-023-09891-8
PMID:37563497
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研究论文 | 本研究比较了年轻和老年小鼠的血管内皮干细胞（VESCs）在体外和体内分化为内皮细胞的潜力 | 首次阐明了衰老如何影响血管内皮干细胞（VESCs） | NA | 探讨衰老对血管内皮干细胞功能的影响 | 年轻和老年小鼠的血管内皮干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 年轻（2-3个月大）和老年（27-28个月大）小鼠的血管内皮干细胞 |
| 2992 | 2024-08-05 |
Two distinct molecular faces of preeclampsia revealed by single-cell transcriptomics
2023-Oct-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.07.005
PMID:37572658
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研究论文 | 本研究揭示了妊娠高血压疾病的两种不同分子特征 | 首次通过单细胞转录组学研究早发和晚发妊娠高血压疾病的分子变化 | 研究仅集中于胎盘细胞类型，可能无法全面反映妊娠高血压的全貌 | 探讨在两种类型的妊娠高血压中胎盘功能的分子变化 | 早发和晚发妊娠高血压患者及相应的妊娠匹配对照 | 数字病理学 | 妊娠高血压 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 包含早发和晚发妊娠高血压病例及相应对照的多个样本 |
| 2993 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals blastomere heterogeneity of 2-cell embryos in pigs
2023-Oct, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14454
PMID:37568261
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研究论文 | 本研究分析了猪2-cell胚胎中的单细胞RNA测序数据，揭示了其胚胎芽细胞异质性。 | 该研究首次系统地揭示了不同类型的猪2-cell胚胎中，芽细胞的分子异质性及其调控机制。 | 研究主要集中于猪的2-cell胚胎，结果可能不适用于其他物种的胚胎发育研究。 | 探讨猪2-cell胚胎芽细胞的异质性及其与胚胎随后发育的关系。 | 本研究对象为猪2-cell胚胎中的单个芽细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 包含3种不同类型的2-cell胚胎：体内受精、体外受精和单性激活 |
| 2994 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq reveals a microenvironment and an exhaustion state of T/NK cells in acute myeloid leukemia
2023-Oct, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15932
PMID:37591615
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研究论文 | 本研究揭示了急性髓性白血病（AML）中T/NK细胞的微环境及其耗竭状态 | 分析了急性髓性白血病的肿瘤微环境，揭示了T/NK细胞在此环境中的耗竭状态及其表达分子 | 未提到具体的限制 | 探讨急性髓性白血病中的免疫微环境及T/NK细胞的状态 | 包括21名急性髓性白血病患者及8名健康供体的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 128,688个细胞，来自29个骨髓抽取 |
| 2995 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing provides insights into the landscape of ovary in PCOS and alterations induced by CUMS
2023-10-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00165.2023
PMID:37584608
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研究论文 | 这项研究通过单细胞RNA测序探讨多囊卵巢综合症（PCOS）卵巢的转录特征及其与抑郁间的机制。 | 提供了PCOS及其抑郁相关的分子机制的新见解，突出了炎症在PCOS发病机制中的重要性。 | 主要使用大鼠模型，是否能完全反映人类的情况仍需进一步验证。 | 探索PCOS卵巢的独特转录组特征及抑郁的影响机制。 | 使用了由来曲唑和慢性不可预测轻度压力（CUMS）诱导的PCOS大鼠模型。 | 数字病理学 | 多囊卵巢综合症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 采用了多个细胞类型进行分析，包括颗粒细胞和成纤维细胞等12种细胞类型 |
| 2996 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptional profiling reveals immunomodulatory properties of stromal and epithelial cells in periodontal immune milieu with diabetes in rats
2023-Oct, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110715
PMID:37562294
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了糖尿病大鼠牙周炎环境中基质细胞和上皮细胞的免疫调节特性 | 首次详细描述了糖尿病相关牙周炎中牙龈细胞的异质性及其免疫微环境的改变，并揭示了基质细胞和上皮细胞在牙龈免疫微环境中的免疫调节功能 | 研究仅限于大鼠模型，未来研究需在人类样本中验证这些发现 | 探讨糖尿病与牙周炎之间的分子联系，并揭示牙龈细胞在糖尿病相关牙周炎中的细胞特异性变化 | 糖尿病大鼠牙周炎环境中的牙龈基质细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 45,259个细胞 |
| 2997 | 2024-08-07 |
Toward the functional interpretation of somatic structural variations: bulk- and single-cell approaches
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad297
PMID:37587831
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综述 | 本文综述了基于全基因组测序（WGS）检测组织和单细胞水平体细胞结构变异（SVs）的最新进展，并讨论了其优势和局限性 | 介绍了先进的计算算法用于体细胞SV的识别，并比较了有无匹配正常对照的体细胞SV检测器的性能 | 体细胞SVs的检测具有挑战性，且目前研究较少 | 探讨体细胞结构变异的功能解释 | 体细胞结构变异（SVs）及其在细胞发育和衰老中的作用 | 数字病理学 | NA | 全基因组测序（WGS） | NA | 基因组数据 | NA |
| 2998 | 2024-08-07 |
An Atlas of Grass Carp IgM+ B Cells in Homeostasis and Bacterial Infection Helps to Reveal the Unique Heterogeneity of B Cells in Early Vertebrates
2023-09-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300052
PMID:37578390
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了草鱼IgM+ B细胞在稳态和细菌感染下的景观 | 发现了草鱼IgM+ B细胞的六个主要群体，包括罕见的先天B细胞和增殖B细胞，并揭示了单个B细胞可能通过共表达重组的IgM亚类基因产生多种抗体 | NA | 揭示早期脊椎动物B细胞的独特异质性 | 草鱼IgM+ B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞分选结合Sanger测序 | NA | RNA | 多个草鱼IgM+ B细胞样本 |
| 2999 | 2024-08-05 |
Mechanism of breast cancer immune microenvironment in prognosis of heart failure
2023-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107339
PMID:37586207
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研究论文 | 本文探讨了乳腺癌免疫微环境对心力衰竭预后的影响机制 | 研究揭示了乳腺癌与心力衰竭之间通过免疫途径的联系，并构建了一种能够预测心力衰竭发生的变换器模型 | 尚未明确乳腺癌治疗对心力衰竭影响的所有潜在机制 | 研究乳腺癌患者心力衰竭预后的潜在机制 | 1260名乳腺癌患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 基因表达分析，单细胞测序，变换器模型 | 变换器 | 基因表达数据 | 1260名乳腺癌患者 |
| 3000 | 2024-08-05 |
Dissecting human placental cells heterogeneity in preeclampsia and gestational diabetes using single-cell sequencing
2023-09, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2023.07.005
PMID:37572508
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析妊娠高血压和妊娠糖尿病患者的胎盘细胞异质性 | 首次揭示了妊娠高血压和妊娠糖尿病患者胎盘细胞类型及其分化顺序的异质性变化 | 样本量较小，仅涉及15名患者，可能影响结果的普遍适用性 | 深入了解妊娠高血压和妊娠糖尿病对胎盘细胞类型的异质性变化 | 研究对象包括妊娠高血压、妊娠糖尿病患者和健康对照组的胎盘细胞 | 数字病理学 | 妊娠高血压, 妊娠糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 共涉及15个样本（妊娠高血压5个，妊娠糖尿病5个，健康对照5个） |