单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 2921 - 2940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2921 | 2024-08-05 |
Case Report: Molecular and microenvironment change upon midostaurin treatment in mast cell leukemia at single-cell level
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1210909
PMID:37638009
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案例报告 | 本案例报告了在中性细胞白血病患者中，米多佐仑治疗前后分子和微环境的变化。 | 这是第一个报告米多佐仑治疗前后中性细胞白血病患者临床、免疫学和分子变化的案例，揭示了米多佐仑抗药性的机制。 | 仅报告了一名59岁男性患者的案例，可能缺乏广泛推广到更大群体的可行性。 | 探究米多佐仑治疗对中性细胞白血病基因表达和微环境的影响。 | 一名带有F522C突变的中性细胞白血病患者。 | 数字病理学 | 中性细胞白血病 | 单细胞测序和全外显子组测序（WES） | NA | 血液和骨髓样本 | 1名患者 |
| 2922 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals that immune cells induce human nucleus pulposus ossification and degeneration
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1224627
PMID:37638033
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了免疫细胞诱导人类核髓质骨化和退化的分子机制 | 揭示了免疫细胞（巨噬细胞和T细胞）在核髓质骨化过程中的作用，以及干细胞向骨化表型分化的相互作用 | 研究仅基于4名退行性核髓质患者，样本量较小，可能影响结果的普适性 | 阐明人类退化性核髓质的分子机制和骨化过程 | 研究目标是人类退行性核髓质细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 退行性椎间盘疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 4名退行性核髓质患者 |
| 2923 | 2024-08-05 |
Pan-cancer analysis of IFN-γ with possible immunotherapeutic significance: a verification of single-cell sequencing and bulk omics research
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1202150
PMID:37646041
|
研究论文 | 本研究探讨了干扰素-γ在多种癌症中的免疫治疗意义。 | 首次系统分析了干扰素-γ在全癌症中的作用，提供了新的免疫治疗指征。 | 研究基于已有数据，可能缺乏临床实证验证。 | 旨在阐明干扰素-γ在多种癌症中的角色及其对免疫治疗的影响。 | 分析干扰素-γ在不同癌症类型中的表达和预后相关性。 | 数字病理学 | 肿瘤 | RNA测序 | PPI网络分析 | RNA表达数据和临床数据 | 涉及TCGA中的多种肿瘤样本 |
| 2924 | 2024-08-05 |
Opportunities and challenges in the application of single-cell and spatial transcriptomics in plants
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1185377
PMID:37636094
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综述 | 本文回顾了植物单细胞和空间转录组技术的应用机会与挑战 | 提出了结合单细胞转录组、空间转录组及空间元素分布的研究方向 | 单细胞和空间转录组分析存在适用性不足、空间信息缺失或分辨率不高等挑战 | 探索单细胞和空间转录组技术在植物研究中的应用前景 | 植物单细胞和空间转录组技术的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组、空间转录组 | NA | NA | NA |
| 2925 | 2024-08-05 |
Aligning the Cord Blood-Bone Marrow Differences and the Post-transplantation Clinical Manifestations by Single-Cell RNA-Seq
2023 Jan-Dec, Cell transplantation
IF:3.2Q2
DOI:10.1177/09636897231193067
PMID:37650431
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序比较脐血、骨髓和粒细胞集落刺激因子诱导的骨髓，探讨了这些移植物的差异。 | 研究首次从综合视角揭示了脐血与骨髓的关键生物特征差异，特别关注了造血干/祖细胞的归巢信号和分化潜力。 | 临床数据的样本量和多样性可能限制了结果的普遍适用性。 | 本研究旨在理解脐血与骨髓之间的生物学差异及其在临床表现中的关联。 | 研究对象为脐血、骨髓和粒细胞集落刺激因子诱导的骨髓样本，以及接受移植的患者的相关临床数据。 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | NA |
| 2926 | 2024-08-07 |
Characterization of the pleural microenvironment niche and cancer transition using single-cell RNA sequencing in EGFR-mutated lung cancer
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.85084
PMID:37649596
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肺癌患者的胸腔积液中的细胞转录组，揭示了胸膜微环境在肺癌转移中的细胞特异性机制 | 首次发现胸膜间皮细胞的间皮-间质转化（MesoMT）在胸膜转移中的作用，并验证了铁死亡抵抗在胸膜转移中的关键作用 | NA | 研究肺癌胸膜转移的细胞特异性机制 | 肺癌患者的胸腔积液细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自肺癌患者和充血性心力衰竭患者的胸腔积液细胞 |
| 2927 | 2024-08-07 |
Histone deacetylase-mediated tumor microenvironment characteristics and synergistic immunotherapy in gastric cancer
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.86928
PMID:37649598
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研究论文 | 本文通过构建基于组蛋白去乙酰化酶（HDAC）表达水平的HDAC评分（HDS）模型，研究了胃癌肿瘤微环境（TME）特征及其对免疫治疗的影响 | 本文创新性地构建了HDS模型，用于评估胃癌TME特征并预测免疫治疗效果，同时发现MIF信号通路抑制和GPX4表达可能是胃癌冷肿瘤协同免疫治疗的重要策略 | 本文仅基于HDAC表达水平构建模型，未考虑其他可能影响TME的因素 | 研究胃癌肿瘤微环境特征及其对免疫治疗的影响 | 胃癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序 | HDS模型 | 转录组数据 | 未明确具体样本数量 |
| 2928 | 2024-08-07 |
Global analysis of HLA-A2 restricted MAGE-A3 tumor antigen epitopes and corresponding TCRs in non-small cell lung cancer
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.84710
PMID:37649599
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研究论文 | 本研究全面筛选了HLA-A2限制的MAGE-A3肿瘤抗原表位，并使用人工抗原呈递细胞系统、单细胞转录组和TCR V(D)J测序以及机器学习技术，鉴定了相应的TCRs，并筛选和验证了具有杀伤能力的肿瘤反应性TCRs。 | 本研究首次系统分析了针对MAGE-A3抗原的T细胞免疫反应和相应的抗原特异性TCR，并鉴定了能够有效诱导CD8+ T细胞活化和细胞毒性的HLA-A2限制性T细胞表位。 | NA | 研究目的是鉴定适用于针对HLA-A2限制性MAGE-A3肿瘤抗原的TCR-T设计的候选TCRs。 | 研究对象包括HLA-A2限制的MAGE-A3肿瘤抗原表位及其相应的TCRs。 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞转录组测序、TCR V(D)J测序、机器学习 | NA | 文本 | 一批HLA-A2+的非小细胞肺癌供体 |
| 2929 | 2024-08-05 |
Emerging technologies in adipose tissue research
2023-12, Adipocyte
IF:3.5Q2
DOI:10.1080/21623945.2023.2248673
PMID:37599422
|
综述 | 本文简要概述了新兴技术在脂肪组织研究中的潜在影响 | 讨论了包括单细胞测序、多组学分析和空间转录组学在内的前沿技术在脂肪组织研究中的重要性 | 没有具体提到某一特定技术的详细实施或实验数据 | 识别这些新技术在脂肪组织研究中最显著的贡献领域 | 脂肪组织作为一种复杂和动态的组织 | 生物医学 | NA | 单细胞测序、多组学分析、空间转录组学、活体成像、3D组织工程、微生物组分析 | NA | NA | NA |
| 2930 | 2024-08-07 |
Identification of tumor immunophenotypes associated with immunotherapy response in bladder cancer
2023-Dec, International journal of urology : official journal of the Japanese Urological Association
IF:1.8Q3
DOI:10.1111/iju.15276
PMID:37602677
|
研究论文 | 本研究旨在揭示与膀胱癌免疫治疗反应相关的免疫表型，识别免疫亚型的特征基因，并为改善免疫治疗反应提供新的分子靶点 | 本研究提供了一种新的肿瘤免疫表型分类方法，并发现膀胱癌免疫表型可以预测免疫检查点阻断的反应 | NA | 揭示与膀胱癌免疫治疗反应相关的免疫表型 | 膀胱癌的免疫表型及其对免疫治疗反应的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了GSE32894、Imvigor210和GSE145140等多个数据集 |
| 2931 | 2024-08-05 |
A robust platform for integrative spatial multi-omics analysis to map immune responses to SARS-CoV-2 infection in lung tissues
2023-Nov, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13679
PMID:37605469
|
研究论文 | 开发了一种创新的空间多组学平台以研究COVID-19感染的肺组织 | 结合了五种组织分析技术与新颖的计算映射方法以深度表征肺部对病毒感染的反应 | 研究中对于深层组织特征描绘的局限性尚未被完全消除 | 深入理解SARS-CoV-2对肺部细胞环境的影响 | COVID-19感染和未感染的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学与蛋白质组学 | NA | 组织样本 | 包含COVID-19感染和未感染的肺组织样本的比较 |
| 2932 | 2024-08-07 |
GPR109A expressed on medullary thymic epithelial cells affects thymic Treg development
2023-11, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350521
PMID:37595951
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研究论文 | 本研究探讨了GPR109A在胸腺髓质上皮细胞中的表达对胸腺Treg细胞发育的影响 | 首次发现GPR109A在胸腺髓质上皮细胞中的表达影响胸腺Treg细胞的发育 | NA | 研究GPR109A在胸腺Treg细胞发育中的作用 | GPR109A在胸腺髓质上皮细胞中的表达及其对Treg细胞发育的影响 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 |
| 2933 | 2024-08-07 |
Identification an innovative classification and nomogram for predicting the prognosis of thyroid carcinoma patients and providing therapeutic schedules
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05252-6
PMID:37596371
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研究论文 | 本研究探讨了程序性细胞死亡（PCD）模式与甲状腺癌患者预后的关系，并基于PCD基因开发了一个预测模型 | 本研究首次深入分析了多种细胞死亡模式，开发了一种新的PCD模型，能够准确预测甲状腺癌患者的临床预后和药物敏感性 | NA | 探讨程序性细胞死亡模式与甲状腺癌预后的关系，并开发一个基于PCD基因的预测模型 | 甲状腺癌患者及其预后和药物敏感性 | 机器学习 | 甲状腺癌 | 非负矩阵分解（NMF） | 支持向量机（SVM） | 基因表达谱 | 568名甲状腺癌患者 |
| 2934 | 2024-08-07 |
Fasting-Mimicking Diet Drives Antitumor Immunity against Colorectal Cancer by Reducing IgA-Producing Cells
2023-11-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0323
PMID:37602826
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研究论文 | 本研究探讨了模拟禁食饮食（FMD）通过减少产生IgA的细胞来驱动结直肠癌的抗肿瘤免疫的作用机制 | 首次揭示了FMD通过抑制B细胞向IgA类别转换来延缓肿瘤生长，并通过增强脂肪酸氧化（FAO）触发RUNX3乙酰化，从而抑制Cα基因转录和IgA类别转换 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验来验证FMD在人类结直肠癌治疗中的效果 | 阐明FMD诱导的代谢重编程在激活结直肠癌抗肿瘤免疫中的作用 | 结直肠癌及其免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠结直肠癌模型 |
| 2935 | 2024-08-07 |
Expressed Barcoding Enables High-Resolution Tracking of the Evolution of Drug Tolerance
2023-11-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0144
PMID:37603596
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研究论文 | 本研究利用表达条形码系统结合单细胞RNA测序技术，高分辨率地追踪了非小细胞肺癌患者中EGFR突变细胞对EGFR抑制剂耐药性的起源和克隆进化 | 首次使用表达条形码系统结合单细胞RNA测序技术，实现对药物耐受细胞克隆进化的纵向基因表达和药物敏感性分析 | NA | 阐明敏感细胞与耐药存活细胞之间的生物学差异，以及耐药细胞如何响应治疗，以提高EGFR抑制剂的疗效 | 非小细胞肺癌中EGFR突变细胞对EGFR抑制剂的耐药性 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 表达条形码系统 | 基因表达数据 | 大量克隆 |
| 2936 | 2024-08-07 |
Solute carrier (SLC) expression reveals skeletogenic cell diversity
2023-11, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.08.004
PMID:37611888
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了紫海胆晚期胚胎阶段的转运蛋白表达模式，揭示了细胞类型的多样性 | 通过基于转运蛋白的聚类分析，发现了跨细胞谱系共享及特定细胞类型独有的转运蛋白表达模式 | NA | 探索紫海胆晚期胚胎阶段ABC和SLC家族转运蛋白的表达模式 | 紫海胆晚期胚胎阶段的细胞类型多样性 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 紫海胆晚期胚胎阶段的细胞样本 |
| 2937 | 2024-08-05 |
Metformin rescues migratory deficits of cells derived from patients with periventricular heterotopia
2023-Oct-11, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202216908
PMID:37609821
|
研究论文 | 本文研究了来自腔旁神经异位患者的细胞迁移缺陷及其恢复机制 | 发现通过调节自噬可以改善来自腔旁神经异位患者的神经前体细胞迁移缺陷 | 本研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类病理情况 | 探讨腔旁神经异位患者神经前体细胞迁移缺陷的机制及其恢复方法 | 来自腔旁神经异位患者的人类神经前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、电子显微镜分析、Western blot分析 | NA | 细胞样本 | NA |
| 2938 | 2024-08-07 |
Characterization of ccl20a.3 and ccl20l as gene markers for Th17 cell in turbot
2023-Oct, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2023.109005
PMID:37604262
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术在比目鱼中鉴定了Th17细胞特异性表达的两个趋化因子相关基因ccl20a.3和ccl20l | 首次在比目鱼中鉴定出Th17细胞特异性表达的ccl20a.3和ccl20l基因，并通过实验验证了它们在Th17细胞中的表达模式和功能 | NA | 旨在阐明Th17细胞在硬骨鱼中的功能及其特异性基因标记 | 比目鱼中的Th17细胞及其相关基因ccl20a.3和ccl20l | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2939 | 2024-08-07 |
Cellular senescence primes liver fibrosis regression through Notch-EZH2
2023-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.346
PMID:37614965
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研究论文 | 本文研究了细胞衰老通过Notch-EZH2途径促进肝纤维化逆转的机制 | 首次揭示了细胞衰老通过Notch-EZH2途径影响肝纤维化逆转的机制，并证明了清除衰老细胞和阻断EZH2信号可以减缓肝纤维化进程 | NA | 探讨细胞衰老在肝纤维化逆转中的作用及其分子机制 | 肝纤维化逆转过程中的细胞衰老及其分子机制 | NA | 肝纤维化 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用dasatinib和quercetin清除衰老细胞，以及通过EPZ6438阻断EZH2信号进行实验 |
| 2940 | 2024-08-07 |
Differential variability analysis of single-cell gene expression data
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad294
PMID:37598422
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研究论文 | 本文提出并比较了12种统计流程，用于分析单细胞基因表达数据的差异变异性 | 本文首次提出并比较了多种统计方法组合，用于量化和测试细胞间转录变异性的差异 | NA | 确定单细胞基因表达数据差异变异性分析的最佳实践 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | COVID-19, 自闭症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 高质量的合成scRNA-seq数据集，COVID-19和自闭症患者的scRNA-seq数据集 |