单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 2841 - 2860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2841 | 2024-08-07 |
Neutrophil metalloproteinase driven spleen damage hampers infection control of trypanosomiasis
2023-09-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41089-w
PMID:37669943
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研究论文 | 本文研究了中性粒细胞金属蛋白酶在布氏锥虫感染中对脾脏损伤的影响及其对睡眠病感染控制的影响。 | 首次揭示了布氏锥虫感染导致脾脏中四种中性粒细胞亚群的扩张和分化，并发现这些中性粒细胞通过金属蛋白酶导致脾脏结构重塑。 | NA | 探讨中性粒细胞在布氏锥虫感染中的作用及其对脾脏结构和功能的影响。 | 布氏锥虫感染引起的中性粒细胞亚群及其对脾脏的影响。 | 免疫学 | 睡眠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 2842 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomes reveal a molecular link between diabetic kidney and retinal lesions
2023-09-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05300-4
PMID:37670124
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了糖尿病肾病和糖尿病视网膜病变之间的细胞和分子关联。 | 发现了肾小球膜细胞和视网膜周细胞在糖尿病状态下具有相似的分子特征和转变，并揭示了这两种细胞类型共享的趋化因子调控对糖尿病肾病和视网膜病变并发的重要性。 | NA | 揭示糖尿病肾病和糖尿病视网膜病变之间的细胞和分子关联，以改善这两种疾病的预防和治疗。 | 糖尿病肾病和糖尿病视网膜病变的细胞和分子关联。 | 数字病理学 | 糖尿病并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2843 | 2024-08-07 |
Self-formation of concentric zones of telencephalic and ocular tissues and directional retinal ganglion cell axons
2023-09-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87306
PMID:37665325
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研究论文 | 本文报道了人脑前脑-眼器官的自形成现象，包括前脑、视神经、视盘和神经视网膜组织沿中心-周边轴的同心区形成，并探讨了视网膜神经节细胞轴突定向生长的机制。 | 首次报道了人脑前脑-眼器官的自形成现象，并通过单细胞RNA测序确认了前脑和眼组织的身份，识别了早期视盘、视神经和视网膜神经节细胞的表达特征。 | NA | 探讨人脑前脑和眼组织在早期发育中的协调指定机制，以及视网膜神经节细胞轴突定向生长的机制。 | 人脑前脑-眼器官的自形成现象，视网膜神经节细胞轴突的定向生长。 | NA | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞表面标记物CNTN2 | NA |
| 2844 | 2024-08-07 |
Abnormal accumulation of extracellular vesicles in hippocampal dystrophic axons and regulation by the primary cilia in Alzheimer's disease
2023-09-04, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-023-01637-3
PMID:37667395
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研究论文 | 本研究探讨了阿尔茨海默病中异常轴突和树突的形成机制及其与细胞外囊泡和初级纤毛的关系 | 首次揭示了初级纤毛在阿尔茨海默病中通过调节细胞外囊泡的积累影响异常轴突和树突的形成 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 旨在阐明阿尔茨海默病中异常轴突和树突的形成机制及其与细胞外囊泡和初级纤毛的关系 | 阿尔茨海默病中的异常轴突和树突 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 三维渲染技术、腺相关病毒（AAV）1、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 小鼠模型中的海马神经元 |
| 2845 | 2024-08-05 |
ePlatypus: an ecosystem for computational analysis of immunogenomics data
2023-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad553
PMID:37682115
|
研究论文 | 本文介绍了ePlatypus，一个用于免疫基因组数据分析的计算生态系统 | ePlatypus是一个开源的基于网络的平台，整合了多种数据模式，并提供编程教程和整合数据库 | NA | 旨在促进计算免疫学和免疫基因组学领域的研究 | 主要关注适应性免疫库和单细胞测序数据 | 计算免疫学 | NA | 单细胞测序，机器学习 | NA | 免疫基因组数据 | NA |
| 2846 | 2024-08-05 |
TimeTalk uses single-cell RNA-seq datasets to decipher cell-cell communication during early embryo development
2023-09-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05283-2
PMID:37660148
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研究论文 | 本文开发了一个名为TimeTalk的计算框架，用于解密早期胚胎发育中细胞间通讯的秘密 | 提出了一个新的计算框架，从公共小鼠单细胞RNA-seq数据集中整合而来，以揭示与早期胚胎发育相关的配体-受体对 | 对eLRs的影响范围和作用尚不清晰，且需要更多的实验验证 | 研究早期胚胎发育过程中细胞间信号传递的机制 | 利用整合的时间序列小鼠单细胞RNA-seq数据集，识别并分析与早期胚胎发育相关的配体-受体对 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 使用了公共的小鼠单细胞RNA-seq数据集 |
| 2847 | 2024-08-07 |
Deciphering early human pancreas development at the single-cell level
2023-09-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40893-8
PMID:37660175
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research paper | 本文通过大规模单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序技术，研究了人类胚胎早期胰腺组织的分子异质性、发育轨迹和调控网络 | 揭示了人类背侧胰腺多能细胞与腹侧多能细胞不同的基因表达模式，并识别了胰胆祖细胞和具有不同分化潜能的内分泌祖细胞亚群 | NA | 理解胰腺发育，为胰腺疾病的治疗提供线索 | 人类胚胎早期胰腺组织的分子异质性和发育轨迹 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序、单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | 基因表达数据 | 来自第一孕期胚胎的人类胚胎胰腺组织 |
| 2848 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of human prepuce reveals dynamic changes in gene regulation and cellular communications
2023-Sep-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09615-8
PMID:37658288
|
研究论文 | 本研究系统性分析了人类包皮在单细胞分辨率下的细胞变异和分子变化 | 首次识别了15种包皮细胞亚型，并揭示了儿童和成人之间的细胞类型特异性基因调控网络的动态变化 | 未能提供成年人和儿童包皮细胞组成和异质性的全面基础数据 | 研究人类包皮的细胞和分子动态，深入了解其生物学和生理功能 | 人类儿童和成人的包皮细胞 | 数字病理学 | 生殖系统相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 90,770个合格细胞 |
| 2849 | 2024-08-05 |
ShIVA: a user-friendly and interactive interface giving biologists control over their single-cell RNA-seq data
2023-09-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-40959-z
PMID:37658061
|
研究论文 | 本文提出了ShIVA，一个用户友好且互动的界面，旨在使生物学家能够控制他们的单细胞RNA-seq数据 | ShIVA提供了一种直观和迭代的分析过程，专门为生物学家设计，结合了视频教程，增强了用户体验 | 该界面主要依赖于Seurat v4 R包，可能限制了其对其他分析工具的适用性 | 研究单细胞RNA-seq和CITE-seq数据的分析方法，以帮助生物学家 | 单细胞RNA-seq和CITE-seq数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 单细胞数据 | NA |
| 2850 | 2024-08-05 |
Inhibition of TCA cycle improves the anti-PD-1 immunotherapy efficacy in melanoma cells via ATF3-mediated PD-L1 expression and glycolysis
2023-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007146
PMID:37678921
|
研究论文 | 本研究探讨了抑制TCA循环如何通过ATF3介导的PD-L1表达和糖酵解，提高黑色素瘤细胞对抗PD-1免疫治疗的疗效 | 研究揭示了TCA循环在免疫检查点抑制中的作用，并提供了一种新的抗PD-1免疫治疗组合策略 | 本研究主要集中在黑色素瘤细胞，结果可能不具有普遍适用性 | 旨在改善黑色素瘤患者抗PD-1免疫治疗的有效性 | 主要研究黑色素瘤细胞及其对免疫治疗的反应 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | NMR，RNA测序，qRT-PCR，西方印迹，氧气凝胶法 | NA | 代谢物，转录组 | 患者的血浆样本及B16F10肿瘤小鼠 |
| 2851 | 2024-08-05 |
Clinical characterization of EFHD2 (swiprosin-1) in Glioma-associated macrophages and its role in regulation of immunosuppression
2023-Sep, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110702
PMID:37673235
|
研究论文 | 本文探讨了EFHD2在胶质瘤相关巨噬细胞中的作用以及其对免疫抑制的调节 | 该研究首次利用多种族群的大规模临床数据探讨EFHD2在胶质瘤中的角色，并提出其作为潜在生物标志物和预后因子的可能性 | 缺乏针对不同种族群体的充分实验验证，且部分数据来源于回顾性分析 | 研究EFHD2对胶质瘤微环境中巨噬细胞极化及免疫抑制的影响 | 胶质瘤患者的临床数据、胶质瘤细胞系及Efhd2缺失小鼠初级巨噬细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq | NA | 临床数据 | 313和657名胶质瘤患者的RNA-seq数据，以及603名来自TCGA的胶质瘤患者数据 |
| 2852 | 2024-08-07 |
CD31 defines a subpopulation of human adipose-derived regenerative cells with potent angiogenic effects
2023-09-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-41535-1
PMID:37658225
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研究论文 | 本文研究了人类脂肪来源的再生细胞（ADRCs）中CD31+亚群的血管生成效应 | 发现CD31+ ADRCs在血管生成和旁分泌效应方面优于CD31- ADRCs和未分选的ADRCs | NA | 探讨ADRCs中特定细胞亚群在再生治疗中的作用 | 人类脂肪来源的再生细胞（ADRCs）及其CD31+亚群 | 再生医学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 9种内皮ADRC亚群 |
| 2853 | 2024-08-07 |
A novel signature of the ligand and receptor genes associated with disulfidoptosis for prediction of prognosis, immunologic therapy responses in hepatocellular carcinoma
2023-Sep, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e19502
PMID:37662746
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研究论文 | 研究旨在探索与二硫化物凋亡相关的配体和受体基因在肝细胞癌中的预后特征，并利用这些基因建立风险标志以预测肝细胞癌患者的预后 | 开发了一种基于与二硫化物凋亡相关配体和受体基因的风险标志，用于有效预测肝细胞癌的预后，并可能指导免疫治疗策略 | NA | 探索肝细胞癌中与二硫化物凋亡相关的配体和受体基因的预后特征 | 肝细胞癌患者的预后预测 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | scRNA-seq | LASSO | 基因表达数据 | 来自GSE166635的scRNA-seq数据 |
| 2854 | 2024-08-07 |
Trackplot: A flexible toolkit for combinatorial analysis of genomic data
2023-09, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011477
PMID:37669275
|
研究论文 | 介绍Trackplot，一个用于生成高质量可视化基因组数据的Python包 | Trackplot提供了一个多功能平台，用于从多种来源（包括基因注释、isoform表达、scRNA-seq和长读序列识别的isoform结构、染色质可及性和结构）直观解释基因组数据，无需任何预处理，并提供广泛的输出文件格式灵活性 | NA | 开发一个灵活的工具包，用于组合分析基因组数据 | 基因组数据的可视化和分析 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, 长读序列 | NA | 基因组数据 | NA |
| 2855 | 2024-08-07 |
Single-cell Profiling Uncovers a Muc4-Expressing Metaplastic Gastric Cell Type Sustained by Helicobacter pylori-driven Inflammation
2023-09, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0142
PMID:37674528
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了由幽门螺杆菌驱动的炎症维持的表达MUC4的胃黏膜化生细胞类型 | 首次发现并描述了由幽门螺杆菌驱动的炎症维持的表达MUC4的胃黏膜化生细胞类型，并证实了其在人类胃癌组织中的存在 | 研究主要基于转基因小鼠模型，需要进一步的人体临床研究来验证这些发现 | 揭示幽门螺杆菌驱动的胃癌机制 | 胃黏膜化生细胞类型及其在胃癌中的作用 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 转基因小鼠模型及人类胃癌样本 |
| 2856 | 2024-08-07 |
RBP7 Regulated by EBF1 Affects Th2 Cells and the Oocyte Meiosis Pathway in Bone Metastases of Bladder Urothelial Carcinoma
2023-08-31, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2808189
PMID:37664915
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序数据分析，揭示了EBF1调控RBP7在膀胱尿路上皮癌骨转移中的潜在重要性，特别是通过Th2细胞和卵母细胞减数分裂途径 | 首次揭示了EBF1与RBP7之间的调控关系在膀胱尿路上皮癌骨转移中的作用，并通过多种技术手段进行了验证 | 研究主要基于TCGA数据库的数据，未来需要更多的临床样本验证 | 探讨EBF1调控RBP7在膀胱尿路上皮癌骨转移中的作用机制 | 膀胱尿路上皮癌的骨转移机制 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序, ATAC-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 31个差异表达的免疫基因 |
| 2857 | 2024-08-07 |
[Imputation method for dropout in single-cell transcriptome data]
2023-Aug-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi
DOI:10.7507/1001-5515.202301009
PMID:37666769
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review | 本文综述了单细胞转录组测序数据中技术零值的填补方法，并讨论了现有方法的优缺点 | NA | NA | 探讨单细胞转录组测序数据中技术零值的填补方法及其应用 | 单细胞转录组测序数据中的技术零值 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | NA |
| 2858 | 2024-08-07 |
Cell Fate Programming by Transcription Factors and Epigenetic Machinery in Stomatal Development
2023-Aug-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.23.554515
PMID:37662219
|
研究论文 | 本文探讨了转录因子与表观遗传机制在气孔发育中的细胞命运编程作用 | 通过scRNA-seq和ChIP-seq数据分析，揭示了气孔发育中转录调控的独特阶段，并提出了染色质重塑通过特定的物理相互作用因子介导的模型 | NA | 研究转录因子和表观遗传机器如何在气孔发育中协同调控转录和染色质重塑 | 气孔发育中的细胞命运编程 | NA | NA | scRNA-seq, ChIP-seq, MNase-seq | NA | 基因组数据 | 特定阶段的植物样本 |
| 2859 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals the Molecular Profile of Go-Opsin Photoreceptor Cells in Sea Urchin Larvae
2023-08-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12172134
PMID:37681865
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了海胆幼虫中Go-Opsin光感受器细胞的分子特征 | 研究了Go-Opsin光感受器细胞的发育及其古老的调控程序 | 没有提到具体的实验样本和数量限制 | 探讨海胆幼虫光感受器细胞的分子特征及发育机制 | 海胆幼虫中的Go-Opsin光感受器细胞 | NA | NA | 免疫组化和荧光原位杂交，单细胞转录组学 | NA | 分子数据 | NA |
| 2860 | 2024-08-05 |
Spatiotemporal molecular dynamics of the developing human thalamus
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.554174
PMID:37662287
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研究论文 | 这篇文章探讨了人类丘脑发育过程中的分子动态 | 揭示了人类丘脑发育中细胞命运特征和组织的分子轨迹 | 在人类丘脑发育过程中，某些分子结构尚未完全明确 | 旨在阐明人类丘脑发育的分子动态 | 研究对象为正在发育的人类丘脑神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞和多重空间转录组学 | NA | NA | NA |