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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell meta-analysis reveals disease-relevant vascular cell states and markers in human atherosclerosis
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113380
PMID:37950869
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研究论文 | 通过整合22个单细胞RNA测序库的元分析,构建了包含118,578个细胞的人类动脉粥样硬化综合图谱 | 首次通过大规模单细胞元分析揭示血管细胞状态与动脉粥样硬化的关联,并发现LTBP1和CRTAC1作为疾病进展标志物 | 基于已有数据集的元分析,可能受原始研究技术差异的限制 | 解析人类动脉粥样硬化中血管细胞状态与疾病关联机制 | 人类动脉粥样硬化组织中的血管和免疫细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, 全基因组关联研究, 空间成像分析 | 整合元分析 | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 空间成像数据 | 118,578个细胞来自22个scRNA-seq文库 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 262 | 2025-10-06 |
Spatial proteo-transcriptomic profiling reveals the molecular landscape of borderline ovarian tumors and their invasive progression
2023-Nov-13, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.11.13.23298409
PMID:38014221
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研究论文 | 本研究通过空间蛋白质组学和空间转录组学整合分析,揭示了卵巢交界性肿瘤向低级别浆液性癌侵袭进展的分子机制 | 首次整合空间蛋白质组学和空间转录组学技术,在分子水平上解析了卵巢交界性肿瘤向侵袭性癌转化的全过程 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 阐明卵巢交界性肿瘤向低级别浆液性癌侵袭进展的分子机制 | 卵巢交界性肿瘤(SBT)和低级别浆液性癌(LGSC)患者组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间蛋白质组学, 空间转录组学, 基因敲低, 药物抑制 | NA | 空间蛋白质组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 263 | 2025-10-06 |
Cell-intrinsic and -extrinsic effects of SARS-CoV-2 RNA on pathogenesis: single-cell meta-analysis
2023-10-24, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00375-23
PMID:37737611
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研究论文 | 通过单细胞RNA-seq数据的荟萃分析,研究SARS-CoV-2 RNA在细胞内外对COVID-19发病机制的影响 | 首次通过跨物种单细胞荟萃分析评估临床前模型模拟人类COVID-19的能力,并发现病毒RNA在多种非上皮细胞中的广泛传播 | 仅分析六个公开可用的单细胞RNA-seq数据集,样本量有限 | 评估SARS-CoV-2 RNA在细胞内外对COVID-19发病机制的影响 | 人类和五种动物模型(K18-hACE2小鼠、仓鼠、雪貂、猕猴等)的肺细胞 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA-seq, 双映射分析, 差异基因表达分析, 主成分分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 六个公开可用的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 264 | 2025-10-06 |
Multi-omic analysis of the cardiac cellulome defines a vascular contribution to cardiac diastolic dysfunction in obese female mice
2023-03-29, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-00983-6
PMID:36988733
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研究论文 | 通过多组学分析揭示平滑肌细胞盐皮质激素受体在肥胖雌性小鼠心脏舒张功能障碍中的关键作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统分析非心肌细胞群体,揭示血管平滑肌细胞MR信号在肥胖相关心脏功能障碍中的核心机制 | 研究仅限于雌性小鼠模型,未涉及雄性动物及人类临床样本验证 | 探究平滑肌细胞特异性MR缺失对肥胖相关冠状动脉和心脏舒张功能的影响 | 雌性小鼠(西方饮食诱导的肥胖模型) | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,基因表达谱分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 雌性小鼠(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 265 | 2025-10-06 |
A single-cell CRISPRi platform for characterizing candidate genes relevant to metabolic disorders in human adipocytes
2023-09-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00148.2023
PMID:37486064
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研究论文 | 开发了一种结合CRISPR干扰和单细胞RNA测序的平台,用于研究人类脂肪细胞中与代谢紊乱相关的候选基因 | 首次将CROP-Seq技术应用于脂肪生成和脂肪细胞生物学研究,能够同时评估多个候选基因的转录效应 | 研究基于SGBS细胞系,可能无法完全代表体内脂肪细胞的行为 | 识别与代谢疾病相关的脂肪生成、前脂肪细胞和脂肪细胞功能的新型调节因子 | 人类前脂肪细胞SGBS细胞系 | 单细胞基因组学 | 代谢紊乱 | CRISPR干扰, 单细胞RNA测序 | CROP-Seq | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 微流控单细胞捕获 |
| 266 | 2025-10-06 |
Neural stem cells persist to generate new neurons in the hippocampus of adult and aged human brain - Fiction or accurate?
2023-12, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2023.102133
PMID:38000512
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综述 | 回顾四十年来关于成人神经发生的研究进展,重点关注海马体神经发生在成年和老年人类大脑中的持续性问题 | 系统梳理了成人神经发生研究领域的关键里程碑、方法学进展和争议焦点 | 成人海马体神经发生的存在性和功能贡献仍需通过大规模单细胞测序等技术验证 | 探讨成人神经发生的证据、机制及其在神经系统疾病中的作用 | 人类海马体神经发生过程 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 267 | 2025-10-06 |
Identification and validation of key biomarkers and potential therapeutic targets for primary open-angle glaucoma
2023-12, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-022-2344-5
PMID:37610681
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研究论文 | 通过生物信息学分析识别原发性开角型青光眼的关键生物标志物和潜在治疗靶点 | 整合多个基因表达数据集,结合单细胞RNA测序技术筛选并验证POAG关键基因 | 需要进一步研究揭示这些基因表达变化的具体机制 | 识别POAG的新型生物标志物和潜在治疗靶点 | 原发性开角型青光眼相关基因表达数据 | 生物信息学 | 青光眼 | mRNA表达微阵列,单细胞RNA测序,功能富集分析,蛋白质相互作用网络分析,加权基因共表达网络分析,免疫荧光,实时定量PCR | NA | 基因表达数据 | 三个数据集(GSE27276,GSE138125,GSE148371) | NA | 单细胞RNA测序,微阵列 | NA | NA |
| 268 | 2025-10-06 |
Distinct mesenchymal cell states mediate prostate cancer progression
2023-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.29.534769
PMID:37034687
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析前列腺癌间质细胞状态及其在癌症进展中的作用 | 识别了8个转录和功能不同的基质细胞群体,建立了能预测前列腺癌转移进展的基因特征 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究前列腺癌进展中基质-上皮细胞相互作用的分子机制 | 基因工程小鼠模型和人类前列腺癌样本中的间质细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 4种基因工程小鼠模型及其野生型对照,以及具有相似基因型的人类肿瘤 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 269 | 2025-10-06 |
Adult skin fibroblast state change in murine wound healing
2023-01-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-27152-4
PMID:36650180
|
研究论文 | 通过分析小鼠皮肤伤口愈合的单细胞RNA测序数据,鉴定出一个在伤口愈合过程中显著增加的成纤维细胞亚群,并发现其与上皮间质转化和血管生成相关 | 首次在伤口愈合过程中识别出具有特定基因特征的成纤维细胞亚群,并通过药物数据库筛选出可能促进或延缓伤口愈合的候选药物 | 研究仅基于小鼠模型数据,尚未进行实验验证 | 探究皮肤伤口愈合过程中成纤维细胞的异质性变化 | 小鼠正常和受伤皮肤组织 | 单细胞转录组学 | 皮肤伤口愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个小鼠皮肤伤口愈合时间点的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 270 | 2025-10-06 |
Data-driven selection of analysis decisions in single-cell RNA-seq trajectory inference
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572214
PMID:38187768
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研究论文 | 开发了Escort框架用于评估单细胞RNA测序数据是否适合轨迹推断并量化分析决策对轨迹特性的影响 | 提出了首个通过数据驱动评估来指导单细胞轨迹分析决策的框架,减少了方法选择和参数优化的不确定性 | 未提及具体的性能验证数据集规模或与其他方法的详细比较结果 | 解决单细胞RNA测序轨迹推断中分析方法选择不确定性的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断方法 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 271 | 2025-10-06 |
Enrichment of a neutrophil-like monocyte transcriptional state in glioblastoma myeloid suppressor cells
2023-Dec-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3793353/v1
PMID:38234734
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了胶质母细胞瘤中髓源性抑制细胞的异质性,并发现了一种中性粒细胞样单核细胞转录状态的富集 | 首次在胶质母细胞瘤患者血液M-MDSC中发现中性粒细胞样单核细胞转录状态的富集,并开发了相应的基因表达和去卷积算法进行定量分析 | M-MDSC的个体发育和明确表型标记仍未知,研究样本来源有限 | 解析胶质母细胞瘤中髓源性抑制细胞的异质性和转录特征 | 胶质母细胞瘤、肺癌和头颈癌患者的髓源性抑制细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 胶质母细胞瘤、肺癌和头颈癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 272 | 2025-10-06 |
Chronic chromosome instability induced by Plk1 results in immune suppression in breast cancer
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113266
PMID:37979172
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研究论文 | 本研究通过过表达Plk1诱导染色体不稳定性,揭示了其在乳腺癌中通过激活SASP、上调PD-L1和CD206以及诱导NF-κβ信号通路促进免疫逃逸的机制 | 首次系统阐明Plk1诱导的慢性染色体不稳定性通过多通路协同作用导致乳腺癌免疫抑制的完整机制 | 研究主要基于Her2乳腺癌模型,在其他亚型中的普适性需进一步验证 | 探究染色体不稳定性相关分子特征如何改变肿瘤进化过程中的免疫识别 | Her2乳腺癌模型和人类乳腺癌肿瘤 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 前病变乳腺组织和人类乳腺癌肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 273 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals variations in monocytes and Tregs between gout flare and remission
2023-12-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171417
PMID:38063198
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示痛风发作期与缓解期单核细胞和调节性T细胞的差异 | 首次在单细胞水平系统揭示痛风发作期HLA-DQA1+非经典单核细胞上调及Tregs在缓解期的关键抑制作用 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究痛风发作与缓解期间免疫细胞变化机制 | 痛风患者的免疫细胞(单核细胞亚群和调节性T细胞) | 单细胞组学 | 痛风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含独立验证队列的患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 274 | 2025-10-06 |
The Novel Checkpoint Target Lymphocyte-Activation Gene 3 Is Highly Expressed in Cutaneous Squamous Cell Carcinoma
2023-12-01, Dermatologic surgery : official publication for American Society for Dermatologic Surgery [et al.]
IF:2.5Q1
DOI:10.1097/DSS.0000000000004006
PMID:37962130
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研究论文 | 本研究首次系统分析了淋巴细胞激活基因3(LAG-3)在皮肤鳞状细胞癌中的表达模式 | 首次发现LAG-3在cSCC浸润淋巴细胞中的表达高于PD-1,并量化了LAG-3 mRNA在不同类型cSCC中的差异表达 | 样本量较小(仅3个SCC肿瘤),需要更大规模研究验证 | 明确LAG-3在皮肤鳞状细胞癌中的表达模式,探索其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 皮肤鳞状细胞癌组织样本及正常皮肤组织 | 肿瘤免疫学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, NanoString技术 | NA | 基因表达数据, mRNA表达数据 | 3个SCC肿瘤样本及正常皮肤对照 | NanoString | 单细胞RNA-seq, 基因表达分析 | NanoString nCounter | NanoString nCounter基因表达分析系统 |
| 275 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing and bulk RNA data reveal the tumor microenvironment infiltration characteristics of disulfidptosis related genes in breast cancer
2023-Oct, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05109-y
PMID:37428249
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研究论文 | 本研究通过整合乳腺癌单细胞测序和bulk RNA数据,揭示了双硫死亡相关基因在肿瘤微环境中的浸润特征并构建了风险预测模型 | 首次将新发现的细胞死亡方式双硫死亡与乳腺癌免疫治疗响应相关联,并识别出TNFRSF14作为关键调控基因 | 研究基于生物信息学分析,需要进一步实验验证双硫死亡与免疫治疗协同作用的机制 | 探索双硫死亡相关基因在乳腺癌中的预后价值及其在免疫微环境中的作用 | 乳腺癌患者样本数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, bulk RNA测序, hdWGCNA, WGCNA, LASSO分析 | Cox比例风险模型, LASSO回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 276 | 2025-10-06 |
TPL2 kinase activity regulates microglial inflammatory responses and promotes neurodegeneration in tauopathy mice
2023-08-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.83451
PMID:37555828
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研究论文 | 本研究探讨TPL2激酶活性在小胶质细胞炎症反应中的作用及其在神经退行性疾病中的影响 | 首次揭示TPL2激酶活性通过调节小胶质细胞活化状态促进tau蛋白病变模型中的神经退行性过程 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究TPL2激酶在神经炎症和神经退行性疾病中的作用机制 | 小鼠小胶质细胞、神经元及tau蛋白病变模型 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 277 | 2025-10-06 |
Phylogenetic inference from single-cell RNA-seq data
2023-08-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-39995-6
PMID:37553438
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研究论文 | 开发了一种从单细胞RNA测序数据重建癌细胞系统发育关系并关联基因表达谱的方法 | 提出PhylinSic方法,首次实现从单细胞RNA测序数据同时推断系统发育关系并关联细胞表型 | NA | 重建癌症进化过程,理解肿瘤恶性特性的获得机制 | 乳腺癌肿瘤细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 278 | 2025-10-06 |
Core conserved transcriptional regulatory networks define the invasive trophoblast cell lineage
2023-08-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201826
PMID:37417811
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了大鼠和人类侵袭性滋养层细胞谱系中保守的转录调控网络 | 首次在大鼠妊娠期子宫-胎盘界面生成单核ATAC-seq数据并与单细胞RNA-seq数据整合分析,发现了侵袭性滋养层细胞中保守的基因调控网络 | 对大鼠和人类调控机制异同的理解仍有限,需要进一步验证 | 研究大鼠和人类侵袭性滋养层细胞调控机制的相似性和差异性 | 大鼠妊娠期子宫-胎盘界面组织 | 单细胞组学 | NA | 单核ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因组可及性数据, 转录组数据 | 妊娠期15.5天和19.5天的大鼠子宫-胎盘界面组织 | NA | 单核ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 279 | 2025-10-06 |
Distinct Inflammatory Milieu in Patients With Right Heart Failure
2023-08, Circulation. Heart failure
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研究论文 | 本研究通过分析右心衰竭患者的循环炎症标志物,揭示了其独特的炎症特征并发现CD163和CXCL12可作为预后生物标志物 | 首次系统揭示右心衰竭患者特有的循环炎症特征,发现可溶性CD163和CXCL12作为新型预后生物标志物,并证实这些因子可能来源于肝脏库普弗细胞 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证;机制研究尚不充分,需要进一步实验验证心脏-肝脏轴的具体作用机制 | 阐明右心衰竭患者的循环炎症环境特征及其与预后的关系 | 右心衰竭患者、心功能正常对照者、非典型心衰患者 | 心血管疾病研究 | 右心衰竭 | 多重蛋白检测、单细胞RNA测序、组织成像 | NA | 血液样本、基因表达数据、组织图像 | 三组患者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 多重蛋白检测, 组织成像 | NA | NA |
| 280 | 2025-10-06 |
Exploring Influenza A Virus-Induced Lung Injury and Immune Response Based on Humanized Lung-on-Chip
2023-08, Discovery medicine..
IF:2.0Q3
DOI:10.24976/Discov.Med.202335177.55
PMID:37553308
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研究论文 | 本研究通过构建人源化肺芯片模型模拟甲型流感病毒感染过程,分析外周血单核细胞的转录组特征 | 结合肺芯片模型与单细胞RNA测序技术,首次在体外真实模拟肺泡结构功能并系统研究流感病毒感染后的免疫反应机制 | 体外芯片模型可能无法完全模拟体内复杂生理环境,样本规模有限 | 系统分析甲型流感病毒感染后外周血单核细胞的转录组特征及免疫反应机制 | 肺泡上皮细胞、血管内皮细胞、肺泡巨噬细胞和外周血单核细胞(PBMCs) | 单细胞生物学 | 流感 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | 肺芯片模型 | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |