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当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-10-06 |
An optimized approach for multiplexing single-nuclear ATAC-seq using oligonucleotide-conjugated antibodies
2023-04-28, Epigenetics & chromatin
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s13072-023-00486-7
PMID:37118773
|
研究论文 | 开发了一种使用寡核苷酸偶联抗体的单核ATAC-seq多重分析方法 | 首次使用识别核孔复合体蛋白的寡核苷酸偶联抗体进行单核ATAC-seq多重分析 | 仅在2重和4重样本中验证了方法准确性 | 开发单核ATAC-seq样本多重分析技术 | 人和小鼠细胞样本的混合样本 | 单细胞测序技术 | NA | 单核ATAC-seq, 寡核苷酸偶联抗体技术 | NA | 基因组测序数据 | 2重样本9144个细胞核，4重样本12208个细胞核 | NA | 单核ATAC-seq, 批量ATAC-seq | NA | NA |
| 262 | 2025-10-06 |
Tobacco smoke exposure recruits inflammatory airspace monocytes that establish permissive lung niches for Mycobacterium tuberculosis
2023-12-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg3451
PMID:38055798
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了烟草烟雾暴露如何通过招募炎性单核细胞建立有利于结核分枝杆菌生长的肺部微环境 | 首次发现吸烟者肺部存在未成熟炎性单核细胞的富集，并鉴定CD93作为这些新招募单核细胞的标志物，阐明了CCR2信号通路在单核细胞招募中的作用机制 | 研究样本量有限，主要基于支气管肺泡灌洗细胞，未涵盖更广泛的肺部组织样本 | 探究吸烟如何促进肺部微环境对结核分枝杆菌生长的易感性 | 当前吸烟者和从不吸烟者的原发性支气管肺泡灌洗细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术, 功能分析 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 当前吸烟者和从不吸烟者的支气管肺泡灌洗细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 263 | 2025-10-06 |
CGCom: a framework for inferring Cell-cell Communication based on Graph Neural Network
2023-Nov-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.10.566642
PMID:38014057
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研究论文 | 提出基于图神经网络的细胞间通讯推断框架CGCom，利用空间转录组数据预测细胞间通讯 | 首次将图神经网络与空间转录组数据结合，利用细胞邻近信息和配体-受体信号下游分子调控信息来推断细胞间通讯 | 仅在小鼠胚胎seqFISH数据集上进行了验证，尚未在其他生物系统或技术平台上测试 | 开发能够准确推断细胞间通讯的计算方法 | 小鼠胚胎细胞 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学，单细胞转录组测序 | 图神经网络(GNN) | 空间转录组数据，单细胞基因表达数据 | 小鼠胚胎seqFISH数据集 | NA | 空间转录组学，seqFISH | seqFISH | NA |
| 264 | 2025-10-06 |
Senescent cell population with ZEB1 transcription factor as its main regulator promotes osteoarthritis in cartilage and meniscus
2023-03, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2022-223227
PMID:36564153
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类膝关节软骨和半月板组织，发现了一个以ZEB1转录因子为主要调控因子的衰老细胞群在骨关节炎中起关键作用 | 首次在软骨和半月板组织中鉴定出共享的致病性衰老细胞亚群，并确定FAP和ZEB1作为该细胞群的主要调控因子 | 样本量相对有限（健康组n=6-7，OA组n=6），功能验证实验需要进一步扩展 | 研究骨关节炎发病机制中软骨和半月板组织的细胞异质性 | 人类膝关节软骨和半月板组织 | 单细胞生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，基因过表达和敲除 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 软骨70,972个细胞，半月板78,017个细胞；来自健康（n=6-7）和OA（n=6）膝关节 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 265 | 2025-10-06 |
SINGLE CELL DISSECTION OF DEVELOPMENTAL ORIGINS AND TRANSCRIPTIONAL HETEROGENEITY IN B-CELL ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA
2023-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.04.569954
PMID:38106088
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析B细胞急性淋巴细胞白血病的发育起源和转录异质性 | 首次使用单细胞RNA测序系统分析B-ALL样本，并与正常B细胞发育参考图谱比较，揭示白血病细胞起源和瘤内异质性 | 样本数量相对有限（89个B-ALL样本），部分亚型样本可能代表性不足 | 解析B-ALL的发育起源和转录异质性，改进临床和基因组分类 | B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）患者样本 | 单细胞组学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 89个B-ALL样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 266 | 2025-10-06 |
Integration of whole transcriptome spatial profiling with protein markers
2023-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01536-3
PMID:36593397
|
研究论文 | 开发了一种名为SPOTS的高通量空间转录组和蛋白质组同步分析技术 | 首次实现了空间转录组和蛋白质组的实验性整合，显著提高了信号分辨率和细胞聚类能力 | NA | 开发能够同时分析空间转录组和蛋白质组的技术方法 | 组织区域中的基因表达和蛋白质分布 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序, 蛋白质组分析 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | SPOTS | Spatial PrOtein and Transcriptome Sequencing (SPOTS) 高通量同步空间转录组和蛋白质分析平台 |
| 267 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of human nasal mucosal IgE antibody secreting cells reveals a newly minted phenotype
2023-06, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2023.02.008
PMID:36931600
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类鼻黏膜IgE抗体分泌细胞，揭示其新近形成的表型特征 | 首次在过敏性真菌性鼻窦炎患者鼻息肉中发现IgE抗体分泌细胞具有早期新生浆细胞表型特征 | 样本量较小（n=3），仅针对鼻息肉组织进行研究 | 探究过敏性真菌性鼻窦炎患者鼻黏膜中IgE抗体分泌细胞的表型和功能特征 | 过敏性真菌性鼻窦炎患者的鼻息肉组织 | 单细胞组学 | 过敏性真菌性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序，Ig基因谱系分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例患者鼻息肉样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 268 | 2025-10-06 |
A single-cell transposable element atlas of human cell identity
2023-Dec-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.28.573568
PMID:38234829
|
研究论文 | 开发了用于单细胞转座子元件位点水平分析的工具Stellarscope，并构建了人类PBMC中转座子元件表达的图谱 | 开发了能够将多重比对reads重新分配到特定基因组位点的工具，首次在单细胞水平系统构建了人类转座子元件表达图谱 | NA | 研究转座子元件在人类细胞身份识别中的作用 | 人类外周血单个核细胞(PBMC) | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 269 | 2025-10-06 |
Multiomic analyses implicate a neurodevelopmental program in the pathogenesis of cerebral arachnoid cysts
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02238-2
PMID:36879130
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示神经发育程序在脑蛛网膜囊肿发病机制中的作用 | 首次采用系统水平的多组学方法整合三重外显子组测序、单细胞RNA测序和自然语言处理数据研究脑蛛网膜囊肿 | 研究结果为初步发现，需要在适当临床背景下进一步验证 | 阐明脑蛛网膜囊肿的发病机制 | 脑蛛网膜囊肿患者及其父母、人类大脑和小鼠脑膜组织 | 自然语言处理 | 脑蛛网膜囊肿 | 外显子组测序,单细胞RNA测序,自然语言处理 | 无监督聚类 | 基因组数据,转录组数据,医疗记录文本 | 617个患者-父母三重样本,152,898个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq,外显子组测序 | NA | NA |
| 270 | 2025-10-06 |
Probing regenerative heterogeneity of corticospinal neurons with scRNA-Seq
2023-Feb-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2588274/v1
PMID:36865182
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究皮质脊髓神经元在脊髓损伤后再生能力的异质性 | 首次使用基于贴片的scRNA-Seq对稀有再生神经元进行深度测序，发现抗氧化反应和线粒体生物合成在再生中的关键作用，并开发了再生分类器 | 仅对数百个表型鉴定的CST神经元进行测序，样本规模有限 | 探究皮质脊髓神经元再生能力的异质性机制 | 皮质脊髓神经元 | 单细胞基因组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，条件性基因敲除 | 监督分类方法(Garnett) | 单细胞转录组数据 | 数百个表型鉴定的CST神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于贴片的单细胞RNA测序 |
| 271 | 2025-10-06 |
HIV-1 activates oxidative phosphorylation in infected CD4 T cells in a human tonsil explant model
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1172938
PMID:37325659
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研究论文 | 本研究通过人类扁桃体离体模型探索HIV-1感染在淋巴组织中诱导的特定转录组变化 | 首次在人类扁桃体离体模型中揭示HIV-1感染的CD4+ T细胞氧化磷酸化基因上调及巨噬细胞的NLRP3炎症小体通路激活 | 研究基于离体模型，可能无法完全反映体内复杂环境；样本来源有限 | 探究HIV-1感染在淋巴组织不同细胞类型中诱导的转录组变化及其与慢性炎症的关系 | 健康人类供体的扁桃体组织中的CD4+ T细胞和巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | HIV感染/艾滋病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康人类供体的扁桃体组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 272 | 2025-10-06 |
Proteostasis governs differential temperature sensitivity across embryonic cell types
2023-11-09, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.10.013
PMID:37949057
|
研究论文 | 本研究通过全动物单细胞RNA测序揭示了不同胚胎细胞类型对温度敏感性的差异机制 | 首次使用全动物单细胞RNA测序技术系统分析温度胁迫下斑马鱼胚胎发育，发现脊索鞘细胞因蛋白质稳态失衡导致发育缺陷 | 研究仅针对斑马鱼胚胎，结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究胚胎发育过程中不同细胞类型对温度敏感性的分子基础 | 斑马鱼胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数百个斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 全动物单细胞RNA测序 |
| 273 | 2025-10-06 |
Bering: joint cell segmentation and annotation for spatial transcriptomics with transferred graph embeddings
2023-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.19.558548
PMID:37786667
|
研究论文 | 提出一种名为Bering的图深度学习模型，用于空间转录组数据的联合细胞分割和分子注释 | 利用转录共定位关系进行联合噪声感知细胞分割，通过转移图嵌入实现多模态输入，并构建预训练模型提高泛化能力 | 未明确说明模型在特定组织类型或技术平台上的性能限制 | 解决空间转录组学中细胞分割和注释的准确性问题 | 空间转录组数据中的单个细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序技术 | 图深度学习模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 274 | 2025-10-06 |
A spatially mapped gene expression signature for intestinal stem-like cells identifies high-risk precursors of gastric cancer
2023-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.20.558462
PMID:37786704
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研究论文 | 本研究通过多组学方法识别了胃肠化生中高风险前体病变的26基因表达特征 | 首次通过空间转录组学定位了高风险胃肠化生前体病变中异常肠干样细胞的基因表达特征 | 样本量相对有限，特别是空间验证队列仅包含5个样本 | 识别胃肠化生高风险前体病变的分子生物标志物以改善癌症预防 | 胃肠化生患者组织样本和胃癌样本 | 空间转录组学 | 胃癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, 单分子多重荧光原位杂交 | NA | 基因组数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 组织学图像 | 303个GIM样本, 198个TCGA样本, 40个scRNA-seq样本, 5个空间验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 275 | 2025-10-06 |
DISCERN: deep single-cell expression reconstruction for improved cell clustering and cell subtype and state detection
2023-09-20, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03049-x
PMID:37730638
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研究论文 | 提出DISCERN深度学习网络，通过参考数据集精确重建单细胞基因表达缺失数据 | 开发新型深度生成网络，能准确重建缺失的单细胞基因表达数据，显著改善细胞聚类和细胞亚型检测 | NA | 改进单细胞测序数据分析中的细胞聚类和细胞亚型识别 | 单细胞基因表达数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞测序 | 深度生成网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 276 | 2025-10-06 |
Vaccine adjuvant-elicited CD8+ T cell immunity is co-dependent on T-bet and FOXO1
2023-08-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112911
PMID:37516968
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研究论文 | 本研究揭示疫苗佐剂引发的CD8+ T细胞免疫需要T-bet和FOXO1转录因子的协同调控 | 发现疫苗佐剂诱导的T细胞应答需要T-bet和FOXO1的协同作用，与感染引发的应答机制不同 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究疫苗佐剂引发CD8+ T细胞免疫的转录调控机制 | 小鼠CD8+ T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 277 | 2025-10-06 |
Anaplastic transformation in thyroid cancer revealed by single-cell transcriptomics
2023-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169653
PMID:37053016
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示甲状腺癌向间变性癌转化的细胞谱系和命运转变过程 | 首次在单细胞水平解析甲状腺癌间变性转化的连续谱系，识别了二倍体和异倍体两个关键转化阶段 | 样本量有限，转化机制需要进一步功能验证 | 探究甲状腺癌向间变性癌转化的细胞分子机制 | 不同亚型甲状腺癌患者样本 | 单细胞组学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 278 | 2025-10-06 |
Exploring the optimization of autoencoder design for imputing single-cell RNA sequencing data
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.07.041
PMID:37671239
|
研究论文 | 通过实证研究探索自编码器设计对单细胞RNA测序数据插补性能的影响 | 首次系统研究自编码器架构和超参数选择对scRNA-seq数据插补性能的影响，发现与计算机视觉领域不同的最佳实践 | 研究结果基于实证分析，缺乏理论证明 | 优化自编码器设计以提高单细胞RNA测序数据插补性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 多个真实和模拟的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 279 | 2025-10-06 |
Complement C1q essential for aeroallergen sensitization via CSF1R+ conventional dendritic cells type 2
2023-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.07.016
PMID:37562753
|
研究论文 | 本研究揭示了补体C1q通过CSF1R+传统2型树突状细胞在气源性过敏原致敏中的关键作用 | 首次发现C1q特异性富集于肺CSF1R+cDC2s细胞，并证明C1q-LRP1轴在过敏原识别和哮喘发病中的核心机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 阐明CSF1R+cDC2s识别吸入过敏原的分子机制 | 小鼠肺树突状细胞和人类支气管肺泡灌洗样本 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序，基因敲除模型，过敏原激发试验 | NA | 基因表达数据，蛋白质检测数据 | 小鼠模型和人类BAL样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 280 | 2025-10-06 |
Bulk brain tissue cell-type deconvolution with bias correction for single-nuclei RNA sequencing data using DeTREM
2023-Sep-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05476-w
PMID:37726653
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研究论文 | 提出了一种名为DeTREM的改进方法，用于校正单核RNA测序数据在脑组织细胞类型反卷积分析中的偏差 | 在MuSiC方法基础上引入偏差校正机制，专门针对单核RNA测序与bulk RNA测序之间的技术差异进行补偿 | 主要针对脑组织数据，在其他组织类型中的适用性需要进一步验证 | 提高使用单核RNA测序参考数据时脑组织细胞类型反卷积的准确性 | 人类脑组织bulk RNA测序数据 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 单核RNA测序, bulk RNA测序 | DeTREM（基于MuSiC的改进算法） | 基因表达数据 | 模拟和真实人类脑组织数据集 | NA | single-nuclei RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |