单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5355 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-10-04 |
Single-Nucleus Transcriptome Profiling of Dorsolateral Prefrontal Cortex: Mechanistic Roles for Neuronal Gene Expression, Including the 17q21.31 Locus, in PTSD Stress Response
2023-10-01, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.20220478
PMID:37491937
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研究论文 | 本研究首次使用单核RNA测序技术分析了创伤后应激障碍（PTSD）和重度抑郁症（MDD）患者背外侧前额叶皮质（DLPFC）的基因表达，揭示了细胞类型特异性的转录组病理机制 | 首次使用单核RNA测序技术在PTSD和MDD患者死后脑组织中进行研究，揭示了细胞类型特异性的基因表达差异 | 样本量相对较小，且仅限于死后脑组织样本 | 探讨PTSD和MDD患者背外侧前额叶皮质的细胞类型特异性基因表达机制 | PTSD和MDD患者的背外侧前额叶皮质 | 数字病理学 | 精神疾病 | 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 32个DLPFC样本，包括11个PTSD患者、10个MDD患者和11个对照组，约415,000个细胞核 |
| 262 | 2024-10-04 |
Molecular insights using spatial transcriptomics of the distal lung in congenital diaphragmatic hernia
2023-10-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00154.2023
PMID:37605849
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研究论文 | 研究使用空间转录组学技术分析先天性膈疝（CDH）远端肺组织的转录组特征 | 首次在CDH患者中应用空间转录组学技术，识别不同肺细胞亚群在CDH病理生理中的作用，并强调性别特异性差异 | NA | 探讨先天性膈疝（CDH）远端肺组织与正常肺组织在转录组水平上的差异 | 先天性膈疝（CDH）和正常新生儿的远端肺组织 | 数字病理学 | 先天性疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 男性和女性CDH及正常新生儿的肺组织样本 |
| 263 | 2024-10-04 |
Identification of de novo Mutations in the Chinese Autism Spectrum Disorder Cohort via Whole-Exome Sequencing Unveils Brain Regions Implicated in Autism
2023-Oct, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-023-01037-6
PMID:36881370
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研究论文 | 通过全外显子测序在中国自闭症谱系障碍队列中识别新生突变，揭示与自闭症相关的大脑区域 | 结合全基因组筛查、单细胞测序和脑成像数据的综合分析，揭示了与自闭症病因相关的大脑区域 | 东亚自闭症队列在全基因组遗传研究中仍代表性不足 | 识别中国自闭症谱系障碍队列中的新生突变，并研究其与大脑区域的关系 | 369个中国自闭症三联体（包括患者及其未受影响的父母） | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 全外显子测序 | NA | 基因组数据、单细胞测序数据、脑成像数据 | 369个自闭症三联体 |
| 264 | 2024-10-04 |
Transcriptomic Profiling Identifies Ferroptosis-Related Gene Signatures in Ischemic Muscle Satellite Cells Affected by Peripheral Artery Disease-Brief Report
2023-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319518
PMID:37675635
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研究论文 | 研究通过转录组分析识别出外周动脉疾病影响下的缺血肌肉卫星细胞中与铁死亡相关的基因特征 | 首次发现铁死亡相关基因在外周动脉疾病影响的人类骨骼肌中差异表达 | 样本量较小，仅基于8个捐赠者的样本 | 探讨外周动脉疾病对肌肉卫星细胞转录组的影响，识别与肌肉病变相关的损伤途径 | 外周动脉疾病患者的肌肉卫星细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8个捐赠者的25000多个细胞 |
| 265 | 2024-10-04 |
Transforming Growth Factor-β Blockade in Pancreatic Cancer Enhances Sensitivity to Combination Chemotherapy
2023-10, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.05.038
PMID:37263309
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研究论文 | 研究探讨了在胰腺癌中阻断TGFβ与化疗联合使用的效果 | 首次证明了TGFβ阻断在胰腺癌模型中增强化疗敏感性的作用，并提供了在临床环境中评估NIS793与FOLFIRINOX或吉西他滨/纳米颗粒（白蛋白结合）紫杉醇联合化疗的理论基础 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 研究TGFβ阻断在胰腺癌中与化疗联合使用的效果 | 胰腺癌细胞及其微环境 | 癌症研究 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序和免疫荧光 | NA | RNA序列和免疫荧光图像 | 使用了正位胰腺癌模型中的小鼠样本 |
| 266 | 2024-10-04 |
Divergent Actions of Renal Tubular and Endothelial Type 1 IL-1 Receptor Signaling in Toxin-Induced AKI
2023-10-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000191
PMID:37545036
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研究论文 | 研究IL-1受体1在肾小管和内皮细胞中的不同信号传导对毒素诱导的急性肾损伤的影响 | 发现IL-1R1在肾小管和内皮细胞中的激活对急性肾损伤有相反的影响，肾小管中的激活加剧损伤，而内皮细胞中的激活减轻损伤 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类中验证结果 | 探讨IL-1R1在不同肾脏细胞类型中的信号传导对急性肾损伤的影响 | IL-1R1在肾小管和内皮细胞中的信号传导 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的肾脏组织样本 |
| 267 | 2024-10-04 |
Single-cell analysis of dorsal root ganglia reveals metalloproteinase signaling in satellite glial cells and pain
2023-10, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.08.005
PMID:37557960
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术分析背根神经节中的卫星胶质细胞，揭示了金属蛋白酶信号在疼痛中的作用 | 首次揭示了卫星胶质细胞中金属蛋白酶信号通路在处理躯体感觉刺激中的作用，并发现了一种潜在的疼痛治疗方法 | 研究主要集中在体外实验和细胞水平，尚未在动物模型或人体中验证 | 探讨卫星胶质细胞在疼痛中的作用及其分子机制 | 背根神经节中的卫星胶质细胞和感觉神经元 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 多个卫星胶质细胞样本 |
| 268 | 2024-10-04 |
Tumor-associated macrophages trigger MAIT cell dysfunction at the HCC invasive margin
2023-08-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.07.026
PMID:37595566
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、流式细胞术和CODEX成像技术，研究了肝细胞癌（HCC）中黏膜相关不变T细胞（MAIT细胞）的功能障碍及其与肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的相互作用 | 首次揭示了肿瘤相关巨噬细胞通过CSF1RPD-L1信号通路诱导MAIT细胞功能障碍，并提出了通过aPD-1/aPD-L1疗法靶向治疗HCC患者中MAIT细胞的可能性 | NA | 探讨MAIT细胞在肝细胞癌中的功能及其与肿瘤微环境的关系 | 肝细胞癌（HCC）患者样本中的MAIT细胞及其与肿瘤相关巨噬细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、CODEX成像 | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、图像数据 | 配对的HCC患者样本及小鼠模型 |
| 269 | 2024-10-04 |
A spatially resolved single-cell genomic atlas of the adult human breast
2023-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06252-9
PMID:37380767
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研究论文 | 构建了成人人类乳腺的单细胞和空间分辨率的全面细胞图谱 | 首次构建了成人人类乳腺的单细胞和空间分辨率的全面细胞图谱，揭示了丰富的血管周围、内皮和免疫细胞群以及高度多样的腔上皮细胞状态 | NA | 研究成人正常乳腺组织的细胞组成和空间分布，为乳腺生物学和疾病研究提供参考 | 成人人类乳腺的单细胞和空间分辨率细胞图谱 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 714,331个细胞来自126名女性，117,346个细胞核来自20名女性 |
| 270 | 2024-10-04 |
Transcriptional programming of CD4+ TRM differentiation in viral infection balances effector- and memory-associated gene expression
2023-05-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq7486
PMID:37172104
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研究论文 | 研究了在病毒感染后，CD4+ T细胞在小肠中的表型、功能和转录特征，揭示了其与循环T1细胞的共同基因表达程序和染色质可及性特征 | 首次揭示了CD4+ T细胞在病毒感染后形成的早期T细胞与T1效应细胞之间的发育关系，并比较了CD4+ T细胞与CD8+ T细胞的差异 | NA | 探讨CD4+ T细胞在病毒感染后的分化和转录调控机制 | CD4+ T细胞在小肠中的表型、功能和转录特征 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 271 | 2024-10-04 |
A human liver organoid screening platform for DILI risk prediction
2023-05, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.01.019
PMID:36738840
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研究论文 | 本研究评估了人肝类器官（HLOs）在药物性肝损伤（DILI）风险预测中的应用，并将其应用于高吞吐量筛选和芯片系统 | 开发了基于人肝类器官的高吞吐量筛选平台和芯片系统，用于预测药物性肝损伤风险，并展示了其在临床前药物筛选中的潜力 | NA | 开发和评估用于药物性肝损伤风险预测的新型体外模型 | 人肝类器官（HLOs）及其在药物性肝损伤风险预测中的应用 | 数字病理学 | 药物性肝损伤 | 单细胞转录组学 | NA | 生物化学数据 | 三个独立的诱导多能干细胞（iPSC）系 |
| 272 | 2024-10-04 |
An optimized approach for multiplexing single-nuclear ATAC-seq using oligonucleotide-conjugated antibodies
2023-04-28, Epigenetics & chromatin
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s13072-023-00486-7
PMID:37118773
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研究论文 | 本文介绍了一种使用寡核苷酸偶联抗体进行单核ATAC-seq多重分析的优化方法 | 开发了一种简单的核哈希方法NuHash，使用寡核苷酸偶联抗体识别核孔复合体蛋白，用于snATAC-seq文库制备的多重分析 | NA | 研究单细胞分辨率下转录和染色质结构的分析技术 | 人类和鼠类细胞样本的snATAC-seq分析 | 基因组学 | NA | 单核ATAC-seq (snATAC-seq) | NA | 基因组数据 | 9144个核（2-plex）和12,208个核（4-plex） |
| 273 | 2024-10-02 |
A telencephalon cell type atlas for goldfish reveals diversity in the evolution of spatial structure and cell types
2023-11-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh7693
PMID:37910612
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统比较了金鱼端脑的细胞类型，揭示了其分子神经解剖学的分区 | 首次构建了金鱼端脑的细胞类型图谱，发现了神经元基因表达的多样性和模块化特征，并提出了金鱼端脑中存在海马结构的可能性 | NA | 研究金鱼端脑的细胞类型多样性及其在进化中的空间结构变化 | 金鱼端脑的细胞类型及其分子特征 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 金鱼端脑的多个细胞样本 |
| 274 | 2024-10-02 |
Spatially Resolved Transcriptomics Technology Facilitates Cancer Research
2023-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202302558
PMID:37632718
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在癌症研究中的应用及其在揭示基因表达和细胞功能空间位置方面的主要成就 | 空间转录组学技术（SRT）能够探索特定细胞与其空间背景之间的关系，弥补了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在空间信息上的不足 | NA | 旨在通过深入理解肿瘤细胞与周围非恶性细胞的相互作用，开发更有效的临床治疗策略 | 肿瘤细胞及其周围非恶性细胞的空间位置与功能 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序（NGS） | NA | 转录组数据 | NA |
| 275 | 2024-10-02 |
Lepr-Expressing PDLSCs Contribute to Periodontal Homeostasis and Respond to Mechanical Force by Piezo1
2023-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303291
PMID:37553778
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研究论文 | 研究揭示了Lepr+ PDLSCs在牙周稳态中的作用及其对机械力的响应机制 | 首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术鉴定出Lepr+ PDLSCs，并发现Piezo1介导了Lepr+ PDLSCs的机械感应 | NA | 探讨Lepr+ PDLSCs在牙周稳态中的作用及其对机械力的响应机制 | Lepr+ PDLSCs及其在牙周组织修复和稳态维持中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 276 | 2024-10-02 |
Simultaneous estimation of gene regulatory network structure and RNA kinetics from single cell gene expression
2023-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.21.558277
PMID:37790443
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研究论文 | 开发了一种深度学习模型，通过单细胞RNA测序数据同时推断基因调控网络结构和RNA动力学参数 | 首次将深度学习模型应用于同时推断基因调控网络结构和RNA动力学参数，并展示了其在预测基因表达状态和模拟转录因子变化效果方面的优越性 | NA | 构建一个完整的、预测性的生物物理模型，用于基因表达调控 | 基因调控网络结构和RNA动力学参数 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 基因表达数据 | 175,000个单细胞 |
| 277 | 2024-10-02 |
Single-Nucleus RNA-Seq: Open the Era of Great Navigation for FFPE Tissue
2023-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813744
PMID:37762049
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综述 | 本文综述了单核RNA测序（snRNA-seq）在福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织中的应用及其技术进展 | snRNA-seq技术减少了离子化转录偏差，适用于更丰富的样本，为深入探索FFPE组织提供了新机会 | 本文总结了snRNA-seq在FFPE样本中的局限性和潜在技术发展 | 探讨单核RNA测序技术在福尔马林固定石蜡包埋组织中的应用 | 单核RNA测序技术及其在FFPE组织中的应用 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 278 | 2024-10-02 |
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq analysis of myogenic differentiation in pig
2023-02-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01519-z
PMID:36726129
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和ATAC测序分析了猪骨骼肌分化的分子和细胞动态 | 首次在猪胚胎发育过程中对骨骼肌分化进行了单细胞分辨率的基因表达和染色质可及性分析 | 研究仅限于猪胚胎发育阶段，未涵盖成年猪或人类 | 深入理解猪胚胎骨骼肌分化的分子和细胞动态 | 猪胚胎的骨骼肌分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | 猪胚胎的骨骼肌细胞 |
| 279 | 2024-10-02 |
A Zinc- and Calcium-Rich Lysosomal Nanoreactor Rescues Monocyte/Macrophage Dysfunction under Sepsis
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205097
PMID:36596693
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研究论文 | 本文研究了一种富含锌和钙的溶酶体纳米反应器在脓毒症中恢复单核细胞/巨噬细胞功能的作用 | 开发了一种名为Alpha-MOFs的纳米颗粒，通过释放溶酶体敏感的离子来提升单核细胞/巨噬细胞的吞噬能力 | NA | 研究脓毒症中单核细胞/巨噬细胞功能失调的机制，并开发新的治疗方法 | 脓毒症中的单核细胞/巨噬细胞及其吞噬功能 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 外周血单核细胞 |
| 280 | 2024-10-01 |
Revealing the impact of CD70 expression on the manufacture and functions of CAR-70 T-cells based on single-cell transcriptomics
2023-Oct, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03475-7
PMID:37382633
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研究论文 | 研究基于单细胞转录组学揭示CD70表达对CAR-70 T细胞制造和功能的影响 | 首次探讨了在CAR T细胞制造过程中敲除CD70对T细胞扩增、存活和抗肿瘤效果的影响 | 研究仅限于实验室环境，尚未在临床上验证其效果 | 探讨CD70表达对CAR-70 T细胞制造和功能的影响，为CAR T细胞治疗T细胞癌症提供指导 | CD70敲除和野生型CAR-70 T细胞的制造和抗肿瘤能力 | 细胞治疗 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 基因表达数据 | CD70敲除和野生型CAR-70 T细胞 |