单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 2721 - 2740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2721 | 2024-08-07 |
Continual learning approaches for single cell RNA sequencing data
2023-09-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-42482-7
PMID:37714869
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研究论文 | 本文提出了一种持续学习方法，用于处理单细胞RNA测序数据中的硬件瓶颈问题 | 使用XGBoost和Catboost算法在持续学习框架下，相较于最佳的静态分类器，实现了高达10%的中位F1分数提升 | 算法在不同数据集间的数据特征变化下可能遭遇灾难性遗忘问题 | 解决处理大规模单细胞RNA测序数据时的硬件限制问题 | 单细胞RNA测序数据及其细胞类型分类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | XGBoost, Catboost | 测序数据 | 大规模数据集 |
| 2722 | 2024-08-07 |
Comparative analysis of single-cell transcriptome reveals heterogeneity in the tumor microenvironment of lung adenocarcinoma and brain metastases
2023-Sep-15, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00784-2
PMID:37715019
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了肺腺癌和脑转移瘤的肿瘤微环境异质性 | 首次在单细胞水平上揭示了肺腺癌和脑转移瘤的肿瘤微环境特征，并发现了一些新的潜在治疗靶点 | NA | 深入理解肺腺癌和脑转移瘤的肿瘤微环境特征，为脑转移瘤的治疗提供新的策略 | 肺腺癌和脑转移瘤的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 15个肺腺癌样本和10个脑转移瘤样本，共86,282个单细胞 |
| 2723 | 2024-08-07 |
Sex differences in renal cell carcinoma: a single-cell analysis reveals exhausted CD8+ T-cells highly infiltrated in males
2023-09-15, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-023-00540-9
PMID:37715192
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光技术，探讨了肾细胞癌（RCC）患者肿瘤微环境（TME）中的性别差异，并探索了增强免疫治疗效果的潜在联合药物方案 | 首次揭示了雄激素-雄激素受体轴在男性RCC中对CD8+ T细胞功能障碍和耗竭的作用，并提出雄激素受体抑制剂与免疫治疗的联合使用可能是一种有前景的治疗策略 | NA | 研究肾细胞癌患者肿瘤微环境中的性别差异及其潜在机制，并探索增强免疫治疗效果的新策略 | 肾细胞癌患者的肿瘤微环境及CD8+ T细胞的状态 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重免疫荧光（MxIF）、流式细胞术（FCM） | NA | 细胞 | 220,156个细胞 |
| 2724 | 2024-08-07 |
Polygenic regression uncovers trait-relevant cellular contexts through pathway activation transformation of single-cell RNA sequencing data
2023-Sep-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100383
PMID:37719150
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研究论文 | 本文开发了一种名为scPagwas的计算方法，通过整合单细胞RNA测序数据的路径激活转换和GWAS汇总统计数据，揭示与特征相关的细胞环境 | scPagwas方法有效地优先考虑与特征相关的基因，有助于高精度地识别与特征相关的细胞类型/群体 | NA | 旨在通过路径激活转换的单细胞RNA测序数据和GWAS汇总统计数据，发现与特征相关的细胞类型，并增强对疾病变异的机制理解 | 与特征相关的细胞环境和疾病相关的遗传变异 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及广泛的模拟和真实数据集 |
| 2725 | 2024-08-07 |
Germ cells do not progress through spermatogenesis in the infertile zebrafish testis
2023-Sep-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.05.556432
PMID:37732254
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，生成了斑马鱼睾丸的发育图谱，并描述了在生育期和生育后睾丸中的细胞特征变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了斑马鱼睾丸在生育能力下降过程中的细胞和分子变化 | NA | 探究斑马鱼睾丸在生育能力下降过程中的分子和细胞机制 | 斑马鱼睾丸中的生殖细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 使用了5个时间点的斑马鱼样本 |
| 2726 | 2024-08-07 |
A new immunological index for the elderly: high proportion of multiple TCR T cells based on scRNA-seq
2023-Sep-04, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0509-01
PMID:37733445
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2727 | 2024-08-07 |
Correction to: Clustering spatial transcriptomics data
2023-Sep-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad574
PMID:37738522
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2728 | 2024-08-07 |
A bioinformatics analysis of potential cellular communication networks in non-alcoholic steatohepatitis and colorectal adenoma using scRNA-seq and bulk-seq
2023-Aug-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-23-502
PMID:37720432
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞数据和在线数据库中的高通量测序数据，筛选了非酒精性脂肪肝炎（NASH）和结直肠腺瘤（CRA）之间的差异表达基因和核心效应通路，以探索NASH/NAFLD-CRA的潜在机制 | 本研究利用scRNA-seq和bulk-seq技术，通过细胞注释和细胞通信分析，筛选了NASH-CRA共病的核心效应通路和特定信号通路，揭示了WNT通路在NASH-CRA细胞信号通信中的关键作用 | 本研究可能遗漏一些生物学上重要的基因表达程序 | 寻找NASH-CRA的潜在生物标志物、治疗靶点和相关效应通路 | 非酒精性脂肪肝炎（NASH）和结直肠腺瘤（CRA） | 生物信息学 | 非酒精性脂肪肝病 | scRNA-seq, bulk-seq | NA | 单细胞数据, 高通量测序数据 | CRA患者单细胞数据和GSE37364、GSE89632数据库中的高通量测序数据 |
| 2729 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Changes in Cell Subsets in the Cortical Microenvironment during Acute Phase of Ischemic Stroke Rats
2023-Aug-22, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/j.jin2205128
PMID:37735120
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了急性缺血性中风大鼠皮层微环境中细胞亚群的变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了缺血再灌注损伤（CIRI）中不同细胞亚群的生物功能和信号通路 | 仅限于大鼠模型，可能无法完全反映人类中风的复杂生物机制 | 研究缺血性中风中CIRI的机制，以找到更好的预防和治疗方法 | 缺血性中风大鼠模型及其脑皮层细胞亚群 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大鼠的21个脑细胞群集以及6个显著差异的细胞亚群 |
| 2730 | 2024-08-05 |
Temporal dynamics of microglia-astrocyte interaction in neuroprotective glial scar formation after intracerebral hemorrhage
2023-Aug, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.02.007
PMID:37719195
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研究论文 | 本研究探讨了微胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用如何影响胶质瘢痕形成及其具体功能。 | 研究首次揭示了微胶质细胞缺失如何在不同阶段影响胶质瘢痕的形成及其修复功能的时间动态。 | 研究主要关注于药理学方法引导的微胶质细胞消耗，可能影响对其自然变化的理解。 | 旨在探讨胶质瘢痕在脑出血后的作用及其形成机制。 | 研究对象为脑出血后微胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用及胶质瘢痕。 | 数字病理学 | 脑出血 | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 2731 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatial heterogeneity landscapes of mature epicardial cells
2023-Aug, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.07.011
PMID:37719196
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研究论文 | 该文章研究了成熟心外膜细胞的单细胞和空间异质性景观 | 识别了特定于产后心外膜组织的几种基因标记，并揭示了心外膜细胞在发育过程中的转录特征 | 研究中未明确指出样本数量和具体的基因标记 | 阐明成熟心外膜细胞的基因标记和发育过程 | 小鼠心脏中的心外膜细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析和空间转录组学 | NA | RNA | 9.5天胚胎至9天后出生的小鼠心脏细胞 |
| 2732 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveals asymmetric cellular responses to injury in the regenerating spiny mouse (Acomys) ear
2023-08, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277538.122
PMID:37726147
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研究论文 | 该论文探讨了刺鼠耳部再生过程中不对称的细胞反应 | 首次利用空间转录组学揭示了刺鼠耳部再生中的不对称基因表达模式 | 未详细研究其他哺乳动物在再生过程中的机理 | 理解刺鼠耳部再生的分子和细胞事件 | 刺鼠耳部的再生过程 | 数字病理 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2733 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis uncovers underlying mechanisms of acute liver injury induced by tripterygium glycosides tablet in mice
2023-Aug, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.03.004
PMID:37719192
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示雷公藤多苷片诱导的小鼠急性肝损伤的细胞和分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了雷公藤多苷片诱导的急性肝损伤中的细胞亚型和分子变化 | NA | 阐明雷公藤多苷片诱导的急性肝损伤的细胞和分子事件 | 雷公藤多苷片诱导的小鼠急性肝损伤模型 | 数字病理学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括多种肝脏细胞亚型，如内皮细胞、肝细胞、胆管细胞和肝星状细胞等 |
| 2734 | 2024-08-07 |
A single-cell landscape of triptolide-associated testicular toxicity in mice
2023-Aug, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.04.006
PMID:37719193
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研究论文 | 研究了雷公藤内酯引起的雄性小鼠睾丸毒性的单细胞转录组图谱 | 首次在单细胞分辨率下全面剖析了雷公藤内酯相关的睾丸毒性，并构建了单细胞转录组图谱 | NA | 探讨雷公藤内酯引起的睾丸损伤机制及其治疗靶点 | 雷公藤内酯对小鼠睾丸细胞的影响 | 数字病理学 | 生殖毒性 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 59,127个细胞 |
| 2735 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the dynamics of hepatic non-parenchymal cells in autoprotection against acetaminophen-induced hepatotoxicity
2023-Aug, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.05.004
PMID:37719199
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了在对抗对乙酰氨基酚诱导的肝毒性中，肝非实质细胞（NPCs）的动态变化及其功能 | 首次详细描述了在对抗药物诱导的肝损伤中，肝非实质细胞的动态变化及其在自动保护机制中的作用 | NA | 深入理解药物诱导肝损伤的自动保护机制，为预防和治疗提供新策略 | 肝非实质细胞（NPCs）在自动保护机制中的动态变化及其功能 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用对乙酰氨基酚（APAP）作为模型药物，在小鼠中进行预处理和二次挑战 |
| 2736 | 2024-08-05 |
Prediction of distinct populations of innate lymphoid cells by transcriptional profiles
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1227452
PMID:37719706
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析结合机器学习技术来识别先天淋巴细胞。 | 提出了一种新的方法，通过深度神经网络准确分类淋巴细胞，并确定了在淋巴细胞发育中起重要作用的四个基因。 | 研究仅聚焦于外围血液中的ILCs，未能涵盖其他组织中的ILCs。 | 研究先天淋巴细胞的识别及其发育功能。 | 647名患者的单细胞RNA-seq数据。 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 深度神经网络 | 转录组数据 | 647名患者，共26087个转录本 |
| 2737 | 2024-08-05 |
Progress in research on tumor microenvironment-based spatial omics technologies
2023, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.029494
PMID:37744276
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研究论文 | 本文总结了空间转录组学和空间蛋白组学技术在表征肿瘤免疫微环境中的研究进展 | 本研究创新性地将空间组学应用于肿瘤微环境研究，揭示传统研究技术无法解决的问题 | 本文未提及具体的实验数据或样本分析，限制了结论的普遍适用性 | 旨在探讨空间组学在肿瘤微环境研究中的应用 | 研究对象为肿瘤微环境及其相关的免疫细胞和分子信息 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间组学技术 | NA | 分子信息 | NA |
| 2738 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics of Aging Rat Ovaries Reveals Unexplored Cell Subpopulations with Reduced Antioxidative Defense
2023, Gerontology
IF:3.1Q3
DOI:10.1159/000533922
PMID:37717573
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研究论文 | 该研究首次描述了与卵巢衰老相关的空间转录组变化，并识别了潜在的预防目标 | 利用空间转录组学技术探索了老化大鼠卵巢中未被探索的细胞亚群及其抗氧化防御减少的特征 | 研究局限于大鼠模型，结果是否适用于人类尚不明确 | 更好地理解卵巢衰老过程中的遗传调控，以便改善与卵巢衰老相关的疾病治疗和生育保护选择 | 老鼠卵巢的空间转录组特征 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 年轻和老化大鼠的卵巢样本 |
| 2739 | 2024-08-05 |
Discovery of neutralizing SARS-CoV-2 antibodies enriched in a unique antigen specific B cell cluster
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0291131
PMID:37729215
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研究论文 | 本文研究了从SARS-CoV-2恢复患者中分离的中和抗体，通过单细胞测序识别出特定B细胞簇 | 发现了一类富含SARS-CoV-2中和抗体的激活B细胞簇，并鉴定出两种有效的中和抗体 | 研究样本量较小，仅涉及15名参与者 | 探索新的SARS-CoV-2治疗抗体以应对病毒变异带来的抵抗问题 | 从15名SARS-CoV-2恢复患者收集的样本中分离的B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 抗体 | 15名SARS-CoV-2恢复参与者 |
| 2740 | 2024-08-05 |
A 12-gene panel in estimating hormone-treatment responses of castration-resistant prostate cancer patients generated using a combined analysis of bulk and single-cell sequencing data
2023, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2023.2260387
PMID:37729607
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研究论文 | 本研究开发了一个12基因面板，用于估计去势抗性前列腺癌患者的激素治疗反应 | 提出了基于CRPC特有的肿瘤微环境特征构建的基因面板，为激素治疗反应预测提供了新工具 | 对CRPC特有的肿瘤微环境特征的了解仍然有限 | 研究去势抗性前列腺癌的激素治疗反应预测 | 去势抗性前列腺癌样本及相关基因表达特征 | 数字病理学 | 前列腺癌 | bulk-sequencing和单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 共分析了16个正常前列腺样本、13个前列腺癌样本、11个前列腺癌样本和6个去势抗性前列腺癌样本 |