单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 2661 - 2680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2661 | 2024-08-07 |
Establishment of a Seven-Gene Signature Associated with CD8+ T Cells through the Utilization of Both Single-Cell and Bulk RNA-Sequencing Techniques in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2023-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813729
PMID:37762031
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序技术，在透明细胞肾细胞癌中建立了一个与CD8+ T细胞相关的七基因标志物 | 首次通过结合单细胞和批量RNA测序数据，识别并验证了与CD8+ T细胞相关的基因标志物，用于透明细胞肾细胞癌的预后评估和免疫治疗反应预测 | 研究样本仅来自TCGA和IMvigor210队列，可能需要更多样本来验证基因标志物的普遍性 | 确定与CD8+ T细胞相关的分子标志物，用于透明细胞肾细胞癌的诊断和治疗 | 透明细胞肾细胞癌患者及其肿瘤免疫微环境中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | LASSO-Cox分析 | RNA测序数据 | 来自TCGA的透明细胞肾细胞癌患者被随机分配到测试组和训练组，IMvigor210队列用于评估标志物的有效性 |
| 2662 | 2024-08-07 |
ScRNA-seq revealed disruption in CD8+ NKG2A+ natural killer T cells in patients after liver transplantation and immunosuppressive therapy
2023-Sep, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.990
PMID:37773707
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析了肝移植患者在接受免疫抑制治疗后的免疫细胞组成和基因表达变化 | 首次揭示了肝移植后CD8+ NKG2A+自然杀伤T细胞的动态变化及其在免疫耐受中的重要作用 | NA | 阐明肝移植后免疫耐受的机制 | 肝移植患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肝移植 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了17,462个外周血单个核细胞，来自一个正常个体和四个接受肝移植及免疫抑制治疗的患者 |
| 2663 | 2024-08-07 |
Preparation of a Single-Cell Suspension from Tumor Biopsy Samples for Single-Cell RNA Sequencing
2023-Aug, Bulletin of experimental biology and medicine
IF:0.9Q4
DOI:10.1007/s10517-023-05898-9
PMID:37770788
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研究论文 | 本文研究了从肿瘤活检样本中制备高质量单细胞悬液的方法，以用于单细胞RNA测序 | 本文开发并优化了机械分离与胶原酶/透明质酸酶混合物孵育相结合的方法，以提高细胞悬液的存活率 | NA | 优化从肿瘤活检组织中制备单细胞悬液的方法，以用于单细胞RNA测序 | 肿瘤活检样本的单细胞悬液制备方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞悬液 | 至少80%存活率的细胞悬液 |
| 2664 | 2024-08-05 |
Omics of an Enigmatic Marine Amoeba Uncovers Unprecedented Gene Trafficking from Giant Viruses and Provides Insights into Its Complex Life Cycle
2023-Jun, Microbiology research
IF:2.1Q3
DOI:10.3390/microbiolres14020047
PMID:37752971
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研究论文 | 本研究探索了一种复杂生活周期的海洋变形虫的基因组多样性 | 揭示了海洋变形虫与巨型病毒之间前所未有的基因转移，以及其复杂生活周期的多样性 | 未详细说明具体的实验方法和样本数量 | 探讨海洋变形虫的基因组多样性和异常行为 | 研究一种多核的海洋变形虫 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 2665 | 2024-08-05 |
Detection of lineage-reprogramming efficiency of tumor cells in a 3D-printed liver-on-a-chip model
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.86921
PMID:37771785
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研究论文 | 该研究探讨了在3D打印的肝脏芯片模型中肿瘤细胞的谱系重编程效率 | 通过简化重编程试剂的制备，使用两种慢病毒载体表达六个转录因子，实现了将MDA-MB-231肿瘤细胞重编程为人源诱导肝细胞样细胞（hiHeps） | 虽然已观察到肝特异性基因的激活，但重编程的所有机制和最佳策略尚未完全确定 | 研究谱系重编程在治疗三阴性乳腺癌肝转移中的应用 | MDA-MB-231肿瘤细胞及其重编程后的肝细胞样细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 慢病毒载体 | 3D打印肝脏芯片模型 | 单细胞测序 | 使用了MDA-MB-231细胞进行研究 |
| 2666 | 2024-08-05 |
Regulatory T cells are associated with the tumor immune microenvironment and immunotherapy response in triple-negative breast cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1263537
PMID:37767092
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研究论文 | 这篇文章探讨了调节性T细胞与三阴性乳腺癌肿瘤免疫微环境及免疫治疗反应的关系 | 提出了一种基于调节性T细胞浸润的预后模型，并揭示了TK1作为肿瘤生物标志物的潜力 | 未提及具体的临床验证和多中心研究加强结果的局限性 | 研究三阴性乳腺癌中调节性T细胞浸润对肿瘤进展和免疫治疗反应的影响 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤组织样本和相关基因表达数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | METABRIC三阴性乳腺癌样本 |
| 2667 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct tumor microenvironment of ground glass nodules and solid nodules in lung adenocarcinoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1198338
PMID:37745301
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了肺腺癌中的磨玻璃结节（GGN）和实性结节（SN）的肿瘤微环境 | 首次详细描述了GGN和SN的肿瘤微环境，并揭示了两者在细胞组成和转录组特征上的差异 | 研究样本量较小，仅包括三名GGN患者和三名SN患者 | 探究肺腺癌中磨玻璃结节和实性结节的不同恶性程度背后的机制 | 肺腺癌中的磨玻璃结节和实性结节 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 共分析了15,902个细胞，来自三名GGN患者和三名SN患者的肿瘤样本 |
| 2668 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of mitophagy-related genes in diagnosis and heterogeneous endothelial cells in chronic rhinosinusitis: based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1228028
PMID:37745856
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研究论文 | 本研究旨在探讨慢性鼻窦炎（CRS）中与线粒体自噬相关的基因（MRGs）的作用，特别是内皮细胞（ECs）的异质性 | 本研究首次综合分析了线粒体自噬相关基因在慢性鼻窦炎中的作用，并强调了内皮细胞异质性的重要性 | NA | 研究线粒体自噬相关基因在慢性鼻窦炎中的作用及其对内皮细胞异质性的影响 | 线粒体自噬相关基因和内皮细胞在慢性鼻窦炎中的作用 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | RNA测序 | 逻辑回归模型 | RNA测序数据 | 92个慢性鼻窦炎样本和35个健康对照样本 |
| 2669 | 2024-08-07 |
A prognostic signature based on seven T-cell-related cell clustering genes in bladder urothelial carcinoma
2023, Open medicine (Warsaw, Poland)
DOI:10.1515/med-2023-0773
PMID:37745978
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，筛选出与膀胱尿路上皮癌预后相关的七个T细胞相关细胞聚类基因，并构建了预测模型。 | 首次基于单细胞RNA测序数据筛选出七个T细胞相关细胞聚类基因，并构建了针对膀胱尿路上皮癌的预后模型。 | NA | 旨在通过分析膀胱尿路上皮癌的免疫微环境，为诊断和治疗提供指导。 | 膀胱尿路上皮癌的免疫细胞及其相关基因。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | Cox和LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2670 | 2024-08-07 |
Unveiling novel insights in prostate cancer through single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1224913
PMID:37746302
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示前列腺癌的新见解 | 使用单细胞RNA测序技术，能够在单个细胞水平上提供详细信息，特别适合识别稀有细胞群体 | NA | 揭示前列腺癌的复杂性和多样性 | 前列腺癌的细胞异质性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2671 | 2024-08-07 |
The immune checkpoint adenosine 2A receptor is associated with aggressive clinical outcomes and reflects an immunosuppressive tumor microenvironment in human breast cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1201632
PMID:37753093
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研究论文 | 本研究探讨了免疫检查点腺苷2A受体（A2AR）在人乳腺癌中的临床和免疫学意义，发现A2AR的高表达与乳腺癌的侵袭性临床结果和免疫抑制性肿瘤微环境相关。 | 首次阐明了A2AR在乳腺癌患者中的临床和免疫学相关性，揭示了A2AR作为克服乳腺癌免疫逃逸的治疗靶点的潜力。 | NA | 研究A2AR在人乳腺癌中的临床和免疫学意义。 | 人乳腺癌中的A2AR表达及其与肿瘤微环境的关系。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RT-qPCR, 免疫组织化学, 数字细胞计量术, ESTIMATE计算方法, GSEA分析, scRNA-seq | NA | mRNA表达, 蛋白质分析, 微阵列数据, 单细胞数据库 | 使用大规模微阵列数据（METABRIC）进行分析 |
| 2672 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing and UPHLC-MS/MS targeted metabolomics offer new insights into the etiological basis for male cattle-yak sterility
2023-Dec-31, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2023.126831
PMID:37716658
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和UPHLC-MS/MS靶向代谢组学方法，对比分析了4岁雄性牦牛和4岁雄性牛牦杂交后代睾丸组织的差异，以探索牛牦杂交后代雄性不育的病因基础。 | 首次系统地对牛牦杂交后代雄性不育现象进行了细胞层面的分析，提供了全面的见解。 | NA | 探索牛牦杂交后代雄性不育的病因基础 | 4岁雄性牦牛和4岁雄性牛牦杂交后代的睾丸组织 | NA | 雄性不育 | 单细胞RNA测序，UPHLC-MS/MS靶向代谢组学 | NA | 细胞类型数据 | 4岁雄性牦牛和4岁雄性牛牦杂交后代的睾丸组织样本 |
| 2673 | 2024-08-05 |
Functional enrichment analysis of LYSET and identification of related hub gene signatures as novel biomarkers to predict prognosis and immune infiltration status of clear cell renal cell carcinoma
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05280-2
PMID:37740762
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研究论文 | 本研究探讨了LYSET在透明细胞肾细胞癌中的潜在途径，并基于这些途径中的核心基因建立相关预测模型 | 文章首次识别了与LYSET相关的核心基因签名，作为透明细胞肾细胞癌的预后和免疫浸润状态的新生物标志物 | 研究结果需要更多的实验验证以确认其有效性 | 旨在探索TMEM251在透明细胞肾细胞癌中的潜在作用及其相关的预测模型 | 研究对象为透明细胞肾细胞癌样本及其相关临床信息 | 数字病理学 | 肾癌 | mRNA表达数据分析、单细胞测序、免疫组化 | LASSO回归、Cox回归模型 | 文本、基因表达数据 | 使用了来自TCGA、E-MATE-1980和免疫治疗队列的透明细胞肾细胞癌样本 |
| 2674 | 2024-08-07 |
Machine-learning based integrating bulk and single-cell RNA sequencing reveals the SLC38A5-CCL5 signaling as a promising target for clear cell renal cell carcinoma treatment
2023-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2023.101790
PMID:37722291
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据，揭示了SLC38A5-CCL5信号通路作为透明细胞肾细胞癌治疗的有前景靶点 | 本研究首次建立了基于ETS1和MEF2C的高激活 regulons 的CAF衍生通信签名，并据此将ccRCC的肿瘤微环境分为两种分子亚型，该模型在预测预后和ICI治疗反应方面表现出高准确性和鲁棒性 | NA | 揭示癌症相关成纤维细胞在透明细胞肾细胞癌中的机制，并寻找新的治疗靶点 | 透明细胞肾细胞癌中的癌症相关成纤维细胞和恶性细胞 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 2675 | 2024-08-07 |
Post-ovulatory aging affects mitochondria, spindle and protein metabolism in mouse oocytes
2023-12-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-23-0130
PMID:37732584
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研究论文 | 本研究首次提供了新鲜和老化卵母细胞的全面mRNA表达谱，并探讨了卵泡后期老化对卵母细胞质量和胚胎发育潜力的影响。 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了老化卵母细胞中差异表达基因的富集情况，特别是在线粒体功能、纺锤体功能和蛋白质代谢方面。 | 研究主要集中在小鼠卵母细胞上，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 探讨卵泡后期老化对卵母细胞质量和胚胎发育潜力的分子机制。 | 新鲜和老化的小鼠卵母细胞。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | mRNA表达谱 | 921个差异表达基因，其中569个基因下调，356个基因上调 |
| 2676 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of tumor microenvironment features to establish a diagnostic model for papillary thyroid cancer using bulk and single-cell RNA sequencing technology
2023-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05420-8
PMID:37733241
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research paper | 本研究通过整合肿瘤微环境特征，利用批量和单细胞RNA测序技术，建立了一个用于诊断乳头状甲状腺癌的模型 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术探索乳头状甲状腺癌的肿瘤微环境特征，并识别出潜在的诊断生物标志物 | NA | 探索乳头状甲状腺癌的肿瘤微环境特征，并建立诊断模型 | 乳头状甲状腺癌的肿瘤微环境特征及诊断生物标志物 | digital pathology | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 2677 | 2024-08-07 |
A Novel Scoring Model of Deubiquitination Patterns Predicts Prognosis and Immunotherapeutic Response in Hepatocellular Carcinoma
2023-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2023.101789
PMID:37734237
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研究论文 | 本研究通过全面分析肝细胞癌中与总生存期相关的26种去泛素化酶的转录和遗传改变，利用共识聚类算法识别不同的去泛素化模式，并建立DUBscore模型来量化个体肝细胞癌患者的去泛素化模式，进一步通过加权基因共表达网络分析确定关键去泛素化酶，揭示了去泛素化模式在塑造肿瘤微环境复杂性和多样性中的重要作用。 | 本研究首次建立了DUBscore模型，用于量化肝细胞癌患者的去泛素化模式，并发现其可作为独立的预后因素和预测免疫治疗反应的指标。此外，研究还确定了BRCC3作为潜在的治疗靶点和预测免疫治疗反应的标志物。 | NA | 研究去泛素化模式在肝细胞癌中的作用及其对肿瘤微环境和免疫治疗反应的影响。 | 肝细胞癌患者的去泛素化模式及其对肿瘤微环境和免疫治疗反应的影响。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 主成分分析(PCA) | 转录组数据 | 26种与总生存期相关的去泛素化酶 |
| 2678 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of CD19 chimeric antigen receptor T cells
2023-11-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.08.015
PMID:37738975
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研究论文 | Li等人通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，分析了复发或难治性大B细胞淋巴瘤（rrLBCL）患者接受标准治疗axicabtagene ciloleucel后的CD19嵌合抗原受体T细胞，并识别了在3个月随访期间通过PET/CT评估的应答者和非应答者之间显著不同的特征。 | 该研究利用单细胞RNA测序技术，首次详细描述了CD19 CAR-T细胞在rrLBCL患者中的特征，并区分了应答者和非应答者的差异。 | NA | 研究CD19 CAR-T细胞在rrLBCL患者中的特征及其对应答者和非应答者的区分。 | 复发或难治性大B细胞淋巴瘤患者的CD19 CAR-T细胞。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 来自复发或难治性大B细胞淋巴瘤患者的CD19 CAR-T细胞样本 |
| 2679 | 2024-08-05 |
Biomarkers for immunotherapy of hepatocellular carcinoma
2023-11, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-023-00816-4
PMID:37726418
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评论 | 这篇综述总结了肝细胞癌免疫治疗中的生物标志物数据 | 提出了新的生物标志物开发概念，包括生物标志物驱动的试验和空间转录组学 | 没有明确说明生物标志物的临床应用限制 | 旨在识别最有可能从免疫检查点抑制剂中受益的患者 | 探讨了肝细胞癌患者在免疫检查点抑制剂治疗中的免疫学和结果 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、放射组学、微生物组分析 | NA | NA | NA |
| 2680 | 2024-08-05 |
MAIT cells confer resistance to Lenvatinib plus anti-PD1 antibodies in hepatocellular carcinoma through TNF-TNFRSF1B pathway
2023-11, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109770
PMID:37717672
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研究论文 | 本文探讨了MAIT细胞通过TNF-TNFRSF1B通路，在肝细胞癌中对Lenvatinib及抗PD1抗体的耐药性提供的抵抗力 | 研究揭示了MAIT细胞分泌TNF对调节性T细胞的作用，提供了Lenvatinib联合抗PD1治疗的潜在机制 | 研究样本数量较少，仅涉及六名肝细胞癌患者 | 探索Lenvatinib与抗PD1抗体联合治疗的耐药机制 | 肝细胞癌患者的单细胞样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞样本 | 六名肝细胞癌患者的样本 |