单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 2621 - 2640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2621 | 2024-08-07 |
Cell-type expression and activation by light of neuropsins in the developing and mature Xenopus retina
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1266945
PMID:37799826
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研究论文 | 研究了神经视蛋白在发育中和成熟的非洲爪蟾视网膜中的细胞类型表达和光激活 | 探讨了神经视蛋白家族在视网膜中的表达和功能，这是先前研究较少的领域 | NA | 深入了解视网膜中神经视蛋白表达细胞的发育起始和光激活 | 神经视蛋白在非洲爪蟾视网膜中的表达和功能 | NA | NA | 原位杂交和免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及非洲爪蟾、斑马鱼、鸡和鼠的视网膜细胞 |
| 2622 | 2024-08-05 |
Understanding the pathogenesis of brain arteriovenous malformation: genetic variations, epigenetics, signaling pathways, and immune inflammation
2023-Dec, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-023-02605-6
PMID:37768356
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综述 | 本文综合分析了与脑动静脉畸形相关的关键通路和炎症因子，并探讨其与表观遗传调控和遗传学的相互作用 | 本文揭示了表观遗传调控、基因变异及其信号通路在脑动静脉畸形中的作用，及其与免疫炎症的关系 | 目前缺乏针对脑动静脉畸形的特定药物，且临床上缺乏相关生物标志物 | 阐明脑动静脉畸形的发病机制并开发潜在治疗策略 | 分析揭示影响脑动静脉畸形的基因、表观遗传调控和免疫炎症因子 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 2623 | 2024-08-05 |
Understanding cervical cancer at single-cell resolution
2023-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216408
PMID:37769795
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综述 | 本文概述了单细胞测序在解析宫颈癌生态系统异质性方面的最新进展 | 突出单细胞水平的高分辨率解析对靶向治疗和个性化医学发展的推动潜力 | NA | 增强对宫颈癌患者预后的理解 | 宫颈癌的肿瘤生态系统 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 2624 | 2024-08-07 |
scTOP: physics-inspired order parameters for cellular identification and visualization
2023-11-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201873
PMID:37756586
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研究论文 | 本文介绍了一种名为'单细胞类型顺序参数'（scTOP）的统计物理启发方法，用于在给定细胞类型参考基础的情况下量化细胞身份，并展示了其在细胞分类、发育轨迹可视化和工程细胞忠实度评估中的应用 | scTOP方法无需特征选择、统计拟合或维度降低，能够准确分类细胞并可视化发育轨迹 | NA | 开发新的理论和计算框架，以分析细胞分化的动态并整合细胞图谱的知识 | 单细胞RNA测序数据，包括人鼠数据集和肺部细胞移植数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | 包括人鼠数据集和肺部细胞移植数据 |
| 2625 | 2024-08-07 |
The Critical Role of The Piezo1/β-catenin/ATF4 Axis on The Stemness of Gli1+ BMSCs During Simulated Microgravity-Induced Bone Loss
2023-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303375
PMID:37759400
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研究论文 | 本研究探讨了Piezo1/β-catenin/ATF4轴在模拟微重力诱导的Gli1+ BMSCs骨丢失中的关键作用 | 首次揭示了Piezo1激活通过促进Gli1 BMSCs的增殖和成骨分化，从而改善模拟微重力下的骨丢失 | 研究主要集中在模拟微重力模型上，实际微重力环境下的效果需要进一步验证 | 探讨Piezo1在异常机械刺激导致的骨丢失中的作用及潜在治疗策略 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs)和Piezo1通道 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了后肢卸载模型模拟微重力环境 |
| 2626 | 2024-08-07 |
Thymosin α1 modulated the immune landscape of COVID-19 patients revealed by single-cell RNA and TCR sequencing
2023-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110983
PMID:37769533
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析了胸腺素α1（Tα1）对COVID-19患者免疫景观的调节作用 | 首次详细探讨了Tα1治疗COVID-19患者的免疫调节机制，发现Tα1能增加特定免疫细胞的比例并刺激TCR克隆的多样性 | 研究样本量相对较小，需要更大规模的研究来验证结果 | 探究Tα1在COVID-19治疗中的免疫调节作用 | COVID-19患者和健康对照组的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和T细胞受体测序（TCR-seq） | NA | 单细胞RNA和T细胞受体数据 | 33名COVID-19患者和11名健康对照 |
| 2627 | 2024-08-07 |
The multi-omics single-cell landscape of sinus mucosa in uncontrolled severe chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2023-11, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109791
PMID:37769787
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、转录组学、表面蛋白质组学以及T细胞和B细胞受体测序，分析了不受控制的严重慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者的鼻息肉组织与健康对照组鼻黏膜的细胞类型和免疫反应差异 | 本研究首次揭示了CRSwNP患者鼻息肉组织中细胞类型的转变，以及T细胞和B细胞受体谱的偏斜，这些发现有助于理解疾病的发病机制 | NA | 研究不受控制的严重慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）的免疫反应和重塑机制 | CRSwNP患者的鼻息肉组织与健康对照组的鼻黏膜 | 数字病理学 | 鼻窦炎 | 单细胞RNA测序、转录组学、表面蛋白质组学、T细胞和B细胞受体测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2628 | 2024-08-07 |
Learning single-cell perturbation responses using neural optimal transport
2023-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01969-x
PMID:37770709
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研究论文 | 本文提出了一种名为CellOT的框架，利用最优传输理论和输入凸神经网络结构，学习单细胞对特定扰动的响应 | CellOT框架通过映射未配对的扰动和非扰动细胞分布，能够预测单细胞药物响应，并在多个未见场景中表现出良好的泛化能力 | NA | 理解和预测单细胞在化学、遗传或机械扰动下的分子响应 | 单细胞对特定扰动的响应 | 生物学 | NA | 最优传输理论，输入凸神经网络 | 输入凸神经网络 | 单细胞RNA测序数据，多重蛋白质成像技术数据 | 未具体说明样本数量 |
| 2629 | 2024-08-07 |
A transient wave of Bhlhe41+ resident macrophages enables remodeling of the developing infarcted myocardium
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113174
PMID:37751357
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、空间转录组学和报告基因小鼠研究了心肌梗死后心脏巨噬细胞亚型的时间-空间动态变化 | 首次识别出心肌梗死区域中由单核细胞衍生的Bhlhe41 Mφs在第7天达到峰值，并揭示了其在抑制肌成纤维细胞激活中的关键作用 | NA | 研究心肌梗死后免疫系统在修复和重塑心肌中的作用 | 心肌梗死后的心脏巨噬细胞亚型及其功能 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 2630 | 2024-08-07 |
MSU crystal deposition contributes to inflammation and immune responses in gout remission
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113139
PMID:37756161
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了在痛风缓解期中，单钠尿酸盐（MSU）晶体沉积对免疫炎症反应的影响 | 首次揭示了在痛风缓解期中，MSU晶体沉积引起的系统性炎症和特异性免疫反应 | NA | 探讨MSU晶体沉积在痛风缓解期对免疫炎症反应的影响及其机制 | 痛风缓解期患者的周围血单个核细胞（PBMCs） | NA | 痛风 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 2631 | 2024-08-07 |
Meningeal macrophages inhibit chemokine signaling in pre-tumor cells to suppress mouse medulloblastoma initiation
2023-10-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.033
PMID:37774709
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研究论文 | 本文探讨了脑膜巨噬细胞通过抑制前肿瘤细胞中的趋化因子信号来抑制小鼠髓母细胞瘤的启动 | 首次揭示了脑膜巨噬细胞在趋化因子调控的抗肿瘤对话中的关键作用，特别是在抑制髓母细胞瘤启动方面 | NA | 研究脑肿瘤微环境对肿瘤启动的影响 | 脑膜巨噬细胞和小鼠髓母细胞瘤 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2632 | 2024-08-05 |
ScribbleDom: using scribble-annotated histology images to identify domains in spatial transcriptomics data
2023-Oct-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad594
PMID:37756699
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研究论文 | 本文提出了一种名为“ScribbleDom”的半监督卷积神经网络方法，用于在空间转录组学中识别领域。 | 通过利用人类专家的输入作为半监督的方法，ScribbleDom结合了人的认知能力与机器的计算能力。 | 在缺乏专家输入时，尽管ScribbleDom可以全自监督运行，但其性能可能无法与带专家输入时的效果相比。 | 研究空间转录组学中领域识别的重要性及其改进方法。 | 该研究以人类侧面前额皮层样本和黑色素瘤数据集为研究对象。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 卷积神经网络 | 半监督卷积神经网络 | 图像 | 12个人类侧面前额皮层样本和多个黑色素瘤数据集 |
| 2633 | 2024-08-05 |
Circulating Tumor Cells and Tumor Progression, Metastasis, and Poor Prognosis in Patients With Neuroblastoma
2023-Oct, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.16627
PMID:37772576
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评论 | 本文简要回顾了循环神经母细胞瘤细胞的定量方法及其与神经母细胞瘤患者预后的关系 | 强调了循环神经母细胞瘤细胞数量与预后不良之间的关系，并提出了对这些细胞进行全面遗传分析的必要性 | 目前大多数研究仅代表肿瘤负担，没有直接证据表明循环肿瘤细胞是神经母细胞瘤患者肿瘤进展和转移的来源 | 探讨循环肿瘤细胞在神经母细胞瘤进展、转移及预后不良中的作用 | 研究神经母细胞瘤患者中的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞测序，外源细胞培养功能测定 | NA | NA | NA |
| 2634 | 2024-08-07 |
The unique interplay of mitochondrial oxidative phosphorylation (OXPHOS) and immunity and its potential implication for the sex- and age-related morbidity of severe COVID-19 patients
2023-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.371
PMID:37750090
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研究论文 | 本研究分析了先前发表的单细胞RNA测序数据，揭示了线粒体氧化磷酸化（OXPHOS）和免疫在严重或危重COVID-19患者中的细胞类型、性别和年龄相关变化 | 发现OXPHOS和免疫在严重或危重COVID-19患者中的相互作用显示出细胞类型特异性、年龄相关性和性别偏向性 | 研究主要基于先前发表的数据，未进行新的实验验证 | 探讨线粒体氧化磷酸化与免疫在COVID-19患者中的相互作用及其对性别和年龄相关发病率的影响 | 严重或危重COVID-19患者、去势和再生小鼠模型 | 生物信息学 | COVID-19 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | RNA | 大量COVID-19患者、去势和再生小鼠、400个基因的RNAi文库 |
| 2635 | 2024-08-07 |
Leprosy-specific subsets of macrophages and Schwann cells identified by single-cell RNA-sequencing
2023-Oct, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2023.154821
PMID:37757621
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了感染麻风分枝杆菌的小鼠模型中巨噬细胞和施万细胞的特定亚群及其相互作用 | 首次详细描述了麻风病中巨噬细胞的M1和M2样亚群及其与施万细胞的相互作用，揭示了这些细胞在疾病中的分子状态和功能 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 探究麻风病中巨噬细胞和施万细胞的分子状态及其相互作用，以深入理解疾病的发病机制 | 麻风分枝杆菌感染的小鼠模型中的单个细胞 | 数字病理学 | 麻风病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类麻风病组织样本 |
| 2636 | 2024-08-05 |
Integration of single-nuclei RNA-sequencing, spatial transcriptomics and histochemistry defines the complex microenvironment of NF1-associated plexiform neurofibromas
2023-09-28, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-023-01639-1
PMID:37770931
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序、空间转录组学和免疫组化定义了NF1相关的多发性神经纤维瘤的复杂微环境 | 首次描述了在多发性神经纤维瘤中存在的NRXN1/NLGN1受体-配体交互作用，可能表明细胞间的直接交流通路 | 由于多发性神经纤维瘤的细胞凝聚性，单细胞RNA测序很难进行，可能导致关键细胞亚群的检测丧失 | 探讨多发性神经纤维瘤肿瘤微环境中的细胞异质性和潜在的新通讯通路 | 研究了8个冷冻多发性神经纤维瘤样本和4个多发性神经纤维瘤样本的空间转录组学数据 | 数字病理学 | 神经纤维瘤 | 单核RNA测序（snRNA-seq），空间转录组学（ST），免疫组化 | NA | RNA测序数据，转录组数据 | 8个冷冻多发性神经纤维瘤样本和4个多发性神经纤维瘤样本 |
| 2637 | 2024-08-07 |
Identifying immune checkpoint-related lncRNA biomarkers for immunotherapy response and prognosis in cancers
2023-09-28, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02550-z
PMID:37770497
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研究论文 | 本文开发了一个多步骤流程，用于识别跨癌症的免疫检查点相关长非编码RNA生物标志物，以预测免疫治疗反应和预后 | 首次构建了免疫检查点与长非编码RNA的合作调控网络，并验证了这些生物标志物在预测免疫检查点抑制剂反应中的有效性 | NA | 旨在增强对长非编码RNA功能的理解，并加速发现基于长非编码RNA的免疫检查点抑制剂治疗生物标志物 | 免疫检查点相关长非编码RNA生物标志物 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及多个独立数据集，包括大量和单细胞RNA测序数据 |
| 2638 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics delineates the immune cell landscape in equine lower airways and reveals upregulation of FKBP5 in horses with asthma
2023-09-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-43368-4
PMID:37758813
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研究论文 | 该文章研究了马的下呼吸道中的免疫细胞概况，并揭示了哮喘马中FKBP5的上调 | 首次通过单细胞转录组测序描绘了马的免疫细胞景观，并发现FKBP5在哮喘病例中的显著上调 | 仅研究了轻度至中度哮喘马的免疫细胞，是否适用于重度哮喘尚未确定 | 探讨马的免疫细胞在哮喘中的变化 | 健康马和轻度至中度马哮喘病例的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 2639 | 2024-08-07 |
Loss of Notch signaling in skeletal stem cells enhances bone formation with aging
2023-09-27, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-023-00283-8
PMID:37752132
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研究论文 | 研究探讨了骨骼干细胞中Notch信号通路的缺失如何增强老年时期的骨形成 | 发现Notch信号通路的调节可以改善骨骼老化现象，增加骨质量，并识别出Ebf3转录因子作为潜在的治疗目标 | NA | 探究Notch信号通路在骨骼干细胞中的作用及其对老年骨骼健康的影响 | 骨骼干细胞和前体细胞（SSPCs）及其在老化过程中的变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 中年条件性敲除小鼠 |
| 2640 | 2024-08-05 |
Tracing immune cells around biomaterials with spatial anchors during large-scale wound regeneration
2023-09-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41608-9
PMID:37752124
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研究论文 | 本研究介绍了一种使用生物可降解的对齐细胞外基质支架进行大面积伤口再生的方法 | 揭示了调节性T细胞在抑制过度2型炎症方面的潜在作用 | 未具体提及实验中样本的多样性和应用的局限性 | 探讨免疫系统在伤口再生过程中的协调作用 | 探索免疫细胞在生物材料周围的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | 使用了缺乏成熟T淋巴细胞的免疫缺陷小鼠 |