单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 2581 - 2600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2581 | 2024-08-07 |
Detection of cell-type-enriched long noncoding RNAs in atherosclerosis using single-cell techniques: A brief review
2023-Nov-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.122138
PMID:37805167
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综述 | 本文综述了利用单细胞技术在动脉粥样硬化中检测细胞类型特异性长非编码RNA（LncRNAs）的研究进展 | 强调了四种在单细胞RNA测序数据中检测到的新型LncRNAs（lncRNA CARMN, LINC00607, PCAT19, LINC01235）及其在动脉粥样硬化中的功能 | NA | 探讨动脉粥样硬化中细胞类型特异性LncRNAs的功能及其在临床治疗和诊断中的潜在应用 | 动脉粥样硬化中的细胞类型特异性长非编码RNA | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 2582 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq of maize meiocytes and pollen grains
2023-Nov, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-023-00889-6
PMID:37783945
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研究论文 | 本文介绍了一种分离单个玉米配子母细胞和花粉粒进行RNA-seq的协议 | 创新点在于能够有效分离稀有植物生殖细胞并进行单细胞RNA测序，从而解析细胞间异质性 | 未提及研究的局限性 | 探讨植物生殖细胞的发育途径及突变表型的影响 | 单个玉米配子母细胞和花粉粒 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | RNA数据 | 最多可采集200个细胞 |
| 2583 | 2024-08-07 |
Mapping Cell-to-cell Interactions from Spatially Resolved Transcriptomics Data
2023-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.18.558298
PMID:37781617
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研究论文 | 本文介绍了一种基于贝叶斯多实例学习框架spacia，用于从空间解析转录组学数据中检测细胞间通信 | spacia框架能够利用空间解析转录组学数据的空间模态，克服了基于单细胞RNA测序工具在推断细胞间通信时的单细胞分辨率丢失和高假阳性率问题 | NA | 推进细胞通信的定量理论 | 细胞间通信在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间解析转录组学 | 贝叶斯多实例学习框架 | 转录组学数据 | 3,354名患者 |
| 2584 | 2024-08-07 |
MAGNETO: Cell type marker panel generator from single-cell transcriptomic data
2023-11, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2023.104510
PMID:37797704
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研究论文 | 本文提出了一种名为MAGNETO的全自动框架，用于从单细胞转录组数据中生成细胞类型标记面板 | MAGNETO框架通过解决特定的双目标优化问题，能够构建出优化的标记面板，有效地区分特定细胞类型 | NA | 开发一种全自动框架，用于从单细胞转录组数据中生成细胞类型标记面板 | 单细胞转录组数据中的细胞类型标记面板生成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双目标优化问题 | 基因表达矩阵 | 三个公共数据集 |
| 2585 | 2024-08-07 |
Sex differences in the genetic and molecular mechanisms of coronary artery disease
2023-11, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 本文通过回顾遗传和表观遗传学研究，探讨了冠状动脉疾病（CAD）中性别差异的遗传和分子机制 | 识别了超过40个性别差异候选基因，并强调了平滑肌细胞表型转换在女性动脉粥样硬化中的关键作用 | 需要增加统计效力和调整研究设计及分析策略，以更深入地解析CAD中性别差异的复杂机制 | 揭示冠状动脉疾病中性别差异的遗传和分子机制 | 性别差异在冠状动脉疾病中的表现、风险因素和预后 | 遗传学 | 心血管疾病 | 转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 基因和表观遗传数据 | 涉及超过40个性别差异候选基因的研究 |
| 2586 | 2024-08-07 |
Supplementation with a high-glucose drink stimulates anti-tumor immune responses to glioblastoma via gut microbiota modulation
2023-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113220
PMID:37804509
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研究论文 | 研究通过给GL261同源胶质母细胞瘤（GBM）小鼠短期补充高葡萄糖饮料（HGD），发现其生存率提高且无代谢疾病迹象，表明HGD通过调节肠道微生物群增强抗肿瘤免疫反应。 | 首次发现HGD补充通过调节肠道微生物群增强GBM小鼠的抗肿瘤免疫反应，特别是通过增加细胞毒性CD4 T细胞和与抗PD-1免疫检查点抑制剂的协同作用。 | 研究仅限于短期HGD补充和特定的小鼠模型，可能需要进一步研究其在人类和其他时间框架中的效果。 | 探讨高葡萄糖饮料补充对胶质母细胞瘤小鼠抗肿瘤免疫反应的影响及其机制。 | GL261同源胶质母细胞瘤小鼠及其肠道微生物群和免疫细胞。 | NA | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 特定数量的GL261同源胶质母细胞瘤小鼠 |
| 2587 | 2024-08-07 |
Immaturity of immune cells around the dural venous sinuses contributes to viral meningoencephalitis in neonates
2023-10-13, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adg6155
PMID:37801517
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研究论文 | 研究使用淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）的Armstrong株探讨病毒在系统感染期间进入中枢神经系统（CNS）的机制，发现新生小鼠在感染后死亡率高，病毒从硬脑膜的静脉窦区域广泛传播至软脑膜、脉络丛和大脑皮层。 | 揭示了新生小鼠硬脑膜静脉窦区域的免疫细胞不成熟，主要由CD206巨噬细胞组成，而MHCII巨噬细胞稀少，这与成年小鼠形成对比，成年小鼠的静脉窦免疫细胞富含MHCII巨噬细胞，能产生抗病毒分子和趋化因子，保护CNS免受系统性病毒入侵。 | NA | 探讨病原体如何突破中枢神经系统屏障及其机制。 | 新生和成年小鼠的中枢神经系统免疫细胞。 | NA | 病毒性脑膜脑炎 | 免疫荧光染色和单细胞RNA测序分析 | NA | NA | 新生和成年小鼠 |
| 2588 | 2024-08-07 |
Acute myeloid leukemia: from NGS, through scRNA-seq, to CAR-T. dissect cancer heterogeneity and tailor the treatment
2023-Oct-06, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02841-8
PMID:37803464
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研究论文 | 本文探讨了急性髓系白血病（AML）的病理学理解演变，以及单细胞RNA测序和基于基因组工具的T细胞修饰技术如何影响AML的分类和治疗 | 文章介绍了通过单细胞RNA测序和高通量下一代测序技术，对AML进行更个性化的诊断和治疗，以及使用工程化CAR-T细胞的个性化治疗策略 | NA | 探讨急性髓系白血病的病理学理解演变，以及新技术如何影响其分类和治疗 | 急性髓系白血病（AML）及其治疗策略 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），下一代测序（NGS） | NA | 基因组数据 | NA |
| 2589 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals altered tumor microenvironments of relapse- and remission-associated pediatric acute myeloid leukemia
2023-10-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41994-0
PMID:37798266
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了儿童急性髓系白血病在诊断、诱导治疗结束和复发时间点的骨髓样本，揭示了复发和持续完全缓解相关AML细胞的微环境差异 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了儿童急性髓系白血病复发和持续完全缓解相关AML细胞的微环境差异，并验证了与AML细胞相关的7基因标志 | NA | 深入表征儿童急性髓系白血病复发和持续完全缓解相关的样本，以提供对骨髓微环境景观的见解 | 儿童急性髓系白血病的骨髓样本 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | 多个时间点的骨髓样本 |
| 2590 | 2024-08-07 |
MCProj: metacell projection for interpretable and quantitative use of transcriptional atlases
2023-10-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03069-7
PMID:37798781
|
研究论文 | 描述了一种名为MCProj的算法，用于通过投影参考单细胞图谱来分析查询scRNA-seq数据 | 该方法能够区分并标记与图谱状态一致的查询细胞，以及未观察到的（新颖或人为的）行为，并识别成功映射的查询状态中的表达差异 | NA | 开发一种算法，用于通过投影参考单细胞图谱来分析查询scRNA-seq数据，以实现精确、定量和可解释的结果 | scRNA-seq数据和单细胞图谱 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2591 | 2024-08-07 |
LINC00922 decoys SIRT3 to facilitate the metastasis of colorectal cancer through up-regulation the H3K27 crotonylation of ETS1 promoter
2023-10-04, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01859-y
PMID:37789393
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研究论文 | 本研究探讨了H3K27巴豆酰化在促进结直肠癌转移中的作用及机制 | 发现了LINC00922通过上调ETS1启动子区域的H3K27巴豆酰化水平，促进结直肠癌转移的新机制 | NA | 阐明巴豆酰化在Lys27位点上的组蛋白H3（H3K27cr）在促进结直肠癌转移中的作用和机制 | 结直肠癌组织和细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序、免疫沉淀分析 | NA | 组织样本、细胞 | 临床上使用了转移性结直肠癌组织样本，体外和体内实验使用了结直肠癌细胞 |
| 2592 | 2024-08-07 |
The integrated single-cell analysis developed an immunogenic cell death signature to predict lung adenocarcinoma prognosis and immunotherapy
2023-10-04, Aging
DOI:10.18632/aging.205077
PMID:37796202
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，开发了一种免疫原性细胞死亡（ICD）特征，用于预测肺腺癌（LUAD）的预后和免疫治疗效果 | 首次在肺腺癌中构建了ICD相关的预后特征，并探讨了其在免疫治疗中的应用 | NA | 旨在为肺腺癌患者创建ICD相关的预后特征，以准确预测生存预后 | 肺腺癌患者的预后和免疫治疗效果 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和COX回归分析 | RNA | 涉及TCGA和GEO数据库中的肺腺癌患者数据 |
| 2593 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Cellular Heterogeneity and Complex Cell-Cell Communication Networks in the Mouse Cornea
2023-10-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.13.5
PMID:37792336
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序绘制了小鼠角膜的细胞异质性和复杂的细胞间通讯网络 | 创新点在于构建了一个完整的单细胞转录组图及角膜中所有细胞类型的复杂信号交流图谱 | NA | 研究小鼠角膜的细胞异质性和细胞间通讯网络 | C57BL/6小鼠的角膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 40只小鼠角膜的14,732个细胞 |
| 2594 | 2024-08-05 |
Alveolar macrophages in tissue homeostasis, inflammation, and infection: evolving concepts of therapeutic targeting
2023-10-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170501
PMID:37781922
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研究论文 | 该文章探讨了肺泡巨噬细胞在组织稳态、炎症和感染中的作用及其治疗靶向的概念演变 | 首次结合单细胞RNA测序和空间组学方法深入研究了肺泡巨噬细胞的起源、功能和可塑性 | 治疗靶向肺泡巨噬细胞可能面临严重的副作用风险，例如抗菌宿主防御能力的丧失 | 探索肺泡巨噬细胞在急性肺损伤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 主要研究对象为肺泡巨噬细胞及其在感染和无菌肺炎中的功能 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 2595 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of cuproptosis and copper homeostasis genotyping and related immune land scape in lung adenocarcinoma
2023-10-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-43795-3
PMID:37783723
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研究论文 | 本研究分析了肺腺癌中铜死亡和铜稳态基因型及相关免疫景观 | 首次在肺腺癌中识别出新的铜死亡和铜稳态相关基因，并建立了基于这些基因的预后标志物 | NA | 探索肺腺癌中铜死亡和铜稳态相关基因及其在肿瘤治疗中的潜在应用 | 肺腺癌中的铜死亡和铜稳态相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），lasso-惩罚的cox回归方法，单细胞RNA测序（scRNA-seq），实时定量聚合酶链反应（RT-qPCR） | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 使用了来自TCGA和GEO的转录组数据，以及GSE30219、GSE183219和GSE203360的单细胞RNA测序数据 |
| 2596 | 2024-08-07 |
Unravelling the role of immune cells and FN1 in the recurrence and therapeutic process of skull base chordoma
2023-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1429
PMID:37784253
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和T/B细胞受体测序，研究了颅底脊索瘤原发和复发肿瘤细胞及其微环境细胞的差异，并探讨了纤维连接蛋白1（FN1）在脊索瘤复发和治疗中的作用。 | 首次详细分析了颅底脊索瘤原发和复发肿瘤细胞及其微环境细胞的差异，并揭示了FN1在脊索瘤复发中的重要作用。 | NA | 深入了解颅底脊索瘤原发和复发肿瘤的细胞差异及其复发机制，为开发有效治疗策略提供依据。 | 颅底脊索瘤的原发和复发肿瘤细胞、浸润淋巴细胞、骨髓细胞、成纤维细胞和B细胞。 | 数字病理学 | 颅底脊索瘤 | 单细胞RNA测序，T/B细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA序列数据 | NA |
| 2597 | 2024-08-07 |
Bladder cancer intrinsic LRFN2 drives anticancer immunotherapy resistance by attenuating CD8+ T cell infiltration and functional transition
2023-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007230
PMID:37802603
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研究论文 | 本文研究了膀胱癌中LRFN2蛋白通过调节肿瘤微环境影响免疫治疗抵抗的机制 | 首次揭示了LRFN2在膀胱癌中通过抑制CD8+ T细胞的招募和功能转变，影响免疫检查点抑制剂治疗效果的新机制 | NA | 探讨LRFN2在膀胱癌免疫治疗抵抗中的作用及其机制 | 膀胱癌中的LRFN2蛋白及其对肿瘤微环境和免疫治疗的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序, 免疫测定, 组织全景量化分析 | NA | RNA, 组织 | 涉及大量RNA测序和单细胞RNA测序，具体样本数量未详细说明 |
| 2598 | 2024-08-07 |
Application of single-cell multi-omics approaches in horticulture research
2023-Sep-26, Molecular horticulture
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s43897-023-00067-y
PMID:37789394
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review | 本文总结了目前可用的单细胞多组学方法及其在植物研究中的应用，回顾了基于单细胞的研究在水果、蔬菜和观赏作物中的应用，并讨论了这些方法在未来园艺研究中的潜力 | 本文介绍了单细胞多组学技术在植物发育生物学研究中的应用，以及这些技术在提高表观组和代谢组研究准确性和灵敏度方面的进展 | NA | 总结单细胞多组学方法在园艺研究中的应用，并探讨其未来潜力 | 水果、蔬菜和观赏作物 | NA | NA | 单细胞转录组测序技术 | NA | 转录组、表观组和代谢组数据 | NA |
| 2599 | 2024-08-07 |
Differential effects of aneuploidy on growth and differentiation in human intestinal stem cells
2023-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.23.559117
PMID:37790420
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研究论文 | 研究在非转化的结肠类器官中诱导异质性非整倍体，探讨非整倍体对细胞生长和分化的影响及其在恶性转化中的作用 | 通过单细胞RNA测序揭示了超过100种独特非整倍体核型的基因表达特征，并发现复杂非整倍体细胞通过激活p53导致G1细胞周期阻滞 | 未详细说明非整倍体在不同环境下的具体作用机制 | 探究非整倍体对人类肠道干细胞生长和分化的影响及其在癌症演变中的作用 | 人类肠道干细胞中的非整倍体效应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过100种独特非整倍体核型的细胞 |
| 2600 | 2024-08-05 |
Cracking the pattern of tumor evolution based on single-cell copy number alterations
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad341
PMID:37791583
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研究论文 | 本研究基于单细胞拷贝数变化探讨肿瘤演化模式 | 提出了一种两步统计方法，能够区分肿瘤细胞群体的演化模式 | 在研究中未提及样本的种类及数量可能限制了结论的普遍性 | 探索肿瘤细胞群体中的拷贝数变化与肿瘤演化模式的关系 | 使用20名乳腺癌患者的单细胞DNA测序数据和132名癌症患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组和转录组数据 | 20名乳腺癌患者和132名癌症患者 |