单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 2561 - 2580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2561 | 2024-08-07 |
SLAM Modification as an Immune-Modulatory Therapeutic Approach in Cancer
2023-Sep-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15194808
PMID:37835502
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综述 | 本文综述了信号淋巴细胞激活分子（SLAM）家族在肿瘤环境中调节免疫反应的关键作用，并探讨了基于SLAM的免疫调节治疗在癌症治疗中的潜力 | 文章提出了基于SLAM家族的精确靶向治疗方法，利用单细胞RNA测序和高级成像技术，为更个性化和适应性强的癌症治疗提供了新方向 | 文章强调了患者安全性和临床试验的重要性，暗示当前研究可能存在临床应用上的限制 | 探讨SLAM家族在癌症治疗中的应用，特别是作为免疫调节治疗的新策略 | 研究对象为SLAM家族及其在肿瘤免疫反应中的作用 | 肿瘤学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA |
| 2562 | 2024-08-07 |
Recent Advances in Single-Cell RNA-Sequencing of Primary and Metastatic Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2023-Sep-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15194734
PMID:37835428
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在原发性和转移性透明细胞肾细胞癌研究中的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术深入解析了肿瘤、免疫和基质细胞的多样性及其在疾病进展中的相互作用和通路 | 对于转移性透明细胞肾细胞癌的研究相对有限，这可能是导致该类型患者生存率和响应率较低的原因之一 | 旨在填补透明细胞肾细胞癌转移研究的知识空白，并强调提高转移性透明细胞肾细胞癌生存率的关键步骤 | 原发性和转移性透明细胞肾细胞癌 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 2563 | 2024-08-07 |
Deciphering Cellular Heterogeneity and Communication Patterns in Porcine Antral Follicles by Single-Cell RNA Sequencing
2023-Sep-26, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani13193019
PMID:37835625
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索了猪腔前卵泡中颗粒细胞的分子和细胞特征 | 揭示了猪腔前卵泡中颗粒细胞的异质性和通信模式，以及它们在卵泡发育和卵母细胞成熟中的作用 | NA | 理解猪腔前卵泡中颗粒细胞的异质性和通信模式 | 猪腔前卵泡中的颗粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2564 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing of Donor-Reactive T Cells Reveals Role of Apoptosis in Donor-Specific Hyporesponsiveness of Kidney Transplant Recipients
2023-Sep-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241914463
PMID:37833911
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肾移植受者中供体反应性T细胞的转录组和T细胞受体谱，揭示了凋亡在供体特异性低反应性中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了肾移植受者中供体反应性T细胞的转录组和T细胞受体谱，并发现了凋亡在供体特异性低反应性中的作用 | 研究样本量较小，仅包括7名肾移植受者，可能影响结果的普遍性 | 探究肾移植后供体特异性低反应性的潜在机制 | 肾移植受者的供体反应性T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7名肾移植受者 |
| 2565 | 2024-08-05 |
Decoding functional cell-cell communication events by multi-view graph learning on spatial transcriptomics
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad359
PMID:37824741
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研究论文 | 该文章开发了一种名为HoloNet的方法，通过空间转录组学数据解码功能性细胞间通信事件。 | 本研究的创新点在于整合了配体-受体对、细胞类型空间分布和下游基因表达到深度学习模型中，以解码功能性通信事件和其目标基因关系。 | 没有提供HoloNet在其他类型的癌症或疾病中的应用结果，可能限制了其普遍性。 | 本研究旨在解码功能性细胞间通信事件，以理解生物过程的机制。 | 研究对象为乳腺癌和肝癌的三组Visium数据集，专注于细胞间的配体-受体相互作用。 | 数字病理学 | 乳腺癌, 肝癌 | 空间转录组学 | 深度学习模型 | 转录组数据 | 三组Visium数据集 |
| 2566 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling of Cells in the Lung of a Patient with Chronic Hypersensitivity Pneumonitis Reveals Inflammatory Niche with Abundant CD39+ T Cells with Functional ATPase Phenotype: A Case Study
2023-Sep-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241914442
PMID:37833889
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研究论文 | 本研究调查了慢性超敏性肺炎中免疫细胞特征，重点关注CD39表达细胞对炎症和组织重塑的影响 | 揭示了CD39表达的T细胞在慢性超敏性肺炎中的双重性质，提示其在调节肺炎症中的潜在作用 | 本研究是单一病例研究，样本量较小，可能限制了广泛的适用性 | 探讨慢性超敏性肺炎中免疫细胞的特征及其对病理机制的影响 | 分析一名慢性超敏性肺炎患者的肺组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 慢性超敏性肺炎 | 单细胞转录组学，流式细胞术，基因表达分析 | NA | 组织样本 | 1名慢性超敏性肺炎患者的肺组织 |
| 2567 | 2024-08-05 |
SGAE: single-cell gene association entropy for revealing critical states of cell transitions during embryonic development
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad366
PMID:37833841
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研究论文 | 本研究提出了一种新颖的计算方法SGAE，用于揭示早期胚胎发育过程中细胞转变的关键状态 | 提出了一种基于基因关联信息的单细胞基因关联熵(SGAE)方法，用于分析单细胞RNA-seq数据，并定量评估基因调控网络的关键特性 | 对单细胞RNA测序数据的精确检测仍然面临稀疏性、噪音和异质性的挑战 | 研究单细胞转变的关键点，以追踪细胞异质性并阐明细胞分化的分子机制 | 分析五个关于胚胎发育的单细胞数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 五个单细胞数据集 |
| 2568 | 2024-08-05 |
Development and validation of a differentiation-related signature based on single-cell RNA sequencing data of immune cells in spinal cord injury
2023-Sep, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e19853
PMID:37809933
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研究论文 | 本文基于脊髓损伤后免疫细胞的单细胞RNA测序数据，开发并验证了一个相关的分化标志。 | 该研究首次利用单细胞RNA测序数据识别了脊髓损伤后的免疫亚型和分子标志。 | 未提及具体的样本来源及其异质性对结果的影响。 | 探讨脊髓损伤后免疫系统的分子亚型及其潜在的诊断标志。 | 脊髓损伤后的免疫细胞及其相关的分化基因。 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三次脊髓样本，时间点为3、10和21天 |
| 2569 | 2024-08-07 |
Single-cell data analysis of malignant epithelial cell heterogeneity in lung adenocarcinoma for patient classification and prognosis prediction
2023-Sep, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e20164
PMID:37809682
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序数据，分析了肺腺癌（LUAD）中的恶性上皮细胞异质性，并识别出与不良预后相关的新型恶性上皮细胞簇KRT81。 | 识别出与不良预后相关的新型恶性上皮细胞簇KRT81，并揭示了这些细胞在缺氧和上皮-间质转化（EMT）途径中的激活状态。 | NA | 研究肺腺癌患者分类和预后预测中的恶性上皮细胞异质性。 | 肺腺癌（LUAD）患者的恶性上皮细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 2570 | 2024-08-07 |
Integrative analysis of cancer-associated fibroblast signature in gastric cancer
2023-Sep, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e19217
PMID:37809716
|
研究论文 | 本研究通过整合分析癌症相关成纤维细胞（CAFs）在胃癌（GC）中的特征，探索了CAFs在肿瘤微环境（TME）中的异质性，并为GC的生物标志物和精准治疗开发奠定了基础。 | 本研究首次识别了胃癌中的五种CAFs亚型，并发现CAF_0亚型与不良预后相关，同时构建了基于CAFs的预后评分模型（CAFs-score），该模型与免疫细胞、基质成分和免疫评分有显著相关性，具有指导治疗决策的潜力。 | NA | 探索癌症相关成纤维细胞在胃癌中的异质性，并为胃癌的生物标志物和精准治疗开发提供基础。 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）在胃癌（GC）中的特征及其与预后的关系。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）、免疫组织化学、免疫荧光、Western blotting | LASSO回归分析、多变量Cox回归 | RNA测序数据 | 来自GEO和TCGA的数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 2571 | 2024-08-07 |
scHOIS: Determining Cell Heterogeneity Through Hierarchical Clustering Based on Optimal Imputation Strategy
2023 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2022.3203592
PMID:37815942
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研究论文 | 本文提出了一种基于最优插补策略的分层聚类算法scHOIS，用于分析单细胞RNA测序数据中的细胞异质性 | scHOIS算法通过两阶段处理，首先使用掩蔽非负矩阵分解近似原始观测数据，然后通过分层聚类对插补细胞进行分组，显著提高了细胞差异的区分能力和聚类性能 | NA | 开发有效的计算方法来解决单细胞RNA测序数据中的缺失值和聚类问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞异质性 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 非负矩阵分解(NMF) | 基因表达数据 | 使用真实世界数据集进行广泛实验 |
| 2572 | 2024-08-05 |
Hypomethylation-induced regulatory programs in T cells unveiled by transcriptomic analyses
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1235661
PMID:37828996
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研究论文 | 这篇文章揭示了低甲基化诱导的调节性T细胞在转录组学分析中的特征 | 文章首次展示了HA诱导的G细胞在转录组层面的变化，阐明了其在调节性T细胞身份和功能中的作用 | 文章没有提供HA对其他类型T细胞影响的全面评估 | 探讨低甲基化如何影响调节性T细胞的转录组特征 | 主要研究HA诱导的调节性T细胞（HA-iTregs）和其特定的G细胞群体 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | HA诱导的G细胞和其对应的G细胞 |
| 2573 | 2024-08-05 |
VISTA: visualizing the spatial transcriptome of the C.elegans nervous system
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad127
PMID:37810458
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研究论文 | 本文介绍了VISTA，一个可视化线虫神经系统空间转录组的方法 | VISTA利用现有数据集实现了单细胞分辨率的综合空间转录组可视化 | 该方法目前仅针对秀丽隐杆线虫的神经系统，可能不适用于其他动物物种 | 探讨空间转录组学中单细胞转录组分析与空间信息的结合 | 研究对象是秀丽隐杆线虫的神经系统及其基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 多个单细胞的转录组数据 |
| 2574 | 2024-08-05 |
Construction of a prognostic model for colorectal adenocarcinoma based on Zn transport-related genes identified by single-cell sequencing and weighted co-expression network analysis
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1207499
PMID:37829346
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研究论文 | 本文构建了基于锌转运相关基因的结直肠腺癌预后模型 | 首次报告了锌转运途径在结直肠腺癌中的作用，并建立了相应的预后模型 | 研究中未充分探讨锌转运基因在结直肠腺癌中的具体机制 | 建立一个有效的预后模型来评估结直肠腺癌患者的免疫微环境与预后 | 结直肠腺癌患者及其相关的锌转运基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序、加权共表达网络分析 | Cox回归模型 | 基因组数据、细胞实验数据 | TCGA和GEO数据库中的结直肠腺癌患者数据 |
| 2575 | 2024-08-05 |
Identification of molecular pattern and prognostic risk model based on ligand-receptor pairs in liver cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1187108
PMID:37818360
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研究论文 | 本研究基于肝癌中的配体-受体对识别分子模式和预后风险模型。 | 结合单细胞测序和转录组测序，构建了用于肝癌的分子分类和风险模型。 | 未提及具体的样本量和外部验证数据，可能限制模型的普适性。 | 识别肝癌微环境中细胞间的相互作用和建立预后风险模型。 | 肝癌细胞系及其微环境中的配体-受体对。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、转录组测序、qPCR | NA | 基因组数据、临床数据 | NA |
| 2576 | 2024-08-05 |
A prognostic model related to necrotizing apoptosis of breast cancer based on biorthogonal constrained depth semi-supervised nonnegative matrix decomposition and single-cell sequencing analysis
2023, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:37818066
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研究论文 | 本研究提出了一种新的聚类算法用于乳腺癌亚型分析，并构建了一个与坏死性凋亡相关的预后模型 | 提出了一种新的聚类算法DO-DSNMF，能够挖掘样本间的非线性关系并改进预后模型 | 没有提供样本量和实验具体细节的限制信息 | 改善乳腺癌患者的预后并识别新兴生物标志物 | 乳腺癌患者的亚型及其与免疫相关的基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | 聚类算法 | 转录组数据 | NA |
| 2577 | 2024-08-07 |
Inflammation-mediated fibroblast activation and immune dysregulation in collagen VII-deficient skin
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1211505
PMID:37809094
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了胶原VII缺陷皮肤中细胞的基因表达模式，揭示了炎症介导的纤维母细胞活化和免疫失调的复杂机制。 | 首次揭示了胶原VII缺陷皮肤中纤维母细胞的两种分化途径，并阐明了炎症细胞因子的动态变化及其在疾病进展中的作用。 | 研究仅基于小鼠模型，可能与人类疾病存在差异。 | 探讨炎症在胶原VII缺陷皮肤中的作用及其对组织微环境的影响。 | 胶原VII缺陷皮肤中的细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的皮肤细胞 |
| 2578 | 2024-08-07 |
CD74 deficiency reduces trophoblast invasion and proliferation mediated by SIRT1 in preeclampsia
2023-12-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-23-0202
PMID:37796743
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研究论文 | 本研究探讨了CD74在子痫前期中通过SIRT1介导的滋养层细胞侵袭和增殖中的作用 | 研究首次揭示了CD74通过调节MAPK信号通路在子痫前期发病机制中的保护作用，并发现SIRT1对此有正向调控作用 | NA | 研究子痫前期的发病机制及其相关基因的作用 | 子痫前期患者的胎盘和SIRT1杂合子敲除小鼠模型 | 数字病理学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 134个差异表达基因(DEGs)，使用CD74敲低的HTR8/SVneo细胞进行实验 |
| 2579 | 2024-08-05 |
Hypoxia activates SREBP2 through Golgi disassembly in bone marrow-derived monocytes for enhanced tumor growth
2023-Nov-15, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2023114032
PMID:37781951
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研究论文 | 研究发现低氧通过高尔基体解聚激活SREBP2，从而促进骨髓来源单核细胞的肿瘤生长 | 首次揭示了低氧状态下高尔基体解聚与SREBP2激活之间的关系，显示这一过程是特定于细胞谱系的 | 研究主要集中在骨髓来源细胞的特定亚群，可能不适用于其他类型的免疫细胞 | 探讨低氧对骨髓来源细胞中SREBP2激活及其在肿瘤进展中的作用机制 | 骨髓来源细胞（BMDCs）及其分化为成熟巨噬细胞的过程 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 2580 | 2024-08-07 |
GPCR signaling contributes to immune characteristics of microenvironment and process of EBV-induced lymphomagenesis
2023-11-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2023.09.029
PMID:37798178
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研究论文 | 本研究首次全面分析了自然杀伤/T细胞淋巴瘤（NKTCL）的蛋白质组学特征，揭示了EB病毒（EBV）基因模式与免疫相关致癌信号的关系，并探讨了GPCR信号在EBV诱导的淋巴瘤发生中的作用。 | 本研究首次揭示了GPCR介导的恶性进展，并将病毒分子传感器转化为EBV特异性抗癌疗法。 | NA | 探讨EB病毒与癌症免疫相互作用的机制及其在疾病发病过程中的作用。 | 自然杀伤/T细胞淋巴瘤（NKTCL） | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 蛋白质组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据 | NA |